| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 2560684 = | 83 (1.160) | 4 (0.060) | 4/250 | NT | 5.5% | coding (747/786 nt) | PP_2244 | TauE‑like transmembrane protein |
| ? | NC_002947 | 2560755 = | 61 (0.910) | coding (676/786 nt) | PP_2244 | TauE‑like transmembrane protein | |||||
ACAGGTGCTTGGGTGTCCGATGAGTGCCGGGCAGCGTATCGACGTGCTGCCGCTGTCACGTCTGCAATTGAGCTTTACCGGGCAGTGGCGGTTGCGCCTGGGCTAAGGCTCAGAACGCCAGCTTGTAACCGATCAGCAGCAGCATCGTTGCCAGGCAAGGGCGCAGCACGCGGTCGGAGATCCGCCCGGTGAGGTGGCTACCCAGGTAGATGCCTGGCAGCGAGCCCAGCAGCAGGTAGCCCAGCAGCGACCAATCCATGTTGCCCATGCCCGCGTGGCCGAGGCCCGCTA > NC_002947/2560536‑2560826 | aCAGGTGCTTGGGTGTCCGATGAGTGCCGGGCAGCGTATCGACGTGCTGCCGCTGTCACGTCTGCAATTGAGCTTTACCGGGCAGTGGCGGTTGCGCCTGGGCTAAGGCTCAGAACGCCAGCTTGTAACCGATCAGCAGCAGCATCGtt > 5:110133/1‑149 (MQ=255) cctgctgtacccgttcctggtcacccgtcgcctggtcggtaccgaaattgcccacgccgtgccactgaccttggtagcgggcctcggccacgcgggcatgggcaacatggattggtcgctgctgggctacctgctgctgggctcgtTGc < 4:52676‑M1/3‑1 (MQ=255) ggTGCTTGGGTGTCCGATGAGTGCCGGGCAGCGTATCGACGTGCTGCCGCTGTCACGTCTGCAATTGAGCTTTACCGGGCAGTGGCGGTTGCGCCTGGGCTAAGGCTCAGAACGCCAGCTTGTAACCGATCAGCAGCAGCATCGTTGcc < 8:137593/149‑1 (MQ=255) gTGCTTGGGTGTCCGATGAGTGCCGGGCAGCGTATCGACGTGCTGCCGCTGTCACGTCTGCAATTGATCTTTACCGGGCAGTGGCGGTTGCGCCTGGGCTAAGGCTCAGAACGCCAGCTTGTAACCGATCAGCAGCAGCATCGTTGCCa < 6:421478/149‑1 (MQ=255) tGCTTGGGTGTCCGATGAGTGCCGGGCAGCGTATCGACGTGCTGCCGCTGTCACGTCTGCAATTGAGCTTTACCGGGCAGTGGCGGTTGCGCCTGGGCTAAGGCTCAGAACGCCAGCTTGTAACCGATCAGCAGCAGCATCGTTGCCAg < 4:212561/149‑1 (MQ=255) ctgtacccgttcctggtcacccgtcgcctggtcggtaccgaaattgcccacgccgtgccactgaccttggtagcgggcctcggccacgcgggcatggcaacatggattggtcgctgctgggctacctgctgctgggctcgcTGCCAgg < 4:334400‑M1/7‑1 (MQ=255) cTTGGGTGTCCGATGAGTGCCGGGCAGCGTATCGACGTGCTGCCGCTGTCACGTCTGCAATTGAGCTTTACCGGGCAGTGGCGGTTGCGCCTGGGCTAAGGCTCAGAACGCCAGCTTGTAACCGATCAGCAGCAGCATCGTTGCCAGGc < 7:91374/149‑1 (MQ=255) tacccgttcctggtcacccgtcgcctggtcggtacccaaattgcccacgccgtgccactgaccttggtagcgggcctcggccacgcgggcatgggcaacatggattggtcgctgctgggctacctgctgctcggctcgcTGCCAGGCa < 5:212572‑M1/9‑1 (MQ=255) tacccgttactggtcacccgtcgcctggtcggtaccgaaattgcccacgccgtgccactgaacttggtagctggcctcggccaagcgggcatgggcaacatggattgttcgctgctgtgctacatgctgatgggctcgcTGCCAGGCaa < 7:358105‑M1/10‑1 (MQ=255) gtCCGATGAGTGCCGGGCAGCGTATCGACGTGCTGCCGCTGTCACGTCTGCAATTGAGCTTTACCGGGCAGTGGCGGTTGCGCCTGGGCTAAGGCTCAGAACGCCAGCTTGTAACCGATCAGCAGCAGCATCGTTGCCAGGCAAGGgcg > 8:162384/1‑149 (MQ=255) cGATGAGTGCCGGGCAGCGTATCGACGTGCTGCCGCTGTCACGTCTGCAATTGAGCTTTACCGGGCAGTGGCGGTTGCGCCTGGGCTAAGGCTCAGAACGCCAGCTTGTAACCGATCAGCAGCAGCATCGTTGCCAGGCAAGGGCgcag > 6:41419/1‑149 (MQ=255) cGATGAGTGCCGGGCAGCGTATCGACGTGCTGCCGCTGTCACGTCTGCAATTGAGCTTTACCGGGCAGTGGCGGTTGCGCCTGGGCTAAGGCTCAGAACGCCAGCTTGTAACCGATCAGCAGCAGCATCGTTGCCAGGCAAGGGCgcag < 7:195072/149‑1 (MQ=255) cGATGAGTGCCGGGCAGCGTATCGACGTGCTGCCGCTGTCACGTCTGCAATTGAGCTTTACCGGGCAGTGGCGGTTGCGCCTGGGCTAAGGCTCAGAACGCCAGCTTGTAACCGATCAGCAGCAGCATCGTTGCCAGGCAAGGGCgcag > 4:385953/1‑149 (MQ=255) cGATGACGGCCGGGCAGCGTATCGACGTGCTGCCGCTGTCACGTCTGCAATTGAGCTTTACCGGGCAGTGGCGGTTGCGCCTGGGCTAAGGCTCAGAACGCCAGCTTGTAACCGATCAGCAGCAGCATCGTTGCCAGGCAAGGGCgca < 8:208288/148‑1 (MQ=255) gTGCCGGGCAGCGTATCGACGTGCTGCCGCTGTCACGTCTGCAATTGAGCTTTACCGGGCAGTGGCGGTTGCGCCTGGGCTAAGGCTCAGAACGCCAGCTTGTAACCGATCAGCAGCAGCATCGTTGCCAGGCAAGGGCGCAGCAcgcg > 6:417444/1‑149 (MQ=255) tGCCGGGCAGCGTATCGACGTGCTGCCGCTGTCACGTCTGCAATTGAGCTTTACCGGGCAGTGGCGGTTGCGCCTGGGCTAAGGCTCAGAACGCCAGCTTGTAACCGATCAGCAGCAGCATCGTTGCCAGGCAAGGGCGCAGCACGCgg > 2:132179/1‑149 (MQ=255) tGCCGGGCAGCGTATCGACGTGCTGCCGCTGTCACGTCTGCAATTGAGCTTTACCGGGCAGTGGCGGTTGCGCCTGGGCTAAGGCTCAGAACGCCAGCTTGTAACCGATCAGCAGCAGCATCGTTGCCAGGCAAGGGCGCAGCACGCgg > 2:294481/1‑149 (MQ=255) tGCCGGGCAGCGTATCGACGTGCTGCCGCTGTCACGTCTGCAATTGAGCTTTACCGGGCAGTGGCGGTTGCGCCTGGGCTAAGGCTCAGAACGCCAGCTTGTAACCGATCAGCAGCAGCATCGTTGCCAGGCAAGGGCGCAGCACGCgg > 2:73829/1‑149 (MQ=255) tGCCGGGCAGCGTATCGACGTGCTGCCGCTGTCACGTCTGCAATTGAGCTTTACCGGGCAGTGGCGGGTGCGCCTGGGCTAAGGCTCAGAACGCCAGCTTGTAACCGATCAGCAGCAGCATCGTTGCCAGGCAAGGGCGCAGCACGCgg < 8:306381/149‑1 (MQ=255) 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gcCGCTGTCACGTCTGCAATTGAGCTTTACCGGGCAGTGGCGGTTGCGCCTGGGCTAAGGCTCAGAACGCCAGCTTGTAACCGATCAGCAGCAGCATCGTTGCCAGGCAAGGGCGCAGCACGCGGTCGGAGATCCGCCCGGTGAGGTgg > 4:264989/1‑149 (MQ=255) ccGCTGTCACGTCTGCAATTGAGCTTTACCGGGCAGTGGCGGTTGCGCCTGGGCTAAGGCTCAGAACGCCAGCTTGTAACCGATCAGCAGCAGCATCGTTGCCAGGCAAGGGCGCAGCACGCGGTCGGAGATCCGCCCGGTGAGGTGGc > 5:3189/1‑149 (MQ=255) cTGTCACGTCTGCAATTGAGCTTTACCGGGCAGTGGCGGTTGCGCCTGGGCTAAGGCTCAGAACGCCAGCTTGTAACCGATCAGCAGCAGCATCGTTGCCAGGCAAGGGCGCAGCACGCGGTCGGAGATCCGCCCGGTGAGGTGGCTAc > 2:81452/1‑149 (MQ=255) aCGTCTGCAATTGAGCTTTACCGGGCAGTGGCGGTTGCGCCTGGGCTAAGGCTCAGAACGCCAGCTTGTAACCGATCAGCAGCAGCATCGTTGCCAGGCAAGGGCGCAGCACGCGGTCGGAGATCAGCCCGGTGAGGTGGCTAcacacg > 6:190903/1‑147 (MQ=255) gTCTGCAATTGAGCTTTACCGGGCAGTGGCGGTTGCGCCTGGGCTAAGGCTCAGAACGCCAGCTTGTAACCGATCAGCAGCAGCATCGTTGCCAGGCAAGGGCGCAGCACGCGGTCGGAGATCCGCCCGGTGAGGTGGCAACCAAGGTa > 4:25263/1‑149 (MQ=255) 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gCCAGCTTGTAACCGATCAGCAGCAGCATCGTTGCCAGGCAAGGGCGCAGCACGCGGTCGGAGATCCGCCCGGTGAGGTGGCTACCCAGGTAGATGCCTGGCAGCGAGCCCAGCAGCAGGTAGCCCAGCAGCGACCAATCCATGTTGcc > 2:197999/1‑149 (MQ=255) cAGCTTGTAACCGATCAGCAGCAGCATCGTTGCCAGGCAAGGGCGCAGCACGCGGTCGGAGATCCGCCCGGTGAGGTGGCTACCCAGGTAGATGCCTg > 1:243168/1‑98 (MQ=255) cAGCTTGTAACCGATCAGCAGCAGCATCGTTGCCAGGCAAGGGCGCAGCACGCGGTCGGAGATCCGCCCGGTGAGGTGGCTACCCAGGTAGATGCCTg < 2:243168/98‑1 (MQ=255) cAGCTTGTAACCGATCAGCAGCAGCATCGTTGCCAGGCAAGGGCGCAGCACGCGGTCGGAGATCCGCCCGGTGAGGTGGCTACCCAGGTAGATGCCTGGCAGCGAGCCCAGCAGCAGGTAGCCCAGCAGCGACCAATCCATGTTGc < 5:118929/146‑1 (MQ=255) cAGCTTGTAACCGATCAGCAGCAGCATCGTTGCCAGGCAAGGGCGCAGCACGCGGTCGGAGATCCGCCCGGTGAGGTGGCTACCCAGGTAGATGCCTGGCAGCGAGCCCAGCAGCAGGTAGCCCAGCAGCGACCAATCCATGTTGc > 6:118929/1‑146 (MQ=255) gTAACCGATCAGCAGCAGCATCGTTGCCAGGCAAGGGCGCAGCACGCGGTCGGAGATCCGCCCGGTGAGGTGGCTACCCAGGTAGATGCCTGGCAGCGAGCCCAGCAGCAGGTAGCCCAGCAGCGACCAATCCATGTTGCCCATGc < 7:97414/146‑1 (MQ=255) gTAACCGATCAGCAGCAGCATCGTTGCCAGGCAAGGGCGCAGCACGCGGTCGGAGATCCGCCCGGTGAGGTGGCTACCCAGGTAGATGCCTGGCAGCGAGCCCAGCAGCAGGTAGCCCAGCAGCGACCAATCCATGTTG‑CCATGCCcgc > 3:334400/1‑149 (MQ=255) aaCCGATCAGCAGCAGCATCGTTGCCAGGCAAGGGCGCAGCACGCGGTCGGAGATCCGCCCGGTGAGGTGGCTACCCAGGTAGATGCCTGGCAGCGAGCCCAGCAGCAGGTAGCCCAGCAGCGACCAATCCATGTTGCCCATGCCcgcg > 8:169529/1‑149 (MQ=255) ccGATAAGCAGCAGAATCGTTGCCAGGCAAGGGCGCAGCACGCGGTCGGATATCCGCGCGGTGAGGTGGCTACACAGGTAGATGCCTGGCAGCGAGCCCAGCAGCAGGTAGCCCAGCAGCGCCCAATCCATGTTGCCCATGCCCGCGTg > 6:212572/1‑149 (MQ=255) cGATCAGCAGCAGCATCGTTGCCAGGCAAGGGCGCAGCACGCGGTCGGAGATCCGCCCGGTGAGGTGGCTACCCAGGTAGATGCCTGGCAGCGAGCCCAGCAGCAGGTAGCCCAGCAGCGACCAATCCATGTTGCCCATGCCCGCGTgg > 4:38585/1‑149 (MQ=255) aTCAGCAGCAGCATCGTTGCCATGCAAGGGCGCAGCACGCGGTAGGATATCCGCCCGGTGAGGTGGCTACCCAGGTAGATGCCTGGCAGCGAGCCCAGCAGCAGGTAGCCCAGCAGCGACCAATCCATGTTGCCCATGCCCGCGTGGcc < 1:166648/149‑1 (MQ=255) aTCAGCAGCAGCATCGTTGCCAGGCAAGGGCGCAGCACGCGGTCGGAGATCCGCCCGGTGAGGTGGCTACCCAGGTAGATGCCTGGCAGCGAGCCCAGCAGCAGGTAGCCCAGCAGCGACCAATCCATGTTGCCCATGCCCGCGTGGcc > 1:176711/1‑149 (MQ=255) gcagcagcaGCGTTGCCAGGCAAGGGCGCAGCACGCGGTCGGAGATCCGCCCGGTGAGGTGGCTACCCAGGTAGATGCCTGGCAGCGAGCCCAGCAGCAGGTAGCCCAGCAGCGACCAATCCATGTTGCCCATGCCCGCGTGGCCGAgg < 5:352229/149‑1 (MQ=255) cagcagcaTCGTTGCCAGGCAAGGGCGCAGCACGCGGTCGGAGATCCGCCCGGTGAGGTGGCTACCCAGGTAGATGCCTGGCAGCGAGCCCAGCAGCAGGTAGCCCAGCAGCGACCAATCCATGTTGCCCATGCCCGCGTGGCCGAGGc > 3:128088/1‑149 (MQ=255) cagcagcaTCGTTGCCAGGCAAGGGCGCAGCACGCGGTCGGAGATCCGCCCGGTGAGGTGGCTACCCAGGTAGATGCCTGGCAGCGAGCCCAGCAGCAGGTAGCCCAGCAGCGACCAATCCATGTTGCCCATGCCCGCGTGGCCGAGGc > 5:275682/1‑149 (MQ=255) gcagcaTCGTTGCCAGGCAAGGGCGCAGCACGCGGTCGGAGATCCGCCCGGTGAGGTGGCTACCCAGGTAGATGCCTGGCAGCGAGCCcagca < 2:119601/93‑1 (MQ=255) gcagcaTCGTTGCCAGGCAAGGGCGCAGCACGCGGTCGGAGATCCGCCCGGTGAGGTGGCTACCCAGGTAGATGCCTGGCAGCGAGCCcagca > 1:119601/1‑93 (MQ=255) caTCGTTGCCAGGCAAGGGCGCAGCACGCGGTCGGAGATCCGCCCGGTGAGGTGGCTACCCAGGTAGATGCCTGGCAGCGAGCCCAGCAGCAGGTAGCCCAGCAGCGACCAATCCATGTTGCCCATGCCCGCGTGGCCGAGGCCCGCTa > 5:279853/1‑149 (MQ=255) | ACAGGTGCTTGGGTGTCCGATGAGTGCCGGGCAGCGTATCGACGTGCTGCCGCTGTCACGTCTGCAATTGAGCTTTACCGGGCAGTGGCGGTTGCGCCTGGGCTAAGGCTCAGAACGCCAGCTTGTAACCGATCAGCAGCAGCATCGTTGCCAGGCAAGGGCGCAGCACGCGGTCGGAGATCCGCCCGGTGAGGTGGCTACCCAGGTAGATGCCTGGCAGCGAGCCCAGCAGCAGGTAGCCCAGCAGCGACCAATCCATGTTGCCCATGCCCGCGTGGCCGAGGCCCGCTA > NC_002947/2560536‑2560826 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |