New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3066171 = | 46 (0.640) | 4 (0.060) | 3/256 | NT | 8.2% | coding (305/924 nt) | PP_2678 | hydrolase |
? | NC_002947 | 3066244 = | 46 (0.670) | coding (378/924 nt) | PP_2678 | hydrolase |
GTTCATCGTCACCGACAGCGGTGTGGTGGTGATCGACAGCGGGCCGTCGAAAGGCTATGGCGAGGCATTGCGCAAGGCAATTGCCACCCTCACCGACAAGCCGGTAGTGGAGGTGCTGCTGACCCATCATCATCCTGACCATGTGCTGGGCAACCAGGCCTTTGCCGATGTGCCGATCGGTGCCCTGGCCGGCACCCGCGACCTGCTGCGCCAGCAAGGCGATGCCATGGCCGAGAACATGTATCGCCTGGTCGGCGACTGGATGCGCGGTACCGAGGTGGTGCTGCCGA > NC_002947/3066028‑3066317 | gcccgcccagccccagcaacctcaggcggtgcccacccacctcatgcacgcccggctgcagcacccgggtcggcagcaccacctcggtaccgcgcatccagtcgccgaccaggcgatacatgttctcggccatggcatcgcctTGCTgg < 4:194011‑M1/6‑1 (MQ=255) gcccgcccagccccagcaacctcaggcggtgcccacccacctcatgcacgcccggctgcagcacccgggtcggcagcaccacctcggtaccgcgcatccagtcgccgaccaggcgatacatgttctcggccatggcatcgcctTGCTgg < 4:187304‑M1/6‑1 (MQ=255) cATCGTCACCGACAGCGGTGTGGTGGTGATCGACAGCGGGCCGTCGAAAGGCTATGGCGAGGCATTGCGCAAGGCAATTGCCACCCTCACCGACAAGCCGGTAGTGGAGGTGCTGCTGACCCATCATCATCCTGACCATGTGCTGGGc < 4:272436/148‑1 (MQ=255) ccagcaacctcaggcggtgcccacccacctcatgcacgcccggctgcagcacccgggtcggcagcaccacctcggtaccgcgcatccagtcgccgaccaggcgatacatgttctcggccatggcatcgcctTGCTgg > 8:33234‑M1/132‑137 (MQ=255) ccagcaacctcaggcggtgcccacccacctcatgcacgcccggctgcagcacccgggtcggcagcaccacctcggtaccgcgcatccagtcgccgaccaggcgatacatgttctcggccatggcatcgcctTGCTgg < 7:33234‑M1/6‑1 (MQ=255) cGGTGTGGTGGTGATCGACAGCGGGCCGTCGAAAGGCTATGGCGAGGCATTGCGCAAGGCAATTGCCACCCTCACCGACAAGCCGGTAGTGGAGGTGCTGCTGACCCATCATCATCCTGACCATGTGCTGGGCAACCAGGCCTTTGcc > 6:310375/1‑148 (MQ=255) tgtgGTGGTGATCGACAGCGGGCCGTCGAAAGGCTATGGCGAGGCATTGCGCAAGGCAATTGCCACCCTCACCGACAAGCCGGTAGTGGAGGTGCTGCTGACCCATCATCATCCTGACCATGTGCTGGGCAACCAGGCCTTTGCCGAtg < 8:16738/149‑1 (MQ=255) gtggtgATCGACAGCGGGCCGTCGAAAGGCTATGGCGAGGCATTGCGCAAGGCAATTGCCACCCTCACCGACAAGCCGGTAGTGGAGGTGCTGCTGACCCATCATCATCCTGACCATGTGCTGGGCAACCAGGCCTTTGCCGATGTGcc < 5:372391/149‑1 (MQ=255) gtggtgATCGACAGCGGGCCGTCGAAAGGCTATGGCGAGGCATTGCGCAAGGCAATTGCCACCCTCACCGACAAGCCGGTAGTGGAGGTGCTGCTGACCCATCATCATCCTGACCATGTGCTGGGCAACCAGGCCTTTGCCGATGTGcc > 4:259142/1‑149 (MQ=255) ggtgATCGACAGCGGGCCGTCGAAAGGCTATGGCGAGGCATTGCGCAAGGCAATTGCCACCCTCACCGACAAGCCGGTAGTGGAGGTGCTGCTGACCCATCATCATCCTGACCATGTGCTGGGCAACCAGGCCTTTGCCGATGTGCCGa > 7:258083/1‑149 (MQ=255) gcccacccacctcatgcacgcccggctgcagcacccgggtcggcagcaccacctcggtaccgcgcatccagtcgccgaccaggcgatacatgttctcggccatggcatcgcctTGCTGGGCAACCAGGCCTTTGCCGATGTGCCGATCg < 7:120317‑M1/36‑1 (MQ=255) aTCGACAGCGGGCCGTCGAAAGGCTATGGCGAGGCATTGCGCAAGGCAATTGCCACCCTCACCGACAAGCCGGTAGTGGAGGTGCTGCTGACCCATCATCATCCTGACCATGTGCTGGGCAACCAGGCCTTTGCCGATGTGCCGATCgg > 6:47164/1‑149 (MQ=255) gACAGCGGGCCGTCGAAAGGCTATGGCGAGGCATTGCGCAAGGCAATTGCCACCCTCACCGACAAGCCGGTAGTGGAGGTGCTGCTGACCCATCATCATCCTGACCATGTGCTGGGCAACCAGGCCTTTGCCGATGTGCCGATCGGTg < 5:310375/148‑1 (MQ=255) gACAGCGGGCCGTCGAAAGGCTATGGCGAGGCATTGCGCAAGGCAATTGCCACCCTCACCGACAAGCCGGTAGTGGAGGTGCTGCTGACCCATCATCATCCTGACCATGTGCTGGGCAACCAGGCCTTTGCCGATGTGCCGATCGGTGc > 5:383417/1‑149 (MQ=255) cAGCGGGCCGTCGAAAGGCTATGGCGAGGCATTGCGCAAGGCAATTGCCACCCTCACCGACAAGCCGGTAGTGGAGGTGCTGCTGACCCATCATCATCCTGACCATGTGCTGGGCAACCAGGCCTTTGCCGATGTGCCGATCGGTGccc > 4:159861/1‑149 (MQ=255) ccGTCGAAAGGCTATGGCGAGGCATTGCGCAAGGCAATTGCCACCCTCACCGACAAGCCGGTAGTGGAGGTGCTGCTGACCCATCATCATCCTGACCATGTGCTGGGCAACCAGGCCTTTGCCGATGTGCCGATCGGTGCCCTGGCCgg < 3:259142/149‑1 (MQ=255) ccGTCGAAAGGCTATGGCGAGGCATTGCGCAAGGCAATTGCCACCCTCACCGACAAGCCGGTAGTGGAGGTGCTGCTGACCCATCATCATCCTGACCATGTGCTGGGCAACCAGGCCTTTGCCGATGTGCCGATCGGTGCCCTGGCCgg < 1:50991/149‑1 (MQ=255) gTCGAAAGGCTATGGCGAGGCATTGCGCAAGGCAATTGCCACCCTCACCGACAAGCCGGTAGTGGAGGTGCTGCTGACCCATCATCATCCTGACCATGTGCTGGGCAACCAGGCCTTTGCCGATGTGCCGATCGGTGCCCTGGCCGGCa > 6:198588/1‑149 (MQ=255) gTCGAAAGGCTATGGCGAGGCATTGCGCAAGGCAATTGCCACCCTCACCGACAAGCCGGTAGTGGAGGTGCTGCTGACCCATCATCATCCTGACCATGTGCTGGGCAACCAGGCCTTTGCCGATGTGCCGATCGGTGCCCTGGCCGGCa < 5:139779/149‑1 (MQ=255) aaGGCTATGGCGAGGCATTGCGCAAGGCAATTGCCACCCTCACCGACAAGCCGGTAGTGGAGGTGCTGCTGACCCATCATCATCCTGACCATGTGCTGGGCAACCAGGCCTTTGCCGATGTGCCGATCGGTGCCCTGGCCGGCACCcgc < 6:383417/149‑1 (MQ=255) aaGGCTATGGCGAGGCATTGCGCAAGGCAATTGCCACCCTCACCGACAAGCCGGTAGTGGAGGTGCTGCTGACCCATCATCATCCTGACCATGTGCTGGGCAACCAGGCCTTTGCCGATGTGCCGATCGGTGCCCTGGCCGGCACCcgc < 7:366063/149‑1 (MQ=255) gCTATGGCGAGGCATTGCGCAAGGCAATTGCCACCCTCACCGACAAGCCGGTAGTGGAGGTGCTGCTGACCCATCATCATCCTGACCATGTGCTGGGCAACCAGGCCTTTGCCGATGTGCCGATCGGTGCCCTGGCCGGCACCCGCGAc > 4:197526/1‑149 (MQ=255) aGGCATTGCGCAAGGCAATTGCCACCCTCACCGACAAGCCGGTAGTGGAGGTGCTGCTGACCCATCATCATCCTGACCATGTGCTGGGCAACCAGGCCTTTGCCGATGTGCCGATCGGTGCCCTGGCCGGCACCCGCGACCTGCTgcgc < 5:21348/149‑1 (MQ=255) ggCATTGCGCAAGGCAATTGCCACCCTCACCGACAAGCCGGTAGTGGAGGTGCTGCTGACCCATCATCATCCTGACCATGTGCTGGGCAACCAGGCCTTTGCCGATGTGCCGATCGGTGCCCTGGCCGGCACCCGCGACCTGCTGCGcc < 3:197526/149‑1 (MQ=255) gtcggcagcaccacctcggtaccgcgcatccagtcgccgaccaggcgatacatgttctcggccatggcatcgcctTGCTGGGCAACCAGGCCTTTGCCGATGTGCCGATCGGTGCCCTGGCCGGCACCCGCGACCTGCTGCGCCAGCaa > 3:4099‑M1/76‑149 (MQ=255) tcggcagcaccacctcggtaccgcgcatccagtcgccgaccaggcgatacatgttctcggccatggcatcgcctTGCTGGGCAACCAGGCCTTTGCCGATGTGCCGATCGGTGCCCTGGCCGGCACCCGCGACCTGCTGCGCCAGCAAg > 5:70419‑M1/75‑149 (MQ=255) tcggcagcaccacctcggtaccgcgcatccagtcgccgaccaggcgatacatgttctcggccatggcatcgcctTGCTGGGCAACCAGGCCTTTGCCGATGTGCCGATCGGTGCCCTGGCCGGCACCCGCGACCTGCTGCGCCAGCAAg > 8:120317‑M1/75‑149 (MQ=255) cgcAAGGCAATTGCCACCCTCACCGACAAGCCGGTAGTGGAGGTGCTGCTGACCCATCATCATCCTGACCATGTGCTGGGCAACCAGGCCTTTGCCGATGTGCCGATCGGTGCCCTGGCCGGCACCCGCGACCTGCTGCGCCAGCAAgg > 6:135611/1‑149 (MQ=255) ggCAATTGCCACCCTCACCGACAAGCCGGTAGTGGAGGTGCTGCTGACCCATCATCATCCTGACCATGTGCTGGGCAACCAGGCCTTTGCCGATGTGCCGATCGGTGCCCTGGCCGGCACCCGCGACCTGCTGCGCCAGCAAGGCGATg > 2:110948/1‑149 (MQ=255) aaTTGCCACCCTCACCGACAAGCCGGTAGTGGAGGTGCTGCTGACCCATCATCATCCTGACCATGTGCTGGGCAACCAGGCCTTTGCCGATGTGCCGATCGGTGCCCTGGCCGGCACCCGCGACCTGCTGCGCCAGCAAGGCGAtacat > 6:376393/1‑145 (MQ=255) aaTTGCCACCCTCACCGACAAGCCGGTAGTGGAGGTGCTGCTGACCCATCATCATCCTGACCAAGTGCTGGGCAACCAGGCCTTTGCCGATGTGCCGATCGGTGCCCTGGCCGGCACCCGCGACCTGCTGCGCCAGCAAGGCGAtacat > 4:342072/1‑145 (MQ=255) cACCCTCACCGACAAGCCGGTAGTGGAGGTGCTGCTGACCCATCATCATCCTGACCATGTGCTGGGCAACCAGGCCTTTGCCGATGTGCCGATCGGTGCCCTGGCCGGCACCCGCGACCTGCTGCGCCAGCAAGGCGATGCCATGGcc > 6:204937/1‑148 (MQ=255) aCCCTCACCGACAAGCCGGTAGTGGAGGTGCTGCTGACCCATCATCATCCTGACCATGTGCTGGGCAACCAGGCCTTTGCCGATGTGCCGATCGGTGCCCTGGCCGGCACCCGCGACCTGCTGCGCCAGCAAGGCGATGCCATGGCCga < 7:321859/149‑1 (MQ=255) aCCGACAAGCCGGTAGTGGAGGTGCTGCTGACCCATCATCATCCTGACCATGTGCTGGGCAACCAGGCCTTTGCCGATGTGCCGATCGGTGCCCTGGCCGGCACCCGCGACCtgctgc > 4:381140/1‑118 (MQ=255) aCCGACAAGCCGGTAGTGGAGGTGCTGCTGACCCATCATCATCCTGACCATGTGCTGGGCAACCAGGCCTTTGCCGATGTGCCGATCGGTGCCCTGGCCGGCACCCGCGACCtgctgc < 3:381140/118‑1 (MQ=255) ccGACAAGCCGGTAGTGGAGGTGCTGCTGACCCATCATCATCCTGACCATGTGCTGGGCAACCAGGCCTTTGCCGATGTGCCGATCGGTGCCCTGGCCGGCACCCGCGACCTGCTGCGCCAGCAAGGCGATGCCATGGCCGAGAACATg > 3:187304/1‑149 (MQ=255) ccGACAAGCCGGTAGTGGAGGTGCTGCTGACCCATCATCATCCTGACCATGTGCTGGGCAACCAGGCCTTTGCCGATGTGCCGATCGGTGCCCTGGCCGGCACCCGCGACCTGCTGCGCCAGCAAGGCGATGCCATGGCCGAGAACATg > 3:194011/1‑149 (MQ=255) cGACAAGCCGGTAGTGGAGGTGCTGCTGACCCATCATCATCCTGACCATGTGCTGGGCAACCAGGCCTTTGCCGATGTGCCGATCGGTGCCCTGGCCGGCACCCGCGACCTGCTGCGCCAGCAAGGCGATGCCATGGCCGAGAACATg > 5:348673/1‑148 (MQ=255) gCCGGTAGTGGAGGTGCTGCTGACCCATCATCATCCTGACCATGTGCTGGGCAACCAGGCCTTTGCCGATGTGCCGATCGGTGCCCTGGCCGGCACCCGCGACCTGCTGCGCCAGCAAGGCGATGCCATGGCCGAGAACATGTATCGcc > 1:11887/1‑149 (MQ=255) gAGGTGCTGCTGACCCATCATCATCCTGACCATGTGCTGGGCAACCAGGCCTTTGCCGATGTGCCGATCGGTGCCCTGGCCGGCACCCGCGACCTGCTGCGCCAGCAAGGCGATGCCATg < 4:249879/120‑1 (MQ=255) gAGGTGCTGCTGACCCATCATCATCCTGACCATGTGCTGGGCAACCAGGCCTTTGCCGATGTGCCGATCGGTGCCCTGGCCGGCACCCGCGACCTGCTGCGCCAGCAAGGCGATGCCATg > 3:249879/1‑120 (MQ=255) gAGGTGCTGCTGACCCATCATCATCCTGACCATGTGCTGGGCAACCAGGCCTTTGCCGATGTGCCGATCGGTGCCCTGGCCGGCACCCGCGACCTGCTGCGCCAGCAAGGCGATGCCATGGCCGAGAACATGTATCGCCTGGTCGGCGa > 6:405778/1‑149 (MQ=255) tgctgcTGACCCATCATCATCCTGACCATGTGCTGGGCAACCAGGCCTTTGCCGATGTGCCGATCGGTGCCCTGGCCGGCACCCGCGACCTGCTGCGCCAGCAAGGCGATGCCATGGCCGAGAACATGTATCGCCTGGTCGGCGACTgg < 7:372427/149‑1 (MQ=255) ctgctgACCCATCATCATCCTGACCATGTGCTGGGCAACCAGGCCTTTGCCGATGTGCCGATCGGTGCCCTGGCCGGCACCCGCGACCTGCTGCGCCAGCAAGGCGATGCCATGGCCGAGAACATGTATCGCCTGGTCGGCGACTGGa < 1:110948/148‑1 (MQ=255) ctgACCCATCATCATCCTGACCATGTGCTGGGCAACCAGGCCTTTGCCGATGTGCCGATCGGTGCCCTGGCCGGCACCCGCGACCTGCTGCGCCAGCAAGGCGATGCCATGGCCGAGAACATGTATCGCCTGGTCGGCGa < 3:214389/140‑1 (MQ=255) ctgACCCATCATCATCCTGACCATGTGCTGGGCAACCAGGCCTTTGCCGATGTGCCGATCGGTGCCCTGGCCGGCACCCGCGACCTGCTGCGCCAGCAAGGCGATGCCATGGCCGAGAACATGTATCGCCTGGTCGGCGACTGGATgcg > 5:15258/1‑149 (MQ=255) ctgACCCATCATCATCCTGACAATGTGCTGGGCAACCAGGCCTTTGCCGATGTGCCGATCGGTGCCCTGGCCGGCACCCGCGACCTGCTGCGCCAGCAAGGCGATGCCATGGCCGAGAACATGTATCGCCTGGTCGGCGa > 4:214389/1‑140 (MQ=255) aCCCATCATCATCCTGACCATGTGCTGGGCAACCAGGCCTTTGCCGATGTGCCGATCGGTGCCCTGGCCGGCACCCGCGACCTGCTGCGCCAGCAAGGCGATGCCATGGCCGAGAACATGTATCGCCTGGTCGGCGACTGGATgcgc < 8:258083/147‑1 (MQ=255) ccATCATCATCCTTACCATGTGCTGGGCAACCAGGCCTTTGCCGATGTGCCGATCGGTGCCCTGGCCGGCACCCGCGACCTGCTGCGCCAGCAAGGCGATGCCATGGCCGAGAACATGTATCGCCTGGTCGGCGACTGGATGCGCGGTa < 1:366388/149‑1 (MQ=255) ccTGACCATGTGCTGGGCAACCAGGCCTTTGCCGATGTGCCGATCGGTGCCCTGGCCGGCACCCGCGACCTGCTGCGCCAGCAAGGCGATGCCATGGCCGAGAACATGTATCGCCTGGTCGGCGACTGGATgcg < 6:212250/134‑1 (MQ=255) ccTGACCATGTGCTGGGCAACCAGGCCTTTGCCGATGTGCCGATCGGTGCCCTGGCCGGCACCCGCGACCTGCTGCGCCAGCAAGGCGATGCCATGGCCGAGAACATGTATCGCCTGGTCGGCGACTGGATgcg > 5:212250/1‑134 (MQ=255) cTGACCATGTGCTGGGCAACCAGGCCTTTGCCGATGTGCCGATCGGTGCCCTGGCCGGCACCCTCGACCTGCTGCGCCAGCAAGGCGATGCCATGGCCGAGAACATGTATCGCCTGGTCGGCGACTGGATGCGCGGTACCGAGgtggtg > 6:152372/1‑149 (MQ=255) cTGACCATGTGCTGGGCAACCAGGCCTTTGCCGATGTGCCGATCGGTGCCCTGGCCGGCACCCGCGACCTGCTGCGCCAGCAAGGCGATGCCATGGCCGAGAACATGTATCGCCTGGTCGGCGACTGGATGCGCGGTACCGAGgtggtg < 2:11887/149‑1 (MQ=255) tGACCATGTGCTGGGCAACCAGGCCTTTGCCGATGTGCCGATCGGTGCCCTGGCCGGCACCCGCGACCTGCTGCGCCAGCAAGGCGATGCCATGGCCGAGAACATGTATCGCCTGGTCGGCGACTGGATGCGCGGTACCGAGGTGGtgc > 5:127457/1‑149 (MQ=255) tgtgCTGGGCAACCAGGCCTTTGCCGATGTGCCGATCGGTGCCCTGGCCGGCACCCGCGACCTGCTGCGCCAGCAAGGCGATGCCATGGCCGAGAACATGTATCGCCTGGTCGGCGACTGGATGCGCGGTACCGAGGTGGTGCTGCCGa < 3:159861/149‑1 (MQ=255) | GTTCATCGTCACCGACAGCGGTGTGGTGGTGATCGACAGCGGGCCGTCGAAAGGCTATGGCGAGGCATTGCGCAAGGCAATTGCCACCCTCACCGACAAGCCGGTAGTGGAGGTGCTGCTGACCCATCATCATCCTGACCATGTGCTGGGCAACCAGGCCTTTGCCGATGTGCCGATCGGTGCCCTGGCCGGCACCCGCGACCTGCTGCGCCAGCAAGGCGATGCCATGGCCGAGAACATGTATCGCCTGGTCGGCGACTGGATGCGCGGTACCGAGGTGGTGCTGCCGA > NC_002947/3066028‑3066317 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |