New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 3859573 | 45 (0.630) | 4 (0.060) | 4/252 | NT | 8.0% | coding (407/753 nt) | cobM | precorrin‑4 C(11)‑methyltransferase |
? | NC_002947 | = 3859599 | 50 (0.740) | coding (433/753 nt) | cobM | precorrin‑4 C(11)‑methyltransferase |
TCGGTGAGCAGATTCGCCACCTGCAAGCGCTGGGCATCGATTACCAGATCATCCCCGGCGTTACCGCCACGGCAGCGAGCGCCGCCCTGCTCGGCTGCGAGCTGACGTTGCCTCAAGTGGCG‑‑‑CAG‑‑‑ACCGTGATCCTCACCCGCTATGGCGACAGCTCGCCCATGCCGCC‑GGGTGAGCAGTTGGGTGACCTGGCGCGCCATGGCAGCACCCTGGCAATTCATCTGGGGGTCAAGCACCTGTCGCGCATTGTCGCTGAGTTGATGCCGCACTACGGCGCGCACTGCCC > NC_002947/3859432‑3859717 | tCGGTGAGCAGATTCGCCACCTGCAAGCGCTGGGCATCGATTACCAGATCATCCCCGGCGTTACCGCCACGGCAGCGAGCGCCGCCCTGCTCGGCTGCGAGCTGACGTTGCCTCAAGTGGCG‑‑‑CAG‑‑‑ACCGTGATCCTCACCCGCTATGGc < 6:129801/149‑1 (MQ=255) tGAGCAGATTCGCCACCTGCAAGCGCTGGGCATCGATTACCAGATCATCCCCGGCGTTACCGCCACGGCAGCGAGCGCCGCCCTGCTCGGCTGCGAGCTGACGTTGCCTCAAGTGGCG‑‑‑CAG‑‑‑ACCGTGATCCTCACCCGCTATGGCGa > 4:108188/1‑147 (MQ=255) aGCAGATTCGCCACCTGCAAGCGCTGGGCATCGATTACCAGATCATCCCCGGCGTTACCGCCACGGCAGCGAGCGCCGCCCTGCTCGGCTGCGAGCTGACGTTGCCTCAAGTGGCG‑‑‑CAG‑‑‑ACCGTGATCCTCACCCGCTATGGCGACAGc > 5:194783/1‑149 (MQ=255) gCCACCTGCAAGCGCTGGGCATCGATTACCAGATCATCCCCGGCGTTACCGCCACGGCAGCGAGCGCCGCCCTGCTCGGCTGCGAGCTGACGTTGCCTCAAGTGGCG‑‑‑CAG‑‑‑ACCGTGATCCTCACCCGCTATGGCGACAGCTCGCCCAt < 7:372686/148‑1 (MQ=255) ccACCTGCAAGCGCTGGGCATCGATTACCAGATCATCCCCGGCGTTACCGCCACGGCAGCGAGCGCCGCCCTGCTCGGCTGCGAGCTGACGTTGCCTCAAGTGGCG‑‑‑CAG‑‑‑ACCGTGATCCTCACCCGCTATGGCGACAGCTCGCCCATgc > 8:127198/1‑149 (MQ=255) cAAGCGCTGGGCATCGATTACCAGATCATCCCCGGCGTTACCGCCACGGCAGCGAGCGCCGCCCTGCTCGGCTGCGAGCTGACGTTGCCTCAAGTGGCG‑‑‑CAG‑‑‑ACCGTGATCCTCACCCGCTATGGCGACAGCTCGCCCATGCCGCcgg > 3:378046‑M2/1‑145 (MQ=255) cAAGCGCTGGGCATCGATTACCAGATCATCCCCGGCGTTACCGCCACGGCAGCGAGCGCCGCCCTGCTCGGCTGCGAGCTGACGTTGCCTCAAGTGGCG‑‑‑CAG‑‑‑ACCGTGATCCTCACCCGCTATGGCGACAGCTCGCCCATGCCGCcg > 6:194783‑M2/1‑145 (MQ=255) cAAGCGCTGGGCATCGATTACCAGATCATCCCCGGCGTTACCCCGACGGCAGCGAGCGCCGCCCTGCTCGGCTGCGAGCTGACGTTGCCTCTAGTGGCG‑‑‑CAG‑‑‑ACCGTGATCCTCACCCGCTATGGCGACAGCGCGCCCATGCCGCcggg > 2:38633‑M2/1‑145 (MQ=255) gcgcTGGGCATCGATTACCAGATCATCCCCGGCGTTACCGCCACGGCAGCGAGCGCCGCCCTGCTCGGCTGCGAGCTGACGTTGCCTCAAGTGGCG‑‑‑CAG‑‑‑ACCGTGATCCTCACCCGgcggcatgggcgagctgtcgccatagcgggtga < 1:410251‑M1/149‑34 (MQ=255) cgcTGGGCATCGATTACCAGATCATCCCCGGCGTTACCGCCACGGCAGCGAGCGCCGCCCTGCTCGGCTGCGAGCTGACGTTGCCTCAAGTGGCG‑‑‑CAG‑‑‑ACCGTGATCCTCACCCGgcggcatgggcgagctgtcgccatagcgggtgag < 5:29105‑M1/149‑35 (MQ=255) cgcTGGGCATCGATTACCAGATCATCCCCGGCGTTACCGCCACGGCAGCGAGCGCCGCCCTGCTCGGCTGCGAGCTGACGTTGCCTCAAGTGGCG‑‑‑CAG‑‑‑ACCGTGATCCTCACCCGCTATGGCGACAGCTCGCCCATGCCGCcgggtgag > 7:127198‑M2/1‑141 (MQ=255) cTGGGCATCGATTACCAGATCATCCCCGGCGTTACCGCCACGGCAGCGAGCGCCGCCCTGCTCGGCTGCGAGCTGACGTTGCCTCAAGTGGCG‑‑‑CAG‑‑‑ACCGTGATCCTCACCCGgcggcatgggcgagctgtcgccatagcgggtgagga < 5:308915‑M1/149‑37 (MQ=255) cATCGATTACCAGATCATCCCCGGCGTTACCGCCACGGCAGCGAGCGCCGCCCTGCTCGGCTGCGAGCTGACGTTGCCTCAAGTGGCG‑‑‑CAG‑‑‑ACCGTGATCCTCACCCGCTATGGCGACAGCTCGCCCATGCCGCC‑GGGTGAGCAGTTgg < 1:335350/149‑1 (MQ=255) cATCGATTACCAGATCATCCCCGGCGTTACCGCCACGGCAGCGAGCGCCGCCCTGCTCGGCTGCGAGCTGACGTTGCCTCAAGTGGCG‑‑‑CAG‑‑‑ACCGTGATCCTCACCCGCTATGGCGACAGCTCGCCCATGCCGCC‑GGGTGAGCAGTTgg > 4:183154/1‑149 (MQ=255) aTCGATTACCAGATCATCCCCGGCGTTACCGCCACGGCAGCGAGCGCCGCCCTGCTCGGCTGCGAGCTGACGTTGCCTCAAGTGGCG‑‑‑CAG‑‑‑ACCGTGATCCTCACCCGCTATGGCGACAGCTCGCCCATGCCGCC‑GGGTGAGCAGTTggg > 2:75774/1‑149 (MQ=255) aTTACCAGATCATCCCCGGCGTTACCGCCACGGCAGCGAGCGCCGCCCTGCTCGGCTGCGAGCTGACGTTGCCTCAAGTGGCG‑‑‑CAG‑‑‑ACCGTGATCCTCACCCGCTATGGCGACAGCTCGCCCATGCCGCC‑GGGTGAGCAGTTGGGTGAc > 5:388813/1‑149 (MQ=255) ccAGATCATCCCCGGCGTTACCGCCACGGCAGCGAGCGCCGCCCTGCTCGGCTGCGAGCTGACGTTGCCTCAAGTGGCG‑‑‑CAG‑‑‑ACCGTGATCCTCACCCGCTATGGCGACAGCTCGCCCATGCCGCcgggtga > 2:400072‑M2/1‑125 (MQ=255) ccAGATCATCCCCGGCGTTACCGCCACGGCAGCGAGCGCCGCCCTGCTCGGCTGCGAGCTGACGTTGCCTCAAGTGGCG‑‑‑CAG‑‑‑ACCGTGATCCTCACCCGCTATGGCGACAGCTCGCCCATGCCGCcgggtga < 1:400072‑M2/132‑8 (MQ=255) gATCATCCCCGGCGTTACCGCCACGGCAGCGAGCGCCGCCCTGCTCGGCTGCGAGCTGACGTTGCCTCAAGTGGCG‑‑‑CAG‑‑‑ACCGTGATCCTCACCCGCTATGGCGACAGCTCGCCCATGCCGCC‑GGGTGAGCAGTTGGGTGACCTGgcgc > 7:206372/1‑149 (MQ=255) tcCCCGGCGTTACCGCCACGGCAGCGAGCGCCGCCCTGCTCGGCTGCGAGCTGACGTTGCCTCAAGTGGCG‑‑‑CAG‑‑‑ACCGTGATCCTCACCCGCTATGGCGACAGCTCGCCCATGCCGCcgg < 4:409471‑M2/120‑4 (MQ=255) tcCCCGGCGTTACCGCCACGGCAGCGAGCGCCGCCCTGCTCGGCTGCGAGCTGACGTTGCCTCAAGTGGCG‑‑‑CAG‑‑‑ACCGTGATCCTCACCCGCTATGGCGACAGCTCGCCCATGCCGCcgg > 3:409471‑M2/1‑117 (MQ=255) cccGGCGTTACCGCCACGGCAGCGAGCGCCGCCCTGCTCGGCTGCGAGCTGACGTTGCCTCAAGTGGCG‑‑‑CAG‑‑‑ACCGTGATCCTCACCCGCTATGGCGACAGCTCGCCCATGCCGCC‑GGGTGAGCAGTTGGGTGACCTGGCGCGCCATgg > 5:421394/1‑149 (MQ=255) ccGGCGTTACCGCCACGGCAGCGAGCGCCGCCCTGCTCGGCTGCGAGCTGACGTTGCCTCAAGTGGCGCGCCAGGTCACCCAACTGCTCACCCGgcggcatgggcgagctgtcgccatagcgggtgaggatcacggtctgcgccacttg < 6:204574‑M1/149‑56 (MQ=255) ccGGCGTTACCGCCACGGCAGCGAGCGCCGCCCTGCTCGGCTGCGAGCTGACGTTGCCTCAAGTGGCG‑‑‑CAG‑‑‑ACCGTGATCCTCACCCGCTATGGCGACAGCTCGCCCATGCCGCC‑GGGTGAGCAGTTGGGTGACCTGGCGCGCCATgg > 8:205574/1‑148 (MQ=255) cGGCGTACCCGCCACGGCCGCGAGCGCCGCCCGGCTCGGCTGGGAGCTGACGTTGCCTCAAGTGGCG‑‑‑CAG‑‑‑ACCGTGATCCTCACCCGCTATGGCGACAGCTCGCCCATGCCGCC‑GGGTGAGCAGTTGGGTGACCTGGCGCGCCATGgca < 4:229308/149‑1 (MQ=255) gTTACCGCCACGGCAGCGAGCGCCGCCCTGCTCGGCTGCGAGCTGACGTTGCCTCAAGTGGCG‑‑‑CAG‑‑‑ACCGTGATCCTCACCCGCTATGGCGACAGCTCGCCCATGCCGCC‑GGGTGAGCAGTTGGGTGACCTGGCGCGCCATGGCAGCAc > 8:372376/1‑149 (MQ=255) aCCGCCACGGCAGCGAGCGCCGCCCTGCTCGGCTGCGAGCTGACGTTGCCTCAAGTGGCG‑‑‑CAG‑‑‑ACCGTGATCCTCACCCGCTATGGCGACAGCTCGCCCATGCCGCC‑GGGTGAGCAGTTGGGTGACCTGGCGCGCCATGGCAGCACCCt > 8:108300/1‑149 (MQ=255) cACGGCAGCGAGCGCCGCCCTGCTCGGCTGCGAGCTGACGTTGCCTCAAGTGGCG‑‑‑CAG‑‑‑ACCGTGATCCTCACCCGCTATGGCGACAGCTCGCCCATGCCGCC‑GGGTGAGCAGTTGGGTGACCTGGCGCGCCATGGCAGCACCCTGGCaa < 1:212675/149‑1 (MQ=255) gcgagcgCCGCCCTGCTCGGCTGCGAGCTGACGTTGCCTCAAGTGGCG‑‑‑CAG‑‑‑ACCGTGATCCTCACCCGCTATGGCGACAGCTCGCCCATGCCGCC‑GGGTGAGCAGTTGGGTGACCTGGCGCGCCATGGCAGCACCCTGGCAATTCATCt > 2:22395/1‑149 (MQ=255) agcgCCGCCCTGCTCGGCTGCGAGCTGACGTTGCCTCAAGTGGCG‑‑‑CAG‑‑‑ACCGTGATCCTCACCCGCTATGGCGACAGCTCGCCCATGCCGCC‑GGGTGAGCAGTTGGGTGACCTGGCGCGCCATGGCAGCACCCTGGCAATTCATCTggg < 8:206372/149‑1 (MQ=255) gcgcCGCCCTGCTCGGCTGCGAGCTGACGTTGCCTCAAGTGGCG‑‑‑CAG‑‑‑ACCGTGATCCTCACCCGCTATGGCGACAGCTCGCCCATGCCGCC‑GGGTGAGCAGTTGGGTGACCTGGCGCGCCATGGCAGCACCCTGGCAATTCATCTgggg < 7:205574/149‑1 (MQ=255) cggcgccCTGCTCGGCTGGGAGCTGACGTTGCCTCAAGTTGCG‑‑‑CAG‑‑‑ACCGTGATCCTCACCCGCTATGGCGACAGCTCGCCCATGCCGCCTGGGTGAGCAGTTGGGTGACCTGGCGCGCCATGGCAGCACCCTGGCAATTCATCCgggg < 1:125772/146‑1 (MQ=255) gccgccCTGCTCGGCTGCGAGCTGACGTTGCCTCAAGTGGCG‑‑‑CAG‑‑‑ACCGTGATCCTCACCCGCTATGGCGACAGCTCGCCCATGCCGCC‑GGGTGAGCAGTTGGGTGACCTGGCGCGCCATGGCAGCACCCTGGCAATTCATCTGGGGGt < 6:403808/149‑1 (MQ=255) gccCTGCTCGGCTGCGAGCTGACGTTGCCTCAAGTGGCG‑‑‑CAG‑‑‑ACCGTGATCCTCACCCGCTATGGCGACAGCTCGCCCATGCCGCC‑GGGTGAGCAGTTGGGTGACCTGGCGCGCCATGGCAGCACCCTGGCAATTCATCTGGGGGTCaa < 7:108300/149‑1 (MQ=255) ccTGCTCGGCTGCGAGCTGACGTTGCCTCAAGTGGCG‑‑‑CAG‑‑‑ACCGTGATCCTCACCCGCTATGGCGACAGCTCGCCCATGCCGCC‑GGGTGAGCAGTTGGGTGACCTGGCGCGCCATGGCAGCACCCTGGCAATTCATCTGGGGGTCAAg > 1:378538/1‑148 (MQ=255) cTCGGCTGCGAGCTGACGTTGCCTCAAGTGGCG‑‑‑CAG‑‑‑ACCGTGATCCTCACCCGCTATGGCGACAGCTCGCCCATGCCGCC‑GGGTGAGCAGTTGGGTGACCTGGCGCGCCATGGCAGCACCCTGGCAATTCATCTGGGGGTCAAGCAc < 5:137511/147‑1 (MQ=255) cGAGCTGACGTTGCCTCAAGTGGCG‑‑‑CAG‑‑‑ACCGTGATCCTCACCCGCTATGGCGACAGCTCGCCCATGCCGCC‑GGGTGAGCAGTTGGGTGACCTGGCGCGCCATGGCAGCACCCTGGCAATTCATCTGGGGGTCAAGCACCTGTCgcgc < 6:421394/148‑1 (MQ=255) aGCTGACGTTGCCTCAAGTGGCG‑‑‑CAG‑‑‑ACCGTGATCCTCACCCGCTATGGCGACAGCTCGCCCATGCCGCC‑GGGTGAGCAGTTGGGTGACCTGGCGCGCCATGGCAGCACCCTGGCAATTCATCTGGGGGTCAAGCACCTGTCGCGCAtt < 6:388813/149‑1 (MQ=255) cGTTGCCTCAAGTGGCG‑‑‑CAG‑‑‑ACCGTGATCCTCACCCGCTATGGCGACAGCTCGCCCATGCCGCC‑GGGTGAGCAGTTGGGTGACCTGGCGCGCCATGGCAGCACCCTGGCAATTCATCTGGGGGTCAAGCACCTGTCGCGCATTGTCGCt < 2:378538/149‑1 (MQ=255) ttGCCTCAAGTGGCG‑‑‑CAG‑‑‑ACCGTGATCCTCACCCGCTATGGCGACAGCTCGCCCATGCCGCC‑GGGTGAGCAGTTGGGTGACCTGGCGCGCCATGGCAGCACCCTGGCAATTCATCTGGGGGTCAAGCACCTGTCGCGCATTGTCGCTGa < 1:22395/149‑1 (MQ=255) tGCCTCAAGTGGCG‑‑‑CAG‑‑‑ACCGTGATCCTCACCCGCTATGGCGACAGCTCGCCCATGCCGCC‑GGGTGAGCAGTTGGGTGACCTGGCGCGCCATGGCAGCACCCTGGCAATTCATCTGGGGGTCAAGCACCTGTCGCGCATTGTCGCTGa < 3:183154/148‑1 (MQ=255) tGCCTCAAGTGGCG‑‑‑CAG‑‑‑ACCGTGATCCTCACCCGCTATGGCGACAGCTCGCCCATGCCGCC‑GGGTGAGCAGTTGGGTGACCTGGCGCGCCATGGCAGCACCCTGGCAATTCATCTGGGGGTCAAGCACCTGTCGCGCATTGTCGCTGAg > 2:284965/1‑149 (MQ=255) gCCTCAAGTGGCG‑‑‑CAG‑‑‑ACCGTGATCCTCACCCGCTATGGCGACAGCTCGCCCATGCCGCC‑GGGTGAGCAGTTGGGTGACCTGGCGCGCCATGGCAGCACCCTGGCAATTCATCTGGGGGTCAAGCACCTGTCGCGCATTGTCGCTGAGt > 1:415934/1‑149 (MQ=255) cTCAAGTGGCG‑‑‑CAG‑‑‑ACCGTGATCCTCACCCGCTATGGCGACAGCTCGCCCATGCCGCC‑GGGTGAGCAGTTGGGTGACCTGGCGCGCCATGGCAGCACCCTGGCAATTCATCTGGGGGTCAAGCACCTGTCGCGCATTGTCGCTGAGtt > 3:154745/1‑148 (MQ=255) cTCAAGTGGCG‑‑‑CAG‑‑‑ACCGTGATCCTCACCCGCTATGGCGACAGCTCGCCCATGCCGCC‑GGGTGAGCAGTTGGGTGACCTGGCGCGCCATGGCAGCACCCTGGCAATTCATCTGGGGGTCAAGCACCTGTCGCGCATTGTCGCTGAGtt > 3:347177/1‑148 (MQ=255) cTCAAGTGACG‑‑‑CAG‑‑‑ACCGTGATCCTCACCCGCTATGGCGACAGCTCGCCCATGCCGCC‑GGGTGAGCAGTTGGGTGACCTGGCGCGCCATGGCAGCACCCTGGCAATTCATCTGGGGGTCAAGCACCTGTCGCGCATTGTCGCTGAGtt > 5:298603/1‑148 (MQ=255) cAAGTGGCG‑‑‑CAG‑‑‑ACCGTGATCCTCACCCGCTATGGCGACAGCTCGCCCATGCCGCcgggtgagcagttgggtgacctggcgcgccacttgaggcaacgtcagctcgcagccgagcagggcggcgctcgctgccgtggcggtaacgccgg < 6:204574‑M2/149‑95 (MQ=255) aaGTGGCG‑‑‑CAG‑‑‑ACCGTGATCCTCACCCGCTATGGCGACAGCTCGCCCATGCCGCC‑GGGTGAGCAGTTGGGTGACCTGGCGCGCCATGGCAGCACCCTGGCAATTCATCTGGGGGTCAAGCACCTGTCGCGCATTGTCGCTGAGTTGATg > 6:302427/1‑149 (MQ=255) g‑‑‑cAG‑‑‑ACCGTGATCCTCACCCGCTATGGCGACAGCTCGCCCATGCCGCC‑GGGTGAGCAGTTGGGTCACCTCGCGCGCCATGGCAGCACCCTGGCAAGTCATCTGGGGGTCAAGCACCTGTCGCGCATTGTCGCTGAGTTGATGCCGCAc > 7:182274/1‑148 (MQ=255) g‑‑‑cAG‑‑‑ACCGTGATCCTCACCCGCTACGGCGACAGCTCGCCCATGCCGCC‑GGGTGAGCAGTTGGGTGACCTGGCGCGCCATGGCAGCACCCTGGCAATTCATCTGGGGGTCAAGCACCTGTCGCGCATTGTCGCTGAGTTGATGCCGCAc > 2:89379/1‑148 (MQ=255) aCCGTGATCCTCACCCGCTATGGCGACAGCTCGCCCATGCCGCC‑GGGTGAGCAGTTGGGTGACCTGGCGCGCCATGGCAGCACCCTGGCAATTCATCTGGGGGTCAAGCACCTGTCGCGCATTGTCGCTGAGTTGATGCCGCACTACgg > 3:384193/1‑149 (MQ=255) cGTGATCCTCACCCGCTATGGCGACAGCTCGCCCATGCCGCC‑GGGTGAGCAGTTGGGTGACCTGGCGCGCCATGGCAGCACCCTGGCAATTCATCTGGGGGTCAAGCACCTGTCGCGCATTGTCGCTGAGTTGATGCCGCACTACGgcg > 5:303535/1‑149 (MQ=255) cGTGATCCTCACCCGCTATGGCGACAGCTCGCCCATGCCGCC‑GGGTGAGCAGTTGGGTGACCTGGCGCGCCATGGCAGCACCCTGGCAATTCATCTGGGGGTCAAGCACCTGTCGCGCATTGTCGCTGAGTTGATGCCGCACTACGgcg > 7:371135/1‑149 (MQ=255) cGTGATCCTCACCCGCTATGGCGACAGCTCGCCCATGCCGCC‑GGGTGAGCAGTTGGGTGACCTGGCGCGCCATCGCAGCACCCTGGCAATTCATCTGGGGGTCACGCACCTGTCGCGCATTGTCGCAGAGTTGATGCCGCACTACGgcg > 5:308913/1‑149 (MQ=255) gATCCTCACCCGCTATGGCGACAGCTCGCCCATGCCGCC‑GGGTGAGCAGTTGGGTGACCTGGCGCGCCATGGCAGCACCCTGGCAATTCATCTGGGGGTCAAGCACCTGTCGCGCATTGTCGCTGAGTTGATGCCGCACTACGgcgcgc > 6:39987/1‑149 (MQ=255) tCCTCACCCGCTATGGCGACAGCTCGCCCATGCCGCcgggtgaggatcacggtctgcgccacttgaggcaacgtcagctcgcagccgagcagggcggcgctcgctgccgtggcggtaacgccggggatgatctggtaatcgatgcccag < 5:308915‑M2/149‑114 (MQ=255) ccTCACCCGCTATGGCGACAGCTCGCCCATGCCGCC‑GTGTGAGCAGTTGGGTGACCTGGCGCGCCATGGCAGCACCCTGGCAATTCATCTGGGGGTCAAGCACCTGTCGCGCATTGTCGCTGAGTTGATGCCGCACTACGGCGCGCACt > 1:297080/1‑149 (MQ=255) ccTCACACGCTATGGCGACAGCTCGCCAATGCCGCG‑GGGTCAGCAGAAGGGTGACCTGGCGCGCCCTGCCAGCACCCTGGCAAGTCATCTGGGGCTCAACCAGCAGTCGCGGATTGTCGCTGAGTTGATGCCGCACTACGGCGCGCCCt > 3:266318/1‑149 (MQ=255) cTCACCCGgcggcatgggcgagctgtcgccatagcgggtgaggatcacggtctgcgccacttgaggcaacgtcagctcgcagccgagcagggcggcgctcgctgccgtggcggtaacgccggggatgatctggtaatcgatgcccagcg > 7:127198‑M1/1‑8 (MQ=255) cTCACCCGCTATGGCGACAGCTCGCCCATGCCGCcgggtgaggatcacggtctgcgccacttgaggcaacgtcagctcgcagccgagcagggcggcgctcgctgccgtggcggtaacgccggggatgatctggtaatcgatgcccagcg < 5:29105‑M2/149‑116 (MQ=255) tCACCCGgcggcatgggcgagctgtcgccatagcgggtgaggatcacggtctgcgccacttgaggcaacgtcagctcgcagccgagcagggcggcgctcgctgccgtggcggtaacgccggggatgatctgg < 1:400072‑M1/132‑126 (MQ=255) tCACCCGgcggcatgggcgagctgtcgccatagcgggtgaggatcacggtctgcgccacttgaggcaacgtcagctcgcagccgagcagggcggcgctcgctgccgtggcggtaacgccggggatgatctgg > 2:400072‑M1/1‑7 (MQ=255) tCACCCGCTATGGCGACAGCTCGCCCATGCCGCcgggtgaggatcacggtctgcgccacttgaggcaacgtcagctcgcagccgagcagggcggcgctcgctgccgtggcggtaacgccggggatgatctggtaatcgatgcccagcgc < 1:410251‑M2/149‑117 (MQ=255) tCACCCGCTATGGCGACAGCTCGCCCATGCCGCC‑GGGTGAGCAGTTGGGTGACCTGGCGCGCCATGGCAGCACCCTGGCAATTCATCTGGGGGTCAAGCACCTGTCGCGCATTGTCGCTGAGTTGATGCCGCACTACGGCGCGCACTGc > 4:173878/1‑149 (MQ=255) cccGgcggcatgggcgcgctgtcgccatagcgggtgaggatcacggtctgcgccactagaggcaacgtcagctcgcagccgagcagggcggcgctcgctgccgtcggggtaacgccggggatgatctggtaatcgatgcccagcgcttg > 2:38633‑M1/1‑4 (MQ=255) ccGgcggcatgggcgagctgtcgccatagcgggtgaggatcacggtctgcgccacttgaggcaacgtcagctcgcagccgagcagggcggcgctcgctgccgtggcggtaacgccggggatgatctggtaatcgatgcccagcgcttg > 3:378046‑M1/1‑3 (MQ=255) ccGgcggcatgggcgagctgtcgccatagcgggtgaggatcacggtctgcgccacttgaggcaacgtcagctcgcagccgagcagggcggcgctcgctgccgtggcggtaacgccgggga > 3:409471‑M1/1‑3 (MQ=255) ccGgcggcatgggcgagctgtcgccatagcgggtgaggatcacggtctgcgccacttgaggcaacgtcagctcgcagccgagcagggcggcgctcgctgccgtggcggtaacgccgggga < 4:409471‑M1/120‑118 (MQ=255) cggcggcatgggcgagctgtcgccatagcgggtgaggatcacggtctgcgccacttgaggcaacgtcagctcgcagccgagcagggcggcgctcgctgccgtggcggtaacgccggggatgatctggtaatcgatgcccagcgcttg > 6:194783‑M1/1‑2 (MQ=255) | TCGGTGAGCAGATTCGCCACCTGCAAGCGCTGGGCATCGATTACCAGATCATCCCCGGCGTTACCGCCACGGCAGCGAGCGCCGCCCTGCTCGGCTGCGAGCTGACGTTGCCTCAAGTGGCG‑‑‑CAG‑‑‑ACCGTGATCCTCACCCGCTATGGCGACAGCTCGCCCATGCCGCC‑GGGTGAGCAGTTGGGTGACCTGGCGCGCCATGGCAGCACCCTGGCAATTCATCTGGGGGTCAAGCACCTGTCGCGCATTGTCGCTGAGTTGATGCCGCACTACGGCGCGCACTGCCC > NC_002947/3859432‑3859717 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |