| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 5492556 | 69 (0.960) | 4 (0.060) | 4/260 | NT | 5.5% | coding (1460/1698 nt) | cobJ | precorrin‑3B C17‑methyltransferase |
| ? | NC_002947 | = 5492606 | 71 (1.020) | coding (1410/1698 nt) | cobJ | precorrin‑3B C17‑methyltransferase | |||||
CCATGGTGCGCATGTCGACCATTTCTGGCAGCAGTTCGGCCAAGGTGACTACCTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCTGGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCAGGCGCTTTTCAATGATCGACCAGGGCTTGAGGTTGTCCGACAGCGACATCACGCAGAAGTCATGCCCCAGCGGT > NC_002947/5492410‑5492702 | ccATGGTGCGCATGTCGACCATTTCTGGCAGCAGTTCGGCCAAGGTGACTACCTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGACCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGc > 7:106318/1‑149 (MQ=255) cATGGTGCGCATGTCGACCATTTCTTGCAGCAGTTCTGCCAAGGTGACTACCTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCCTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCt > 6:434829/1‑149 (MQ=255) cATGGTGCGCATGTCGACCATTTCTGGCAGCAGTTCGGCCAAGGTGACTACCTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCt > 2:205554/1‑149 (MQ=255) aTGGTGCGCATGTCGACCATTTCTGGCAGCAGTTCGGCCAAGGTGACTACCTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCTg > 6:326507/1‑149 (MQ=255) gTGCGCATGTCGACCATTTCTGGCAGCAGTTCGGCCAAGGTGACTACCTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCTGGt < 1:96263/148‑1 (MQ=255) cgcATGTCGACCATTTCTGGCAGCAGTTCGGCCAAGGTGACTACCTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCTGGTGCgg < 7:333978/149‑1 (MQ=255) gcATGTCGACCATTTCTGGCAGCAGTTCGGCCAAGGTGACTACCTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCTGGTGCggc < 5:154432/149‑1 (MQ=255) tGTCGACCATTTCTGGCAGCAGTTCGGCCAAGGTGACTACCTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCTGGTGCggcctg > 8:321637/1‑149 (MQ=255) tCGACCATTTCTGGCAGCAGTTCGGCCAAGGTCACTACCTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGACACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTGACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCCAGCTGGTGCggcctggc > 3:73730/1‑149 (MQ=255) gACCATTTCTGGCAGCAGTTCGGCCAAGGTGACTACCTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAcctggtgctggccttcta > 4:396718‑M1/1‑131 (MQ=255) cATTTCTGGCAGCAGTTCGGCCAAGGTGACTACCTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCTGGTGCGGCCTGGCCTTgg < 8:240381/149‑1 (MQ=255) gcagcaTTTCGGCCAAGGTGACTACCTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCTGGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCggg < 8:174726/149‑1 (MQ=255) gcagTTCGGCCAAGGTGACTACCTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCTGGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTg > 5:383838/1‑149 (MQ=255) gcagTTCGGCCAAGGGGACTACCTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCTGGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTg < 3:408709/149‑1 (MQ=255) cagTTCGGCCAAGGTGACTACCTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCTGGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGt < 5:88106/149‑1 (MQ=255) agTTCGGCCAAGGTGACTACCTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCTGGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTg > 1:401240/1‑147 (MQ=255) agTTCGGCCAAGGTGACTACCTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCTGGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTg > 1:394908/1‑147 (MQ=255) cGGCCAAGGTGACTACCTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCTGGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGaa < 6:78935/148‑1 (MQ=255) ggCCAAGGTGACTACCTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTTACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCGCAACCTCCAGGGCCACACCGAGCTGGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAgg > 6:390369/1‑149 (MQ=255) ggCCAAGGTGACTACCTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCTGGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAg < 5:35512/148‑1 (MQ=255) ggTGACTACCTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTAGAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCTGGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCa < 8:237396/149‑1 (MQ=255) ggTGACTACCTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAcctggtgctggccttctacaacccgatctccaaggccaggccgca < 1:29349‑M1/149‑46 (MQ=255) ggTGACTACCTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCTGGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCa > 1:219964/1‑149 (MQ=255) tGACTACCTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCTGGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGcc > 2:97589/1‑143 (MQ=255) tGACTACCTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCTGGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGcc < 1:97589/143‑1 (MQ=255) ccTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAcctggtgctggccttctacaacccgatctccaaggccaggccgcaccagctcg < 3:396718‑M1/149‑54 (MQ=255) cTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAcctggtgctggccttctacaacccgatctccaaggccaggccgcaccagctcgg < 1:420650‑M1/149‑55 (MQ=255) ttCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGGTGGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGt > 1:356467/1‑124 (MQ=255) ttCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCTGGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGt < 2:356467/124‑1 (MQ=255) tCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCTGGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGcc > 7:168686/1‑149 (MQ=255) tCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCTGGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGcc > 7:381744/1‑149 (MQ=255) ccccGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCTGGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGc < 6:222121/147‑1 (MQ=255) cccGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCTGGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAg < 7:13476/149‑1 (MQ=255) cccGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGGCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCTGGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAg < 3:255258/149‑1 (MQ=255) ccTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACTGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCTCGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTc > 6:400653/1‑147 (MQ=255) ccTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCTGGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCa < 7:321637/149‑1 (MQ=255) cTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCTGGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCAg > 2:200846/1‑149 (MQ=255) tCACGGCCAAGGACTACTGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCTGGTGCGGCGTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTTGGTCTGGGCAGCCAGGTCCAGGTGCTTTTc < 8:65596/149‑1 (MQ=255) aCGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCTGGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCAGGCGCTTTTCaa > 7:240414/1‑149 (MQ=255) 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tgtTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCTGGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCAGGCGCTTTTCAATGATCGACCAGGGCTTGAgg < 5:434829/149‑1 (MQ=255) cGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCTGGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCAGGCGCTTTTCAATGATCGACCAGGGCTTGAGGTTGTCCGACAg > 4:348927/1‑149 (MQ=255) cGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCTGGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCAGGCGCTTTTCAATGATCGACCAGGGCTTGAGGTTGTCCGACAg > 7:58689/1‑149 (MQ=255) gATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCTGGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCAGGCGCTTTTCAATGATCGACCAGGGCTTGAGGTTGTCCGACAGc < 1:323489/149‑1 (MQ=255) aTGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCTGGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCAGGCGCTTTTCAATGATCGACCAGGGCTTGAGGTTGTCCGACAGCg < 6:383838/149‑1 (MQ=255) 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aCCTCCAGGGCCACACCGAGCTGGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCAGGCGCTTTTCAATGATCGACCAGGGCTTGAGGTTGTCCGACAGCGACATCACGCAGaa < 2:394908/149‑1 (MQ=255) aCCTCCAGGGCCACACCGAGCTGGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCAGGCGCTTTTCAATGATCGACCAGGGCTTGAGGTTGTCCGACAGCGACATCACGCAGaa < 2:401240/149‑1 (MQ=255) ccTCCAGGGCCACACCGAGCTGGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCAGGCGCTTTTCAATGATCGACCAGGGCTTGAGGTTGTCCGACAGCGACATCACGCAGAAg > 7:392211/1‑149 (MQ=255) tCCAGGGCCACACCGAGCTGGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCAGGCGCTTTTCAATGATCGCCCAGGGCTTGAGGTTGTCCGACAGCGACATCACGCAGAAGt > 7:71165/1‑148 (MQ=255) cAGGGCCACACCGATCTGTTGCGTCCTGGCCTTTGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCAGGCGCTTTTCAATGATCGACCAGGGCTTGAGGTTGTCCGACAGCGACATCACGCAGAAGTc < 6:87740/147‑1 (MQ=255) 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cGAGCTGGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCAGGCGCTTTTCAATGATCGACCAGGGCTTGAGGTTGTCCGACAGCGACATCACGCAGAAGTCATGCCCCAGCGGt > 3:217212/1‑149 (MQ=255) cGAGCTGGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCAGGCGCTTTTCAATGATCGACCAGGGCTTGAGGTTGTCCGACAGCGACATCACGCAGAAGTCATGCCCCAGCGGt > 5:217926/1‑149 (MQ=255) | CCATGGTGCGCATGTCGACCATTTCTGGCAGCAGTTCGGCCAAGGTGACTACCTTCAGCGTCTGCCCCGGCCTACCGATGTCACGGCCAAGGACTACAGGCGTGTTCCCGTCACGATGTCGGCGCACAACCTCCAGGGCCACACCGAGCTGGTGCGGCCTGGCCTTGGAGATCGGGTTGTAGAAGGCCAGCACCAGGTCGGCCTGGGCAGCCAGGTCCAGGCGCTTTTCAATGATCGACCAGGGCTTGAGGTTGTCCGACAGCGACATCACGCAGAAGTCATGCCCCAGCGGT > NC_002947/5492410‑5492702 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |