New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 5976554 | 93 (1.300) | 5 (0.070) | 5/252 | NT | 5.4% | coding (355/1491 nt) | yifB | ATP‑dependent chelatase |
? | NC_002947 | = 5976597 | 88 (1.310) | coding (398/1491 nt) | yifB | ATP‑dependent chelatase |
Only 100 of 124 total aligned reads displayed.
GCCCCCGCCGACCTGCCCAAGGATGGCGGCCGATATGACCTGGCCATCGCCCTGGGCATCCTCGCCGCCGACGGCCAGGTGCCGATTGCCACCCTGACCGATATGGAATGCCTGGGCGAACTGGCCCTGTCGGGGAAATTGCGCCCGGTGCAGGGCGTGCTACCTGCGGCACTGGCGGCACGCGAAGCAGGCCGGGCGCTGGTGGTACCACGGGAAAATGCCGAGGAAGCCAGCCTGGCCGGCGGGTTGGTGGTGTATGCGGTGGGCCACCTGCTGGAGTTGGTCGCCCACCTGA > NC_002947/5976407‑5976701 | gCCCCCGCCGACCTGCCCAAGGATGGCGGCCGATATGACCTGGCCATCGCCCTGGGCATCCTCGCCGCCGACGGCCAGGTGCCGATTGCCACCCTGACCGATATGGAATGCCTGGGCGAACTGGCCCTGTCGGGGAAATTGCGCCCGGt < 1:391791/149‑1 (MQ=255) ccccGCAGACCTGCCCAAGGATGTCGGCCGATATGCCGTTGGCATCGCCCTGGGGATCCTCGCCGACGACGGCAAGGTGCCGATTTCCACCCTGACAGATATGTAATGCCTGGGCGAAGTTGCCCTGTCGGGGAAATTGCTCCCGGTg < 8:247679/148‑1 (MQ=255) gACCTGCCCAAGGATGGCGGCCGATATGACCTGGCCATCGCCCTGGGCATCCTCGCCGCCGACGGCCAGGTGCCGATTGCCACCCTGACCGATATGGAATGCCTGGGCGAACTGGCCCTGTCGGGGAAATTGCGCCCGGTGCAGGGCGt < 5:55671/149‑1 (MQ=255) gCCCAAGGATGGCGGCCGATATGACCTGGCCATCGCCCTGGGCATCCTCGCCGCCGACGGCCAGGTGCCGATTGCCACCCTGACCGATATGGAATGCCTGGGCGAACTGGCCCTGTCGGGGTAATTGCGCCCGGTGCAGGGCGTGCTAc > 8:214375/1‑149 (MQ=255) cccAAGGATGGCGGCCGATATGACCTGGCCATCGCCCTGGGCATCCTCGCCGCCGACGGCCAGGTGCCGATTGCCACCCTGACCGATATGGAATGCCTGGGCGAACTGGCCCTGTCGGGGAAATTGCGCCCGGTGCAGGGCGTGCTAcc > 3:133727/1‑149 (MQ=255) cccAAGGATGGCGGCCGATATGACCTGGCCATCGCCCTGGGCATCCTCGCCGCCGACGGCCAGGTGCCGATTGCCACCCTGACCGATATGGAATGCCTGGGCGAACTGGCCCTGTCGGGGAAATTGCGCCCGGTGCAGGGCGTGCTAc < 2:377061/148‑1 (MQ=255) cAAGGATGGCGGCCGATATGACCTGGCCATCGCCCTGGGCATCCTCGCCGCCGACGGCCAGGTGCCGATTGCCACCCTGACCGATATGGAATGCCTGGGCGAACTGGCCCTGTCGGGGAAATTGCGCCCGGTGCAGGGCGTGCTACCTg > 5:37663/1‑149 (MQ=255) aaGGATGGCGGCCGATATGACCTGGCCATCGCCCTGGGCATCCTCGCCGCCGACGGCCAGGTGCCGATTGCCACCCTGACCGATATGGAATGCCTGGGCGAACTGGCCCTGTCGGGGAAATTGCGCCCGGTGCAGGGCGTGCTACCTGc < 2:334778/149‑1 (MQ=255) aaGGATGGCGGCCGATATGACCTGGCCATCGCCCTGGGCATCCTCGCCGCCGACGGCCAGGTGCCGATTGCCACCCTGACCGATATGGAATGCCTGGGCGAACTGGCCCTGTCGGGGAAATTGCGCCCGGTGCAGGGCGTGCTACCTGc > 8:106615/1‑149 (MQ=255) aGGATGGCGGCCGATATGACCTGGCCATCGCCCTGGGCATCCTCGCCGCCGACGGCCAGGTGCCGATTGCCACCCTGACCGATATGGAATGCCTGGGCGAACTGGCCCTGTCGGGGAAATTGCGCCCGGTGCAGGGCGTGCTACCTGCg > 2:275679/1‑149 (MQ=255) gATGGCGGCCGATATGACCTGGCCATCGCCCTGGGCATCCTCGCCGCCGACGGCCAGGTGCCGATTGCCACCCTGACCGATATGGAATGCCTGGGCGAACTGGCCCTGTCGGGGAAATTGCGCCCGGTGCAGGGCGTGCTACCTGCgg > 5:286256/1‑148 (MQ=255) tGGCGGCCGATATGACCTGGCCATCGCCCTGGGCATCCTCGCCGCCGACGGCCAGGTGCCGATTGCCACCCTGACCGATATGGAATGCCTGGGCGAACTGGCCCTGTCGGGGAAATTGCGCCCGGTGCAGGGCGTGCTACCTGCGGCAc > 7:402037/1‑149 (MQ=255) tGGCGGCCGATATGACCTGGCCATCGCCCTGGGCATCCTCGCCGCCGACGGCCAGGTGCCGATTGCCACCCTGACCGATATGGAATGCCTGGGCGAACTGGCCCTGTCGGGGAAATTGCGCCCGGTGCAGGGCGTGCTACCTGCGGCAc > 2:205625/1‑149 (MQ=255) gcggcCGATATGACCTGGCCATCGCCCTGGGCATCCTCGCCGCCGACGGCCAGGTGCCGATTGCCACCCTGACCGATATGGAATGCCTGGGCGAACTGGCCCTGTCGGGGAAATTGCGCCCGGTGCAGGGCGTGCTACCt > 6:50437/1‑140 (MQ=255) gcggcCGATATGACCTGGCCATCGCCCTGGGCATCCTCGCCGCCGACGGCCAGGTGCCGATTGCCACCCTGACCGATATGGAATGCCTGGGCGAACTGGCCCTGTCGGGGAAATTGCGCCCGGTGCAGGGCGTGCTACCt < 5:50437/140‑1 (MQ=255) ggcCGATATGACCTGGCCATCGCCCTGGGCATCCTCGCCGCCGACGGCCAGGTGCCGATTGCCACCCTGACCGATATGGAATGCCTGGGCGAACTGGCCCTGACGGGGAAATTGCGCCCGGTGCAGGGCGTGCTACCTGCGGCACTggc > 4:149093/1‑149 (MQ=255) gcCGATATGACCTGGCCATCGCCCTGGGCATCCTCGCCGCCGACGGCCAGGTGCCGATTGCCACCCTGACCGATATGGAATGCCTGGGCGAACTGGCCCTGTCGGGGAAATTGCGCCCGGTGCAGGGCGTGCTACCTGCGGCACTggcg < 3:1735/149‑1 (MQ=255) ccGATATGACCTGGCCATCGCCCTGGGCATCCTCGCCGCCGACGGCCAGGTGCCGATTGCCACCCTGACCGATATGGAATGCCTGGGCGAACTGGCCCTGTCGGGGAAATTGCGCCCGGTGCAGGGCGTGCTACCTGCGGCACTggcgg < 7:106615/149‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) cTGGGCATCCTCGCCGCCGACGGCCAGGTGCCGATTGCCACCCTGACCGATATGGAATGCCTGGGCGAACTGGCCCTGTCGGGGAAATTGCGCCCGGTGCAGGGCGTGCTACCTGCGGCACTGGCGGCACGCGAAGCAGGCCGGGCGCt < 5:388920/149‑1 (MQ=255) tGGGCATCCTCGCCGCCGACGGCCAGGTGCCGATTGCCACCCTGACCGATATGGAATGCCTGGGCGAACTGGCCCTGTCGGGGAAATTGCGCCCGGTGCAGGGCGTGCTACCTGCGGCACTGGCGGCACGCGAAGCAGGCCGGGCGCtg > 6:200043/1‑149 (MQ=255) gggCATCCTCGCCGCCGACGGCCAGGTGCCGATTGCCACCCTGACCGATATGGAATGCCTGGGCGAACTGGCCCTGTCGGGGAAATTGCGCCCGGTGCAGGGCGTGCTACCTGCGGCACTGGCGGCACGCGAAGCAGGCCGGGCGCtgg > 8:40580/1‑149 (MQ=255) ggCATCCTCGCCGCCGACGGCCAGGTGCCGATTGCCACCCTGACCGATATGGAATGCCTGGGCGAACTGGCCCTGTCGGGGAAATTGCGCCCGGTGCAGGGCGTGCTACCTGCGGCACTGGCGGCACGCGAAGCAGGCCGGGCGCtggt > 7:64153/1‑149 (MQ=255) ggCATCCTCGCCGCCGACGGCCAGGTGCCGATTGCCACCCTGACCGATATGGAATGCCTGGGCGAACTGGCCCTGTCGGGGAAATTGCGCCCGGTGCAGGGCGTGCTACCTGCGGCACTGGCGGCACGCGAAGCAGGCCGGGCGCtggt < 4:212566/149‑1 (MQ=255) 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gggAAATTGCGCCCGGTGCAGGGCGTGCTACCTGCGGCACTGGCGGCACGCGAAGCAGGCCGGGCGCTGGTGGTACCACGGGAAAATGCCGAGGAAGCCAGCCTGGCCGGCGGGTTGGTGGTGTATGCGGTGGGCCACCTGCTGGAGtt > 5:162690/1‑149 (MQ=255) ggAAATTGCGCCCGGTGCAGGGCGTGCTACCTGCGGCACTGGCGGCACGCGAAGCAGGCCGGGCGCTGGTGGTACCACGGGAAAATGCCGAGGAAGCCAGCCTGGCCGGCGGGTTGGTGGTGTATGCGGTGGGCCACCTGCTGGAGTTg > 3:132487/1‑149 (MQ=255) ggAAATTGCGCCCGGTGCAGGGCGTGCTACCTGCGGCACTGGCGGCACGCGAAGCAGGCCGGGCGCTGGTGGTACCACGGGAAAATGCCGAGGAAGCCAGCCTGGCCGGCGGGTTGGTGGTGTATGCGGTGGGCCACCTGCTGGAGTTg > 2:278523/1‑149 (MQ=255) cgctcctgcgcccGGTGCAGGGCGTGCTACCTGCGGCACTGGCGGCACGCGAAGCAGGccgggcgcaatttccccgacagggccagttcgcccaggcattccatatcggtcagggtggcaatcggcacctggccgtcggcggcgaggat > 3:410625‑M2/7‑58 (MQ=255) aaTTGCGCCCGGTGCAGGGCGTGCTACCTGCGGCACTGGCGGCACGCGAAGCAGGCCGGGCGCTGGTGGTACCACGGGAAAATGCCGAGGAAGCCAGCCTGGCCGGCTGGTTGGTGGTGTATGCGGTGGGCCACCTGCTGGAGTTGGTc < 4:272907/149‑1 (MQ=255) aaTTGCGCCCGGTGCAGGGCGTGCTACCTGCGGCACTGGCGGCACGCGAAGCAGGCCGGGCGCTGGTGGTACCACGGGAAAATGCCGAGGAAGCCAGCCTGGCCGGCGGGTTGGTGGTGTATGCGGTGGGCCACCTGCTGGAGTTGGTc < 1:275679/149‑1 (MQ=255) ttGCGCCCGGTGCAGGGCGTGCTACCTGCGGCACTGGCGGCACGCGAAGCAGGCCGGGCGCTGGTGGTACCACGGGAAAATGCCGAGGAAGCCAGCCTGGCCGGCGGGTTGGTGGTGTATGCGGTGGGCCACCTGCTGGAGTTGGTCGc < 7:304324/149‑1 (MQ=255) gcgcCCGGTGCAGGGCGTGCTACCTGCGGCACTGGCGGCACGCGAAGCAGGCCGGGCGCTGGTGGTACCACGGGAAAATGCCGAGGAAGCCAGCCTGGCCGGCGGGTTGGTGGTGTATGCGGTGGGCCACCTGCTGGAGTTGGTCGccc > 7:393310/1‑149 (MQ=255) cgcCCGGcctgcttcgcgtgccgccagtgccgcaggtagcacgccctgcaccgggcgcaatttccccgacagggccagttcgcccaggcattccatatcggtcagggtggcaatcggcacctggccgtcggcggtgaggatgcccaggg < 2:139453‑M1/149‑143 (MQ=255) gcCCGGcctgcttcgcgtgccgccagtgccgcaggtagcacgccctgcaccgggcgcaatttccccgacagggccagttcgcccaggcattccatatcggtcagggtggcaatcggcacctggccgtcggcggcgaggatgcccagggc < 4:41476‑M1/149‑144 (MQ=255) cccGGcctgcttcgcgtgccgccagtgccgcaggtagcacgccctgcaccgggcgcaatttccccgacagggccagttcgcccaggcattccataacggtcagggtggcaatcggcacctggccgtcggcggcgaggatgcccagggc > 1:358060‑M1/1‑5 (MQ=255) cccGGTGCAGGGCGTGCTACCTGCGGCACTGGCGGCACGCGAAGCAGGCCGGGCGCTGGTGGTACCACGGGAAAATGCCGAGGAAGCCAGCCTGGCCGGCGGGTTGGTGGTGTATGCGGTGGGCCACCTGCTGGAGTTGGTCGCCCAcc < 6:37663/149‑1 (MQ=255) cccGGTGCAGGGCGTGCTACCTGCGGCACTGGCGGCACGCGAAGCAGGCCGGGCGCTGGTGGTACCACGGGAAAATGCCGAGGAAGCCAGCCTGGCCGGCGGGTTGGTGGTGTATGCGGTGGGCCACCTGCTGGAGTTGGTCGCCCAcc > 8:341535/1‑149 (MQ=255) cccGGTGCAGGGCGTGCTACCTGCGGCACTGGCGGCACGCGAAGCAGGCCGGGCGCTGGTGGTACCACGGGAAAATGCCGAGGAAGCCAGCCTGGCCGGCGGGTTGGTGGTGTATGCGGTGGGCCACCTGCTGGAGTTGGTCGCCCAcc > 5:19630/1‑149 (MQ=255) cGGcctgcttcgcgtgccgccagtgccgcaggtagcacgccctgcaccgggcgcaatttccccgacagggccagttcgcccaggcattccatatcggtcagggtggcaatcggcacctggccgtcggcggcgaggatgcccagggcgat < 6:259723‑M1/149‑147 (MQ=255) cGGTGCAGGGCGTGCTACCTGCGGCACTGGCGGCACGCGAAGTAGGccgggcgcaatttccccgacagggccagttcgcccaggcattccatatcggtcagggtggcaatcggcacctggccgtcggcggcgaggatgcccagggcgat < 5:228448‑M2/149‑104 (MQ=255) ggcctgcttcgcgtgccgccagtgccgcaggtagcacgccctgcaccgggcgcaatttccccgacagggccagttcgcccaggcattccatatcggtcagggtggcaatcggcacctggccgtcggcggcgaggatgcccagggcgatg < 5:20898‑M1/149‑148 (MQ=255) ggTGCAGGGCGTGCTACCTGCGGCACTGGCGGCACGCGAAGTAGGccgggcgcaatttccccgacagggccagttcgcccaggcattccatatcggtcagggtggcaatcggcacctggccgtcggcggcgaggatgcccagggcgatg > 6:228448‑M2/1‑45 (MQ=255) | GCCCCCGCCGACCTGCCCAAGGATGGCGGCCGATATGACCTGGCCATCGCCCTGGGCATCCTCGCCGCCGACGGCCAGGTGCCGATTGCCACCCTGACCGATATGGAATGCCTGGGCGAACTGGCCCTGTCGGGGAAATTGCGCCCGGTGCAGGGCGTGCTACCTGCGGCACTGGCGGCACGCGAAGCAGGCCGGGCGCTGGTGGTACCACGGGAAAATGCCGAGGAAGCCAGCCTGGCCGGCGGGTTGGTGGTGTATGCGGTGGGCCACCTGCTGGAGTTGGTCGCCCACCTGA > NC_002947/5976407‑5976701 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |