New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 102 total aligned reads displayed.
CACCGTCGCCATCGACCGCATGGCCTTCCTGGTACCCGTCGCGGTCGGCGCACAGCTGTCTTTCTATACCCAGACCCTGGAAATCGGCCGCAGCTCGATCCAGATGATGGTCGAGGTGTGGAGCGACGACCCGCTGTCCAGCGAATGGCGCAAGGTCACCGAAGCGGTATTCGTCTTCGTCGCCATCGACGGCAGTGGTCGTACCCGCTCGGTGCCTCGTCGCTGAGCCACGCTGGCGGTAAACTCATTGCATCTGCCCGGGTCCAAGGCCCACTGGCAATCAATGAGAAGAA > NC_002947/6079760‑6080052 | cACCGTCGCCATCGACCGCATGGCCTTCCTGGTACCCGTCGCGGTCGGCGCACAGCTGTCTTTCTATACCCAGACCCTGGAAATCGGCCGCAGCTCGATCCAGATGATGGTCGAGGTGTGGAGCGACGACCCGCTGTCCAGCGAATGgc < 3:411667/149‑1 (MQ=255) cGTCGCCATCGACCGCATGGCCTTCCTGGTACCCGTCGCGGTCGGCGCACAGCTGTCTTTCTATACCCAGACCCTGGAAATCGGCCGCAGCTCGATCCAGATGATGGTCGAGGTGTGGAGCGACGACCCGCTGTCCAGCGAATGGCGCa < 8:87579/149‑1 (MQ=255) ccATCGACCGCATGGCCTTCCTGGTACCCGTCGCGGTCGGCGCACAGCTGTCTTTCTATACCCAGACCCTGGAAATCGGCCGCAGCTCGATCCAGATGATGGTCGAGGTGTGGAGCGACGACCCGCTGTCCAGCGAATGGCGCAAGGt > 6:43653/1‑148 (MQ=255) ccGCATGGCCTTCCTGGTACCCGTCGCGGTCGGCGCACAGCTGTCTTTCTATACCCAGACCCTGGAAATCGGCCGCAGCTCGATCCAGATGATGGTCGAGGTGTGGAGCGACGACCCGCTGTCCAGCGAATGGCGCAAGGTCACCGAAg < 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gCTGTCCAGCGAATGGCGCAAGGTCACCGAAGCGGTATTCGTCTTCGTCGCCATCGACGGCAGTGGTCGTACCCGCTCGGTGCCTCGTCGCTGAGCCACGCTGGCGGTAAACTCATTGCATCTGCCCGGGTCCAAGGCCCACTGGcaa > 1:437295/1‑148 (MQ=255) tCCAGCGAATGGCGCAAGGTCACCGAAGCGGTATTCGTCTTCGTCGCCATCGACGGCAGTGGTCGTACCCGCTCGGTGCCTCGTCGCTGAGCCACGCTGGCGGTAAACTCATTGCATCTGCCCGGGTCCAAGGCCCACTGGcaatcaat < 1:154222/149‑1 (MQ=255) tCCAGCGAATGGCGCAAGGTCACCGAAGCGGTATTCGTCTTCGTCGCCATCGACGGCAGTGGTCGTACCCGCTCGGTGCCTCGTCGCTGAGCCACGCTGGCGGTAAACTCATTGCATCTGCCCGGGTCCAAGGCCCACTGGcaatcaat > 5:333816/1‑149 (MQ=255) tCCAGCGAATGGCGCAAGGTCACCGAAGCGGTATTCGTCTTCGTCGCCATCGACGGCAGTGGTCGTACCCGCTCGGTGCCTCGTCGCTGAGCCACGCTGGCGGTAAACTCATTGCATCTGCCCGGGTCCAAGGCCCACTGGcaatcaat > 5:122748/1‑149 (MQ=255) tCCAGCGAATGGCGCAAGGTCACCGAAGCGGTATTCGTCTTCGTCGCCATCGACGGCAGTGGTCGTACCCGCTCGGTGCCTCGTCGCTGAGCCACGCTGGCGGTAAACTCATTGCATCTGCCCGGGTCCAAGGCCCACTGGcaatcaat < 1:582/149‑1 (MQ=255) cAGCGAATGGCGCAAGGTCACCGAAGCGGTattcgctggacagcgggtcgtcgctccacacctcgaccatcatctggatcgagctgcggccgatttccagggtctgggtatagaaagacagctgtgcgccgaccgcgacgggtaccag < 5:129067‑M2/148‑119 (MQ=255) cAGCGAATGGCGCAAGGTCACCGAAGCGGTattcgctggacagcgggtcgtcgctccacacctcgaccatcatctggatcgagctgcggccgatttccagggtctgggtatagaaagacagctgtgcgccgaccgcgacgggtaccag < 5:285449‑M2/148‑119 (MQ=255) cAGCGAATGGCGCAAGGTCACCGAAGCGGTattcgctggacagcgggtcgtcgctccacacctcgaccatcatctggatcgagctgcggccgatttccagggtctgggtatagaaagacagctgtgcgccgaccgcgacgggtaccag < 5:135109‑M2/148‑119 (MQ=255) cAGCGAATGGCGCAAGGTCACCGAAGCGGTATTCGTCTTCGTCGCCATCGACGGCAGTGGTCGTACCCGCTCGGTGCCTCGTCGCTGAGCCACGCTGGCGGTAAACTCATTGCATCTGCCCGGGTCCAAGGCCCACTGGcaatcaat > 7:310277/1‑147 (MQ=255) cAGCGAATGGCGCAAGGTCACCGAAGCGGTATTCGTCTTCGTCGCCATCGACGGCAGTGGTCGTACCCGCTCGGTGCCTCGTCGCTGAGCCACGCTGGCGGTAAACTCATTGCATCTGCCCGGGTCCAAGGCCCACTGGcaatcaat > 3:240796/1‑147 (MQ=255) cAGCGAATGGCGCAAGGTCACCGAAGCGGTATTCGTCTTCGTCGCCATCGACGGCAGTGGTCGTACCCGCTCGGTGCCTCGTCGCTGAGCCACGCTGGCGGTAAACTCATTGCATCTGCCCGGGTCCAAGGCCCACTGGcaatcaat > 7:72931/1‑147 (MQ=255) cAGCGAATGGCGCAAGGTCACCGAAGCGGTATTCGTCTTCGTCGCCATCGACGGCAGTGGTCGTACCCGCTCGGTGCCTCGTCGCTGAGCCACGCTGGCGGTAAACTCATTGCATCTGCCCGGGTCCAAGGCCCACTGGCAATCAATga < 2:437295/149‑1 (MQ=255) cAGCGAATGGCGCAAGGTCACCGAAGCGGTATTCGTCTTCGTCGCCATCGACGGCAGTGGTCGTACCCGCTCGGTGCCTCGTCGCTGAGCCACGCTGGCGGTAAACTCATTGCATCTGCCCGGGTCCAAGGCCCACTGGCAATCAATga < 7:297398/149‑1 (MQ=255) cAGCGAATGGCGCAAGGTCACCGAAGCGGTATTCGTCTTCGTCGCCATCGACGGCAGTGGTCGTACCCGCTCGGTGCCTCGTCGCTGAGCCACGCTGGCGGTAAACTCATTGCATCTGCCCGGGTCCAAGGCCCACTGGCAATCAATga < 8:343006/149‑1 (MQ=255) aGCGAATGGCGCAAGGTCACCGAAGCGGTattcgctggacagcgggtcgtcgctccacacctcgaccatcatctggatcgagctgcggccgatttccagggtctgggtatagaaa > 1:37349‑M2/1‑29 (MQ=255) aGCGAATGGCGCAAGGTCACCGAAGCGGTattcgctggacagcgggtcgtcgctccacacctcgaccatcatctggatcgagctgcggccgatttccagggtctgggtatagaaa < 2:37349‑M2/115‑87 (MQ=255) aGCGAATGGCGCAAGGTCACCGAAGCGGTATTCGTCTTCGTCGCCATCGACGGCAGTGGTCGTACCCGCTCGGTGCCTCGTCGCTGAGCCACGCTGGCGGTAAACTCATTGCATCTGCCCGGGTCCAAGGCCCACTGGcaatcaat > 8:224296/1‑146 (MQ=255) aGCGAATGGCGCAAGGTCACCGAAGCGGTATTCGTCTTCGTCGCCATCGACGGCAGTGGTCGTACCCGCTCGGTGCCTCGTCGCTGAGCCACGCTGGCGGTAAACTCATTGCATCTGCCCGGGTCCAAGGCCCACTGGcaatcaat > 8:1430/1‑146 (MQ=255) gAATaccgcttcggtgaccttgcgccattcgctggacagcgggtcgtcgctccacacctcgaccatcatctggatcgagctgcggccgatttccagggtctgggtattgaaagacagctgtgcgccgaccgcgacgggtaccaggaagg > 5:374130‑M1/1‑4 (MQ=255) gAATaccgcttcggtgaccttgcgccattcgctggacagcgggtcgtcgctccacacctcgaccatcatctggatcgagctgcggccgatttccagggtctgggtatagaaagacagctgtgcgccgaccgcgacgggtaccaggaagg < 4:118523‑M1/149‑146 (MQ=255) aTaccgcttcggtgaccttgcgccattcgctggacagcgggtcgtcgctccacacctcgaccatcatctggatcgagctgcggccgatttccagggtctgggtatagaaagacagctgtgcgccgaccgcgacgggtaccaggaaggcc < 4:45074‑M1/149‑148 (MQ=255) | CACCGTCGCCATCGACCGCATGGCCTTCCTGGTACCCGTCGCGGTCGGCGCACAGCTGTCTTTCTATACCCAGACCCTGGAAATCGGCCGCAGCTCGATCCAGATGATGGTCGAGGTGTGGAGCGACGACCCGCTGTCCAGCGAATGGCGCAAGGTCACCGAAGCGGTATTCGTCTTCGTCGCCATCGACGGCAGTGGTCGTACCCGCTCGGTGCCTCGTCGCTGAGCCACGCTGGCGGTAAACTCATTGCATCTGCCCGGGTCCAAGGCCCACTGGCAATCAATGAGAAGAA > NC_002947/6079760‑6080052 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |