| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 83467 = | 80 (1.120) | 7 (0.100) | 4/250 | NT | 9.1% | coding (207/912 nt) | hemF | coproporphyrinogen‑III oxidase |
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CTGGGTGCGCGAAGCCGGTGGCGGGGGCCGCACGCGGGTTATCGGTGAGGGCAACG‑TGATCGAAAAAGGCGGGGTCAACTTCTCCCATGTGTTTGGTAGCGGCCTGCCGCCGTCGGCCAGTGCCCACCGTCCCGAACTGGCAGGCCGTGGCTTCGAAGCCTTGGGTGTGTCGCTGGTGATACACCCGCACAACCCGCATGTGCCCACTTCCCACGCCAACGTTCGCTTCTTCATCGCCGAAAAGGAAGGTGAAGAGGCCGTATGGTGGTTTGGCGGCGGCTTTGACCTGACGCCAT > NC_002947/83368‑83663 | cTGGGTGCGCGAAGCCGGTGGCGGGGGCCGCACGCGGGTTATCGGTGAGGGCAACG‑TGATCGAAAAAGGCGGGGTCAACTTCTCCCATGTGTTTGGTAGCGGCCTGCCGCCGTCGGCCAGTGCCCACCGTCCCGAACTGGCAGGCCGTg > 7:327357/1‑149 (MQ=255) ccttttcggcgctgaagaagcgaacgttcgctggggaagttggcacatgcgggttgtgcgggtgtatcaccagcgacacacccaagtcttggacgccaCGGCCTGCCGCGGTCGGCCAGGGCCCACCGTCCCGAACTGGCAGGCCGt > 7:300855‑M1/99‑147 (MQ=255) gTGCGCGAAGCCGGTGGCGGGGGCCGCACGCGGGTTATCGGTGAGGGCAACGTTGAGCGAAAATGGCGGGGTCAACTGGGCCCTTGTGTTTGGTAGCGGCCTGCCGCCGGCGGCCAGTGCCCACCGTCCGGAACTGGCAGGCCGTGGCt > 1:331175/1‑149 (MQ=255) gcgAAGCCGGTGGCGGGGGCCGCACGCGGGTTATCGGTGAGGGCAACG‑TGATCGAAAAAGGCGGGGTCAACTTCTCCCATGTGTTTGGTAGCGGCCTGCCGCCGTCGGCCAGTGCCCACCGTCCCGAACTGGCAGGCCGTGGCTTCg > 2:235322/1‑147 (MQ=255) aaGCCGGTGGCGGGGGCCGCACGCGGGTTATCGGTGAGGGCAACG‑TGATCGAAAAAGGCGGGGTCAACTTCTCCCATGTGTTTGGTAGCGGCCTGCCGCCGTCGGCCAGTGCCCACCGTCCCGAACTGGCAGGCCGTGGCTTCGAAGcc < 1:179942/149‑1 (MQ=255) gCCGGTGGCGGGGGCCGCACGCGGGTTATCGGTGAGGGCAACG‑TGATCGAAAAAGGCGGGGTCAACTTCTCCCATGTGTTTGGTAGCGACCTGCCGCCGTCGGCCAGTGCCCACCGTCCCGAACTGGCAGGCCGTGGCTTCGAAGCCtt < 1:68210/149‑1 (MQ=255) gCCGGTGGCGGGGGCCGCACGCGGGTTATCGGTGAGGGCAACG‑TGATCGAAAAAGGCGGGGGCAACTTCTCCCATGTGTTTGGTAGCGGCCTGCCGCCGTCGGCCAGTGCCCACCGTCCCGAACTGGCAGGCCGTGGCTTCGAAGCCtt < 7:391385/149‑1 (MQ=255) ggggggggggggCCGCACGCGGGTTATGGGTGAGGGCAACG‑TGATCGAAAACGGCGGGGTCAACTTCTCCCATGTGTTTGGTAGCGGCGTGCCGCCGTCGGCCAGTGCCCACCGTCCCGAACTGGCAGGCCGTGGCTTCGAAGCCTTgg < 6:319182/142‑1 (MQ=255) cGGTGGCGGGGGCCGCAGGCGGTTTATCGGTGAGGTCAACG‑TGATCGAAAAAGGCGGGGTCAACTTCTCCCATGTGTTTGGTAGCGGCCTGCCGCCGTCGGCCAGTGCCCACCGTCCCGAACTGGCAGGCCGTGGCTTCGAAGCCTTgg < 6:25120/149‑1 (MQ=255) cGGTGGCGGGGGCCGCACGCGGGTTATCGGTGAGGGCAACG‑TGATCGAAAAAGGCGGGGTCAACTTCTCCCATGTGTTTGGTAGCGGCCTTCCGCCGTCGGCCAGTGCCCACCGTCCCGAACTGGCAGGCCGTGGCTTCGAAGCCTTgg < 7:212958/149‑1 (MQ=255) cGGTGGCGGGGGCCGCACGCGGGTTATCGGTGAGGGCAACG‑TGATCGAAAAAGGCGGGGTCAACTTCTCCCATGTGTTTGGTAGCGGCCTGCCGCCGTCGGCCAGTGCCCACCGTCCCGAACTGGCAGGCCGTGGCTTCGAAGCCTTgg > 7:44152/1‑149 (MQ=255) ggTGGCGGGGGCCGCACGCGGGTTATCGGTGAGGGCAACG‑TGATCGAAAAAGGCGGGGTCAACTTCTCCCATGTGTTTGGTAGCGGCCTGCCGCCGTCGGCCAGTGCCCACCGTCCCGAACTGGCAGGCCGTGGCTTCGAAGCCTTggg > 5:161555/1‑149 (MQ=255) gaagcgaacgttggcgtgggaagtgggcacatgcgggttgtgcgggtgtatcaccagcgacacacccaaggcttcgaagccaCGGCCTGCCGCCGTCGGCCAGTGCCCACCGTCCCGAACTGGCAGGCCGTg < 7:259370‑M1/50‑1 (MQ=255) gaagcgaacgttggcgtgggaagtgggcacatgcgggttgtgcgggtgtatcaccagcgacacacccaaggcttcgaagccaCGGCCTGCCGCCGTCGGCCAGTGCCCACCGTCCCGAACTGGCAGGCCGTg > 8:259370‑M1/83‑132 (MQ=255) gggggCCGCACGCGGGTTATCGGTGAGGGCAACG‑TGATCGAAAAAGGCGGGGTCAACTTCTCCCATGTGTTTGGTAGCGGCCTGCCGCCGTCGGCCAGTGCCCACCGTCCCGAACTGGCAGGCCGTGGCTTCGAAGCCTTGGGTGTGTc > 2:374926/1‑149 (MQ=255) gggCCGCACTCGGGTTATCGGTGAGGGCAACG‑TGATCGAAAAAGGCGGGGTCAACTTCTCCCATGTGTTTGGTAGCGGCCTGCCGCCGTCGGCCAGTGCCCACCGTCCCGAACTGGCAGGCCGTGGCTTCGAAGCCTTGGGTGTGTCGc < 7:99697/149‑1 (MQ=255) gCCGCACGCGGGTTATCGGTGAGGGCAACG‑TGATCGAAAAAGGCGGGGTCAACTTCTCCCATGTGTTTGGTAGCGGCCTGCCGCCGTCGGCCAGTGCCCACCGTCCCGAACTGGCAGGCCGTGGCTTCGAAGCCTTGGGTGTGTCGCTg > 2:226641/1‑149 (MQ=255) cGCACGCGGGTTATCGGGGAGGGCAACG‑TGATCGAAAACCGCGGGGTCAACTTCTCCCATGTGTTTGGTAGCGGCCTGCCGCCGTCGGCCAGTGCCCACCGTCCCGAACTGGCAGGCCGTGGCTTCGAAGCCTTGGGTGTGTCGCTGGt < 8:161051/149‑1 (MQ=255) aTCGGTGAGGGCAACG‑TGATCGAAAAAGGCGGGGTCAACTTCTCCCATGTGTTTGGTAGCGGCCTGCCGCCGTCGGCCAGTGCCCACCGTCCCGAACTGGCAGGCCGTgg > 8:176629/1‑110 (MQ=255) 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aaaaaGGCGGGGTCAACTTCTCCCATGTGTTTGGTAGCGGCCTGCCGCCGTCGGCCAGTGCCCACCGTCCCGAACTGGCAGGCCGTGGCTTCGAAGCCTTGGGTGTGTCGCTGGTGATACACCCGCACAACCCGCATGTGCCCACTTcc < 1:374926/149‑1 (MQ=255) aaaaGGCGGGGTCAACTTCTCCCATGTGTTTGGTAGCGGCCTGCCGCCGTCGGCCAGTGCCCACCGTCCCGAACTGGCAGGCCGTGGCTTCGAAGCCTTGGGTGTGTCGCTGGTGATACACCCGCACAACCCGCATGTGCCCACTTccc < 8:44152/149‑1 (MQ=255) aaaaGGCGGGGTCAACTTCTCCCATGTGTTTGGTAGCGGCCTGCCGCCGTCGGCCAGTGCCCACCGTCCCGAACTGGCAGGCCGTGGCTTCGAAGCCTTGGGTGTGTCGCTGGTGATACACCCGCACAACCCGCATGTGCCCACTTcc > 8:27104/1‑148 (MQ=255) ggggTCAACTTCTCCCATGTGTTTGGTAGCGGCCTGCCGCCGTCGGCCAGTGCCCACCGTCCCGAACTGGCAGGCCGTGGCTTCGAAGCCTTGGGTGTGTCGCTGGTGATACACCCGCACAACCCGCATGTGCCCACTTCCCACGCCaa > 5:403278/1‑149 (MQ=255) ggTCAACTTCTCCCATGTGTTTGGTAGCGGCCTGCCGCCGTCGGCCAGTGCCCACCGTCCCGAACTGGCAGGCCGTGGCTTCGAAGCCTTGGGTGTGTCGCTGGTGATACACCCGCACAACCCGCATGTGCCCACTTCCCACGCCAACg > 5:293546/1‑149 (MQ=255) 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ccGTCCCGAACTGGCAGGCCGTGGCTTCGAAGCCTTGGGTGTGTCGCTGGTGATACACCCGCACAACCCGCATGTGCCCACTTCCCACGCCAACGTTCGCTTCTTCATCGCCGAAAAGGAAGGTGAAGAGGCCGTATGGTGGTTTggcg < 6:403278/149‑1 (MQ=255) cGTCCCGAACTGGCAGGCCGTGGCTTCGAAGCCTTGGGTGTGTCGCTGGTGATACACCCGCACAACCCGCATGTGCCCACTTCCCACGCCAACGTTCGCTTCTTCATCGCCGAAAAGGAAGGTGAAGAGGCCGTATGGTGGTTTggcgg < 2:51835/149‑1 (MQ=255) cccGAACTGGCAGGCCGTGGCTTCGAAGCCTTGGGTGTGTCGCTGGTGATACACCCGCACAACCCGCATGTGCCCACTTCCCACGCCAACGTTCGCTTCTTCATCGCCGAAAAGGAAGGTGAAGAGGCCGTATGGTGGTTTggcggcgg > 1:52059/1‑149 (MQ=255) ccGAACTGGCAGGCCGTGGCTTCGAAGCCTTGGGTGTGTCGCTGGTGATACACCCGCACAACCCGCATGTGCCCACTTCCCACGCCAACGTTCGCTTCTTCATCGCCGAAAAGGAAGGTGAAGAGGCCGTATGGTGGTTTggcggcggc > 2:33320/1‑149 (MQ=255) cGAACTGGCAGGCCGTGGCTTCGAAGCCTTGGGTGTGTCGCTGGTGATACACCCGCACAACCCGCATGTGCCCACTTCCCACGCCAACGTTCGCTTCTTCATCGCCGAAAAGGAAGGTGAAGAGGCCGTATGGTGGTTTGGCGGCGGCt > 7:44854/1‑149 (MQ=255) aCTGGCAGGCCGTGGCTTCGAAGCCTTGGGTGTGTCGCTGGTGATACACCCGCACAACCCGCATGTGCCCACTTCCCACGCCAACGTTCGCTTCTTCATCGCCGAAAAGGAAGGTGAAGAGGCCGTATGGTGGTTTGGCGGCGGCTTTg < 2:14947/149‑1 (MQ=255) cTGGCAGGGCGTGGCTTCGAAGCCTTGGGTGTGTCGCTGGTGATACACCCGCACAACCCGCATGTGCCCACTTCCCACGCCAACGTTCGCTTCTTCATCGCCGAAAAGGAAGGTGAAGAGGCCGTATGGTGGTTTGGCGGCGGCTTTGa < 8:285742/149‑1 (MQ=255) gcaggccgTGGCTTCGAAGCCTTGGGTGTGTCGCTGGTGATACACCCGCACAACCCGCATGTGCCCACTTCCCACGCCAACGTTCGCTTCTTCATCGCCGAAAAGGAAGGTGAAGAGGCCGTATGGTGGTTTGGCGGCGGCTTTGAcc < 2:417622‑M2/140‑1 (MQ=255) aggccgTGGCTTCGAAGCCTTGGGTGTGTCGCTGGTGATACACCCGCACAACCCGCATGTGCCCACTTCCCACGCCAACGTTCGCTTCTTCATCGCCGAAAAGGAAGGTGAAGAGGCCGTATGGTGGTTTGGCGGCGGCTTTGACCTGa < 3:328735‑M2/143‑1 (MQ=255) gccgTGGCTTCGAAGCCTTGGGTGTGTCGCTGGTGATACACCCGCACAACCCGCATGTGCCCACTTCCCACGCCAACGTTCGCTTCTTCATCGCCGAAAAGGAAGGTGAAGAGGCCGTATGGTGGTTTGGCGGCGGCTTTGACCTGACg > 3:393722‑M2/5‑149 (MQ=255) tGGCTTCGAAGCCTTGGGTGTGTCGCTGGTGATACACCCGCACAACCCGCATGTGCCCACTTCCCACGCCAACGTTCGCTTCTTCATCGCCGAAAAGGAAGGTGAAGAGGCCGTATGGTGGTTTGGCGGCGGCTTTGACCTGACGCCAt < 5:385515/149‑1 (MQ=255) | CTGGGTGCGCGAAGCCGGTGGCGGGGGCCGCACGCGGGTTATCGGTGAGGGCAACG‑TGATCGAAAAAGGCGGGGTCAACTTCTCCCATGTGTTTGGTAGCGGCCTGCCGCCGTCGGCCAGTGCCCACCGTCCCGAACTGGCAGGCCGTGGCTTCGAAGCCTTGGGTGTGTCGCTGGTGATACACCCGCACAACCCGCATGTGCCCACTTCCCACGCCAACGTTCGCTTCTTCATCGCCGAAAAGGAAGGTGAAGAGGCCGTATGGTGGTTTGGCGGCGGCTTTGACCTGACGCCAT > NC_002947/83368‑83663 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |