New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 182535 = | 76 (1.060) | 4 (0.060) | 3/258 | NT | 5.6% | coding (2028/2487 nt) | PP_0160 | ferrioxamine receptor |
? | NC_002947 | 182589 = | 62 (0.900) | coding (1974/2487 nt) | PP_0160 | ferrioxamine receptor |
GCTCGGCATTGACTTCGAATACTCGATATCGGTGAAGGTATAGCCACCCAGCAGTTTGAGGCTGTCGGTCAGTTGCACATGGGCCTCCAGCTCCAGCCCTTGCGAGCGGACTTCACCGACAGGGCGGTAGAAGTCTTCGTCAGGCTGTTTAGACGCCAAATTCTCCTGCTCGATGCGG‑AACACCGATGCGGTGAACAGGTTGTCGCTCCCTGGTGGCTGATATTTGATGCCGGCTTCCCACTGAGTGCCCTCCGTCGGCGCCAGCGGCCGGCCTTGCTGGTCGGACACGGTGTTC > NC_002947/182442‑182736 | tgggaagccggcatcaaatatcagccaccagggagcgacaacctgttcaccgcatcggtgttccgcatcgagcaggagaatttggcgtctaaaCAGCCCTTGCGAGCGGACTTCACCGACAGGGCGGTAGAAGTCTTCGTCAGGCTGtt > 2:288546‑M1/94‑149 (MQ=255) gCTCGGCATTGACTTCGAATACTCGATATCGGTGAAGGTATAGCCACCCAGCAGTTTGAGGCTGTCGGTCAGTTGCACATGGGCCTCCAGCTCCAGCCCTTGCGAGCGGACTTCACCGACAGGGCGGTAGAAGTCTTCGTCAGGCTGtt < 4:202679/149‑1 (MQ=255) tCGGCATTGACTTCGAATCCTCGATATCGGTGAAGGTATAGCCACCCAGCAGTTTGAGGCTGTCGGTCAGTTGCACATGGGCCTCCAGCTCCAGCCCTTGCGAGCGGACTTCACCGACAGGGCGGTAGAAGTCTGCGTCAGGGTGtt > 8:278220/1‑147 (MQ=255) gaagccggcatcaaatatcagccaccagggagcgacaacctgttcaccgcatcggtgttccgcatcgagcaggagaatttggcgtctaaaCAGCCCTTGCGAGCGGACTTCACCGACAGGGCGGTAGAAGTCTTCGTCAGGCTGTTTAg > 3:64520‑M1/91‑149 (MQ=255) gaagccggcatcaaatatcagccaccagggagcgacaacctgttcaccgcatcggtgttccgcatcgagcaggagaatttggcggctaaaCAGCCCTTGCGAGCGGACTTCACCGACAGGGCGGTAGAAGTCTTCGTCAGGCTGTTTAg > 7:210678‑M1/91‑149 (MQ=255) ttCGAATACTCGATATCGGTGAAGGTATAGCCACCCAGCAGTTTGAGGCTGTCGGTCAGTTGCACATGGGCCTCCAGCTCCAGCCCTTGCGAGCGGACTTCACCGACAGGGCGGTAGAAGTCTTCGTCAGGCTGTTTAGACGCCaa > 8:396412/1‑146 (MQ=255) ttCGAATACTCGATATCGGTGAAGGTATAGCCACCCAGCAGTTTGAGGCTGTCGGTCAGTTGCACATGGGCCTCCAGCTCCAGCCCTTGCGAGCGGACTTCACCGACAGGGCGGTAGAAGTCTTCGTCAGGCTGTTTAGACGCCaa < 7:396412/146‑1 (MQ=255) ttCGAATACTCGATATCGGTGAAGGTATAGCCACCCAGCAGTTTGAGGCTGTCGGTCAGTTGCACATGGGCCTCCAGCTCCAGCCCTTGCGAGCGGACTTCACCGACAGGGCGGTAGAAGTCTTCGTCAGGCTGTTTAGACGCCAAAt > 5:259507/1‑148 (MQ=255) gAATACTCGATATCGGTGAAGGTATAGCCACCCAGCAGTTTGAGGCTGTCGGTCAGTTGCACATGGGCCTCCAGCTCCAGCCCTTGCGAGCGGACTTCACCGACAGGGCGGTAGAAGTCTTCGTCAGGCTGTTTAGACGCCAAATtctc < 8:93100/149‑1 (MQ=255) gAATACTCGATATCGGTGAAGGTATAGCCACCCAGCAGTTTGAGGCTGTCGGTCAGTTGCACATGGGCCTCCAGCTCCAGCCCTTGCGAGCGGACTTCACCGACAGGGCGGTAGAAGTCTTCGTCAGGCTGTTTAGACGCCAAATtctc < 6:7735/149‑1 (MQ=255) gAATACTCGATATCGGTGAAGGTATAGCCACCCAGCAGTTTGAGGCTGTCGGTCAGTTGCACATGGGCCTCCAGCTCCAGCCCTTGCGAGCGGACTTCACCGACAGGGCGGTAGAAGTCTTCGTCAGGCTGTTTAGACGCCAAATtctc < 7:177773/149‑1 (MQ=255) aTACTCGATATCGGTGAAGGTATAGCCACCCAGCAGTTTGAGGCTGTCGGTCAGTTGCACATGGGCCTCCAGCTCCAGCCCTTGCGAGCGGACTTCACCGACAGGGCGGTAGAAGTCTTCGTCAGGCTGTTTAGACGCCAAATTCTCCt < 6:256181/149‑1 (MQ=255) tCGATATCGGTGAAGGTATAGCCCCCCAGCAGTTTGAGGCTGTCGGTCAGTTGCACATGGGCCTCCAGCTCCAGCCCTTGCGAGCGGACTTCACCGACAGGGCGGTAGAAGTCTTCGTCAGGCTGTTTAGACGCCAAATTCTCCTGCTc > 5:334038/1‑149 (MQ=255) tCGATATCGGTGAAGGTATAGCCACCCAGCAGTTTGAGGCTGTCGGTCAGTTGCACATGGGCCTCCAGCTCCAGCCCTTGCGAGCGGACTTCACCGACAGGGCGGTAGAAGTCTTCGTCAGGCTGTTTAGACGCCAAATTCTCCTGCTc > 3:321727/1‑149 (MQ=255) tCGATATCGGTGAAGGTATAGCCACCCAGCAGTTTGAGGCTGTCGGTCAGTTGCACATGGGCCTCCAGCTCCAGCCCTTGCGAGCGGACTTCACCGACAGGGCGGTAGAAGTCTTCGTCAGGCTGTTTAGACGCCAAATTCTCCTGCTc > 7:133050/1‑149 (MQ=255) tCGATATCGGTGAAGGTATAGCCACCCAGCAGTTTGAGGCTGTCGGTCAGTTGCACATGGGCCTCCAGCTCCAGCCCTTGCGAGCGGACTTCACCGACAGGGCGGTAGAAGTCTTCGTCAGGCTGTTTAGACGACAAATTCTCCTGCTc > 4:29025/1‑149 (MQ=255) tatCTGTGAAGGTATAGCCACCCAGCAGTTTGAGGCTGTCGGTCAGTTGCACATGGGCCTCCAGCTCCAGCCCTTGCGAGCGGACTTCACCGACAGGGCGGTAGAAGTCTTCGTCAGGCTGTTTAGACGCCAAATTCTCCTGCTCGATg < 7:175560/149‑1 (MQ=255) tCGGTGAAGGTATAGCCACCCAGCAGTTTGAGGCTGTCGGTCAGTTGCACATGGGCCTCCAGCTCCAGCCCTTGCGAGCGGACTTCACCGACAGGGCGGTAGAAGTCTTCGTCAGGCTGTTTAGACGCCAAATTCTCCTGCTCGATg < 6:334038/147‑1 (MQ=255) 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aGCCACCCAGCAGTTTGAGGCTGTCGGTCAGTTGCACATGGGCCTCCAGCTCCAGCCCTTGCGAGCGGACTTCACCGACAGGGCGGTAGAAGTCTTCGTCAGGCTGTTTAGACGCCAAATTCTCCTGCTCGATGCGG‑AACACCGATGCg < 7:374991/149‑1 (MQ=255) gCCACCCAGCAGTTTGAGGCTGTCGGTCAGTTGCACATGGGCCTCCAGCTCCAGCCCTTGCGAGCGGACTTCACCGACAGGGCGGTAGAAGTCTTCGTCAGGCTGTTTAGACGCCAAATTCTCCTGCTCGATGCGG‑AACACCGATGCga < 8:133050/149‑2 (MQ=255) ccACCCAGCAGTTTGAGGCTGTCGGTCAGTTGCACATGGGCCTCCAGCTCCAGCCCTTGCGAGCGGACTTCACCGACAGGGCGGTAGAAGTCTTCGTCAGGCTGTTTAGACGCCAAATTCTCCTGCTCGATGCGG‑AACACCGATGCGGt < 5:295414/149‑1 (MQ=255) cACCCAGCAGTTTGAGGCTGTCGGTCAGTTGCACATGGGCCTCCAGCTCCAGCCCTTGCGAGCGGACTTCACCGACAGGGCGGTAGAAGTCTTCGTCAGGCTGTTTAGACGCCAAATTCTCCTGCTCGATGCGG‑AACACCGATGCGGt > 6:237082/1‑148 (MQ=255) aCCCAGCAGTTTGAGGCTGTCGGTCAGTTGCACATGGGCCTCCAGCTCCAGCCCTTGCGAGCGGACTTCACCGACAGGGCGGTAGAAGTCTTCGTCAGGCTGTTTAGACGCCAAATTCTCCTGCTCGATGCGG‑AACACCGATGCGGTg > 2:74099/1‑148 (MQ=255) 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gcagTTTGAGGCTGTCGGTCAGTTGCACATGGGCCTCCAGCTCCAGCCCTTGCGAGCGGACTTCACCGACAGGGCGGTAGAAGTCTTCGTCAGGCTGTTTAGACGCCAAATTCTCCTGCTCGATGCGG‑AACACCGATGCGGTGAACAgg > 2:434169/1‑149 (MQ=255) cagTTTGAGGCTGTCGGTCAGTTGCACATGGGCCTCCAGCTCCAGCCCTTGCGCGCGGCCTAAACCGAAAGGGCGGTAGAAGGCTTCGGCAGGCGGTTTAGCCGCCAAATGCGCCTCCGCGATCCGC‑ACCACCGAGGCGGGGACCCGGt > 2:298471/1‑149 (MQ=255) agTTTGAGGCTGTCGGTCAGTTGCACATGGGCCTCCAGCTCCAGCCCTTGCGAGCGGACTTCACCGACAGGGCGGTAGAAGTCTTCGTCAGGCTGTTTAGACGCCAAATTCTCCTGCTCGATGCGG‑AACACCGATGCGGTGAACAGGtt > 3:291496/1‑149 (MQ=255) aGGCTGTCGGTCAGTTGCACATGGGCCTCCAGCTCCAGCCCTTGCGAGCGGACTTCACCGACAGGGCGGTAGAAGTCTTCGTCAGGCTGTTTAGACGCCAAATTCTCCTGCTCGATGCGG‑AACACCGATGCGGTGAACAGGTTGTCGCt > 4:178820/1‑149 (MQ=255) gCTGTCGGTCAGTTGCACATGGGCCTCCAGCTCCAGCCCTTGCGAGCGGACTTCACCGACAGGGCGGTAGAAGTCTTCGTCAGGCTGTTTAGACGCCAAATTCTCCTGCTCGATGCGG‑AACACCGATGCGGTGAACAGGTTGTCGCTcc > 2:67874/1‑149 (MQ=255) 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GCTCGGCATTGACTTCGAATACTCGATATCGGTGAAGGTATAGCCACCCAGCAGTTTGAGGCTGTCGGTCAGTTGCACATGGGCCTCCAGCTCCAGCCCTTGCGAGCGGACTTCACCGACAGGGCGGTAGAAGTCTTCGTCAGGCTGTTTAGACGCCAAATTCTCCTGCTCGATGCGG‑AACACCGATGCGGTGAACAGGTTGTCGCTCCCTGGTGGCTGATATTTGATGCCGGCTTCCCACTGAGTGCCCTCCGTCGGCGCCAGCGGCCGGCCTTGCTGGTCGGACACGGTGTTC > NC_002947/182442‑182736 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |