New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | 247753 = | 59 (0.820) | 4 (0.060) | 4/250 | NT | 6.3% | coding (21/588 nt) | PP_0197 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | 247816 = | 63 (0.940) | coding (84/588 nt) | PP_0197 | hypothetical protein |
GGCCTGGATGGAAGCGCTGGAAACCCTTGAAAGC‑ATGCAGGCCGAACTCGAGGCGTTGTCCTGATGGAGGAACTGCGTTCGCTGCTGCCAGGGCAATGGATGGACACCTTCTGGCTGGGTTTGCAGATCCTC‑TTGATCCTGGCAGCGGCGTTCATCCTGCAACGTATCGTCGCCCGCGGGCTGAGCCGCCTGGGCCAGCGTTACCCGTTACCGCCGGAGCTGCTGGTGCCCGTGCGCGGTGGCCTGCGCTGGCTGATCATGGGCAGCGCGCTGCTGTTCGTGCTGGAGC > NC_002947/247670‑247958 | ggcaccagcagctccggcggtaacgggtaacgctggcccaggcggctcagcccgcgggcgacgatacgttgcaggatgaacgccGCTGCCAGGGCAATGGATGGACACCTTCTGGCTGGGTTTGCAGATCCTC‑TTGATCCTGGCAgcgg > 4:176836‑M1/85‑149 (MQ=255) gcaccagcagctccggcggtaacgggtaacgctggcccaggcggctcagcccgcgggcgacgatacgttgcaggatgaacgccGCTGCCAGGGCAATGGATGGACACCTTCTGGCTGGGTTTGCAGATCCTC‑TTGATCCTGGCAgcggc > 1:274406‑M1/84‑149 (MQ=255) gCCTGGATGGAAGCGCTGGAAACCCTTGAAAGC‑ATGCAGGCCGAACTCGAGGCGTTGTCCTGATGGAGGAACTGCGTTCGCTGCTGCCAGGGCAATGGATGGACACCTTCTGGCTGGGTTTGCAGATCCTC‑TTGATCCTGGCAgcggcg < 4:159127/149‑1 (MQ=255) cTGGATGGAAGCGCTGGAAACCCTTGAAAGCGATGCAGGCCGAACTCGAGGCGTTGTCCTGATGGAGGAACTGCGTTCGCTGCTGCCAGGGCAATGGATGGACACCTTCTGGCTGGGTTTGCAGATCCTC‑TTGATCCTGGCAGCGGCGt > 1:46997/1‑149 (MQ=255) atggaAGCGCTGGAAACCCTTGAAAGC‑ATGCAGGCCGAACTCGAGGCGTTGTCCTGATGGAGGAACTGCGTTCGCTGCTGCCAGGGCAATGGATGGACACCTTCTGGCTGGGTTTGCAGATCCTC‑TTGATCCTGGCAGCGGCGTTCATc < 5:108156/149‑1 (MQ=255) tggaAGCGCTGGAAACCATTGAAAGC‑ATGCAGGCCGAACTCGAGGCGTTGTCCTGATGGAGGAACTGCGTTCGCTGCTGCCAGGGCAATGGATGGACACCTTCTGGATGCGTTTGCAGATCCTC‑TTGATCCTGGCAGCGGCGTTCATcc > 8:190721/1‑149 (MQ=255) gcgcTGGAAACCCTTGAAAGC‑ATGCAGGCCGAACTCGAGGCGTTGTCCTGATGGAGGAACTGCGTTCGCTGCTGCCAGGGCAATGGATGGACACCTTCTGGCTGGGTTTGCAGATCCTC‑TTGATCCTGGCAGCGGCGTTCATCCTGCaa < 1:224161/149‑1 (MQ=255) cgcTGGAAACCCTTGAAAGC‑ATGCAGGCCGAACTCGAGGCGTTGTCCTGATGGAGGAACTGCGTTCGCTGCTGCCAGGGCAATGGATGGACACCTTCTGGCTGGGTTTGCAGATCCTC‑TTGATCCTGGCAGCGGCGTTCATCCTGCAAc < 3:279447/149‑1 (MQ=255) tGGAAACCCTTGAAAGC‑ATGCAGGCCGAACTCGAGGCGTTGTCCTGATGGAGGAACTGCGTTCGCTGCTGCCAGGGCAATGGATGGACACCTTCTGGCTGGGTTTGCAGATCCTC‑TTGATCCTGGCAGCGGCGTTCATCCTGCAACGTa > 1:226999/1‑149 (MQ=255) gAAACCCTTGAAAGC‑ATGCAGGCCGAACTCGAGGCGTTGTCCTGATGGAGGAACTGCGTTCGCTGCTGCCAGGGCAATGGATGGACACCTTCTGGCTGGGTTTGCAGATCCTC‑TTGATCCTGGCAGCGGCGTTCATCCTGCAACGTa < 2:88166/147‑1 (MQ=255) gAAACCCTTGAAAGC‑ATGCAGGCCGAACTCGAGGCGTTGTCCTGATGGAGGAACTGCGTTCGCTGCTGCCAGGGCAATGGATGGACACCTTCTGGCTGGGTTTGCAGATCCTC‑TTGATCCTGGCAGCGGCGTTCATCCTGCAACGTAtc < 1:168473/149‑1 (MQ=255) aaCCCTTGAAAGC‑ATGCAGGCCGAACTCGAGGCGTTGTCCTGATGGAGGAACTGCGTTCGCTGCTGCCAGGGCAATGGATGGACACCTTCTGGCTGGGTTTGCAGATCCTC‑TTGATCCTGGCAGCGGCGTTCATCCTGCAAc < 3:71421/142‑1 (MQ=255) aaCCCTTGAAAGC‑ATGCAGGCCGAACTCGAGGCGTTGTCCTGATGGAGGAACTGCGTTCGCTGCTGCCAGGGCAATGGATGGACACCTTCTGGCTGGGTTTGCAGATCCTC‑TTGATCCTGGCAGCGGCGTTCATCCTGCAAc > 4:71421/1‑142 (MQ=255) aCCCTTGAAAGC‑ATGCAGGCCGAACTCGAGGCGTTGTCCTGATGGAGGAACTGCGTTCGCTGCTGCCAGGGCAATGGATGGACACCTTCTGGCTGGGTTTGCAGATCCTC‑TTGATCCTGGCAGCGGCGTTCATCCTGCAACGTAtcgtc < 6:343123/149‑1 (MQ=255) aCCCTTGAAAGC‑ATGCAGGCCGAACTCGAGGCGTTGTCCTGATGGAGGAACTGCGTTCGCTGCTGCCAGGGCAATGGATGGACACCTTCTGGCTGGGTTTGCAGATCCTC‑TTGATCCTGGCAGCGGCGTTCATCCTGCAACGTAtcgtc > 7:74960/1‑149 (MQ=255) aCCCTTGAAAGC‑ATGCAGGCCGAACTCGAGGCGTTGTCCTGATGGAGGAACTGCGTTCGCTGCTGCCAGGGCAATGGATGGACACCTTCTGGCTGGGTTTGCAGATCCTC‑TTGATCCTGGCAGCGGCGTTCATCCTGCAACGTAtcgtc < 2:27901/149‑1 (MQ=255) ccTTGAAAGC‑ATGCAGGCCGAACTCGAGGCGTTGTCCTGATGGAGGAACTGCGTTCGCTGCTGCCAGGGCAATGGATGGACACCTTCTGGCTGGGTTTGCAGATCCTC‑TTGATCCTGGCAGCGGCGTTCATCCTGCAACGTATCGTCGc > 4:319312/1‑149 (MQ=255) ccTTGAAAGC‑ATGCAGGCCGAACTCGAGGCGTTGTCCTGATGGAGGAACTGCGTTCGCTGCTGCCAGGGCAATGGATGGACACCTTCTGGCTGGGTTTGCAGATCCTC‑TTGATCCTGGCAGCGGCGTTCATCCTGCAACGTATCGTCGc < 4:406395/149‑1 (MQ=255) 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cTCGAGGCGTTGTCCTGATGGAGGAACTGCGTTCGCTGCTGCCAGGGCAATGGATGGACACCTTCTGGCTGGGTTTGCAGATCCTC‑TTGATCCTGGCAGCGGCGTTCATCCTGCAACGTATCGTCGCCCGCGGGCTGAGCCGCCTGGGc > 4:310401/1‑149 (MQ=255) gAGGCGTTGTCCTGATGGAGGAACTGCGTTCGCTGCTGCCAGGGCAATGGATGGACACCTTCTGGCTGGGTTTGCAGATCCTC‑TTGATCCTGGCAGCGGCGTTCATCCTGCAACGTATCGTCGCCCGCGGGCTGAGCCGCCTgg < 2:284116/144‑1 (MQ=255) gAGGCGTTGTCCTGATGGAGGAACTGCGTTCGCTGCTGCCAGGGCAATGGATGGACACCTTCTGGCTGGGTTTGCAGATCCTC‑TTGATCCTGGCAGCGGCGTTCATCCTGCAACGTATCGTCGCCCGCGGGCTGAGCCGCCTgg > 1:284116/1‑144 (MQ=255) ttGTCCTGATGGAGGAACTGCGTTCGCTGCTGCCAGGGCAATGGATGGACACCTTCTGGCTGGGTTTGCAGATCCTC‑TTGATCCTGGCAGCGGCGTTCATCCTGCAACGTATCGTCGCCCGCGGGCTGAGCCGCCTGGGCCAGcgttac > 2:307494/1‑149 (MQ=255) tCCTGATGGAGGAACTGCGTTCGCTGCTGCCAGGGCAATGGATGGACACCTTCTGGCTGGGTTTGCAGATCCTC‑TTGATCCTGGCAGCGGCGTTCATCCTGCAACGTATCGTCGCCCGCGGGCTGAGCCGCCTGGGCCAGcgttacccg > 4:172560/1‑149 (MQ=255) ccTGATGGAGGAACTGCGGCCGCGGCTGCCAGGGCAATGGATGGACACCTGCTGGCTCGGTTTGCAGATCCTC‑TTGATCCTGGCAGCGGCGTTCATCCTGCAACGTATCGTCGCCCGCGGGCTGAGCCGCCTGGGCCAGcgttacccgt < 8:340147/149‑1 (MQ=255) tGATGGAGGAACTGCGTTCGCTGCTGCCAGGGCAATGGATGGACACCTTCTGGCTGGGTTTGCAGATCCTC‑TTGATCCTGGCAGCGGCGTTCATCCTGCAACGTATCGTCGCCCGCGGGCTGAGCCGCCTGGGCCAGcgttacccgtta > 4:270097/1‑149 (MQ=255) gATGGAGGAACTGCGTTCGCTGCTGCCAGGGCAATGGATGGACACCTTCTGGCTGGGTTTGCAGATCCTC‑TTGATCCTGGCAGCGGCGTTCATCCTGCAACGTATCGTCGCCCGCGGGCTGCGCCGCCTGGGCCAGcgttacccgttac > 8:181319/1‑149 (MQ=255) gATGGAGGAACTGCGTTCGCTGCTGCCAGGGCAATGGATGGACACCTTCTGGCTGGGTTTGCAGATCCTC‑TTGATCCTGGCAGCGGCGTTCATCCTGCAACGTATCGTCGCCCGCGGGCTGAGCCGCCTGGGCCAGcgttacccgttac > 6:396379/1‑149 (MQ=255) aggaACTGCGTTCGCTGCTGCCAGGGCAATGGATGGACACCTTCTGGCTGGGTTTGCAGATCCTC‑TTGATCCTGGCAGCGGCGTTCATCCTGCAACGTATCGTCGCCCGCGGGCTGAGCCGCCTGGGCCAGCGTTACCCGTTAccgccg > 2:147095/1‑149 (MQ=255) ggaACTGCGTTCGCTGCTGCCAGGGCAATGGATGGACACCTTCTGGCTGGGTTTGCAGATCCTC‑TTGATCCTGGCAGCGGCGTTCATCCTGCAACGTATCGTCGCCCGCGGGCTGAGCCGCCTGGGCCAGCGTTACCCGTTAccgccg > 3:214718/1‑148 (MQ=255) gaACTGCGTTCGCTGCTGCCAGGGCAATGGATGGACAACTTCTGGCTGGGTTTGCTGATCCTC‑TTGATCCTGGCAGCGGCGTTCATCCTGCAACGTATCGTCGCCCGCGGGCTGAGCCGCCTGGGCCAGcgttac > 5:2223/1‑135 (MQ=255) gaACTGCGGTCGCTGCTGCCATGGCAATGGATGGACACCTTCTGGCTGGGTTTGCAGATCCTC‑TTGATCCTGGCAGCGGCGTTCATCCTGCAACGTATCGTCGCCCGCGGGCTGAGCCGCCTGGGCCAGcgttac < 6:2223/135‑1 (MQ=255) aCTGCGTTCGCTGCTGCCAGGGCAATGGATGGACACCTTCTGGCTGGGTTTGCAGATCCTC‑TTGATCCTGGCAGCGGCGTTc > 4:280905/1‑82 (MQ=255) aCTGCGTTCGCTGCTGCCAGGGCAATGGATGGACACCTTCTGGCTGGGTTTGCAGATCCTC‑TTGATCCTGGCAGCGGCGTTc < 3:280905/82‑1 (MQ=255) cTGCGTTCGCTGCTGCCAGGGCAATGGATGGACACCTTCTGGCTGGGTTTGCAGATCCTC‑TTGATCCTGGCAGCGGCGTTCATCCTGCAACGTATCGTCGCCCGCGGGCTGAGCCGCCTGGGCCAGc > 1:391754/1‑127 (MQ=255) cTGCGTTCGCTGCTGCCAGGGCAATGGATGGACACCTTCTGGCTGGGTTTGCAGATCCTC‑TTGATCCTGGCAGCGGCGTTCATCCTGCAACGTATCGTCGCCCGCGGGCTGAGCCGCCTGGGCCAGc < 2:391754/127‑1 (MQ=255) cGTTCGCTGCTGCCAGGGCAATGGATGGACACCTTCTGGCTGGGTTTGCAGATCCTC‑TTGATCCTGGCAGCGGCGTTCATCCTGCAACGTATCGTCGCCCGCGGGCTGAGCCGCCTGGGCCAGCGTTACCCGTTACCGCCGGAgctgc < 3:132532/148‑1 (MQ=255) cGTTCGCTGCTGCCAGGGCAATGGATGGACACCTTCTGGCTGGGTTTGCAGATCCTC‑TTGATCCTGGCAGCGGCGTTCATCCTGCAACGTATCGTCGCCCGCGGGCTGAGCCGCCTGGGCCAGCGTTACCCGTTACCGCCGGAgctg < 3:270097/147‑1 (MQ=255) gctgctGCCAGGGCAATGGATGGACACCTTCTGGCTGGGTTTGCAGATCCTC‑TTGATCCTGGCAGCGGCGTTCATCCTGCAACGTATCGTCGCCCGCGGGCTGAGCCGCCTGGGCCAGCGTTACACGTTACCGCCGGAGCTGCTGGTGc > 6:42024/1‑149 (MQ=255) gccgctgccaggatcaagaggatctgcaaacccagccagaaggtgtccatccattgccctggcagcGGCGTTCATCCTGCAACGTATCGTCGCCCGCGGGCTGAGCCGCCTGGGCCAGCGTTACCCGTTACCGCCGGAGCTGCTGGTGc > 1:274406‑M2/67‑149 (MQ=255) ctgctgCCAGGGCAATGGATGGACACCTTCTGGCTGGGTTTGCAGATCCTC‑TTGATCCTGCCAGCGGCGTGCTGCGTGAACCTTAGCTACGCCCCCGGGGTGACCCGCCTGGGCCAGCTTAACCCGTAACCCCCGGACGTGATGGTGcc > 4:229448/1‑149 (MQ=255) 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GGGCAATGGATGGACACCTTCTGGCTGGGTTTGCAGATCCTC‑TTGATCCTGGCAGCGGCGTTCATCCTGCAACGTATCGTCGCCCGCGGGCTGAGCCGCCTGGGCCAGCGTTACCCGTTACCGCCGGAGCTGCTGGTGCCCGTGCGCgg < 1:153688‑M1/149‑1 (MQ=255) GGCAATGGATGGACACCTTCTGGCTGGGTTTGCAGATCCTC‑TTGATCCTGGCAGCGGCGTTCATCCTGCAACGTATCGTCGCCCGCGGGCTGAGCCGCCTGGGCCAGCGTTACCCGTTACCGCCGGAGCTGCTGGTGCCCGTGCGCGGt < 7:104373‑M1/149‑1 (MQ=255) gCAATGGATGGACACCTTCTGGCTGGGTTTGCAGATCCTC‑TTGATCCTGGCAGCGGCGTTCATCCTGCAACGTATCGTCGCCCGCGGGCTGAGCCGCCTGGGCCAGCGTTACCCGTTACCGCCGGAGCTGCTGGTGCCCGTGCGCGGTg < 2:226999/149‑1 (MQ=255) cacCTTCTGGCTGGGTTTGCAGATCCTC‑TTGATCCTGGCAGCGGCGTTCATCCTGCAACGTATCGTCGCCCGCGGGCTGAGCCGCCTGGGCCAGCGTTACCCGTTACCGCCGGAGCTGCTGGTGCCCGTGCGCGGTGGCCTGCgctggc < 5:417560/149‑1 (MQ=255) cacCTTCTGGCTGGGTTTGCAGATCCTC‑TTGATCCTGGCAGCGGCGTTCATCCTGCAACGTATCGTCGCCCGCGGGCTGAGCCGCCTGGGCCAGCGTTACCCGTTACCGCCGGAGCTGCTGGTGCCCGTGCGCGGTGGCCTGCgctggc < 5:42024/149‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |