New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 3556464 | 59 (0.820) | 4 (0.060) | 4/256 | NT | 6.8% | coding (881/1188 nt) | PP_3140 | group 2 family glycosyl transferase |
? | NC_002947 | = 3556485 | 54 (0.790) | coding (902/1188 nt) | PP_3140 | group 2 family glycosyl transferase |
GCCAGCAGGGCCTCAACAGCCAACGTACCCGCTGGGAGCACGGCCATCTGGGCTTGATGCTTGCCGACGCACCCAAGCGGGCGATGGCTGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTGCCGCCCCTGGCGTTGCTGGTACTGACCTTGCTCGGGCTTAACCTGGTGACCTGGCTGGCGTACCTGCTGTTCGGCCTGGCGGCGCCCGCGTGGCTCGCCTTTGCCGGTTTGGCCTTGCTGGCCTTTGCCGTGGTGTTGGCCTGGGC > NC_002947/3556344‑3556632 | gCCAGCAGGGCCTCAACAGCCAACGTACCCGCTGGGAGCACGGCCATCTGGGCTTGATGCTTGCCGACGCACCCAAGCGGGCGATGGCTGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTGCCGccc > 4:344799/1‑149 (MQ=255) agcagGGCCTCAACAGCCAACGTACCCGCTGGGAGCACGGCCATCTGGGCTTGATGCTTGCCGACGCACCCAAGCGGGCGATGGCTGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTGCCGCCCCTg < 3:344799/149‑1 (MQ=255) gCCTCAACAGCCAACGTACCCGCTGGGAGCACGGCCATCTGGGCTTGATGCTTGCCGACGCACCCAAGCGGGCGATGGCTGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTGCCGCCCCTGGCGTTg < 5:83898/149‑1 (MQ=255) ccTCAACAGCCAACGTACCCGCTGGGAGCACGGCCATCTGGGCTTGATGCTTGCCGACGCACCCAAGCGGGCGATGGCTGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTGCCGCCCCTGGCGTTGc > 1:258852/1‑149 (MQ=255) cTCAACAGCCAACGTACCCGCTGGGAGCACGGCCATCTGGGCTTGATGCTTGCCGACGCACCCAAGCGGGCGATGGCTGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTGCCGCCCCTGGCGTTGCt > 2:393140/1‑149 (MQ=255) aaCAGCCAACGTACCCGCTGGGAGCACGGCCATCTGGGCTTGATGCTTGCCGACGCACCCAAGCGGGCGATGGCTGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTGCCGCCCCTGGCGTTGCTgg < 2:194296/148‑1 (MQ=255) aaCAGCCAACGTACCCGCTGGGAGCACGGCCATCTGGGCTTGATGCTTGCCGACGCACCCAAGCGGGCGATGGCTGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTGCCGCCCCTGGCGTTGCTg < 1:255284/147‑1 (MQ=255) aGCCAACGTACCCGCTGGGAGCACGGCCATCTGGGCTTGATGCTTGCCGACGCACCCAAGCGGGCGATGGCTGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTGCCGCCCCTGGCGTTGCTGGTACt < 2:281490/149‑1 (MQ=255) cAACGTACCCGCTGGGAGCACGGCCATCTGGGCTTGATGCTTGCCGACGCACCCAAGCGGGCGATGGCTGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTGCCGCCCCTGGCGTTGCTGGTACTGAc < 1:157217/149‑1 (MQ=255) aaCGTACCCGCTGGGAGCACGGCCATCTGGGCTTGATGCTTGCCGACGCACCCAAGCGGGCGATGGCTGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTGCCGCCCCTGGCGTTGCTGGTACTGAcc < 6:401535/149‑1 (MQ=255) ccGCTGGGAGCACGGCCATCTGGGCTTGATGCTTGCCGACGCACCCAAGCGGGCGATGGCTGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTGCCGCCCCTgg > 3:84219/1‑125 (MQ=255) ccGCTGGGAGCACGGCCATCTGGGCTTGATGCTTGCCGACGCACCCAAGCGGGCGATGGCTGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTGCCGCCCCTgg < 4:84219/125‑1 (MQ=255) cGCTGGGAGCACGGCCATCTGGGCTTGATGCTTGCCGACGCACCCAAGCGGGCGATGGCTGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTGCCGCCCCTGGCGTTGCTGGTACTGACCTTGCTCgg < 2:59221/149‑1 (MQ=255) gCTGGGAGCACGGCCATCTGGGCTTGATGCTTGCCGACGCACCCAAGCGGGCGATGGCTGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTGCCGCCCCTGGCGTTGCTGGTACTGACCTTGCTCggg < 5:84941/149‑1 (MQ=255) gCTGGGAGCACGGCCATCTGGGCTTGATGCTTGCCGACGCACCCAAGCGGGCGATGGCTGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTGCCGCCCCTGGCGTTGCTGGTACTGACCTTGCTCggg > 2:414632/1‑149 (MQ=255) gCTGGGAGCACGGCCATCTGGGCTTGATGCTTGCCGACGCACCCAAGCGGGCGATGGCTGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTGCCGCCCCTGGCGTTGCTGGTACTGACCTTGCTCggg < 6:166036/149‑1 (MQ=255) cGGCCATCTGGGCTTGATGCTTGCCGACGCACCCAAGCGGGCGATGGCTGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTGCCGCCCCTGGCGTTGCTGGTACTGACCTTGCTCGGGCTTAACCTgg > 6:170550/1‑149 (MQ=255) tGGGCTTGATGCTTGCCGACGCACCCAAGCGGGCGATGGCTGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTGCCGCCCCTGGCGTTGCTGGTACTGACCTTGCTCGGGCTTACCCTGGTGACctgg > 8:246673/1‑149 (MQ=255) ggCTTGATGCTTGCCGACGCACCCAAGCGGGCGATGGCTGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTGCCGCCCCTGGCGTTGCTGGTACTGACCTTGCTCGGGCTTAACCTGGTGACctggct < 5:170550/149‑1 (MQ=255) cTTGATGCTTGCCGACGCACCCAAGCGGGCGATGGCTGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTGCCGCCCCTGGCGTTGCTGGTACTGACCTTGCTCGGGCTTAACCTGGTGACctggctgg < 3:388451/149‑1 (MQ=255) tGCTTGCCGACGCACCCAAGCGGGCGATGGCTGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTGCCGCCCCTGGCGTTGCTGGTACTGACCTTGCTCGGGCTTAACCTGGTGACCTGGCTGGCGTAc < 4:165176/149‑1 (MQ=255) gCTTGCCGACGCACCCAAGCGGGCGATGGCTGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTGCCGCCCCTGGCGTTGCTGGTACTGACCTTGCTCGGGCTTAACCTGGTGACCTGGCTGGCGTAcc > 2:37212/1‑149 (MQ=255) gCCGACGCACCCAAGCGGGCGATGGCTGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTGCCGCCCCTGGCGTTGCTGGTACTGACCTTGCTCGGGCTTAACCTGGTGACCTGGCTGGCGTACctgct > 8:61589/1‑149 (MQ=255) gCCGACGCACCCAAGCGGGCGATGGCTGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTGCCGCCCCTGGCGTTGCTGGTACTGACCTTGCTCGGGCTTAACCTGGTGACCTGGCTGGCGTACctgct > 3:213333/1‑149 (MQ=255) gCCGACGCACCCAAGCGGGCGATGGCTGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTGCCGCCCCTGGCGTTGCTGGTACTGACCTTGCTCGGGCTTAACCTGGTGACCTGGCTGGCGTACctg < 5:90929/147‑1 (MQ=255) ccGACGCACCCAAGCGGGCGATGGCTGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTGCCGCCCCTGGCGTTGCTGGTACTGACCTTGCTCGGGCTTAACCTGGTGACCTGGCTGGCGTACctgctg > 7:116332/1‑149 (MQ=255) cGACGCACCCAAGCGGGCGATGGCTGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTGCCGCCCCTGGCGTTGCTGGTACTGACCTTGCTCGGGCTTAACCTGGTGACCtggctggc > 1:346881/1‑138 (MQ=255) cGACGCACCCAAGCGGGCGATGGCTGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTGCCGCCCCTGGCGTTGCTGGTACTGACCTTGCTCGGGCTTAACCTGGTGACCtggctggc < 2:346881/138‑1 (MQ=255) cGACGCACCCAAGCGGGCGATGGCTGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTGCCGCCCCTGGCGTTGCTGGTACTGACCTTGCTCGGGCTTAACCTGGTGACCTGGCTGGCGTACCTGCTGt > 1:22382/1‑149 (MQ=255) aCGCACCCAAGCGGGCGATGGCTGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTGCCGCCCCTGGCGTTGCTGGTACTGACCTTGCTCGGGCTTAACCTGGTGACCTGGCTGGCGTACCTGCTGTTc < 4:213333/149‑1 (MQ=255) aCGCACCCAAGCGGGCGATGGCTGCCAGCACCCAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTGCCGCCCCTGGCGTTGCTGGTACTGACCTTGCTCGGGCTTAACCTGGTGACCTGGCTGGCGTACCTGCTGTTc < 5:250098/149‑1 (MQ=255) aCCCAAGCGGGCGATGGCTGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTGCCGCCCCTGGCGTTGCTGGTACTGACCTTGCTCGGGCTTAACCTGGTGACCTGGCTGGCGTACCTGCTGTTCGGcc < 2:258852/149‑1 (MQ=255) ccAAGCGGGCGATGGCTGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTGCCGCCCCTGGCGTTGCTGGTACTGACCTTGCTCGGGCTTAACCTGGTGACCTGGCTGGCGTACCTGCTGTTCGGCCTg > 2:98771/1‑149 (MQ=255) ccAAGCGGGCGATGGCTGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTGCCGCCCCTGGCGTTGCTGGTACTGACCTTGCTCGGGCTTAACCTGGTGACCTGGCTGGCGTACCTGCTGTTCGGCCTg > 6:386383/1‑149 (MQ=255) cGGGCGATGGCTGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTGCCGCCCCTGGCGTTGCTGGTACTGACCTTGCTCGGGCTTAACCTGGTGACCTGGCTGGCGTACCTGCTGTTCGGCCTggcggc < 4:322495/149‑1 (MQ=255) aTGGCTGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTGCCGCCCCTGGCGTTGCTGGTACTGACCTTGCTCGGGCTTAACCTGGTGACCTGGCTGGCGTACCTGCTGTTCGGCCTGGCGGCGCCcgc < 8:116332/149‑1 (MQ=255) cTGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTGCCGCCCCTGGCGTTGCTGGTACTGACCTTGCTCGGGCTTAACCTGGTGACCTGGCTGGCGTACCTGCTGTTCGGCCTGGCGGCGCCCGCGTgg > 6:222811/1‑149 (MQ=255) tGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTGCCGCCCCTGGCGTTGCTGGTACTGACCTTGCTCGGGCTTAACCTGGTGACCTGGCTGGCGTACCTGCTGTTCGGCCTGGCGGCGCCCGCGTGGc > 8:28451/1‑149 (MQ=255) cccAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTGCCGCCCCTGGCGTTGCTGGTACTGACCTTGCTCGGGCTTAACCTGGTGACCTGGCTGGCGTACCTGCTGTTCGGCCTGGCGGCGCCCGCGTGGCTCGCCttt < 1:98771/149‑1 (MQ=255) cccAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTGCCGCCCCTGGCGTTGCTGGTACTGACCTTGCTCGGGCTTAACCTGGTGACCTGGCTGGCGTACCTGCTGTTCGGCCTGGCGGCGCCCGCGTGGCTCGCCttt > 1:86614/1‑149 (MQ=255) ccAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGCCCCTGGACTTGCTGGTGCCGCCCCTGGCGTTGCTGGTACTGACCTTGCTCGGGCTTAACCTGGTGACCTGGCTGGCGTACCTGCTGTTCGGCCTGGCGGCGCCCGCGTGGCTCGCCTTTg < 5:237029/149‑1 (MQ=255) ccAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTgccgcccctggcgttgctgggtgatggcagccatcgcccgcttgggtgcgtcggcaagcatcaagcccagatggccgtgctcccagcgggtacgttggctgtt < 4:181781‑M2/148‑104 (MQ=255) gCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTGCCGCCCCTGGCGTTGCTGGTACTGACCTTGCTCGGGCTTAACCTGGTGACCTGGCTGGCGTACCTGCTGTTCGGCCTGGCGGCGCCCGCGTGGCTCGCCTTTGCCg < 3:81821/149‑1 (MQ=255) gTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTGCCGCCCCTGGCGTTGCTGGTACTGACCTTGCTCGGGCTTAACCTGGTGACCTGGCTGGCGTACCTGCTGTTCGGCCTGGCGGCGCCCGCGTGGCTCGCCTTTGCCGGt < 7:12012/149‑1 (MQ=255) aaCGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTGCCGCCCCTGGCGTTGCTGGTACTGACCTTGCTCGGGCTTAACCTGGTGACCTGGCTGGCGTACCTGCTGTTCGGCCTGGCGGCGCCCGCGTGGCTCGCCTTTGc < 1:249228/143‑1 (MQ=255) aaCGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTGCCGCCCCTGGCGTTGCTGGTACTGACCTTGCTCGGGCTTAACCTGGTGACCTGGCTGGCGTACCTGCTGTTCGGCCTGGCGGCGCCCGCGTGGCTCGCCTTTGc > 2:249228/1‑143 (MQ=255) aCGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTGCCGCCCCTGGCGTTGCTGGTACTGACCTTGCTCGGGCTTAACCTGGTGACCTGGCTGGCGTACCTGCTGTTCGGCCTGGCGGCGCCCGCGTGGCTCGCCTTTGCCGGttt < 1:37212/148‑1 (MQ=255) aCGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTGCCGCCCCTGGCGTTGCTGGTACTGACCTTGCTCGGGCTTAACCTGGTGACCTGGCTGGCGTACCTGCTGTTCGGCCTGGCGGCGCCCGCGTGGCTCGCCTTTGCCGGttt < 2:22382/148‑1 (MQ=255) gCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTGCCGCCCCTGGCGTTGCTGGTACTGACCTTGCTCGGGCTTAACCTGGTGACCTGGCTGGCGTACCTGCTGTTCGGCCTGGCGGCGCCCGCGTGGCTCGCCTTTGCCGGTTTGGc > 4:97340/1‑149 (MQ=255) aGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTGCCGCCCCTGGCGTTGCTGGTACTGACCTTGCTCGGGCTTAACCTGGTGACCTGGCTGGCGTACCTGCTGTTCGGCCTGGCGGCGCCCGCGTGGCTCGCCTTTGCCGGTTTGGCCtt > 5:126152/1‑149 (MQ=255) gCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTgccgccaggctagcgttacgctgggtgatggcagccatcgcccgcttgggtgcgtcggcaagcatcaagcccagatggccgtgctcccagcgggtacgttggctgttgaggccctgct < 5:331084‑M2/149‑119 (MQ=255) cTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTGCCGCCCCTGGCGTTGCTGGTACTGACCTTGCTCGGGCTTAACCTGGTGACCTGGCTGGCGTACCTGCTGTTCGGCCTGGCGGCGCCCGCGTGGCTCGCCTTTGCCGGTTTGGCCTTGCt > 3:261577/1‑149 (MQ=255) tGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTgccgccaggctagcgttacgctgggtgatggcagccatcgcccgcttgggtgcgtcggcaagcatcaagcccagatggccgtgctcccagcgggtacgttggc < 2:143977‑M2/131‑104 (MQ=255) tGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTgccgccaggctagcgttacgctgggtgatggcacccatcgcccgcttgggtgcgtcggcaagcatcaagcccagatggccgtgctcccagcgggtacgttggc > 1:143977‑M2/1‑28 (MQ=255) cTTGACCCTGGACTTGCTGGTGCCGCCCCTGGCGTTGCTGGTACTGACCTTGCTCGGGCTTAACCTGGTGACCTGGCTGGCGTACCTGCTGTTCGGCCTGGCGGCGCCCGCGTGGCTCGCCTTTGCCGGTTTGGCCTTGCTg > 1:236620/1‑142 (MQ=255) cTTGACCCTGGACTTGCTGGTGCCGCCCCTGGCGTTGCTGGTACTGACCTTGCTCGGGCTTAACCTGGTGACCTGGCTGGCGTACCTGCTGTTCGGCCTGGCGGCGCCCGCGTGGCTCGCCTTTGCCGGTTTGGCCTTGCTg < 2:236620/142‑1 (MQ=255) gACCCTGGACTTGCTGGTGCCGCGCCTGGCGTTGCTGGTACTGACCTTGCTCGGGCTTAACCTGGTGACCTGGCTGGCGTACCTGCTGTTCGGCCTGGCGGCGCCCGCGTGGCTCGCCTTTGCCGGTTTGGCCTTGCTGGCCTTTGCCg > 4:33704/1‑149 (MQ=255) gACCCTGGACTTGCTGGTGCCGCCCCTGGCGTTGCTGGTACTGACCTTGCTCGGGCTTAACCTGGTGACCTGGCTGGCGTACCTGCTGTTCGGCCTGGCGGCGCCCGCGTGGCTCGCCTTTGCCGGTTTGGCCTTGCTGGCCTTTGcc < 5:386383/148‑1 (MQ=255) ccTGGACTTGCTGGTGCCGCCCCTGGCGTTGCTGGTACTGACCTTGCTCGGGCTTAACCTGGTGACCTGGCTGGCGTACCTGCTGTTCGGCCTGGCGGCGCCCGCGTGGCTCGCCTTTGCCGGTTTGGCCTTGCTGGCCTTTGCCgtgg > 2:428622/1‑149 (MQ=255) ccTGGACTTGCTGGTGCCGCCCCTGGCGTTGCTGGTACTGACCTTGCTCGGGCTTAACCTGGTGACCTGGCTGGCGTACCTGCTGTTCGGCCTGGCGGCGCCCGCGTGGCTCGCCTTTGCCGGTTTGGCCTTGCTGGCCTTTGCCgtgg > 8:268603/1‑149 (MQ=255) tGGACTTGCTGGTGCCGCCCCTGGCGTTGCTGGTACTGACCTTGCTCGGGCTTAACCTGGTGACCTGGCTGGCGTACCTGCTGTTCGGCCTGGCGGCGCCCGCGTGGCTCGCCTTTGCCGGTTTGGCCTTGCTGGCCTTTGCCgtggtg > 6:312627/1‑149 (MQ=255) gACTTGCTGGTGCCGCCCCTGGCGTTGCTGGTACTGACCTTGCTCGGGCTTAACCTGGTGACCTGGCTGGCGTACCTGCTGTTCGGCCTGGCGGCGCCCGCGTGGCTCGCCTTTGCCGGTTTGGCCTTGCTGGCCTTTGCCGTGGTGtt < 4:261577/149‑1 (MQ=255) ggTGCCGCCCCTGGCGTTGCTGGTACTGACCTTGCTCGGGCTTAACCTGGTGACCTGGCTGGCGTACCTGCTGTTCGGCCTGGCGGCGCCCGCGTGGCTCGCCTTTGCCGGTTTGGCCTTGCTGGCCTTTGCCGTGGTGTTGGCCTggg > 5:370115/1‑149 (MQ=255) gTGCCGCCCCTGGCGTTGCTGGTACTGACCTTGCTCGGGCTTAACCTGGTGACCTGGCTGGCGTACCTGCTGTTCGGCCTGGCGGCGCCCGCGTGGCTCGCCTTTGCCGGTTTGGCCTTGCTGGCCTTTGCCGTGGTGTTGGCCTgg < 1:393140/147‑1 (MQ=255) gTGCCGCCCCTGGCGTTGCTGGTACTGACCTTGCTCGGGCTTAACCTGGTGACCTGGCTGGCGTACCTGCTGTTCGGCCTGGCGGCGCCCGCGTGGCTCGCCTTTGCCGGTTTGGCCTTGCTGGCCTTTGCCGTGGTGTTGGCCTGGgc > 3:183602/1‑149 (MQ=255) | GCCAGCAGGGCCTCAACAGCCAACGTACCCGCTGGGAGCACGGCCATCTGGGCTTGATGCTTGCCGACGCACCCAAGCGGGCGATGGCTGCCATCACCCAGCGTAACGCTAGCCTGGCGGCCTTGACCCTGGACTTGCTGGTGCCGCCCCTGGCGTTGCTGGTACTGACCTTGCTCGGGCTTAACCTGGTGACCTGGCTGGCGTACCTGCTGTTCGGCCTGGCGGCGCCCGCGTGGCTCGCCTTTGCCGGTTTGGCCTTGCTGGCCTTTGCCGTGGTGTTGGCCTGGGC > NC_002947/3556344‑3556632 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |