New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5000481 = | 62 (0.870) | 3 (0.040) | 3/254 | NT | 5.5% | coding (1334/1383 nt) | PP_4407 | gamma‑aminobutyrate transporter |
? | NC_002947 | 5000541 = | 44 (0.650) | intergenic (+11/‑1675) | PP_4407/PP_4409 | gamma‑aminobutyrate transporter/site‑specific recombinase |
CCAGGCGTTCGACCCGGCATCGCGTTTCCAATTCTGGTTCACGGTGCTGACGGTACTGCTGGTGGTGGCGGGGTACTTCCTGATGCGCCAGCGGCTGGCGTCAAGCGCGGTGTTAGCCCACGAACGTGATGCATGACAGCGCTGGCCACGCGCAGGTGCTGTCAACAGCAGCATGGCGGCAACGAAGACGACGGAGACAAGATGGGAATGACGAGAATGGCGTCCCAGGCAGGAATTGAACCCTTATCTGGGGTGCCTCCTGCCTGATCAAGGTGCCGTGGTGCGGTATGC > NC_002947/5000395‑5000685 | ctgcctgggacgccattctcgtcattcccatcttgtctccgtcgtcttcgttgccgccatgctgctgttgacagcacctgcgcgtgGCCAGCGGCTGGCGTCAAGCGCGGTGTTAGCCCACGAACGTGATGCATGACAGCGCTGGCCa > 1:122997‑M1/87‑148 (MQ=255) ccAGGCGTTCGACCCGGCATCGCGTTTCGAATTCTGGTTCACGGTGCTGACGGTACTGCTGGTGGTGGCGGGGTACTTCCTGATGCGCCAGCGGCTGGCGTCAAGCGCGGTGTTAGCCCACGAACGTGATGCATGACAGCGCTGGCCAc > 1:246963/1‑149 (MQ=255) ccAGGCGTTCGACCCGGCATCGCGTTTCCAATTCTGGTTCACGGTGCTGACGGTACTGCTGGTGGTGGCGGGGTACTTCCTGATGCGCCAGCGGCTGGCGTCAAGCGCGGTGTTAGCCCACGAACGTGATGCATGACAGCGCTGGCCAc > 2:402341/1‑149 (MQ=255) ccAGGCGTTCGACCCGGCATCGCGTTTCCAATTCTGGTTCACGGTGCTGACGGTACTGCTGGTGGTGGCGGGGTACTTCCTGATGCGCCAGCGGCTGGCGTCAAGCGCGGTGTTAGCCCACGAACGTGATGCATGACAGCGCTGGCCAc > 1:209840/1‑149 (MQ=255) gACCCGGCATCGCGTTTCCAATTCTGGTTCACGGTGCTGACGGTACTGCTGGTGGTGGCGGGGTACTTCCTGATGCGCCAGCGGCTGGCGTCAAGCGCGGTGTTAGCCCACGAACGTGATGCATGACAGCGCTGGCCACGCGCAGGTg < 3:212291/148‑1 (MQ=255) aCCCGGCATCGCGTTTCCAATTCTGGTTCACGGTGCTGACGGTACTGCTGGTGGTGGCGGGGTACTTCCTGATGCGCCAGCGGCTGGCGTCAAGCGCGGTGTTAGCCCACGAACGTGATGCATGACAGCGCTGGCCACGCGCAGGTGCt < 1:374178/149‑1 (MQ=255) aCCCGGCATCGCGTTTCCAATTCTGGTTCACGGTGCTGACGGTACTGCTGGTGGTGGCGGGGTACTTCCTGATGCGCCAGCGGCTGGCGTCAAGCGCGGTGTTAGCCCACGAACGTGATGCATGACAGCGCTGGCCACGCGCAGGTGCt < 3:313211/149‑1 (MQ=255) aCCCGGCATCGCGTGTCCAATTCTGGTTCACGGTGCTGACGGTACTGCTGGTGGTGGCGTGGTACTTCCTGATGCGCCAGCGGCTGGCGTCAAGCGCGGTGTTAGCCCACGAACGTGATGCATGACAGCGCTGGCCACGCGCAGGTGCt < 7:179928/149‑1 (MQ=255) cATCGCGTTTCCAATTCTGGTTCACGGTGCTGACGGTACTGCTGGTGGTGGCGGGGTACTTCCTGATGCGCCAGCGGCTGGCGTCAAGCGCGGTGTTAGCCCACGAACGTGATGCATGACAGCGCTGGCCACGCGCAGGTGCTGTCAAc < 6:189563/149‑1 (MQ=255) cATCGCGTTT‑CAATTCTGCTTCACGGTGCTGACGGTACTTCTTGTGGTGGCTGGGTACTTCCTGATGCGCCATCGGGTGGCGTCAAGCGCGGTGTTAGCCCACGAACGTGATGCATGACAGCGCTGGCCACGCGCAGGTGCTGTCAAca < 7:285530/149‑1 (MQ=255) gcgTTTCCAATTCTGGTTCACGGTGCTGACGGTACTGCTGGTGGTGGCGGGGTACTTCCTGATGCGCCAGCAGCTGGCGTCAAGCGCGGTGTTAGCCCACGAACGTGATGCATGACAGCGCTGGCCACGCGCAGGTGCTGTCAAcagca < 8:316722/149‑1 (MQ=255) gTTTCCAATTCTGGTTCACGGTGCTGACGGTACTGCTGGTGGTGGCGGGGTACTTCCTGATGCGCCAGCGGCTGGCGTCAAGCGCGGTGTTAGCCCACGAACGTGATGCATGACAGCGCTGGCCACGCGCAGGTGCTGTCAAcagcag > 3:15237/1‑148 (MQ=255) gTTTCCAATTCTGGTTCACGGTGCTGACGGTACTGCTGGTGGTGGCGGGGTACTTCCTGATGCGCCAGCGGCTGGCGTCAAGCGCGGTGTTAGCCCACGAACGTGATGCATGACAGCGCTGGCCACGCGCAGGTGCTGTCAAcagcag > 3:321899/1‑148 (MQ=255) aaTTCTGGTTCACGGTGCTGACGGTACTGCTGGTGGTGGCGGGGTACTTCCTGATGCGCCAGCGGCTGGCGTCAAGCGCGGTGTTAGCCCACGAACGTGATGCATGACAGCGCTGGCCACGCGCAGGTGCTGTCAACAGCAGCATggcg > 2:413091/1‑149 (MQ=255) aaTTCTGGTTCACGGTGCTGACGGTACTGCTGGTGGTGGCGGGGTACTTCCTGATGCGCCAGCGGCTGGCGTCAAGCGCGGTGTTAGCCCACGAACGTGATGCATGACAGCGCTGGCCACGCGCAGGTGCTGTCAACAGCAGCATggcg < 2:246963/149‑1 (MQ=255) aaTTCTGGTTCACGGTGCTGACGGTACTGCTGGTGGTGGCGGGGTACTTCCTGATGCGCCAGCGGCTGGCGTCAAGCGCGGTGTTAGCCCACGAACGTGATGCATGACAGCGCTGGCCACGCGCAGGTGCTGTCAACAGCAGCATggcg < 3:357834/149‑1 (MQ=255) gTTCACGGTGCTGACGGTACTGCTGGTGGTGGCGGGGTACTTCCTGATGCGCCAGCGGCTGGCGTCAAGCGCGGTGTTAGCCCACGAACGTGATGCATGACAGCGCTGGCCAcgc > 5:1580/1‑115 (MQ=255) gTTCACGGTGCTGACGGTACTGCTGGTGGTGGCGGGGTACTTCCTGATGCGCCAGCGGCTGGCGTCAAGCGCGGTGTTAGCCCACGAACGTGATGCATGACAGCGCTGGCCAcgc < 6:1580/115‑1 (MQ=255) tGCTGACGGTACTGCTGGTGGTGGCGGGGTACTTCCTGATGCGCCAGCGGCTGGCGTCAAGCGCGGTGTTAGCCCACGAACGTGATGCATGACAGCGCTGGCCACGCGCAGGTGCTGTCAACAGCAGCATGGCGGCAACGAAGacgacg < 6:38212/149‑1 (MQ=255) gACGGTACTGCTGGTGGTGGCGGGGTACTTCCTGATGCGCCAGCGGCTGGAGTCAAGCGCGGTGTTAGCCCACGAACGTGATGCATGACAGCGCTGGCCACGCGCAGGTGCTGTCAACAGCAGCATGGCGGCAACGAAGACGACGgag > 5:192685/1‑148 (MQ=255) aCGGTACTGCTGGTGGTGGCGGGGTACTTCCTGATGCGCCAGCGGCTGGCGTCAAGCGCGGTGTTAGCCCACGAACGTGATGCATGACAGCGCTGGCCACGCGCAGGTGCTGTCAACAGCAGCATGGCGGCAACGAAGACGACGGAGAc < 3:357561/149‑1 (MQ=255) tgctgGTGGTGGCGGGGTACTTCCTGATGCGCCAGCGGCTGGCGTCAAGCGCGGTGTTAGCCCACGAACGTGATGCATGACAGCGCTGGCCACGCGCAGGTGCt < 8:317767/104‑1 (MQ=255) tgctgGTGGTGGCGGGGTACTTCCTGATGCGCCAGCGGCTGGCGTCAAGCGCGGTGTTAGCCCACGAACGTGATGCATGACAGCGCTGGCCACGCGCAGGTGCt > 7:317767/1‑104 (MQ=255) gctgGTGGTGGCGGGGTACTTCCTGATGCGCCAGCGGCTGGCGTCAAGCGCGGTGTTAGCCAACGAACGTGATGCATGACAGCGCTGGCCACGCGCAGGTGCTGTCAACAGCAGCATGGCGGCAACGAAGACGACGGAGACAAGATgg > 8:190967/1‑148 (MQ=255) ctgGTGGTGGCGGGGTACTTCCTGATGCGCCAGCGGCTGGCGTCAAGCGCGGTGTTAGCCCACGAACGTGATGCATGACAGCGCTGGCCACGCGCAGGTGCTGTCAACAGCAGCATGGCGGCAACGAAGACGACGGAGACAAGATgg < 2:209840/147‑1 (MQ=255) gtggtggCGGGGTAGTTCCTGATGCGCCAGCGGCTGGCGTCAAGCGCGGTGTTAGCCCACGAAGGTGATGCATGACAGCGCTGGCCACGCGAAGGTGCTGTCCACAGCAGCATGGCGGCAACGAAGACGCCGGAGACAAGAACGGAAt > 3:38254/1‑148 (MQ=255) gtggCGGGGTACTTCCTGATGCGCCAGCGGCTGGCGTCAAGCGCGGTGTTAGCCCACGAACGTGATGCATGACAGCGCTGGCCACGCGCAGGTGCTGTCAACAGCAGCATGGCGGCAACGAAGACGACGGAGACAAGATGGGAATGAc < 1:147764/148‑1 (MQ=255) gtggCGGGGTACTTCCTGATGCGCCAGCGGCTGGCGTCAAGCGCGGTGTTAGCCCACGAACGTGATGCATGACAGCGCTGGCCACGCGCAGGTGCTGTCAACAGCAGCATGGCGGCAACGAAGACGACGGAGACAAGATGGGAATGACg < 1:413091/149‑1 (MQ=255) ggCGGGGTACTTCCTGATGCGCCAGCGGCTGGCGTCAAGCGCGGTGTTAGCCCACGAACGTGATGCATGACAGCGCTGGCCACGCGCAGGTGCTGTCAACAGCAGCATGGCGGCAACGAAga > 1:134891/1‑122 (MQ=255) ggCGGGGTACTTCCTGATGCGCCAGCGGCTGGCGTCAAGCGCGGTGTTAGCCCACGAACGTGATGCATGACAGCGCTGGCCACGCGCAGGTGCTGTCAACAGCAGCATGGCGGCAACGAAga < 2:134891/122‑1 (MQ=255) ttCCTGATGCGCCAGCGGCTGGCGTCAAGCGCGGTGTTAGCCCACGAACGTGATGCATGACAGCGCTGGCCACGCGCAGGTGCTGTCAACAGCAGCATGGCGGCAACGAAGACGACGGAGACAAGATGGGAATGACGAGAATGGc > 6:64276/1‑145 (MQ=255) ttCCTGATGCGCCAGCGGCTGGCGTCAAGCGCGGTGTTAGCCCACGAACGTGATGCATGACAGCGCTGGCCACGCGCAGGTGCTGTCAACAGCAGCATGGCGGCAACGAAGACGACGGAGACAAGATGGGAATGACGAGAATGGc < 5:64276/145‑1 (MQ=255) ttCCTGATGCGCCAGCGGCTGGCGTCAAGCGCGGTGTTAGCCCACGAACGTGATGCATGACAGCGCTGGCCACGCGCAGGTGCTGTCAACAGCAGCATGGCGGCAACGAAGACGACGGAGACAAGATGGGAATGACGAGAATGGCGTcc > 4:63089/1‑149 (MQ=255) aTGCGCCAGCGGCTGGCGTCAAGCGCGGTGTTAGCCCACGAACGTGATGCATGACAGCGCTGGCCACGCGCAGGTGCTGTCAACAGCAGCATGGCGGCAACGAAGACGACGGAGACAAGATGGGAATGACGAGAATGGCGTCCcagg < 6:192685/147‑1 (MQ=255) tggccagcgctgtcatgcatcacgttcgtgggctaacaccgcgcttgacgccagccgctggcCACGCGCAGGTGCTGTCAACAGCAGCATGGCGGCAACGAAGACGACGGAGACAAGATGGGAATGACGAGAATGGCGTCCcaggcag > 1:122997‑M2/63‑148 (MQ=255) gcgcCAGCGGCTGGCGTCAAGCGCGGTGTTAGCCCACGAACGTGATGCATGACAGCGCTGGCCACGCGCAGGTGCTGTCAACAGCAGCATGGCGGCAACGAAGACGACGGAGACAAGATGGGAATGACGAGAATGGCGTCCcaggcag > 7:367275/1‑148 (MQ=255) gcgcCAGCGGCTGGCGTCAAGCGCGGTGTTAGCCCACGAACGTGATGCATGACAGCGCTGGCCACGCGCAGGTGCTGTCAACAGCAGCATGGCGGCAACGAAGACGACGGAGACAAGATGGGAATGACGAGAATGGCGTCCcaggcag < 1:402341/148‑1 (MQ=255) GCCAGCGGCTGGCGTCAAGCGCGGTGTTAGCCCACGAACGTGATGCATGACAGCGCTGGCCACGCGCAGGTGCTGTCAACAGCAGCATGGCGGCAACGAAGACGACGGAGACAAGATGGGAATGACGAGAATGGCGTCCCAGGCAGGaa < 4:98470‑M1/149‑1 (MQ=255) ccagcgctgtcatgcatcacgttcgtgggctaacaccgcgcttgacgccagccgctggcCACGCGCAGGTGCTGTCAACAGCAGCATGGCGGCAACGAAGACGACGGAGACAAGATGGGAATGACGAGAATGGCGTCCCAGGCAGGAAt > 6:383170‑M2/60‑149 (MQ=255) ccagcgctgtcatgcatcacgttcgtgggctaacaccgcgcttgacgccagccgctggcCACGCGCAGGTGCTGTCAACAGCAGCATGGCGGCAACGAAGACGACGGAGACAAGATGGGAATGACGAGAATGGCGTCCCAGGCAGGAAt < 5:383170‑M2/90‑1 (MQ=255) CCAGCGGCTGGCGTCAAGCGCGGTGTTAGCCCACGAACGTGATGCATGACAGCGCTGGCCACGCGCAGGTGCTGTCAACAGCAGCATGGCGGCAACGAAGACGACGGAGACAAGATGGGAATGACGAGAATGGCGTCCCAGGCAGGAAt < 8:141961‑M1/149‑1 (MQ=255) CCAGCGGCTGGCGTCAAGCGCGGTGTTAGCCCACGAACGTGATGCATGACAGCGCTGGCCACGCGCAGGTGCTGTCAACAGCAGCATGGCGGCAACGAAGACGACGGAGACAAGATGGGAATGACGAGAATGGCGTCCCAGGCAGGAAt < 5:378102‑M1/149‑1 (MQ=255) CAGCGGCTGGCGTCAAGCGCGGTGTTAGCCCACGAACGTGATGCATGACAGCGCTGGCCACGCGCAGGTGCTGTCAACAGCAGCATGGCGGCAACGAAGACGACGGAGACAAGATGGGAATGACGAGAATGGCGTCCCAGGCAGGAAtt < 3:104934‑M1/149‑1 (MQ=255) AGCGGCTGGCGTCAAGCGCGGTGTTAGCCCACGAACGTGATGCATGACAGCGCTGGCCACGCGCAGGTGCTGTCAACAGCAGCATGGCGGCAACGAAGACGACGGAGACAAGATGGGAATGACGAGAATGGCGTCCCAGGCAGGAAtt < 2:411118‑M1/148‑1 (MQ=255) GGCTGGCGTCAAGCGCGGTGTTAGCCCACGAACGTGATGCATGACAGCGCTGGCCACGCGCAGGTGCTGTCAACAGCAGCATGGCGGCAACGAAGACGACGGAGACAAGATGGGAATGACGAGAATGGCGTCCCAGGCAGGAATTGAAc > 4:321899‑M1/1‑149 (MQ=255) cTGGCGTCAAGCGCGGTGTTAGCCCACGAACGTGATGCATGACAGCGCTGGCCACGCGCAGGTGCTGTCAACAGCAGCATGGCGGCAACGAAGACGACGGAGACAAGATGGGAATGACGAGAATGGCGTCCCAGGCAGGAATTGAAccc > 3:199674/1‑149 (MQ=255) gCGTCAAGCGCGGTGTTAGCCCACGAACGTGATGCATGACAGCGCTGGCCACGCGCAGGTGCTGTCAACAGCAGCATGGCGGCAACGAAGACGACGGAGACAAGATGGGAATGACGAGAATGGCGTCCCAGGCAGGAATTGAACCCtt < 7:311738/148‑1 (MQ=255) cAAGCGCGGTGTTAGCCCACGAACGTGATGCATGACAGCGCTGGCCACGCGCAGGTGCTGTCAACAGCAGCATGGCGGCAACGAAGACGACGGAGACAAGATGGGAATGACGAGAATGGCGTCCCAGGCAGGAATTGAACCCTTATCTg > 5:166278/1‑149 (MQ=255) gcgcGGTGTTAGCCCACGAACGTGATGCATGACAGCGCTGGCCACGCGCAGGTGCTGTCAACAGCAGCATGGCGGCAACGAAGACGACGGAGACAAGATGGGAATGACGAGAATGGCGTCCCAGGCAGGAATTGAACCCTTATCTgggg < 3:98470/149‑1 (MQ=255) tgtTAGCCCACGAACGTGATGCATGACAGCGCTGGCCACGCGCAGGTGCTGTCAACAGCAGCATGGCGGCAACGAAGACGACGGAGACAAGATGGGAATGACGAGAATGGCGTCCCAGGCAGGAATTGAACCCTTATCTGGGGTGcctc < 2:341193/149‑1 (MQ=255) ttAGCCCACGAACGTGATGCATGACAGCGCTGGCCACGCGCAGGTGCTGTCAACAGCAGCATGGCGGCAACGAAGACGACGGAGACAAGATGGGAATGACGAGAATGGCGTCCCAGGCAGGAATTGAACCCTTATCTGGGGTGcctcct < 5:215826/149‑1 (MQ=255) gCCCACGAACGTGATGCATGACAGCGCTGGCCACGCGCAGGTGCTGTCAACAGCAGCATGGCGGCAACGAAGACGACGGAGACAAGATGGGAATGACGAGAATGGCGTCCCAGGCAGGAATTGAACCCTTATCTGGGGTGCCTcctgcc < 6:378102/149‑1 (MQ=255) cACGAACGTGATGCATGACAGCGCTGGCCACGCGCAGGTGCTGTCAACAGCAGCATGGCGGCAACGAAGACGACGGAGACAAGATGGGAATGACGAGAATGGCGTCCCAGGCAGGAATTGAACCCTTATCTGGGGTGCCTCCTGCCTGa > 3:45147/1‑149 (MQ=255) cGAACGTTATGGATGACAGCGCTGTCCACGCGCAGGTGCTCTCAACAGCATAATGGAGGCAACGAAGACGACCGAGACAAGATGGGAAAGACGAGAATGTCGTCCCATGCAGGAATTGAACCCTTATCTGTGGTGCCTCCTGCCTGATc < 4:38254/149‑1 (MQ=255) aCGTGATGCATGACAGCGCTGGCCACGCGCAGGTGCTGTCAACAGCAGCATGGCGGCAACGAAGACGACGGAGACAAGATGGGAATGACGAGAATGGCGTCCCAGGCAGGAATTGAACCCTTATCTGGGGTGCCTCCTGCCTGATCAAg < 4:136345/149‑1 (MQ=255) gTGATGCATGACAGCGCTGGCCACGCGCAGGTGCTGTCAACAGCAGCATGGCGGCAACGAAGACGACGGAGACAAGATGGGAATGACGAGAATGGCGTCCCAGGCAGGAATTGAACCCTTATCTGGGGTGCCTCCTGCCTGATCAAGGt < 1:411118/149‑1 (MQ=255) tGATGCAAGACAGCGCTGGCAACCAGCAGGTGCTGTCAACAGCAGCATGGGGGGAACGATGACGACGTAGACAAGCTGGGAATGACGAGAATGTCGTCCCAGGCAGGAATTGAACGCTTATCTGTGGTGCCTCCTGCCTGATCAAGGTg < 1:205237/149‑1 (MQ=255) ggtacATGACAGCGCTGGCCACGCGCAGGTGCTGTCAACAGCAGCATGGCGGCAACGAAGACGACGGAGACAAGATGGGAATGACGAGAATGGCGTCCCAGGCAGGAATTGAACCCTTATCTGGGGTGCCTCCTGCCTGATCAAGGTGc < 1:381524/145‑1 (MQ=255) tGCATGACAGCGCTGGCCACGCGCAGGTGCTGTCAACAGCAGCATGGCGGCAACGAAGACGACGGAGACAAGATGGGAATGACGAGAATGGCGTCCCAGGCAGGAATTGAACCCTTATCTGGGGTGCCTCCTGCCTGATCAAGGTGCCg > 8:202745/1‑149 (MQ=255) aCAGCGCTGGCCACGCGCAGGTGCTGTCAACAGCAGCATGGCGGCAACGAAGACGACGGAGACAAGATGGGAATGACGAGAATGGCGTCCCAGGCAGGAATTGAACCCTTATCTGGGGTGCCTCCTGCCTGATCAAGGTGCCGTGGTGc < 7:190967/149‑1 (MQ=255) aCAGCGCTGGCCACGCGCAGGTGCTGTCAACAGCAGCATGGCGGCAACGAAGACGACGGAGACAAGATGGGAATGACGAGAATGGCGTCCCAGGCAGGAATTGAACCCTTATCTGGGGTGCCTCCTGCCTGATCAAGGTGCCGTGGTGc < 8:367275/149‑1 (MQ=255) aGCGCTGGCCACGCGCAGGTGCTGTCAACAGCAGCATGGCGGCAACGAAGACGACGGAGACAAGATGGGAATGACGAGAATGGCGTCCCAGGCAGGAATTGAACCCTTATCTGGGGTGCCTCCTGCCTGATCAAGGTGCCGTGGTGCgg > 8:321539/1‑149 (MQ=255) cgctggcCACGCGCAGGTGCTGTCAACAGCAGCATGGCGGCAACGAAGACGACGGAGACAAGATGGGAATGACGAGAATGGCGTCCCAGGCAGGAATTGAACCCTTATCTGGGGTGCCTCCTGCCTGATCAAGGTGCCGTGGTGCGGTa < 4:199674‑M2/142‑1 (MQ=255) cgctggcCACGCGCAGGTGCTGTCAACAGCAGCATGGCGGCAACGAAGACGACGGAGACAAGATGGGAATGACGAGAATGGCGTCCCAGGCAGGAATTGAACCCTTATCTGGGGTGCCTCCTGCCTGATCAAGGTGCCGTGGTGCGGTa > 4:119119‑M2/8‑149 (MQ=255) gctggcCACGCGCAGGTGCTGTCAACAGCAGCATGGCGGCAACGAAGACGACGGAGACAAGATGGGAATGACGAGAATGGCGTCCCAGGCAGGAATTGAACCCTTATCTGGGGTGCCTCCTGCCTGATCAAGGTGCCGTGGTGCGGTAt < 2:122997‑M2/143‑1 (MQ=255) tggcCACGCGCAGGTGCTGTCAACAGCAGCATGGCGGCAACGAAGACGACGGAGACAAGATGGGAATGACGAGAATGGCGTCCCAGGCAGGAATTGAACCCTTATCTGGGGTGCCTCCTGCCTGATCAAGGTGCCGTGGTGCGGTATg > 1:17069‑M2/5‑148 (MQ=255) gcCACGCGCAGGTGCTGTCAACAGCAGCATGGCGGCAACGAAGACGACGGAGACAAGATGGGAATGACGAGAATGGCGTCCCAGGCAGGAATTGAACCCTTATCTGGGGTGCCTCCTGCCTGATCAAGGTGCCGTGGTGCGGTATGc < 4:45147‑M2/145‑1 (MQ=255) | CCAGGCGTTCGACCCGGCATCGCGTTTCCAATTCTGGTTCACGGTGCTGACGGTACTGCTGGTGGTGGCGGGGTACTTCCTGATGCGCCAGCGGCTGGCGTCAAGCGCGGTGTTAGCCCACGAACGTGATGCATGACAGCGCTGGCCACGCGCAGGTGCTGTCAACAGCAGCATGGCGGCAACGAAGACGACGGAGACAAGATGGGAATGACGAGAATGGCGTCCCAGGCAGGAATTGAACCCTTATCTGGGGTGCCTCCTGCCTGATCAAGGTGCCGTGGTGCGGTATGC > NC_002947/5000395‑5000685 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |