New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | = 5865354 | 76 (1.060) | 4 (0.060) | 4/246 | NT | 5.2% | coding (797/2253 nt) | cadA‑III | cadmium translocating P‑type ATPase |
? | NC_002947 | = 5865380 | 75 (1.140) | coding (771/2253 nt) | cadA‑III | cadmium translocating P‑type ATPase |
ACAGGCAGGCTTTCACCGGTAATCGGCGCCTGATCGACGCTGGATTGCCCGCGGGTCACTTCACCGTCCAGTCCGATGCGCTCACCGGGGCGCACCCGCACCAGTGCGCCGATGGCCACCTCACGCACGTCCAGCTCGCGCCACTGGCCATCGGCCTGCTGCACCGTGGCCATGTCCGGGGTCAGCTGCATCAACCCGCCAATGGCATTGCGCGCACGGTCCAGCGAGCGCGCTTCGATCAGTTCGGCAACGGTGAACAGCACCATCACCATAGCCGCTTCCGGCCACTGG > NC_002947/5865237‑5865527 | acaGGCAGGCTTTCACCGGTAATCGGCGCCTGATCGACGCTGGATTGCCCGCGGGTCACTTCACCGTCCAGTCCGATGCGCTCACCGGGGCGCACCCGCACCAGTGCGCCGATGGCCACCTCACGCACGTCCAGCTCGCGCCACtggc < 7:258423‑M2/148‑5 (MQ=255) gcaggcTTTCACCGGTAATCGGCGCCTGATCGACGCTGGATTGCCCGCGGGTCACTTCACCGTCCAGTCCGATGCGCTCACCGGGGCGCACCCGCACCAGTGCGCCGATGGCCACCTCACGCACGTCCAGCTCGCGCCACtggccatcg > 8:258423‑M2/1‑140 (MQ=255) aggcTTTCACCGGTAATCGGCGCCTGATCGACGCTGGATTGCCCGCGGGTCACTTCACCGTCCAATCCGATGCGCTCACCGGGGCGCACCCGCACCAGTGCGCCGATGGCCACCTCGCGCACGTCCAGCTCGCGCCACtggccatcggc < 7:4358‑M2/149‑12 (MQ=255) ggcTTTCACCGGTAATCGGCGCCTAATCGACGCTGGATTGCCCGCGGGTCACTTCACCGTCCAGTCCGATGCGCTCACCGGGGCGCACCCGCACCAGTGGGCCGATGGCCACCTCACGCACGTCCAGCTCGCGCCACTGGCCATCGGcc < 8:5935/149‑1 (MQ=255) gcTTTCACCGGTAATCGTCGCCTGGTCGACGCTGGATTGCCCGAGGGTCACTTCACCGTCCATTCCGATGCGATAACCGGGGCGCACCCGAACCAGTGCGCCGATGGCCACCTCACGCACGTCCAGCTCGCGCCACTGGCCATCGGCct > 4:244712/1‑149 (MQ=255) gcTTTCACCGGTAATCGGCGCCTGATCGACGCTGGATTTCCCGCGGGTCACTTCACCGTCCAGTCCGATGCGCTCACCGGGGCGCACCCCCACCAGTGCCCCGATGGCCACCTCACGCACGTCCAGCTCGCGCCACTGGCCATAGGCct > 8:397963/1‑149 (MQ=255) cgttCACCGGTAATCGGCGCCTGATCGACGCTGGATTGCCCGCGGGTCACTTCACCGTCCAGTCCGATGCGCTCACCGGGGCGCACCCGCACCAGTGCGCCGATGGCCACCTCACGCACGTCCAGCTCGCGCCACTGGCCATCGGCctg < 5:129912/147‑1 (MQ=255) cTTTCACCGGTAATCGGCGCCTGATCGACGCTGGATTGCCCGCGGGTCACTTCACCGTCCAGTCCGATGCGCTCACCGGGGCGCACCCGCACCAGTGCGCCGATGGCCACCTCACGCACGTCCAGCTCGCGCCACTGGCCATCGGCctg < 4:194582/149‑1 (MQ=255) tCACCGGTAATCGGCGCCTGATCGACGCTGGATTGCCCGCGGGTCACTTCACCGTCCAGTCCGATGCGCTCACCGGGGCGCACCCGCACCAGTGCGCCGATGGCCACCTCACGCACGTCCAGCTCGCGCCACTGGCCATCGGCctgct < 6:401181/148‑1 (MQ=255) cACCGGTAATCGGCGCCTGATCGACGCTGGATTGCCCGCGGGTCACTTCACCGTCCAGTCCGATGCGCTCACCGGGGCGCACCCGCACCAGTGCGCCGATGGCCACCTCACGCACGTCCAGCTCGCGCCACTGGCCATCGGCctgctg < 3:35210/148‑1 (MQ=255) cGGTAATCGGCGCCTGATCGACGCTGGATTGCCCGCGGGTCACTTCACCGTCCAGTCCGATGCGCTCACCGGGGCGCACCCGCACCAGTGCGCCGATGGCCACCTCACGCACGTCCAGCTCGCGCCACTGGCCATCGGCCTGCTGCAcc > 6:240589/1‑149 (MQ=255) ggTAATCGGCGCCTGATCGACGCTGGATTGCCCGCGGGTCACTTCACCGTCCAGTCCGATGCGCTCACCGGGGCGCACCCGCACCAGTGCGCCGATGGCCACCTCACGCACGTCCAGCTCGCGCCACTGGCCATCGGCCTGCTGCa > 5:369317/1‑146 (MQ=255) ggTAATCGGCGCCTGATCGACGCTGGATTGCCCGCGGGTCACTTCACCGTCCAGTCCGATGCGCTCACCGGGGCGCACCCGCACCAGTGCGCCGATGGCCACCTCACGCACGTCCAGCTCGCGCCACTGGCCATCGGCCTGCTGCa < 6:369317/146‑1 (MQ=255) ggTAATCGGCGCCTGATCGACGCTGGATTGCCCGCGGGTCACTTCACCGT‑CAGTCCGATGCGCTCACCGGGGCGCACCCACACCAGTGCGCCGATGGCCACCTCACGCACGTCCAGCTCGCGCCACTGGCCATCGGCCTGCTGCACCGt < 4:225515/149‑1 (MQ=255) ccTGATCGACGCTGGATTGCCCGCGGGTCACTTCACCGTCCAGTCCGATGCGCTCACCGGGGCGCACCCGCACCAGTGCGCCGATGGCCACCTCACGCACGTCCAGCTCGCGCCACTGGCCATCGGCCTGCTGCACCGTGGCCATGTcc > 2:385653/1‑149 (MQ=255) gATCGACGCTGGATTGCCCGCGGGTCACTTCACCGTCCAGTCCGATGCGCTCACCGGGGCGCACCCGCACCAGTGCGCCGATGGCCACCTCACGCACGTCCAGCTCGCGCCACTGGCCATCGGCCTGCTGCACCGTGGCCATGTCCggg > 5:280690/1‑149 (MQ=255) aTCGCCGCTGGATTGCCCGCGGGTCACTTCACCGTCCAGTCCGATGCGCTCACCGGGGCGCACCCGCACCAGTGCGCCGATGGCCACCTCACGCACGTCCAGCTCGCGCCACTGGCCATCGGCCTGCTGCACCGTGGCCATGTCCgggg > 5:304008/1‑149 (MQ=255) aTCGACGCTGGATTGCCCGCGGGTCACTTCACCGTCCAGTCCGATGCGCTCACCGGGGCGCACCCGCACCAGTGCGCCGATGGCCACCTCACGCACGTCCAGCTCGCGCCACTGGCCATCGGCctgc < 4:408233/127‑1 (MQ=255) 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ttCACCGTCCAGTCCGATGCGCTCACCGGGGCGCACCCGCACCAGTGCGCCGATGGCCACCTCACGCACGTCCAGCTCGCGCCACTGGCCATCGGCCTGCTGCACCGTGGCCATGTCCGGGGTCAGCTGCATCAACCCGCCAATg < 6:150586/145‑1 (MQ=255) ttCACCGTCCAGTCCGATGCGCTCACCGGGGCGCACCCGCACCAGTGCGCCGATGGCCACCTCACGCACGTCCAGCTCGCGCCACTGGCCATCGGCCTGCTGCACCGTGGCCATGTCCGGGGTCAGCTGCATCAACCCGCCAATGGCAt > 1:140393/1‑149 (MQ=255) cACCGTCCAGTCCGATGCGCTCACCGGGGCGCACCCGCACCAGTGCGCCGATGGCCACCTCACGCACGTCCAGCTCGCGCCACTGGCCATCGGCCTGCTGCACCGTGGCCATGTCCggg > 1:371502/1‑119 (MQ=255) cACCGTCCAGTCCGATGCGCTCACCGGGGCGCACCCGCACCAGTGCGCCGATGGCCACCTCACGCACGTCCAGCTCGCGCCACTGGCCATCGGCCTGCTGCACCGTGGCCATGTCCggg < 2:371502/119‑1 (MQ=255) aCCGTCCAGTCCGATGCGCTCACCGGGGCGCACCCGCACCAGTGCGCCGATGGCCACCTCACGCACGTCCAGCTCGCGCCACTGGCCATCGGCCTGCTGCACCGTGGCCATGTCCGGGGTCAGCTGCATCAACCCGCCAATGGCATTgc < 1:385653/149‑1 (MQ=255) aCCGTCCAGTCCGATGCGCTCACCGGGGCGCACCCGCACCAGTGCGCCGATGGCCACCTCACGCACGTCCAGCTCGCGCCACTGGCCATCGGCCTGCTGCACCGTGGCCATGTCCGGGGTCAGCTGCATCAACCCGCCAATGGCATTgc > 7:177393/1‑149 (MQ=255) 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acgcacgTCCAGCTCGCGCCACTGGCCATCGGCCTGCTGCACCGTGGCCATGTCCGGGGTCAGCTGCATCAACCCGCCAATGGCATTGCGCGCACGGTCCAGCGAGCGCGCTTCGATCAGTTCGGCAACGGTGAACAGcaccatcac < 6:10381/147‑1 (MQ=255) acgTCCAGCTCGCGCCTCTGGCCATCGGCCTGCTGCACCGTGGCCATGTCCGGGGTCAGCTGCATCAACCCGCCAATGGCATTGCGCGCTCGGTCCAGCGAGCGCGCTTCGATCAGTTCGGCAACGGTGAACTGCACCATCACCATAGc < 2:348606/149‑1 (MQ=255) acgTCCAGCTCGCGCCACtggccatcggcgcactggtgcgggtgcgccccggtgagcgcatcggactggacggtgaagtgacccgcgggcaatccagcgtcgatcaggcgccgattaccggtgaaagcctgcctgtggagaagggggtg > 5:340631‑M2/1‑18 (MQ=255) acgTCCAGCTCGCGCCACTGGCCATCGGCCTGCTGCACCGTGGCCATGTCCGGGGTCAGCTGCATCAACCCGCCAATGGCATTGCGCGCACGGTCCAGCGAGCGCGCTTCGATCAGTTCGGCAACGGTGAACAGCACCATCACCATAGc > 1:397204/1‑149 (MQ=255) cgTCCAGCTCGCGCCACTGGCCATCGGCCTGCTGCACCGTGGCCATGTCCGGGGTCAGCTGCATCAACCCGCCAATGGCATTGCGCGCACGGTCCAGCGAGCGCGCTTCGATCAGTTCGGCAACGGTGAACAGCACCATCACCATAGcc < 5:262761/149‑1 (MQ=255) aGCTCGCGCCACTGGCCATCGGCCTGCTGCACCGTGGCCATGTCCGGGGTCAGCTGCATCAACCCGCCAATGGCATTGCGCGCACGGTCCAGCGAGCGCGCTTCGATCAGTTCGGCAACGGTGAACAGCACCATCACCATAGCCGCtt > 6:356938/1‑148 (MQ=255) aGCTCGCGCCACTGGCCATCGGCCTGCTGCACCGTGGCCATGTCCGGGGTCAGCTGCATCAACCCGCCAATGGCATTGCGCGCACGGTCCAGCGAGCGCGCTTCGATCAGTTCGGCAACGGTGAACAGCACCATCACCATAGCCGCTTc > 1:410950/1‑149 (MQ=255) gCTCGCGCCACTGGCCATCGGCCTGCTGCACCGTGGCCATGTCCGGGGTCAGCTGCATCAACCCGCCAATGGCATTGCGCGCACGGTCCAGCGAGCGCGCTTCGATCAGTTCGGCAACGGTGAACAGCACCATCACCATAGCCGCTTcc > 4:195752/1‑149 (MQ=255) cgcgCCACTGGCCATCGGCCTGCTGCACCGTGGCCATGTCCGGGGTCAGCTGCATCAACCCGCCAATGGCATTGCGCGCACGGTCCAGCGAGCGCGCTTCGATCAGTTCGGCAACGGTGAACAGCACCATCACCATAGCCGCTTCCGGc > 4:304505/1‑149 (MQ=255) gcgcCACTGGCCATCGGCCTGCTGCACCGTGGCCATGTCCGGGGTCAGCTGCATCAACCCGCCAATGGCATTGCGCGCACGGTCCAGCGAGCGCGCTTCGATCAGTTCGGCAACGGTGAACAGCACCATCACCATAg < 3:305181/137‑1 (MQ=255) gcgcCACTGGCCATCGGCCTGCTGCACCGTGGCCATGTCCGGGGTCAGCTGCATCAACCCGCCAATGGCATTGCGCGCACGGTCCAGCGAGCGCGCTTCGATCAGTTCGGCAACGGTGAACAGCACCATCACCATAg > 4:305181/1‑137 (MQ=255) gcgcCACTGGCCATCGGCCTGCTGCACCGTGGCCATGTCCGGGGTCAGCTGCATCAACCCGCCAATGGCATTGCGCGCACGGTCCAGCGAGCGCGCTTCGATCAGTTCGGCAACGGTGAACAGCACCATCACCATAGCCGCTTCCgg < 2:305366/147‑1 (MQ=255) gcCCCTGGCCATCGGCCTGCTGCACCGTGGCCATGTCCGGGGTCAGCTGCATCAACCCGCCAATGGCATTGCGCGCACGCTCCAGCGAGCGCGCTTCGATCAGTTCGGCAACGGTGAACAGCACCATCACCATAGCCGCTTCCGGCCAc < 4:37302/149‑1 (MQ=255) cACTGGCCATCGGCCTGCTGCACCGTGGCCATGTCCGGGGTCAGCTGCATCAACCCGCCAATGGCATTGCGCGCACGGTCCAGCGAGCGCGCTTCGATCAGTTCGGCAACGGTGAACAGCACCATCACCATAGCCGCTTCCGGCCACTg > 6:222056/1‑149 (MQ=255) cACTGGCCATCGGCCTGCTGCACCGTGGCCATGTCCGGGGTCAGCTGCATCAACCCGCCAATGGCATTGCGCGCACGGTCCAGCGAGCGCGCTTCGATCAGTTCGGCAACGGTGAACAGCACCATCACCATAGCCGCTTCCGGCCACTg < 8:382062/149‑1 (MQ=255) aCTGGCCATCGGCCTGCTGCACCGTGGCCATGTCCGGGGTCAGCTGCATCAACCCGCCAATGGCATTGCGCGCACGGTCCAGCGAGCGCGCTTCGATCAGTTCGGCAACGGTGAACAGCACCATCACCATAGCCGCTTCCGGCCACTgg < 6:368116/149‑1 (MQ=255) aCTGGCCATCGGCCTGCTGCACCGTGGCCATGTCCGGGGTCAGCTGCATCAACCCGCCAATGGCATTGCGCGCACGGTCCAGCGAGCGCGCTTCGATCAGTTCGGCAACGGTGAACAGCACCATCACCATAGCCGCTTCCGGCCACTgg > 2:240741/1‑149 (MQ=255) | ACAGGCAGGCTTTCACCGGTAATCGGCGCCTGATCGACGCTGGATTGCCCGCGGGTCACTTCACCGTCCAGTCCGATGCGCTCACCGGGGCGCACCCGCACCAGTGCGCCGATGGCCACCTCACGCACGTCCAGCTCGCGCCACTGGCCATCGGCCTGCTGCACCGTGGCCATGTCCGGGGTCAGCTGCATCAACCCGCCAATGGCATTGCGCGCACGGTCCAGCGAGCGCGCTTCGATCAGTTCGGCAACGGTGAACAGCACCATCACCATAGCCGCTTCCGGCCACTGG > NC_002947/5865237‑5865527 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |