| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 373,393 | C→G | 5.3% | T212S (ACC→AGC) | dgcB → | dimethylglycine dehydrogenase subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 373,393 | 0 | C | G | 5.3% | 245.9 / 3.8 | 76 | T212S (ACC→AGC) | dgcB | dimethylglycine dehydrogenase subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (38/34); new base G (2/2); total (40/36) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.55e-01 | |||||||||||
ATTCTGGGCCTGGGCGTGCTGTGGGGTGTGTCGGAGCTGTTCTTTGGCATGACCTGGGGCGGCCCGATGAAGCACGCCTTCGCCGGTGCCTTGCACCTGGCCTGGCACCGCCGTGCCGAACGCTTCGGCGGCGGCCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGACCCGAACGCGCCCCTTGGCGTGGAAAAGCCGGTGGACTTCACCTGGAACCAGCTGCTGGGCTTCGATGCCTGCGTGCAGTGCGGTAAATGTGAAGCCATGTGCCCGGCCTTTGCCGCTGGC > NC_002947/373251‑373541 | aTTCTGGGCCTGGGCGTGCTGTGGGGTGTGTCGGAGCTGTTCTTTGGCATGACCTGGGGCGGCCCGATGAAGCACGCCTTCGCCGGTGCCTTGCACCTGGCCTGGCACCGCCGTGCCGAACGCTTCGGCGGCGGCCGCTCCACCGGCCt > 3:326328/1‑149 (MQ=255) tgggcctgggcGTGCTGTGGGGTGTGTCGGAGCTGTTCTTTGGCATGACCTGGGGCGGCCCGATGAAGCACGCCTTCGCCGGTGCCTTGCACCTGGCCTGGCACCGCCGTGCCGAACGCTTCGGCGGCGGCCGCTCCACCGGCCTCAAg > 3:49940/1‑149 (MQ=255) ctgggcGTGCTGTGGGGTGTGTCGGAGCTGTTCTTTGGCATGACCTGGGGCGGCCCGATGAAGCACGCCTTCGCCGGTGCCTTGCACCTGGCCTGGCACCGCCGTGCCGAACGGTTCGGCGGCGGCCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCt < 4:206892/149‑1 (MQ=255) ggcGTGCTGTGGGGTGTGTCGGAGCTGTTCTTTGGCATGACCTGGGGCGGCCCGATGAAGCACGCCTTCGCCGGTGCCTTGCACCTGGCCTGGCACCGCCGTGCCGAACGCTTCGGCGGCGGCCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGa > 8:11752/1‑149 (MQ=255) gcGTGCTGTGGGGTGTGTCGGAGCTGTTCTTTGGCATGACCTGGGGCGGCCCGATGAAGCACGCCTTCGCCGGTGCCTTGCACCTGGCCTGGCACCGCCGTGCCGAACGCTTCGGCGGCGGCCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGAc < 5:44058/149‑1 (MQ=255) tGCTGTGGGGTGTGTCGGAGCTGTTCTTTGGCATGACCTGGGGCGGCCCGATGAAGCACGCCTTCGCCGGTGCCTTGCACCTGGCCTGGCACCGCCGTGCCGAACGCTTCGGCGGCGGCCGCTCCAGCGGCTTGAGGCCGGTGGagcgg < 4:369332/149‑5 (MQ=255) gCTGTGGGGTGTGTCGGAGCTGTTCTTTGGCATGACCTGGGGCGGCCCGATGAAGCACGCCTTCGCCGGTGCCTTGCACCTGGCCTGGCACCGCCGTGCCGAACGCTTCGGCGGCGGCCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTg > 6:195082/1‑148 (MQ=255) gtgGGGTGTGTCGGAGCTGTTCTTTGGCATGACCTGGGGCGGCCCGATGAAGCACGCCTTCGCCGGTGCCTTGCACCTGGCCTGGCACCGCCGTGCCGAACGCTTCGGCGGCGGCCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTgg > 5:126877/1‑146 (MQ=255) ggTGTGTCGGAGCTGTTCTTTGGCATGACCTGGGGCGGCCCGATGAAGCACGCCTTCGCCGGTGCCTTGCACCTGGCCTGGCACCGCCGTGCCGAACGCTTCGGCGGCGGCCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGAccc < 3:427652/149‑1 (MQ=255) gtgtgtCGGAGCTGTTCTTTGGCATGACCTGGGGCGGCCCGATGAAGCACGCCTTCGCCGGTGCCTTGCACCTGGCCTGGCACCGCCGTGCCGAACGCTTCGGCGGCGGCCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGACCCg < 6:126877/149‑1 (MQ=255) tgtCGGAGCTGTTCTTTGGCATGACCTGGGGCGGCCCGATGAAGCACGCCTTCGCCAGTGCCTTGCACCTGGCCTGGCACCGCCGTGCCGAACGCTTCGGCGGCGGCCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGACCCGAAc > 5:310982/1‑149 (MQ=255) ggAGCTGTTCTTTGGCATGACCTGGGGCGGCCCGATGAAGCACGCCTTCGCCGGTGCCTTGCACCTGGCCTGGCACCGCCGTGCCGAACGCTTCGGCGGCGGCCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGACCCGAACgcgc > 7:210209/1‑149 (MQ=255) tGGCATGACCTGGGGCGGCCCGATGAAGCACGCCTTCGCCGGTGCCTTGCACCTGGCCTGGCACCGCCGTGCCGAACGCTTCGGCGGCGGCCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGACCCGAACGCGCCCCTTGGCGTg < 7:199151/148‑1 (MQ=255) aTGACCTGGGGCGGCCCGATGAAGCACGCCTTCGCCGGTGCCTTGCACCTGGCCTGGCACCGCCGTGCCGAACGCTTCGGCGGCGGCCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGACCCGAACGCGCCCCTTGGCGTGGaaaa < 2:81278/149‑1 (MQ=255) aTGACCTGGGGCGGCCCGATGAAGCACGCCTTCGCCGGTGCCTTGCACCTGGCCTGGCACCGCCGTGCCGAACGCTTCGGCGGCGGCCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGACCCGAACGCGCCCCTTGGCGTGGaaa > 2:271993/1‑148 (MQ=255) aTGACCTGGGGCGGCCCGATGAAGCACGCCTTCGCCGGTGCCTTGCACCTGGCCTGGCACCGCCGTGCCGAACGCTTCGGCGGCGGCCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGACCCGAACGCGCCCCTTGGCGTGGaaa < 1:271993/148‑1 (MQ=255) cTGGGGCGGCCCGATGAAGCACGCCTTCGCCGGTGCCTTGCACCTGGCCTGGCACCGCCGTGCCGAACGCTTCGGCGGCGGCCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGACCCGAACGCGCCCCTTGGCGTGGAAAAGCCgg > 8:166511/1‑149 (MQ=255) ggggCGGCCCGATGAAGCACGCCTTCGCCGGTGCCTTGCACCTGGCCTGGCACCGCCGTGCCGAACGCTTCGGCGGCGGCCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGACCCGAACGCGCCCCTTGGCGTGGAAAAGCCgg > 2:238391/1‑147 (MQ=255) ggggCGGCCCGATGAAGCACGCCTTCGCCGGTGCCTTGCACCTGGCCTGGCACCGCCGTGCCGAACGCTTCGGCGGCGGCCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGACCCGAACGCGCCCCTTGGCGTGGAAAAGCCgg < 1:238391/147‑1 (MQ=255) ggcggcCCGATGAAGCACGCCTTCGCCGGTGCCTTGCACCTGGCCTGGCACCGCCGTGCCGAACGCTTCGGCGGCGGCCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGACCCGAACGCGCCCCTTGGCGTGGAAAAGCCGGTGGa > 4:223956/1‑149 (MQ=255) gcggcCCGATGAAGCACGCCTTCGCCGGTGCCTTGCACCTGGCCTGGCACCGCCGTGCCGAACGCTTCGGCGGCGGCCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGACCCGAACGCGCCCCTTGGCGTGGAAAAGCCGGTGGAc > 3:312816/1‑149 (MQ=255) gcCCGATGAAGCACGCCTTCGCCGGTGCCTTGCACCTGGCCTGGCACCGCCGTGCCGAACGCTTCGGCGGCGGCCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGACCCGAACGCGCCCCTTGGCGTGGAAAAGCCGGTGGACtt > 2:282891/1‑148 (MQ=255) cccGATGAAGCACGCCTTCGCCGGTGCCTTGCACCTGGCCTGGCACCGCCGTGCCGAACGCTTCGGCGGCGGCCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGACCCGAACGCGCCCCTTGGCGTGGAAAAGCCGGTGGACTTCa > 2:372270/1‑149 (MQ=255) ccGATGAAGCACGCCTTCGCCGGTGCCTTGCACCTGGCCTGGCACCGCCGTGCCGAACGCTTCGGCGGCGGCCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGACCCGAACGCGCCCCTTGGCGTGGAAAAGCCGGTGGACTTCAc > 2:58778/1‑149 (MQ=255) aTGAAGCACGCCTTCGCCGGTGCCTTGCACCTGGCCTGGCACCGCCGTGCCGAACGCTTCGGCGGCGGCCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGACCCGAACGCGCCCCTTGGCGTGGAAAAGCCGGTGGACTTCACCTg < 8:210209/149‑1 (MQ=255) tGAAGCACGCCTTCGCCGGTGCCTTGCACCTGGCCTGGCACCGCCGTGCCGAACGCTTCGGCGGCGGCCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGACCCGAACGCGCCCCTTGGCGTGGAAAAGCCGGTGGACTTCACCTgg < 1:282891/149‑1 (MQ=255) cACGCCTTCGCCGGTGCCTTGCACCTGGCCTGGCACCGCCGTGCCGAACGCTTCGGCGGCGGCCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGACCCGAACGCGCCCCTTGGCGTGGAAAAGCCGGTGGACTTCACCTGGAAc > 6:260439/1‑147 (MQ=255) aCGCCTTCGCCGGTGCCTTGCACCTGGCCTGGCACCGCCGTGCCGAACGCTTCGGCGGCGGCCGCCCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGACCCGAACGCGCCCCTTGGCGTGGAAAAGCCGGTGGACTTCACCTGGAACCAg > 3:281087/1‑149 (MQ=255) ttCGCCGGTGCCTTGCACCTGGCCTGGCACCGCCGTGCCGAACGCTTCGGCGGCGGCCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGACCCGAACGCGCCCCTTGGCGTGGAAAAGCCGGTGGACTTCACCTGGAACCAgctgct > 5:121762/1‑149 (MQ=255) ttCGCCGGTGCCTTGCACCTGGCCTGGCACCGCCGTGCCGAACGCTTCGGCGGCGGCCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGACCCGAACGCGCCCCTTGGCGTGGAAAAGCCGGTGGACTTCACCTGGAACCAgctgct > 1:411972/1‑149 (MQ=255) ttCGCCGGTGCCTTGCACCTGGCCTGGCACCGCCGTGCCGAACGCTTCGGCGGCGGCCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGACCCGAACGCGCCCCTTGGCGTGGAAAAGCCGGTGGACTTCACCTGGAACCAgctgct > 4:170212/1‑149 (MQ=255) gCCGGTGCCTTGCACCTGGCCTGGCACCGCCGTGCCGAACGCTTCGGCGGCGGCCGCTCCAGCGGCTTGAGGCCGGTGGa > 3:209834/1‑80 (MQ=38) gCCGGTGCCTTGCACCTGGCCTGGCACCGCCGTGCCGAACGCTTCGGCGGCGGCCGCTCCAGCGGCTTGAGGCCGGTGGa < 4:209834/80‑1 (MQ=38) gCCGGTGCCTTGCACCTGGCCTGGCACCGCCGTGCCGAACGCTTCGGCGGCGGCCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGACCCGAACGCGCCCCTTGGCGTGGAAAAGCCGGTGGACTTCACCTGGAACCAGCTGCTggg > 1:244073/1‑149 (MQ=255) gCCGGTGCCTTGCACCTGGCCTGGCACCGCCGTGCCGAACGCTTCGGCGGCGGCCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGACCCGAACGCGCCCCTTGGCGTGGAAAAGCCGGTGGACTTCACCTGGAACCAGCTGCTggg > 2:388261/1‑149 (MQ=255) gCCGGTGCCTTGCACCTGGCCTGGCACCGCCGTGCCGAACGCTTCGGCGGCGGCCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGACCCGAACGCGCCCCTTGGCGTGGAAAAGCCGGTGGACTTCACCTGGAACCAGCTGCTgg < 3:51815/148‑1 (MQ=255) gCCAGTGCCTTGCACCTGGCCTGGCACCGCCGTGCCGAACGCTTCGGCGGCGGCCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGACCCGAACGCGCTCCTTGGCGTGGAAAAGCCGGTGGACTTCACCTGGAACCAGCTGCTgg < 6:310982/148‑1 (MQ=255) gTGCCTTGCACCTGGCCTGGCACCGCCGTGCCGAACGCTTCGGCGGCGGCCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGACCCGAACGCGCCCCTTGGCGTGGAAAAGCCGGTGGACTTCACCTGGAACCAGCTGCTGGGCTTc > 5:234864/1‑149 (MQ=255) gTGCCTTGCACCTGGCCTGGCACCGCCGTGCCGAACGCTTCGGCGGCGGCCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGACCCGAACGCGCCCCTTGGCGTGGAAAAGCCGGTGGACTTCACCTGGAACCAGCTGCTGGGCTTc < 5:195082/149‑1 (MQ=255) tGCCTTGCACCTGGCCTGGCACCGCCGTGCCGAACGCTTCGGCGGCGGCCGCCCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGACCCGAACGCGCCCCTTGGCGTGGAAAAGCCGGTGGACTTCACCTGGAACCAGCTGCTGGGCTTCg < 4:281087/149‑1 (MQ=255) ccTTGCACCTGGCCTGGCACCGCCGTGCCGAACGCTTCGGCGGCGGCCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGACCCGAACGCGCCCCTTGGCGTGGAAAAGCCGGTGGACTTCACCTGGAACCAGCTGCTGGGCTTCGAt < 4:49940/149‑1 (MQ=255) cTTGCACCTGGCCTGGCACCGCCGTGCCGAACGCTTCGGCGGCGGCCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGACCCGAACGCGCCCCTTGGCGTGGAAAAGCCGGTGGACTTCACCTGGAACCAGCTGCTGGGCTTCGATg > 6:33078/1‑149 (MQ=255) cTTGCACCTGGCCTGGCACCGCCGTGCCGAACGCTTCGGCGGCGGCCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGACCCGAACGCGCCCCTTGGCGTGGAAAAGCCGGTGGACTTCACCTGGAACCAGCTGCTGGGCTTCGATg < 7:166511/149‑1 (MQ=255) aCCTGGCCTGGCACCGCCGTGCCGAACGCTTCGGCGGCGGCCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGACCCGAACGCGCCCCTTGGCGTGGAAAAGCCGGTGGACTTCACCTGGAACCAGCTGCTGGGCTTCGATGCCTGc < 2:244073/149‑1 (MQ=255) ctggcctggcACCGCCGTGCCGAACGCTTCGGCGGCGGCCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGACCCGAACGCGCCCCTTGGCGTGGAAAAGCCGGTGGACTTCACCTGGAACCAg > 6:258707/1‑126 (MQ=255) ctggcctggcACCGCCGTGCCGAACGCTTCGGCGGCGGCCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGACCCGAACGCGCCCCTTGGCGTGGAAAAGCCGGTGGACTTCACCTGGAACCAg < 5:258707/126‑1 (MQ=255) gcACCGCCGTGCCGAACGCTTCGGCGGCGGCCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGACCCGAACGCGCCCCTTGGCGTGGAAAAGCCGGTGGACTTCACCTGGAACCAGCTGCTGGGCTTCGATGCCTGCGTGCAGTGCg > 6:248501/1‑149 (MQ=255) cACCGCCGTGCCGAACGCTTCGGCGGCGGCCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGACCCGAACGCGCCCCTTGGCGTGGAAAAGCCGGTGCACTTCACCTGGAACCAGCTGCTGGGCTTCGATGCCTGCGTGCAGTGCgg > 2:225676/1‑149 (MQ=255) gccgTGCCGAACGCTTCGGCGGCGGCCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGACCCGAACGCGCCCCTTGGCGTGGAAAAGCCGGTGGACTTCACCTGGAACCAGCTGCTGGGCTTCGATGCCTGCGTGCAGTGCGGTaaa > 8:14373/1‑149 (MQ=255) gccgTGCCGAACGCCTCTGCGGCGGCCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGACCCGAACGCGCCCCTTGGCGTGGAAAACCCGGTGGACTTCACCTGGAACCAGCTGCTGGGCTTCGATGCCTGCGTGCAGTGCGGTaaa < 2:118315/149‑1 (MQ=255) cgTGCCGAACGCTTCGGCGGCGGCCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGACCCGAACGCGCCCCTTGGCGTGGAAAAGCCGGTGGACTTCACCTGGAACCAGCTGCTGGGCTTCGATGCCTGCGTGCAGTGCGGTAAAtg > 8:123481/1‑149 (MQ=255) gTGCCGAACGCTTCGGCGGCGGCCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGACCCGAACGCGCCCCTTGGCGTGGAAAAGCCGGTGGACTTCACCTGGAACCAGCTGCTGGGCTTCGATGCCTGCGTGCAGTGCGGTAAAtgt > 3:330882/1‑149 (MQ=255) tGCCGAACGCTTCGGCGGCGGCCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGACCCGAACGCGCCCCTTGGCGTGGAAAAGCCGGTGGACTTCACCTGGAACCAGCTGCTGGGCTTCGATGCCTGCGTGCAGTGCGGTAAAtgtg < 7:117607/149‑1 (MQ=255) gCCGAACGCTTCGGCGGCGGCCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGACCCGAACGCGCCCCTTGGCGTGGAAAAGCCGGTGGACTTCACCTGGAACCAGCTGCTGGGCTTCGATGCCTGCGTGCAGTGCGGTAAAtgtg < 4:56439/148‑1 (MQ=255) gCCGAACGCTTCGGCGGCGGCCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGACCCGAACGCGCCCCTTGGCGTGGAAAAGCCGGTGGACTTCACCTGGAACCAGCTGCTGGGCTTCGATGCCTGCGTGCAGTGCGGTAAAtgtg > 3:56439/1‑148 (MQ=255) cGAACGCTTCGGCGGCGGCCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGACCCGAACGCGCCCCTTGGCGTGGAAAAGCCGGTGGACTTCACCTGGAACCAGCTGCTGGGCTTCGATGCCTGCGTGCAGTGCGGTAAATGTGAAg > 4:122969/1‑149 (MQ=255) cGCTTCGGCGGCGGCCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGACCCGAACGCGCCCCTTGGCGTGGAAAAGCCGGTGGACTTCACCTGGAACCAGCTGCTGGGCTTCGATGCCTGCGTGCAGTGCGGTAAATGTGAAGCCAt < 5:33078/149‑1 (MQ=255) cGCTTCGGCGGCGGCCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGACCCGAACGCGCCCCTTGGCGTGGAAAAGCCGGTGGACTTCACCTGGAACCAGCTGCTGGGCTTCGATGCCTGCGTGCAGTGCGGTAAATGTGAAGCCAt < 3:286704/149‑1 (MQ=255) cGCTTCGGCGGCGGCCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGACCCGAACGCGCCCCTTGGCGTGGAAAAGCCGGTGGACTTCACCTGGAACCAGCTGCTGGGCTTCGATGCCTGCGTGCAGTGCGGTAAATGTGAAGCCAt < 6:234864/149‑1 (MQ=255) gCTTCGGCGGCGGCCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGACCCGAACGCGCCCCTTGGCGTGGAAAAGCCGGTGGACTTCACCTGGAACCAGCTGCTGGGCTTCGATGCCTGCGTGCAGTGCGGTAAATGTGAAGCCAtg > 3:31083/1‑149 (MQ=255) ttCGGCGGCGGCCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGACCCGAACGCGCCCCTTGGCGTGGAAAAGCCGGTGGACTTCACCTGGAACCAGCTGCTGGGCTTCGATGCCTGCGTGCAGTGCGGTAAATGTGAAGCCAtgtg > 4:185215/1‑149 (MQ=255) cggcggcggCCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGACCCGAACGCGCCCCTTGGCGTGGAAAAGCCGGTGGACTTCACCTGGAACCAGCTGCTGGGCTTCGATGCCTGCGTGCAGTGCGGTAAATGTGAAGCCAtgtg < 7:123481/147‑1 (MQ=255) gcggcggcCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGACCCGACCGCGCCCCTTGGCGTGGAAAAGCCGGTGGACTTCACCTGGAACAAGCTGCTGGGCTTCGATGCCTGCGTGCAGTGCGGTAAATGTGAAGCCATGTGCCCg > 3:3570/1‑149 (MQ=255) ggcCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGACCCGAACGCGCCCCTTGGCGTGGAAAAGCCGGTGGACTTCACCTGGAACCAGCTGCTGGGCTTCGATGCCTGCGTGCAGTGCGGTAAATGTGAAGCCATGTGCCCGGCCtt > 3:258416/1‑149 (MQ=255) gcCGCTGCACCGGCCTCAAGGCGGGGGACCTGGAAGACCCGAACGCGCCCCTTGGCGTGGAAAAGCCGGTGGACTTCACCTGGAACCAGCTGCTGGGCTTCGATGCCTGCGTGCAGTGCGGTAAATGTGAAGCCATGTGCCCGGCCttt < 1:296977/149‑1 (MQ=255) gcCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGACCCGAACGCGCCCCTTGGCGTGGAAAAGCCGGTGGACTTCACCTGGAACCAGCTGCTGGGCTTCGATGCCTGCGTGCAGTGCGGTAAATGTGAAGCCATGTGCCCGGCCttt < 4:166265/149‑1 (MQ=255) gcCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGACCCGAACGCGCCCCTTGGCGTGGAAAAGCCGGTGGACTTCACCTGGAACCAGCTGCTGGGCTTCGATGCCTGCGTGCAGTGCGGTAAATGTGAAGCCATGTGCCCGGCCttt < 1:58778/149‑1 (MQ=255) ccGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGACCCGAACGCGCCCCTTGGCGTGGAAAAGCCGGTGGACTTCACCTGGAACCAGCTGCTGGGCTTCGATGCCTGCGTGCAGTGCGGTAAATGTGAAGCCATGTGCCCGGCCTTTg > 6:65970/1‑149 (MQ=255) ccGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGACCCGAACGCGCCCCTTGGCGTGGAAAAGCCGGTGGACTTCACCTGGAACCAGCTGCTGGGCTTCGATGCCTGCGTGCAGTGCGGTAAATGTGAAGCCATGTGCCCGGCCTTTg < 1:388261/149‑1 (MQ=255) cGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGACCCGAACGCGCCCCTTGGCGTGGAAAAGCCGGTGGACTTCACCTGGAACCAGCTGCTGGGCTTCGATGCCTGCGTGCAGTGCGGTAAATGTGAAGCCATGTGCCCGGCCTTTGc < 5:248501/149‑1 (MQ=255) cTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGACCCGAACGCGCCCCTTGGCGTGGAAAAGCCGGTGGACTTCACCTGGAACCAGCTGCTGGGCTTCGATGCCTGCGTGCAGTGCGGTAAATGTGAAGCCATGTGCCCGGCCTTTGCCg > 7:192993/1‑149 (MQ=255) ccAGCGGCTTGAGGCCGGTGGACCTGGAAGACCCGAACGCGCCCCTTGGCGTGGAAAAGCCGGTGGACTTCACCTGGAACCAGCTGCTGGGCTTCGATGCCTGCGTGCAGTGCGGTAAATGTGAAGCCATGTGCCCGGCCTTTGCCGCt > 8:228627/1‑149 (MQ=255) cACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGACCCGAACGCGCCCCTTGGCGTGGAAAAGCCGGTGGACTTCACCTGGAACCAGCTGCTGGGCTTCGATGCCTGCGTGCAGTGCGGTAAATGTGAAGCCATGTGCCCGGCCTTTGCCGCt < 2:411972/148‑1 (MQ=255) cACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGACCCGAACGCGCCCCTTGGCGTGGAAAAGCCGGTGGACTTCACCTGGAACCAGCTGCTGGGCTTCGATGCCTGCGTGCAGTGCGGTAAATGTGAAGCCATGTGCCCGGCCTTTGCCGCTg < 6:121762/149‑1 (MQ=255) cACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGACCCGAACGCGCCCCTTGGCGTGGAAAAGCCGGTGGACTTCACCTGGAACCAGCTGCTGGGCTTCGATGCCTGCGTGCAGTGCGGTAAATGTGAAGCCATGTGCCCGGCCTTTGCCGCTg < 4:31083/149‑1 (MQ=255) aCCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGACCCGAACGCGCCCCTTGGCGTGGAAAAGCCGGTGGACTTCACCTGGAACCAGCTGCTGGGCTTCGATGCCTGCGTGCAGTGCGGTAAATGTGAAGCCATGTGCCCGGCCTTTGCCGCTgg < 5:260439/149‑1 (MQ=255) ccGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGACCCGAACGCGCCCCTTGGCGTGGAAAAGCCGGTGGACTTCACCTGGAACCAGCTGCTGGGCTTCGATGCCTGCGTGCAGTGCGGTAAATGTGAAGCCATGTGCCCGGCCTTTGCCGCTGGc < 7:14373/149‑1 (MQ=255) | ATTCTGGGCCTGGGCGTGCTGTGGGGTGTGTCGGAGCTGTTCTTTGGCATGACCTGGGGCGGCCCGATGAAGCACGCCTTCGCCGGTGCCTTGCACCTGGCCTGGCACCGCCGTGCCGAACGCTTCGGCGGCGGCCGCTCCACCGGCCTCAAGCCGCTGGACCTGGAAGACCCGAACGCGCCCCTTGGCGTGGAAAAGCCGGTGGACTTCACCTGGAACCAGCTGCTGGGCTTCGATGCCTGCGTGCAGTGCGGTAAATGTGAAGCCATGTGCCCGGCCTTTGCCGCTGGC > NC_002947/373251‑373541 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |