| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,963,035 | G→A | 5.4% | A207V (GCC→GTC) | fleS ← | two‑component system sensor histidine kinase FleS |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,963,035 | 0 | G | A | 5.4% | 345.1 / 4.9 | 111 | A207V (GCC→GTC) | fleS | two‑component system sensor histidine kinase FleS |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (48/57); new base A (3/3); total (51/60) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.09e-01 | |||||||||||
Only 100 of 113 total aligned reads displayed.
CCGGTCCCCCAGTGGCAACTCGCCACGGGCAAACACCAGCATGTCGCGCACCTGGTGTTCCAGTTCGTGCAGGCGCTCCTTCAAGGTCGCGGCGAAGCGCTGACGGGTTTGCGCGCTCAGCGCTTGCTCGTTGTCGGCCAGGTGGCCGGCATACAGCATGGCTGCCGACAGCGGCGTGCGGATCTGGTGGGCCAGCGAGGCAACCATGCGCCCCAACGACGACAGCCGCTCGTGGCGAGCCAG‑CTGGTCCTGGAGGCGACGGGTTTCAGTCAGGTCGTTGAGCAGCACCAATTGG > NC_002947/4962887‑4963181 | ccGGTCCCCCAGTGGCAACTCGCCACGGGCAAACACCAGCATGTCGCGCACCTGGTGTTCCAGTTCGTGCAGGCGCTCCTTCAAGGTCGCGGCGAAGCGCTGACGGGTTTGCGCGCTCAGCGCTTGCTCGTTGTCGGCCAGGTGGCCgg < 1:116192/149‑1 (MQ=255)ccGGTCCCCCAGTGGCAACTCGCCACGGGCAAACACCAGCATGTCGCGCACCTGGTGTTCCAGTTCGTGCAGGCGCTCCTTCAAGGTCGCGGCGAAGCGCTGACGGGTTTGCGCGCTCAGCGCTTGCTCGTTGTCGGCCAGGTGGCCgg > 5:358361/1‑149 (MQ=255) tCCCCCAGTGGCAACTCGCCACGGGCAAACACCAGCATGTCGCGCACCTGGTGTTCCAGTTCGTGCAGGCGCTCCTTCAAGGTCGCGGCGAAGCGCTGACGGGTTTGCGCGCTCAGCGCTTGCTCGTTGCCGGCCACCTGGCCGACaac < 2:364066/149‑3 (MQ=255) ttgcccgTGGCGAGTTGCCACTGGCAAACACCAGCATGTCGCGCACCTGGTGTTCCAGTTCGTGCAGGCGCTCCTTCAAGGTCGCGGCGAAGCGCTGACGGGTTTGCGCGCTCAGCGCTTGCTCGTTGTCGGCCAGGTGGCCGGCATa > 7:255947/7‑148 (MQ=255) ccccAGTGGCAACTCGCCACGGGCAAACACCAGCATGTCGCGCACCTGGTGTTCCAGTTCGTGCAGGCGCTCCTTCAAGGTCGCGGCGAAGCGCTGACGGGTTTGCGCGCTCAGCGCTTGCTCGTTGTCGGCCAGGTGGCCGGCATa > 2:74554/1‑147 (MQ=255) ccccAGTGGCAACTCGCCACGGGCAAACACCAGCATGTCGCGCACCTGGTGTTCCAGTTCGTGCAGGCGCTCCTTCAAGGTCGCGGCGAAGCGCTGACGGGTTTGCGCGCTCAGCGCTTGCTCGTTGTCGGCCAGGTGGCCGGCATAc < 4:15776/148‑1 (MQ=255) cccAGTGGCAACTCGCCACGGGCAAACACCAGCATGTCGCGCACCTGGTGTTCCAGTTCGTGCAGGCGCTCCTTCAAGGTCGCGGCGAAGCGCTGACGGGTTTGCGCGCTCAGCGCTTGCTCGTTGTCGGCCAGGTGGCCGGCATACAg < 5:247610/149‑1 (MQ=255) ccAGTGGCAACTCGCCACGGGCAAACACCAGCATGTCGCGCACCTGGTGTTCCAGTTCGTGCAGGCGCTCCTTCAAGGTCGCGGCGAAGCGCTGACGGGTTTGCGCGCTCAGCGCTTGCTCGTTGTCGGCCAGGTGGCCGGCATACAg > 6:191880/1‑148 (MQ=255) ccAGTGGCAACTCGCCACGGGCAAACACCAGCATGTCGCGCACCTGGTGTTCCAGTTCGTGCAGGCGCTCCTTCAAGGTCGCGGCGAAGCGCTGACGGGTTTGCGCGCTCAGCGCTTGCTCGTTGTCGGCCAGGTGGCCGGCATACAg > 8:302431/1‑148 (MQ=255) aGTGGCAACTCGCCACGGGCAAACACCAGCATGTCGCGCACCTGGTGTTCCAGTTCGTGCAGGCGCTCCTTCAAGGTCGCGGCGAAGCGCTGACGGGTTTGCGCGCTCAGCGCTTGCTCGTTGTCGGCCAGGTGGCCGGCATACAGCAt < 8:112416/149‑1 (MQ=255) gTGGCAACTCGCCACGGGCAAACACCAGCATGTCGCGCACCTGGTGTTCCAGTTCGTGCAGGCGCTCCTTCAAGGTCGCGGCGAAGCGCTGACGGGTTTGCGCGCTCAGCGCTTGCTCGTTGTCGGCCAGGTGGCCGGCATACAGCATg < 5:158084/149‑1 (MQ=255) gTGGCAACTCGCCACGGGCAAACACCAGCATGTCGCGCACCTGGTGTTCCAGTTCGTGCAGGCGCTCCTTCAAGGTCGCGGCGAAGCGCTGACGGGTTTGCGCGCTCAGCGCTTGCTCGTTGTCGGCCAGGTGGCCGGCATACAGCATg < 8:130098/149‑1 (MQ=255) tGGCAACTCGCCACGGGCAAACACCAGCATGTCGCGCACCTGGTGTTCCAGTTCGTGCAGGCGCTCCTTCAAGGTCGCGGCGAAGCGCTGACGGGTTTGCGCGCTCAGCGCTTGCTCGTTGTCGGCCAGGTGGCCGGCATACAGCATgg < 4:115773/149‑1 (MQ=255) gCAACTCGCCACGGGCAAACACCAGCATGTCGCGCACCTGGTGTTCCAGTTCGTGCAGGCGCTCCTTCAAGGTCGCGGCGAAGCGCTGACGGGTTTGCGCGCTCAGCGCTTGCTCGTTGTCGGCCAGGTGGCCGGCATACAGCATGGCt < 5:416917/149‑1 (MQ=255) aCTCGCCACGGGCAAACACCAGCATGTCGCGCACCTGGTGTTCCAGTTCGTGCAGGCGCTCCTTCAAGGTCGCGGCGAAGCGCTGACGGGTTTGCGCGCTCAGCGCTTGCTCGTTGTCGGCCAGGTGGCCGGCATACAGCATGGCTGcc < 6:243847/149‑1 (MQ=255) aCTCGCCACGGGCAAACACCAGCATGTCGCGCACCTGGTGTTCCAGTTCGTGCAGGCGCTCCTTCAAGGTCGCGGCGAAGCGCTGACGGGTTTGCGCGCTCAGCGCTTGCTCGTTGTCGGCCAGGTGGCCGGCATACAGCATGGCTGcc < 4:118279/149‑1 (MQ=255) aCGGGCAAACACCAGCATGTCGCGCACCTGGTGTTCCAGTTCGTGCAGGCGCTCCTTCAAGGTCGCGGCGAAGCGCTGACGGGTTTGCGCGCTCAGCGCTTGCTCGTTGTCGGCCAGGTGGCCGGCATACAGCATGGCTGCCGACAgcg < 6:358361/149‑1 (MQ=255) gggCAAACACCAGCATGTCGCGCACCTGGTGTTCCAGTTCGTGCAGGCGCTCCTTCAAGGTCGCGGCGAAGCGCTGACGGGTTTGCGCGCTCAGCGCTTGCTCGTTGTCGGCCAGGTGGCCGGCATACAGCATGGCTGCCGACAgcggc < 5:363170/149‑1 (MQ=255) gCAAACACCAGCATGTCGCGCACCTGGTGTTCCAGTTCGTGCAGGCGCTCCTTCAAGGTCGCGGCGAAGCGCTGACGGGTTTGCGCGCTCAGCGCTTGCTCGTTGTCGGCCAGGTGGCCGGCATACAGCATGGCTGCCGACAGCGGCGt > 6:169453/1‑149 (MQ=255) aaaCACCAGCATGTCGCGCACCTGGTGTTCCAGTTCGTGCAGGCGCTCCTTCAAGGTCGCGGCGAAGCGCTGACGGGTTTGCGCGCTCAGCGCTTGCTCGTTGTCGGCCAGGTGGCCGGCATACAGCATGGCTGCCGACAGCGGCGTGc < 3:383576/149‑1 (MQ=255) aaaCACCAGCATGTCGCGCACCTGGTGTTCCAGTTCGTGCAGGCGCTCCTTCAAGGTCGCGGCGAAGCGCTGACGGGTTTGCGCGCTCAGCGCTTGCTCGTTGTCGGCCAGGTGGCCGGCATACAGCATGGCTGCCGACAGCGGCGTGc > 3:308948/1‑149 (MQ=255) acacCAGCATGTCGCGCACCTGGTGTTCCAGTTCGTGCAGGCGCTCCTTCAAGGTCGCGGCGAAGCGCTGACGGGTTTGCGCGCTCAGCGCTTGCTCGTTGTCGGCCAGGTGGCCGGCATACAGCATGGCTGCCGACAGCGGCGTGCgg < 5:169453/149‑1 (MQ=255) gCATGTCGCGCACCTGGTGTTCCAGTTCGTGCAGGCGCTCCTTCAAGGTCGCGGCGAAGCGCTGACGGGTTTGCGCGCTCAGCGCTTGCTCGTTGTCGGCCAGGTGGCCGGCATACAGCATGGCTGCCGACAGCGGCGTGCGGATCtgg < 1:106927/149‑1 (MQ=255) gCATGTCGCGCACCTGGTGTTCCAGTTCGTGCAGGCGCTCCTTCAAGGTCGCGGCGAAGCGCTGACGGGTTTGCGCGCTCAGCGCTTGCTCGTTGTCGGCCAGGTGGCCGGCATACAGCATGGCTGCCGACAGCGGCGTGCGGATCtgg < 2:286051/149‑1 (MQ=255) aTGTCGCGCACCTGGTGTTCCAGTTCGTGCAGGCGCTCCTTCAAGGTCGCGGCGAAGCGCTGACGGGTTTGCGCGCTCAGCGCTTGCTCGTTGTCGGCCAGGTGGCCGGCATACAGCATGGCTGCCGACAGCGGCGTGCGGATCtggtg > 7:399602/1‑149 (MQ=255) tGTCGCGCACCTGGTGTTCCAGTTCGTGCAGGCGCTCCTTCAAGGTCGCGGCGAAGCGCTGACGGGTTTGCGCGCTCAGCGCTTGCTCGTTGTCGGCCAGGTGGCCGGCATACAGCATGGCTGCCGACAGCGGCGTGCGGATCtggtgg < 2:360031/149‑1 (MQ=255) tGTCGCGCACCTGGTGTTCCAGTTCGTGCAGGCGCTCCTTCAAGGTCGCGGCGAAGCGCTGACGGGTTTGCGCGCTCAGCGCTTGCTCGTTGTCGGCCAGGGGGCCGGCATACAGCATGGCTGCCGACAGCGGCGTGCGGATCtggtgg < 3:384950/149‑1 (MQ=255) tCGCGCACCTGGTGTTCCAGTTCGTGCAGGCGCTCCTTCAAGGTCGCGGCGAAGCGCTGACGGGTTTGCGCGCTCAGCGCTTGCTCGTTGTCGGCCAGGTGGCCGGCATACAGCATGGCTGCCGACAGCGGCGTGCGGATCTGGTGGGc > 8:154473/1‑149 (MQ=255) gcgcACCTGGTGTTCCAGTTCGTGCAGGCGCTCCTTCAAGGTCGCGGCGAAGCGCTGACGGGTTTGCGCGCTCAGCGCTTGCTCGTTGTCGGCCAGGTGGCCGGCATACAGCATGGCTGCCGACAGCGGCGTGCGGATCTGGTGGGCCa < 4:308948/149‑1 (MQ=255) gcgcACCTGGTGTTCCAGTTCGTGCAGGCGCTCCTTCAAGGTCGCGGCGAAGCGCTGACGGGTTTGCGCGCTCAGCGCTTGCTCGTTGTCGGCCAGGTGGCCGGCATACAGCATGGCTGCCGACAGCGGCGTGCGGATCTGGTGGGCCa > 2:242533/1‑149 (MQ=255) gcACCTGGTGTTCCAGTTCGTGCAGGCGCTCCTTCAAGGTCGCGGCGAAGCGCTGACGGGTTTGCGCGCTCAGCGCTTGCTCGTTGTCGGCCAGGTGGCCGGCATACAGCATGGCTGCCGACAGCGGCGTGCGGATCTGGTGGGCCAGc < 2:287259/149‑1 (MQ=255) gcACCTGGTGTTCCAGTTCGTGCAGGCGCTCCTTCAAGGTCGCGGCGAAGCGCTGACGGGTTTGCGCGCTCAGCGCTTGCTCGTTGTCGGCCAGGTGGCCGGCATACAGCATGGCTGCCGACAGCGGCGTGCGGATCTGGTGGGCCAGc < 6:141294/149‑1 (MQ=255) aCCTGGTGTTCCAGTTCGTGCAGGCGCTCCTTCAAGGTCGCGGCGAAGCGCTGACGGGTTTGCGCGCTCAGCGCTTGCTCGTTGTCGGCCAGGTGGCCGGCATACAGCATGGCTGCCGACAGCGGCGTGCGGATCTGGTGGGCCAGCGa < 8:356687/149‑1 (MQ=255) cTGGTGTTCCAGTTCGTGCAGGCGCTCCTTCAAGGTCGCGGCGAAGCGCTGACGGGTTTGCGCGCTCAGCGCTTGCTCGTTGTCGGCCAGGTGGCCGGCATACAGCATGGCTGCCGACAGCGGCGTGCGGATCTGGTGGGCCAGCGAgg > 8:224216/1‑149 (MQ=255) cTGGTGTTCCAGTTCGTGCAGGCGCTCCTTCAAGGTCGCGGCGAAGCGCTGACGGGTTTGCGCGCTCAGCGCTTGCTCGTTGTCGGCCAGGTGGCCGGCATACAGCATGGCTGCCGACAGCGGCGTGCGGATCTGGTGGGCCAGCGAgg < 7:386474/149‑1 (MQ=255) cTGGTGTTCCAGTTCGTGCAGGCGCTCCTTCAAGGTCGCGGCGAAGCGCTGACGGGTTTGCGCGCTCAGCGCTTGCTCGTTGTCGGCCAGGTGGCCGGCATACAGCATGGCTGCCGACAGCGGCGTGCGGATCTGGTGGGCCAGCGAgg > 3:133832/1‑149 (MQ=255) tGGTGTTCCAGTTCGTGCAGGCGCTCCTTCAAGGTCGCGGCGAAGCGCTGACGGGTTTGCGCGCTCAGCGCTTGCTCGTTGTCGGCCAGGTGGCCGGCATACAGCATGGCTGCCGACAGCGGCGTGCGGATCTGGTGGGCCAGCGAgg > 4:374170/1‑148 (MQ=255) tGGTGTTCCAGTTCGTGCAGGCGCTCCTTCAAGGTCGCGGCGAAGCGCTGACGGGTTTGCGCGCTCAGCGCTTGCTCGTTGTCGGCCAGGTGGCCGGCATACAGCATGGCTGCCGACAGCGGCGTGCGGATCTGGTGGGCCAGCGAgg > 2:408858/1‑148 (MQ=255) ttCCAGTTCGTGCAGGCGCTCCTTCAAGGTCGCGGCGAAGCGCTGACGGGTTTGCGCGCTCAGCGCTTGCTCGTTGTCGGCCAGGTGGCCGGCATACAGCATGGCTGCCGACAGCGGCGTGCGGATCTGGTGGGCCAGCGAGGCAACCa > 5:231570/1‑149 (MQ=255) ttCCAGTTCGTGCAGGCGCTCCTTCAAGGACGCGGCGAAGCGCTGACGGGTTTGCGCGCTCAGCGCTTGCTCGTTGTCGGCCAGGTGGCCGGCATACAGCATGGCTGCCGACAGCGGCGTGCGGATCTGGTGGGCCAGCGAGGCAACCa > 1:31998/1‑149 (MQ=255) cAGTTCGTGCAGGCGCTCCTTCAAGGTCGCGGCGAAGCGCTGACGGGTTTGCGCGCTCAGCGCTAGCTCGTTGTCGGCCAGGTCGCCGGCATACAGCATGGCTGCCGACAGCGGCCTGCGGATCTGGTGGGCCAGCGAGGCAACCATgc > 2:67117/1‑149 (MQ=255) ttCGTGCAGGCGCTCCTTCAAGGTCGCGGCGAAGCGCTGACGGGTTTGCGCGCTCAGCGCTTGCTCGTTGTCGGCCAGGTGGCCGGCATACAGCATGGCTGCCGACAGCGGCGTGCGGATCTGGTGGGCCAGCGAGGCAACCATGCGcc > 6:138407/1‑149 (MQ=255) ttCGTGCAGGCGCTCCTTCAAGGTCGCGGCGAAGCGCTGACGGGTTTGCGCGCTCAGCGCTTGCTCGTTGTCGGCCAGGTGGCCGGCATACAGCATGGCTGCCGACAGCGGCGTGCGGATCTGGTGGGCCAGCGAGGCAACCATGCGcc > 2:203571/1‑149 (MQ=255) gCAGGCGCTCCTTCAAGGTCGCGGCGAAGCGGTGACGGGTTTGCGCGCTCAGCGCTTGCTCGTTGTCGGCCAGGTGGCCGGCATACAGCATGGCTGCCGACAGCGGCGTGCGGATCTGGTGGGCCAGCGAGGCAACCATGCGCCCCAac > 3:246995/1‑149 (MQ=255) cAGGCGCTCCTTCAAGGTCGCGGCGAAGCGCTGACGGGTTTGCGCGCTCAGCGCTTGCTCGTTGTCGGCCAGGTGGCCGGCATACAGCATGGCTGCCGACAGCGGCGTGCGGATCTGGTGGGCCAGCGAGGCAACCATGCGCCCCAacg < 6:135738/149‑1 (MQ=255) tCCTTCAAGGTCGCGGCGAAGCGCTGACGGGTTTGCGCGCTCAGCGCTTGCTCGTTGTCGGCCAGGTGGCCGGCATACAGCATgg < 6:357405/85‑1 (MQ=255) tCCTTCAAGGTCGCGGCGAAGCGCTGACGGGTTTGCGCGCTCAGCGCTTGCTCGTTGTCGGCCAGGTGGCCGGCATACAGCATgg > 5:357405/1‑85 (MQ=255) tCCTTCAAGGTCGCGGCGAAGCGCTGACGGGTTTGCGCGCTCAGCGCTTGCTCGTTGTCGGCCAGGTGGCCGGCATACAGCATGGCTGCCGACAGCGGCGTGCGGATCTGGTGGGCCAGCGAGGCAACCATGCGCCCCAACGACGACAg < 7:154473/149‑1 (MQ=255) cTTCAAGGTCGCGGCGAAGCGCTGACGGGTTTGCGCGCTCAGCGCTTGCTCGTTGTCGGCCAGGTGGCCGGCATACAGCATGGCTGCCGACAGCGGCGTGCGGATCTGGTGGGCCAGCGAGGCAACCATGCGCCCCAACGACGACAGcc > 6:319397/1‑149 (MQ=255) cTTCAAGGTCGCGGCGAAGCGCTGACGGGTTTGCGCGCTCAGCGCTTGCTCGTTGTCGGCCAGGTGGCCGGCATACAGCATGGCTGCCGACAGCGGCGTGCGGATCTGGTGGGCCAGCGAGGCAACCATGCGCCCCAACGACGACAGc < 1:190856/148‑1 (MQ=255) ttCAAGGTCGCGGCGAAGCGCTGACGGGTTTGCGCGCTCAGCGCTTGCTCGTTGTCGGCCAGGTGGCCGGCATACAGCATGGCTGCCGACAGCGGCGTGCGGATCTGGTGGGCCAGCGAGGCAACCATGCGCCCCAACGACGACAGCCg > 7:226020/1‑149 (MQ=255) cAAGGTCGCGGCGAAGCGCTGACGGGTTTGCGCGCTCAGCGCTTGCTCGTTGTCGGCCAGGTGGCCGGCATACAGCATGGCTGCCGACAGCGGCGTGCGGATCTGGTGGGCCAGCGAGGCAACCATGCGCCCCAACGACGACAGCCGCt > 4:420979/1‑149 (MQ=255) aaGGTCGCGGCGAAGCGCTGACGGGTTTGCGCGCTCAGCGCTTGCTCGTTGTCGGCCAGGTGGCGGGCATACAGCATGGCTGACGACAGCGGGGTGCGGATCTGGTGGGCCCGCGAGGCCTCCATGCGCCGCAACTCCGACAGCCGGTc > 4:51071/1‑149 (MQ=255) aaGGTCGCGGCGAAGCGCTGACGGGTTTGCGCGCTCAGCGCTTGCTCGTTGTCGGCCAGGTGGCCGGCATACAGCATGGCTGCCGACAGCGGCGTGCGGATCTGGTGGGCCAGCGAGGCAACCATGCGCCCCAACGACGACAGCCGCTc < 5:138407/149‑1 (MQ=255) aaGGTCGCGGCGAAGCGCTGACGGGTTTGCGCGCTCAGCGCTTGCTCGTTGTCGGCCAGGTGGCCGGCATACAGCATGGCTGCCGACAGCGGCGTGCGGATCTGGTGGGCCAGCGAGGCAACCATGCGCCCCAACGACGACAGCCGCTc < 7:302431/149‑1 (MQ=255) gTCGCGGCGAAGCGCTGACGGGTTTGCGCGCTCAGCGCTTGCTCGTTGTCGGCCAGGTGGCCGGCATACAGCATGGCTGCCGACAGCGGCGTGCGGATCTGGTGGGCCAGCGAGGCACCCATGCGCCCCAACGCCGACAGCCGCTCGTg > 6:335296/1‑149 (MQ=255) cggcgAAGCGCTGACGGGTTTGCGCGCTCAGCGCTTGCTCGTTGTCGGCCAGGTGGCCGGCATACAGCATGGCTGCCGACAGCGGCGTGCGGATCTGGTGGGCCAGCGAGGCAACCATGCGCCCCAACGACGACAGCCGCTCGTGGCGa < 6:116482/149‑1 (MQ=255) gAAGCGCTGACGGGTTTGCGCGCTCAGCGCTTGCTCGTTGTCGGCCAGGTGGCCGGCATACAGCATGGCTGCCGACAGCGGCGTGCGGATCTGGTGGGCCAGCGAGGCAACCATGCGCCCCAACGACGACAGCCGCTCGTGGCGAGCCa < 5:419973/149‑1 (MQ=255) aaGCGCTGACGGGTTTGCGCGCTCAGCGCTTGCTCGTTGTCGGCCAGGTGGCCGGCATACAGCATGGCTGCCGACAGCGGCGTGCGGATCTGGTGGGCCAGCGAGGCAACCATGCGCCCCAACGACGACAGCCGCTCGTGGCGAGCCAg > 4:27875/1‑149 (MQ=255) gcgcTGACGGGTTTGCGCGCTCAGCGCTTGCTCGTTGTCGGCCAGGTGGCCGGCATACAGCATGGCTGCCGACAGCGGCGTGCGGATCTGGTGGGCCAGCGAGGCAACCATGCGCCCCAACGACGACAGCCGCTCGTGGCGAGCCAG‑Ct > 2:212052/1‑149 (MQ=255) cgcTGACGGGTTTGCGCGCTCAGCGCTTGCTCGTTGTCGGCCAGGTGGCCGGCATACAGCATGGCTGCCGACAGCGGCGGGCGGATCTGGTGGGCCAGCGAGGCAACCATGCGCCCCAACGACGACAGCCGCTCGTGGCGAGCCAG‑CTg < 7:187445/149‑1 (MQ=255) cTGACGGGTTTGCGCGCTCAGCGCTTGCTCGTTGTCGGCCAGGTGGCCGGCATACAGCATGGCTGCCGACAGCGGCGTGCGGATCTGGTGGGCCAGCGAGGCAACCATGCGCCCCAACGACGACAGCCGCTCGTGGCGAGCCAG‑CTGGt > 4:187699/1‑149 (MQ=255) gggTTTGCGCGCTCAGCGCTTGCTCGTTGTCGGCCAGGTGGCCGGCATACAGCATGGCTGCCGACAGCGGCGTGCGGATCTGGTGGGCCAGCGAGGCAACCATGCGCCCCAACGACGACAGCCGCTCGTGGCGAGCCAG‑CTGGTCCTgg < 4:133832/149‑1 (MQ=255) gggTTTGCGCGCTCAGCGCTTGCTCGTTGTCGGCCAGGTGGCCGGCATACAGCATGGCTGCCGACAGCGGCGTGCGGATCTGGTGGGCCAGCGAGGCAACCATGCGCCCCAACGACGACAGCCGCTCGTGGCGAGCCAG‑CTGGTCCTgg < 1:394327/149‑1 (MQ=255) ggTTTGCGCGCTCAGCGCTTGCTCGTTGTCGGCCAGGTGGCCGGCATACAGCATGGCTGCCGACAGCGGCGTGCGGATCTGGTGGGCCAGCGAGGCAACCATGCGCCCCAACGACGACAGCCGCTCGTGGCGAGCCAG‑CTGGTCCTGGa < 1:408858/149‑1 (MQ=255) ggTTTGCGCGCTCAGCGCTTGCTCGTTGTCGGCCAGGTGGCCGGCATACAGCATGGCTGCCGACAGCGGCGTGCGGATCTGGTGGGCCAGCGAGGCAACCATGCGCCCCAACGACGACAGCCGCTCGTGGCGAGCCAG‑CTGGTCCTGGa < 2:309606/149‑1 (MQ=255) gTTTGCGCGCTCAGCGCTTGCTCGTTGTCGGCCAGGTGGCCGACATACAGCATGGCTGCCGACAGCGGCGTGCGGATCTGGTGGGCCAGCGAGGCAACCATGCGCCCCAACGACGACAGCCGCTCGTGGCGAGCCAG‑CTGGTCCTGGAg > 8:245449/1‑149 (MQ=255) gTTTGCGCGCTCAGCGCTTGCTCGTTGTCGGCCAGGTGGCCGACATACAGCATGGCTGCCGACAGCGGCGTGCGGATCTGGTGGGCCAGCGAGGCAACCATGCGCCCCAACGACGACAGCCGCTCGTGGCGAGCCAG‑CTGGTCCTGGAg < 7:245449/149‑1 (MQ=255) gTTTGCGCGCTCAGCGCTTGCTCGTTGTCGGCCAGGTGGCCGACATACAGCATGGCTGCCGACAGCGGCGTGCGGATCTGGTGGGCCAGCGAGGCAACCATGCGCCCCAACGACGACAGCCGCTCGTGGCGAGCCAG‑CTGGTCCTGGAg > 6:288940/1‑149 (MQ=255) gTTTGCGCGCTCAGCGCTTGCTCGTTGTCGGCCAGGTGGCCGACATACAGCATGGCTGCCGACAGCGGCGTGCGGATCTGGTGGGCCAGCGAGGCAACCATGCGCCCCAACGACGACAGCCGCTCGTGGCGAGCCAG‑CTGGTCCTGGAg < 5:288940/149‑1 (MQ=255) tGCGCGCTCAGCGCTTGCTCGTTGTCGGCCAGGTGGCCGGCATACAGCATGGCTGCCGACAGCGGCGTGCGGATCTGGTGGGCCAGCGAGGCAACCATGCGCCCCAACGACGACAGCCGCTCGTGGCGAGCCAG‑CTGGTCCTGGAGGc < 5:191880/148‑1 (MQ=255) tGCGCGCTCAGCGCTTGCTCGTTGTCGGCCAGGTGGCCGGCATACAGCATGGCTGCCGACAGCGGCGTGCGGATCTGGTGGGCCAGCGAGGCAACCATGCGCCCCAACGACGACAGCCGCTCGTGGCGAGCCAG‑CTGGTCCTGGAGGc < 6:231570/148‑1 (MQ=255) gcgcgcTCAGCGCTTGCTCGTTGTCGGCCAGGTGGCCGGCATACAGCATGGCTGCCGACAGCGGCGTGCGGATCTGGTGGGCCAGCg > 8:387420/1‑87 (MQ=255) gcgcgcTCAGCGCTTGCTCGTTGTCGGCCAGGTGGCCGGCATACAGCATGGCTGCCGACAGCGGCGTGCGGATCTGGTGGGCCAGCg < 7:387420/87‑1 (MQ=255) cgcTCAGCGCTTGCTCGTTGTCGGCCATGGGGCCGGCATACAGAATGGCTGCCGACTGCGGCGGGCGGATCTGGTGGGCCAGCGAGGCAACCATTCGCCCCAACGACGCCAGCCGCTCGTGGCGAGCCAG‑CTGGTCCTGGAGGCGACgg < 8:408426/149‑1 (MQ=255) gcTCAGCGCTTGCTCGTTGTCGGCCAGGTGGCCGGCATACAGCATGGCTGCCGACAGCGGCGTGCGGATCTGGTGGGCCAGCGAGGCAACCATGCGCCCCAACGACGACAGCCGCTCGTGGCGAGCCAG‑CTGGTCCTGGAGGCGACggg < 2:31998/149‑1 (MQ=255) cTCAGCGCTTGCTCGTTGTCGGCCAGGTGGCCGGCATACAGCATGGCTGCCGACAGCGGCGTGCGGATCTGGTGGGCCAGCGAGGCAACCATGCGCCCCAACGACGACAGCCGCTCGTGGCGAGCCAG‑CTGGTCCTGGAGGCGACGGGt < 7:224216/149‑1 (MQ=255) tCAGCGCTTGCTCGTTGTCGGCCAGGTGGCCGGCATACAGCATGGTTGCCGACAGCGGCGTGCGGATCTGGTGGGCCAGCGAGGCAACCATGCGCCCCAACGACGACAGCCGCTCGTGGCGAGCCAG‑CTGGTCCTGGAGGCGACGGGtt > 1:307794/1‑149 (MQ=255) tCAGCGCTTGCTCGTTGTCGGCCAGGTGGCCGGCATACAGCATGGCTGCCGACAGCGGCGTGCGGATCTGGTGGGCCAGCGAGGCAACCATGCGCCCCAACGACGACAGCCGCTCGTGGCGAGc < 4:296062/124‑1 (MQ=255) tCAGCGCTTGCTCGTTGTCGGCCAGGTGGCCGGCATACAGCATGGCTGCCGACAGCGGCGTGCGGATCTGGTGGGCCAGCGAGGCAACCATGCGCCCCAACGACGACAGCCGCTCGTGGCGAGc > 3:296062/1‑124 (MQ=255) tCAGCGCTTGCTCGTTGTCGGCCAGGTGGCCGGCATACAGCATGGCTGCCGACAGCGGCGTGCGGATCTGGTGGGCCAGCGAGGCAACCATGCGCCCCAACGACGACAGCCGCTCGTGGCGAGCCAG‑CTGGTCCTGGAGGCGACGGGtt > 3:359400/1‑149 (MQ=255) gcgcTTGCTCGTTGTCGGCCAGGTGGCCGGCATACAGCATGGCTGCCGACAGCGGCGTGCGGATCTGGTGGGCCAGCGAGGCAACCATGCGCCCCAACGACGACAGCCGCTCGt > 7:381584/1‑114 (MQ=255) gcgcTTGCTCGTTGTCGGCCAGGTGGCCGGCATACAGCATGGCTGCCGACAGCGGCGTGCGGATCTGGTGGGCCAGCGAGGCAACCATGCGCCCCAACGACGACAGCCGCTCGt < 8:381584/114‑1 (MQ=255) gcgcTTGCTCGTTGTCGGCCAGGTGGCCGGCATACAGCATGGCTGCCGACAGCGGCGTGCGGATCTGGTGGGCCAGCGAGGCAACCATGCGCCCCAACGACGACAGCCGCTCGTGGCGAGCCAG‑CTGGTCCTGGAGGCGACGGGTTtca < 6:124466/149‑1 (MQ=255) gcgcTTGCTCGTTGTCGGCCAGGTGGCCGGCATACAGCATGGCTGCCGACAGCGGCGTGCGGATCTGGTGGGCCAGCGAGGCAACCATGCGCCCCAACGACGACAGCCGCTCGTGGCGAGCCAG‑CTGGTCCTGGAGGCGACGGGTTtca < 5:127615/149‑1 (MQ=255) cTTGCTCGTTGTCGGCCAGGTGGCCGGCATACAGCATGGCTGCCGACAGCGGCGTGCGGATCTGGTGGGCCAGCGAGGCAACCATGCGCCCCAACGACGACAGCCGCTCGTGGCGAGCCAG‑CTGGTCCTGGAGGCGACGGGTTtcagtc < 1:203571/149‑1 (MQ=255) ttGCTCGTTGTCGGCCAGGTGGCCGGCATACAGCATGGCTGCCGACAGCGGCGTGCGGATCTGGTGGGCCAGCGAGGCAACCATGCGCCCCAACGACGACAGCCGCTCGTGGCGAGCCAG‑CTGGTCCTGGAGGCGACGGGTTtcagt > 1:292697/1‑147 (MQ=255) ttGCTCGTTGTCGGCCAGGTGGCCGGCATACAGCATGGCTGCCGACAGCGGCGTGCGGATCTGGTGGGCCAGCGAGGCAACCATGCGCCCCAACGACGACAGCCGCTCGTGGCGAGCCAG‑CTGGTCCTGGAGGCGACGGGTTtcagt > 7:86138/1‑147 (MQ=255) gCTCGTTGTCGGCCAGGTGGCCGGCATACAGCATGGCTGCCGACAGCGGCGTGCGGATCTGGTGGGCCAGCGAGGCAACCATGCGCCCCAACGACGACAGCCGCTCGTGGCGAGCCAG‑CTGGTCCTGGAGGCGACGGGTTTCAGTCAgg > 1:55352/1‑149 (MQ=255) cTCGTTGTCGGCCAGGTGGCCGGCATACAGCATGGCTGCCGACAGCGGCGTGCGGATCTGGTGGGCCAGCGAGGCAACCATGCGCCCCAACGACGACAGCCGCTCGTGGCGAGCCAGCCTGGTCCTGGAGGCGACGGGTTTCAGTCAgg < 1:47115/149‑1 (MQ=255) cTCGTTGTCGGCCAGGTGGCCGGCATACAGCATGGCTGCCGACAGCGGCGTGCGGATCTGGTGGGCCAGCGAGGCAACCATGCGCCCCAACGACGACAGCCGCTCGTGGCGAGCCAG‑CTGGTCCTGGAGGCGACGGGTTTCAGTCAGGt > 6:182514/1‑149 (MQ=255) tCGTTGTCGGCCAGGTGGCCGGCATACAGCATGGCTGCCGACAGCGGCGTGCGGATCTGGTGGGCCAGCGAGGCAACCATGCGCCCCAACGACGACAGCCGCTCGTGGCGAGCCAG‑CTGGTCCTGGAGGCGACGGGTTTCAGTCAGGTc < 7:316641/149‑1 (MQ=255) tCGTTGTCGGCCAGGTGGCCGGCATACAGCATGGCTGCCGACAGCGGCGTGCGGATCTGGTGGGCCAGCGAGGCAACCATGCGCCCCAACGACGACAGCCGCTCGTGGCGAGCCAG‑CTGGACCTGGAGGCGACGGGTTTCAGTCAGGTc < 1:242533/149‑1 (MQ=255) ttGTCGGCCAGGTGGCCGGCATACAGCATGGCTGCCGACAGCGGCGTGCGGATCTGGTGGGCCAGCGAGGCAACCATGCGCCCCAACGACGACAGCCGCTCGTGGCGAGCCAG‑CTGGTCCTGGAGGCGACGGGTTTCGGTCAGGTCGtt > 6:284120/1‑149 (MQ=255) ttGTCGGCCAGGTGGCCGGCATACAGCATGGCTGCCGACAGCGGCGTGCGGATCTGGTGGGCCAGCGAGGCAACCATGCGCCCCAACGACGACAGCCGCTCGTGGCGAGCCAG‑CTGGTCCTGGAGGCGACGGGTTTCAGTCAGGTCGtt < 4:246995/149‑1 (MQ=255) tgccGGCCACCTGGCCGACATACAGCATGGCTGCCGACAGCGGCGTGCGGATCTGGTGGGCCAGCGAGGCAACCATGCGCCCCAACGACGACAGCCGCTCGTGGCGAGCCAG‑CTGGTCCTGGAGGCGACGGGTTTCAGTCAGGTCGtt > 6:401743/4‑148 (MQ=255) gTCGGCCAGGTGGCCGGCATACAGCATGGCTGCCGACAGCGGCGTGCGGATCTGGTGGGCCAGCGAGGCAACCATGCGCCCCAACGACGACAGCCGCTCGTGGCGAGCCAG‑CTGGTCCTGGAGGCGACGGGTTTCAGTCAGGTCGTTg < 2:325311/148‑1 (MQ=255) cGGCCAGGTGGCCGGCATACAGCATGGCTGCCGACAGCGGCGTGCGGATCTGGTGGGCCAGCGAGGCAACCATGCGCCCCAACGACGACAGCCGCTCGTGGCGAGCCAG‑CTGGTCCTGGAGGCGACGGGTTTCAGTCAGGTCGTTGag > 3:288123/1‑148 (MQ=255) ggCCAGGTGGCCGGCATACAGCATGGCTGCCGACAGCGGCGTGCGGATCTGGTGGGCCAGCGAGGCAACCATGCGCCCCAACGACGACAGCCGCTCGTGGCGAGCCAG‑CTGGTCCTGGAGGCGACGGGTTTCAGTCAGGTCGTTGagc < 4:288123/148‑1 (MQ=255) tGGCCGGCATACAGCATGGCTGCCGACAGCGGCGTGCGGATCTGGTGGGCCAGCGAGGCAACCATGCGCCCCAACGACGACAGCCGCTCGTGGCGAGCCAG‑CTGGTCCTGGAGGCGACGGGTTTCAGTCAGGTCGTTGAGCAGCACCaa > 2:206563/1‑149 (MQ=255) | CCGGTCCCCCAGTGGCAACTCGCCACGGGCAAACACCAGCATGTCGCGCACCTGGTGTTCCAGTTCGTGCAGGCGCTCCTTCAAGGTCGCGGCGAAGCGCTGACGGGTTTGCGCGCTCAGCGCTTGCTCGTTGTCGGCCAGGTGGCCGGCATACAGCATGGCTGCCGACAGCGGCGTGCGGATCTGGTGGGCCAGCGAGGCAACCATGCGCCCCAACGACGACAGCCGCTCGTGGCGAGCCAG‑CTGGTCCTGGAGGCGACGGGTTTCAGTCAGGTCGTTGAGCAGCACCAATTGG > NC_002947/4962887‑4963181 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |