| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,964,909 | C→G | 6.8% | S150T (AGT→ACT) | fleQ ← | transcriptional regulator FleQ |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,964,909 | 0 | C | G | 6.8% | 234.2 / 6.8 | 74 | S150T (AGT→ACT) | fleQ | transcriptional regulator FleQ |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (27/41); new base G (2/3); total (29/45) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.82e-01 | |||||||||||
ACGAACGGCGCTTCGCGGCGCTTGGAATGGTAGTGCAGGTTGCGCGCTACCACTTCCTTGCCGGTGCCGGACTCACCCAGGATCAGCACGCTGGCGTCGGTATCCGCCACTTGCTGCATCATCTGCCGCACGTGCTGAATGGCACGACTGGTGCCAACCAGGCTG‑CGGAACAGATTGGGTTCGCGCTGGCGACCCCGCTCGCGCGCCTGGTCATACATTTCGCGGTAGACCTGGGCACGGTGCAGCGAGTCCAGCAATTGGCTGTAGCTTGGCGGCATTTCCAGGTTGGAAAG > NC_002947/4964762‑4965054 | aCGAACGGCGCTTCGCGGCGCTTGGAATGGTAGTGCAGGTTGCGCGCTACCACTTCCTTGCCGGTGCCGGACTCACCCAGGATCAGCACGCTGGCGTCGGTATCCGCCACTTGCTGCATCATCTGCCGCACGTGCTGAATGGCACGACt > 8:237086/1‑149 (MQ=255) cGAACGGCGCTTCGCGGCGCTTGGAATGGTAGTGCAGGTTGCGCGCTACCACTTCCTTGCCGGTGCCGGACTCACCCAGGATCAGCACGCTGGCGTCGGTATCCGCCACTTGCTGCATCATCTGCCGCACGTGCTGAATGGCACGACTg < 7:47246/149‑1 (MQ=255) aaCGGCGCTTCGCGGCGCTTGGAATGGTAGTGCAGGTTGCGCGCTACCACTTCCTTGCCGGTGCCGGACTCACCCAGGATCAGCACGCTGGCGTCGGTATCCGCCACTTGCTGCATCATCTGCCGCACGTGCTGAATGGCACGACTGGt < 2:30025/149‑1 (MQ=255) gcTTCGCGGCGCTTGGAATGGTAGTGCAGGTTGCGCGCTACCACTTCCTTGCCGGTGCCGGACTCACCCAGGATCAGCCCGCTGGCGGCGGTATCCGCCACTTGCTGCATCATCTGCCGCACGTGCTGAATGGCACGACTGGTGCCAAc < 2:220590/149‑1 (MQ=255) cgcgGCGCTTGGAATGGTAGTGCAGGTTGCGCGCTACCACTTCCTTGCCGGTGCCGGACTCACCCAGGATCAGCACGCTGGCGTCGGTATCCGCCACTTGCTGCATCATCTGCCGCACGTGCTGAATGGCACCAGTCGTGCCattca < 2:434926/147‑5 (MQ=255) ggcgCTTGGAATGGTAGTGCAGGTTGCGCGCTACCACTTCCTTGCCGGTGCCGGACTCACCCAGGATCAGCACGCTGGCGTCGGTATCCGCCACTTGCTGCATCATCTGCCGCACGTGCTGAATGGCACCAGTCGTGCCattca < 8:394378/144‑5 (MQ=255) ggcgCGTGGAATGGTAGTGCAGGTTGCGCGCTACCACTTCCTTGCCGGTGCCGGACTCACCCAGGATCAGCACGCTGGCGTCGGTATCCGCCACTTGCTGCATCATCTGCCGCACGTGCTGAATGGCACCAGTCGTGCCattca > 7:394378/1‑140 (MQ=255) gcTTGGAATGGTAGTGCAGGTTGCGCGCTACCACTTCCTTGCCGGTGCCGGACTCACCCAGGATCAGCACGCTGGCGTCGGTATCCGCCACTTGCTGCATCATCTGCCGCACGTGCTGAATGGCACGACTGGTGCCAACCAGGCTT‑Cgg < 8:263944/149‑1 (MQ=255) ggAATGGTAGTGCAGGTTGCGCGCTACCACTTCCTTGCCGGTGCCGGACTCACCCAGGATCAGCACGCTGGCGTCGGTATCCGCCACTTGCTGCATCATCTGCCGCACGTGCTGAATGGCACGACTGGTGCCAACCAGGCTG‑CGGaa < 7:79233/147‑1 (MQ=255) tGGTAGTGCAGGTTGCGCGCTACCACTTCCTTGCCGGTTCCGGACTCACCCAGGATCAGCACGCTGGCGTCGGTATCCGCCACTTGCTGCATCATCTGCCGCACGTGCTGAATGGCACGACTGGTGCCAACCAGGCTG‑CGGAACAGAtt < 5:269166/149‑1 (MQ=255) gTAGTGCAGGTTGCGCGCTACCACTTCCTTGCCGGTGCCGGACTCACCCAGGATCAGCACGCTGGCGTCGGTATCCGCCACTTGCTGCATCATCTGCCGCACGTGCTGAATGGCACGACTGGTGCCAACCAGGCTG‑CGGAACAGATTgg < 4:268728/149‑1 (MQ=255) gTAGTGCAGGTTGCGCGCTACCACTTCCTTGCCGGTGCCGGACTCACCCAGGATCAGCACGCTGGCGTCGGTATCCGCCACTTGCTGCATCATCTGCCGCACGTGCTGAATGGCACGACTGGTGCCAACCAGGCTG‑CGGAACAGATTgg < 8:384739/149‑1 (MQ=255) gTAGTGCAGGTTGCGCGCTACCACTTCCTTGCCGGTGCCGGACTCACCCAGGATCAGCACGCTGGCGTCGGTATCCGCCACTTGCTGCATCATCTGCCGCACGTGCTGAATGGCACGACTGGTGCCAACCAGGCTG‑CGGAACAGATTgg > 5:415769/1‑149 (MQ=255) gTAGTGCAGGTTGCGCGCTACCACTTCCTTGCCGGTGCCGGACTCACCCAGGATCAGCACGCTGGCGTCGGTATCCGCCACTTGCTGCATCATCTGCCGCACGTACTGAATGGCACGACTGGTGCCAACCAGGCTG‑CGGAACAGATTgg < 1:192608/149‑1 (MQ=255) tAGTGCAGGTTGCGCGCTACCACTTCCTTGCCGGTGCCGGACTCACCCAGGATCAGCACGCTGGCGTCGGTATCCGCCACTTGCTGCATCATCTGCCGCACGTGCTGAATGGCACGACTGGTGCCAACCAGGCTG‑CGGAACAGATTggg > 7:314420/1‑149 (MQ=255) gTGCAGGTTGCGCGCTACCACTTCCTTGCCGGTGCCGGCCTCACCCAGGATCAGCACGCTGGCGTCGGTATCCGCCACTTGCTGCATCATCTGCCGCACGTGCTGAATGGCACGACTGGTGCCAACCAGGCTG‑CGGAACAGATTGGGt > 6:261646/1‑148 (MQ=255) gTGCAGGTTGCGCGCTACCACTTCCTTGCCGGTGCCGGACTCACCCAGGATCAGCACGCTGGCGTCGGTATCCGCCACTTGCTGCATCATCTGCCGCACGTGCTGAATGGCACGACTGGTGCCAACCAGGCTG‑CGGAACAGATTGGGt < 5:19430/148‑1 (MQ=255) cTACCACTTCCTTGCCGGTGCCGGACTCACCCAGGATCAGCACGCTGGCGTCGGTATCCGCCACTTGCTGCATCATCTGCCGCACGTGCTGAATGGCACGACTGGTGCCAACCAGGCTG‑CGGAACAGATTGGGTTCGCGCTGGCGAccc < 2:36925/149‑1 (MQ=255) tACCACTTCCTTGCCGGTGCCGGACTCACCCAGGATCAGCACGCTGGCGTCGGTATCCGCCACTTGCTGCATCATCTGCCGCACGTGCTGAATGGCACGACTGGTGCCAACCAGGCTG‑CGGAACAGATTGGGTTCGCGCTGGCGAcccc > 8:142989/1‑149 (MQ=255) cACTTCCTTGCCGGTGCCGGACTCACCCAGGATCAGCACGCTGGCGTCGGTATCCGCCACTTGCTGCATCATCTGCCGCACGTGCTGAATGGCACGACTGGTGCCAACCAGGCTG‑c < 1:75667/116‑1 (MQ=255) cACTTCCTTGCCGGTGCCGGACTCACCCAGGATCAGCACGCTGGCGTCGGTATCCGCCACTTGCTGCATCATCTGCCGCACGTGCTGAATGGCACGACTGGTGCCAACCAGGCTG‑c > 2:75667/1‑116 (MQ=255) cACTTCCTTGCCGGTGCCGGACTCACCCAGGATCAGCACGCTGGCGTCGGTATCCGCCACTTGCTGCATCATCTGCCGCACGTGCTGAATGGCACGACTGGTGCCAACCAGGCTG‑CGGAACAGATTGGGTTCGCGCTGGCGACCCCGCt > 8:327127/1‑149 (MQ=255) aattCCTTGCCGGTGGCGGACTCCCCCCTGATCACCACGCTGGCGTCGGTATCCGCCACTTGCTGCATCATCTTCCGCCAGTGCCGAATGGCACGAATGGTGCCAACCAGGCTG‑CGGCACAGATTGGGTTCGCGCTGGCGACCCCGCTc < 2:404148/147‑1 (MQ=255) ccTTGCCGGTGCCGGACTCACCCAGGATCAGCACGCTGGCGTCGGTATCCGCCACTTGCTGCATCATCTGCCGCACGTGCTGAATGGCACGACTGGTGCCAACCAGGCTG‑CGGAACAGATTGGGTTCGCGCTGGCGACCCCGCTcgc < 6:160365/147‑1 (MQ=255) ttGCCGGTGCCGGACTCCCCCAGGATCAGCACGCTGGCGTCGGTATCCGCCACTTGCTGCATCATCTGCCGCACGTGCTGAATGGCACGACTGGTGCCAACCAGGCTG‑CGGAACAGATTGGGTTCGCGCTGGCGACCCCGCTCgcgcgc > 8:261544/1‑149 (MQ=255) ttGACGGTGACGGACTCACCCAGGATCAGCACGCTGGCGTCGGTATCCGCCACTTGCTGCATCATCTGCCGCACGTGCTGAATGGCACGACTGGTGCCAACCAGGCTG‑CGGAACAGATTGGGTTCGCGCTGGCGACCCCGCTCgcgcgc > 4:131112/1‑149 (MQ=255) gccggtgccggACTCACCCAGGATCAGCACGCTGGCGTCGGTATCCGCCACTTGCTGCATCATCTGCCGCACGTGCTGAATGGCACGACTGGTGCCAACCAGGCTG‑CGGAACAGATTGGGTTCGCGCTGGCGACCCCGCTCGCGCGCCt > 4:28881/1‑149 (MQ=255) gtgccggACTCACCCAGGATCAGCACGCTGGCGTCGGTATCCGCCACTTGCTGCATCATCTGCCGCACGTGCTGAATGGCACGACTGGTGCCAACCAGGCTG‑CGGAACAGATTGGCTTCGCGCTGGCGACCCCGCTCGCGCGCCTGGTc < 4:336316/149‑1 (MQ=255) tgccggACTCACCCAGGATCAGCACGCTGGCGTCGGTATCCGCCACTTGCTGCATCATCTGCCGCACGTGCTGAATGGCACGACTGGTGCCAACCAGGCTG‑CGGAACAGATTGGGTTCGCGCTGGCGACCCCGCTCGCGCGCCTGGTCa < 7:124333/149‑1 (MQ=255) tCACCCAGGATCAGCACGCTGGCGTCGGTATCCGCCACTTGCTGCATCATCTGCCGCACGTGCTGAATGGCACGACTGGTGCCAACCAGGCTG‑CGGAACAGATTGGGTTCGCGCTGGCGACCCCGCTCGCGCGCCTGGTCATACATTTc > 4:140200/1‑149 (MQ=255) acacAGGATCAGCACGCTGGCGTCGGTATCCGCCACTTGCTGCATCATCTGCCGCACGTGCTGAATGGCACGACTGGTGCCAACCAGGCTG‑CGGAACAGATTGGGTTCGCGCTGGCGACCCCGCTCGCGCGCCTGGTCATACATTTcgc > 3:84530/4‑149 (MQ=255) aCCCAGGATCAGCACGCTGGCGTCGGTATCCGCCACTTGCTGCATCATCTGCCGCACGTGCTGAATGGCACGACTGGTGCCAACCAGGCTG‑CGGAACAGATTGGGTTCGCGCTGGCGACCCCGCTCGCGCGCCTGGTCATACATTTcgc > 2:45755/1‑149 (MQ=255) cccAGGATCAGCACGCTGGCGTCGGTATCCGCCACTTGCTGCATCATCTGCCGCACGTGCTGAATGGCACGACTGGTGCCAACCAGGCTG‑CGGAACAGATTGGGTTCGCGCTGGCGACCCCGCTCGCGCGCCTGGTCATACATTTcgcg < 3:140200/149‑1 (MQ=255) cccAGGATCAGCACGCTGGCGTCGGTATCCGCCACTTGCTGCATCATCTGCCGCACGTGCTGAATGGCACGACTGGGGCCAACCAGGCTG‑CGGAACAGATTGGGTTCGCGCTGGCGACCCCGCTCGCGCGCCTGGTCATACATTTcgcg < 8:84599/149‑1 (MQ=255) ccAGGATCAGCACGCTGGCGTCGGTATCCGCCACTTGCTGCATCATCTGCCGCACGTGCTGAATGGCACGACTGGTGCCAACCAGGCTG‑TGGAACAGATTGGGTTCGCGCTGGCGACCCCGCTCGCGCGCCTGGTCATACATTTCGCgg < 2:407982/149‑1 (MQ=255) ccAGGATCAGCACGCTGGCGTCGGTATCCGCCACTTGCTGCATCATCTGCCGCACGTGCTGAATGGCACGACTGGTGCCAACCAGGCTG‑CGGAACAGATTGGGTTCGCGCTGGCGACCCCGCTCGCGCGCCTGGTCATACATTTcgcg > 1:203191/1‑148 (MQ=255) ccAGGATCAGCACGCTGGCGTCGGTATCCGCCACTTGCTGCATCATCTGCCGCACGTGCTGAATGGCACGACTGGTGCCAACCAGGCTG‑CGGAACAGATTGGGTTCGCGCTGGCGACCCCGCTCGCGCGCCTGGTCATACATTTcgcg < 2:203191/148‑1 (MQ=255) ccAGGATCAGCACGCTGGCGTCGGTATCCGCCACTTGCTGCATCATCTGCCGCACGTGCTGAATGGCACGACTGGTGCCAACCAGGCTG‑CGGAACAGATTGGGTTCGCGCTGGCGACCCCGCTCGCGCGCCTGGTCATACATTTCGCgg < 8:314420/149‑1 (MQ=255) cAGGATCAGCACGCTGGCGTCGGTATCCGCCACTTGCTGCATCATCTGCCGCACGTGCTGAATGGCACGACTGGTGCCAACCAGGCTG‑CGGAACAGATTGGGTTCGCGCTGGCGACCCCGCTCGCGCGCCTGGTCATACATTTCGCgg > 2:40355/1‑148 (MQ=255) aGCACGCTGGCGTCGGTATCCGCCACTTGCTGCATCATCTGCCGCACGTGCTGAATGGCACGACTGGTGCCAACCAGGCTG‑CGGAACAGATTGGGTTCGCGCTGGCGACCCCGCTCGCGCGCCTGGTCATACATTTCGCGGt > 8:387674/1‑142 (MQ=255) aGCACGCTGGCGTCGGTATCCGCCACTTGCTGCATCATCTGCCGCACGTGCTGAATGGCACGACTGGTGCCAACCAGGCTG‑CGGAACAGATTGGGTTCGCGCTGGCGACCCCGCTCGCGCGCCTGGTCATACATTTCGCGGt < 7:387674/142‑1 (MQ=255) gCACGCTGGCGTCGGTATCCGCCACTTGCTGCATCATCTGCCGCACGTGCTGAATGGCACGACTGGTGCCAACCAGGCTG‑CGGAACAGATTGGGTTCGCGCTGGCGACCCCGCTCGCGCGCCTGGTCATACATTTCGCGGTAGACCTgg > 4:408531/1‑149 (MQ=255) cGCTGGCGTCGGTATCCGCCACTTGCTGCATCATCTGCCGCACGTGCTGAATGGCACGACTGGTGCCAACCAGGCTG‑CGGAACAGATTGGGTTCGCGCTGGCGACCCCGCTCGCGCGCCTGGTCATACATTTCGCGGTAGACCTGGGCa > 5:62338/1‑149 (MQ=255) cTGGCGTCGGTATCCGCCACTTGCTGCATCATCTGCCGCACGTGCTGAATGGCACGACTGGTGCCAACCAGGCTG‑CGGAACAGATTGGGTTCGCGCTGGCGACCCCGCTCGCGCGCCTGGTCATACATTTCGCGGTAGACCTGGGCACg < 1:182362/149‑1 (MQ=255) gCGTCGGTATCCGCCACTTGCTGCATCATCTGCCGCACGTGCTGAATGGCACGACTGGTGCCAACCAGGCTG‑CGGAACAGATTGGGTTCGCGCTGGCGACCCCGCTCGCGCGCCTGGTCATACATTTCGCGGTAGACCTGGGCACGGTg < 3:271627/149‑1 (MQ=255) gCGTCGGTATCCGCCACTTGCTGCATCATCTGCCGCACGTGCTGAATGGCACGACTGGTGCCAACCAGGCTG‑CGGAACAGATTGGGTTCGCGCTGGCGACCCCGCTCGCGCGCCTGGTCATACATTTCGCGGTAGACCTGGGCACGGTg > 8:394991/1‑149 (MQ=255) gCGTCGGTATCCGCCACTTGCTGCATCATCTGCCGCACGTGCTGAATGGCACGACTGGTGCCAACCAGGCTG‑CGGAACAGATTGGGTTCGCGCTGGCGACCCCGCTCGCGCGCCTGGTCATACATTTCGCGGTAGACATGGGCACGGt > 8:400627/1‑148 (MQ=255) gTCGGTATCCGCCACTTGCTGCATCATCTGCCGCACGTGCTGAATGGCACGACTGGTGCCAACCAGGCTG‑CGGAACAGATTGGGTTCGCGCTGGCGACCCCGCTCGCGCGCCTGGTCATACATTTCGCGGTAGACCTGGGCACGGTg > 8:43187/1‑147 (MQ=255) tCGGTATCCGCCACTTGCTGCATCATCTGCCGCACGTGCTGAATGGCACGACTGGTGCCAACCAGGCTG‑CGGAACAGATTGGGTTCGCGCTGGCGACCCCGCTCGCGCGCCTGGTCATACATTTCGCGGTAGACCTGGGCACGGTGCAg < 3:131112/149‑1 (MQ=255) ggTATCCGCCACTTGCTGCATCATCTGCCGCACGTGCTGAATGGCACGACTGGGGCCAACCAGGCTG‑CGGAACAGATTGGGTTCGCGCTGGCGACCCCGCTCGCGCGCCTGGTCATACATTTCGCGGTAGACCTGGGCACGGTGCAGCg < 4:154755/149‑1 (MQ=255) tATCCGCCACTTGCTGCATCATCTGCCGCACGTGCTGAATGGCACGACTGGTGCCAACCAGGCTGTAGGAACAGATTGGGTTCGCGCTGGCGACCCCGCTCGCGCGCCTGGTCATACATTTCGCGGTAGACCTGGGCACGGTGCAGc > 1:349004/1‑147 (MQ=255) cGCCACTTGCTGCATCATCTGCCGCACGTGCTGAATGGCACGACTGGTGCCAACCAGGCTG‑CGGAACAGATTGGGTTCGCGCTGGCGACCCCGCTCGCGCGCCTGGTCATACATTTCGCGGTAGACCTGGGCACGGTGCAGCGAGTc > 7:19995/1‑147 (MQ=255) ctgcATCATCTGCCGCACGTGCTGAATGGCACGACTGGTGCCAACCAGGCTG‑CGGAACAGATTGGGTTCGCGCTGGCGACCCCGCTCGCGCGCCTGGTCATACATTTCGCGGTAGACCTGGGCACGGTGCAGCGAGTCCAGCAATTgg < 6:62338/148‑1 (MQ=255) ctgcATCATCTGCCGCACGTGCTGAATGGCACGACTGGTGCCAACCAGGCTG‑CGGAACAGATTGGGTTCGCGCTGGCGACCCCGCTCGCGCGCCTGGTCATACATTTCGCGGTAGACCTGGGCACGGTGCAGCGAGTCCAGCAATTgg < 7:327127/148‑1 (MQ=255) catcatCTGCCGCACGTGCTGAATGGCACGACTGGTGCCAACCAGGCTG‑CGGAACAGATTGGGTTCGCGCTGGCGACCCCGCTCGCGCGCCTGGTCATACATTTCGCGGTAGACCTGGGCACGGTGCAGCGAGTCCAGCAATTGGCTGt < 6:19798/149‑1 (MQ=255) atcatcTGCCGCACGTGCTGAATGGCACGACTGGTGCCAACCAGGCTG‑CGGAACAGATTGGGTTCGCGCTGGCGACCCCGCTCGCGCGCCTGGTCATACATTTCGCGGTAGACCTGGGGACGGTGCAGCGAGTCCAGCAATTGGCTGTa < 1:40355/149‑1 (MQ=255) atcatcTGCCGCACGTGCTGAATGGCACGACTGGTGCCAACCAGGCTG‑CGGAACAGATTGGGTTCGCGCTGGCGACCCCGCTCGCGCGCCTGGTCATACATTTCGCGGTAGACCTGGGCACGGTGCAGCGAGTCCAGCAATTGGCTg > 7:342220/1‑147 (MQ=255) atcatcTGCCGCACGTGCTGAATGGCACGACTGGTGCCAACCAGGCTG‑CGGAACAGATTGGGTTCGCGCTGGCGACCCCGCTCGCGCGCCTGGTCATACATTTCGCGGTAGACCTGGGCACGGTGCAGCGAGTCCAGCAATTGGCTGTa < 3:408531/149‑1 (MQ=255) ccGCAGGTGCTGAATGGCACGACTGGTGCCAACCAGGCTG‑CGGAACAGATTGGGTTCGCGCTGGCGACCCCGCTCGCGCGCCTGGTCATACATTTCGCGGTAGACCTGGGCACGGTGCAGCGAGTCCAGCAATTGGCTGTAGCTTggcg < 2:140185/149‑1 (MQ=255) ccGCACGTGCTGAATGGCACGACTGGTGCCAACCAGGCTG‑CGGAACAGATTGGGTTCGCGCTGGCGACCCCGCTCGCGCGCCTGGTCATACATTTCGCGGTAGACCTGGGCACGGTGCAGCGAGTCCAGCAATTGGCTGTAGCTTggcg < 1:421353/149‑1 (MQ=255) ccGCACGTGCTGAATGGCACGACTGGTGCCAACCAGGCTG‑CGGAACAGATTGGGTTCGCGCTGGCGACCCCGCTCGCGCGCCTGGTCATACATTTCGCGGTAGACCTGGGCACGGTGCAGCGAGTCCAGCAATTGGCTGTAGCTTggc < 7:394991/148‑1 (MQ=255) ccGCACGTGCTGAATGGCACGACTGGTGCCAACCAGGCTG‑CGGAACAGATTGGGTTCGCGCTGGCGACCCCGCTCGCGCGCCTGGTCATACATTTCGCGGTAGACCTGGGCACGGTGCAGCGAGTCCAGCAATTGGCTGTAGCTTggc < 7:400627/148‑1 (MQ=255) gCACGTGCTGAATGGCACGACTGGTGCCAACCAGGCTG‑CGGAACAGATTGGGTTCGCGCTGGCGACCCCGCTCGCGCGCCTGGTCATACATTTCGCGGTAGACCTGGGCACGGTGCAGCGAGTCCAGCAATTGGCTGTAGCTTggcggc < 8:283613/149‑1 (MQ=255) gCACGTGCTGAATGGCACGACTGGTGCCAACCAGGCTG‑CGGAACAGATTGGGTTCGCGCTGGCGACCCCGCTCGCGCGCCTGGTCATACATTTCGCGGTAGACCTGGGCACGGTGCAGCGAGTCCAGCAATTGGCTGTAGCTTggcgg > 6:248326/1‑148 (MQ=255) aCGTGCTGAATGGCACGACTGGTGCCAACAAGGCTG‑CGGAACAGATTGGGTTCGCGCTGGCGACCCCGCTCGCGCGCCTGGTCATACATTTCGCGGTAGACCTGGGCACGGTGCAGCGAGTCCAGCAATTGGCTGTAGCTTGGCGGCAt > 2:286952/1‑149 (MQ=255) ggttGGCACCAGTCGTGCCAACCAGGCTG‑CGGAACAGATTGGGTTCGCGCTGGCGACCCCGCTCGCGCGCCTGGTCATACATTTCGCGGTAGACCTGGGCACGGTGCAGCGAGTCCAGCAAtt < 5:435866/120‑1 (MQ=255) ggttGGCACCAGTCGTGCCAACCAGGCTG‑CGGAACAGATTGGGTTCGCGCTGGCGACCCCGCTCGCGCGCCTGGTCATACATTTCGCGGTAGACCTGGGCACGGTGCAGCGAGTCCAGCAAtt > 6:435866/4‑123 (MQ=255) gCACGACTGGTGCCAACCAGGCTG‑CGGAACAGATTGGGTTCGCGCTGGCGACCCCGCTCGCGCGCCTGGTCATACATTTCGCGGTAGACCTGGGCACGGTGCAGCGAGTCCAGCAATTGGCTGTAGCTTGGCGGCATTTCCAGGTTgg < 4:84530/148‑1 (MQ=255) gCACGACTGGTGCCAACCAGGCTG‑CGGAACAGATTGGGTTCGCGCTGGCGACCCCGCTCGCGCGCCTGGTCATACATTTCGCGGTAGACCTGGGCACGGTGCAGCGAGTCCAGCAATTGGCTGTAGCTTGGCGGCATTTCCAGGTTGGa < 1:69426/149‑1 (MQ=255) cACGACTGGTGCCAACCAGGCTG‑CGGAACAGATTGGGTTCGCGCTGGCGACCCCGCTCGCGCGCCTGGTCATACATTTCGCGGTAGACCTGGGCACGGTGCAGCGAGTCCAGCAATTGGCTGTAGCTTGGCGGCATTTCCAGGTTGGaa < 3:28881/149‑1 (MQ=255) aCGACTGGTGCCAACCAGGCTG‑CGGAACAGATTGGGTTCGCGCTGGCGACCCCGCTCGCGCGCCTGGTCATACATTTCGCGGTAGACCTGGGCACGGTGCAGCGAGTCCAGCAATTGGCTGTAGCTTGGCGGCATTTCCAGGTTGGaaa < 5:261646/149‑1 (MQ=255) cGACTGGTGCCAACCAGGCTG‑CGGAACAGATTGGGTTCGCGCTGGCGACCCCGCTCGCGCGCCTGGTCATACATTTCGCGGTAGACCTGGGCACGGTGCAGCGAGTCCAGCAATTGGCTGTAGCTTGGCGGCATTTCCAGGTTGGAAAg < 6:415769/149‑1 (MQ=255) gACTGGTGCCAACCAGGCTG‑CGGAACAGATTGGGTTCGCGCTGGCGACCCCGCTCGCGCGCCTGGTCATACATTTCGCGGTAGACCTGGGCACGGTGCAGCGAGTCCAGCAATTGGCTGTAGCTTGGCGGCATTTCCAGGTTGGaa < 4:239257/146‑1 (MQ=255) gACTGGTGCCAACCAGGCTG‑CGGAACAGATTGGGTTCGCGCTGGCGACCCCGCTCGCGCGCCTGGTCATACATTTCGCGGTAGACCTGGGCACGGTGCAGCGAGTCCAGCAATTGGCTGTAGCTTGGCGGCATTTCCAGGTTGGaa > 3:239257/1‑146 (MQ=255) | ACGAACGGCGCTTCGCGGCGCTTGGAATGGTAGTGCAGGTTGCGCGCTACCACTTCCTTGCCGGTGCCGGACTCACCCAGGATCAGCACGCTGGCGTCGGTATCCGCCACTTGCTGCATCATCTGCCGCACGTGCTGAATGGCACGACTGGTGCCAACCAGGCTG‑CGGAACAGATTGGGTTCGCGCTGGCGACCCCGCTCGCGCGCCTGGTCATACATTTCGCGGTAGACCTGGGCACGGTGCAGCGAGTCCAGCAATTGGCTGTAGCTTGGCGGCATTTCCAGGTTGGAAAG > NC_002947/4964762‑4965054 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |