Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 5,137,665 | A→G | 8.9% | intergenic (‑64/‑149) | PP_4522 ← / → PP_4523 | LysR family transcriptional regulator/agmatinase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 5,137,665 | 0 | A | G | 8.9% | 210.7 / 9.2 | 78 | intergenic (‑64/‑149) | PP_4522/PP_4523 | LysR family transcriptional regulator/agmatinase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (28/43); new base G (3/4); total (31/47) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
GCGCTGGGCGTTGGCAAAGCCCTGGTGGCGCACCACGCTGATGAAGATGCGCAGCAGTTTCAGGTCGGGCAAGGTCGAGGCCATGGTGCAACGGTTCCACAAGGGTATGTGCGCGCAGTCTAACTGCTCTACCCGCCTTTAGTTCAGAAATTCCTGAACTAAGTATTTGTCGGTA‑GC‑‑GATTCTTCCCCGGCGCTCGCTTGAGCAGACTTGGCCGAAATGTCCCTGCCCGCCGGCAAACCACACGTGAATGGCGCGCGGCGGCACAGGTTCGAACAAACACAACAATCGACCGA > NC_002947/5137518‑5137810 | gcgcTGGGCGTTGGCAAAGCCCTGGTGGCGCACCACGCTGATGAAGATGCGCAGCAGTTTCAGGTCGGGCAAGGTCGAGGCCATGGTGCAACGGTTCCACAAGGGTATGTGCGCGCAGTCTAACTGCTCTACCCGCCTTTAGTTCAGa < 8:139912/148‑1 (MQ=255) gcTGGGCGTTGGCAAAGCCCTGGTGGCGCACCACGCTGATGAAGATGCGCAGCAGTTTCAGGTCGGGCAAGGTCGAGGCCATGGTGCACCGGTTCCACAAGGGTATGTGCGCGCAGTCTAACTGCTCTACCCGCCTTTAGTTCAGAAAt > 4:47087/1‑149 (MQ=255) gggCGTTGGCAAAGCCCTGGTGGCGCACCACGCTGATGAAGATGCGCAGCAGTTTCAGGTCGGGCAAGGTCGAGGCCATGGTGCAACGGTTCCACAAGGGTATGTGCGCGCAGTCTAACTGCTCTACCCGCCTTTAGTTCAGAAATTcc > 1:133586/1‑149 (MQ=255) ggCGTTGGCAAAGCCCTGGTGGCGCACCACGCTGATGAAGATGCGCAGCAGTTTCAGGTCGGGCAAGGTCGAGGCCATGGTGCAACGGTTCCACAAGGGTATGTGCGCGCAGTCTAACTGCTCTACCCGCCTTTAGTTCAGAAATTcc < 1:121569/148‑1 (MQ=255) ggCGTTGGCAAAGCCCTGGTGGCGCACCACGCTGATGAAGATGCGCAGCAGTTTCAGGTCGGGCAAGGTCGAGGCCATGGTGCAACGGTTCCACAAGGGTATGTGCGCGCAGTCTAACTGCTCTACCCGCCTTTAGTTCAGAAATTCCt < 8:363012/149‑1 (MQ=255) ggCGTTGGCAAAGCCCTGGTGGCGCACCACGCTGATGAAGATGCGCAGCAGTTTCAGGTCGGGCAAGGTCGAGGCCATGGTGCAACGGTTCCACAAGGGTATGTGCGCGCAGTCTAACTGCTCTACCCGCCTTTAGTTCAGAAATTCCt < 2:140067/149‑1 (MQ=255) ggCGTGTGCAACGCCCTGGTGGCGCACCACGCTGATGTAGATGCGCAGCAGTTTCAGGTCGGGCAAGGTCGAGGCCATGGTGCAACGGTTCCACAAGGGTATGTGCGCGCAGTCTAACTGCTCTACCCGCCTTTAGTTCAGAAATTc < 8:296914/147‑1 (MQ=255) gTTGGCAAAGCCCTGGTGGCGCACCACGCTGATGAAGATGCGCAGCAGTTTCAGGTCGGGCAAGGTCGAGGCCATGGTGCAACGGTTCCACAAGGGTATGTGCGCGCAGTCTAACTGCTCTACCCGCCTTTAGTTCAGAAATTCCTGaa < 7:374327/149‑1 (MQ=255) ttGGCAAAGCCCTGGTGGCGCACCACGCTGATGAAGATGCGCAGCAGTTTCAGGTCGGGCAAGGTCGAGGCCATGGTGCAACGGTTCCACAAGGGTATGTGCGCGCAGTCTAACTGCTCTACCCGCCTTTAGTTCAGAAATTCCTGAAc > 3:409135/1‑149 (MQ=255) ggCAAAGCCCTGGTGGCGCACCACGCTGATGAAGATGCGCAGGAGTTTCAGGTCGGGCAAGGTCGAGGCCATGGTGCAACGGTTCCACAAGGGTATGTGCGCGCAGTCTAACTGCTCTACCCGCCTTTAGTTCAGAAATTCCTGAACt < 5:321040/148‑1 (MQ=255) gCAAAGCCCTGGTGGCGCACCACGCTGATGAAGATGCGCAGCAGTTTCAGGTCGGGCAAGGTCGAGGCCATGGTGCAACGGTTCCACAAGGGTATGTGCGCGCAGTCTAACTGCTCTACCCGCCTTTAGTTCAGAAATTCCTGAACTaa < 8:166112/149‑1 (MQ=255) cAAAGCCCTGGTGGCGCACCACGCTGATGAAGATGCGCAGCAGTTTCAGGTCGGGCAAGGTCGAGTCCATGGTGCAACGGTTCCACAAGGGTATGTGCGCGCAGTCTAACTGCTCTACCCGCCTTTAGTTCAGAAATTCCTGAACTaa < 3:208189/148‑1 (MQ=255) aaaGCCCTGGTGGCGCACCACGCTGATGAAGATGCGCAGCAGTTTCAGGTCGGGCAAGGTCGAGGCCATGGTGCAACGGTTCCACAAGGGTATGTGCGCGCAGTCTAACTGCTCTACCCGCCTTTAGTTCAGGAATTTCTGAACTaaag < 7:112356/149‑3 (MQ=255) aGCCCTGGTGGCGCACCACGCTGATGAAGATGCGCAGCAGTTTCAGGTCGGGCAAGGTCGAGGCCATGGTGCAACGGTTCCACAAGGGTATGTGCGCGCAGTCTAACTGCTCTACCCGCCTTTAGTTCAGGAATTTCTGAACTaaaggc < 3:29149/149‑5 (MQ=255) cccTGGTGGCGCACCACGCTGATGAAGATGCGCAGCAGTTTCAGGTCGGGCAAGGTCGAGGCCATGGTGCAACGGTTCCACAAGGGTATGTGCGCGCAGTCTAACTGCTCTACCCGCCTTTAGTTCAGGAATTTCTGAACTaaaggcgg < 7:394061/149‑7 (MQ=255) cccTGGTGGCGCACCACGCTGATGAAGATGCGCAGCAGTTTCAGGTCGGGCAAGGTCGAGGCCATGGTGCAACGGTTCCACAAGGGTATGTGCGCGCAGTCTAACTGCTCTACCCGCCTTTAGTTCAGAAATTCCTGAACTAAGTAttt < 6:61896/149‑1 (MQ=255) ccTGGTGGCGCACCACGCTGATGAAGATGCGCAGCAGTTTCAGGTCGGGCAAGGTCGAGGCCATGGTGCAACGGTTCCACAAGGGTATGTGCGCGCAGTCTAACTGCTCTACCCGCCTTTAGTTCAGGAATTTCTGAACTaaaggcggg < 8:335333/149‑8 (MQ=255) cTGGTGGCGCACCACGCTGATGAAGATGCGCAGCAGTTTCAGGTCGGGCAAGGTCGAGGCCATGGTGCAACGGTTCCACAAGGGTATGTGCGCGCAGTCTAACTGCTCTACCCGCCTTTAGTTCAGAAATTCCTGAACTAAGTATTTGt < 5:416534/149‑1 (MQ=255) cTGGTGGCGCACCACGCTGATGAAGATGCGCAGCAGTTTCAGGTCGGGCAAGGTCGAGGCCATGGTGCAACGGTTCCACAAGGGTATGTGCGCGCAGTCTAACTGCTCTACCCGCCTTTAGTTCAGAAATTCCTGAACTAAGTATTTGt < 8:214920/149‑1 (MQ=255) gcgcACCACGCTGATGAAGATGCGCAGCAGTTTCAGGTCGGGCAAGGTCGAGGCCATGGTGCAACGGTTCCACAAGGGTATGAGCGCGCAGTCTAACTGCTCTACCAGCCTTTAGTTCAGAAATTCATGAACTAAGTATTTGTCGGTA‑g > 7:119352/1‑149 (MQ=255) cacGCTGATGAAGATGCTCAGCAGTTTCAGGTCGTGCAAGGTCGATGCCATGGTGCATCGGTTCCACAAGTGTATGTGCGCGCAGTCTAACTGCTGTACCCGCCTTTAGTTCAGAAATTCCTGAACTAAGTATTTGTCGGTA‑GC‑‑GAttc < 7:260190/149‑1 (MQ=255) gatgaagaAGATGCGCAGCAGTTTCAGGTCGCGCAAGGAAGACGCCATGGTGCAACGGTGCCACATGGGTATGTGCGCGCAGTCAAACTGCTGTACCCGCCTTTAGTTCAGAAATTCCTGAACTAAGTATTTGTCGGTA‑GC‑‑GAttcttc < 8:407614/147‑1 (MQ=255) gCTGATGAAGATGCGCAGCAGTTTCAGGTCGGGCAAGGTCGAGGCCATGGTGCAACGGTTCCACAAGGGTATGTGCGCGCAGTCTAACTGCTCTACCCGCCTTTAGTTCAGAAATTCCTGAACTAAGTATTTGTCGGTA‑GC‑‑GAttcttc < 3:47087/149‑1 (MQ=255) atgaAGATGCGCAGCAGTTTCATGTCGGGCAAGGTCGATGCCATGGTGCAACGGTTCCACAAGGGTATGTGCGCGCAGTCTAACTGCTCTACCCGCCTTTAGTTCAGAAATTCCTGAACTAAGTATTTGTCGGTA‑GC‑‑GATTCTTcccc < 4:285704/148‑1 (MQ=255) aTGCGCAGCAGTTTCAGGTCGGGCAAGGTCGAGGCCATGGTGCAACGGTTCCACAAGGGTATGTGCGCGCAGTCTAACTGCTCTACCCGCCTTTAGTTCAGAAATTCCTGAACTAAGTATTTGTCGGAA‑GC‑‑GATTCTTCCCCGGcgctc < 7:339354/149‑1 (MQ=255) cgcAGCAGTTTCAGGTCGGGCAAGGTCGAGGCCATGGTGCAACGGTTCCACAAGGGTATGTGCGCGCAGTCTAACTGCTCTACCCGCCTTTAGTTCAGAAATTCCTGAACTAAGTATTTGTCGGTA‑GC‑‑GATTCTTCCCCGGcgctcgc < 1:19679/148‑1 (MQ=255) cgcAGCAGTTTCAGGTCGGGCAAGGTCGAGGCCATGGTGCAACGGTTCCACAAGGGTATGTGCGCGCAGTCTAACTGCTCTACCCGCCTTTAGTTCAGAAATTCCTGAACTAAGTATTTGTCGGTA‑GC‑‑GATTCTTCCCCGGcgctcgc < 1:393018/148‑1 (MQ=255) gcagcaGTTTCAGGTCGGGCAAGGTCGAGGCCATGGTGCAACGGTTCCACAAGGGTATGTGCGCGCAGTCTAACTGCTCTACCCGCCTTTAGTTCAGAAATTCCTGAACTAAGTATTTGTCGGTA‑GC‑‑GATTCTTCCCCGGCGCTCGCtt > 4:219581/1‑149 (MQ=255) agcagTTTCAGGTCGGGCAAGGTCGAGGCCATGGTGCAACGGTTCCACAAGGGTATGTGCGCGCAGTCTAACTGCTCTACCCGCCTTTAGTTCAGAAATTCCTGAACTAAGTATTTGTCGGTA‑GC‑‑Ga > 5:73829/1‑127 (MQ=255) agcagTTTCAGGTCGGGCAAGGTCGAGGCCATGGTGCAACGGTTCCACAAGGGTATGTGCGCGCAGTCTAACTGCTCTACCCGCCTTTAGTTCAGAAATTCCTGAACTAAGTATTTGTCGGTA‑GC‑‑Ga < 6:73829/127‑1 (MQ=255) aGGTCGGGCAAGGTCGAGGCCATGGTGCAACGGTTCCACAAGGGTATGTGCGCGCAGTCTAACTGCTCTACCCGCCTTTAGTTCAGAAATTCCTGAACTAAGTATTTGTCGGTA‑GC‑‑GATTCTTCCCCGGCGCTCGCTTGAGCAGACTTg > 2:431457/1‑149 (MQ=255) gTCGGGCAAGGTCGAGGCCATGGTGCAACGGTTCCACAAGGGTATGTGCGCGCAGTCTACCTGCTCTACCCGCCTTTAGTTCAGAAATTCCTGAACTAAGTATTTGGCGGTA‑GC‑‑GATTCTTCCCCGGCGCTCGCTTGAGCAGACTTGGc < 3:416735/149‑1 (MQ=255) ggCAAGGTCGAGGCCATGGTGCAACGGTTCCACAAGGGTATGTGCGCGCAGTCTAACTGCTCTACCCGCCTTTAGTTCAGAAATTCCTGAACTAAGTATTTGTCGGTA‑GC‑‑GATTCTTCCCCGGCGCTCGCTTGAGCAGACTTGGCCGa > 5:340660/1‑148 (MQ=255) gCAAGGTCGAGGCCATGGTGCAACGGTTCCACAAGGGTATGTGCGCGCAGTCTAACTGCTCTACCCGCCTTTAGTTCAGAAATTCCTGAACTAAGTATTTGTCGGTA‑GC‑‑GATTCTTCCCCGGCGCTCGCTTGAGCAGACTTGGCCGaaa < 8:272177/149‑1 (MQ=255) aGGTCGAGGCCATGGTGCAACGGTTCCACAAGGGTATGTGCGCGCAGTCTAACTGCTCTACCCGCCTTTAGTTCAGAAATTCCTGAACTAAGTATTTGTCGGTA‑GC‑‑GATTCTTCCCCGGCGCTCGCTTGAGCAGACTTGGCCGAAATGt < 7:312791/149‑1 (MQ=255) gTCGAGGCCATGGTGCAACGGTTCCACAAGGGTATGTGCGCGCAGTCTAACTGCTCTACCCGCCTTTAGTTCAGAAATTCCTGAACTAAGTATTTGTCGGTA‑GC‑‑GATTCTTCCCCGGCGCTCGCTTGAGCAGACTTGGCCGAAATGTcc < 3:219581/149‑1 (MQ=255) tCGAGGCCATGGTGCAACGGTTCCACAAGGGTATGTGCGCGCAGTCTAACTGCTCTACCCGCCTTTAGTTCAGAAATTCCTGAACTAAGTATTTGTCGGTA‑GC‑‑GATTCTTCCCCGGCGCTCGCTTGAGCAGACTTGGCCGAAATGTccc < 2:133586/149‑1 (MQ=255) tCGAGGCCATGGTGCAACGGTTCCACAAGGGTATGTGCGCGCAGTCTAACTGCTCTACCCGCCTTTAGTTCAGAAATTCCTGAACTAAGTATTTGTCGGTA‑GC‑‑GATTCTTCCCCGGCGCTCGCTTGAGCAGACTTGGCCGAAATGTccc > 5:64773/1‑149 (MQ=255) gAGGCCATGGTGCAACGGTTCCACAAGGGTATGTGCGCGCAGTCTAACTGCTCTACCCGCCTTTAGTTCAGAAATTCCTGAACTAAGTATTTGTCGGTA‑GC‑‑GATTCTTCCCCGGCGCTCGCTTGAGCAGACTTGGCCGAAATGTCCCTg < 4:337943/149‑1 (MQ=255) ggCCATGGTGCAACGGTTCCACAAGGGTATGTGCGCGCAGTCTAACTGCTCTACCCGCCTTTAGTTCAGAAATTCCTGAACTAAGTATTTGTCGGTA‑GC‑‑GATTCTTCCCCGGCGCTCGCTTGAGCAGACTTGGCCGAAATGTCCCTGcc > 7:160944/1‑149 (MQ=255) cATGGTGCAACGGTTCCACAAGGGTATGTGCGCGCAGTCTAACTGCTCTACCCGCCTTTAGTTCAGAAATTCCTGAACTAAGTATTTGTCGGTA‑GC‑‑GATTCTTCCCCGGTGCTCGCTTGAGCAGACTTGGCCGAAATGTCCCTGCccgc > 8:213578/1‑149 (MQ=255) cATGGTGCAACGGTTCCACAAGGGTATGTGCGCGCAGTCTAACTGCTCTACCCGCCTTTAGTTCAGAAATTCCTGAACTAAGTATTTGTCGGTA‑GC‑‑GATTCTTCCCCGGCGCTCGCTTGAGCAGACTTGGCCGAAATGTCCCTGCccgc > 5:28113/1‑149 (MQ=255) aTGGTGCAACGGTTCCACAAGGGTATGTGCGCGCAGTCTAACTGCTCTACCCGCCTTTAGTTCAGAAATTCCTGAACTAAGTATTTGTCGGTA‑GC‑‑GATTCTTCCCCGGCGCTCGCTTGAGCAGACTTGGCCGAAATGTCCCTGCccgcc < 5:403802/149‑1 (MQ=255) tGGTGCAACGGTTCCACAAGGGTATGTGCGCGCAGTCTAACTGCTCTACCCGCCTTTAGTTCAGAAATTCCTGAACTAAGTATTTGTCGGTA‑GC‑‑GATTCTTCCCCGGCGCTCGCTTGAGCAGACTTGGCCGAAATGTCCCTGCccgccg < 6:340660/149‑1 (MQ=255) cAACGGTTCCACAAGGGTATGTGCGCGCAGTCTAACTGCTCTACCCGCCTTTAGTTCAGAAATTCCTGAACTAAGTATTTGTCGGTA‑GC‑‑GATTCTTCCCCGGCGCTCGCTTGAGCAGACTTGGCCGAAATGTCCCTGCCCGCCGGCaaa > 2:90471/1‑149 (MQ=255) aaCGGTTCCACAAGGGTATGTGCGCGCAGTCTAACTGCTCTACCCGCCTTTAGTTCAGAAATTCCTGAACTAAGTATTTGTCGGTA‑GC‑‑GATTCTTCCCCGGCGCTCGCTTGAGCAGACTTGGCCGAAATGTCCCTGCCCGCCGGCAAAc < 2:205095/149‑1 (MQ=255) aCGGTTCCACAAGGGTATGTGCGCGCAGTCTAACTGCTCTACCCGCCTTTAGTTCAGAAATTCCTGAACTAAGTATTTGTCGGTA‑GC‑‑GATTCTTCCCCGGCGCTCGCTTGAGCAGACTTGGCCGAAATGTCCCTGCCCGCCGGCAAAc > 4:308729/1‑148 (MQ=255) ggTTCCACAAGGGTATGTGCGCGCAGTCTAACTGCTCTACCCGCCTTTAGTTCAGAAATTCCTGAACTAAGTATTTGTCGGTA‑GC‑‑GATTCTTCCCCGGCGCTCGCTTGAGCAGACTTGGCCGAAATGTCCCTGCCCGCCGGCAAACca > 1:416497/1‑148 (MQ=255) cacaAGGGTATGTGCGCGCAGTCTAACTGCTCTACCCGCCTTTAGTTCAGAAATTCCTGAACTAAGTATTTGTCGGTA‑GC‑‑GATTCTTCCCCGGCGCTCGCTTGAGCAGACTTGGCCGAAATGTCCCTGCCCGCCGGCAAACCACACGt < 3:4791/148‑1 (MQ=255) acaAGGGTATGTGCGCGCAGTCTAACTGCTCTACCCGCCTTTAGTTCAGAAATTCCTGAACTAAGTATTTGTCGAAANGCGGGATTAGAAACCGGCGCACGCTTGATCAGACTTGGCCGAAATTTCCCTGCCCGCCGGCAAACCACACg > 1:141041/1‑149 (MQ=255) tgtgCGCGCAGTCTAACTGCTCTACCCGCCTTTAGTTCAGAAATTCCTGAACTAAGTATTTGTCGGTA‑GC‑‑GATTCTTCCCCGGCGCTCGCTTGAGCAGACTTGGCCGAAATGTCCCTGCCCGCCGGCAAACCACACGTGAATGgcgcg < 6:64773/148‑1 (MQ=255) gcgcAGTCTAACTGCTCTACCCGCCTTTAGTTCAGAAATTCCTGAACTAAGTATTTGTCGGTA‑GC‑‑GATTCTTCCCCGGCGCTCGCTTGAGCAGACTTGGCCGAAATGTCCCTGCCCGCCGGCAAACCACACGTGAATGGCGCGcggcgg < 1:431457/149‑1 (MQ=255) aGTCTAACTGCTCTACCCGCCTTTAGTTCAGAAATTCCTGAACTAAGTATTTGTCGGTA‑GC‑‑GATTCTTCCCCGGCGCTCGCTTGAGCAGACTTGGCCGAAATGTCCCTGCCCGCCGGCAAACCACACGTGAATGGCGCGCGGCGGca > 1:185676/1‑147 (MQ=255) tCTAACTGCTCTACCCGCCTTTAGTTCAGAAATTCCTGAACTAAGTATTTGTCGGTA‑GC‑‑GATTCTTCCCCGGCGCTCGCTTGAGCAGACTTGGCCGAAATGTCCCTGCCCGCCGGCAAACCACACGTGAATGGCGCGCGGCGGCACAgg < 8:160944/149‑1 (MQ=255) tAACTGCTCTACCCGCCTTTAGTTCAGAAATTCCTGAACTAAGTATTTGTCGGTA‑GC‑‑GATTCTTCCCCGGCGCTCGCTTGAGCAGACTTGGCCGAAATGTCCCTGCCCGCCGGCAAACCACACGTGAATGGCGCGCGGCGGCACAGGtt > 3:53912/1‑149 (MQ=255) aCTGCTCTACCCGCCTTTAGTTCAGAAATTCCTGAACTAAGTATTTGTCGGTA‑GC‑‑GATTCTTCCCCGGCGCTCGCTTGAGCAGACTTGGCCGAAATGTCCCTGCCCGCCGGCAAACCACACGTGAATGGCGCGCGGCGGCACAGGtt < 4:409135/147‑1 (MQ=255) cTGCTCTACCCGCCTTTAGTTCAGAAATTCCTGAACTAAGTATTTGTCGGTA‑GC‑‑GATTCTTCCCCGGCGCTCGCTTGAGCAGACTTGGCCGAAATGTCCCTGCCCGCCGGCAAACCACACGTGAATGGCGCGCGGCGGCACAGGTTCGa < 4:53912/149‑1 (MQ=255) tGCTCTACCCGCCTTTAGTTCAGAAATTCCTGAACTAAGTATTTGTCGGTA‑GC‑‑GATTCTTCCCCGGCGCTCGCTTGAGCAGACTTGGCCGAAATGTCCCTGCCCGCCGGCAAACCACACGTGAATGGCGCGCGGCGGCACAGGTTCGaa > 2:76735/1‑149 (MQ=255) gCTCTACCCGCCTTTAGTTCAGAAATTCCTGAACTAAGTATTTGTCGGTA‑GC‑‑GATTCTTCCCCGGCGCTCGCTTGAGCAGACTTGGCCGAAATGTCCCTGCCCGCCGGCAAACCACACGTGAATGGCGCGCGGCGGCACAGGTTCGaa > 7:160286/1‑148 (MQ=255) tctACCCGCCTTTAGTTCAGAAATTCCTGAACTAAGTATTTGTCGGTA‑GC‑‑GATTCTTCCCCGGCGCTCGCTTGAGCAGACTTGGCCGAAATGTCCCTGCCCGCCGGCAAACCACACGTGAATGgcg < 8:244306/126‑1 (MQ=255) tctACCCGCCTTTAGTTCAGAAATTCCTGAACTAAGTATTTGTCGGTA‑GC‑‑GATTCTTCCCCGGCGCTCGCTTGAGCAGACTTGGCCGAAATGTCCCTGCCCGCCGGCAAACCACACGTGAATGgcg > 7:244306/1‑126 (MQ=255) aCCCGCCTTTAGTTCAGAAATTCCTGAACTAAGTATTTGTCGGTA‑GC‑‑GATTCTTCGCCGGCGCTCGCTTGAGCAGACTTGGCCGAAATGTCCCTGCCCGCCGGCAAACCACACGTGAATGGCGCGCGGCGGCACAGGTTCGaacaaaca > 1:226604/1‑149 (MQ=255) aCCCGCCTTTAGTTCAGAAATTCCTGAACTAAGTATTTGTCGGTA‑GC‑‑GATTCTTCCCCGGCGCTCGCTTGAGCAGACTTGGCCGAAATGTCCCTGCCCGCCGGCAAACCACACGTGAATGGCGCGCGGCGGCACAGGTTCGaacaaaca > 4:217836/1‑149 (MQ=255) aCCCGCCTTTAGTTCAGAAATTCCTGAACTAAGTATTTGTCGGTA‑GC‑‑GATTCTTCCCCGGCGCTCGCTTGAGCAGACTTGGCCGAAATGTCCCTGCCCGCCGGCAAACCACACGTGAATGGCGCGCGGCGGCACAGGTTCGaacaaaca > 2:307725/1‑149 (MQ=255) cccGCCTTTAGTTCAGAAATTCCTGAACTAAGTATTTGTCGGTA‑GC‑‑GATTCTTCCCCGGCGCTCGCTTGAGCAGACTTGGCCGAAATGTCCCTGCCCGCCGGCAAACCACACGTGAATGGCGCGCGGCGGCACAGGTTCGaacaaa < 3:308729/146‑1 (MQ=255) cccGCCTTTAGTTCAGAAATTCCTGAACTAAGTATTTGTCGGTA‑GC‑‑GATTCTTCCCCGGCGCTCGCTTGAGCAGACTTGGCCGAAATGTCCCTGCCCGCCGGCAAACCACACGTGAATGGCGCGCGGCGGCACAGGTTCGaacaaa < 2:185676/146‑1 (MQ=255) ccGCCTTTAGTTCAGAAATTCCTGAACTAAGTATTTGTCGGTA‑GC‑‑GATTCTTCCCCGGCGCTCGCTTGAGCAGACTTGGCCGAAATGTCCCTGCCCGCCGGCAAACCACACGTGAATGGCGCGCGGCGGCACAGGTTCGAACAAacac > 1:237054/1‑148 (MQ=255) ccGCCTTTAGTTCAGAAATTCCTGAACTAAGTATTTGTCGGTA‑GC‑‑GATTCTTCCCCGGCGCTCGCTTGAGCAGACTTGGCCGAAATGTCCCTGCCCGCCGGCAAACCACACGTGAATGGCGCGCGGCGGCACAGGTTCGAACAAAcaca > 4:208356/1‑149 (MQ=255) aaatacttAGTTCAGGAATTTCTGAACTAAGTATTTGTCGGTA‑GC‑‑GATTCTTCCCCGGCGCTCGCTTGAGCAGACTTGGCCGAAATGTCCCTGCCCGCCGGCAAACCACACGTGAATGGCGCGCGGCGGCACAGGTTCGAACAAacac > 7:317437/7‑148 (MQ=255) cttAGTTCAGGAATTTCTGAACTAAGTATTTGTCGGTA‑GC‑‑GATTCTTCCCCGGCGCTCGCTTGAGCAGACTTGGCCGAAATGTCCCTGCCCGCCGGCAAACCACACGTGAATGGCGCGCGGCGGCACAGGTTCGAACAAACACAACAAt > 5:92591/2‑149 (MQ=255) ttAGTTCAGGAATTTCTGAACTAAGTATTTGTCGGTA‑GC‑‑GATTCTTCCCCGGCGCTCGCTTGAGCAGACTTGGCCGAAATGTCCCTGCCCGCCGGCAAACCACACGTGAATGGCGCGCGGCGGCACAGGTTCGAACAAACACAACAATc > 5:204624/1‑149 (MQ=255) tAGTTCAGAAATTCCTGAACTAAGTATTTGTCGGTA‑GC‑‑GATTCTTCCCCGGCGCTCGCTTGAGCAGACTTGGCCGAAATGTCCCTGCCCGCCGGCAAACCACACGTGAATGGCGCGCGGCGGCACAGGTTCGAACAAACACAACAAt < 1:90471/147‑1 (MQ=255) tAGTTCAGAAATTCCTGAACTAAGTATTTGTCGGTA‑GC‑‑GATTCTTCCCCGGCGCTCGCTTGAGCAGACTTGGCCGAAATGTCCCTGCCCGCCGGCAAACCACACGTGAATGGCGCGCGGCGGCACAGGTTCGAACAAACACAACAATc < 7:106319/148‑1 (MQ=255) gTTCAGAAATTCCTGAACTAAGTATTTGTCGGTA‑GC‑‑GATTCTTCGCCGGCGCTCGCTTGAGCAGACTTGGCCGAAATGTCCCTGCCCGCCGGCAAACCACACGTGAATGGCGCGCGGCGGCACAGGTTCGAACAAACACAACAATcga < 2:226604/148‑1 (MQ=255) ttCAGAAATTCCTGAACTAAGTATTTGTCGGTA‑GC‑‑GATTCTTCCCCGGCGCTCGCTTGAGCAGACTTGGCCGAAATGTCCCTGCCCGCCGGCAAACCACACGTGAATGGCGCGCGGCGGCACAGGtt < 4:309693/127‑1 (MQ=255) ttCAGAAATTCCTGAACTAAGTATTTGTCGGTA‑GC‑‑GATTCTTCCCCGGCGCTCGCTTGAGCAGACTTGGCCGAAATGTCCCTGCCCGCCGGCAAACCACACGTGAATGGCGCGCGGCGGCACAGGtt > 3:309693/1‑127 (MQ=255) ttCAGAAATTCCTGAACTAAGTATTTGTCGGTA‑GC‑‑GATTCTTCCCCGGCGCTCGCTTGAGCAGACTTGGCCGAAATGTCCCTGCCCGCCGGCAAACCACACGTGAATGGCGCGCGGCGGCACAGGTTCGAACAAACACAACAATcgacc < 1:115320/149‑1 (MQ=255) cAGAAATTCCTGAACTAAGTATTTGTCGGTA‑GC‑‑GATTCTTCCCCGGCGCTCGCTTGAGCAGACTTGGCCGAAATGTCCCTGCCCGCCGGCAAACCACACGTGAATGGCGCGCGGCGGCACAGGTTCGAACAAACCCAACACTcgaccga > 7:215145/1‑149 (MQ=255) aGAAATTCCTGAACTAAGTATTTGTCGGTA‑GC‑‑GATTCTTCCCCGGCGCTCGCTTGAGCAGACTTGGCCGAAATGTCCCTGCCCGCCGGCAAACCACACGTGAATGGCGCGCGGCGGCACAGGTTCGAACAAACACAACAATcgaccga < 2:141041/148‑1 (MQ=255) | GCGCTGGGCGTTGGCAAAGCCCTGGTGGCGCACCACGCTGATGAAGATGCGCAGCAGTTTCAGGTCGGGCAAGGTCGAGGCCATGGTGCAACGGTTCCACAAGGGTATGTGCGCGCAGTCTAACTGCTCTACCCGCCTTTAGTTCAGAAATTCCTGAACTAAGTATTTGTCGGTA‑GC‑‑GATTCTTCCCCGGCGCTCGCTTGAGCAGACTTGGCCGAAATGTCCCTGCCCGCCGGCAAACCACACGTGAATGGCGCGCGGCGGCACAGGTTCGAACAAACACAACAATCGACCGA > NC_002947/5137518‑5137810 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |