| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,182,065 | T→G | 13.2% | intergenic (‑123/+31) | PP_4560 ← / ← csbD | ribonuclease BN/stress response protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,182,065 | 0 | T | G | 13.2% | 199.7 / 21.7 | 84 | intergenic (‑123/+31) | PP_4560/csbD | ribonuclease BN/stress response protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (41/31); new base G (3/8); total (44/40) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.04e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.91e-01 | |||||||||||
GCCGCGCAGGTCGGGGAAAATCATAGCGTCTCCTTTCGCCGCTTGATCGTTACACAGGCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAG‑AAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGACCTGCTGCGCCTCGCCTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTCGGCCCGCAGCTTTTCGTTGTCGGTCACCTTGCCAAC > NC_002947/5181919‑5182209 | gCCGAGGAGGTCGGGGAAAATCATATCTTCTACTTTCTCCGCTTGATCGTTACACAGGCAAGTCTAATCGACCGTTCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGAGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCa < 8:197448/149‑1 (MQ=255) cgcgCAGGTCGGGGAAAATCATAGCGTCTCCTTTCGCCGCTTGATCGTTACACAGGCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCAcc < 6:87343/149‑1 (MQ=255) cgcgCAGGTCGGGGAAAATCATAGCGTCTCCTTTCGCCGCTTGATCGTTACACAGGCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCAcc < 6:84270/149‑1 (MQ=255) cgcgCAGGTCGGGGAAAATCATAGCGTCTCCTTTCGCCGCTTGATCGTTACACAGGCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGATTACGAATAAGTGCCGGCCTCTACGCGGGTTCAcc > 2:247309/1‑149 (MQ=255) gcgcAGGTCGGGGAAAATCATAGCGTCTCCTTTCGCCGCTTGATCGTTACACAGGCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCAccc > 3:193061/1‑149 (MQ=255) gcAGGTCGGGGAAAATCATAGCGTCTCCTTTCGCCGCTTGATCGTTACACAGGCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCga < 3:181777/149‑1 (MQ=255) gcAGGTCGGGGAAAATCATAGCGTCTCCTTTCGCCGCTTGATCGTTACACAGGCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCga < 8:279797/149‑1 (MQ=255) aGGTCGGGGAAAATCATTGCGTCTCGTTTCGCGGCTTGATCGTTACACAGGCAAGTGTAATAGACCGTGCGCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGATTAAGTGCCGGCCTCTTCTCGGGTGAACCCgcg‑a < 2:403758/149‑1 (MQ=255) ggTCGGGGAAAATCATAGCGTCTCCTTTCGCCGCTTGATCGTTACACAGGCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCTCGGGTGAACCCGcg‑aa < 5:137035/149‑1 (MQ=255) tCGGGGAAAATCATAGCGTCTCCTTTCGCCGCTTGATCGTTACACAGGCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGag‑aaga < 1:86753/149‑1 (MQ=255) tCGGGGAAAATCATAGCGTCTCCTTTCGCCGCTTGATCGTTACACAGGCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGag‑aaga < 1:92720/149‑1 (MQ=255) tCGGGGAAAATCATAGCGTCTCCTTTCGCCGCTTGATCGTTACACAGGCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGag‑aaga < 6:185786/149‑1 (MQ=255) tCGGGGAAAATCATAGCGTCGCCTTGCTCCGCTTGATCGTTACACAGGCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTTCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTTCCGGCCTCTTCTCGGGTGAACCCGcg‑aaga < 3:139856/149‑1 (MQ=255) ggggAAAATCATAGCGTCTCCTTTCGCCGCTTGATCGTTACACAGGCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCTCGGGTGAACCCGCG‑Aagag < 8:100296/148‑1 (MQ=255) ggggAAAATCATAGCGTCTCCTTTCGCCGCTTGATCGTTACACAGGCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCTCGGGTGAACCCGCG‑AAGAgg < 7:178000/149‑1 (MQ=255) ggggAAAATCATAGCGTCTCCTTTCGCCGCTTGATCGTTACACAGGCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAG‑AAGAgg > 1:213721/1‑149 (MQ=255) gggAAAATCATAGCGTCTCCTTTCGCCGCTTGATCGTTACACAGTCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCTCGGGTGAACCCGCG‑AAGAGGc < 1:157780/149‑1 (MQ=39) gggAAAATCATAGCGTCTCCTTTCGCCGCTTGATCGTTACACAGGCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCTCGGGTGAACCCGCG‑AAGAGGc < 3:53379/149‑1 (MQ=255) gggAAAATCATAGCGTCTCCTTTCGCCGCTTGATCGTTACACAGGCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAG‑AAGAGGc > 6:423437/1‑149 (MQ=255) aaaTCATAGCGTCTCCTTTCGCCGCTTGATCGTTACACAGGCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAG‑AAGAGGCCgg > 1:237806/1‑148 (MQ=255) tAGCGTCTCCTTTCGCCGCTTGATCGTTACACAGGCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGag‑aaga > 4:239624/1‑136 (MQ=255) tAGCGTCTCCTTTCGCCGCTTGATCGTTACACAGGCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGag‑aaga < 3:239624/136‑1 (MQ=255) tctcCTTTCGCCGCTTGATCGTTACACAGGCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAG‑AAGAGGCCGGCACCGCCtcaag > 5:163575/1‑149 (MQ=255) tcCTTTCGCCGCTTGATCGTTACACAGGCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAG‑AAGAGGCCGGCACCGCCtcaagt > 3:103805/1‑148 (MQ=255) ccTTTCGCCGCTTGATCGTTACACAGGCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAG‑AAGAGGCCGGCACCGCCtcaagtc > 5:8074/1‑148 (MQ=255) cTTTCGCCGCTTGATCGTTACACTGGCATGTCTAATACACCGTGCCCGTGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTTAATAATTTGGTTACGATTACGTGCCGGCCTGTTGGCGGGTTCACCCTAG‑AATTGGCCGGCACCGCCtcaagt < 6:198768/146‑1 (MQ=255) cggcgcTTGATCGTTACACCGGCAAGTCTTATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGGCGTGGTTGAAGATTTTGCTTTCGAATTAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAGTAAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAgg < 1:247309/145‑1 (MQ=255) gccgcTTGATCGTTACACAGGCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAG‑AAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGct > 4:391058/1‑148 (MQ=255) gcTTGATCGTTACACAGGCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAG‑AAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGcttctt > 8:240953/1‑149 (MQ=255) gcTTGATCGTTACACAGGCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAG‑AAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGcttct > 5:334738/1‑148 (MQ=255) cTTGATCGTTACACAGGCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAG‑AAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGcttctt > 5:22744/1‑148 (MQ=255) tCGTTACACAGGCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCTCGGGTGAACCCGCG‑AAGAGGCCg < 3:267852/118‑1 (MQ=38) tCGTTACACAGGCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCTCGGGTGAACCCGCG‑AAGAGGCCg > 4:267852/1‑118 (MQ=38) gTTACACAGGCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAG‑AAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCAt > 1:361294/1‑149 (MQ=255) aGGCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAG‑AAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTca > 5:2716/1‑148 (MQ=255) aGGCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAG‑AAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTca > 7:114626/1‑148 (MQ=255) gCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAG‑AAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTcacag > 6:111813/1‑148 (MQ=255) tAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAG‑AAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGAc > 5:418215/1‑149 (MQ=255) tAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAG‑AAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGAc < 7:240953/149‑1 (MQ=255) gACCGTGCCCGAGGTGTGGTGCTCCCGGCCGTGGTTTAATATTTTGATTACTAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGTTTCACCCGAT‑AAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGAcc < 6:8074/148‑1 (MQ=255) cccGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAG‑AAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGACTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGACCTGCTgcgc > 3:419531/1‑149 (MQ=255) tgctgcTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAG‑AAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGACCTGCTGCGCCTCGCCttt < 5:423437/149‑1 (MQ=255) tcctgctCCCGCCCGGGGTTCAAGAATTTCCTAACCAAAACGTCCCGGCCTCTGCGCGGTTTCACCCGAT‑AAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGACCTGCTGCGCCTCGCCttt < 4:193061/147‑1 (MQ=255) gctgctCCCGGCCTTGGTTTAATAATTTGCTTACCAATAAGTGCGGTCCTCTTGGCGGTTTCACCCGAT‑AATAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGACCTGCTGCGCCTCGCCttt < 5:10910/148‑1 (MQ=255) gctgctCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAG‑AAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGACCTGCTGCGCCTCGCCttt < 6:386763/148‑1 (MQ=255) gctgctCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAG‑AAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGACCTGCTGCGCCTCGCCttt > 5:386763/1‑148 (MQ=255) tgctCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAG‑AAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGACCTGCTGCGCCTCGCCTTTGAg > 3:307285/1‑149 (MQ=255) gctCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATACGTGCCGGCCTCTTCGCGGGGTCCGCCGAG‑AAGAGGCCGGCACCGCGTCAAGTCAAGGCGTCTTCACCGCAGCCGTCACATTTCCCTTGACCTGCTGCGCGTCGCCTTGGAGc > 6:417718/1‑149 (MQ=255) gctCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAG‑AAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGAc > 6:306108/1‑127 (MQ=255) gctCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAG‑AAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGAc < 5:306108/127‑1 (MQ=255) gctCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAG‑AAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGACCTGCTGcgcctcgc > 6:398359/1‑141 (MQ=255) gctCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAG‑AAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGACCTGCTGcgcctcgc < 5:398359/141‑1 (MQ=255) tCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAG‑AAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGACCTGCTGCGCCTCGCCTTTGAGCTc > 2:200696/1‑149 (MQ=255) tCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAG‑AAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGACCTGCTGCGCCTCGCCTTTGAGCTc > 5:347833/1‑149 (MQ=255) tCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAG‑AAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGACCTGCTGCGCCTCGCCGTTGAGCTc > 4:498/1‑149 (MQ=255) ccccgcccgGGGTCCAACAATTTCCTTCCCAATACGCCCCGCCCTCCCCGCGGGGCCACCCGAC‑AACAGGCCGGCACCGCCTCACGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGACCTGCTGCGCCTCGCCTTTGAGCTc < 4:284418/148‑1 (MQ=255) ggCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAG‑AAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGACCTGCTGCGCCTCGCCTTTGAGCTCCTgc < 6:303758/149‑1 (MQ=255) gCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAG‑AAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGACCTGCTGCGCCTCGCCTTTGAGCTCCTgcg > 1:44383/1‑149 (MQ=255) cGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAG‑AAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGACCTGCTGCGCCTCGCCTTTGAGCTCCTGCgcc > 4:46640/1‑149 (MQ=255) gTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAG‑AAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGACCTGCTGCGCCTCGCCTTTGAGCTCCTGCgcct < 4:398240/149‑1 (MQ=255) tGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAG‑AAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGACCTGCTGCGCCTCGCCTTTGAGCTCCTGCgcctt < 6:163575/149‑1 (MQ=255) ttGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAG‑AAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGACCTGCTGCGCCTCGCCTTTGAGCTCCTGCgccttgcc > 3:204785/1‑149 (MQ=255) aagaaTTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAG‑AAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGACCTGCTGcgcct > 5:137892/1‑121 (MQ=255) aagaaTTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAG‑AAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGACCTGCTGcgcct < 6:137892/121‑1 (MQ=255) agaaTTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAG‑AAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGACCTGCTGCGCCTCGCCTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTCg < 4:293651/149‑1 (MQ=255) ttACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAG‑AAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGACCTGCTGCGCCTCGCCTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTCGGCCCGCAGc > 5:95067/1‑149 (MQ=255) tACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAG‑AAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGACCTGCTGCGCCTCGCCTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTCGGCCCGCAGCt > 7:222935/1‑149 (MQ=255) tAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAG‑AAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGACCTGCTGCGCCACGCCTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTCGGCCCGCAGCTTTTCGt < 2:361294/149‑1 (MQ=255) aaGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAG‑AAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGACCTGCTGCGCCTCGCCTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTCGGCCCGCAGCTTTTCGtt < 2:237806/149‑1 (MQ=255) cgTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGTT‑AAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGACCTGCTGCGCCTCGCCTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTCGGCCCGCAGCTTTTCGTTg < 4:103805/148‑1 (MQ=255) gTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAG‑AAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGACCTGCTGCGCCTCGCCTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTCGGCCCGCAGCTTTTCGTTGt > 1:105007/1‑149 (MQ=255) gCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAG‑AAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGACTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGACCTGCTGCGCCTCGCCTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTCGGCCCGCAGCTTTTCGTTGTCg < 4:419531/149‑1 (MQ=255) ccGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAG‑AAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGACCTGCTGCGCCTCGCCTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTCGGCCCGCAGCTTTTCGTTGTCgg > 8:211905/1‑149 (MQ=255) ggCCTCTTCTCGGGTGAACCCGCG‑AAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTTCCTTGACCTGCTGCGCCTCGCCTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTCGGCCCGCAGCTTTTCGTTGTCGGt > 1:229338/1‑148 (MQ=39) ggCCTCTTCTCGGGTGAACCCGCG‑AAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTACCTTGACCTGCTGCGCCTCGCCTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTCGGCCCGCAGCTTTTCGTTGTCGGt > 2:225013/1‑148 (MQ=39) ggCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAG‑AAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGACCTGCTGCGCCTCGCCTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTCGGCCCGCAGCTTTTCGTTGTCGGt > 4:301003/1‑148 (MQ=255) gCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAG‑AAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGACCTGCTGCGCCTCGCCTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTCGGCCCGCAGCTTTTCGTTGTCGGTCa > 2:186102/1‑149 (MQ=255) ccTCTTCGCGGGTTCACCCGAG‑AAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGACCTGCTGCGCCTCGCCTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTCGGCCCGCAGCTTTTCGTTGTCGGTCAc > 8:65234/1‑149 (MQ=255) tctTCGCGGGTTCACCCGAG‑AAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGACCTGCTGCGCCTCGCCTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTCGGCCCGCAGCTTTTCGTTGTCGGTCACCt > 8:181596/1‑149 (MQ=255) tctTCGCGGGTTCACCCGAG‑AAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAACGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGACCTGCTGCGCCTCGCCTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTCGGCCCGCAGCTTTTCGTTGTCGGTCACCt > 2:152918/1‑149 (MQ=255) gcgGGTTCACCCGAG‑AAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGACCTGCTGCGCCTCGCCTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTCGGCCCGCAGCTTTTCGTTGTCGGTCACCTTGcc < 3:46640/148‑1 (MQ=255) gggTTCACCCGAG‑AAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGACCTGCTGCGCCTCGCCTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTCGGCCCGCAGCTTTTCGTTGTCGGTCACCTTGCCAac < 8:222935/149‑1 (MQ=255) gTTCACCCGAG‑AAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGACCTGCTGCGCCTCGCCTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTCGGCCCg > 2:415455/1‑117 (MQ=255) gTTCACCCGAG‑AAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGACCTGCTGCGCCTCGCCTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTCGGCCCg < 1:415455/117‑1 (MQ=255) | GCCGCGCAGGTCGGGGAAAATCATAGCGTCTCCTTTCGCCGCTTGATCGTTACACAGGCAAGTCTAATAGACCGTGCCCGAGCTGTGCTGCTCCCGGCCGTGGTTGAAGAATTTGCTTACGAATAAGTGCCGGCCTCTTCGCGGGTTCACCCGAG‑AAGAGGCCGGCACCGCCTCAAGTCAAGGCTTCTTCACCGCATCCTTCACATTTCCCTTGACCTGCTGCGCCTCGCCTTTGAGCTCCTGCGCCTTGCCTTCGGCCCGCAGCTTTTCGTTGTCGGTCACCTTGCCAAC > NC_002947/5181919‑5182209 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |