| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 83,541 | T→C | 5.7% | L94P (CTG→CCG) | hemF → | coproporphyrinogen‑III oxidase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 83,541 | 0 | T | C | 5.7% | 251.7 / 4.0 | 87 | L94P (CTG→CCG) | hemF | coproporphyrinogen‑III oxidase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (43/39); new base C (2/3); total (45/42) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.69e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.17e-01 | |||||||||||
GCCGCACGCGGGTTATCGGTGAGGGCAACGTGATCGAAAAAGGCGGGGTCAACTTCTCCCATGTGTTTGGTAGCGGCCTGCCGCCGTCGGCCAGTGCCCACCGTCCCGAACTGGCAGGCCGTGGCTTCGAAGCCTTGGGTGTGTCGCTGGTGATACACCCGCACAACCCGCATGTGCCCACTTCCCACGCCAACGTTCGCTTCTTCATCGCCGAAAAGGAAGGTGAAGAGGCCGTATGGTGGTTTGGCGGCGGCTTTGACCTGACGCCATACTATGGCAACGAAGAAGACTGCATT > NC_002947/83394‑83689 | gCCGCACGCGGGTTATCGGTGAGGGCAACGTGATCGAAAAAGGCGGGGTCAACTTCTCCCATGTGTTTGGTAGCGGCCTGCCGCCGTCGGCCAGTGCCCACCGTCCCGAACTGGCAGGCCGTGGCTTCGAAGCCTTGGGTGTGTCGCTg > 2:226641/1‑149 (MQ=255) cGCACGCGGGTTATCGGGGAGGGCAACGTGATCGAAAACCGCGGGGTCAACTTCTCCCATGTGTTTGGTAGCGGCCTGCCGCCGTCGGCCAGTGCCCACCGTCCCGAACTGGCAGGCCGTGGCTTCGAAGCCTTGGGTGTGTCGCTGGt < 8:161051/149‑1 (MQ=255) aTCGGTGAGGGCAACGTGATCGAAAAAGGCGGGGTCAACTTCTCCCATGTGTTTGGTAGCGGCCTGCCGCCGTCGGCCAGTGCCCACCGTCCCGAACTGGCAGGCCGTGGCTTCGAAGCCTTGGGTGTGTCGCTGGTGATACACCCGca > 2:291096/1‑149 (MQ=255) aTCGGTGAGGGCAACGTGATCGAAAAAGGCGGGGTCAACTTCTCCCATGTGTTTGGTAGCGGCCTGCCGCCGTCGGCCAGTGCCCACCGTCCCGAACTGGCAGGCCGTGGCTTCGAAGCCTTGGGTGTATCACCAGCGACACAcccaa < 1:235322/148‑3 (MQ=255) tCGGTGAGGGCAACGTGATCGAAAAAGGCGGGGTCAACTTCTCCCATGTGTTTGGTAGCGGCCTGCCGCCGTCGGCCAGTGCCCACCGTCCCGAACTGGCAGGCCGTGGCTTCGAAGCCTTGGGTGTATCACCAGCGACACAcccaagg < 3:264651/149‑5 (MQ=255) gTGAGGTCTACGTGATCGAAAAAGGCGGGGTCAACTTCTACCATGTGTTTGGTAGCGGCATGCCGCCGTCGGACAGTGCCCACCGTCCCTAACTGGCAGGCCGTGGCTTCGAAGCCTTGGGTGTGTCGCTGGTGATACACCCGCACAAc < 4:362313/149‑1 (MQ=255) gTGAGGGCAACGTGATCGAAAAAGGCGGGGTCAACTTCTCCCATGTGTTTGGTAGCGGCCTGCCGCCGTCGGCCAGTGCCCACCGTCCCGAACTGGCAGGCCGTGGCTTCGAAGCCTTGGGTGTGTCGCTGGTGATACACCCGCACAAc > 5:48769/1‑149 (MQ=255) cAACGTGATCGAAAAAGGCGGGGTCAACTTCTCCCATGTGTTTGGTAGCGGCCTGCCGCCGTCGGCCAGTGCCCACCGTCCCGAACTGGCAGGCCGTGGCTTCGAAGCCTTGGGTGTATCACCAGCGACACAcccaaggc < 8:342131/140‑6 (MQ=255) cAACGTGATCGAAAAAGGCGGGGTCAACTTCTCCCATGTGTTTGGTAGCGGCCTGCCGCCGTCGGCCAGTGCCCACCGTCCCGAACTGGCAGGCCGTGGCTTCGAAGCCTTGGGTGTATCACCAGCGACACAcccaaggc > 7:342131/1‑135 (MQ=255) aaCGTGATCGAAAAAGGCGGGGTCAACTTCTCCCATGTGTTTGGTAGCGGCCTGCCGCCGTCGGCCAGTGCCCACCGTCCCGAACTGGCAGGCCGTGGCTTCGAAGCCTTGGGTGTGTCGCTGGTGATACACCCGCACAACCCGCAtgt < 7:281295/149‑1 (MQ=255) gTGATCGAAAAAGGCGGGGTCAACTTCTCCCATGTGTTTGGTAGCGGCCTGCCGCCGTCGGCCAGTGCCCACCGTCCCGAACTGGCAGGCCGTGGCTTCGAAGCCTTGGGTGTGTCGCTGGTGATACACCCGCACAACCCGCATGTGcc < 6:161555/149‑1 (MQ=255) gTGATCGAAAAAGGCGGGGTCAACTTCTCCCATGTGTTTGGTAGCGGCCTGCCGCCGTCGGCCAGTGCCCACCGTCCCGAACTGGCAGGCCGTGGCTTCGAAGCCTTGGGTGTGTCGCTGGTGATACACCCGCACAACCCGCATGTGcc < 4:243592/149‑1 (MQ=255) gATCGAAAAAGGCGGGGTCAACTTCTCCCATGTGTTTGGTAGCGGCCTGCCGCCGTCGGCCAGTGCCCACCGTCCCGAACTGGCAGGCCGTGGCTTCGAAGCCTTGGGTGTGTCGCTGGTGATACACCCGCACAACCCGCATGTGCCCa > 8:36831/1‑149 (MQ=255) cGAAAAAGGCGGGGTCAACTTCTCCCATGTGTTTGGTAGCGGCCTGCCGCCGTCGGCCAGTGCCCACCGTCCCGAACTGGCAGGCCGTGGCTTCGAAGCCTTGGGTGTGTCGCTGGTGATACACCCGCACAACCCGCATGTGCCCACtt > 1:418778/1‑149 (MQ=255) gAAAAAGGCGGGGGCAACTTCTCCCATGTGTTTGGTAGCGGCCTGCCGCCGTCGGCCAGTGCCCACCGTCCCGAACTGGCAGGCCGTGGCTTCGAAGCCTTGGGTGTGTCGCTGGTGATACACCCGCACAACCCGCATGTGCCCACTTc < 7:336289/149‑1 (MQ=255) aaaaaGGCGGGGTCAACTTCTCCCATGTGTTTGGTAGCGGCCTGCCGCCGTCGGCCAGTGCCCACCGTCCCGAACTGGCAGGCCGTGGCTTCGAAGCCTTGGGTGTGTCGCTGGTGATACACCCGCACAACCCGCATGTGCCCACTTcc < 1:374926/149‑1 (MQ=255) aaaaaGGCGGGGTCAACTTCTCCCATGTGTTTGGTAGCGGCCTGCCGCCGTCGGCCAGTGCCCACCGTCCCGAACTGGCAGGCCGTGGCTTCGAAGCCTTGGGTGTGTCGCTGGTGATACACCCGCACAACCCGCATGTGCCCACTTcc > 2:162031/1‑149 (MQ=255) aaaaaGGCGGGGTCAACTTCTCCCATGTGTTTGGTAGCGGCCTGCCGCCGTCGGCCAGTGCCCACCGTCCCGAACTGGCAGGCCGTGGCTTCGAAGCCTTGGGTGTGTCGCTGGTGATACACCCGCACAACCCGCATGTGCCCACTTcc > 2:203856/1‑149 (MQ=255) aaaaGGCGGGGTCAACTTCTCCCATGTGTTTGGTAGCGGCCTGCCGCCGTCGGCCAGTGCCCACCGTCCCGAACTGGCAGGCCGTGGCTTCGAAGCCTTGGGTGTGTCGCTGGTGATACACCCGCACAACCCGCATGTGCCCACTTccc < 8:44152/149‑1 (MQ=255) aaaaGGCGGGGTCAACTTCTCCCATGTGTTTGGTAGCGGCCTGCCGCCGTCGGCCAGTGCCCACCGTCCCGAACTGGCAGGCCGTGGCTTCGAAGCCTTGGGTGTGTCGCTGGTGATACACCCGCACAACCCGCATGTGCCCACTTcc > 8:27104/1‑148 (MQ=255) ggggTCAACTTCTCCCATGTGTTTGGTAGCGGCCTGCCGCCGTCGGCCAGTGCCCACCGTCCCGAACTGGCAGGCCGTGGCTTCGAAGCCTTGGGTGTGTCGCTGGTGATACACCCGCACAACCCGCATGTGCCCACTTCCCACGCCaa > 5:403278/1‑149 (MQ=255) ggTCAACTTCTCCCATGTGTTTGGTAGCGGCCTGCCGCCGTCGGCCAGTGCCCACCGTCCCGAACTGGCAGGCCGTGGCTTCGAAGCCTTGGGTGTGTCGCTGGTGATACACCCGCACAACCCGCATGTGCCCACTTCCCACGCCAACg > 5:293546/1‑149 (MQ=255) tCAACTTCTCCCATGTGTTTGGTAGCGGCCTGCCGCCGTCGGCCAGTGCCCACCGTCCCGAACTGGCAGGCCGTGGCTTCGAAGCCTTGGGTGTGTCGCTGGTGATACACCCGCACAACCCGCATGTGCCCACTTCCCACGCCAACGtt < 1:162031/149‑1 (MQ=255) tCAACTTCTCCCATGTGTTTGGTAGCGGCCTGCCGCCGTCGGCCAGTGCCCACCGTCCCGAACTGGCAGGCCGTGGCTTCGAAGCCTTGGGTGTGTCGCTGGTGATACACCCGCACAACCCGCATGTGCCCACTTCCCACGCCAACGtt < 8:142160/149‑1 (MQ=255) aaCTTCTCCCATGTGTTTGGTAGCGGCCTGCCGCCGTCGGCCAGTGCCCACCGTCCCGAACTGGCAGGCCGTGGCTTCGAAGCCTTGGGTGTGTCGCTGGTGATACACCCGCACAACCCGCATGTGCCCACTTCCCACGCCAACGTTCg > 1:417622/1‑149 (MQ=255) aCTTCTCCCATGTGTTTGGTAGCGGCCTGCCGCCGTCGGCCAGTGCCCACCGTCCCGAACTGGCAGGCCGTGGCTTCGAAGCCTTGGGTGTGTCGCTGGTGATACACCCGCACAACCCGCATGTGCCCACTTCCCACGCCAACGTTCGc < 5:189819/149‑1 (MQ=255) ttCTCCCATGTGTTTGGTAGCGGCCTGCCGCCGTCGGCCAGTGCCCACCGTCCCGAACTGGCAGGCCGTGGCTTCGAAGCCTTGGGTGTGTCGCTGGTGATACACCCGCACAACCCGCATGTGCCCACTTCCCACGCCAACGTTCGctt > 6:122821/1‑149 (MQ=255) ccATGTGTTTGGTAGCGGCCTGCCGCCGTCGGCCAGTGCCCACCGTCCCGAACTGGCAGGCCGTGGCTTCGAAGCCTTGGGTGTGTCGCTGGTGATACACCCGCACAACCCGCATGTGCCCACTTCCCACGCCAACGTTCGcttctt < 8:327357/147‑1 (MQ=255) ccATGTGTTTGGTAGCGGCCTGCCGCCGTCGGCCAGTGCCCACCGTCCCGAACTGGCAGGCCGTGGCTTCGAAGCCTTGGGTGTGTCGCTGGTGATACACCCGCACAACCCGCATGTGCCCACTTCCCACGCCAACGTTCGCttcttc < 5:122821/148‑1 (MQ=255) aTGTGTTTGGTAGCGGCCTGCCGCCGTCGGCCAGTGCCCACCGTCCCGAACTGGCAGGCCGTGGCTTCGAAGCCTTGGGTGTGTCGCTGGTGATACACCCGCACAACCCGCATGTGCCCACTTCCCACGCCAACGTTCGCTTCTTCATc < 8:93242/149‑1 (MQ=255) aTGTGTTTGGTAGCGGCCTGCCGCCGTCGGCCAGTGCCCACCGTCCCGAACTGGCAGGCCGTGGCTTCGAAGCCTTGGGTGTGTCGCTGGTGATACACCCGCACAACCCGCATGTGCCCACTTCCCACGCCAACGTTCGCTTCTTCATc > 1:14947/1‑149 (MQ=255) tgtTTGGTAGCGGCCTGCCGCCGTCGGCCAGTGCCCACCGTCCCGAACTGGCAGGCCGTGGCTTCGAAGCCTTGGGTGTGTCGCTGGTGATACACCCGCACAACCCGCATGTGCCCACTTCCCACGCCAACGTTCGCTTCTTCATCGcc < 1:85852/149‑1 (MQ=255) tgtTTGGTAGCGGCCTGCCGCCGTCGGCCAGTGCCCACCGTCCCGAACTGGCAGGCCGTGGCTTCGAAGCCTTGGGTGTGTCGCTGGTGATACACCCGCACAACCCGCATGTGCCCACTTCCCACGCCAACGTTCGCTTCTTCATCGcc > 5:421511/1‑149 (MQ=255) gtTTGGTAGCGGCCTGCCGCCGTCGGCCAGTGCCCACCGTCCCGAACTGGCAGGCCGTGGCTTCGAAGCCTTGGGTGTGTCGCTGGTGATACACCCGCACAACCCGCATGTGCCCACTTCCCACGCCAACGTTCGCTTCTTCATCGcc > 8:255763/1‑148 (MQ=255) ggTAGCGGCCTGCCGCCGTCGGCCAGTGCCCACCGTCCCGAACTGGCAGGCCGTGGCTTCGAAGCCTTGGGTGTGTCGCTGGTGATACACCCGCACAACCCGCATGTGCCCACTTCCCACGCCAACGTTCGCTTCTTCATCGCCGaaa < 2:418778/148‑1 (MQ=255) cacggcctgccagttcgggacggtgggcactggccgacggcggcaggccgTGGCTTCGAAGCCTTGGGTGTGTCGCTGGTGATACACCCGCACAACCCGCATGTGCCCACTTCCCACGCCAACGTTCGcttc > 8:259370‑M2/51‑132 (MQ=255) cacggcctgccagttcgggacggtgggcactggccgacggcggcaggccgTGGCTTCGAAGCCTTGGGTGTGTCGCTGGTGATACACCCGCACAACCCGCATGTGCCCACTTCCCACGCCAACGTTCGcttc < 7:259370‑M2/82‑1 (MQ=255) gCGGCCTGCCGCCGTCGGCCAGTGCCCACCGTCCCGAACTGGCAGGCCGTGGCTTCGAAGCCTTGGGTGTGTCGCTGGTGATACACCCGCGCAACCCGCATGTGCCCACTTCCCACGCCAACGTTCGCTTCTTCATCGCCGAAaaggaa < 7:114782/149‑1 (MQ=255) gCGGCCTGCCGCCGTCGGCCAGTGCCCACCGTCCCGAACTGGCAGGCCGTGGCTTCGAAGCCTTGGGTGTGTCGCTGGTGATACACCCGCACAACCCGCATGTGCCCACTTCCCACGCCAACGTTCGCTTCTTCATCGCCGAAaagga < 1:291096/148‑1 (MQ=255) acggcctgccagttcgggacggtgggccctggccgaccgcggcaggccgTGGCGTCCAAGACTTGGGTGTGTCGCTGGTGATACACCCGCACAACCCGCATGTGCCAACTTCCCCAGCGAACGTTCGCTTCTTCAGCGCCGAAaagg > 7:300855‑M2/50‑147 (MQ=255) cggcctgccagttcgggacggtgggcactggccgacggcggcaggccgTGGCTTCGAAGCCTTGGGTGTGTCGCTGGTGATACACCCGCACAACCCGCATGTGCCCACTTCCCACGCCAACGTTCGcttc < 2:394193‑M2/82‑1 (MQ=255) cggcctgccagttcgggacggtgggcactggccgacggcggcaggccgTGGCTTCGAAGCCTTGGGTGTGTCGCTGGTGATACACCCGCACAACCCGCATGTGCCCACTTCCCACGCCAACGTTCGcttc > 1:394193‑M2/49‑130 (MQ=255) cggcctgccagttcgggacggtgggcactggccgacggcggcaggccgTGGCTTCGAAGCCTTGGGTGTGTCGCTGGTGATACACCCGCACAACCCGCATGTGCCCACTTCCCACGCCAACGTTCGcttc > 1:389001‑M2/49‑130 (MQ=255) cggcctgccagttcgggacggtgggcactggccgacggcggcaggccgTGGCTTCGAAGCCTTGGGTGTGTCGCTGGTGATACACCCGCACAACCCGCATGTGCCCACTTCCCACGCCAACGTTCGcttc < 2:389001‑M2/82‑1 (MQ=255) CGGCCTGCCGCCGTCGGCCAGTGCCCACCGTCCCGAACTGGCAGGCCGTGGCTTCGAAGCCTTGGGTGTGTCGCTGGTGATACACCCGCACAACCGGCATGTGCCCACTTCCCACGCCAACGTTCGCTTCTTCATCGCCGAAaaggaag < 6:84391‑M1/149‑1 (MQ=255) CTGCCGCCGTCGGCCAGTGCCCACCGTCCCGAACTGGCAGGCCGTGGCTTCGAAGCCTTGGGTGTGTCGCTGGTGATACACCCCCACAACCCGCATGTGCACACTTCCCACGCCAACGTTCGCTTCTTCAACGCCGAAAAGGAAGGTg < 4:211036‑M1/148‑1 (MQ=255) TGCCGCCGTCGGCCAGTGCCCACCGTCCCGAACTGGCAGGCCGTGGCTTCGAAGCCTTGGGTGTGTCGCTGGTGATACACCCGCACAACCCGCATGTGCCCACTTCCCACGCCAACGTTCGCTTCTTCATCGCCGAAAAGGAAGGTg < 6:385515‑M1/147‑1 (MQ=255) CCGCCGTCGGCCAGTGCCCACCGTCCCGAACTGGCAGGCCGTGGCTTCGAAGCCTTGGGTGTGTCGCTGGTGATACACCCGCACAACCCGCATGTGCCCACTTCCCACGCCAACGTTCGCTTCTTCATCGCCGAAAAGGAAGGTGAag > 1:226641‑M1/1‑148 (MQ=255) CGCCGTCGGCCAGTGCCCACCGTCCCGAACTGGCAGGCCGTGGCTTCGAAGCCTTGGGTGTGTCGCTGGTGATACACCCGCACAACCCGCATGTGCCCACTTCCCACGCCAACGTTCGCTTCTTCATCGCCGAAAAGGAAGGTGAagag < 1:51835‑M1/149‑1 (MQ=255) gccgTCGGCCAGTGCCCACCGTCCCGAACTGGCAGGCCGTGGCTTCGAAGCCTTGGGTGTGTCGCTGGTGATACACCCGCACAACCCGCATGTGCCCACTTCCCACGCCAACGTTCGCTTCTTCATCGCCGAAAAGGAAGGTGAAGAgg > 3:13121/1‑149 (MQ=255) gccgTCGGCCAGTGCCCACCGTCCCGAACTGGCAGGCCGTGGCTTCGAAGCCTTGGGTGTGTCGCTGGTGATACACCCGCACAACCCGCATGTGCCCACTTCCCACGCCAACGTTCGCTTCTTCATCGCCGAAAAGGAAGGTGAAGAgg > 4:161442/1‑149 (MQ=255) gccgTCGGCCAGTGCCCACCGTCCCGAACTGGCAGGCCGTGGCTTCGAAGCCTTGGGTGTGTCGCCGGTGATACACCCGCACAACCCGCATGTGCCCACTTCCCACGCCAACGTTCGCTTCTTCATCGCCGAAAAGGAAGGTGAAGAgg > 2:265424/1‑149 (MQ=255) ccgTCGGCCAGTGCCCACCGTCCCGAACTGGCAGGACGTGGCTTCGAAGCCTTGGGTGTGTCGCTGGTGATACACCCGCACAACCCGCATGTGCCCACTTCCCACGCCAACGTTCGCTTCTTCATCGCCGAAAAGGAAGGTGAAGAGGc > 7:285742/1‑149 (MQ=255) ggCCAGTGCCCACCGTCCCGAACTGGCAGGCCGTGGCTTCGAAGCCTTGGGTGTGTCGCTGGTGATACACCCGCACAACCCGCCTGTGCCCACTTCCCACGCCAACGTTc < 1:232173/110‑1 (MQ=255) ggCCAGTGCCCACCGTCCCGAACTGGCAGGCCGTGGCTTCGAAGCCTTGGGTGTGTCGCTGGTGATACACCCGCACAACCCGCATGTGCCCACTTCCCACGCCAACGTTc > 2:232173/1‑110 (MQ=255) ggCCAGTGCCCACCGTCCCGAACTGGCAGGCCGTGACTTCGAAGCCTTGGGTGTGTCGCTGGTGATACACCCGCACAACCCGCATGTGCCCACTTCCCACGCCAACGTTCGCTTCTTCATCGCCGAAAAGGAAGGTGAAGAGGCCGTAt > 1:64719/1‑149 (MQ=255) tGCCCACCGTCCCGAACTGGCAGGCCGTGGCTTCGAAGCCTTGGGTGTGTCGCTGGTGATACACCCGCACAACCCGCATGTGCCCACTTCCCACGCCAACGTTCGCTTCTTCATCGCCGAAAAGGAAGGTGAAGAGGCCGTATggtggt > 8:399191/1‑149 (MQ=255) gCCCACCGTCCCGAACTGGCAGGCCGTGGCTTCGAAGCCTTGGGTGTGTCGCTGGTGATACACCCGCACAACCCGCATGTGCCCACTTCCCACGCCAACGTTCGCTTCTTCATCGCCGAAAAGGAAGGTGAAGAGGcc > 2:50558/1‑138 (MQ=255) gCCCACCGTCCCGAACTGGCAGGCCGTGGCTTCGAAGCCTTGGGTGTGTCGCTGGTGATACACCCGCACAACCCGCATGTGCCCACTTCCCACGCCAACGTTCGCTTCTTCATCGCCGAAAAGGAAGGTGAAGAGGcc < 1:50558/138‑1 (MQ=255) cccACCGTCCCGAACTGGCAGGCCGTGGCTTCGAAGCCTTGGGTGTGTCGCTGGTGATACACCCGCACAACCCGCATGTGCCCACTTCCCACGCCAACGTTCGCTTCTTCATCGc < 8:72797/115‑1 (MQ=255) cccACCGTCCCGAACTGGCAGGCCGTGGCTTCGAAGCCTTGGGTGTGTCGCTGGTGATACACCCGCACAACCCGCATGTGCCCACTTCCCACGCCAACGTTCGCTTCTTCATCGc > 7:72797/1‑115 (MQ=255) ccGTCCCGAACTGGCAGGCCGTGGCTTCGAAGCCTTGGGTGTGTCGCTGGTGATACACCCGCACAACCCGCATGTGCCCACTTCCCACGCCAACGTTCGCTTCTTCATCGCCGAAAAGGAAGGTGAAGAGGCCGTATGGTGGTTTggcg < 6:403278/149‑1 (MQ=255) cGTCCCGAACTGGCAGGCCGTGGCTTCGAAGCCTTGGGTGTGTCGCTGGTGATACACCCGCACAACCCGCATGTGCCCACTTCCCACGCCAACGTTCGCTTCTTCATCGCCGAAAAGGAAGGTGAAGAGGCCGTATGGTGGTTTggcgg < 2:51835/149‑1 (MQ=255) cccGAACTGGCAGGCCGTGGCTTCGAAGCCTTGGGTGTGTCGCTGGTGATACACCCGCACAACCCGCATGTGCCCACTTCCCACGCCAACGTTCGCTTCTTCATCGCCGAAAAGGAAGGTGAAGAGGCCGTATGGTGGTTTggcggcgg > 1:52059/1‑149 (MQ=255) ccGAACTGGCAGGCCGTGGCTTCGAAGCCTTGGGTGTGTCGCTGGTGATACACCCGCACAACCCGCATGTGCCCACTTCCCACGCCAACGTTCGCTTCTTCATCGCCGAAAAGGAAGGTGAAGAGGCCGTATGGTGGTTTggcggcggc > 2:33320/1‑149 (MQ=255) cGAACTGGCAGGCCGTGGCTTCGAAGCCTTGGGTGTGTCGCTGGTGATACACCCGCACAACCCGCATGTGCCCACTTCCCACGCCAACGTTCGCTTCTTCATCGCCGAAAAGGAAGGTGAAGAGGCCGTATGGTGGTTTGGCGGCGGCt > 7:44854/1‑149 (MQ=255) aCTGGCAGGCCGTGGCTTCGAAGCCTTGGGTGTGTCGCTGGTGATACACCCGCACAACCCGCATGTGCCCACTTCCCACGCCAACGTTCGCTTCTTCATCGCCGAAAAGGAAGGTGAAGAGGCCGTATGGTGGTTTGGCGGCGGCTTTg < 2:14947/149‑1 (MQ=255) cTGGCAGGGCGTGGCTTCGAAGCCTTGGGTGTGTCGCTGGTGATACACCCGCACAACCCGCATGTGCCCACTTCCCACGCCAACGTTCGCTTCTTCATCGCCGAAAAGGAAGGTGAAGAGGCCGTATGGTGGTTTGGCGGCGGCTTTGa < 8:285742/149‑1 (MQ=255) gcaggccgTGGCTTCGAAGCCTTGGGTGTGTCGCTGGTGATACACCCGCACAACCCGCATGTGCCCACTTCCCACGCCAACGTTCGCTTCTTCATCGCCGAAAAGGAAGGTGAAGAGGCCGTATGGTGGTTTGGCGGCGGCTTTGAcc < 2:417622‑M2/140‑1 (MQ=255) aggccgTGGCTTCGAAGCCTTGGGTGTGTCGCTGGTGATACACCCGCACAACCCGCATGTGCCCACTTCCCACGCCAACGTTCGCTTCTTCATCGCCGAAAAGGAAGGTGAAGAGGCCGTATGGTGGTTTGGCGGCGGCTTTGACCTGa < 3:328735‑M2/143‑1 (MQ=255) gccgTGGCTTCGAAGCCTTGGGTGTGTCGCTGGTGATACACCCGCACAACCCGCATGTGCCCACTTCCCACGCCAACGTTCGCTTCTTCATCGCCGAAAAGGAAGGTGAAGAGGCCGTATGGTGGTTTGGCGGCGGCTTTGACCTGACg > 3:393722‑M2/5‑149 (MQ=255) tGGCTTCGAAGCCTTGGGTGTGTCGCTGGTGATACACCCGCACAACCCGCATGTGCCCACTTCCCACGCCAACGTTCGCTTCTTCATCGCCGAAAAGGAAGGTGAAGAGGCCGTATGGTGGTTTGGCGGCGGCTTTGACCTGACGCCAt < 5:385515/149‑1 (MQ=255) ttCGAAGCCTTGGGTGTGTCGCTGGTGATACACCCGCACAACCCGCATGTGCCCACTTCCCACGCCAACGTTCGCTTCTTCATCGCCGAAAAGGAAGGTGAAGAGGCCGTATGGTGGTTTGGCGGCGGCTTTGACCTGACGCCATACTa > 7:406330/1‑149 (MQ=255) ttCGAAGCCTTGGGTGTGTCGCTGGTGATACACCCGCACAACCCGCATGTGCCCACTTCCCACGCCAACGTTCGCTTCTTCATCGCCGAAAAGGAAGGTGAAGAGGCCGTATGGTGGTTTGGCGGCGGCTTTGACCTGACGCCATACTa > 3:133163/1‑149 (MQ=255) cGAAGCCTTGGGTGTGTCGCTGGTGATACACCCGCACAACCCGCATGTGCCCACTTCCCACGCCACCGTTCGCTTCTTCATCGCCGAAAAGGAAGGTGAAGAGGCCGTATGGTGGTTTGGCGGCGGCTTTGACCTGACGCCATACTATg > 6:251071/1‑149 (MQ=255) gAAGCCTTGGGTGTGTCGCTGGTGATACACCCGCACAACCCGCATGTGCCCACTTCCCACGCCAACGTTCGCTTCTTCATCGCCGAAAAGGAAGGTGAAGAGGCCGTATGGTGGTTTGGCGGCGGCTTTGACCTGACGCCATACTATgg > 1:410354/1‑149 (MQ=255) aaGCCTTGGGTGTGTCGCTGGTGATACACCCGCACAACCCGCATGTGCCCACTTCCCACGCCAACGTTCGCTTCTTCATCGCCGAAAAGGAAGGTGAAGAGGCCGTATGGTGGTTTGGCGGCGGCTTTGACCTGACGCCATACTATgg > 3:21965/1‑148 (MQ=255) gCCTTGGGTGTGTCGCTGGTGATACACCCGCACAACCCGCATGTGCCCACTTCCCACGCCAACGTTCGCTTCTTCATCGCCGAAAAGGAAGGTGAAGAGGCCGTATGGTGGTTTGGCGGCGGCTTTGACCTGACGcc < 8:146711/137‑1 (MQ=255) gCCTTGGGTGTGTCGCTGGTGATACACCCGCACAACCCGCATGTGCCCACTTCCCACGCCAACGTTCGCTTCTTCATCGCCGAAAAGGAAGGTGAAGAGGCCGTATGGTGGTTTGGCGGCGGCTTTGACCTGACGcc > 7:146711/1‑137 (MQ=255) gCCTTGGGTGTGTCGCTGGTGATACACCCGCACAACCCGCATGTGCCCACTTCCCACGCCAACGTTCGCTTCTTCATCGCCGAAAAGGAAGGTGAAGAGGCCGTATGGTGGTTTGGCGGCGGCTTTGACCTGACGCCATACTATGGCaa < 7:399191/149‑1 (MQ=255) ggTGTGTCGCTGGTGATACACCCGCACAACCCGCATGTGCCCACTTCCCACGCCAACGTTCGCTTCTTCATCGCCGAAAAGGAAGGTGAAGAGGCCGTATGGTGGTTTGGCGGCGGCTTTGACCTGACGCCATACTATGGCAACgaag > 3:95938/1‑148 (MQ=255) tgtCGCTGGTGCTACACCCGCACAACCCGCATGTGCCCACTTCCCACGCCAACGTTCGCTTCTTCATCGCCGAAAAGGAATGTGAAGAGGCCGTATGGTGGTTTGGCGGCGTCTTTGACCTTACGCCATACTATGGCAACGAagaaga < 6:48769/148‑1 (MQ=255) tCGCTGGTGATACACCCGCACAACCCGCATGTGCCCACTTCCCACGCCAACGTTCGCTTCTTCATCGCCGAAAAGGAAGGTGAAGAGGCCGTATGGTGGTTTGGCGGCGGCTTTGACCTGACGCCATACTATGGCAACGAAGAAGACt < 6:421511/148‑1 (MQ=255) tCGCTGGTGATACACCCGCACAACCCGCATGTGCCCACTTCCCACGCCAACGTTCGCTTCTTCATCGCCGAAAAGGAAGGTGAAGAGGCCGTATGGTGGTTTGGCGGCGGCTTTGACCTGACGCCATACTATGGCAACGAAGAAGACTg > 5:64283/1‑149 (MQ=255) tCGCTGGTGATACACCCGCACAACCCGCATGTGCCCACTTCCCACGCCAACGTTCGCTTCTTCATCGCCGAAAAGGAAGGTGAAGAGGCCGTATGGTGGTTTGGCGGCGGCTTTGACCTGACGCCATACTAGGGAAACGGAGAAGACTg > 4:17157/1‑149 (MQ=255) gCTGGTGATACACCCGCACAACCCGCATGTGCCCACTTCCCACGCCAACGTTCGCTTCTTCATCGCCGAAAAGGAAGGTGAAGAGGCCGTATGGTGGTTTGGCGGCGGCTTTGACCTGACGCCATACTATGGCAACGAAGAAGACTGCa > 7:407042/1‑149 (MQ=255) gCTGGTGATACACCCGCACAACCCGCATGTGCCCACTTCCCACGCCAACGTTCGCTTCTTCATCGCCGAAAAGGAAGGTGAAGAGGCCGTATGGTGGTTTGGCGGCGGCTTTGACCTGACGCCATACTATGGCAACGAAGAAGACTGCa > 2:23558/1‑149 (MQ=255) tGGTGATACACCCGCACAACCCGCATGTGCCCACTTCCCACGCCAACGTTCGCTTCTTCATCGCCGAAAAGGAAGGTGAAGAGGCCGTATGGTGGTTTGGCGGCGGCTTTGACCTGACGCCATACTATGGCAACGAAGAAGACTGCAtt < 2:410354/149‑1 (MQ=255) | GCCGCACGCGGGTTATCGGTGAGGGCAACGTGATCGAAAAAGGCGGGGTCAACTTCTCCCATGTGTTTGGTAGCGGCCTGCCGCCGTCGGCCAGTGCCCACCGTCCCGAACTGGCAGGCCGTGGCTTCGAAGCCTTGGGTGTGTCGCTGGTGATACACCCGCACAACCCGCATGTGCCCACTTCCCACGCCAACGTTCGCTTCTTCATCGCCGAAAAGGAAGGTGAAGAGGCCGTATGGTGGTTTGGCGGCGGCTTTGACCTGACGCCATACTATGGCAACGAAGAAGACTGCATT > NC_002947/83394‑83689 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |