| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,300,132 | A→T | 9.1% | V1214E (GTA→GAA) | recB ← | Chi activated ATP‑dependent DNA helicase/dsDNA/ssDNA exonuclease |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,300,132 | 0 | A | T | 9.1% | 243.6 / 12.3 | 88 | V1214E (GTA→GAA) | recB | Chi activated ATP‑dependent DNA helicase/dsDNA/ssDNA exonuclease |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (38/42); new base T (3/5); total (41/47) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.19e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.32e-01 | |||||||||||
GCTCAACCCAACGGTCGAGTAATTGCAGCAGGTCAGCGCTGTTGTGCTGCGGTGCCAGCGCCAGCAGGTGCTCTGCGTGCAACGGGGTGG‑GCAACAGGTCGACAAGGCTTCGGCTCATGGCGCAACTCCGGCAAACAGGTCC‑TGCTGTACCGGCGCGTGCTCGCCACGGAACAGCGCATCGAGGCTTTCGATCAGCTCACGCGGTGGCTTGGCGTGGTACACGCCGTGGCCGCTGCTGCTGGCACCGCGCAGGAAGATGAACAGGGCGCCGCCAACATGGCGGTCATAATCG > NC_002947/5299984‑5300275 | gCTCAACCCAACGGTCGAGTAATTGCAGCAGGTCAGCACTGTTGTGCTGCGGTGCCAGCGCCAGCAGGTGCTCTGCGTGCAACGGGGTGG‑GCAACAGGTCGACAAGGCTTCGGCTCATGGCGCAACTCCGGCAAACAGGTCC‑TGCTGTa > 1:298292/1‑149 (MQ=255) aaCCCAACGGTCGAGTAATTGCAGCAGGTCAGCGCTGTTGTGCTGCGGTGCCAGCGCCAGCAGGTGCTCTGCGTGCAACGGGGTGGCTCAACAGGTCGACAAGGCTTCGGCTCATGGCGCAACTCCGGCAAACAGGTCC‑TGCTGTAc < 1:343252/147‑1 (MQ=255) cccAACGGTCGAGTAATTGCAGCAGGTCAGCGCTGTTGTGCTGCGGTGCCAGCGCCAGCAGGTGCTCTGCGTGCAACGGGGTGG‑GCAACAGGTCGACAAGGCTTCGGCTCATGGCGCAACTCCGGCAAACAGGTCC‑TGCTGTACCGgcg > 6:13678/1‑149 (MQ=255) ccAACGGTCGAGTAATTGCAGCAGGTCAGCGCTGTTGTGCTGCGGTGCCAGCGCCAGCAGGTGCTCTGCGTGCAACGGGGTGG‑GCAACAGGTCGACAAGGCTTCGGCTCATGGCGCAACTCCGGCAAACAGGTCC‑TGCTGTACCGgcgc > 1:220607/1‑149 (MQ=255) ccAACGGTCGAGTAATTGCAGCAGGTCAGCGCTGTTGTGCTGCGGTGCCAGCGCCAGCAGGTGCTCTGCGTGCAACGGGGTGG‑GCAACAGGTCGACAAGGCTTCGGCTCATGGCGCAACTCCGGCAAACAGGTCC‑TGCTGTACCGgcgc > 2:420154/1‑149 (MQ=255) ccAACGGTCGAGTAATTGCAGCAGGTCAGCGCTGTTGTGCTGCGGTGCCAGCGCCAGCAGGTGCTCTGCGTGCAACGGGGTGG‑GCAACAGGTCGACAAGGCTTCGGCTCATGGCGCAACTCCGGCAAACAGGTCC‑TGCTGTACCGgcgc > 2:323110/1‑149 (MQ=255) ccAACGGTCGAGTAATTGCAGCAGGTCAGCGCTGTTGTGCTGCGGTGCCAGCGCCAGCAGGTGCTCTGCGTGCAACGGGGTGG‑GCAACAGGTCGACAAGGCTTCGGCTAATGGCGCAACTCCGGCAAACAGGTCC‑TGCTGTACCGgcgc < 8:32464/149‑1 (MQ=255) aCGGTCGAGTAATTGCAGCAGGTCAGCGCTGTTGTGCTGCGGTGCCAGCGCCAGCAGGTGCTCTGCGTGCAACGGGGTGG‑GCAACAGGTCGACAAGGCTTCGGCTCATGGCGCAACTCCGGCAAACAGGTCC‑TGCTGTACCGGCGCGTg < 6:144784/149‑1 (MQ=255) gTCGAGTAATTGCAGCAGGTCAGCGCTGTTGTGCTGCGGTGCCAGCGCCAGCAGGTGCTCTGCGTGCAACGGGGTGG‑GCAACAGGTCGACAAGGCTTCGGCTCATGGCGCAACTCCGGCAAACAGGTCC‑TGCTGTACCGGCGCGTGCTc > 7:37410/1‑149 (MQ=255) gTCGAGTAATTGCAGCAGGTCAGCGCTGTTGTGCTGCGGTGCCAGCGCCAGCAGGTGCTCTGCGTGCAACGGGGTGG‑GCAACAGGTCGACAAGGCTTCGGCTCATGGCGCAACTCCGGCAAACAGGTCC‑TGCTGTACCGGCGCGTGCTc > 6:11343/1‑149 (MQ=255) gTCGAGTAATTGCAGCAGGTCAGCGCTGTTGTGCTGCGGTGCCAGCGCCAGCAGGTGCTCTGCGTGCAACGGGGTGG‑GCAACAGGTCGACAAGGCTTCGGCTCATGGCGCAACTCCGGCAAACAGGTCC‑TGCTGTACCGGCGCGTGCTc < 2:199629/149‑1 (MQ=255) gAGTAATTGCAGCAGGTCAGCGCTGTTGTGCTGCGGTGCCAGCGCCAGCAGGTGCTCTGCGTGCAACGGGGTGG‑GCAACAGGTCGACAAGGCTTCGGCTCATGGCGCAACTCCGGCAAACAGGTCC‑TGCTGTACCGGCGCGTGCTCGcc < 3:324836/149‑1 (MQ=255) gAGTAATTGCAGCAGGTCAGCGCTGTTGTGCTGCGGTGCCAGCGCCAGCAGGTGCTCTGCGTGCAACGGGGTGG‑GCAACAGGTCGACAAGGCTTCGGCTCATGGCGCAACTCCGGCAAACAGGTCC‑TGCTGTACCGGCGCGTGCTCGc < 5:13678/148‑1 (MQ=255) gcacttGCAGCAGGTCAGCGCTGTTGTGCTGCGGTGCCAGCGCCAGCAGGTGCTCTGCGTGCAACGGGGTGG‑GCAACAGGGCGACAAGGCTTCGGCTCATGGCGCAACTCCGGCAAACAGGTCC‑TGCTGTACCGGCGCGTGCTCGCCAc < 8:347102/145‑1 (MQ=255) cagcagGTCAGCGCTGTTGTGCTGCGGTGCCAGCGCCAGCAGGTGCTCTGCGTGCAACGGGGTGG‑GCAACAGGTCGACAAGGCTTCGGCTCATGGCGCAACTCCGGCAAACAGGTCC‑TGCTGTTCCGTGGCGAGCACGCGCCGGTACAg < 2:38160/149‑1 (MQ=255) cagcagGTCAGCGCTGTTGTGCTGCGGTGCCAGCGCCAGCAGGTGCTCTGCGTGCAACGGGGTGG‑GCAACAGGTCGACAAGGCTTCGGCTCATGGCGCAACTCCGGCAAACAGGTCC‑TGCTGTACCGGCGCGTGCTCGCCACGGAACAg > 6:96977/1‑149 (MQ=255) gcagGTCAGCGCTGTTGTGCTGCGGTGCCAGCGCCAGCAGGTGCTCTGCGTGCAACGGGGTGG‑GCAACAGGTCGACAAGGCTTCGGCTCATGGCGCAACTCCGGCAAACAGGTCC‑TGCTGTTCCGTGGCGAGCACGCGCCGGTACAgca < 2:29641/149‑2 (MQ=255) cagGTCAGCGCTGTTGTGCTGCGGTGCCAGCGCCAGCAGGTGCTCTGCGTGCAACGGGGTGG‑GCAACAGGTCGACAAGGCTTCGGCTCATGGCGCAACTCCGGCAAACAGGTCC‑TGCTGTACCGGCGCGTGCTCGCCACGGAACAgcg > 4:165563/1‑148 (MQ=255) gcgcTGTTGTGCTGCGGTGCCAGCGCCAGCAGGTGCTCTGCGTGCAACGGGGTGG‑GCAACAGGTCGACAAGGCTTCGGCTCATGGCGCAACTCCGGCAAACAGGTCC‑TGCTGTACCGGCGCGTGCTCGCCACGGAACAGCGCATCGAgg < 8:339832/149‑1 (MQ=255) cgcTGTTGTGCTGCGGTGCCAGCGCCAGCAGGTGCTCTGCGTGCAACGGGGTGG‑GCAACAGGTCGACAAGGCTTCGGCTCATGGCGCAACTCCGGCAAACAGGTCC‑TGCTGTACCGGCGCGTGCTCGCCACGGAACAGCGCATCGAGGc < 7:83353/149‑1 (MQ=255) cTGTTGTGCTGCGGTGCCAGCGCCAGCAGGTGCTCTGCGTGCAACGGGGTGG‑GCAACAGGTCGACAAGGCTTCGGCTCATGGCGCAACTCCGGCAAACAGGTCC‑TGCTGTACCGGCGCGTGCTCGCCACGGAACAGCGCATCGAGGCtt < 2:220607/149‑1 (MQ=255) ttgtGCTGCGGTGCCAGCGCCAGCAGGTGCTCTGCGTGCAACGGGGTGG‑GCAACAGGTCGACAAGGCTTCGGCTCATGGCGCAACTCCGGCAAACAGGTCC‑TGCTGTACCGGCGCGTGCTCGCCACGGAACAGCGCATTGAGGCttt < 1:323110/147‑1 (MQ=255) ttgtGCTGCGGTGCCAGCGCCAGCAGGTGCTCTGCGTGCAACGGGGTGG‑GCAACAGGTCGACAAGGCTTCGGCTCATGGCGCAACTCCGGCAAACAGGTCC‑TGCTGTACCGGCGCGTGCTCGCCACGGAACAGCGCATCGAGGCTTTc < 1:44894/148‑1 (MQ=255) tgctgcGGTGCCAGCGCCAGCAGGTGCTCTGCGTGCAACGGGGTGG‑GCAACAGGTCGACAAGGCTTCGGCTCATGGCGCAACTCCGGCAAACAGGTCC‑TGCTGTACCGGCGCGTGCTCGCCACGGAACAGCGCATCGAGGCTTTCGAt > 7:151719/1‑148 (MQ=255) ctgcGGTGCCAGCGCCAGCAGGTGCTCTGCGTGCAACGGGGTGG‑GCAACAGGTCGACAAGGCTTCGGCTCATGGCGCAACTCCGGCAAACAGGTCC‑TGCTGTACCGGCGCGTGCTCGCCACGGAACAGCGCATCGAGGCTTTCGATCAg < 8:151719/149‑1 (MQ=255) ctgcGGTGCCAGCGCCAGCAGGTGCTCTGCGTGCAACGGGGTGG‑GCAACAGGTCGACAAGGCTTCGGCTCATGGCGCAACTCCGGCAAACAGGTCC‑TGCTGTACCGGCGCGTGCTCGCCACGGAACAGCGCATCGAGGCTTTCGATCAg > 6:265948/1‑149 (MQ=255) ctgcGGTGCCAGCGCCAGCAGGTGCTCTGCGTGCAACGGGGTGG‑GCAACAGGTCGACAAGGCTTCGGCTCATGGCGCAACTCCGGCAAACAGGTCC‑TGCTGTACCGGCGCGTGCTCGCCACGGAACAGCGCATCGAGGCTTTCGATCAg > 7:34108/1‑149 (MQ=255) gcGGTGCCAGCGCCAGCAGGTGCTCTGCGTGCAACGGGGTGG‑GCAACAGGTCGACAAGGCTTCGGCTCATGGCGCAACTCCGGCAAACAGGTCC‑TGCTGTACCGGCGCGTGCTCGCCACGGAACAGCGCATCGAGGCTTTCGATCAGCt > 1:310988/1‑149 (MQ=255) agcagGTGCTCTGCGTGCAACGGGGTGG‑GCAACAGGTCGACAAGGCTTCGGCTCATGGCGCAACTCCGGCAAACAGGTCC‑TGCTGTTCCGTGGCGAGCACGCGCCGGTACAgc > 2:50424/1‑113 (MQ=37) agcagGTGCTCTGCGTGCAACGGGGTGG‑GCAACAGGTCGACAAGGCTTCGGCTCATGGCGCAACTCCGGCAAACAGGTCC‑TGCTGTTCCGTGGCGAGCACGCGCCGGTACAgc < 1:50424/113‑1 (MQ=37) agcagGTGCTCTGCGTGCAACGGGGTGG‑GCAACAGGTCGACAAGGCTTCGGCTCATGGCGCAACTCCGGCAAACAGGTCC‑TGCTGTACCGGCGCGTGCTCGCCACGGAACAGCGCATCGCGGCTTTCGAt > 3:17212/1‑130 (MQ=255) agcagGTGCTCTGCGTGCAACGGGGTGG‑GCAACAGGTCGACAAGGCTTCGGCTCATGGCGCAACTCCGGCAAACAGGTCC‑TGCTGTACCGGCGCGTGCTCGCCACGGAACAGCGCATCGAGGCTTTCGATCAGCTCACGCGGTGGCTTg < 3:165563/149‑1 (MQ=255) gcagGTGCTCTGCGTGCAACGGGGTGG‑GCAACAGGTCGACAAGGCTTCGGCTCATGGCGCAACTCCGGCAAACAGGTCC‑TGCTGTACCGGCGCGTGCTCGCCACGGAACAGCGCATCGAGGCTTTCGATCAGCTCACGCGGTGGCTTgg < 7:26371/149‑1 (MQ=255) ggTGCTCTGCGTGCAACGGGGTGG‑GCAACAGGTCGACAAGGCTTCGGCTCATGGCGCAACTCCGGCAAACAGGTCC‑TGCTGTACCGgcgc > 3:114244/1‑90 (MQ=255) ggTGCTCTGCGTGCAACGGGGTGG‑GCAACAGGTCGACAAGGCTTCGGCTCATGGCGCAACTCCGGCAAACAGGTCC‑TGCTGTACCGgcgc < 4:114244/90‑1 (MQ=255) gTGCTCTGCGTGCAACGGGGTGG‑GCAACAGGTCGACAAGGCTTCGGCTCATGGCGCAACTCCGGCAAACAGGTCC‑TGCTGTACCGGCGCGTGCTCGCCACGGAACAGCGCATCGAGGCTTTCGATCAGCTCACGCGGTGGCTTGGCGTg > 1:182773/1‑149 (MQ=255) gTGCTCTGCGTGCAACGGGGTGG‑GCAACAGGTCGACAAGGCTTCGGCTCATGGCGCAACTCCGGCAAACAGGTCC‑TGCTGTACCGGCGCGTGCTCGCCACGGAACAGCGCATCGAGGCTTTCGATCAGCTCACGCGGTGGCTTGGCGTg < 5:96977/149‑1 (MQ=255) gCTCTGCGTGCAACGGGGTGG‑GCAACAGGTCGACAAGGCTTCGGCTCATGGCGCAACTCCGGCAAACAGGTCC‑TGCTGTACCGGCGCGTGCTCGCCACGGAACAGCGCATCGAGGCTTTCGATCAGCTCACGCGGTGGCTTGGCGTGGt < 3:5116/149‑1 (MQ=255) tGCGTGCAACGGGGTGG‑GCAACAGGTCGACAAGGCTTCGGCTCATGGCGCAACTCCGGCAAACAGGTCC‑TGCTGTACCGGCGCGTGCTCGCCACGGAACAGCGCATCGAGGCTTTCGATCAGCTCACGCGGTGGCTTGGCGTGGTacac > 2:121746/1‑149 (MQ=255) gCGTGCAACGGGGTGG‑GCAACAGGTCGACAAGGCTTCGGCTCATGGCGCAACTCCGGCAAACAGGTCC‑TGCTGTACCGGCGCGt > 3:73904/1‑84 (MQ=255) gCGTGCAACGGGGTGG‑GCAACAGGTCGACAAGGCTTCGGCTCATGGCGCAACTCCGGCAAACAGGTCC‑TGCTGTACCGGCGCGt < 4:73904/84‑1 (MQ=255) gCAACGGGGTGG‑GCAACAGGTCGACAAGGCTTCGGCTCATGGCGCAACTCCGGCAAACAGGTCC‑TGCTGTACCGGCGCGTGCTCGCCACGGAACAGCGCATCGAGGCTTTCGATCAGCTCACGCGGTGGCTTGGCGTGTACCACGccaa < 8:388556/149‑3 (MQ=255) cAACGGGGTGG‑GCAACAGGTCGACAAGGCTTCGGCTCATGGCGCAACTCCGGCAAACAGGTCC‑TGCTGTACCGGCGCGTGCTCGCCACGGAACAGCGCATCGAGGCTTTCGATCAGCTCACGCGGTGGCTTGGCGTGTACCACGccaa < 3:277366/148‑3 (MQ=255) aCGGGGTGG‑GCAACAGGTCGACAAGGCTTCGGCTCATGGCGCAACTCCGGCAAACAGGTCC‑TGCTGTACCGGCGCGTGCTCGCCACGGAACAGCGCATCGAGGCTTTCGATCAGCTCACGCGGTGGCTTGGCGTGGTACACGCCGTGGc < 7:296884/149‑1 (MQ=255) aCGGGGTGG‑GCAACAGGTCGACAAGGCTTCGGCTCATGGCGCAACTCCGGCAAACAGGTCC‑TGCTGTACCGGCGCGTGCTCGCCACGGAACAGCGCATCGAGGCTTTCGATCAGCTCACGCGGTGGCTTGGCGTGGTACACGCCGTGGc > 3:345674/1‑149 (MQ=255) ggTGG‑GCAACAGGTCGACAAGGCTTCGGCTCATGGCGCAACTCCGGCAAACAGGTCC‑TGCTGTACCGGCGCGTGCTCGCCACGGAACAGCGCATCGAGGCTTTCGATCAGCTCACGCGGTGGCTTg > 6:88427/1‑126 (MQ=255) ggTGG‑GCAACAGGTCGACAAGGCTTCGGCTCATGGCGCAACTCCGGCAAACAGGTCC‑TGCTGTACCGGCGCGTGCTCGCCACGGAACAGCGCATCGAGGCTTTCGATCAGCTCACGCGGTGGCTTg < 5:88427/126‑1 (MQ=255) gg‑gCAACAGGTCGACAAGGCTTCGGCTCATGGCGCAACTCCGGCAAACAGGTCC‑TGCTGTACCGGCGCGTGCTCGCCACGGAACAGCGCATCGAGGCTTTCGATCAGCTCACGCGGTGGCTTGGCGTGGTACACGCCGTGGCCgctgct > 5:122503/1‑149 (MQ=255) g‑gCAACAGGTCGACAAGGCTTCGGCTCATGGCGCAACTCCGGCAAACAGGTCC‑TGCTGTACCGGCGCGTGCTCGCCACGGAACAGCGCATCGAGGCTTTCGATCAGCTCACGCGGTGGCTTGGCGTGGTACACGCCGTGGCCgctgctg < 5:265948/149‑1 (MQ=255) gCAACAGGTCGACAAGGCTTCGGCTCATGGCGCAACTCCGGCAAACAGGTCC‑TGCTGTACCGGCGCGTGCTCGCCACGGAACAGCGCATCGAGGCTTTCGATCAGCTCACGCGGTGGCTTGGCGTGGTACACGCCGTGGCCgctgctgc > 6:346635/1‑149 (MQ=255) cAACAGGGCGACAAGGCTTCGGCTCATGGCGCAACTCCGGCAAACAGGTCC‑TGCTGGACCGGCGCGTGCTCGCCACGGAACAGCGCATCGAGGCTTTCGATCAGCTCACGCGGTGGCTTGGCGTGGTACACGCCGTGGCCgctgctgct < 5:68150/149‑1 (MQ=255) aaCAGGTCGACAAGGCTTCGGCTCATGGCGCAACTCCGGCAAACAGGTCC‑TGCTGTACCGGCGCGTGCTCGCCACGGAACAGCGCATCGAGGCTTTCGATCAGCTCACGCGGTGGCTTGGCGTGGTACACGCCGTGGCCGctgctgctg < 6:122503/149‑1 (MQ=255) aGGTCGACAAGGCTTCGGCTCATGGCGCAACTCCGGCAAACAGGTCCGTGCTGTACCGGCGCGTGCTCGCCACGGAACAGCGCATCGAGGCTTTCGATCAGCTCACGCGGTGGCTTGGCGTGGTACACGCCGTGGCCGCTGCTGCTgg > 1:96888/1‑148 (MQ=255) ggTCGACAAGGCTTCGGCTCATGGCGCAACTCCGGCAAACAGGTCC‑TGCTGTACCGGCGCGTGCTCGCCACGGAACAGCGCATCGAGGCTTTCGATCAGCTCACGCGGTGGCTTGGCGTGGTACACGCCGTGGCCGCTGCTGCTGGCAc < 8:37410/149‑1 (MQ=255) gACAAGGCTTCGGCTCATGGCGCAACTCCGGCAAACAGGTCC‑TGCTGTACCGGCGCGTGCTCGCCACGGAACAGCGCATCGAGGCTTTCGATCAGCTCACGCGGTGGCTTGGCGTGGTACACGCCGTGGCCGCTGCTGCTGGCACcgcg < 1:121746/149‑1 (MQ=255) aaGGCTTCGGCTCATGGCGCAACTCCGGCAAACAGGTCC‑TGCTGTACCGGCGCGTGCTCGCCACGGAACAGCGCATCGAGGCTTTCGATCAGCTCACGCGGTGGCTTGGCGTGGTACACGCCGTGGCCGCTGCTGCTGGCACCGCGCAg > 4:197810/1‑149 (MQ=255) gCTTCGGCTCATGGCGCAACTCCGGCAAACAGGTCC‑TGCTGTACCGGCGCGTGCTCGCCACGGAACAGCGCATCGAGGCTTTCGATCAGCTCACGCGGTGGCTTGGCGTGGTACACGCCGTGGCCGCTGCTGCTGGCACCGCGCAGGaa > 8:384558/1‑149 (MQ=255) ttCGGCTCATGGCGCAACTCCGGCAAACAGGTCC‑TGCTGTACCGGCGCGTGCTCGCCACGGAACAGCGCATCGAGGCTTTCGATCAGCTCACGCGGTGGCTTGGCGTGGTACACGCCGTGGCCGCTGCTGCTGGCACCGCGCAgg > 1:226302/1‑145 (MQ=255) cGGCTCATGGCGCAACTCCGGCAAACAGGTCC‑TGCTGTACCGGCGCGTGCTCGCCACGGAACAGCGCATCGAGGCTTTCGATCAGCTCACGCGGTGGCTTGGCGTGGTACACGCCGTGGCCGCTGCTGCTGGCACCGCGCAGGAAGa < 2:298292/147‑1 (MQ=255) cGGCTCATGGCGCAACTCCGGCAAACAGGTCC‑TGCTGTACCGGCGCGTGCTCGCCACGGAACAGCGCATCGAGGCTTTCGATCAGCTCACGCGGTGGCTTGGCGTGGTACACGCCGTGGCCGCTGCTGCTGGCACCGCGCAGGAAGAt < 1:420154/148‑1 (MQ=255) gCTCATGGCGCAACTCCGGCAAACAGGTCC‑TGCTGTACCGGCGCGTGCTCGCCACGGAACAGCGCATCGAGGCTTTCGATCAGCTCACGCGGTGGCTTGGCGTGGTACACGCCGTGGCCGCTGCTGCTGGCACCGCGCAGGAAg < 6:225175/144‑1 (MQ=255) gCTCATGGCGCAACTCCGGCAAACAGGTCC‑TGCTGTACCGGCGCGTGCTCGCCACGGAACAGCGCATCGAGGCTTTCGATCAGCTCACGCGGTGGCTTGGCGTGGTACACGCCGTGGCCGCTGCTGCTGGCACCGCGCAGGAAg > 5:225175/1‑144 (MQ=255) gCTCATGGCGCAACTCCGGCAAACAGGTCC‑TGCTGTACCGGCGCGTGCTCGCCACGGAACAGCGCATCGAGGCTTTCGATCAGCTCACGCGGTGGCTTGGCGTGGTACACGCCGTGGCCGCTGCTGCTGGCACCGCGCAGGAAGATGaa < 6:188080/149‑1 (MQ=255) tCATGGCGCAACTCCGGCAAACAGGTCC‑TGCTGTACCGGCGCGTGCTCGCCACGGAACAGCGCATCGAGGCTTTCGATCAGCTCACGCGGTGGCTTGGCGTGGTACACGCCGTGGCCGCTGCTGCTGGCACCGCGCAgg > 2:41718/1‑139 (MQ=255) tCATGGCGCAACTCCGGCAAACAGGTCC‑TGCTGTACCGGCGCGTGCTCGCCACGGAACAGCGCATCGAGGCTTTCGATCAGCTCACGCGGTGGCTTGGCGTGGTACACGCCGTGGCCGCTGCTGCTGGCACCGCGCAGGAAGATGaa > 3:80323/1‑147 (MQ=255) tCATGGCGCAACTCCGGCAAACAGGTCC‑TGCTGTACCGGCGCGTGCTCGCCACGGAACAGCGCATCGAGGCTTTCGATCAGCTCACGCGGTGGCTTGGCGTGGTACACCCCGTGGCCGCTGCTGCTGGCACCGCGCAgg < 1:41718/139‑1 (MQ=255) aCTCCGGCAAACAGGTCC‑TGCTGTACCGGCGCGTGCTCGCCACGGAACAGCGCATCGAGGCTTTCGATCAGCTCACGCGGTGGCTTGGCGTGGTACACGCCGTGGCCGCTGCTGCTGGCACCGCGCAGGAAGATGAACAGGGCgccgcc < 5:11343/149‑1 (MQ=255) tCCGGCAAACAGGTCC‑TGCTGTACCGGCGCGTGCTCGCCACGGAACAGCGCATCGAGGCTTTCGATCAGCTCACGCGGTGGCTTGGCGTGGTACACGCCGTGGCCGCTGCTGCTGGCACCGCGCAGGAAGACGAACAGGGTGCCGCCaa > 5:53516/1‑149 (MQ=255) tCCGGCAAACAGGTCC‑TGCTGTACCGGCGCGTGCTCGCCACGGAACAGCGCATCGAGGCTTTCGATCAGCTCACGCGGTGGCTTGGCGTGGTACACGCCGTGGCCGCTGCTGCTGGCACCGCGCAGGAAGACGAACAGGGCGCCGCCaa > 3:423641/1‑149 (MQ=255) gCAAACAGGTCC‑TGCTGTACCGGCGCGTGCTCGCCACGGAACAGCGCATCGAGGCTTTCGATCAGCTCACGCGGTGGCTTGGCGTGGTACACGCCGTGGCCGCTGCTGCTGGCACCGCGCAGGAAGATGAACAGGGCGCCGCCAACATg > 2:375248/1‑149 (MQ=255) cAAACAGGTCC‑TGCTGTACCGGCGCGTGCTCGCCACGGAACAGCGCATCGAGGCTTTCGATCAGCTCACGCGGTGGCTTGGCGTGGTACACGCCGTGGCCGCTGCTGCTGGCACCGCGCAGGAAGATGAACAGGGCGCCGCCAACATgg > 8:193263/1‑149 (MQ=255) cAAACAGGTCC‑TGCTGTACCGGCGCGTGCTCGCCACGGAACAGCGCATCGAGGCTTTCGATCAGCTCACGCGGTGGCTTGGCGTGGTACACGCCGTGGCCGCTGCTGCTGGCACCGCGCAGGAAGATGAACAGGGCGCCGCCAACATga < 8:240291/149‑2 (MQ=255) aaaCAGGTCC‑TGCTGTACCGGCGCGTGCTCGCCACGGAACAGCGCATCGAGGCTTTCGATCAGCTCACGCGGTGGCTTGGCGTGGTACACGCCGTGGCCGCTGCTGCTGGCACCGCGCAGGAAGATGAACAGGGCGCCGCCAACATgg < 7:179533/148‑1 (MQ=255) aaaCAGGTCC‑TGCTGTACCGGCGCGTGCTCGCCACGGAACAGCGCATCGAGGCTTTCGATCAGCTCACGCGGTGGCTTGGCGTGGTACACGCCGTGGCCGCTGCTGCTGGCACCGCGCAGGAAGATGAACAGGGCGCCGCCAACATgg > 8:179533/1‑148 (MQ=255) aaCAGGTCC‑TGCTGTACCGGCGCGTGCTCGCCACGGAACAGCGCATCGAGGCTTTCGATCAGCTCACGCGGTGGCTTGGCGTGGTACACGCCGTGGCCGCTGCTGCTGGCACCGCGCAGGAAGATGAACAGGGCGCCGCCAACATGGCg < 8:133268/149‑1 (MQ=255) cc‑TGCTGTACCGGCGCGTGCTCGCCACGGAACAGCGCATCGAGGCTTTCGATCAGCTCACGCGGTGGCTTGGCGTGGTACACGCCGTGGCCGCTGCTGCTGGCACCGCGCAGGAAGATGAACAGGGCGCCGCCAACATGGCg < 5:119090/142‑1 (MQ=255) cc‑TGCTGTACCGGCGCGTGCTCGCCACGGAACAGCGCATCGAGGCTTTCGATCAGCTCACGCGGTGGCTTGGCGTGGTACACGCCGTGGCCGCTGCTGCTGGCACCGCGCAGGAAGATGAACAGGGCGCCGCCAACATGGCg > 6:119090/1‑142 (MQ=255) c‑tgctgTACCGGCGCGTGCTCGCCACGGAACAGCGCATCGAGGCTTTCGATCAGCTCACGCGGTGGCTTGGCGTGGTACACGCCGTGGCCGCTGCTGCTGGCACCGCGCAGGAAGATGAACAGGGCGCCGCCAACATGGCGGTCATAAt > 3:223664/1‑149 (MQ=255) gcgctgTTCCGTGGCGAGCACGCGCCGGTACAGCGCATCGAGGCTTTCGATCAGCTCACGCGGTGGCTTGGCGTGGTACACGCCGTGGCCGCTGCTGCTGGCACCGCGCAGGAAGATGAACAGGGCGCCGCCAACATGGCg < 7:291676/139‑1 (MQ=38) gcgctgTTCCGTGGCGAGCACGCGCCGGTACAGCGCATCGAGGCTTTCGATCAGCTCACGCGGTGGCTTGGCGTGGTACACGCCGTGGCCGCTGCTGCTGGCACCGCGCAGGAAGATGAACAGGGCGCCGCCAACATGGCg > 8:291676/3‑141 (MQ=38) tgctgTACCGGCGCGTGCTCGCCACGGAACAGCGCATCGAGGCTTTCGATCAGCTCACGCGGTGGCTTGGCGTGGTACACGCCGTGGCCGCTGCTGCTGGCACCGCGCAGGAAGATGAACAGGGCGCCGCCAACATGGCGGTCATaa > 6:313370/1‑147 (MQ=255) tgctgTACCGGCGCGTGCTCGCCACGGAACAGCGCATCGAGGCTTTCGATCAGCTCACGCGGTGGCTTGGCGTGGTACACGCCGTGGCCGCTGCTGCTGGCACCGCGCAGGAAGATGAACAGGGCGCCGCCAACATGGCGGTCATaa < 5:313370/147‑1 (MQ=255) gctgTTCCGTGGCGAGCACGCGCCGGTACAGCGCATCGAGGCTTTCGATCAGCTCACGCGGTGGCTTGGCGTGGTACACGCCGTGGCCGCTGCTGCTGGCACCGCGCAGGAAGATGAACAGGGCgccgcc < 3:95679/130‑1 (MQ=38) gctgTTCCGTGGCGAGCACGCGCCGGTACAGCGCATCGAGGCTTTCGATCAGCTCACGCGGTGGCTTGGCGTGGTACACGCCGTGGCCGCTGCTGCTGGCACCGCGCAGGAAGATGAACAGGGCgccgcc > 4:95679/1‑130 (MQ=38) gctgTACCGGCGCGTGCTCGCCACGGAACAGCGCATCGAGGCTTTCGATCAGCTCACGCGGTGGCTTGGCGTGGTACACGCCGTGGCCGCTGCTGCTGGCACCGCGCAGGAAGATGAACAg < 5:390470/121‑1 (MQ=255) gctgTACCGGCGCGTGCTCGCCACGGAACAGCGCATCGAGGCTTTCGATCAGCTCACGCGGTGGCTTGGCGTGGTACACGCCGTGGCCGCTGCTGCTGGCACCGCGCAGGAAGATGAACAg > 6:390470/1‑121 (MQ=255) gctgTACCGGCGCGTGCTCGCCACGGAACAGCGCATCGAGGCTTTCGATCAGCTCACGCGGTGGCTTGGCGTGGTACACGCCGTGGCCGCTGCTGCTGGCACCGCGCAGGAAGATGAACAGGGCGCCGCCAACATGGCGGTCATAATCg > 3:333484/1‑149 (MQ=255) ctgTACCGGCGCGTGCTCGCCACGGAACAGCGCATCGAGGCTTTCGATCAGCTCACGCGGTGGCTTGGCGTGGTACACGCCGTGGCCGCTGCTGCTGGCACCGCGCAGGAAGATGAACAGGGCGCCGCCAACATGGCGGTCATAATCg < 2:182773/148‑1 (MQ=255) ctgTACCGGCGCGTGCTCGCCACGGAACAGCGCATCGAGGCTTTCGATCAGCTCACGCGGTGGCTTGGCGTGGTACACGCCGTGGCCGCTGCTGCTGGCACCGCGCAGGAAGATGAACAGGGCGCCGCCAACATGGCGGTCATAATCg < 8:34108/148‑1 (MQ=255) | GCTCAACCCAACGGTCGAGTAATTGCAGCAGGTCAGCGCTGTTGTGCTGCGGTGCCAGCGCCAGCAGGTGCTCTGCGTGCAACGGGGTGG‑GCAACAGGTCGACAAGGCTTCGGCTCATGGCGCAACTCCGGCAAACAGGTCC‑TGCTGTACCGGCGCGTGCTCGCCACGGAACAGCGCATCGAGGCTTTCGATCAGCTCACGCGGTGGCTTGGCGTGGTACACGCCGTGGCCGCTGCTGCTGGCACCGCGCAGGAAGATGAACAGGGCGCCGCCAACATGGCGGTCATAATCG > NC_002947/5299984‑5300275 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |