Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 432,365 | G→T | 6.9% | intergenic (‑52/‑41) | PP_0354 ← / → PP_0355 | CBS domain‑containing protein/two‑component system response regulator |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 432,365 | 0 | G | T | 6.9% | 209.0 / 4.2 | 70 | intergenic (‑52/‑41) | PP_0354/PP_0355 | CBS domain‑containing protein/two‑component system response regulator |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (33/32); new base T (3/2); total (36/34) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.69e-01 |
GAACGGCGGAAAGCGCTGCAGGAACTGCAATGTGCCCTGGATGTTTTGCAGTACCGCTGTCTTGCCCGCCTGGCTGTAGGCGTCCTTTTTGCTCATGAAACTGACCGTATCGCTATGCCG‑‑AACTATATATATCTATATATAGGTACCGGCCATGTTGTTCTCTGCCTCCATGGTCGGCTTGCGGCGGGGTGGTGCCCATTGGACGTAAGTCTATGAGCGCCCTTGTCAAAGACCCGACGAAAGGCGAAACGGGTTACGCGAGTAATGCGGTCCTAATGCTGAAGCGGAATTTTTTT > NC_002947/432218‑432513 | gAACGGCGGAAAGCGCTGCAGGAACTGCAATGTGCCCTGGATGTTTTGCAGTACCGCTGTCTTGCCCGCCTGGCTGTAGGCGTCCTTTTTGCTCATGAAACTGACCGTATCGCTATGCCG‑‑AACTATATATATCTATATATAGGTACCg < 7:220302/148‑1 (MQ=255) gAACGGCGGAAAGCGCTGCAGGAACTGCAATGTGCCCTGGATGTTTTGCAGTACCGCTGTCTTGCCCGCCTGGCTGTAGGCGTCCTTTTTGCTCATGAAACTGACCGTATCGCTATGCCG‑‑AACTATATATATCTATATATAGGTACCg < 5:188960/148‑1 (MQ=255) aaCGGCGGAAAGCGCTGCAGGAACTGCAATGTGCCCTGGATGTTTTGCAGTACCGCTGTCTTGCCCGCCTGGCTGTAGGCGTCCTTTTTGCTCATGAAACTGACCGTATCGCTATGCCG‑‑AACTATATATATCTATATATAGGTACCGGc > 3:160646/1‑149 (MQ=255) cggcggAAAGCGCTGCAGGAACTGCAATGTGCCCTGGATGTTTTGCAGTACCGCTGTCTTGCCCGCCTGGCTGTAGGCGTCCTTTTTGCTCATGAAACTGACCGTATCGCTATGCCG‑‑AACTATATATATCTATATATAGGTACCGGCCa < 5:353445/149‑1 (MQ=255) gcggAAAGCGCTGCAGGAACTGCAATGTGCCCTGGATGTTTTGCAGTACCGCTGTCTTGCCCGCCTGGCTGTAGGCGTCCTTTTTGCTCATGAAACTGACCGTATCGCTATGCCG‑‑AACTATATATATCTATATATAGGTACCGGCCAtg < 5:421805/149‑1 (MQ=255) gcggAAAGCGCTGCAGGAACTGCAATGTGCCCTGGATGTTTTGCAGTACCGCTGTCTTGCCCGCCTGGCTGTAGGCGTCCTTTTTGCTCATGAAACTGACCGTATCGCTATGCCG‑‑AACTATATATATCTATATATAGGTACCGGCCAtg < 4:244468/149‑1 (MQ=255) cggATAGCGCTGCAGGAACTGCAATGTGCCCTTGATGTTTTGCAGTTCCGCTGTCTTGCCCGCCTGGCTGTAGGCGTCCTTTTTGCTCATGAAACTGACCGTATCGCTATGCCG‑‑AACTATATATATCTATATATAGGTACCGGCCAt < 2:150008/147‑1 (MQ=255) cggAAAGCGCTGCAGGAACTGCAATGTGCCCTGGATGTTTTGCAGTACCGCTGTCTTGCCCGCCTGGCTGTAGGCGTCCTTTTTGCTCATGAAACTGACCGTATCGCTATGCCG‑‑AACTATATATATCTATATATAGGTACCGGCCAtgt < 6:302739/149‑1 (MQ=255) ggAAAGCGCTGCAGGAACTGCAATGTGCCCTGGATGTTTTGCAGTACCGCTGTCTTGCCCGCCTGGCTGTAGGCGTCCTTTTTGCTCATGAAACTGACCGTATCGCTATGCCG‑‑AACTATATATATCTATATATAGGTACCGGCCAtgtt < 5:160282/149‑1 (MQ=255) gAAAGCGCTGCAGGAACTGCAATGTGCCCTGGATGTTTTGCAGTACCGCTGTCTTGCCCGCCTGGCTGTAGGCGTCCTTTTTGCTCATGAAACTGACCGTATCGCTATGCCG‑‑AACTATATATATCTATATATAGGTACCGGCCAtgttg < 8:257623/149‑1 (MQ=255) gAAAGCGCTGCAGGAACTGCAATGTGCCCTGGATGTTTTGCAGTACCGCTGTCTTGCCCGCCTGGCTGTAGGCGTCCTTTTTGCTCATGAAACTGACCGTATCGCTATGCCG‑‑AACTATATATATCTATATATAGGTACCGGCCAtgttg > 8:253337/1‑149 (MQ=255) cTGCAGGAACTGCAATGTGCCCTGGATGTTTTGCAGTACCGCTGTCTTGCCCGCCTGGCTGTAGGCGTCCTTTTTGCTCATGAAACTGACCGTATCGCTATGCCG‑‑AACTATATATATCTATATATAGGTACCGGCCATGTTGTTCTCTg < 7:47114/149‑1 (MQ=255) cAGGAACTGCAATGTGCCCTGGATGTTTTGCAGTACCGCTGTCTTGCCCGCCTGGCTGTAGGCGTCCTTTTTGCTCATGAAACTGACCGTATCGCTATGCCG‑‑AACTATATATATCTATATATAGGTACCGGCCATGTTGTTCTCTGCCt > 8:76190/1‑149 (MQ=255) gAACTGCAATGTGCCCTGGATGTTTTGCAGTACCGCTGTCTTGCCCGCCTGGCTGTAGGCGTCCTTTTTGCTCATGAAACTGACCGTATCGCTATGCCG‑‑AACTATATATATCTATATATAGGTACCTGCCATGTTGTTCTCTGCCTCCa > 5:362629/1‑149 (MQ=255) gAACTGCAATGTGCCCTGGATGTTTTGCAGTACCGCTGTCTTGCCCGCCTGGCTGTAGGCGTCCTTTTTGCTCATGAAACTGACCGTATCGCTATGCCG‑‑AACTATATATATCTATATATAGGTACCTGCCATGTTGTTCTCTGCCTCCa > 3:69195/1‑149 (MQ=255) aaCTGCAATGTGCCCTGGATGTTTTGCAGTACCGCTGTCTTGCCCGCCTGGCTGTAGGCGTCCTTTTTGCTCATGAAACTGACCGTATCGCTATGCCG‑‑AACTATATATATCTATATATAGGTACCGGCCATGTTGTTCTCTGCCTCCAt < 4:1279/149‑1 (MQ=255) gCAATGTGCCCTGGATGTTTTGCAGTACCGCTGTCTTGCCCGCCTGGCTGTAGGCGTCCTTTTTGCTCATGAAACTGACCGTATCGCTATGCCG‑‑AACTATATATATCTATATATAGGTACCGGCCATGTTGTTCTCTGCCTCCATGGTc > 5:37229/1‑149 (MQ=255) cAATGTGCCCTGGATGTTTTGCAGTACCGCTGTCTTGCCCGCCTGGCTGTAGGCGTCCTTTTTGCTCATGAAACTGACCGTATCGCTATGCCG‑‑AACTATATATATCTATATATAGGTACCTGCCATGTTGTTCTCTGCCTCCATGGTCg < 6:362629/149‑1 (MQ=255) cAATGTGCCCTGGATGTTTTGCAGTACCGCTGTCTTGCCCGCCTGGCTGTAGGCGTCCTTTTTGCTCATGAAACTGACCGTATCGCTATGCCG‑‑AACTATATATATCTATATATAGGTACCTGCCATGTTGTTCTCTGCCTCCATGGTCg < 4:69195/149‑1 (MQ=255) cAATGTGCCCTGGATGTTTTGCAGTACCGCTGTCTTGCCCGCCTGGCTGTAGGCGTCCTTTTTGCTCATGAAACTGACCGTATCGCTATGCCG‑‑AACTATATATATCTATATATAGGTACCGGCCATGTTGTTCTCTGCCTCCATGGTc < 6:43293/148‑1 (MQ=255) cAATGTGCCCTGGATGTTTTGCAGTACCGCTGTCTTGCCCGCCTGGCTGTAGGCGTCCTTTTTGCTCATGAAACTGACCGTATCGCTATGCCG‑‑AACTATATATATCTATATATAGGTACCGGCCATGTTGTTCTCTGCCTCCATGGTCg > 7:90626/1‑149 (MQ=255) aTGTGCCCTGGATGTTTTGCAGTACCGCTGTCTTGCCCGCCTGGCTGTAGGCGTCCTTTTTGCTCATGAAACTGACCGTATCGCTATGCCG‑‑AACTATATATATCTATATATAGGTACCGGCCATGTTGTTCTCTGCCTCCATGGTCGGc > 4:340755/1‑149 (MQ=255) tgCCCTGGATGTTTTGCAGTACCGCTGTCTTGCCCGCCTGGCTGTAGGCGTCCTTTTTGCTCATGAAACTGACCGTATCGCTATGCCG‑‑AACTATATATATCTATATATAGGTACCGGCCATGTTGTTCTCTGCCTCCATGGTCGGCTTg < 4:160646/149‑1 (MQ=255) tgCCCTGGATGTTTTGCAGTACCGCTGTCTTGCCCGCCTGGCTGTAGGCGTCCTTTTTGCTCATGAAACTGACCGTATCGCTATGCCG‑‑AACTATATATATCTATATATAGGTACCGGCCATGTTGTTCTCTGCCTCCATGGTCGGCTTg > 8:81234/1‑149 (MQ=255) tGGATGTTTTGCAGTACCGCTGTCTTGCCCGCCTGGCTGTAGGCGTCCTTTTTGCTCATGAAACTGACCGTATCGCTATGCCG‑‑AACTATATATATCTATATATAGGTACCGGCCATGTTGTTCTCTGCCTCCATGGTCGGCTTgcggcg > 5:95832/1‑149 (MQ=255) ggATCTTTTGCAGTACCGCTGTCTTGCCCGCCTGGCTGTAGGCGTCCTTTTTGCTCATGAAACTGACCGTATCGCTATGCCG‑‑AACTATATATATCAATATATAGGTACCGGCCATGATGTTCTCTGCCTGCATGTTCGGCTTGcggcgg > 5:263624/1‑149 (MQ=255) gATGTTTTGCAGTACCGCTGTCTTGCCCGCCTGGCTGTAGGCGTCCTTTTTGCTCATGAAACTGACCGTATCGCTATGCCG‑‑AACTATATATATCTATATATAGGTACCGGCCATGTTGTTCTCTGCCTCCATGGTCGGCTTGCGGCggg < 3:340755/149‑1 (MQ=255) aTGTTTTGCAGTACCGCTGTCTTGCCCGCCTGGCTGTAGGCGTCCTTTTTGCTCATGAAACTGACCGTATCGCTATGCCG‑‑AACTATATATATCTATATATAGGTACCGGCCATGTTGTTCTCTGCCTCCATGGTCGGCTTGCGGCgggg > 7:268350/1‑149 (MQ=255) ttttGCAGTACCGCTGTCTTGCCCGCCTGGCTGTAGGCGTCCTTTTTGCTCATGAAACTGACCGTATCGCTATGCCG‑‑AACTATATATATCTATATATAGGTACCGGCCATGTTGTTCTCTGCCTCCATGGTCGGCTTGCGGCGGggtg < 6:95832/148‑1 (MQ=255) ttGCAGTACCGCTGTCTTGCCCGCCTGGCTGTAGGCGTCCTTTTTGCTCATGAAACTGACCGTATCGCTATGCCG‑‑AACTATATATATCTATATATAGGTACCGGCCATGTTGTTCTCTGCCTCCATGGTCGGCTTGCGGCGGggtggt < 4:109987/148‑1 (MQ=255) gCAGTACCGCTGTCTTGCCCTCCTGGCTGTAGGCGTCCTTTTTGCTCATGAAACTGACCGTATCGCTATGCCG‑‑AACTATATATATCTATATATAGGTACCGGCCATGTTGTTCTCTGCCTCCATGGTCGGCTTGCGGCGGGGTGGTGc < 7:76190/148‑1 (MQ=255) cAGTACCGCTGTCTTGCCCGCCTGGCTGTAGGCGTCCTTTTTGCTCATGAAACTGACCGTATCGCTATGCCG‑‑AACTATATATATCTATATATAGGTACCGGCCATGTTGTTCTCTGCCTCCATGGTCGGCTTGCGGCGGGGTGGTGcc > 7:326974/1‑148 (MQ=255) aGTACCGCTGTCTTGCCCGCCTGGCTGTAGGCGTCCTTTTTGCTCATGAAACTGACCGTATCGCTATGCCG‑‑AACTATATATATCTATATATAGGTACCTGCCATGTTGTTCTCTGCCTCCATGGTCGGCTTGCGGCGGGGTGGTGCCCa > 8:312929/1‑149 (MQ=255) cGCTGTCTTGCCCGCCTGGCTGTAGGCGTCCTTTTTGCTCATGAAACTGACCGTATCGCTATGCCG‑‑AACTATATATATCTATATATAGGTACCGGCCATGTTGTTCTCTGCCTCCATGGTCGGCTTGCGGCGGGGTGGTGCCCATTGGa > 4:190556/1‑149 (MQ=255) cGCTGTCTTGCCCGCCTGGCTGTAGGCGTCCTTTTTGCTCATGAAACTGACCGTATCGCTATGCCG‑‑AACTATATATATCTATATATAGGTACCGGCCATGTTGTTCTCTGCCTCCATGGTCGGCTTGCGGCGGGGTGGTGCCCATTGGa < 1:435346/149‑1 (MQ=255) cGCTGTCTTGCCCGCCTGGCTGTAGGCGTCCTTTTTGATCATGAAACTGACCGTATCGCTATGCCG‑‑AACTATATATATCTATATATAGGTACCGGCCATGTTGTTCTCTGCCTCCATGGTCGGCTTGCGGCGGGGTGGTGCCCATTGGa > 1:175546/1‑149 (MQ=255) cTGTCTTGCCCGCCTGGCTGTAGGCGTCCTTTTTGCTCATGAAACTGACCGTATCGCTATGCCG‑‑AACTATATATATCTATATATAGGTACCGGCCATGTTGTTCTCTGCCTCCATGGTCGGCTTGCGGCGGGGTGGTGCCCATTGGACg > 5:323395/1‑149 (MQ=255) tCTTGCCCGCCTGGCTGTAGGCGTCCTTTTTGCTCATGAAACTGACCGTATCGCTATGCCG‑‑AACTATATATATCTATATATAGGTACCGGCCATGTTGTTCTCTGCCTCCATGGTCGGCTTGCGGCGGGGTGGTGCCCATTGGACGTaa < 2:278706/149‑1 (MQ=255) ttGCCCGCCTGGCTGTAGGCGTCCTTTTTGCTCATGAAACTGACCGTATCGCTATGCCG‑‑AACTATATATATCTATATATAGGTACCGGCCATGTTGTTCTCTGCCTCCATGGTCGGCTTGCGGCGGGGTGGTGCCCATTGGACGTAAGt > 3:405247/1‑149 (MQ=255) ccGCCTGGCTGTAGGCGTCCTTTTTGCTCATGAAACTGACCGTATCGCTATGCCG‑‑AACTATATATATCTATATATAGGTACCGGCCATGTTGTTCTCTGCCTCCATGGTCGGCTTGCGGCGGGGTGGTGCCCATTGGACGTAAGTCTAt > 2:31316/1‑149 (MQ=255) cGCCTGGCTGTAGGCGTCCTTTTTGCTCATGAAACTGACCGTATCGCTATGCCG‑‑AACTATATATATCTATATATAGGTACCGGCCATGTTGTTCTCTGCCTCCATGGTCGGCTTGCGGCGGGGTGGTGCCCATTGGACGTAAGTCTATg < 7:81234/149‑1 (MQ=255) cTGGCTGTAGGCGTCCTTTTTGCTCATGAAACTGACCGTATCGCTATGCCG‑‑AACTATATATATCTATATATAGGTACCGGCCATGTTGTTCTCTGCCTCCATGGTCGGCTTGCGGCGGGGTGGTGCCCATTGGACGTAAGTCTATGAgc > 3:161360/1‑149 (MQ=255) cTGTAGGCTTCCTTTTTGCTCATGAATCTGACCGTATCGCTATGCAG‑‑AACTATATATATCTATATATAGGTACCGGCCATGTTGTTCTCTGCCTCCATGGTCGGCTTGCGGCGGGGTGGTGCCCATTGGACGTAAGTCTATGAGCGccc < 8:106325/149‑1 (MQ=255) tGTAGGCGTCCTTTTTGCTCATGAAACTGACCGTATCGCTATGCCG‑‑AACTATATATATCTATATATAGGTACCGGCCATGTTGTTCTCTGCCTCCATGGTCGGCTTGCGGAGGGGTGGTGCACATTGGACGTAAGTCTATGAGCGCCCt > 3:276781/1‑149 (MQ=255) tGTAGGCGTCCTTTTTGCTCATGAAACTGACCGTATCGCTATGCCG‑‑AACTATATATATCTATATATAGGTACCGGCCATGTTGTTCTCTGCCTCAATGGTCGGCTTGCCGCGGGGTGGTGCCCATTGGACGTAAGTCTATGAGCGCCCt > 5:360466/1‑149 (MQ=255) cGTCCTTTTTGCTCATGAAACTGACCGTATCGCTATGCCG‑‑AACTATATATATCTATATATAGGTACCGGCCATGTTGTTCTCTGCCTCCATGGTCGGCTTGCGGCGGGGTGGTGCCCATTGGACGTAAGTCTATGAGCGCCCTTGTCa > 1:244146/1‑148 (MQ=255) gTCCTTTTTGCTCATGAAACTGACCGTATCGCTATGCCG‑‑AACTATATATATCTATATATAGGTACCGGCCATGTTGTTCTCTGCCTCCATGGTCGGCTTGCGGCGGGGTGGTGCCCATTGGACGTAAGTCTATGAGCGCCCTTGTCaaa < 4:405247/149‑1 (MQ=255) gTCCTTTTTGCTCATGAAACTGACCGTATCGCTATGCCG‑‑AACTATATATATCTATATATAGGTACCGGCCATGTTGTTCTCTGCCTCCATGGTCGGCTTGCGGCGGGGTGGTGCCCATTGGACGTAAGTCTATGAGCGCCCTTGTCaaa < 8:326974/149‑1 (MQ=255) tCCTTTTTGCTCATGAAACTGACCGTATCGCTATGCCGGTACCTATATATATCTATATATAGGTACCGGCCATGTTGTTCTCTGCCTCCATGGTCGGCTTGCGGCGGGGTGGTGCCCATTGGACGTAAGTCTATGAGCGCCCTTGTCa > 8:293255/1‑148 (MQ=255) tCCTTTTTGCTCATGAAACTGACCGTATCGCTATGCCG‑‑AACTATATATATCTATATATAGGTACCGGCCATGTTGTTCTCTGCCTCCATGGTCGGCTTGCGGCGGGGTGGTGCCCATTGGACGTAAGTCTATGAGCGCCCTTGTCa > 7:288467/1‑146 (MQ=255) cTTTTTGCTCATGAAACTGACCGTATCGCTATGCCG‑‑AACTATATATATCTATATATAGGTACCGGCCATGTTGTTCTCTGCCTCCATGGTCGGCTTGCGGCGGGGTGGTGCCCATTGGACGTAAGTCTATGAGCGCCCTTGTCAAAGa < 5:135103/148‑1 (MQ=255) cTTTTTGCTCATGAAACTGACCGTATCGCTATGCCG‑‑AACTATATATATCTATATATAGGTACCGGCCATGTTGTTCTCTGCCTCCATGGTCGGCTTGCGGCGGGGTGGTGCCCATTGGACGTAAGTCTATGAGCGCCCTTGTCAAAGAc > 2:379805/1‑149 (MQ=255) tCATGAAACTGACCGTATCGCTATGCCG‑‑AACTATATATATCTATATATAGGTACCGGCCATGTTGTTCTCTGCCTCCATGGTCGGCTTGCGGCGGGGTGGTGCCCATTGGACGTAAGTCTATGAGCGCCCTTGTCaaa < 4:383322/138‑1 (MQ=255) tCATGAAACTGACCGTATCGCTATGCCG‑‑AACTATATATATCTATATATAGGTACCGGCCATGTTGTTCTCTGCCTCCATGGTCGGCTTGCGGCGGGGTGGTGCCCATTGGACGTAAGTCTATGAGCGCCCTTGTCaaa > 3:383322/1‑138 (MQ=255) aTGAAACTGACCGTATCGCTATGCCG‑‑AACTATATATATCTATATATAGGTACCGGCCATGTTGTTCTCTGCCTCCATGGTCGGCTTGCGGCGGGGTGGTGCCCATTGGACGTAAGTCTATGAGCGCCCTTGTCAAAGACCCGACGAAAg > 5:19930/1‑149 (MQ=255) tGACCGTATCGCTATGCCG‑‑AACTATATATATCTATATATAGGTACCGGCCATGTTGTTCTCTGCCTCCATGGTCGGCTTGCGGCGGGGTGGTGCCCATTGGACGTAAGTCTATGAGCGCCCTTGTCAAAGACCCGACGAAAGGCGAAAc > 2:378647/1‑149 (MQ=255) aCCGTATCGCTATGCCG‑‑AACTATATATATCTATATATAGGTACCGGCCATGTTGTTCTCTGCCTCCATGGTCGGCTTGCGGCGGGGTGGTGCCCATTGGACGTAAGTCTATGAGCGCCCTTGTCAAAGACCCGACGAAAGGCGAAACgg < 6:323395/149‑1 (MQ=255) ccGTATCGCTATGCCG‑‑AACTATATATATCTATATATAGGTACCGGCCATGTTGTTCTCTGCCTCCATGGTCGGCTTGCGGCGGGGTGGTGCCCATTGGACGTAAGTCTATGAGCGCCCTTGTCAAAGACCCGACGAAAGGCGAAACggg < 2:244146/149‑1 (MQ=255) cGTATCGCTATGCCG‑‑AACTATATATATCTATATATAGGTACCGGCCATGTTGTTCTCTGCCTCCATGGTCGGCTTGCGGCGGGGTGGTGCCCATTGGACGTAAGTCTATGAGCGCCCTTGTCAAAg > 4:381792/1‑126 (MQ=255) cGTATCGCTATGCCG‑‑AACTATATATATCTATATATAGGTACCGGCCATGTTGTTCTCTGCCTCCATGGTCGGCTTGCGGCGGGGTGGTGCCCATTGGACGTAAGTCTATGAGCGCCCTTGTCAAAg < 3:381792/126‑1 (MQ=255) cG‑‑AACTATATATATCTATATATAGGTACCGGCCATGTTGTTCTCTGCCTCCATGGTCGGCTTGCGGCGGGGTGGTGCCCATTGGACGTAAGTCTATGAGCGCCCTTGTCAAAGACCCGACGAAAGGCGAAACGGGTTACGCGAGTAATg > 4:335715/1‑149 (MQ=255) aaCTATATATATCTATATATAGGTACCGGCCATGTTGTTCTCTGCCTCCATGGTCGGCTTGCGGCGGGGTGGTGCCCATTGGACGTAAGTCTATGAGCGCCCTTGTCAAAGACCCGACGAAAGGCGAAACGGGTTACGCGAGTAATGCg < 3:335715/149‑1 (MQ=255) ctaattatatCTATATATTGGTTCGGGCCATGTAGTTCTCTCCCTCCATGGTCTGCTTGCGGCGGGGTGGTGCGCTTTGGACGTAAGTCTTTGAGCGCCCTTGTCTAAGACGCGACGAAACGCGAAACGGGTTACGCGAGTATTGCGGt < 6:263624/144‑1 (MQ=255) tatatataTCTATATATAGGTACCGGCCATGTTGTTCTCTGCCTCCATGGTCGGCTTGCGGCGGGGTGGTGCCCATTGGACGTAAGTCTATGAGCGCCCTTGTCAAAGACCCGACGAAAGGCGAAACGGGTTACGCGAGTAATGCGGTc < 7:253337/149‑1 (MQ=255) tatatatCTATATATAGGTACCGGCCATGTTGTTCTCTGCCTCCATGGTCGGCTTGCGGCGGGGTGGTGCCCATTGGACGTAAGTCTATGAGCGCCCTTGTCAAAGACCCGACGAAAGGCGAAACGGGTTACGCGAGTAATGCGGTcc > 8:120625/1‑148 (MQ=255) tatCTATATATAGGTACCGGCCATGTTGTTCTCTGCCTCCATGGTCGGCTTGCGGCGGGGTGGTGCCCATTGGACGTAAGTCTATGAGCGCCCTTGTCAAAGACCCGACGAAAGGCGAAACGGGTTACGCGAGTAATGCGGTCCTAAt < 1:379805/148‑1 (MQ=255) tatCTATATATAGGTACCGGCCATGTTGTTCTCTGCCTCCATGGTCGGCTTGCGGCGGGGTGGTGCCCATTGGACGTAAGTCTATGAGCGCCCTTGTCAAAGACCCGACGAAAGGCGAAACGGGTTACGCGAGTAATGCGGTCCTAATg < 5:9308/149‑1 (MQ=255) atCTATATATAGGTACCGGCCATGTTGTTCTCTGCCTCCATGGTCGGCTTGCGGCGGGGTGGTGCCCATTGGACGTAAGTCTATGAGCGCCCTTGTCAAAGACCCGACGAAAGGCGAAACGGGTTACGCGAGTAATGCGGTCCTAATGc > 6:168211/1‑149 (MQ=255) atatataGGTACCGGCCATGTTGTTCTCTGCCTCCATGGTCGGCTTGCGGCGGGGTGGTGCCCATTGGACGTAAGTCTATGAGCGCCCTTGTCAAAGACCCGACGAAAGGCGAAACGGGTTACGCGAGTAATGCGGTCCTAATGCTg > 5:412908/1‑147 (MQ=255) tataGGTACCGGCCATGTTGTTCTCTGCCTCCATGGTCGGCTTGCGGCGGGGTGGTGCCCATTGGACGTAAGTCTATGAGCGCCCTTGTCAAAGACCCGACGAAAGGCGAAACGGGTTACGCGAGTAATGCGGTCCTAATGCTGAAGCg < 7:293255/149‑1 (MQ=255) taGGTACCGGCCATGTTGTTCTCTGCCTCCATGGTCGGCTTGCGGCGGGGTGGTGCCCATTGGACGTAAGTCTATGAGCGCCCTTGTCAAAGACCCGACGAAAGGCGAAACGGGTTACGCGAGTAATGCGGTCCTAATGCTGAAGCgg > 2:352352/1‑148 (MQ=255) ccGGCCATGTTGTTCTCTGCCTCCATGGTCGGCTTGCGGCGGGGTGGTGCCCATTGGACGTAAGTCTATGAGCGCCCTTGTCAAAGACCCGACGAAAGGCGAAACGGGTTACGCGAGTAATGCGGTCCTAATGCTGAAGCGGAAttttt > 5:151740/1‑149 (MQ=255) ggCCATGTTGTTCTCTGCCTCCATGGTCGGCTTGCGGCGGGGTGGTGCCCATTGGACGTAAGTCTATGAGCGCCCTTGTCAAAGACCCGACGAAAGGCGAAACGGGTTACGCGAGTAATGCGGTCCTAATGCTGAAGCGGAAttttttt < 4:161360/149‑1 (MQ=255) ggCCATGTTGTTCTCTGCCTCCATGGTCGGCTTGCGGCGGGGTGGTGCCCATTGGACGTAAGTCTATGAGCGCCCTTGTCAAAGACCCGACGAAAGGCGAAACGGGTTACGCGAGTAATGCGGTCCTAATGCTGAAGCGGAAttttttt < 1:352352/149‑1 (MQ=255) | GAACGGCGGAAAGCGCTGCAGGAACTGCAATGTGCCCTGGATGTTTTGCAGTACCGCTGTCTTGCCCGCCTGGCTGTAGGCGTCCTTTTTGCTCATGAAACTGACCGTATCGCTATGCCG‑‑AACTATATATATCTATATATAGGTACCGGCCATGTTGTTCTCTGCCTCCATGGTCGGCTTGCGGCGGGGTGGTGCCCATTGGACGTAAGTCTATGAGCGCCCTTGTCAAAGACCCGACGAAAGGCGAAACGGGTTACGCGAGTAATGCGGTCCTAATGCTGAAGCGGAATTTTTTT > NC_002947/432218‑432513 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |