Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 5,301,890 | T→C | 5.7% | D628G (GAC→GGC) | recB ← | Chi activated ATP‑dependent DNA helicase/dsDNA/ssDNA exonuclease |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 5,301,890 | 0 | T | C | 5.7% | 254.2 / 4.2 | 88 | D628G (GAC→GGC) | recB | Chi activated ATP‑dependent DNA helicase/dsDNA/ssDNA exonuclease |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (38/44); new base C (3/2); total (41/47) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.63e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.60e-01 |
CCCCTGGCGCTGCCAGGTGTCGCGGTACAGGCGAAAACGCATCACCCAGCTCTCCCAGACCCGCTCGTCCTGGTTAAGCCGGTCCAGCGCAGCCAGCGACAGGCCCAGTGTAAGGCTTGCCAGAGCAGCCTTGAGCAGGCGCTCCGAGTCAGGCTCGGCGCAGGCCTTGAGCCAGGCCAGCAGGTCGTGGGCTTCCTGGGCGGCAAACACCGAGTCCT‑TGTCGGACAGGTAGACGCTGCGCACCTCGCGTGCGGCCAGTTCGGCGCGGACCATCTGCGCCTCATGGCCATCGCGCAC > NC_002947/5301742‑5302038 | ccccTGGCGCTGCCAGGTGTCGCGGTACAGGCGAAAACGCATCACCCAGCTCTCCCAGACCCGCTCGTCCTGGTTAAGCCGGTCCAGCGCAGCCAGCGACAGGCCCAGTGTAAGGCTTGCCAGAGCAGCCTTGAGCAGGCGCTCCGAGt > 8:237808/1‑149 (MQ=255) cccTGGCGCTGCCAGGTGTCGCGGTACAGGCGAAAACGCATCACCCAGCTCTCCCAGACCCGCTCGTCCTGGTTAAGCCGGTCCAGCGCAGCCAGCGACAGGCCCAGTGTAAGGCTTGCCAGAGCAGCCTTGAGCAGGCGCTCCGAGTc < 3:241880/149‑1 (MQ=255) cccTGGCGCTGCCAGGTGTCGCGGTACAGGCGAAAACGCATCACCCAGCTCTCCCAGACCCGCTCGTCCTGGTTAAGCCGGTCCAGCGCAGCCAGCGACAGGCCCAGTGTAAGGCTTGCCAGAGCAGCCTTGAGCAGGCGCTCCGAGTc < 1:8034/149‑1 (MQ=255) gtcAGGTGTCGCGGTACAGGCGAAAACGCATCACCCAGCTCTCCCAGACCCGCTCGTCCTGGTTAAGCCGGTCCAGCGCAGCCAGCGACAGGCCCAGTGTAAGGCTTGCCAGAGCAGCCTTGAGCAGGCGCTCCGAGTCAGGCTCGgcg > 6:275674/3‑149 (MQ=255) ccAGGTGTCGCGGTACAGGCGAAAACGCATCACCCAGCTCTCCCAGACCCGCTCGTCCTGGTTAAGCCGGTCCAGCGCAGCCAGCGACAGGCCCAGTGTAAGGCTTGCCAGAGCAGCCTTGAGCAGGCGCTCCGAGTCAGGCTCGgcg > 5:137245/1‑148 (MQ=255) aGGTGTCGCGGTACAGGCGAAAACGCATCACCCAGCTCTCCCAGACCCGCTCGTCCTGGTTAAGCCGGTCCAGCGCAGCCAGCGACAGGCCCAGTGTAAGGCTTGCCAGAGCAGCCTTGAGCAGGCGCTCCGAGTCAGGCTCGGCGCAg < 6:27443/149‑1 (MQ=255) aGGTGTCGCGGTACAGGCGAAAACGCATCACCCAGCTCTCCCAGACCCGCTCGTCCTGGTTAAGCCGGTCCAGCGCAGCCAGCGACAGGCCCAGTGTAAGGCTTGCCAGAGCAGCCTTGAGCAGGCGCTCCGAGCCTGACTCGgagcgc < 6:100577/149‑3 (MQ=255) aGGTGTCGCGGTACAGGCGAAAACGCATCACCCAGCTCTCCCAGACCCGCTCGTCCTGGTTAAGCCGGTCCAGCGCAGCCAGCGACAGGCCCAGTGTAAGGCTTGCCAGAGCAGCCTTGAGCAGGCGCGCCGAGCCTGACTCGgagcgc < 7:248008/149‑3 (MQ=255) gtgtCGCGGTACAGGCGAAAACGCATCACCCAGCTCTCCCAGACCCGCTCGTCCTGGTTAAGCCGGTCCAGCGCAGCCAGCGACAGGCCCAGTGTAAGGCTTGCCAGAGCAGCCTTGAGCAGGCGCTCCGAGTCAGGCTCGGCGCAGGc < 5:275674/149‑1 (MQ=255) tCGCGGTACAGGCGAAAACGCATCACCCAGCTCTCCCAGACCCGCTCGTCCTGGTTAAGCCGGTCCAGCGCAGCCAGCGACAGGCCCAGTGTAAGGCTTGCCAGAGCAGCCTTGAGCAGGCGCTCCGAGTCAGGCTCGGCGCAGGCCt < 2:136405/148‑1 (MQ=255) gcgGTACAGGCGAAAACGCATCACCCAGGTCTCCCAGACCCGCTCGTCCTGGTTAAGCCGGTCCAGCGCAGCCAGCGACAGGCCCAGTGTAAGGCTTGCCAGAGCAGCCTTGAGCAGGCGCTCCGAGTCAGGCTCGGCGCAGGCCtt > 1:243599/1‑147 (MQ=255) gcgGTACAGGCGAAAACGCATCACCCAGCTCTCCCAGACCCGCTCGTCCTGGTTAAGCCGGTCCAGCGCAGCCAGCGACAGGCCCAGTGTAAGGCTTGCCAGAGCAGCCTTGAGCAGGCGCTCCGAGTCAGGCTCGGCGCAGGCCTTGa < 3:363439/149‑1 (MQ=255) gcgGTACAGGCGAAAACGCATCACCCAGCTCTCCCAGACCAGCTCGTCCTGGTTAAGCCGGTCCAGCGCAGCCAGCGACAGGCCCAGTGTAAGGCTTGCCAGAGCAGCCTTGAGCAGGCGCTCCGAGTCAGGCTCGGCGCAGGCCTTGa < 5:124256/149‑1 (MQ=255) cgGTACAGGCGAAAACGCATCACCCAGCTCTCCCAGACCCGCTCGTCCTGGTTAAGCCGGTCCAGCGCAGCCAGCGACAGGCCCAGTGTAAGGCTTGCCAGAGCAGCCTTGAGCAGGCGCTCCGAGTCAGGCTCGGCGCAGGCCTTGAg < 1:227184/149‑1 (MQ=255) cgGTACAGGCGAAAACGCATCACCCAGCTCTCCCAGACCCGCTCGTCCTGGTTAAGCCGGTCCAGCGCAGCCAGCGACAGGCCCAGTGTAAGGCTTGCCAGAGCAGCCTTGAGCAGGCGCTCCGAGTCAGGCTCGGCGCAGGCCTTGAg < 3:131951/149‑1 (MQ=255) cAGGCGAAAACGCATCACCCAGCTCTCCCAGACCCGCTCGTCCTGGTTAAGCCGGTCCAGCGCAGCCAGCGACAGGCCCAGTGTAAGGCTTGCCAGAGCAGCCTTGAGCAGGCGCTCCGAGTCAGGCTCGGCGCAGGCCTTGAgccag < 1:237491/148‑1 (MQ=255) aGGCGAAAACGCATCACCCAGCTCTCCCAGACCCGCTCGTCCTGGTTAAGCCGGTCCAGCGCAGCCAGCGACAGGCCCAGTGTAAGGCTTGCCAGAGCCGCCTTGAGCAGGCGCTCCGAGTCCGGCTCGGCGCCGGCCTGGAgccaggc > 6:389859/1‑149 (MQ=255) aGGCGAAAACGCATCACCCAGCTCTCCCAGACCCGCTCGTCCTGGTTAAGCCGGTCCAGCGCAGCCAGCGACAGGCCCAGTGTAAGGCTTGCCAGAGCAGCCTTGAGCAGGCGCTCCGAGTCAGGCTCGGCGCAGGCCTTGAgccaggc < 4:208856/149‑1 (MQ=255) aGGCGAAAACGCATCACCCAGCTCTCCCAGACCCGCTCGTCCTGGTTAAGCCGGTCCAGCGCAGCCAGCGACAGGCCCAGTGTAAGGCTTGCCAGAGCAGCCTTGAGCAGGCGCTCCGAGTCAGGCTCGGCGCAGGCCTTGAgccaggc > 1:278670/1‑149 (MQ=255) aaaCGCATCACCCAGCTCTCCCAGACCCGCTCTTCCTGGTTAAGCCGGTCCAGCGCAGCCAGCGACAGGCCCAGTGTAAGGCTTGCCAGAGCAGCCTTGAGCAGGCGCTCCGAGTCAGGCTCGGCGCAGGCCTTGAGCCAGGCcagcag < 8:410884/149‑1 (MQ=255) aCGCATCACCCAGCTCTCCCAGACCCGCTCGTCCTGGTTAAGCCGGTCCAGCGCAGCCAGCGACAGGCCCAGTGTAAGGCTTGCCAGAGCAGCCTTGAGCAGGCGCTCCGAGTCAGGCTCgg > 3:25437/1‑122 (MQ=255) aCGCATCACCCAGCTCTCCCAGACCCGCTCGTCCTGGTTAAGCCGGTCCAGCGCAGCCAGCGACAGGCCCAGTGTAAGGCTTGCCAGAGCAGCCTTGAGCAGGCGCTCCGAGTCAGGCTCgg < 4:25437/122‑1 (MQ=255) gCATCACCCAGCTCTCCCAGACCCGCTCGTCCTGGTTAAGCCGGTCCAGCGCAGCCAGCGACAGGCCCAGTGTAAGGCTTGCCAGAGCAGCCTTGAGCAGGCGCTCCGAGTCAGGCTCGGCGCAGGCCTTGAGCCAGGCCAGCAGGTCg > 4:139230/1‑149 (MQ=255) cATCACCCAGCTCTCCCAGACCCGCTCGTCCTGGTTAAGCCGGTCCAGCGCAGCCAGCGACAGGCCCAGTGTAAGGCTTGCCAGAGCAGCCTTGAGCAGGCGCTCCGAGTCAGGCTCGGCGCAGGCCTTGAGCCAGGCCAGCAGGTc > 4:203290/1‑147 (MQ=255) aTCACCCAGCTCTCCCAGACCCGCTCGTCCTGGTTAAGCCGGTCCAGCGCAGCCAGCGCCAGGCCCAGTGTAAGGCTTGCCAGAGCAGCCTTGAGCAGGCGCTCCGAGTCAGGCTCGGCGCAGGCCTTGAGCCAGGCCAGCAGGTCGTg > 2:108253/1‑149 (MQ=255) aTCACCCAGCTCTCCCAGACCCGCTCGTCCTGGTTAAGCCGGTCCAGCGCAGCCAGCGACAGGCCCAGTGTAAGGCTTGCCAGAGCAGCCTTGAGCAGGCGCTCCGAGTCAGGCTCGGCGCAGGCCTTGAGCCAGGCCAGCAGGTCGTg < 7:321654/149‑1 (MQ=255) aCCCAGCTCTCCCAGACCCGCTCGTCCTTGTTAAGCCTGTCCAGCGCAGCCAGCGACAGGCCCAGTGTAAGGCTTGCCAGAGCAGCCTTGAGCAGGCGCTCCGAGTCAGGCTCGGCGCAGGCCTTGAGCCAGGCCAGCAGGTCGTGGGc < 4:149140/149‑1 (MQ=255) cccAGCTCTCCCAGACCCGCTCGTCCTGGTTAAGCCGGTCCAGCGCAGCCAGCGACAGTCCCAGTGTAAGGCTTGCCAGAGCAGCCTTGAGCAGGCGCTCCGAGTCAGGCTCGGCGCAGGCCTTGAGCCAGGCCAGCAGGTCGTGGGCt > 6:51882/1‑149 (MQ=255) cccAGCTCTCCCAGACCCGCTCGTCCTGGTTAAGCCGGTCCAGCGCAGCCAGCGACAGGCCCAGTGTAAGGCTTGCCAGAGCAGCCTTGAGCAGGCGCTCCGAGTCAGGCTCGGCGCAGGCCTTGAGCCAGGCCAGCAGGTCGTGGGCt > 6:58252/1‑149 (MQ=255) ccAGCTCTCCCAGACCCGCTCGTCCTGGTTAAGCCGGTCCAGCGCAGCCAGCGACAGGCCCAGTGTAAGGCTTGCCAGAGCAGCCTTGAGCAGGCGCTCCGAGTCAGGCTCGGCGCAGGCCTTGAGCCAGGCCAGCAGGTCGTGGGCtt > 7:102399/1‑149 (MQ=255) cAGCTCTCCCAGACCCGCTCGTCCTGGTTAAGCCGGTCCAGCGCAGCCAGCGACAGGCCCAGTGTAAGGCTTGCCAGAGCAGCCTTGAGCAGGCGCTCCGAGTCAGGCTCGGCGCAGGCCTTGAGCCAGGCCAGCAGGTCGTGGGCTTc < 2:243599/149‑1 (MQ=255) ctctCCCAGACCCGCTCGTCCTGGTTAAGCCGGTCCAGCGCAGCCAGCGACAGGCCCAGTGTAAGGCTTGCCAGAGCAGCCTTGAGCAGGCGCTCCGAGTCAGGCTCGGCGCAGGCCTTGAGCCAGGCCAGCAGGTCGTGGGCTTCCTg < 3:13401/149‑1 (MQ=255) ctctCCCAGACCCGCTCGTCCTGGTTAAGCCGGTCCAGCGCAGCCAGCGACAGGCCCAGTGTAAGGCTTGCCAGAGCAGCCTTGAGCAGGCGCTCCGAGTCAGGCTCGGCGCAGGCCTTGAGCCAGGCCAGCAGGTCGTGGGCTTCCTg < 5:103504/149‑1 (MQ=255) ccAGACCCGCTCGTCCTGGTTAAGCCGGTCCAGCGCAGCCAGCGACAGGCCCAGTGTAAGGCTTGCCAGAGCAGCCTTGAGCAGGCGCTCCGAGTCAGGCTCGGCGCAGGCCTTGAGCCAGGCCAGCAGGTCGTGGGCTTCCTGggcgg > 6:185930/1‑149 (MQ=255) ccAGACCCGCTCGTCCTGGTTAAGCCGGTCCAGCGCAGCCAGCGACAGGCCCAGTGTAAGGCTTGCCAGAGCAGCCTTGAGCAGGCGCTCCGAGTCAGGCTCGGCGCAGGCCTTGAGCCAGGCCAGCAGGTCGTGGGCTTCCTGggcgg > 3:92975/1‑149 (MQ=255) ccAGACCCGCTCGTCCTGGTTAAGCCGGTCCAGCGCAGCCAGCGACAGGCCCAGTGTAAGGCTTGCCAGAGCAGCCTTGAGCAGGCGCTCCGAGTCAGGCTCGGCGCAGGCCTTGAGCCAGGCCAGCAGGTCGTGGGCTTCCTGggc < 4:834/147‑1 (MQ=255) ccAGACCCGCTCGTCCTGGTTAAGCCGGTCCAGCGCAGCCAGCGACAGGCCCAGTGTAAGGCTTGCCAGAGCAGCCTTGAGCAGGCGCTCCGAGTCAGGCTCGGCGCAGGCCTTGAGCCAGGCCAGCAGGTCGTGGGCTTCCTGggc < 8:102399/147‑1 (MQ=255) ccAGACCCGCTCGTCCTGGTTAAGCCGGTCCAGCGCAGCCAGCGACAGGCCCAGTGTAAGGCTTGCCAGAGCAGCCTTGAGCAGGCGCTCCGAGTCAGGCTCGGCGCAGGCCTTGAGCCAGGCCAGCAGGTCGTGGGCTTCCTGggc < 7:186262/147‑1 (MQ=255) cAGACCCGCTCGTCCTGGTTAAGCCGGTCCAGCGCAGCCAGCGACAGGCCCAGTGTAAGGCTTGCCAGAGCAGCCTTGAGCAGGCGCTCCGAGTCAGGCTCGGCGCAGGCCTTGAGCCAGGCCAGCAGGTCGTGGGCTTCCTGggcggc < 4:333677/149‑1 (MQ=255) aCCCGCTCGTCCTGGTTAAGCCGGTCCAGCGCAGCCAGCGACAGGCCCAGTGTAAGGCTTGCCAGAGCAGCCTTGAGCAGGCGCTCCGAGTCAGGCTCGGCGCAGGCCTTGAGCCAGGCCAGCAGGTCGTGGGCTTCCTGGGCGGCaaa < 1:339249/149‑1 (MQ=255) ccGCTCGTCCTGGTTAAGCCGGTCCAGCGCAGCCAGCGACAGGCCCAGTGTAAGGCTTGCCAGAGCAGCCTTGAGCAGGCGCTCCGAGTCAGGCTCGGCGCAGGCCTTGAGCCAGGCCAGCAGGTCGTGGGCTTCCTGGGCGGCAAaca > 1:49928/1‑149 (MQ=255) gTCCTGGTTAAGCCGGTCCAGCGCAGCCAGCGACAGGCCCAGTGTAAGGCTTGCCAGAGCAGCCTTGAGCAGGCGCTCCGAGTCAGGCTCGGCGCAGGCCTTGAGCCAGGCcagcag < 1:79176/117‑1 (MQ=255) gTCCTGGTTAAGCCGGTCCAGCGCAGCCAGCGACAGGCCCAGTGTAAGGCTTGCCAGAGCAGCCTTGAGCAGGCGCTCCGAGTCAGGCTCGGCGCAGGCCTTGAGCCAGGCcagcag > 2:79176/1‑117 (MQ=255) tCCTGGTTAAGCCGGTCCAGCGCAGCCAGCGACAGGCCCAGTGTAAGGCTTGCCAGAGCAGCCTTGAGCAGGCGCTCCGAGTCAGGCTCGGCGCAGGCCTTGAGCCAGGCCAGCAGGTCGTGGGCTTCCTGGGCGGCAAACACCGAGTc > 2:154133/1‑149 (MQ=255) gTTAAGCCGGTCCAGCGCAGCCAGCGACAGGCCCAGTGTAAGGCTTGCCAGAGCAGCCTTGAGCAGGCGCTCCGAGTCAGGCTCGGCGCAGGCCTTGAGCCAGGCCAGCAGGTCGTGGGCTTCCTGGGCGGCAAACACCGAGTCCT‑TGt > 4:380567/1‑149 (MQ=255) gTTAAGCCGGTCCAGCGCAGCCAGCGACAGGCCCAGTGTAAGGCTTGCCAGAGCAGCCTTGAGCAGGCGCTCCGAGTCAGGCTCGGCGCAGGCCTTGAGCCAGGCCAGCAGGTCGTGGGCTTCCTGGGCGGCAAACACCGAGTCCT‑TGt > 3:230541/1‑149 (MQ=255) ttAAGCCGGTCCAGCGCAGCCAGCGACAGGCCCAGTGTAAGGCTTGCCAGAGCAGCCTTGAGCAGGCGCTCCGAGTCAGGCTCGGCGCAGGCCTTGAGCCAGGCCAGCAGGTCGTGGGCTTCCTGGGCGGCAAACACCGAGTCCT‑TGTc < 5:389859/149‑1 (MQ=255) gCCGGTCCAGCGCAGCCAGCGACAGGCCCAGTGTAAGGCTTGCCAGAGCAGCCTTGAGCAGGCGCTCCGAGTCAGGCTCGGCGCAGGCCTTGAGCCAGGCCAGCAGGTCGTGGGCTTCCTGGGCGGCAAACACCGAGTCCT‑TGTCGGa > 3:145865/1‑148 (MQ=255) gCCGGTCCAGCGCAGCCAGCGACAGGCCCAGTGTAAGGCTTGCCAGAGCAGCCTTGAGCAGGCGCTCCGAGTCAGGCTCGGCGCAGGCCTTGAGCCAGGCCAGCAGGTCGTGGGCTTCCTGGGCGGCAAACACCGAGTCCT‑TGTCGGa > 5:336451/1‑148 (MQ=255) gCCGGTCCAGCGCAGCCAGCGACAGGCCCAGTGTAAGGCTTGCCAGAGCAGCCTTGAGCAGGCGCTCCGAGTCAGGCTCGGCGCAGGCCTTGAGCCAGGCCAGCAGGTCGTGGGCTTCCTGGGCGGCAAACACCGAGTCCT‑TGTCGGAc < 3:139230/149‑1 (MQ=255) gCCGGTCCAGCGCAGCCAGCGACAGGCCCAGTGTAAGGCTTGCCAGAGCAGCCTTGAGCAGGCGCTCCGAGTCAGGCTCGGCGCAGGCCTTGAGCCAGGCCAGCAGCTCGTGGGCTTCCTGGGCGGCAAACACCGAGTCCT‑TGTCGGa > 6:267590/1‑148 (MQ=255) caggTCCAGCGCAGCCAGCGACAGGCCCAGTGTAAGGCTTCCCAGAGCAGCCTTGAGCAGGCGCTCCGAGTCAGGCTCGGCGCAGGCCTTGAGCCAGGCCAGCAGGGCGTGGGCTACATGGGCGGCAAACACCGAGACCT‑TGTCGGa > 6:244375/3‑147 (MQ=255) ggTCCAGCGCAGCCAGCGACAGGCCCAGTGTAAGGCTTGCCAGAGCAGCCTTGAGCAGGCGCTCCGAGTCAGGCTCGGCGCAGGCCTTGAGCCAGGCCAGCAGGTCGTGGGCTTCCTGggcgg > 8:76897/1‑123 (MQ=255) ggTCCAGCGCAGCCAGCGACAGGCCCAGTGTAAGGCTTGCCAGAGCAGCCTTGAGCAGGCGCTCCGAGTCAGGCTCGGCGCAGGCCTTGAGCCAGGCCAGCAGGTCGTGGGCTTCCTGggcgg < 7:76897/123‑1 (MQ=255) ggTCCAGCGCAGCCAGCGACAGGCCCAGTGTAAGGCTTGCCAGAGCAGCCTTGAGCAGGCGCTCCGAGTCAGGCTCGGCGCAGGCCTTGAGCCAGGCCAGCAGGTCGTGGGCTTCCTGGGCGGCAAACACCGAGTCCT‑TGTCGGACAgg < 8:319882/149‑1 (MQ=255) gcgcAGCCAGCGACAGGCCCAGTGTAAGGCTTGCCAGAGCAGCCTTGAGCAGGCGCTCCGAGTCAGGCTCGGCGCAGGCCTTGAGCCAGGCCAGCAGGTCGTGGGCTTCCTGGGCGGCAAACACCGAGTCCT‑TGTCGGACAGGTAGACg > 7:313945/1‑149 (MQ=255) gcgcAGCCAGCGACAGGCCCAGTGTAAGGCTTGCCAGAGCAGCCTTGAGCAGGCGCTCCGAGTCAGGCTCGGCGCAGGCCTTGAGCCAGGCCAGCAGGTCGTGGGCTTCCTGGGCGGCAAACACCGAGTCCT‑TGTCGGACAGGTAGACg > 3:320452/1‑149 (MQ=255) agccagcGACAGGCCCAGTGTAAGGCTTGCCAGAGCAGCCTTGAGCAGGCGCTCCGAGTCAGGCTCGGCGCAGGCCTTGAGCCAGGCCAGCAGGTCGTGGGCTTCCTGGGCGGCAAACACCGAGTCCT‑TGTCGGACAGGTAGAc < 4:37431/144‑1 (MQ=255) agccagcGACAGGCCCAGTGTAAGGCTTGCCAGAGCAGCCTTGAGCAGGCGCTCCGAGTCAGGCTCGGCGCAGGCCTTGAGCCAGGCCAGCAGGTCGTGGGCTTCCTGGGCGGCAAACACCGAGTCCT‑TGTCGGACAGGTAGAc > 3:37431/1‑144 (MQ=255) ccagcGACAGGCCCAGTGTAAGGCTAGCCAGAGCAGCCTTGAGCAGGCGCTCCGAGTCAGGCTCGGCGCAGGCCTTGAGCCAGGCCAGCAGGTCGTGGGCTTCCTGGGCGGCAAACACCGAGTCCT‑TGTCGGACAGGTAGACGCTgcg > 7:364241/1‑148 (MQ=255) gCCCAGTGTAAGGCTTGCCAGAGCAGCCTTGAGCAGGCGCTCCGAGTCAGGCTCGGCGCAGGCCTTGAGCCAGGCCAGCAGGTCGTGGGCTTCCTGGGCGGCAAACACCGAGTCCT‑TGTCGGACAGGTAGACGCTGCGCACCTCGCGTg > 5:89973/1‑149 (MQ=255) gCCCAGTGTAAGGCTTGCCAGAGCAGCCTTGAGCAGGCGCTCCGAGTCAGGCTCGGCGCAGGCCTTGAGCCAGGCCAGCAGGTCGTGGGCTTCCTGGGCGGCAAACACCGAGTCCT‑TGTCGGACAGGTAGACGCTGCGCACCTCGCGTg > 5:96046/1‑149 (MQ=255) cccAGTGTAAGGCTTGCCAGAGCAGCCTTGAGCAGGCGCTCCGAGTCAGGCTCGGCGCAGGCCTTGAGCCAGGCCAGCAGGTCGTGGGCTTCCTGGGCGGCAAACACCGAGTCCT‑TGTCGGACAGGTAGACGCTGCGCACCTCGCGTGc > 2:303844/1‑149 (MQ=255) cAGTGTAAGGCTTGCCAGAGCAGCCTTGAGCAGGCGCTCCGAGTCAGGCTCGGCGCAGGCCTTGAGCCAGGCCAGCAGGTCGTGGGCTTCCTGGGCGGCAAACACCGAGTCCT‑TGTCGGACAGGTAGACGCTGCGCACCTCGCGTGCgg > 4:249450/1‑149 (MQ=255) aGTGTAAGGCTTGCCAGAGCAGCCTTGAGCAGGCGCTCCGAGTCAGGCTCGGCGCAGGCCTTGAGCCAGGCCAGCAGGTCGTGGGCTTCCTGGGCGGCAAACACCGAGTCCT‑TGTCGGACAGGTAGACGCTGCGCACCTCGCGTGCGGc < 4:230541/149‑1 (MQ=255) ggCTTGCCAGAGCAGCCTTGAGCAGGCGCTCCGAGTCAGGCTCGGCGCAGGCCTTGAGCCAGGCCAGCAGGTCGTGGGCTTCCTGGGCGGCAAACACCGAGTCCT‑TGTCGGACAGGTAGACGCTGCGCACCTCGCGTGCGGCCAGTTCg < 1:344700/149‑1 (MQ=255) 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cTTGAGCAGGCGCTCCGAGTCAGGCTCGGCGCAGGCCTTGAGCCAGGCCAGCAGGTCGTGGGCTTCCTGGGCGGCAAACACCGAGTCCT‑TGTCGGACAGGTAGACGCTGCGCACCTCGCGTGCGGCCAGTTCGGCGCGGACCATCTgcg < 4:92975/149‑1 (MQ=255) gAGCAGGCGCTCCGAGTCAGGCTCGGCGCAGGCCTTGAGCCAGGCCAGCAGGTCGTGGGCTTCCTGGGCGGCAAACACCGAGTCCT‑TGTCGGACAGGTAGACGCTGCGCACCTCGCGTGCGGCCAGTTCGGCGCGGACCATCTgcgc < 8:313945/147‑1 (MQ=255) gAGCAGGCGCTCCGAGTCAGGCTCGGCGCAGGCCTTGAGCCAGGCCAGCAGGTCGTGGGCTTCCTGGGCGGCAAACACCGAGTCCT‑TGTCGGACAGGTAGACGCTGCGCACCTCGCGTGCGGCCAGTTCGGCGCGGACCATCTGCGcc < 2:218597/148‑1 (MQ=255) cAGGCGCTCCGAGTCAGGCTCGGCGCAGGCCTTGAGCCAGGCCAGCAGGTCGTGGGCTTCCTGGGCGGCAAACACCGAGTCCT‑TGTCGGACa < 7:309121/92‑1 (MQ=255) cAGGCGCTCCGAGTCAGGCTCGGCGCAGGCCTTGAGCCAGGCCAGCAGGTCGTGGGCTTCCTGGGCGGCAAACACCGAGTCCT‑TGTCGGACa > 8:309121/1‑92 (MQ=255) aGGCGCTCCGAGTCAGGCTCGGCGCAGGCCTTGAGCCAGGCCAGCAGGTCGTGGGCTTCCTGGGCGGCAAACACCGAGTCCT‑TGTCGGACAGGTAGACGCTGCGCACCTCGCGTGCGGCCAGTTCGGCGCGGACCATCTGCGCCTCATg < 7:170688/149‑1 (MQ=255) tgcgccGAGCCTGACTCGGAGCAGGCCTTGAGCCAGGCCAGCAGGTCGTGGGCTTCCTGGGCGGCAAACACCGAGTCCT‑TGTCGGACAGGTAGACGCTGCGCACCTCGCGTGCGGCCAGTTCGGCGCGGACCATCTGCGCCTCATGGc > 8:117461/5‑148 (MQ=255) tgcgccGAGCCTGACTCGGAGCAGGCCTTGAGCCAGGCCAGCAGGTCGTGGGCTTCCTGGGCGGCAAACACCGAGTCCT‑TGTCGGACAGGTAGACGCTGCGCACCTCGCGTGCGGCCAGTTCGGCGCGGACCATCTGCGCCTCATGGc > 8:123639/5‑148 (MQ=255) gcgccGAGCCTGACTCGGAGCAGGCCTTGAGCCAGGCCAGCAGGTCGTGGGCTTCCTGGGCGGCAAACACCGAGTCCT‑TGTCGGACAGGTAGACGCTGCGCACCTCGCGTGCGGCCAGTTCGGCGCGGACCATCTGCGCCTCATGGCCa > 2:123580/4‑149 (MQ=255) cGAGGCAGGCGCGGCGCAGGCCTTGAGCCAGGCCAGCAGGTCGGGGGCTTCCTCGGCGGCAACCACCGAGTCCT‑TGTCGGACAGGTAGACGCTGCGCACCTCGCGTGCGGCCAGCTCGGCGCGGACCATCTGCGCCTCATGGCCATcgc < 2:9421/149‑1 (MQ=255) gTCAGGCTCGGCGCAGGCCTTGAGCCAGGCCAGCAGGTCGTGGGCTTCCTGGGCGGCAAACACCGAGTCCT‑TGTCGGACAGGTAGACGCTGCGCACCTCGCGTGCGGCCAGTTCGGCGCGGACCATCTGCGCCTCATGGCCATCgcgc > 8:112483/1‑148 (MQ=255) gTCAGGCTCGGCGCAGGCCTTGAGCCAGGCCAGCAGGTCGTGGGCTTCCTGGGCGGCAAACACCGAGTCCT‑TGTCGGACAGGTAGACGCTGCGCACCTCGCGTGCGGCCAGTTCGGCGCGGACCATCTGCGCCTCATGGCCATCgcgc < 7:112483/148‑1 (MQ=255) gTCAGGCTCGGCGCAGGCCTTGAGCCAGGCCAGCAGGTCGTGGGCTTCCTGGGCGGCAAACACCGAGTCCT‑TGTCGGACAGGTAGACGCTGCGCACCTCGCGTGCGGCCAGTTCGGCGCGGACCATCTGCGCCTCATGGCCATCGCGCa < 4:320452/149‑1 (MQ=255) tCAGGCTCGGCGCAGGCCTTGAGCCAGGCCAGCAGGTCGTGGGCTTCCTGGGCGGCAAACACCGAGTCCT‑TGTCGGACAGGTAGACGCTGCGCACCTCGCGTGCGGCCAGTTCGGCGCGGACCATCTGCGCCTCATGGCCATCGCGCAc < 4:38849/149‑1 (MQ=255) | CCCCTGGCGCTGCCAGGTGTCGCGGTACAGGCGAAAACGCATCACCCAGCTCTCCCAGACCCGCTCGTCCTGGTTAAGCCGGTCCAGCGCAGCCAGCGACAGGCCCAGTGTAAGGCTTGCCAGAGCAGCCTTGAGCAGGCGCTCCGAGTCAGGCTCGGCGCAGGCCTTGAGCCAGGCCAGCAGGTCGTGGGCTTCCTGGGCGGCAAACACCGAGTCCT‑TGTCGGACAGGTAGACGCTGCGCACCTCGCGTGCGGCCAGTTCGGCGCGGACCATCTGCGCCTCATGGCCATCGCGCAC > NC_002947/5301742‑5302038 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |