| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,301,892 | A→T | 5.7% | P627P (CCT→CCA) ‡ | recB ← | Chi activated ATP‑dependent DNA helicase/dsDNA/ssDNA exonuclease |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,301,892 | 0 | A | T | 5.7% | 269.4 / 4.7 | 87 | P627P (CCT→CCA) ‡ | recB | Chi activated ATP‑dependent DNA helicase/dsDNA/ssDNA exonuclease |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (37/44); new base T (3/2); total (41/46) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.60e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.99e-01 | |||||||||||
GCCAGGTGTCGCGGTACAGGCGAAAACGCATCACCCAGCTCTCCCAGACCCGCTCGTCCTGGTTAAGCCGGTCCAGCGCAGCCAGCGACAGGCCCAGTGTAAGGCTTGCCAGAGCAGCCTTGAGCAGGCGCTCCGAGTCAGGCTCGGCGCAGGCCTTGAGCCAGGCCAGCAGGTCGTGGGCTTCCTGGGCGGCAAACACCGAGTCCT‑TGTCGGACAGGTAGACGCTGCGCACCTCGCGTGCGGCCAGTTCGGCGCGGACCATCTGCGCCTCATGGCCATCGCGCAC > NC_002947/5301753‑5302038 | gtcAGGTGTCGCGGTACAGGCGAAAACGCATCACCCAGCTCTCCCAGACCCGCTCGTCCTGGTTAAGCCGGTCCAGCGCAGCCAGCGACAGGCCCAGTGTAAGGCTTGCCAGAGCAGCCTTGAGCAGGCGCTCCGAGTCAGGCTCGgcg > 6:275674/3‑149 (MQ=255) ccAGGTGTCGCGGTACAGGCGAAAACGCATCACCCAGCTCTCCCAGACCCGCTCGTCCTGGTTAAGCCGGTCCAGCGCAGCCAGCGACAGGCCCAGTGTAAGGCTTGCCAGAGCAGCCTTGAGCAGGCGCTCCGAGTCAGGCTCGgcg > 5:137245/1‑148 (MQ=255) aGGTGTCGCGGTACAGGCGAAAACGCATCACCCAGCTCTCCCAGACCCGCTCGTCCTGGTTAAGCCGGTCCAGCGCAGCCAGCGACAGGCCCAGTGTAAGGCTTGCCAGAGCAGCCTTGAGCAGGCGCTCCGAGTCAGGCTCGGCGCAg < 6:27443/149‑1 (MQ=255) aGGTGTCGCGGTACAGGCGAAAACGCATCACCCAGCTCTCCCAGACCCGCTCGTCCTGGTTAAGCCGGTCCAGCGCAGCCAGCGACAGGCCCAGTGTAAGGCTTGCCAGAGCAGCCTTGAGCAGGCGCTCCGAGCCTGACTCGgagcgc < 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gcgGTACAGGCGAAAACGCATCACCCAGCTCTCCCAGACCAGCTCGTCCTGGTTAAGCCGGTCCAGCGCAGCCAGCGACAGGCCCAGTGTAAGGCTTGCCAGAGCAGCCTTGAGCAGGCGCTCCGAGTCAGGCTCGGCGCAGGCCTTGa < 5:124256/149‑1 (MQ=255) cgGTACAGGCGAAAACGCATCACCCAGCTCTCCCAGACCCGCTCGTCCTGGTTAAGCCGGTCCAGCGCAGCCAGCGACAGGCCCAGTGTAAGGCTTGCCAGAGCAGCCTTGAGCAGGCGCTCCGAGTCAGGCTCGGCGCAGGCCTTGAg < 1:227184/149‑1 (MQ=255) cgGTACAGGCGAAAACGCATCACCCAGCTCTCCCAGACCCGCTCGTCCTGGTTAAGCCGGTCCAGCGCAGCCAGCGACAGGCCCAGTGTAAGGCTTGCCAGAGCAGCCTTGAGCAGGCGCTCCGAGTCAGGCTCGGCGCAGGCCTTGAg < 3:131951/149‑1 (MQ=255) cAGGCGAAAACGCATCACCCAGCTCTCCCAGACCCGCTCGTCCTGGTTAAGCCGGTCCAGCGCAGCCAGCGACAGGCCCAGTGTAAGGCTTGCCAGAGCAGCCTTGAGCAGGCGCTCCGAGTCAGGCTCGGCGCAGGCCTTGAgccag < 1:237491/148‑1 (MQ=255) aGGCGAAAACGCATCACCCAGCTCTCCCAGACCCGCTCGTCCTGGTTAAGCCGGTCCAGCGCAGCCAGCGACAGGCCCAGTGTAAGGCTTGCCAGAGCCGCCTTGAGCAGGCGCTCCGAGTCCGGCTCGGCGCCGGCCTGGAgccaggc > 6:389859/1‑149 (MQ=255) 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ccAGACCCGCTCGTCCTGGTTAAGCCGGTCCAGCGCAGCCAGCGACAGGCCCAGTGTAAGGCTTGCCAGAGCAGCCTTGAGCAGGCGCTCCGAGTCAGGCTCGGCGCAGGCCTTGAGCCAGGCCAGCAGGTCGTGGGCTTCCTGggcgg > 6:185930/1‑149 (MQ=255) ccAGACCCGCTCGTCCTGGTTAAGCCGGTCCAGCGCAGCCAGCGACAGGCCCAGTGTAAGGCTTGCCAGAGCAGCCTTGAGCAGGCGCTCCGAGTCAGGCTCGGCGCAGGCCTTGAGCCAGGCCAGCAGGTCGTGGGCTTCCTGggcgg > 3:92975/1‑149 (MQ=255) ccAGACCCGCTCGTCCTGGTTAAGCCGGTCCAGCGCAGCCAGCGACAGGCCCAGTGTAAGGCTTGCCAGAGCAGCCTTGAGCAGGCGCTCCGAGTCAGGCTCGGCGCAGGCCTTGAGCCAGGCCAGCAGGTCGTGGGCTTCCTGggc < 8:102399/147‑1 (MQ=255) ccAGACCCGCTCGTCCTGGTTAAGCCGGTCCAGCGCAGCCAGCGACAGGCCCAGTGTAAGGCTTGCCAGAGCAGCCTTGAGCAGGCGCTCCGAGTCAGGCTCGGCGCAGGCCTTGAGCCAGGCCAGCAGGTCGTGGGCTTCCTGggc < 7:186262/147‑1 (MQ=255) ccAGACCCGCTCGTCCTGGTTAAGCCGGTCCAGCGCAGCCAGCGACAGGCCCAGTGTAAGGCTTGCCAGAGCAGCCTTGAGCAGGCGCTCCGAGTCAGGCTCGGCGCAGGCCTTGAGCCAGGCCAGCAGGTCGTGGGCTTCCTGggc < 4:834/147‑1 (MQ=255) cAGACCCGCTCGTCCTGGTTAAGCCGGTCCAGCGCAGCCAGCGACAGGCCCAGTGTAAGGCTTGCCAGAGCAGCCTTGAGCAGGCGCTCCGAGTCAGGCTCGGCGCAGGCCTTGAGCCAGGCCAGCAGGTCGTGGGCTTCCTGggcggc < 4:333677/149‑1 (MQ=255) aCCCGCTCGTCCTGGTTAAGCCGGTCCAGCGCAGCCAGCGACAGGCCCAGTGTAAGGCTTGCCAGAGCAGCCTTGAGCAGGCGCTCCGAGTCAGGCTCGGCGCAGGCCTTGAGCCAGGCCAGCAGGTCGTGGGCTTCCTGGGCGGCaaa < 1:339249/149‑1 (MQ=255) ccGCTCGTCCTGGTTAAGCCGGTCCAGCGCAGCCAGCGACAGGCCCAGTGTAAGGCTTGCCAGAGCAGCCTTGAGCAGGCGCTCCGAGTCAGGCTCGGCGCAGGCCTTGAGCCAGGCCAGCAGGTCGTGGGCTTCCTGGGCGGCAAaca > 1:49928/1‑149 (MQ=255) gTCCTGGTTAAGCCGGTCCAGCGCAGCCAGCGACAGGCCCAGTGTAAGGCTTGCCAGAGCAGCCTTGAGCAGGCGCTCCGAGTCAGGCTCGGCGCAGGCCTTGAGCCAGGCcagcag < 1:79176/117‑1 (MQ=255) gTCCTGGTTAAGCCGGTCCAGCGCAGCCAGCGACAGGCCCAGTGTAAGGCTTGCCAGAGCAGCCTTGAGCAGGCGCTCCGAGTCAGGCTCGGCGCAGGCCTTGAGCCAGGCcagcag > 2:79176/1‑117 (MQ=255) tCCTGGTTAAGCCGGTCCAGCGCAGCCAGCGACAGGCCCAGTGTAAGGCTTGCCAGAGCAGCCTTGAGCAGGCGCTCCGAGTCAGGCTCGGCGCAGGCCTTGAGCCAGGCCAGCAGGTCGTGGGCTTCCTGGGCGGCAAACACCGAGTc > 2:154133/1‑149 (MQ=255) gTTAAGCCGGTCCAGCGCAGCCAGCGACAGGCCCAGTGTAAGGCTTGCCAGAGCAGCCTTGAGCAGGCGCTCCGAGTCAGGCTCGGCGCAGGCCTTGAGCCAGGCCAGCAGGTCGTGGGCTTCCTGGGCGGCAAACACCGAGTCCT‑TGt > 4:380567/1‑149 (MQ=255) gTTAAGCCGGTCCAGCGCAGCCAGCGACAGGCCCAGTGTAAGGCTTGCCAGAGCAGCCTTGAGCAGGCGCTCCGAGTCAGGCTCGGCGCAGGCCTTGAGCCAGGCCAGCAGGTCGTGGGCTTCCTGGGCGGCAAACACCGAGTCCT‑TGt > 3:230541/1‑149 (MQ=255) ttAAGCCGGTCCAGCGCAGCCAGCGACAGGCCCAGTGTAAGGCTTGCCAGAGCAGCCTTGAGCAGGCGCTCCGAGTCAGGCTCGGCGCAGGCCTTGAGCCAGGCCAGCAGGTCGTGGGCTTCCTGGGCGGCAAACACCGAGTCCT‑TGTc < 5:389859/149‑1 (MQ=255) gCCGGTCCAGCGCAGCCAGCGACAGGCCCAGTGTAAGGCTTGCCAGAGCAGCCTTGAGCAGGCGCTCCGAGTCAGGCTCGGCGCAGGCCTTGAGCCAGGCCAGCAGGTCGTGGGCTTCCTGGGCGGCAAACACCGAGTCCT‑TGTCGGa > 3:145865/1‑148 (MQ=255) gCCGGTCCAGCGCAGCCAGCGACAGGCCCAGTGTAAGGCTTGCCAGAGCAGCCTTGAGCAGGCGCTCCGAGTCAGGCTCGGCGCAGGCCTTGAGCCAGGCCAGCAGGTCGTGGGCTTCCTGGGCGGCAAACACCGAGTCCT‑TGTCGGa > 5:336451/1‑148 (MQ=255) gCCGGTCCAGCGCAGCCAGCGACAGGCCCAGTGTAAGGCTTGCCAGAGCAGCCTTGAGCAGGCGCTCCGAGTCAGGCTCGGCGCAGGCCTTGAGCCAGGCCAGCAGGTCGTGGGCTTCCTGGGCGGCAAACACCGAGTCCT‑TGTCGGAc < 3:139230/149‑1 (MQ=255) gCCGGTCCAGCGCAGCCAGCGACAGGCCCAGTGTAAGGCTTGCCAGAGCAGCCTTGAGCAGGCGCTCCGAGTCAGGCTCGGCGCAGGCCTTGAGCCAGGCCAGCAGCTCGTGGGCTTCCTGGGCGGCAAACACCGAGTCCT‑TGTCGGa > 6:267590/1‑148 (MQ=255) caggTCCAGCGCAGCCAGCGACAGGCCCAGTGTAAGGCTTCCCAGAGCAGCCTTGAGCAGGCGCTCCGAGTCAGGCTCGGCGCAGGCCTTGAGCCAGGCCAGCAGGGCGTGGGCTACATGGGCGGCAAACACCGAGACCT‑TGTCGGa > 6:244375/3‑147 (MQ=255) ggTCCAGCGCAGCCAGCGACAGGCCCAGTGTAAGGCTTGCCAGAGCAGCCTTGAGCAGGCGCTCCGAGTCAGGCTCGGCGCAGGCCTTGAGCCAGGCCAGCAGGTCGTGGGCTTCCTGggcgg > 8:76897/1‑123 (MQ=255) ggTCCAGCGCAGCCAGCGACAGGCCCAGTGTAAGGCTTGCCAGAGCAGCCTTGAGCAGGCGCTCCGAGTCAGGCTCGGCGCAGGCCTTGAGCCAGGCCAGCAGGTCGTGGGCTTCCTGggcgg < 7:76897/123‑1 (MQ=255) ggTCCAGCGCAGCCAGCGACAGGCCCAGTGTAAGGCTTGCCAGAGCAGCCTTGAGCAGGCGCTCCGAGTCAGGCTCGGCGCAGGCCTTGAGCCAGGCCAGCAGGTCGTGGGCTTCCTGGGCGGCAAACACCGAGTCCT‑TGTCGGACAgg < 8:319882/149‑1 (MQ=255) gcgcAGCCAGCGACAGGCCCAGTGTAAGGCTTGCCAGAGCAGCCTTGAGCAGGCGCTCCGAGTCAGGCTCGGCGCAGGCCTTGAGCCAGGCCAGCAGGTCGTGGGCTTCCTGGGCGGCAAACACCGAGTCCT‑TGTCGGACAGGTAGACg > 7:313945/1‑149 (MQ=255) gcgcAGCCAGCGACAGGCCCAGTGTAAGGCTTGCCAGAGCAGCCTTGAGCAGGCGCTCCGAGTCAGGCTCGGCGCAGGCCTTGAGCCAGGCCAGCAGGTCGTGGGCTTCCTGGGCGGCAAACACCGAGTCCT‑TGTCGGACAGGTAGACg > 3:320452/1‑149 (MQ=255) agccagcGACAGGCCCAGTGTAAGGCTTGCCAGAGCAGCCTTGAGCAGGCGCTCCGAGTCAGGCTCGGCGCAGGCCTTGAGCCAGGCCAGCAGGTCGTGGGCTTCCTGGGCGGCAAACACCGAGTCCT‑TGTCGGACAGGTAGAc < 4:37431/144‑1 (MQ=255) agccagcGACAGGCCCAGTGTAAGGCTTGCCAGAGCAGCCTTGAGCAGGCGCTCCGAGTCAGGCTCGGCGCAGGCCTTGAGCCAGGCCAGCAGGTCGTGGGCTTCCTGGGCGGCAAACACCGAGTCCT‑TGTCGGACAGGTAGAc > 3:37431/1‑144 (MQ=255) ccagcGACAGGCCCAGTGTAAGGCTAGCCAGAGCAGCCTTGAGCAGGCGCTCCGAGTCAGGCTCGGCGCAGGCCTTGAGCCAGGCCAGCAGGTCGTGGGCTTCCTGGGCGGCAAACACCGAGTCCT‑TGTCGGACAGGTAGACGCTgcg > 7:364241/1‑148 (MQ=255) 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ggCTTGCCAGAGCAGCCTTGAGCAGGCGCTCCGAGTCAGGCTCGGCGCAGGCCTTGAGCCAGGCCAGCAGGTCGTGGGCTTCCTGGGCGGCAAACACCGAGTCCT‑TGTCGGACAGGTAGACGCTGCGCACCTCGCGTGCGGCCAGTTCg < 1:344700/149‑1 (MQ=255) gCTTGCCAGAGCAACCTTGAGCAGGCGCTCCGAGTCAGGCTCGGCGCAGGCCTTGAGCCAGGCCAGCAGGTCGTGGGCTTCCTGGGCGGCAAACACCGAGTCCT‑TGTCGGACAGGTAGACGCTGCGCACCTCGCGTGCGGCCAGTTCgg > 3:109632/1‑149 (MQ=255) gCCAGAGCAGCCTTGAGCAGGCGCTCCGAGTCAGGCTCGGCGCAGGCCTTGAGCCAGGCCAGCAGGTCGTGGGCTTCCTGGGCGGCAAACACCGAGTCCT‑TGTCGGACAGGTAGACGCTGCGCACCTCGCGTGCGGCCAGTTCGGcgcg > 3:123868/1‑149 (MQ=255) cAGTGCAGCCTTGAGCAGGCGCTCCGAGTCAGGCTCGGCGCAGGCCTTGAGCCAGGCCAGCAGGTCGTGGGCTTCCTGGGCGGCAAACACCGAGTCCT‑TGTCGGACAGGTAGACGCTGCGCACCTCGCGTGCGGCCAGTTCGGCGCGGa > 5:245233/1‑149 (MQ=255) cAGAGCAGCCTTGAGCAGGCGCTCCGAGTCAGGCTCGGCGCAGGCCTTGAGCCAGGCCAGCAGGTCGTGGGCTTCCTGGGCGGCAAACACCGAGTCCT‑TGTCGGACAGGTAGACGCTGCGCACCTCGCGTGCGGCCAGTTCGGCGCGGa < 3:380567/149‑1 (MQ=255) 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ccTTGAGCAGGCGCTCCGAGTCAGGCTCGGCGCAGGCCTTGAGCCAGGCCAGCAGGTCGTGGGCTTCCTGGGCGGCAAACACCGAGTCCT‑TGTCGGACAGGTAGACGCTGCGCACCTCGCGTGCGGCCAGTTCGGCGCGGACCATCTgc < 6:137245/149‑1 (MQ=255) cTTGAGCAGGCGCTCCGAGTCAGGCTCGGCGCAGGCCTTGAGCCAGGCCAGCAGGTCGTGGGCTTCCTGGGCGGCAAACACCGAGTCCT‑TGTCGGACAGGTAGACGCTGCGCACCTCGCGTGCGGCCAGTTCGGCGCGGACCATCTgcg < 4:92975/149‑1 (MQ=255) gAGCAGGCGCTCCGAGTCAGGCTCGGCGCAGGCCTTGAGCCAGGCCAGCAGGTCGTGGGCTTCCTGGGCGGCAAACACCGAGTCCT‑TGTCGGACAGGTAGACGCTGCGCACCTCGCGTGCGGCCAGTTCGGCGCGGACCATCTgcgc < 8:313945/147‑1 (MQ=255) gAGCAGGCGCTCCGAGTCAGGCTCGGCGCAGGCCTTGAGCCAGGCCAGCAGGTCGTGGGCTTCCTGGGCGGCAAACACCGAGTCCT‑TGTCGGACAGGTAGACGCTGCGCACCTCGCGTGCGGCCAGTTCGGCGCGGACCATCTGCGcc < 2:218597/148‑1 (MQ=255) cAGGCGCTCCGAGTCAGGCTCGGCGCAGGCCTTGAGCCAGGCCAGCAGGTCGTGGGCTTCCTGGGCGGCAAACACCGAGTCCT‑TGTCGGACa < 7:309121/92‑1 (MQ=255) cAGGCGCTCCGAGTCAGGCTCGGCGCAGGCCTTGAGCCAGGCCAGCAGGTCGTGGGCTTCCTGGGCGGCAAACACCGAGTCCT‑TGTCGGACa > 8:309121/1‑92 (MQ=255) aGGCGCTCCGAGTCAGGCTCGGCGCAGGCCTTGAGCCAGGCCAGCAGGTCGTGGGCTTCCTGGGCGGCAAACACCGAGTCCT‑TGTCGGACAGGTAGACGCTGCGCACCTCGCGTGCGGCCAGTTCGGCGCGGACCATCTGCGCCTCATg < 7:170688/149‑1 (MQ=255) tgcgccGAGCCTGACTCGGAGCAGGCCTTGAGCCAGGCCAGCAGGTCGTGGGCTTCCTGGGCGGCAAACACCGAGTCCT‑TGTCGGACAGGTAGACGCTGCGCACCTCGCGTGCGGCCAGTTCGGCGCGGACCATCTGCGCCTCATGGc > 8:117461/5‑148 (MQ=255) tgcgccGAGCCTGACTCGGAGCAGGCCTTGAGCCAGGCCAGCAGGTCGTGGGCTTCCTGGGCGGCAAACACCGAGTCCT‑TGTCGGACAGGTAGACGCTGCGCACCTCGCGTGCGGCCAGTTCGGCGCGGACCATCTGCGCCTCATGGc > 8:123639/5‑148 (MQ=255) gcgccGAGCCTGACTCGGAGCAGGCCTTGAGCCAGGCCAGCAGGTCGTGGGCTTCCTGGGCGGCAAACACCGAGTCCT‑TGTCGGACAGGTAGACGCTGCGCACCTCGCGTGCGGCCAGTTCGGCGCGGACCATCTGCGCCTCATGGCCa > 2:123580/4‑149 (MQ=255) cGAGGCAGGCGCGGCGCAGGCCTTGAGCCAGGCCAGCAGGTCGGGGGCTTCCTCGGCGGCAACCACCGAGTCCT‑TGTCGGACAGGTAGACGCTGCGCACCTCGCGTGCGGCCAGCTCGGCGCGGACCATCTGCGCCTCATGGCCATcgc < 2:9421/149‑1 (MQ=255) gTCAGGCTCGGCGCAGGCCTTGAGCCAGGCCAGCAGGTCGTGGGCTTCCTGGGCGGCAAACACCGAGTCCT‑TGTCGGACAGGTAGACGCTGCGCACCTCGCGTGCGGCCAGTTCGGCGCGGACCATCTGCGCCTCATGGCCATCgcgc > 8:112483/1‑148 (MQ=255) gTCAGGCTCGGCGCAGGCCTTGAGCCAGGCCAGCAGGTCGTGGGCTTCCTGGGCGGCAAACACCGAGTCCT‑TGTCGGACAGGTAGACGCTGCGCACCTCGCGTGCGGCCAGTTCGGCGCGGACCATCTGCGCCTCATGGCCATCgcgc < 7:112483/148‑1 (MQ=255) gTCAGGCTCGGCGCAGGCCTTGAGCCAGGCCAGCAGGTCGTGGGCTTCCTGGGCGGCAAACACCGAGTCCT‑TGTCGGACAGGTAGACGCTGCGCACCTCGCGTGCGGCCAGTTCGGCGCGGACCATCTGCGCCTCATGGCCATCGCGCa < 4:320452/149‑1 (MQ=255) tCAGGCTCGGCGCAGGCCTTGAGCCAGGCCAGCAGGTCGTGGGCTTCCTGGGCGGCAAACACCGAGTCCT‑TGTCGGACAGGTAGACGCTGCGCACCTCGCGTGCGGCCAGTTCGGCGCGGACCATCTGCGCCTCATGGCCATCGCGCAc < 4:38849/149‑1 (MQ=255) aGGCTCGGCGCAGGCCTTGAGCCAGGCCAGCAGGTCGTGGGCTTCCTGGGCGGCAAACACCGAGTCCT‑TGTCGGACAGGTAGACGCTGCGCACCTCGCGTGCGGCCAGTTCGGCGCGGACCATCTGCGCCTCATGGCCATCGCGCAc > 2:299409/1‑147 (MQ=255) | GCCAGGTGTCGCGGTACAGGCGAAAACGCATCACCCAGCTCTCCCAGACCCGCTCGTCCTGGTTAAGCCGGTCCAGCGCAGCCAGCGACAGGCCCAGTGTAAGGCTTGCCAGAGCAGCCTTGAGCAGGCGCTCCGAGTCAGGCTCGGCGCAGGCCTTGAGCCAGGCCAGCAGGTCGTGGGCTTCCTGGGCGGCAAACACCGAGTCCT‑TGTCGGACAGGTAGACGCTGCGCACCTCGCGTGCGGCCAGTTCGGCGCGGACCATCTGCGCCTCATGGCCATCGCGCAC > NC_002947/5301753‑5302038 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |