Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_002947 | 5,761,304 | T→A | 6.4% | L119Q (CTG→CAG) | gpmI → | 2,3‑bisphosphoglycerate‑independent phosphoglycerate mutase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_002947 | 5,761,304 | 0 | T | A | 6.4% | 294.9 / 7.0 | 94 | L119Q (CTG→CAG) | gpmI | 2,3‑bisphosphoglycerate‑independent phosphoglycerate mutase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (46/42); new base A (3/3); total (49/45) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.49e-01 |
Only 100 of 101 total aligned reads displayed.
CCTCGGCGCAGGTCGCGTCGTGTATCAGGACTTCACGCGGGTGACCAAGGCCATCCGCGACGGCGAGTTCTTCGAAAACCCGGTACTGACCGGTGCTGTGGACAAGGCAGTCGGTGCTGGCAAGGCCGTGCACATCCTCGGACTGCTGTCCGATGGTGGTGTACACAGCCACCAGGACCACTTGGTGGCCATGGCCGAACTGGCCGCCCAGCGTGGCGCTGAAAAGATCTACCTGCACGCCTTCCTCGATGGCCGCGACACCCCGCCACGCAGCGCGCAGTCGTCCATCGAACT > NC_002947/5761158‑5761451 | ccTCGGCGCAGGTCGCGTCGTGTATCAGGACTTCACGCGGGTGACCAAGGCCATCCGCGACGGCGAGTTCTTCGAAAACCCGGTACTGACCGGTGCTGTGGACAAGGCAGTCGGTGCTGGCAAGGCCGTGCACATCCTCGGACTGCTGt < 6:116272/149‑1 (MQ=255) cTCGGCGCAGGTCGCGTCGTGTATCAGGACTTCACGCGGGTGACCAAGGCCATCCGCGACGGCGAGTTCTTCGAAAACCCGGTACTGACCGGTGCTGTGGACAAGGCAGTCGGTGCTGGCAAGGCCGTGCACATCCTCGGACTGCTGTc > 8:13048/1‑149 (MQ=255) gcgcAGGTCGCGTCGTGTATCAGGACTTCACGCGGGTGACCAAGGCCATCCGCGACGGCGAGTTCTTCGAAAACCCGGTACTGACCGGTGCTGTGGACAAGGCAGTCGGTGCTGGCAAGGCCGTGCACATCCTCGGGCTGCTGTCCGAt < 6:435837/149‑1 (MQ=255) cgcAGGTCGCGTCGTGTATCAGGACTTCACGCGGGTGACCAAGGCCATCCGCGACGGCGAGTTCTTCGAAAACCCGGTACTGACCGGTGCTGTGGACAAGGCAGTCGGTGCTGGCAAGGCCGTGCACATCCTCGGACAGCAGTCCGagg < 7:159659/149‑3 (MQ=255) aGGTCGCGTCGTGTATCAGGACTTCACGCGGGTGACCAAGGCCATCCGCGACGGCGAGTTCTTCGAAAACCCGGTACTGACCGGTGCTGTGGACAAGGCAGTCGGTGCTGGCAAGGCCGTGCACATCCTCGGACTGCTGTCCGAtggtg < 3:371465/149‑1 (MQ=255) aGGTCGCGTCGTGTATCAGGACTTCACGCGGGTGACCAAGGCCATCCGCGACGGCGAGTTCTTCGAAAACCCGGTACTGACCGGTGCTGTGGACAAGGCAGTCGGTGCTGGCAAGGCCGTGCACATCCTCGGACTGCTGTCCGAtggtg < 2:284822/149‑1 (MQ=255) aGGTCGCGTCGTGTATCAGGACTTCACGCGGGTGACCAAGGCCATCCGCGACGGCGAGTTCTTCGAAAACCCGGTACTGACCGGTGCTGTGGACAAGGCAGTCGGTGCTGGCAAGGCCGTGCACATCCTCGGACAGCAGTCCGaggatg < 4:408833/149‑6 (MQ=255) tCGCGTCGTGTATCAGGACTTCACGCGGGTGACCAAGGCCATCCGCGACGGCGAGTTCTTCGAAAACCCGGTACTGACCGGTGCTGTGGACAAGGCAGTCGGTGCTGGCAAGGCCGTGCACATCCTCGGACTGCTGTCCGATGgtggtg < 2:365027/149‑1 (MQ=255) tCGCGTCGTGTATCAGGACTTCACGCGGGTGACCAAGGCCATCCGCGACGGCGAGTTCTTCGAAAACCCGGTACTGACCGGTGCTGTGGACAAGGCAGTCGGTGCTGGCAAGGCCGTGCACATCCTCGGACTGCTGTCCGATGgtggtg > 8:370510/1‑149 (MQ=255) gcgcgTCGTGTATCAGGACTTCACGCGGGTCACCAAGGCCATCCGCGACGGCGAGTGCTTCGAAAACCCGGTACTGACCGGTGCTGTGGACAAGGCAGTCGGTGCTGGCAAGGCCGTGCACATCCTCGGACTGCTGTCCGATGgtggtg < 4:311933/148‑1 (MQ=255) cgcgTCGTGTATCAGGACTTCACGCGGGTGACCAAGGCCATCCGCGACGGCGAGTTCTTCGAAAACCCGGTACTGACCGGTGCTGTGGACAAGGCAGTCGGTGCTGGCAAGGCCGTGCACATCCTCGGACTGCTGTCCGATGGTGgtgt < 3:312511/149‑1 (MQ=255) gcgTCGTGTATCAGGACTTCACGCGGGTGACCAAGGCCATCCGCGACGGCGAGTTCTTCGAAAACCCGGTACTGACCGGTGCTGTGGACAAGGCAGTCGGTGCTGGCAAGGCCGTGCACATCCTCGGACTGCTGTCCGATGGTGgtgt < 7:135741/148‑1 (MQ=255) gcgTCGTGCATCAGGACTTCACGCGGGTGACCAAGGCCATCCGCGACGGCGAGTTCTTCGAAAACCCGGTACTGACCGGTGCTGTGGACAAGGCAGTCGGTGCTGGCAAGGCCGTGCACATCCTCGGACTGCTGTCCGATGGTGgtgt < 3:184452/148‑1 (MQ=255) cgtcgtGTATCAGGACTTCACGCGGGTGACCAAGGCCATCCGCGACGGCGAGTTCTTCGAAAACCAGGTACTGACCGGTGCTGTGGACAAGGCAGTCGGTGCTGGCAAGGCCGTGCACATCCTCGGACTGCTGTCCGATGGTGGTGTa > 6:86079/1‑148 (MQ=255) gtcgtGTATCAGGACTTCACGCGGGTGACCAAGGCCATCCGCGACGGCGAGTTCTTCGAAAACCCGGTACTGACCGGTGCTGTGGACAAGGCAGTCGGTGCTGGCAAGGCCGTGCACATCCTCGGACTGCTGTCCGATGGTGGTGTaca < 5:426002/149‑1 (MQ=255) cgtGTATCAGGACTTCACGCGGGTGACCAAGGCCATCCGCGACGGCGAGTTCTTCGAAAACCCGGTACTGACCGGTGCTGTGGACAAGGCAGTCGGTGCTGGCAAGGCCGTGCACATCCTCGGACTGCTGTCCGATGGTGGTGTAcaca < 3:293002/149‑1 (MQ=255) gtgtATCAGGACTTCACGCGGGTGACCAAGGCCATCCGCGACGGCGAGTTCTTCGAAAACCCGGTACTGACCGGTGCTGTGGACAAGGCAGTCGGTGCTGGCAAGGCCGTGCACATCCTCGGACTGCTGTCCGATGGTGGTGTAcaca < 7:289725/148‑1 (MQ=255) aTCAGGACTTCACGCGGGTGACCAAGGCCATCCGCGACGGCGAGTTCTTCGAAAACCCGGTACTGACCGGTGCTGTGGACAAGGCAGTCGGTGCTGGCAAGGCCGTGCACATCCTCGGACTGCTGTCCGATGGTGGTGTACACAGccac > 2:26976/1‑149 (MQ=255) tCAGGACTTCACGCGGGTGACCAAGGCCATCCGCGACGGCGAGTTCTTCGAAAACCCGGTACTGACCGGTGCTGTGGACAAGGCAGTCGGTGCTGGCAAGGCCGTGCACATCCTCGGACTGCTGTCCGAtggt > 5:250909/1‑133 (MQ=255) tCAGGACTTCACGCGGGTGACCAAGGCCATCCGCGACGGCGAGTTCTTCGAAAACCCGGTACTGACCGGTGCTGTGGACAAGGCAGTCGGTGCTGGCAAGGCCGTGCACATCCTCGGACTGCTGTCCGAtggt < 6:250909/133‑1 (MQ=255) tCAGGACTTCACGCGGGTGACCAAGGCCATCCGCGACGGCGAGTTCTTCGAAAACCCGGTACTGACCGGTGCTGTGGACAAGGCAGTCGGTGCTGGCAAGGCCGTGCACATCATCGGACAGCAGTCCGaggat < 6:285596/133‑5 (MQ=255) tCAGGACTTCACGCGGGTGACCAAGGCCATCCGCGACGGCGAGTTCTTCGAAAACCCGGTACTGACCGGTGCTGTGGACAAGGCAGTCGGTGCTGGCAAGGCCGTGCACATCATCGGACAGCAGTCCGaggat > 5:285596/1‑129 (MQ=255) cAGGACTTCACGCGGGTGACCAAGGCCATCCGCGACGGCGAGTTCTTCGAAAACCCGGTACTGACCGGTGCTGTGGACAAGGCAGTCGGTGCTGGCAAGGCCGTGCACATCCTCGGACTGCTGTCCGATGGTGGTGTACACAGccac > 7:68878/1‑147 (MQ=255) ggACTTCACGCGGGTGACCAAGGCCATCCGCGACGGCGAGTTCTTCGAAAACCCGGTACTGACCGGTGCTGTGGACAAGGCAGTCGGTGCTGGCAAGGCCGTGCACATCCTCGGACTGCTGTCCGAt < 7:192834/127‑1 (MQ=255) 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gcgGGTGACCAAGGCCATCCGCGACGGCGAGTTCTTCGAAAACCCGGTACTGACCGGTGCTGTGGACAAGGCAGTCGGTGCTGGCAAGGCCGTGCACATCCTCGGACTGCTGTCCGATGGTGGTGTACACAGCCACCAGGACCACTtgg > 6:84076/1‑149 (MQ=255) cgGGTGACCAAGGCCATCCGCGACGGCGAGTTCTTCGAAAACCCGGTACTGACCGGTGCTGTGGACAAGGCAGTCGGTGCTGGCAAGGCCGTGCACATCCTCGGACTGCTGTCCGATGGTGGTGTACACAGCCACCAGGACCACTtggt < 2:65366/149‑1 (MQ=255) gggTGACCAAGGCCATCCGCGACGGCGAGTTCTTCGAAAACCCGGTACTGACCGGTGCTGTGGACAAGGCAGTCGGTGCTGGCAAGGCCGTGCACATCCTCGGACTGCTGTCCGATGGTGGTGTACACAGCCACCAGGACCACTtggtg < 7:333652/149‑1 (MQ=255) gggTGACCAAGGCCATCCGCGACGGCGAGTTCTTCGAAAACCCGGTACTGACCGGTGCTGTGGACAAGGCAGTCGGTGCTGGCAAGGCCGTGCACATCCTCGGACTGCTGTCCGATGGTGGTGTACACAGCCACCAGGACCACTtggtg > 8:202936/1‑149 (MQ=255) gTGACCAAGGCCATCCGCGACGGCGAGTTCTTCGAAAACCCGGTACTGACCGGTGCTGTGGACAAGGCAGTCGGTGCTGGCAAGGCCGTGCACATCCTCGGACTGCTGTCCGATGGTGGTGTACACAGCCACCAGGACCACTTGGTGGc < 5:86079/149‑1 (MQ=255) 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cTCGGACTGCTGTCCGATGGTGGTGTACACCGCCACCAGGACCACTTGGTGGCCATGGCCGAACTGGCCGCCCAGCGTGGCGCTGAAAAGATCTACCTGCACGCCTTCCTCGATGGCCGCGACACCCCGCCACGCAGCGCGCAgtcgtc > 7:58640/1‑149 (MQ=255) cTCGGACTGCTGTCCGATGGTGGTGTACACAGCCACCAGGACCACTTGGTGGCCATGGCCGAACTGGCCGCCCAGCGTGGCGCTGAAAAGATCTACCTGCACGCCTTCCTCGATGGCCGCGACACCCCGCCACGCAGCGCGCAgtcgtc > 1:12670/1‑149 (MQ=255) cTCGGACTGCTGTCCGATGGTGGTGTACACAGCCACCAGGACCACTTGGTGGCCATGGCCGAACTGGCCGCCCAGCGTGGCGCTGAAAAGATCTACCTGCACGCCTTCCTCGATGGCCGCGACACCCCGCCACGCAGCGCGCAgtcgt < 4:69597/148‑1 (MQ=255) cGGACTGCTGTCCGATGGTGGTGTACACAGCCACCAGGACCACTTGGTGGCCATGGCCGAACTGGCCGCCCAGCGTGGCGCTGAAAAGATCTACCTGCACGCCTTCCTCGATGGCCGCGACACCCCGCCACGCAGCGCGCAGTCGTCCa > 2:435591/1‑149 (MQ=255) gACTGCTGTCCGATGGTGGTGTACACAGCCACCAGGACCACTTGGTGGCCATGGCCGAACTGGCCGCCCAGCGTGGCGCTGAAAAGATCTACCTGCACGCCTTCCTCGATGGCCGCGACACCCCGCCACGCAGCGCGCAGTCGTCCATc < 7:288503/149‑1 (MQ=255) 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ctgTCCGATGGTGGTGTACACAGCCACCAGGACCACTTGGTGGCCATGGCCGAACTGGCCGCCCAGCGTGGCGCTGAAAAGATCTACCTGCACGCCTTCCTCGATGGCCGCGACACCCCGCCACGCAGCGCGCAGTCGTCCATCGaa < 8:248384/147‑1 (MQ=255) ctgTCCGATGGTGGTGTACACAGCCACCAGGACCACTTGGTGGCCATGGCCGAACTGGCCGCCCAGCGTGGCGCTGAAAAGATCTACCTGCACGCCTTCCTCGATGGCCGCGACACCCCGCCACGCAGCGCGCAGTCGTCCATCGAACt > 7:256605/1‑149 (MQ=255) tgTCAGATGGTGGTGTACACAGCCACCAGGACCACTTGGTGGCCATGGCCGAACTGGCCGCCCAGCGTGGCGCTGAAAAGATCTACCTGCACGCCTTCCTAGATGGCCGCGACACCCCGCCACGCAGCGCGCAGTCGTCCATCGAACt > 3:54831/1‑148 (MQ=255) | CCTCGGCGCAGGTCGCGTCGTGTATCAGGACTTCACGCGGGTGACCAAGGCCATCCGCGACGGCGAGTTCTTCGAAAACCCGGTACTGACCGGTGCTGTGGACAAGGCAGTCGGTGCTGGCAAGGCCGTGCACATCCTCGGACTGCTGTCCGATGGTGGTGTACACAGCCACCAGGACCACTTGGTGGCCATGGCCGAACTGGCCGCCCAGCGTGGCGCTGAAAAGATCTACCTGCACGCCTTCCTCGATGGCCGCGACACCCCGCCACGCAGCGCGCAGTCGTCCATCGAACT > NC_002947/5761158‑5761451 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |