Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 5,793,887 | A→T | 5.2% | L1338Q (CTG→CAG) | gltB ← | L‑glutamate synthase subunit alpha |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 5,793,887 | 0 | A | T | 5.2% | 336.4 / 5.2 | 108 | L1338Q (CTG→CAG) | gltB | L‑glutamate synthase subunit alpha |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (49/53); new base T (2/4); total (51/57) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.82e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 108 total aligned reads displayed.
GAACCGAAGTTGTAACCGGTCTTGCCCAGAACGCAGACAAAGCCGCCGGTCATGTATTCACAGCAGTGATCGCCAGTGCCCTCGACAACAGCATGGGCGCCGGAGT‑TACGTACAGCGAAGCGCTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCAGTGGCACCGTACAGGCAGGTGTTGCCGACGATGGCGCTGTGCTGGGTTTCGAACGGGCTGCCGGCTGGCGGCACGATGGTGACCTTGCCACCGGTCATGCCTTTGCCGACGTAATCGTTGGCGTCGCCTTCCAGGT > NC_002947/5793740‑5794034 | gAACCGAAGTTGTAACCGGTCTTGCCCAGAACGCAGACAAAGCCGCCGGTCATGTATTCACAGCAGTGATCGCCAGTGCCCTCGACAACAGCATGGGCGCCGGAGT‑TACGTACAGCGAAGCGCTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAg < 6:345017/149‑1 (MQ=255) gAACCGAAGTTGTAACCGGTCTTGCCCAGAACGCAGACAAAGCCGCCGGTCATGTATTCACAGCAGTGATCGCCAGTGCCCTCGACAACAGCATGGGCGCCGGAGT‑TACGTACAGCGAAGCGCTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAg > 5:121657/1‑149 (MQ=255) gAACCGAAGTTGTAACCGGTCTTGCCCAGAACGCAGACAAAGCCGCCGGTCATGTATTCACAGCAGTGATCGCCAGTGCCCTCGACAACAGCATGGGCGCCGGAGT‑TACGTACAGCGAAGCGCTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAg < 3:142826/149‑1 (MQ=255) aaCCGAAGTTGTAACCGGTCTTGCCCAGAACGCAGACAAAGCCGCCGGTCATGTATTCACAGCAGTGATCGCCAGTGCCCTCGACAACAGCATGGGCGCCGGAGT‑TACGTACAGCGAAGCGCTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAGc > 1:317542/1‑149 (MQ=255) cGAAGTTGTAAGCGGTCTTGCCCAGAACGCAGACAAAGCCGCCGGTCATGTATTCACAGCAGTGATCGCCAGTGCCCTCGACAACAGCATGGGCGCCGGAGT‑TACGTTCAGCGAAGCGCTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAGCTTg < 3:1420/149‑1 (MQ=255) gAAGTTGTAACCGGTCTTGCCCAGAACGCAGACAAAGCCGCCGGTCATGTATTCACAGCAGTGATCGCCAGTGCCCTCGACAACAGCATGGGCGCCGGAGT‑TACGTACAGCGAAGCGCTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAGCTTgc < 8:84705/149‑1 (MQ=255) aGTTGTAACCGGTCTTGCCCAGAACGCAGACAAAGCCGCCGGTCATGTATTCACAGCAGTGATCGCCAGTGCCCTCGACAACAGCATGGGCGCCGGAGT‑TACGTACAGCGAAGCGCTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAGCTTgcc < 6:284939/148‑1 (MQ=255) gTAACCGGTCTTGCCCAGAACGCAGACAAAGCCGCCGGTCATGTATTCACAGCAGTGATCGCCAGTGCCCTCGACAACAGCATGGGCGCCGGAGT‑TACGTACAGCGAAGCGCTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAGCTGTTTgccgcag < 6:99623/148‑3 (MQ=255) gTAACCGGTCTTGCCCAGAACGCAGACAAAGCCGCCGGTCATGTATTCACAGCAGTGATCGCCAGTGCCCTCGACAACAGCATGGGCGCCGGAGT‑TACGTACAGCGAAGCGCTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCa < 4:100996/148‑1 (MQ=255) cGGTCTTGCCCAGAACGCAGACAAAGCCGCCGGTCATGTATTCACAGCAGTGATCGCCAGTGCCCTCGACAACAGCATGGGCGCCGGAGT‑TACGTACAGCGAAGCGCTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCAGTGGCa > 3:25757/1‑149 (MQ=255) gTCTTGCCCAGAACGCAGACAAAGCCGCCGGTCATGTATTCACAGCAGTGATCGCCAGTGCCCTCGACAACAGCATGGGCGCCGGAGT‑TACGTACAGCGAAGCGCTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAGCTGTTTgccgc < 4:101685/139‑1 (MQ=255) gTCTTGCCCAGAACGCAGACAAAGCCGCCGGTCATGTATTCACAGCAGTGATCGCCAGTGCCCTCGACAACAGCATGGGCGCCGGAGT‑TACGTACAGCGAAGCGCTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAGCTGTTTgccgc > 3:101685/1‑139 (MQ=255) gCCCAGAACGCAGACAAAGCCGCCGGTCATGTATTCACAGCAGTGATCGCCAGTGCCCTCGACAACAGCATGGGCGCCGGAGT‑TACGTACAGCGAAGCGCTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCAGTGGCACCGTa > 7:161064/1‑147 (MQ=255) ccAGAACGCAGACAAAGCCGCCGGTCATGTATTCACAGCAGTGATCGCCAGTGCCCTCGACAACAGCATGGGCGCCGGAGT‑TACGTACAGCGAAGCGCTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCAGTGGCACCGTAcagg > 2:184166/1‑149 (MQ=255) cAGAACGCAGACAAAGCCGCCGGTCATGTATTCACAGCAGTGATCGCCAGTGCCCTCGACAACAGCATGGGCGCCGGAGT‑TACGTACAGCGAAGCGCTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCa < 5:234540/133‑1 (MQ=255) cAGAACGCAGACAAAGCCGCCGGTCATGTATTCACAGCAGTGATCGCCAGTGCCCTCGACAACAGCATGGGCGCCGGAGT‑TACGTACAGCGAAGCGCTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCa > 6:234540/1‑133 (MQ=255) gACAAAGCCGCCGGTCATGTATTCACAGCAGTGATCGCCAGTGCCCTCGACAACAGCATGGGCGCCGGAGT‑TACGTACAGCGAAGGGCTCGCCCGCAGTACGTTCGGCAAACAGCTTGCCGCCAGTGGCACCGTACAGGCAGGTGTTGc < 6:224933/149‑1 (MQ=255) gACAAAGCCGCCGGTCATGTATTCACAGCAGTGATCGCCAGTGCCCTCGACAACAGCATGGGCGCCGGAGT‑TACGTACAGCGAAGCGCTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCAGTGGCACCGTACAGGCAGGTGTTGc < 4:37073/149‑1 (MQ=255) aCAAAGCCGCCGGTCATGTATTCACAGCAGTGATCGCCAGTGCCCTCGACAACAGCATGGGCGCCGGAGT‑TACGTACAGCGAAGCGCTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCAGTGGCACCGTACAGGCAGGTGTTGcc > 4:131707/1‑149 (MQ=255) aaaGCCGCCGGTCATGTATTCACAGCAGTGATCGCCAGTGCCCTCGACAACAGCATGGGCGCCGGAGT‑TACGTACAGCGAAGCGCTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCAGTGGCACCGTAca < 1:431832/134‑1 (MQ=255) aaaGCCGCCGGTCATGTATTCACAGCAGTGATCGCCAGTGCCCTCGACAACAGCATGGGCGCCGGAGT‑TACGTACAGCGAAGCGCTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCAGTGGCACCGTAca > 2:431832/1‑134 (MQ=255) aaaGCCGCCGGTCATGTATTCACAGCAGTGATCGCCAGTGCCCTCGACAACAGCATGGGCGCCGGAGT‑TACGTACAGCGAAGCGCTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCAGTGGCACCGTACAGGCAGGTGTTGCcga < 4:25757/149‑1 (MQ=255) aaaGCCGCCGGTCATGTATTCACAGCAGTGATCGCCAGTGCCCTCGACAACAGCATGGGCGCCGGAGT‑TACGTACAGCGAAGCGCTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCAGTGGCACCGTACAGGCAGGTGTTGCcga < 8:142620/149‑1 (MQ=255) gccgccGGTCATGTATTCACAGCAGTGATCGCCAGTGCCCTCGACAACAGCATGGGCGCCGGAGT‑TACGTACAGCGAAGCGCTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCAGTGGCACCGTACAGGCAGGTGTTGCcgacga < 1:28840/149‑1 (MQ=255) gccgccGGTCATGTATTCACAGCAGTGATCGCCAGTGCCCTCGACAACAGCATGGGCGCCGGAGT‑TACGTACAGCGAAGCGCTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGACAGTGGCACCGTACAGGCAGGTGTTGCcgacga > 8:401225/1‑149 (MQ=255) cgccgGTCATGTATTCACAGCAGTGATCGCCAGTGCCCTCGACAACAGCATGGGCGCCGGAGT‑TACGTACAGCGAAGCGCTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCAGTGGCACCGTACAGGCAGGTGTTGCCGACGATg < 2:317542/149‑1 (MQ=255) cgGTCATGTATTCACAGCAGTGATCGCCAGTGCCCTCGACAACAGCATGGGCGCCGGAGT‑TACGTACAGCGAAGCGCTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCAGTGGCACCGTACAGGCAGGTGTTGCCGACGATGgcg > 3:286793/1‑149 (MQ=255) gTATTCACAGCAGTGATCGCCAGTGCCCTCGACAACAGCATGGGCGCCGGAGTGTACGTACAGCGAAGCGCTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCAGTGGCACCGTACAGGCAGGTGTTGCCGACGATGGCGCTGTGc > 1:332311/1‑149 (MQ=255) gTATTCACAGCAGTGATCGCCAGTGCCCTCGACAACAGCATGGGCGCCGGAGT‑TACGTACAGCGAAGCGCTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCAGTGGCACCGTACAGGCAGGTGTTGCCGACGATGGCGCTGTGCt > 5:165738/1‑149 (MQ=255) gTATTCACAGCAGTGATCGCCAGTGCCCTCGACAACAGCATGGGCGCCGGAGT‑TACGTACAGCGAAGCGCTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCAGTGGCACCGTACAGGCAGGTGTTGCCGACGATGGCGCTGTGCt > 7:10522/1‑149 (MQ=255) cacaGCAGTGATCGCCAGTGCCCTCGACAACAGCATGGGCGCCGGAGT‑TACGTACAGCGAAGCGCTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCAGTGGCACCGTACAGGCAGGTGTTGCCGACGATGGCGCTGTGCTGGGt < 3:119220/148‑1 (MQ=255) acaGCAGTGATCGCCAGTGCCCTCGACAACAGCATGGGCGCCGGAGT‑TACGTACAGCGAAGCGCTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCAGTGGCACCGTACAGGCAGGTGTTGCCGACGATGGCGCTGTGCTGGGttt > 8:213067/1‑149 (MQ=255) acaGCAGTGATCGCCAGTGCCCTCGACAACAGCATGAGCGCCGGAGT‑TACGTACAGCGAAGCGCTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCAGTGGCACCGTACAGGCAGGTGTTGCCGACGATGGCGCTGTGCTGGGttt > 1:290904/1‑149 (MQ=255) cagcagTGATCGCCAGTGCCCTCGACAACAGCATGGGCGCCGGAGT‑TACGTACAGCGAAGCGCTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCAGTGGCACCGTACAGGCAGGTGTTGCCGACGATGGCGCTGTGCTGGGTTTc > 1:201290/1‑149 (MQ=255) cagcagTGATCGCCAGTGCCCTCGACAACAGCATGGGCGCCGGAGT‑TACGTACAGCGAAGCGCTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCAGTGGCACCGTACAGGCAGGTGTTGCCGACGATGGCGCTGTGCTGGGTTTc > 7:154668/1‑149 (MQ=255) agcagTGATCGCCAGTGCCCTCGACAACAGCATGGGCGCCGGAGT‑TACGTACAGCGAAGCGCTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCAGTGGCACCGTACAGGCAGGTGTTGCCGACGATGGCGCTGTGCTGGGTTTc > 1:400787/1‑148 (MQ=255) agcagTGATCGCCAGTGCCCTCGACAACAGCATGGGCGCAGGAGT‑TACGTACAGCGAAGCGCTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCAGAGGCACCGTACAGGCAGGTGTTGCCGACGATGGCGCTGTGCTGGGTTTc > 6:43344/1‑148 (MQ=255) gTGATCGCCAGTGCCCTCGACAACAGCATGGGCGCCGGAGT‑TACGTACAGCGAAGCGCTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCAGTGGCACCGTACAGGCAGGTGTTGCCGACGATGGCGCTGTGCTGGGTTTCGAACg > 4:67437/1‑149 (MQ=255) tGATCGCCAGTGCCCTCGACAACAGCATGGGCGCCGGAGT‑TACGTACAGCGAAGCGCTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCAGTGGCACCGTACAGGCAGGTGTTGCCGACGATGGCGCTGTGCTGGGTTTCGAACgg < 6:165738/149‑1 (MQ=255) aTCGCCAGTGCCCTCGACAACAGCATGGGCGCCGGAGT‑TACGTACAGCGAAGCGCTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCAGTGTCACCGTACAGGCAGGTGTTGCCGACGATGGCTCTTGGGTGGGTTTCTAACGGGc > 8:313372/1‑149 (MQ=255) tCGCCAGTGCCCTCGACAACAGCATGGGCGCCGTAGT‑TACGTACAGCGAAGCGCTCGCCCGCATTACCTTCGGAAAACAGCTTGGCGCCAGTGGCACCGTACAGGCAGGTGTTGCCGACGATGGCGCTGTGCTGGGTTTCGAACGGGc < 3:367472/148‑1 (MQ=255) gCCAGTGCCCCCGACAACAGCAGGCGCTCCGGAGT‑TACGTACAGCGAAGCGCTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCAGTGGCACCGTACAGGCAGGTGTTGCCGACGATGGCGCTGTGCTGGGTTTCGAACGGGCTGc < 4:158827/149‑1 (MQ=255) ccAGTGCCCTCGACAACAGCATGGGCGCCGGAGT‑TACGTACAGCGAAGCGCTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCAGTGGCACCGTACAGGCAGGTGTTGCCGACGATGGCGCTGTGCTGGGTTTCGAACGGGCTGcc > 3:126037/1‑149 (MQ=255) ccAGTGCCCTCGACAACAGCATGGGCGCCGGAGT‑TACGTACAGCGAAGCGCTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCAGTGGCACCGTACAGGCAGGTGTTGCCGACGATGGCGCTGTGATGGGTTTCGAACGGGCTGcc > 5:203165/1‑149 (MQ=255) tCGACAACAGCATGGGCGCCGGAGT‑TACGTACAGCGAAGCGCTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCAGTGGCACCGTACAGGCAGGTGTTGCCGACGATGGCGCTGTGCTGGGTTTCGAACGGGCTGCCGGCTggcgg > 7:299141/1‑149 (MQ=255) gACAACAGCATGGGCGCCGGAGT‑TACGTACAGCGAAGCGCTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCAGTGGCACCGTACAGGCAGGTGTTGCCGACGATGGCGCTGTGCTGGGTTTCGAACGGGCTGCCGGCTggcgg < 2:290904/147‑1 (MQ=255) gACAACAGCATGGGCGCCGGAGT‑TACGTACAGCGAAGCGCTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCAGTGGCACCGTACAGGCAGGTGTTGCCGACGATGGCGCTGTGCTGGGTTTCGAACGGGCTGCCGGCTGGCGGCa < 8:161064/149‑1 (MQ=255) aacaGCATGGGCGCCGGAGT‑TACGTACAGCGAAGCGCTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCAGTGGCACCGTACAGGCAGGTGTTGCCGACGATGGCGCTGTGCTGGGTTTCGAACGGGCTGCCGGCTGGCGGCACGa < 1:184166/149‑1 (MQ=255) caGCATGGGCGCCGGAGT‑TACGTACAGCGAAGCGCTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCAGTGGCACCGTACAGGCAGGTGTTGCCGACGATGGCGCTGTGCTGGGTTTCGAACGGGCTGCCGGCTGGCGGCACGATg > 5:264385/1‑149 (MQ=255) caGCATGGGCGCCGGAGT‑TACGTACAGCGAAGCGCTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCAGTGGCACCGTACAGGCAGGTGTTGCCGACGATGGCGCTGTGCTGGGTTTCGAACGGGCTGCCGGCTGGCGGCACGATg < 5:49105/149‑1 (MQ=255) caGCATGGGCGCCGGAGT‑TACGTACAGCGAAGCGCTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCAGTGGCACCGTACAGGCAGGTGTTGCCGACGATGGCGCTGTGCTGGGTTTCGAACGGGCTGCCGGCTGGCGGCACGATg < 2:141571/149‑1 (MQ=255) caGCATGGGCGCCGGAGT‑TACGTACAGCGAAGCGCTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCAGTGGCACCGTACAGGCAGGTGTTGCCGACGATGGCGCTGTGCTGGGTTTCGAACGGGCTGCCGGCTGGCGGCACGATg > 6:221787/1‑149 (MQ=255) caGCATGGGCGCCGGAGT‑TACGTACAGCGAAGCGCTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCAGTGGCACCGTACAGGCAGGTGTTGCCGACGATGGCGCTGTGCTGGGTTTCGAACGGGCTGCCGGCTGGCGGCACGATg > 2:31400/1‑149 (MQ=255) cATGGGCGCCGGAGT‑TACGTACAGCGAAGCGCTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCAGTGGCACCGTACAGGCAGGTGTTGCCGACGATGGCGCTGTGCTGGGTTTCGAACGGGCTGCCGGCTGGCGGCACGATGGTg < 4:286793/149‑1 (MQ=255) cATGGGCGCCGGAGT‑TACGTACAGCGAAGCGCTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCAGTGGCACCGTACAGGCAGGTGTTGCCGACGATGGCGCTGAGCTGGGTTTCGAACGGGCTGCCGGCTGGCGGCACGATGGTg > 5:370783/1‑149 (MQ=255) tGGGCGCCGGAGT‑TACGTACAGCGAAGCGCTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCAGTGGCACCGTACAGGCAGGTGTTGCCGACGATGGCGCTGTGCTGGGTTTCGAACGGGCTGCCGGCTGGCGGCACGATGGTGAc > 7:397323/1‑149 (MQ=255) tGGGCGCCGGAGT‑TACGTACAGCGAAGCGCTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCAGTGGCACCGTACAGGCAGGTGGTGCCGACGATGGCGCTGTGCTGGGTTTCGAACGGGCTGCCGGCTGGCGGCACGATGGTGAc < 5:262071/149‑1 (MQ=255) gggCGCCGGAGT‑TACGTACAGCGAAGCGCTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCAGTGGCACCGTACAGGCAGGTGTTGCCGACGATGGCGCTGTGCTGGGTTTCGAACGGGCTGCCGGCTGGCGGCACGATGGTGAcc > 6:384096/1‑149 (MQ=255) ggCGCCGGAGT‑TACGTACAGCGAAGCGCTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCAGTGGCACCGTACAGGCAGGTGTTGCCGACGATGGCGCTGTGCTGGGTTTCGAACGGGCTGCCGGCTGGCGGCACGATGGTGAcc < 4:126037/148‑1 (MQ=255) gcgcCGGAGT‑TACGTACCGCGAAGCGCTCGCCCGCAGTACCTGCCGCAACCAGCTTGCCGCCAGTGGCACCGTACAGCCAGCTGTTGCCGACGATGGCGCTGTGCTTGGTTTCGAACGGGCTGCCGGCTGGCGGCACGATGGTGACCtt < 7:367353/149‑1 (MQ=255) gcgcCGGAGT‑TACGTACAGCGAAGCGCTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCAGTGGCACCGTACAGGCAGGTGTTGCCGACGATGGCGCTGTGCTGGGTTTCGAACGGGCTGCCGGCTGGCGGCACGATGGTGACCtt < 8:227311/149‑1 (MQ=255) gcgcCGGAGT‑TACGTACAGCGAAGCGCTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCAGTGGCACCGTACAGGCAGGTGTTGCCGACGATGGCGCTGTGCTGGGTTTCGAACGGGCTGCCGGCTGGCGGCACGATGGTGACCtt < 8:10522/149‑1 (MQ=255) gcgcCGGAGT‑TACGTACAGCGAAGCGCTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCAGTGGCACCGTACAGGCAGGTGTTGCCGACGATGGCGCTGTGCTGGGTTTCGAACGGGCTGCCGGCTGGCGGCACGATGGTGACCtt > 6:6498/1‑149 (MQ=255) gcCGGAGT‑TACGTACAGCGAAGCGCTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCAGTGGCACCGTACAGGCAGGTGTTGCCGACGATGGCGCTGTGCTGGGTTTCGAACGGGCTGCCGGCTGGCGGCACGATg > 8:69902/1‑139 (MQ=255) gcCGGAGT‑TACGTACAGCGAAGCGCTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCAGTGGCACCGTACAGGCAGGTGTTGCCGACGATGGCGCTGTGCTGGGTTTCGAACGGGCTGCCGGCTGGCGGCACGATg < 7:69902/139‑1 (MQ=255) gAGT‑TACGTACAGCGAAGCGCTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCAGTGGCACCGTACAGGCAGGACTTGCCGACGATGGCGCTGTGCTGGGATTCGAACGGGCTGACGGCTGGCGGCACGATGGTGACCTTGCCAcc > 3:237099/1‑149 (MQ=255) aGT‑TACGTACAGCGAAGCGCTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCAGTGGCACCGTACAGGCAGGTGTTGCCGACGATGGCGCTGTGCTGGGTTTCGAACGGGCTGCCGGCTGGCGGCACGATGGTGACCTTGCCACCg < 3:131707/149‑1 (MQ=255) aCGTACAGCGAAGCGCTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCAGTGGCACCGTACAGGCAGGTGTTGCCGACGATGGCGCTGTGCTGGGTTTCGAACGGGCTGCCGGCTggc > 3:202449/1‑121 (MQ=255) aCGTACAGCGAAGCGCTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCAGTGGCACCGTACAGGCAGGTGTTGCCGACGATGGCGCTGTGCTGGGTTTCGAACGGGCTGCCGGCTggc < 4:202449/121‑1 (MQ=255) aCGTACAGCGAAGCGCTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCAGTGGCACCGTACAGGCAGGTGTTGCCGACGATGGCGCTGTGCTGGGTTTCGAACGGGCTGCCGGCTGGCGGCACGATGGTGACCTTGCCACCGGTCa > 5:295595/1‑149 (MQ=255) cGTACAGCGAAGCGCTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCAGTGGCACCATACAGGCAGGTGTTGCCGACGATGGCGCTGTGCTGGGTTTCGAACGGGCTGCCGGCTGGCGGCACGATGGTGACCTTGCCACCGGTCAt < 8:290159/149‑1 (MQ=255) gTACAGCGAAGCGCTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCAGTGGCACCGTACAGGCAGGTGTTGCCGACGATGGCGCTGTGCTGGGTTTCGAACGGGCTGCCGGCTGGCGGCACGATGGTGACCTTGCCACCGGTCATg > 6:409856/1‑149 (MQ=255) gTACAGCGAAGCGCTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCAGTGGCACCGTACAGGCAGGTGTTGCCGACGATGGCGCTGTGCTGGGTTTCGAACGGGCTGCCGGCTGGCGGCACGATGGTGACCTTGCCACCGGTCATg > 3:363296/1‑149 (MQ=255) tACAGCGAAGCGCTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCAGTGGCACCGTACAGGCAGGTGTTGCCGACGATGGCGCTGTGCTGGGTTTCGAACGGGCTGCCGGCTGGCGGCACGATGGTGACCTTGCCACCGGTCATGc > 2:152580/1‑149 (MQ=255) tACAGCGAAGCGCTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCAGTGGCACCGTACAGGCAGGTGTTGCCGACGATGGCGCTGTGCTGGGTTTCGAACGGGCTGCCGGCTGGCGGCACGATGGTGACCTTGCCACCGGTCATGc > 1:20260/1‑149 (MQ=255) aGCGAAGCGCTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCAGTGGCACCGTACAGGCAGGTGTTGCCGACGATGGCGCTGTGCTGGGTTTCGAACGGGCTGCCGGCTGGCGGCACGATGGTGACCTTGCCACCGGTCATGCCtt > 5:143028/1‑149 (MQ=255) gAAGCGCTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCAGTGGCACCGTACAGGCAGGTGTTGCCGACGATGGCGCTGTGCTGGGTTTCGAACGGGCTGCCGGCTGGCGGCACGATGGTGACCTTGCCACCGGTCATGCCTTTGc < 1:31400/149‑1 (MQ=255) cgcTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCAGTGGCACCGTACAGGCAGGTGTTGCCGACGATGGCGCTGTGCTGGGTTTCGAACGGGCTGCCGGCTGGCGGCACGATGGTGACCTTGCCACCGGTCATGCCTTTGCCGAc < 6:264385/149‑1 (MQ=255) cgcTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCAGTGGCACCGTACAGGCAGGTGTTGCCGACGATGGCGCTGTGCTGGGTTTCGAACGGGCTGCCGGCTGGCGGCACGATGGTGACCTTGCCACCGGTCATGCCTTTGCCGAc < 3:72834/149‑1 (MQ=255) cGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCAGTGGCACCGTACAGGCAGGTGTTGCCGACGATGGCGCTGTGCTGGGTTTCGAACGGGCTGCCGGCTGGCGGCACGATGGTGACCTTGCCACCGGTCATGCCTTTGCCGACGTaa > 5:185884/1‑149 (MQ=255) ccGCAGTACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCAGTGGCACCGTACAGGCAGGTGTTGCCGACGATGGCGCTGTGCTGGGTTTCGAACGGGCTGCCGGCTGGCGGCACGATGGTGACCTTGCCACCGGTCATGCCTTTGCCGACGTAATCg > 8:206476/1‑149 (MQ=255) gCAGTACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCAGTGGCACCGTACAGGCAGGTGTTGCCGACGATGGCGCTGTGCTGGGTTTCGAACGGGCTGCCGGc > 7:106261/1‑95 (MQ=255) gCAGTACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCAGTGGCACCGTACAGGCAGGTGTTGCCGACGATGGCGCTGTGCTGGGTTTCGAACGGGCTGCCGGCTGGCGGCACGATGGTGACCTTGCCACCGGTCATGCCTTTGCCGACGTAATCGtt < 6:295595/149‑1 (MQ=255) gCAGTACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCAGTGGCACCGTACAGGCAGGTGTTGCCGACGATGGCGCTGTGCTGGGTTTCGAACGGGCTGCCGGCTGGCGGCACGATGGTGACCTTGCCACCGGTCATGCCTTTGCCGACGTAATCGtt > 4:251020/1‑149 (MQ=255) cattACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCAGTGGCACCGTACAGGCAGGTGTTGCCGACGATGGCTCTGTGCTGGGTTTCGAACGGGCTGCCGGCTGGCGGCACGATGGTGACCTTGCCACCGGTCATGCCTTTGCCGACGTAATCGTTg < 6:121657/146‑1 (MQ=255) cAGTACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCAGTGGCACCGTACAGGCAGGTGTTGCCGACGATGGCGCTGTGCTGGGTTTCGAACGGGCTGCCGGCTGGCGGCACGATGGTGACCTTGCCACCGGTCATGCCTTTGCCGACGTAATCGTTg < 8:154668/149‑1 (MQ=255) cAGTACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCAGTGGCACCGTACAGGCAGGTGTTCCCGACGATGGCGCTGTGCTGGGTTTCGAACGGGCTGCCGGCTGGCGGCACGATGGTGACCTTGCCACCGGTCATGCCTTTGCCGACGTAATCGTTg < 2:201290/149‑1 (MQ=255) gTACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCAGTGGCACCGTACAGGCAGGTGTTGCCGACGATGGCGCTGTGCTGGGTTTCGAACGGGCTGCCGGCTGGCGGCACGATGGTGACCTTGCCACCGGTCATGCCTTTGCCGACGTAATCGTTGGc < 6:143028/149‑1 (MQ=255) gTACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCAGTGGCACCGTACAGGCAGGTGTTGCCGACGATGGCGCTGTGCTGGGTTTCGAACGGGCTGCCGGCTGGCGGCACGATGGTGACCTTGCCACCGGTCATGCCTTTGCCGACGTAATCGTTGGc < 8:299141/149‑1 (MQ=255) tACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCAGTGGCACCGTACAGGCAGGTGTTGCCGACGATGGCGCTGTGCTGGGTTTCGAACGGGCTGCCGGCTGGCGGCACGATGGTGACCTTGCCACCGGTCATGCCTTTGCCGACGTAATCGTTGGCg > 1:275593/1‑149 (MQ=255) actggCGGCAAGCTGTTTGCCGCCAGTGGCACCGTACAGGCAGGTGTTGCCGACGATGGCGCTGTGCTGGGTTTCGAACGGGCTGCCGGCTGGCGGCACGATGGTGACCTTGCCACCGGTCATGCCTTTGCCGACGTAATCGTTGGCGt > 3:103066/5‑149 (MQ=255) atGCGGCAAACAGCTTGCCGCCAGTGGCACCGTACTGTCAGGTTTTGCCGAGGATGGCGCTGTTCTGGGTTTCGACCGGGCTGCCGGCTGGCGGAACGATTGTGACCTTGCCACCGGTAATGCATTTGCCGACGTAATCGTTGGCGTCg < 2:418892/148‑1 (MQ=255) tGCGGCAAACAGCTTGCCGCCAGTGGCACCGTACAGGCAGGTGTTGCCGACGATGGCGCTGTGCTGGGTTTCGAACGGGCTGCCGGCTGGCGGCACGATGGTGACCTTGCCACCGGTCATGCCTTTGCCGACGTAATCGTTGGCGTc < 1:210883/147‑1 (MQ=255) tGCGGCAAACAGCTTGCCGCCAGTGGCACCGTACAGGCAGGTGTTGCCGACGATGGCGCTGTGCTGGGTTTCGAACGGGCTGCCGGCTGGCGGCACGATGGTGACCTTGCCACCGGTCATGCCTTTGCCGACGTAATCGTTGGCGTc > 2:210883/1‑147 (MQ=255) cGGCAAACAGCTTGCCGCCAGTGGCACCGTACAGGCAGGTGTTGCCGACGATGGCGCTGTGCTGGGTTTCGAACGGGCTGCCGGCTGGCGGCACGATGGTGACCTTGCCACCGGTCATGCCTTTGCCGACGTAATCGTTGGCGTCGcc < 1:152580/148‑1 (MQ=255) cAAACAGCTTGCCGCCAGTGGCACCGTACAGGCAGGTGTTGCCGACGATGGCGCTGTGCTGGGTTTCGAACGGGCTGCCGGCTGGCGGCACGATGGTGACCTTGCCACCGGTCATGCCTTTGCCGACGTAATCGTTGGCGTCGCCTTcc < 3:126334/149‑1 (MQ=255) cAAACAGCTTGCCGCCAGTGGCACCGTACAGGCAGGTGTTGCCGACGATGGCGCTGTGCTGGGTTTCGAACGGGCTGCCGGCTGGCGGCACGATGGTGACCTTGCCACCGGTCATGCCTTTGCCGACGTAATCGTTGGCGTCGCCTTcc < 5:400567/149‑1 (MQ=255) aaCTGCTTGCCGCCAGGGGGACCGTACAGGCAGGGGTTGCCGACGATGGCGCTGTGCTGGGTTTCGACCGGGCTGCCGGCTGGCGGCACGATGGTGACCTTGCCACCGGTCATGCCTTTGCCGACGTAATCGTTGGCGTCGCCTTCCAg < 5:43344/149‑1 (MQ=255) aaCAGCTTGCCGCCAGTGGCACCGTACAGGCAGGTGTTGCCGACGATGGCGCTGTGCTGGGTTTCGAACGGGCTGCCGGCTGGCGGCACGATGGTGACCTTGCCACCGGTCATGCCTTTGCCGACGTAATCGTTGGCGTCGCCTTCCAg < 3:251020/149‑1 (MQ=255) cAGCTTGCCGCCAGTGGCACCGTACAGGCAGGTGTTGCCGACGATGGCGCTGTGCTGGGTTTCGAACGGGCTGCCGGCTGGCGGCACGATGGTGACCTTGCCACCGGTCATGCCTTTGCCGACGTAATCGTTGGCGTCGCCTTCCAGGt < 6:185884/149‑1 (MQ=255) | GAACCGAAGTTGTAACCGGTCTTGCCCAGAACGCAGACAAAGCCGCCGGTCATGTATTCACAGCAGTGATCGCCAGTGCCCTCGACAACAGCATGGGCGCCGGAGT‑TACGTACAGCGAAGCGCTCGCCCGCAGTACCTGCGGCAAACAGCTTGCCGCCAGTGGCACCGTACAGGCAGGTGTTGCCGACGATGGCGCTGTGCTGGGTTTCGAACGGGCTGCCGGCTGGCGGCACGATGGTGACCTTGCCACCGGTCATGCCTTTGCCGACGTAATCGTTGGCGTCGCCTTCCAGGT > NC_002947/5793740‑5794034 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |