| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 6,045,726 | G→T | 5.3% | Q129K (CAG→AAG) ‡ | PP_5298 ← | glutamine amidotransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 6,045,726 | 0 | G | T | 5.3% | 271.3 / 3.7 | 85 | Q129K (CAG→AAG) ‡ | PP_5298 | glutamine amidotransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (39/41); new base T (3/2); total (42/43) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.76e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.70e-01 | |||||||||||
GACCTCGAACTGCGCCACCAACCCCAGGCGCTCGAACAACCCGCCAGGCTCGATGCTGACCGAGTGGCGAGGGCCGTATTGCACCTCCAG‑GGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGGCTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCTGGTAGCCTCGGCAGATGCAGAATACGGGCACACCGACGGCAATGGCTGCCTGCAACAGCGGCAGGGTCAGGCGATCACGCGCCAGATCATGCCGGGTACCCGCCACACTGGG > NC_002947/6045580‑6045873 | gACCTCGAACTGCGCCACCAACCCCAGGCGCTCGAACAACCCGCCAGGCTCGATGCTGACCGAGTGGCGAGGGCCGTATTGCACCTCCAG‑GGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGt > 5:220092/1‑149 (MQ=255) cTCGAACTGCGCCACCAACCCCAGGCGCTCGAACAACCCGCCAGGCTCGATGCTGACCGAGTGGCGAGGGCCGTATTGCACCTCCAG‑GGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTg > 8:237895/1‑147 (MQ=255) gAACTGCGCCACCAACCCCAGGCGCTCGAACAACCCGCCAGGCTCGATGCTGACCGAGTGGCGAGGGCCGTATTGCACCTCCAG‑GGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACCAGCGTGTGCAg < 2:310581/147‑1 (MQ=255) gAACTGCGCCACCAACCCCAGGCGCTCGAACAACCCGCCAGGCTCGATGCTGACCGAGTGGCGAGGGCCGTATTGCACCTCCAG‑GGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAg < 3:311680/147‑1 (MQ=255) tGCGCCACCAACCCCAGGCGCTCGAACAACCCGCCAGGCTCGATGCTGACCGAGTGGCGAGGGCCGTATTGCACCTCCAG‑GGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGGCTgcc > 1:401363/1‑149 (MQ=255) gcgcCACCAACCCCAGGCGCTCGAACAACCCGCCAGGCTCGATGCTGACCGAGTGGCGAGGGCCGTATTGCACCTCCAG‑GGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGGCTgccg > 5:222259/1‑149 (MQ=255) gcgcCACCAACCCCAGGCGCTCGAACAACCCGCCAGGCTCGATGCTGACCGAGTGGCGAGGGCCGTATTGCACCTCCAG‑GGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGGCTgccg > 5:5584/1‑149 (MQ=255) cgcCACCAACCCCAGGCGCTCGAACAACCCGCCAGGCTCGATGCTGACCGAGTGGCGAGGGCCGTATTGCACCTCCAG‑GGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGGCTgccgc > 4:369795/1‑149 (MQ=255) caccaACCCCAGGCGCTCGAACAACCCGCCAGGCTCGATGCTGACCGAGTGGCGAGGGCCGTATTGCACCTCCAG‑GGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGGCTgccgcc > 4:16656/1‑147 (MQ=255) accaACCCCAGGCGCTCGAACAACCCGCCAGGCTCGATGCTGACCGAGTGGCGAGGGCCGTATTGCACCTCCAG‑GGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGGCTGCCGCCAAg > 5:263472/1‑149 (MQ=255) ccaACCCCAGGCGCTCGAACAACTCGCCAGGCTCGATGCTGACCGAGTGGCGAGGGCCGTATTGCACCTCCAG‑GGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGGCTGCCGCCAAgg < 6:302513/149‑1 (MQ=255) ccaACCCCAGGCGCTCGAACAACCCGCCAGGCTCGATGCTGACCGAGTGGCGAGGGCCGTATTGCACCTCCAG‑GGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGGCTGCCGCCAAgg < 6:200510/149‑1 (MQ=255) aaCCCCAGGCGCTCGAACAACCCGCCAGGCTCGATGCTGACCGAGTGGCGAGGGCCGTATTGCACCTCCAG‑GGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGGCTGCCGCCAAGGGc < 8:197991/149‑1 (MQ=255) aaCCCCAGGCGCTCGAACAACCCGCCAGGCTCGATGCTGACCGAGTGGCGAGGGCCGTATTGCACCTCCAG‑GGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGGCTGCCGCCAAGGGc < 6:7891/149‑1 (MQ=255) aCCCCAGGCGCTCGAACAACCCGCCAGGCTCGATGCTGACCGAGTGGCGAGGGCCGTATTGCACCTCCAG‑GGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGGCTGCCGCCAAGGGcc < 6:220092/149‑1 (MQ=255) aCCCCAGGCGCTCGAACAACCCGCCAGGCTCGATGCTGACCGAGTGGCGAGGGCCGTATTGCACCTCCAG‑GGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGGCTGCCGCCAAGGGcc < 5:176843/149‑1 (MQ=255) cccAGGCGCTCGAACAACCCGCCAGGCTCGATGCTCCCCGATTGGCGAGGGCCCTAATGCACCTACAG‑GGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGGCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCCCACGCTGGTGCAGGCTGCCGCCAATGGCCAc > 8:202260/1‑149 (MQ=255) tCGAACAACCCGCCAGGCTCGATGCTGACCGAGTGGCGAGGGCCGTATTGCACCTCCAG‑GGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGGCTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTc > 3:140991/1‑149 (MQ=255) gAACAACCCGCCAGGCTCGATGCTGACCGAGTGGCGAGGGCCGTATTGCACCTCCAG‑GGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGGCTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCt > 4:39439/1‑149 (MQ=255) aacCCGCCAGGCTCGATGCTGACCGAGTGGCGAGGGCCGTATTGCACCTCCAG‑GGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGGCTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCTGGTa < 6:222259/149‑1 (MQ=255) cccGCCAGGCTCGATGCTGACCGAGTGGCGAGGGCCGTATTGCACCTCCAGAGGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGGCTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCTGGTAg > 1:108810/1‑149 (MQ=255) ccGCCAGGCTCGATGCTGACCGAGTGGCGAGGGCCGTATTGCACCTCCAG‑GGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGGCTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCTGGTAGcc > 6:28003/1‑149 (MQ=255) ggCTCGATGCTGACCGAGTGGCGAGGGCCGTATTGCACCTCCAG‑GGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGGCTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCTGGTAGCCTCGGCa < 5:23248/149‑1 (MQ=255) gATGCTGACCGAGTGGCGAGGGCCGTATTGCACCTCCAG‑GGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCCGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGGCTGCCGCCACGGGCCACGTTCAGCTCCTGGTAGGCGCGGCAGATGc > 8:186238/1‑149 (MQ=255) gATGCTGACCGAGTGGCGAGGGCCGTATTGCACCTCCAG‑GGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGGCTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCTGGTAGCCTCGGCAGAt < 4:284383/147‑1 (MQ=255) tGCTGACCGAGTGGCGAGGGCCGTATTGCACCTCCAG‑GGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGGCTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCTGGTAGCCTCGGCAGATGCAg < 3:361282/149‑1 (MQ=255) gACCGAGTGGCGAGGGCCGTATTGCACCTCCAG‑GGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGGCTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCTGGTAGCCTCGGCAGATGCAGAATa > 2:315695/1‑149 (MQ=255) ccGAGTGGCGAGGGCCGTATTGCACCTCCAG‑GGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGGCTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCTGGTAGCCTCGGCAGATGCAGAATACg < 1:315695/149‑1 (MQ=255) cGAGTGGCGAGGGCCGTATTGCACCTCCAG‑GGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGGCTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCTGGTAGCCTCGGCAGATGCAGAATACgg > 4:73936/1‑149 (MQ=255) cGAGTGGCGAGGGCCGTATTGCACCTCCAG‑GGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGGCTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCTGGTAGCCTCGGCAGATGCAGAATACgg < 5:240041/149‑1 (MQ=255) aGTGGCGAGGGCCGTATTGCACCTCCAG‑GGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGGCTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCTGGTAGCCTCGGCAGATGAAGAATACggg > 6:417849/1‑148 (MQ=255) gCGAGGGCCGTATTGCACCTCCAG‑GGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGGCTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCTGGTAGCCTCGGCAGATGCAGAATACGGGCacac > 5:336032/1‑149 (MQ=255) gCGAGGGCCGTATTGCACCTCCAG‑GGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGGCTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCTGGTAGCCTCGGCAGATGCAGAATACGGGCacac > 4:40337/1‑149 (MQ=255) gAGGGCCGTATTGCACCTCCAG‑GGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGGCTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCTGGTAGCCTCGGCAGATGCAGAATACGGGCACACCg > 5:327840/1‑149 (MQ=255) aGGGCCGTATTGCACCTCCAG‑GGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGGCTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCTGGTAGCCTCGGCAGATGCAGAATACggg < 2:28075/141‑1 (MQ=255) aGGGCCGTATTGCACCTCCAG‑GGGGGCGACCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGGCTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCTGGTAGCCTCGGCAGATGCAGAATACggg > 1:28075/1‑141 (MQ=255) cGTATTGCACCTCCAG‑GGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGGCTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCTGGTAGCCTCGGCAGATGCAGAATACGGGCACACCGACGGc > 7:287114/1‑148 (MQ=255) tATTGCACCTCCAG‑GGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGGCTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCTGGTAGCCTCGGCAGATGCAGAATACGGGCACACCGACGGCAAt < 6:263472/149‑1 (MQ=255) aTTGCACCTCCAG‑GGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGGCTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCTGGTAGCCTCGGCAGATGCAGAATACGGGCACACCGACGGCAATg > 3:264883/1‑149 (MQ=255) gCACCTCCAG‑GGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGGCTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCTGGTAGCCTCGGCAGATGCAGAATACGGGCACACCGACGGCAATGGc < 6:241269/148‑1 (MQ=255) gCACCTCCAG‑GGGGGCGTCCTCAGGTTAGCGGAGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTACTGCACACGCTGGTGCAGGCTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCTGGTAGCCTCGGCAGATGCAGAATACGGGCACACCGACGGCAATGGct > 5:227685/1‑149 (MQ=255) cACCTCCAG‑GGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGGCTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCTGGTAGc < 4:349335/107‑1 (MQ=255) cACCTCCAG‑GGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGGCTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCTGGTAGc > 3:349335/1‑107 (MQ=255) cACCTCCAG‑GGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGGCTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCTGGTAGCCTCGGCAGATGCAGAATACGGGCACACCGACGGCAATGGctg < 5:177154/149‑1 (MQ=255) aCCTCCAG‑GGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGGCTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCTGGTAGCCTCGGCAGATGCAGAATACGGGCACACCGACGGCAATGGctgc < 2:401363/149‑1 (MQ=255) aCCTCCAG‑GGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGGCTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCTGGTAGCCTCGGCAGATGCAGAATACGGGCACACCGACGGCAATGGctgc < 4:197116/149‑1 (MQ=255) cTCCAG‑GGGGTCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGGCTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCTGGTAGCCTCGGCAGATGCAGAATACGGGCACACCGACGGCAATGGctgcct < 7:92383/149‑1 (MQ=255) cTCCAG‑GGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGGCTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCTGGTAGCCTCGGCAGATGCAGAATACGGGCACACCGACGGCAATGGctgcct > 4:222932/1‑149 (MQ=255) cTCCAG‑GGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGGCTCCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCTGGTAGCCTCGGCAGATGCACAATACGGGCCCACCGACGGCAATGGctgcct > 7:250462/1‑149 (MQ=255) tCCAG‑GGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGGCTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCTGGTAGCCTCGGCAGATGCAGAATACGGGCACACCGACGGCAATGGctgcctg > 3:112332/1‑149 (MQ=255) aG‑GGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGGCTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCTGGTAGCCTCGGCAGATGCAGAATACGGGCACACCGACGGCAATGGCTGCCTGCaa < 3:39439/149‑1 (MQ=255) aG‑GGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGGCTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCTGGTAGCCTCGGCAGATGCAGAATACGGGCACACCGACGGCAATGGCTGCCTGCaa < 3:392133/149‑1 (MQ=255) ggggCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGGCTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCTGGTAGCCTCGGCAGATGCAGAATACGGGCACACCGACGGCAATGGCTGCCTGCAACAg < 8:269478/149‑1 (MQ=255) gggCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGGCTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCTGGTAGCCTCGGCAGATGCAGAATACGGGCACACCGACGGCAATGGCTGCCTGCAACAGc < 3:369795/149‑1 (MQ=255) ggCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGGCTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCTGGTAGCCTCGGCAGATGCAGAATACGGGCACACCGACTGCAATGGCTGCCTGCAACAGCg < 3:73936/149‑1 (MQ=255) tCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGGCTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCTGGTAGCCTCGGCAGATGCAGAATACGGGCACACCGACGGCAATGGCTGCCTGCAACAGCGGCAg < 4:112332/149‑1 (MQ=255) cTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGGCTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCTGGTAGCCTCGGCAGATGCAGAATACGGGCACACCGACGGCAATGGCTGCCTGCAACAGCGGCAggg > 3:321058/1‑149 (MQ=255) cTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGGCTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCTGGTAGCCTCGGCAGATGCAGAATACGGGCACACCGACGGCAATGGCTGCCTGCAACAGCGGCAgg < 7:237895/148‑1 (MQ=255) cTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGGCTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCTGGTAGCCTCGGCAGATGCAGAATACGGGCACACCGACGGCAATGGCTGCCTGCAACAGCGGCAgg < 3:288402/148‑1 (MQ=255) aGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGGCTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCTGGTAGCCTCGGCAGATGCAGAATACGGGCACACCGACGGCAATGGCTGCCTGCAACAGCGGCAGGGt < 7:186238/147‑1 (MQ=255) gTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGGCTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCTGGTAGCCTCGGCAGATGCAGAATACGGGCACACCGACGGCAATGGCTGCCTGCAACAGCGGCAGGGTCAgg < 3:16656/149‑1 (MQ=255) gTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGGCTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCTGGTAGCCTCGGCAGATGCAGAATACGGGCACACCGACGGCAATGGCTGCCTGCAACAGCGGCAGGGTCAgg < 3:222932/149‑1 (MQ=255) gTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGGCTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCTGGTAGCCTCGGCAGATGCAGAATACGGGCACACCGACGGCAATGGCTGCCTGCAACAGCGGCAGGGTCAgg < 2:108810/149‑1 (MQ=255) gTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGGCTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCTGGTAGCCTCGGCAGATGCAGAATACGGGCACACCGACGGCAATGGCTGCCTGCAACAGCGGCAGGGTCAgg < 8:287114/149‑1 (MQ=255) ttCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGGCTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCTGGTAGCCTCGGCAGATGCAGAATACGGGCACACCGACGGCAATGGCTGCCTGCAACAGCGGCAGGGTCAGGc < 6:5584/149‑1 (MQ=255) tggtAAAGGTAGCAAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGGCTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCTGGTAGCCTCGGCAGATGCAGAATACGGGCACACCGACGGCAATGGCTGCCTGCAACAGCGGCAGGGTCAGGCGATCAcg < 3:40337/149‑1 (MQ=255) cAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGGCTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCTGGTAGCCTCGGCAGATGCAGAATACGGGCACACCGACGGCAATGGCTGCCTGCAACAGCGGCAGGGTCAGGCGATCACgcgc > 1:200851/1‑148 (MQ=255) cAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGGCTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCTGGTAGACTCGGCAGCTGCAGAATACGGGCACACCGCCCGCAATGCCTGACAGCCACAGCGGCACGTTCAGGCGAACACgcgc > 8:396048/1‑148 (MQ=255) aaGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGGCTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCTGGTAGCCTCGGCAGATGCAGAATACGGGCACACCGACGGCAATGGCTGCCTGCAACAGCGGCAGGGTCAGGCGATCACgcgc > 1:422224/1‑147 (MQ=255) 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agccTGCACCAGCGTGTGCAGGCTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCTGGTAGCCTCGGCAGATGCAGAATACGGGCACACCGACGGCAATGGCTGCCTGCAACAGCGGCAGGGTCAGGCGATCACGCGCCAGATCATGCCGGGTAc > 5:200931/3‑149 (MQ=255) cTGCACACGCTGGTGCAGGCTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCTGGTAGCCTCGGCAGATGCAGAATACGGGCACACCGACGGCAATGGCTGCCTGCAACAGCGGCAGGGTCAGGCGATCACGCGCCAGATCATGCCGGGTACCCg > 7:92830/1‑149 (MQ=255) gCACACGCTGGTGCAGGCTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCTGGTAGCCTCGGCAGATGCAGAATACGGGCACACCGACGGCAATGGCTGCCTGCAACAGCGGCAGGGTCAGGCGATCACGCGCCAGATCATGCCGGGTACCCGcc > 2:406907/1‑149 (MQ=255) cacaCGCTGGTGCAGGCTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCTGGTAGCCTCGGCAGATGCAGAATACGGGCACACCGACGGCAATGGCTGCCTGCAACAGCGGCAGGGTCAGGCGATCACGCGCCAGATCATGCCGGGTACCCGc < 3:403821/147‑1 (MQ=255) cacaCGCTGGTGCAGGCTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCTGGTAGCCTCGGCAGATGCAGAATACGGGCACACCGACGGCAATGGCTGCCTGCAACAGCGGCAGGGTCAGGCGATCACGCGCCAGATCATGCCGGGTACCCGc < 3:344030/147‑1 (MQ=255) cacaCGCTGGTGCAGGCTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCTGGTAGCCTCGGCAGATGCAGAATACGGGCACACCGACGGCAATGGCGGCCTGCAACAGCGGCAGGGTCAGGCGATCACGCGCCAGATCATGCCGGGTACCCGc < 3:235591/147‑1 (MQ=255) acacGCTGGTGCAGGCTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCTGGTAGCCTCGGCAGATGCAGAATACGGGCACACCGACGGCAATGGCTGCCTGCAACAGCGGCAGGGTCAGGCGATCACGCGCCAGATCATGCCGGGTACCCGCca > 3:270842/1‑148 (MQ=255) gCTGGTGCAGGCTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCTGGTAGCCTCGGCAGATGCAGAATACGGGCACACCGACGGCAATGGCTGCCTGCAACAGCGGCAGGGTCAGGCGATCACGCGCCAGATCATGCCGGGTACCCGCCACACTg > 7:53056/1‑149 (MQ=255) cTGGTGCAGGCTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCTGGTAGCCTCGGCAGATGCAGAATACGGGCACACCGACGGCAATGGCTGCCTGCAACAGCGGCAGGGTCAGGCGATCACGCGCCAGATCATGCCGGGTACCCGCCACACTgg < 5:28003/149‑1 (MQ=255) tGGTGCAGGCTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCTGGTAGCATCGGCAGATGCAGAATACGGGCACACCGACGGCAATGGCTGCCTGCAACAGCGGCAGGGTCAGGCGATCACGCGCCAGATCATGTCGGGTACCCGCCACACTggg > 8:18648/1‑149 (MQ=255) | GACCTCGAACTGCGCCACCAACCCCAGGCGCTCGAACAACCCGCCAGGCTCGATGCTGACCGAGTGGCGAGGGCCGTATTGCACCTCCAG‑GGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGGCTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCTGGTAGCCTCGGCAGATGCAGAATACGGGCACACCGACGGCAATGGCTGCCTGCAACAGCGGCAGGGTCAGGCGATCACGCGCCAGATCATGCCGGGTACCCGCCACACTGGG > NC_002947/6045580‑6045873 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |