Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 6,138,444 | T→A | 6.6% | F300Y (TTC→TAC) ‡ | czcC → | CzcC family metal RND transporter outer membrane protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 6,138,444 | 0 | T | A | 6.6% | 271.8 / 6.5 | 91 | F300Y (TTC→TAC) ‡ | czcC | CzcC family metal RND transporter outer membrane protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (45/39); new base A (3/3); total (48/43) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.61e-01 |
GACCCGTGAAGCACAAGCCCAGGTGCAGCAGGCCATCGCCGAGAAAAAGTCGGATTGGGGCTGGCAGGTCGACTACCAACGCCGCGGGCCCGAATTCAGCAACATGGTCAGTGTCCAGGTCAGTTTTCAATTGCCGCTGTTCAGCGGCTCGCGGCAAGACCCGATGATCGCTGCTCGCCGGGCCCAGGTGCGTCAGCTGGAGGACGAACAGGAAGCGGCACTGCGTGAGCACACCGCGCAACTCGAAGCTGACCTGGCGGAATACCAACGCCTACAACGGGCAGTGAC > NC_002947/6138304‑6138591 | gACCCGTGAAGCACAAGCCCAGGTGCAGCAGGCCATCGCCGAGAAAAAGTCGGATTGGGGCTGGCAGGTCGACTACCAACGCCGCGGGCCCGAATTCAGCAACATGGTCAGTGTCCAGGTCAGTTTTCAATTGCCGCTGTTCAGCGGCt > 2:15575/1‑149 (MQ=255) cccGTGAAGCACAAGCCCAGGTGCAGCAGGCCATCGCCGAGAAAAAGTCGGATTGGGGCTGGCAGGTCGACTACCAACGCCGCGGGCCCGAATTCAGCAACATGGTCAGTGTCCAGGTCAGTTTTCAATTGCCGCTGAACAGCGGcaat > 5:282612/1‑146 (MQ=255) cccGTGAAGCACAAGCCCAGGTGCAGCAGGCCATCGCCGAGAAAAAGTCGGATTGGGGCTGGCAGGTCGACTACCAACGCCGCGGGCCCGAATTCAGCAACATGGTCAGTGTCCAGGTCAGTTTTCAATTGCCGCTGAACAGCGGcaat < 7:243755/149‑4 (MQ=255) gTGAAGCACAAGCCCAGGTGCAGCAGGCCATCGCCGAGAAAAAGTCGGATTGGGGCTGGCAGGTCGACTACCAACGCCGCGGGCCCGAATTCAGCAACATGGTCAGTGTCCAGGTCAGTTTTCAATTGCCGCTGTTCAGCGGCTCGCgg < 6:259489/149‑1 (MQ=255) tGAAGCACAAGCCCAGGTGCAGCAGGCCATCGCCGAGAAAAAGTCGGATTGGGGCTGGCAGGTCGACTACCAACGCCGCGGGCCCGAATTCAGCAACATGGTCAGTGTCCAGGTCAGTTTTCAATTGCCGCTGTTCAGCGGCTCGCgg > 7:248574/1‑148 (MQ=255) tGAAGCACAAGCCCAGGTGCAGCAGGCCATCGCCGAGAAAAAGTCGGATTGGGGCTGGCAGGTCGACTACCAACGCCGCGGGCCCGAATTCAGCAACATGGTCAGTGTCCAGGTCAGTTTTCAATTGCCGCTGTTCAGCGGCTCGCGGc < 5:303167/149‑1 (MQ=255) gCACAAGCCCAGGTGCAGCAGGCCATCGCCGAGAAAAAGTCGGATTGGGGCTGGCAGGTCGACTACCAACGCCGCGGGCCCGAATTCAGCAACATGGTCAGTGTCCAGGTCAGTTTTCAATTGCCGCTGAACAGCGGcaa < 7:159359/140‑3 (MQ=255) gCACAAGCCCAGGTGCAGCAGGCCATCGCCGAGAAAAAGTCGGATTGGGGCTGGCAGGTCGACTACCAACGCCGCGGGCCCGAATTCAGCAACATGGTCAGTGTCCAGGTCAGTTTTCAATTGCCGCTCAACAGCGGcaa > 8:159359/1‑138 (MQ=255) acaAGCCCAGGTGCAGCAGGCCATCGCCGAGAAAAAGTCGGATTGGGGCTGGCAGGTCGACTACCAACGCCGCGGGCCCGAATTCAGCAACATGGTCAGTGTCCAGGTCAGTTTTCAATTGCCGCTGTTCAGCGGCTCGCGGCAAGAcc < 6:112990/149‑1 (MQ=255) acaAGCCCAGGTGCAGCAGGCCATCGCCGAGAAAAAGTCGGATTGGGGCTGGCAGGTCGACTACCAACGCCGCGGGCCCGAATTCAGCAACATGGTCAGTGTCCAGGTCAGTTTTCAATTGCCGCTGTTCAGCGGCTCGCGGCAAGAcc < 1:417439/149‑1 (MQ=255) acaAGCCCAGGTGCAGCAGGCCATCGCCGAGAAAAAGTCGGATTGGGGCTGGCAGGTCGACTACCAACGCCGCGGGCCCGAATTCAGCAACATGGTCAGTGTCCAGGTCAGTTTTCAATTGCCGCTGTTCAGCGGCTCGCGGCAAGAcc < 7:17927/149‑1 (MQ=255) acaAGCCCAGGTGCAGCAGGCCATCGCCGAGAAAAAGTCGGATTGGGGCTCGCAGGTCGACTACCAACGCCGCGCGCCCGAATTCAGCAACATGGTCAGTGTCCAGGTCAGTTTTCAATTCCCGCTGTTCAGCGGCTCGCGGCAAGAcc > 1:52642/1‑149 (MQ=255) aaGCCCAGGTGCAGCAGGCCATCGCCGAGAAAAAGTCGGATTGGGGCTGGCAGGTCGACTACCAACGCCGCGGGCCCGAATTCAGCAACATGGTCAGTGTCCAGGTCAGTTTTCAATTGCCGCTGTTCAGCGGCTCGCGGCAAGAccc > 1:10997/1‑148 (MQ=255) ccAGGTGCAGCAGGCCATCGCCGAGAAAAAGTCGGATTGGGGCTGGCAGGTCGACTACCAACGCCGCGGGCCCGAATTCAGCAACATGGTCAGTGTCCAGGTCAGTTTTCAATTGCCGCTGTTCAGCGGCTCGCGGCAAGACCCgatga > 2:435162/1‑149 (MQ=255) ccAGGTGCAGCAGGCCATCGCCGAGAAAAAGTCGGATTGGGGCTGGCAGGTCGACTACCAACGCCGCGGGCCCGAATTCAGCAACATGGTCAGTGTACAGGTCAGTTTTCAATTGCCGCTGTTCAGCGGCTCGCGGCAAGACCCgatga > 3:61066/1‑149 (MQ=255) cAGGTGCAGCAGGCCATCGCCCAGAAAAAGTCGGATTGGGGCTGGCAGGTCTACTACCAACGCCCCGGGCCCGAATACAGCAACATGGTCAGTGTCCAGGTCAGTTTTCAATTGCCGCTGTTAAGCGGCTCGCGGCAAGACCCgatgat > 7:88545/1‑149 (MQ=255) aGGTGCAGCAGGCCATCGCCGAGAAAAAGTCGGATTGGGGCTGGCAGGTCGACTACCAACGCCGCGGGCCCGAATTCAGCAACATGGTCAGTGTCCAGGTCAGTTTTCAATTGCCGCTGTTCAGCGGCTCGCGGCAAGACCCGATGATc < 4:214921/149‑1 (MQ=255) ggTGCAGCAGGCCATCGCCGAGAAAAAGTCGGATTGGGGCTGGCAGGTCGACTACCAACGCCGCGGGCCCGAATTCAGCAACATGGTCAGTGTCCAGGTCAGTTTTCAATTGCCGCTGTTCAGCGGCTCGCGGCAAGACCCGATGATCg < 3:72198/149‑1 (MQ=255) cagcagGCCATCGCCGAGAAAAAGTCGGATTGGGGCTGGCAGGTCGACTACCAACGCCGCGGGCCCGAATTCAGCAACATGGTCAGTGTCCAGGTCAGTTTTCAATTGCCGCTGTTCAGCGGCTCGCGGCAAGACCCGATGATCgctg < 6:165725/148‑1 (MQ=255) 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cGCCGAGAAAAAGTCGGATTGGGGCTGGCAGGTCGACTACCAACGCCGCGGGCCCGAATTCAGCAACATGGTCAGTGTCCAGGTCAGTTTTCAATTGCCGCTGTTCAGCGGCTCGCGGCAAGACCCGATGATCGCTGCTCGCCGGGcc > 3:139734/1‑148 (MQ=255) ccGAGAAAAAGTCGGATTGGGGCTGGCAGGTCGACTACCAACGCCGCGGGCCCGAATTCAGCAACATGGTCAGTGTCCAGGTCAGTTTTCAATTGCCGCTGTTCAGCGGCTCGCGGCAAGACCCGATGATCGCTGCTCGCCGGGCCCAg > 3:200141/1‑149 (MQ=255) gagaAAAAGTCGGATTGGGGCTGGCAGGTCGACTAACAACGCCGCGGGCCCGAATTCAGCAACATGGTCAGTGTCCAGGTCAGTTTTCAATTGCCGCTGTTCAGCGGCTCGCGGCAAGACCCGATGATCGCTGCTCGCCGGGCCCAGGt > 6:321110/1‑149 (MQ=255) agaAAAAGTCGGATTGGGGCTGGCAGGTCGACTACCAACGCCGCGGGCCCGAATTCAGCAACATGGTCAGTGTCCAGGTCAGTTTTCAATTGCCGCTGTTCAGCGGCTCGCGGCAAGACCCGATGATCGCTGCTCGCCGGGCCCAGGTg > 3:417696/1‑149 (MQ=255) agaAAAAGTCGGATTGGGGCTGGCAGGTCGACTACCAACGCCGCGGGCCCGAATTCAGCAACATGGTCAGTGTCCAGGTCAGTTTTCAATTGCCGCTGTTCAGCGGCTCGCGGCAAGACCCGATGATCGCTGCTCGCCGGGCCCAGGTg > 4:122348/1‑149 (MQ=255) agaAAAAGTCGGATTGGGGCTGGCAGGTCGACTAACAACGCCGCGGGCCCGAATTCAGCAACATGGTCAGTGTCCAGGTCAGTTTTCAATTGCCGCTGTTCAGAGGCTCGCGGCAAGACCCGAAGATCGCTGCTCGCCTGGCCCAGGTg > 7:249808/1‑149 (MQ=255) gaAAAAGTCGGATTGGGGCTGGCAGGTCGACTACCAACGCCGCGGGCCCGAATTCAGCAACATGGTCAGTGTCCAGGTCAGTTTTCAATTGCCGCTGTTCAGCGGCTCGCGGCAAGACCCGATGATCGCTGCTCGCCGGGCCCAGGTGc < 3:195267/149‑1 (MQ=255) aaaaaGTCGGATTGGGGCTGGCAGGTCGACTACCAACGCCGCGGGCCCGAATTCAGCAACATGGTCAGTGTCCAGGTCAGTTGTCAATTGCCGCTGTTCAGCGGCTCGCGGCAAGACCCGATGATCGCTGCTCGCCGGGCCCAGGTGCg > 2:352687/1‑149 (MQ=255) aaaGTCGGATTGGGGCTGGCAGGTCGACTACCAACGCCGCGGGCCCGAATTCAGCAACATGGTCAGTGTCCAGGTCAGTTTTCAATTGCCGCTGTTCAGCGGCTCGCGGCAAGACCCGATGATCGCTGCTCGCCGGGCCCAGGTGCGt > 8:57680/1‑148 (MQ=255) aaGTCGGATTGGGGCTGTCAGGTCTACTACCAAAGCCGCGGGCCCTAATTCAGGAACATGGTCAGTGTCCAGGTCAGTTTTCAATTGCCGCTGTTGAGCGGCTCGCGGCAAGACCCGATGATCGCTGCTCGCCTGGCCCAGTTGCGTCa < 8:88545/149‑1 (MQ=255) aaGTCGGATTGGGGCTGGCAGGTCGACTACCAACGCCGCGGGCCCGAATTCAGCAACATGGTCAGTGTCCAGGTCAGTTTTCAATTGCCGCTGTTCAGCGGCTCGCGGCAAGACCCGATGATCGCTGCTCGCCGGGCCCAGGTGCGt > 4:148094/1‑147 (MQ=255) tCGGATTGGGGCTGGCAGGTCGACTACCAACGCCGCGGGCCCGAATTCAGCAACATGGTCAGTGTCCAGGTCAGTTTTCAATTGCCGCTGTTCAGCGGCTCGCGGCAAGACCCGATGATCGCTGCTCGCCGGGCCCAGGTGCGTCAGCt > 7:200844/1‑149 (MQ=255) tCGGATTGGGGCTGGCAGGTCGACTACCAACGCCGCGGGCCCGAATTCAGCAACATGGTCAGTGTCCAGGTCAGTTTTCAATTGCCGCTGTTCAGCGGCTCGCGGCAAGACCCGATGATCGCTGCTCGCCGGGCCCAGGTGCGTCAGCt > 8:16126/1‑149 (MQ=255) gATTGGGGCTGGCAGGTCGACTACCAACGCCGCGGGCCCGAATTCAGCAACATGGTCAGTGTCCAGGTCAGTTTTCAATTGCCGCTGTTCAGCGGCTCGCGGCAAGACCCGATGATCGCTGCTCGCCGGGCCCAGGTGCGTCAGCTgga < 6:26827/149‑1 (MQ=255) aTTGGGGCTGGCAGGTCGACTACCAACGCCGCGGGCCCGAATTCAGCAACATGGTCAGTGTCCAGGTCAGTTTTCAATTGCCGCTGTTCAGCGGCTCGCGGCAAGACCCGATGATCGCTGCTTGCCGGGCCCAGGTGCGTCAGCt > 7:72037/1‑145 (MQ=255) aTTGGGGCTGGCAGGTCGACTACCAACGCCGCGGGCCCGAATTCAGCAACATGGTCAGTGTCCAGGTCAGTTTTCAATTGCCGCTGTTCAGCGGCTCGCGGCAAGACCCGATGATCGCTGCTTGCCGGGCCCAGGTGCGTCAGCt < 8:72037/145‑1 (MQ=255) aTTGGGGCTGGCAGGTCGACTACCAACGCCGCGGGCCCGAATTCAGCAACATGGTCAGTGTCCAGGTCAGTTTTCAATTGCCGCTGTTCAGCGGCTCGCGGCAAGACCCGATGATCGCTGCTCGCCGGGCCCAGGTGCGTCAGCTggag < 1:15575/149‑1 (MQ=255) gggCTGGCAGGTCGACTACCAACGCCGCGGGCCCGAATTCAGCAACATGGTCAGTGTCCAGGTCAGTTTTCAATTGCCGCTGTTCAGCGGCTCGCGGCAAGACCCGATGATCGCTGCTCGCCGGGCCCAGGTGCGTCAGCTGGAGGAc > 2:106094/1‑148 (MQ=255) gggCTGGCAGGTCGACTACCAACGCCGCGGGCCCGAATTCAGCAACATGGTCAGTGTCCAGGTCAGTTTTCAATTGCCGCTGTTCAGCGGCTCGCGGCAAGACCCGATGATCGCTGCTCGCCGGGCCCAGGTGCGTCAGCTGGAGGAc < 1:435162/148‑1 (MQ=255) gCTGGCAGGTCGACTACCAACGCCGCGGGCCCGAATTCAGCAACATGGTCAGTGTCCAGGTCAGTTTTCAATTGCCGCTGTTCAGCGGCTCGCGGCAAGAcc < 4:147004/102‑1 (MQ=255) gCTGGCAGGTCGACTACCAACGCCGCGGGCCCGAATTCAGCAACATGGTCAGTGTCCAGGTCAGTTTTCAATTGCCGCTGTTCAGCGGCTCGCGGCAAGAcc > 3:147004/1‑102 (MQ=255) gCTGGCAGGTCGACTACCAACGCCGCGGGCCCGAATTCAGCAACATGGTCAGTGTCCAGGTCAGTTTTCAATTGCCGCTGTTCAGCGGCTCGCGGCAAGACCCGATGATCGCTGCTCGCCGGGCCCAGGTGCGTCAGCTGGAGGACGaa < 2:281250/149‑1 (MQ=255) cTGGCAGGTCGACTACCAACGCCGCGGGCCCGAATTCAGCAACATAGTCAGTGTCCAGGTCAGTTTTCAATTGCCGCTGTTCAGCGGCTCGCGGCAAGACCCGATGATCGCTGCTCGCCGGGCCCAGGTGCGTCAGCTGGAGGACGaa > 1:90734/1‑148 (MQ=255) aGGTCGACTACCAACGCCGCGGGCCCGAATTCAGCAACATGGTGAGTGTCCAGGTCAGTTTTCAATTGCCGCTGTTCAGCTGCTCGCGGCAAGACCCGATGATCGCTGCTCGCCGGGCCCAGGTGCGTCAGCTGGAGGACGAACAgg > 6:269021/1‑147 (MQ=255) ggTCGACTACCAACGCCGCGGGCCCGAATTCAGCAACATGGTCAGTGTCCAGGTCAGTTTTCAATTGCCGCTGTTCAGCGGCTCGCGGCAAGACCCGATGATCGCTGCTCGCCGGGCCCAGGTGCGTCAGCTGGAGGACGAACAGGAAg > 1:362570/1‑149 (MQ=255) ggTCGACTACCAACGCCGCGGGCCCGAATTCAGCAACATGGTCAGTGTCCAGGTCAGTTTTCAATTGCCGCTGTTCAGCGGCTCGCGGCAAGACCCGATGATCGCTGCTCGCCGGGCCCAGGTGCGTCAGCTGGAGGACGAACAGGAAg < 1:37017/149‑1 (MQ=255) tCGACTACCAACGCCGCGGGCCCGAATTCAGCAACATGGTCAGTGTCCAGGTCAGTTTTCAATTGCCGCTGTTCAGCGGCTCGCGGCAAGACCCGATGATCGCTGCTCGCCGGGCCCAGGTGCGTCAGCTGGAGGACGAACAGGAAGCg < 4:200141/149‑1 (MQ=255) tCGACTACCAACGCCGCGGGCCCGAATTCAGCAACATGGTCAGTGTCCAGGTCAGTTTTCAATTGCCGCTGTTCAGCGGCTCGCGGCAAGACCCGATGATCGCTGCTCGCCGGGCCCAGGTGCGTCAGCTGGAGGACGAACAGGAAGCg > 3:101536/1‑149 (MQ=255) agACTACCAACGCCGCGGGCCCGAATTCAGCAACATGGTCAGTGTCCAGGTCAGTTTTCAATTGCCGCTGTTCAGCGGCTCGCGGCAAGACCCGATGATCGCTGCTCGCCGGGCCCAGGTGCGTCAGCTGGAGGACGAACAGGAAGCgg < 8:306805/148‑1 (MQ=255) gACTACCAACGCCGCGGGCCCGAATTCAGCAACATGGTCAGTGTCCAGGTCAGTTTTCAATTGCCGCTGTTCAGCGGCTCGCGGCAAGACCCGATGATCGCTGCTCGCCGGGCCCAGGTGCGTCAGCTGGAGGACGAACAGGAAGCGGc > 8:150909/1‑149 (MQ=255) tACCAACGCCGCGGGCCCGAATTCAGCAACATGGTCAGTGTCCAGGTCAGTTTTCAATTGCCGCTGTTCAGCGGCTCGCGGCAAGACCCGATGATCGCTGCTCGCCGGGCCCAGGTGCGTAAGCTGGAGGACGAACAGGAAGCGGCACt > 7:349407/1‑149 (MQ=255) ccAACGCCGCGGGCCCGAATTCAGCAACATGGTCAGTGTCCAGGTCAGTTTTCAATTGCCGCTGTTCAGCGGCTCGCGGCAAGACCCGATGATCGCTGCTCGCCGGGGCCAGGTGCGTCAGCTGGAGGACGAACAGGAAGCGGCACTGc > 5:372832/1‑149 (MQ=255) aaCGCCGCGGGCCCGAATTCAGCAACATGGTCAGTGTCCAGGTCAGTTTTCAATTGCCGCTGTTCAGCGGCTCGCGGCAAGACCCGATGATCGCTGCTCGCCGGGCCCAGGTGCGTCAGCTGGAGGACGAACAGGAAGCGGCACTGCGt > 3:259045/1‑149 (MQ=255) aaCGCCGCGGGCCAGAATACAGCAACATGGTCAGTGTCCAGGTCAGTAATCAATTGCCGCAGTTCAGCGGCTCGCGCCAAGACCCGATGATAGCTGCTCGCCGGGCCCAGGTGCCTCAGCTGGAGGACGAACAGGAAGCGTCACTGCGt > 1:73644/1‑149 (MQ=255) aCGCCGCGGGCCCGAATTCAGCAACATGGTCAGTGTCCAGGTCAGTTTTCAATTGCCGCTGTTCAGCGGCTCGCGGCAAGACCCGATGATCGCTGCTCGCCGGGCCCAGGTGCGTCAGCTGGAGGACGAACAGGAAGCGGCACTGCGt > 8:268487/1‑148 (MQ=255) aCGCCGCGGGCCCGAATTCAGCAACATGGTCAGTGTCCAGGTCAGTTTTCAATTGCCGCTGTTCAGCGGCTCGCGGCAAGACCCGATGATCGCTGCTCGCCGGGCCCAGGTGCGTCAGCTGGAGGACGAACAGGAAGCGGCACTGCGTg > 2:367826/1‑149 (MQ=255) cgccgcTGGCCCGAATTCAGCAACATGGTCAGTGTCCAGGTCAGTTTTCAATTGCCGCTGTTCAGCGGCTCGCGGCAAGACCCGATGATCGCTGCTCGCCGGGCCCAGGTGCGTCAGCTGGAGGACGAACAGGAAGCGGCACTGCGTGa < 3:247719/149‑1 (MQ=255) cgccgcGGGCCCGAATTCAGCAACATGGTCAGTGTCCAGGTCAGTTTTCAATTGCCGCTGTTCAGCGGCTCGCGGCAAGACCCGATGATCGCTGCTCGCCGGGCCCAGGTGCGTCAGCTGGAGGACGAACAGGAAGCGGCACTGCGTGa < 3:122348/149‑1 (MQ=255) cgccgcGGGCCCGAATTCAGCAACATGGTCAGTGTCCAGGTCAGTTTTCAATTGCCGCTGTTCAGCGGCTCGCGGCAAGACCCGATGATCGCTGCTCGCCGGGCCCAGGTGCGTCAGCTGGAGGACGAACAGGAAGCGGCACTGCGTGa < 4:139734/149‑1 (MQ=255) cgccgcGGGCCCGAATTCAGCAACATGGTCAGTGTCCAGGTCAGTTTTCAATTGCCGCTGTTCAGCGGCTCGCGGCAAGACCCGATGATCGCTGCTCGCCGGGCCCAGGTGCGTCAGCTGGAGGACGAACAGGAAGCGGCACTGCGTGa < 4:101536/149‑1 (MQ=255) cgGGCCCGTATTCAGCAACATGGTCAGTGTCCAGGTCAGTTTTCAATTGCCGCTGTTCAGCGGCTCGCGGCAAGACCCGATGATCGCTGCTCGCCGGGCCCAGGTGCGTCAGCTGGAGGACGAACAGGAAGCGGCACTGCGTGAGcaca < 6:170424/149‑1 (MQ=255) 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tgtCCAGGTCAGTTTTCAATTGCCGCTGTTCAGCGGCTCGCGGCAAGACCCGATGATCGCTGCTCGCCGGGCCCAGGTGCGTCAGCTGGAGGACGAACAGGAAGCGGCACTGCGTGAGCACACCGCGCAACTCGAAGCTGACCTGGCgg < 8:200844/149‑1 (MQ=255) gtCCAGGTCAGTTTTCAATTGCCGCTGTTCAGCGGCTCGCGGCAAGACCCGATGATCGCTGCTCGCCGGGCCCAGGTGCGTCAGCTGGAGGACGAACAGGAAGCGGCACTGCGTGAGCACACCGCGCAACTCGAAGCTGACCTGGCgg > 4:180886/1‑148 (MQ=255) ccAGGTCAGTTTTCAATTGCCGCTGTTCAGCGGCTCGCGGCAAGACCCGATGATCGCTGCTCGCCGGGCCCAGGTGCGTCAGCTGGAGGACGAACAGGAAGCGGCACTGCGTGAGCACACCGCGCAACTCGAAGCTGACCTGGCGGAAt < 4:290389/149‑1 (MQ=255) aGTTTTCAATTGCCGCTGTTCAGCGGCTCGCGGCAAGACCCGATGATCGCTGCTCGCCGGGCCCAGGTGCGTCAGCTGGAGGACGAACAGGAAGCGGCAGTGCGTGAGCACACCGCGCAACTCGAAGCTGACCTGGCGGAATACCAACg < 2:52642/149‑1 (MQ=255) ttttCAATTGCCGCTGTGCAGCGGCTCTCGTCAAGACCCGATGATCGCTGCTCGCCGGGCCCAGGTTCGTCAGCTGGAGGACGAACATGAAGCGGCACTGCGTGAGCACACCGCGCAACTCGTAGCTGACCTTTCGTAATACCAACGc < 8:249808/148‑1 (MQ=255) ttCAATTGCCGCTGTTCAGCGGCTCGCGGCAAGACCCGATGATCGCTGCTCGCCGGGCCCAGGTGCGTCAGCTGGAGGACGAACAGGAAGCGGCACTGCGTGAGCACACCGCGCAACTCGAAGCTGACCTGGCGGAATACCAAc < 4:163061/144‑1 (MQ=255) ttCAATTGCCGCTGTTCAGCGGCTCGCGGCAAGACCCGATGATCGCTGCTCGCCGGGCCCAGGTGCGTCAGCTGGAGGACGAACAGGAAGCGGCACTGCGTGAGCACACCGCGCAACTCGAAGCTGACCTGGCGGAATACCAAc > 3:163061/1‑144 (MQ=255) tCAATTGCCGCTGTTCAGCGGCTCGCGGCAAGACCCGATGATCGCTGCTCGCCGGGCCCAGGTGCGTCAGCTGGAGGACGAACAGGAAGCGGCACTGCGTGAGCACACCGCGCAACTCGAAGCTGACCTGGCGGAATACCAACGCCTa > 6:53757/1‑148 (MQ=255) cgcgagCCGCTGAACAGCGGCTCGCGGCAAGACCCGATGATCGCTGCTCGCCGGGCCCAGGTGCGTCAGCTGGAGGACGAACAGGAAGCGGCACTGCGTGAGCACACCGCGCAACTCGAAGCTGACCTGGCGGAATAc > 7:47300/6‑138 (MQ=255) cgcgagCCGCTGAACAGCGGCTCGCGGCAAGACCCGATGATCGCTGCTCGCCGGGCCCAGGTGCGTCAGCTGGAGGACGAACAGGAAGCGGCACTGCGTGAGCACACCGCGCAACTCGAAGCTGACCTGGCGGAATAc < 8:47300/133‑1 (MQ=255) aaTTGCCGCTGTTCAGCGGCTCGCGGCAAGACCCGATGATCGCTGCTCGCCGGGCCCAGGTGCGTCAGCTGGAGGACGAACAGGAAGCGGCACTGCGTGa > 1:420833/1‑100 (MQ=255) aaTTGCCGCTGTTCAGCGGCTCGCGGCAAGACCCGATGATCGCTGCTCGCCGGGCCCAGGTGCGTCAGCTGGAGGACGAACAGGAAGCGGCACTGCGTGa < 2:420833/100‑1 (MQ=255) aaTTGCCGCTGTTCAGCGGCTCGCGGCAAGACCCGATGATCGCTGCTCGCCGGGCCCAGGTGCGTCAGCTGGAGGACGAACAGGAAGCGGCACTGCGTGAGCACACCGCGCAACTCGAAGCTGACCTGGCGGAATACCAACGCCTACaa < 7:57680/149‑1 (MQ=255) cGCTGTTCAGCGGCTCGCGGCAAGACCCGATGATCGCTGCTCGCCGGGCCCAGGTGCGTCAGCTGGAGGACGAACAGGAAGCGGCACTGCGTGAGCACACCGCGCAACTCGAAGCTGACCTGGCGGAATACCAACGCCTACAACggg > 8:44803/1‑147 (MQ=255) cGCTGTTCAGCGGCTCGCGGCAAGACCCGATGATCGCTGCTCGCCGGGCCCAGGTGCGTCAGCTGGAGGACGAACAGGAAGCGGCACTGCGTGAGCACACCGCGCAACTCGAAGCTGACCTGGCGGAATACCAACGCCTACAACGGGCa < 7:268487/149‑1 (MQ=255) cTGTTCAGCGGCTCGCGGCAAGACCCGATGATCGCTGCTCGCCGGGCCCAGGTGCGTCAGCTGGAGGACGAACAGGAAGCGGCACTGCGTGAGCACACCGCGCAACTCGAAGCTGACCTGGCGGAATACCAACGCCTACAACGGGCAGt < 2:10997/149‑1 (MQ=255) ttCAGCGGCTCGCGGCAAGACCCGATGATCGCTGCTCGCCGGGCCCAGGTGCGTCAGCTGGAGGACGAACAGGAAGCGGCACTGCGTGAGCACACCGCGCAACTCGAAGCTGACCTGGCGGAATACCAACGCCTACAACGGGCAGTGAc < 2:362570/149‑1 (MQ=255) | GACCCGTGAAGCACAAGCCCAGGTGCAGCAGGCCATCGCCGAGAAAAAGTCGGATTGGGGCTGGCAGGTCGACTACCAACGCCGCGGGCCCGAATTCAGCAACATGGTCAGTGTCCAGGTCAGTTTTCAATTGCCGCTGTTCAGCGGCTCGCGGCAAGACCCGATGATCGCTGCTCGCCGGGCCCAGGTGCGTCAGCTGGAGGACGAACAGGAAGCGGCACTGCGTGAGCACACCGCGCAACTCGAAGCTGACCTGGCGGAATACCAACGCCTACAACGGGCAGTGAC > NC_002947/6138304‑6138591 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |