| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 683,823 | T→C | 8.2% | S10G (AGC→GGC) | PP_0585 ← | MerR family metal‑sensitive transcriptional regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 683,823 | 0 | T | C | 8.2% | 269.7 / 11.0 | 98 | S10G (AGC→GGC) | PP_0585 | MerR family metal‑sensitive transcriptional regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (51/38); new base C (3/5); total (54/44) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.60e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.41e-01 | |||||||||||
GAAAAGCCCAGGTCGCGGGAGCGCTTGATGAAGGCCAGGTTGTGCAAGTCTTGCGCCTGGTACAGGCGGTAGCCGCTGTCGCTGCGAGTGGCGGGTTTGAGCAGGCCGATGGATTCGTAGTAACGGATCATCTTGGTGCTGAGCCCGCTGCGGCGGGCGGCCTGGCCGATGTTCATGGCGCCTCCTGGGTGCTGCTGGTGGGTTTCCACGTTTTAAGCCACAGTGCATTGCTGACGACGCTGACACTGGACAGGGCCATGGCGGCTCCTGCCAGTACCGGGTTGAGGTAACCCA > NC_002947/683675‑683968 | gAAAAGCCCAGGTCGCGGGAGCGCTTGATGAAGGCCAGGTTGTGCAAGTCTTGCGCCTGGTACAGGCGGTAGCCGCTGTCGCTGCGAGTGGCGGGTTTGAGCAGGCCGATGGATTCGTAGTAACGGATCATCTTGGTGCTGAGCCCGCt > 3:162318/1‑149 (MQ=255) aaaaGCCCAGGTCGCGGGAGCGCTTGATGAAGGCCAGGTTGTGCAAGTCTTGCGCCTGGTACAGGCGGTAGCCGCTGTCGCTGCGAGTGGCGGGTTTGAGCAGGCCGATGGATTCGTAGTAACGGATCATCTTGGTGCTGAGCCCGCTg > 8:110497/1‑149 (MQ=255) cccAGGTCGCGGGAGCGCTTGATGAAGGCCAGGTTGTGCAAGTCTTGCGCCTGGTACAGGCGGTAGCCGCTGTCGCTGCGAGTGGCGGGTTTGAGCAGGCCGATGGATTCGTAGTAACGGATCATCTTGGTGCTGAGCCCGCTgcggcg < 5:10061/149‑1 (MQ=255) gTCGCGGGAGCGCTTGATGAAGGCCAGGTTGTGCAAGTCTTGCGCCTGGTACAGGCGGTAGCCGCTGTCGCTGCGAGTGGCGGGTTTGAGCAGGCCGATGGATTCGTAGTAACGGATCATCTTGGTGCTGAGCCCGCTGCGgcgggcgg < 6:46447/149‑1 (MQ=255) gTCGCGGGAGCGCTTGATGAAGGCCAGGTTGTGCAAGTCTTGCGCCTGGTACAGGCGGTAGCCGCTGTCGCTGCGAGTGGCGGGTTTGAGCAGGCCGATGGATTCGTAGTAACGGATCATCTTGGTGCTGAGCCCGCTGCGgcgggcgg > 3:321555/1‑149 (MQ=255) gTCGCGGGAGCGCTTGATGAAGGCCAGGTTGTGCAAGTCTTGCGCCTGGTACAGGCGGTAGCCGCTGTCGCTGCGAGTGGCGGGTTTGAGCAGGCCGATGGATTCGTAGTAACGGATCATCTTCGTGCTGAGCCCGCTGCGgcgggcgg > 6:277783/1‑149 (MQ=255) tCGCGGGAGCGCTTGATGAAGGCCAGGTTGTGCAAGTCTTGCGCCTGGTACAGGCGGTAGCCGCTGTCGCTGCGAGTGGCGGGTTTGAGCAGGCCGATGGATTCGTAGTAACGGATCATCTTGGTGCTGAGCCCGCCGCagcgggctca < 8:50431/149‑4 (MQ=255) cgcgGGAGCGCTTGATGAAGGCCAGGTTGTGCAAGTCTTGCGCCTGGTACAGGCGGTAGCCGCTGTCGCTGCGAGTGGCGGGTTTGAGCAGGCCGATGGATTCGTAGTAACGGATCATCTTGGTGCTGAGCCCGCCGCagcgggctcag < 4:219674/149‑5 (MQ=255) gcgGGAGCGCTTGATGAAGGCCAGGTTGTGCAAGTCTTGCGCCTGGTACAGGCGGTAGCCGCTGTCGCTGCGAGTGGCGGGTTTGAGCAGGCCGATGGATTCGTAGTAACGGATCATCTTGGTGCTGAGCCCGCCGCagcgggctcagc < 4:87213/149‑6 (MQ=255) gcgGGAGCGCTTGATGAAGGCCAGGTTGTGCAAGTCTTGCGCCTGGTACAGGCGGTAGCCGCTGTCGCTGCGAGTGGCGGGTTTGAGCAGGCCGATGGATTCGTAGTAACGGATCATCTTGGTGCTGAGCCCGCCGCagcgggctcag < 6:433468/148‑5 (MQ=255) cgGGAGCGCTTGATGAAGGCCAGGTTGTGCAAGTCTTGCGCCTGGTACAGGCGGTAGCCGCTGTCGCTGCGAGTGGCGGGTTTGAGCAGGCCGATGGATTCGTAGTAACGGATCATCTTGGTGCTGAGCCCGCTGCGGCGGGCGGCCTg < 4:321555/149‑1 (MQ=255) gggAGCGCTTGATGAAGGCCAGGTTGTGCAAGTCTTGCGCCTGGTACAGGCGGTAGCCGCTGTCGCTGCGAGTGGCGGGTTTGAGCAGGCCGATGGATTCGTAGTAACGGATCATCTTGGTGCTGAGCCCGCTGCGGCGGGCGGCCTgg > 7:341872/1‑149 (MQ=255) gcgcTTGATGAAGGCCAGGTTGTGCAAGTCTTGCGCCTGGTACAGGCGGTAGCCGCTGTCGCTGCGAGTGGCGGGTTTGAGCAGGCCGATGGATTCGTAGTAACGGATCATCTTGGTGCTGAGCCCGCTGCGGCGGGCGGCCTGGCCGa < 7:196853/149‑1 (MQ=255) gcTTGATGAAGGCCAGGTTGTGCAAGTCTTGCGCCTGGTACAGGCGGTAGCCGCTGTCGCTGCGAGTGGCGGGTTTGAGCAGGCCGATGGATTCGTAGTAACGGATCATCTTGGTGCTGAGCCCGCTGCGGCGGGCGGCCTGGCCGATg > 7:53486/1‑149 (MQ=255) cTTGATGAAGGCCAGGTTGTGCAAGTCTTGCGCCTGGTACAGGCGGTAGCCGCTGTCGCTGCGAGTGGCGGGTTTGAGCAGGCCGATGGATTCGTAGTAACGGATCATCTTGGTGCTGAGCCCGCCGCagcgggctcagc < 1:395948/140‑6 (MQ=255) cTTGATGAAGGCCAGGTTGTGCAAGTCTTGCGCCTGGTACAGGCGGTAGCCGCTGTCGCTGCGAGTGGCGGGTTTGAGCAGGCCGATGGATTCGTAGTAACGGATCATCTTGGTGCTGAGCCCGCCGCagcgggctcagc > 2:395948/1‑135 (MQ=255) gatgaAGGCCAGGTTGTGCAAGTCTTGCGCCTGGTACAGGCGGTAGCCGCTGTCGCTGCGAGTGGCGGGTTTGAGCAGGCCGATGGATTCGTAGTAACGGATCATCTTGGTGCTGAGCCCGCTGCGGCGGGCGGCCTGGCCGATGTTCa > 3:28376/1‑149 (MQ=255) gaAGGCCAGGTTGTGCAAGTCTTGCGCCTGGTACAGGCGGTAGCCGCTGTCGCTGCGAGTGGCGGGTTTGAGCAGGCCGATGGATTCGTAGTAACGGATCATCTTGGTGCTGAGCCCGCTGCGGCGGGCGGCCt < 1:220864/134‑1 (MQ=255) gaAGGCCAGGTTGTGCAAGTCTTGCGCCTGGTACAGGCGGTAGCCGCTGTCGCTGCGAGTGGCGGGTTTGAGCAGGCCGATGGATTCGTAGTAACGGATCATCTTGGTGCTGAGCCCGCTGCGGCGGGCGGCCt > 2:220864/1‑134 (MQ=255) aGGCCAGGTTGTGCAAGTCTTGCGCCTGGTACAGGCGGTAGCCGCTGTCGCTGCGAGTGGCGGGTTTGAGCAGGCCGATGGATTCGTAGTAACGGATCATCTTGGTGCTGAGCCCGCTg > 6:59658/1‑119 (MQ=255) aGGCCAGGTTGTGCAAGTCTTGCGCCTGGTACAGGCGGTAGCCGCTGTCGCTGCGAGTGGCGGGTTTGAGCAGGCCGATGGATTCGTAGTAACGGATCATCTTGGTGCTGAGCCCGCTg < 5:59658/119‑1 (MQ=255) gCCAGGTTGTGCAAGTCTTGCGCCTGGTACAGGCGGTAGCCGCTGTCGCTGCGAGTGGCGGGTTTGAGCAGGCCGATGGATTCGTAGTAACGGATCATCTTGGTGCTGAGCCCGCTGCGGCGGGCGGCCTGGCCGATGTTCATGGCGcc > 3:400061/1‑149 (MQ=255) ccAGGTTGTGCAAGTCTTGCGCCTGGTACAGGCGGTAGCCGCTGTCGCTGCGAGTGGCGGGTTTGAGCAGGCCGATGGATTCGTAGTAACGGATCATCTTGGTGCTGAGCCCGCTGCGGCGGGCGGCCTGGCCGATGTTCATGGCGcct > 3:43372/1‑149 (MQ=255) cAGGTTGTGCAAGTCTTGCGCCTGGTACAGGCGGTAGCCGCTGTCGCTGCGAGTGGCGGGTTTGAGCAGGCCGATGGATTCGTAGTAACGGATCATCTTGGTGCTGAGCCCGCTGCGGCGGGCGGCCTGGCCGATGTTCATGGCGcctc > 6:294041/1‑149 (MQ=255) aGGTTGTGCAAGTCTTGCGCCTGGTACAGGCGGTAGCCGCTGTCGCTGCGAGTGGCGGGTTTGAGCAGGCCGATGGATTCGTAGTAACGGATCATCTTGGTGCTGAGCCCGCTGCGGCGGGCGGCCTGGCCGATGTTCATGGCGcctcc > 3:177946/1‑149 (MQ=255) gTTGTGCAAGTCTTGCGCCTGGTACAGGCGGTAGCCGCTGTCGCTGCGAGTGGCGGGTTTGAGCAGGCCGATGGATTCGTAGTAACGGATCATCTTGGTGCTGAGCCCGCTGCGGCGGGCGGCCTGGCCGATGTTCATGGCGcctcct < 8:53486/148‑1 (MQ=255) gTTGTGCAAGTCTTGCGCATTGTACAGGAGGTAGCCTCTGTCGCTGCGAGTGGCGGTTTTGAGCAGGCCGATGGATTCGTAGTAACGGATCATCTTGTTGCTGAGACAGCTGCGGCGGGCGGACTGGCCGATGTTCATGGCGCCTCCTg > 8:295264/1‑149 (MQ=255) ttGTGCAAGTCTTGCGCCTGGTACAGGCGGTAGCCGCTGTCGCTGCGAGTGGCGGGTTTGAGCAGGCCGATGGATTCGTAGTAACGGATCATCTTGGTGCTGAGCCCGCTGCGGCGGGCGGCCTGGCCGATGTTCATGGCGCCTCCTgg < 4:315606/149‑1 (MQ=255) tgCAAGTCTTGCGCCTGGTACAGGCGGTAGCCGCTGTCGCTGCGAGTGGCGGGTTTGAGCAGGCCGATGGATTCGTAGTAACGTATCATCTTGGTGCTGAGCCCTCTGCGGCGGGCGGCCTGGCCGATGTTCATGGCGCCTCCtgtgtg < 7:295264/149‑1 (MQ=255) cAAGTCTTGCGCCTGGTACAGGCGGTAGCCGCTGTCGCTGCGAGTGGCGGGTTTGAGCAGGCCGATGGATTCGTAGTAACGGATCATCTTGGTGCTGAGCCCGCTGCGGCGGGCGGCCTGGCCGATGTTCATGGCGCCTCCTGGGtgct > 2:227534/1‑149 (MQ=255) aaGTCTTGCGCCTGGTACAGGCGGTAGCCGCTGTCGCTGCGAGTGGCGGGTTTGAGCAGGCCGATGGATTCGTAGTAACGGATCATCTTGGTGCTGAGCCCGCTGCGGCGGGCGGCCTGGCCGATGTTCATGGCGCCTCCTGGGtgctg > 5:237366/1‑149 (MQ=255) aaGTCTTGCGCCTGGTACAGGCGGTAGCCGCTGTCGCTGCGAGTGGCGGGTTTGAGCAGGCCGATGGATTCGTAGTAACGGATCATCTTGGTGCTGAGCCCGCTGCGGCGGGCGGCCTGGCCGATGTTCATGGCGCCTCCTGGGtgctg > 1:303381/1‑149 (MQ=255) ttGCGCCTGGTACAGGCGGTAGCCGCTGTCGCTGCGAGTGGTGGGTTTGAGCAGGCCGATGGATTCGTAGTAACGGATCATCTTGGTGCTGAGCCCGCTGCGGCGGGCGGCCTGGCCGATGTTCATGGCGCCTCCTGGGTGCTGCtggt > 6:72770/1‑149 (MQ=255) ttGCGCCTGGTACAGGCGGTAGCCGCTGTCGCTGCGAGTGGCGGGTTTGAGCAGGCCGATGGATTCGTAGTAACGGATCATCTTGGTGCTGAGCCCGCTGCGGCGGGCGGCCTGGCCGATGTTCGTGGCGCCTCCTGGGTGCTGCtggt > 3:287559/1‑149 (MQ=255) ttGCGCCTGGTACAGGCGGTAGCCGCTGTCGCTGCGAGTGGCGGGTTTGAGCAGGCCGATGGATTCGTAGTAACGGATCATCTTGGTGCTGAGCCCGCTGCGGCGGGCGGCCTGGCCGATGTTCATGGCGCCTCCTgg < 3:385614/138‑1 (MQ=255) ttGCGCCTGGTACAGGCGGTAGCCGCTGTCGCTGCGAGTGGCGGGTTTGAGCAGGCCGATGGATTCGTAGTAACGGATCATCTTGGTGCTGAGCCCGCTGCGGCGGGCGGCCTGGCCGATGTTCATGGCGCCTCCTgg > 4:385614/1‑138 (MQ=255) 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gTACAGGCGGTAGCCGCTGTCGCTGCGAGTGGCGGGTTTGAGCAGGCCGATGGATTCGTAGTAACGGATCATCTTGGTGCTGAGCCCGCTGCGGCGGGCGGCCTGGCCGTTGTTCATGGCGCCTCCTGGGTGCTGCTGGTGGGTTTcc < 7:110497/148‑1 (MQ=255) aCAGGCGGTAGCCGCTGTCGCTGCGAGTGGCGGGTTTGAGCAGGCCGATGGATTCGTAGTAACGGATCATCTTGGTGCTGAGCCCGCTGCGGCGGGCGGCCTGGCCGATGTTCATGGCGCCTCCTGGGTGCTGCTGGTGGGTTTCCa > 6:395923/1‑147 (MQ=255) aCAGGCGGTAGCCGCTGTCGCTGCGAGTGGCGGGTTTGAGCAGGCCGATGGATTCGTAGTAACGGATCATCTTGGTGCTGAGCCCGCTGCGGCGGGCGGCCTGGCCGATGTTCATGGCGCCTCCTGGGTGCTGCTGGTGGGTTTCCa < 5:395923/147‑1 (MQ=255) ggCGGTAGCCGCTGTCGCTGCGAGTGGCGGGTTTGAGCAGGCCGATGGATTCGTAGTAACGGATCATCTTGGTGCTGAGCCCGCTGCGGCGGGCGGCCTGGCCGATGTTCATGGCGCCTCCTGGGTGCTGCTGGTGGGTTTCCACGttt > 4:138208/1‑149 (MQ=255) gCGGTAGCCGCTGTCGCTGCGAGTGGCGGGTTTGAGCAGGCCGATGGATTCGTAGTAACGGATCATCTTGGTGCTGAGCCCGCTGCGGCGGGCGGCCTGGCCGATGTTCATGGCGCCTCCTGGGTGCTGCTGGTGGGTTTCCAc > 3:8728/1‑144 (MQ=255) gCGGTAGCCGCTGTCGCTGCGAGTGGCGGGTTTGAGCAGGCCGATGGATTCGTAGTAACGGATCATCTTGGTGCTGAGCCCGCTGCGGCGGGCGGCCTGGCCGATGTTCATGGCGCCTCCTGGGTGCTGCTGGTGGGTTTCCAc < 4:8728/144‑1 (MQ=255) gCGGTAGCCGCTGTCGCTGCGAGTGGCGGGTTTGAGCAGGCCGATGGATTCGTAGTAACGGATCATCTTGGTGCTGAGCCCGCTGCGGCGGGCGGCCTGGCCGATGTTCATGGCGCCTCCTGGGTGCTGCTGGTGGGTTTCCACGttt < 5:294041/148‑1 (MQ=255) ggTAGCCGCTGTCGCTGCGAGTGGCGGGTTTGAGCAGGCCGATGGATTCGTAGTAACGGATCATCTTGGTGCTGAGCCCGCTGCGGCGGGCGGCCTGGCCGATGTTCATGGCGCCTCCTGGGTGCTGCTGGTGGGTTTCCACGTTTTaa < 5:121848/149‑1 (MQ=255) gTAGCCGCTGTCGCTGCGAGTGGCGGGTTTGAGCAGGCCGATGGATTCGTAGTAACGGATCATCTTGGTGCTGAGCCCGCTGCGGCGGGCGGCCTGGCCGATGTTCATGGCGCCTCCTGGGTGCTGCTGGTGGGTTTCCACGTTTTAAg > 5:376124/1‑149 (MQ=255) gTAGCCGCTGTCGCTGCGAGTGGCGGGTTTGAGCAGGCCGATGGATTCGTAGTAACGGATCATCTTGGTGCTGAGCCCGCTGCGGCGGGCGGCCTGGCCGATGTTCATGGCGCCTCCTGGGAGCTGCTGGTGGGTTTCCACGTTTTAAg > 6:207669/1‑149 (MQ=255) tAGCCGCTGGCGCGGCGAGTGGCGGGTGTGAGCAGGCCGATGGATTCGTAGTAACCGATCATCTTGGTGCTGACCCCGCTGCGGCGGGCGGCCTGGCCGATGTTCATGGCGCCTCCTGGGTGCTGCTGGTGGGCTTCCACGTTTTAAGc < 4:43372/149‑1 (MQ=255) ccGCTGTCGCTGCGAGTGGCGGGTTTGAGCAGGCCGATGGATTCGTAGTAACGGATCATCTTGGCGCTGAGCCCGCTGCGGCGGGCGGCCTGGCCGATGTTCATCGCGCCTCCTGGGTGCTGCTGGTGGGTTTCCACGTTTTAAGCca > 8:77202/1‑148 (MQ=255) cGCTGTCGCTGCGAGTGGCGGGTTTGAGCAGGCCGATGGATTCGTAGTAACGGATCATCTTGGTGCTGAGCCCGCTGCGGCGGGCGGCCTGGCCGATGTTCGTGGCGCCTCCTGGGTGCTGCTGGTGGGTTTCCACGTTTTAAGCcaca < 4:287559/149‑1 (MQ=255) cGCTGTCGCTGCGAGTGGCGGGTTTGAGCAGGCCGATGGATTCGTAGTAACGGATCATCTTGGTGCTGAGCCCGCTGCGGCGGGCGGCCTGGCCGATGTTCATGGCGCCTCCTGGGTGCTGCTGGTGGGTTTCCACGTTTTAAGCca > 6:18071/1‑147 (MQ=255) gCTGTCGCTGCGAGTGGCGGGTTTGAGCAGGCCGATGGATTCGTAGTAACGGATCATCTTGGTGCTGAGCCCGCTGCGGCGGGCGGCCTGGCCGATGTTCATGGCGCCTCCTGGGTGCTGCTGGTGGGTTTCCACGTTTTAAGCCACAg > 3:311924/1‑149 (MQ=255) 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aGTGGCGGGTTTGAGCAGGCCGATGGATTCGTAGTAACGGATCATCTTGGTGCTGAGCCCGCTGCGGCGGGCGGCCTGGCCGATGTTCATGGCGCCTCCTGGGTGCTGCTGGTGGGTTTCCACGTTTTAAGCCACAGTGCATTGCTgac > 7:105185/1‑149 (MQ=255) gCGGGTTTGAGCAGGCCGATGGATTCGTAGTAACGGATCATCTTGGTGCTGAGCCCGCTGCGGCGGGCGGCCTGGCCGATGTTCATGGCGCCTCCTGGGTGCTGCTGGTGGGTTTCCACGTTTTAAGCCACAGTGCATTGCTGacgacg > 3:128395/1‑149 (MQ=255) ggTTTGAGCAGGCCGATGGATTCGTAGTAACGGATCATCTTGGTGCTGAGCCCGCTGCGGCGGGCGGCCTGGCCGATGTTCATGGCGCCTCCTGGGTGCTGCTGGTGGGTTTCCACGTTTTAAGCCACAGTGCATTGCTGACGACGCt > 1:229528/1‑148 (MQ=255) tttGAGCAGGCCGATGGATTCGTAGTAACGGATCATCTTGGTGCTGAGCCCGCTGCGGCGGGCGGCCTGGCCGATGTTCATGGCGCCTCCTGGGTGCTGCTGGTGGGTTTCCACGTTTTAAGCCACAGTGCATTGCTga > 2:79422/1‑139 (MQ=255) tttGAGCAGGCCGATGGATTCGTAGTAACGGATCATCTTGGTGCTGAGCCCGCTGCGGCGGGCGGCCTGGCCGATGTTCATGGCGCCTCCTGGGTGCTGCTGGTGGGTTTCCACGTTTTAAGCCACAGTGCATTGCTga < 1:79422/139‑1 (MQ=255) tttGAGCAGGCCGATGGATTCGTAGTAAAGGATCATCTTGGTGCTGAGCCCGCTGCGGCGGGCGGCCTGGCCGATGTTCATGGCGCCTCCTGGGTGCTGCTGGTGGGTTTCCACGTTTTAAGCCACAGTGCATTGCTGACGACGCTGa > 1:27166/1‑148 (MQ=255) ccGATGGATTCGTAGTAACGGATCATCTTGGTGCTGAGCCCGCTGCGGCGGGCGGCCTGGCCGATGTTCATGGCGCCTCCTGGGTGCTGCTGGTGGGTTTCCACGTTTTAAGCCACAGTGCATTGCTGACGACGCTGACACTGGACAgg < 6:25202/149‑1 (MQ=255) cGATGGATTCGTAGTAACGGATCATCTTGGTGCTGAGCCCGCTGCGGCGGGCGGCCTGGCCGATGTTCATGGCGCCTCCTGGGTGCTGCTGGTGGGTTTCCACGTTTTAAGCCACAGTGCATTGCTGACGACGCTGACACTGGACAggg > 3:402949/1‑149 (MQ=255) gATTCGTAGTAACGGATCATCTTGGTGCTGAGCCCGCTGCGGCGGGCGGCCTGGCCGATGTTCATGGCGCCTCCTGGGTGCTGCTGGTGGGTTTCCACGTTTTAAGCCACAGTGCATTGCTGACGACGCTGACACTGGACAGGGCCAt < 4:400061/148‑1 (MQ=255) aTTCGTAGTAACGGATCATCTTGGTGCTGAGCCCGCTGCGGCGGGCGGCCTGGCCGATGTTCATGGCGCCTCCTGGGTGCTGCTGGTGGGTTTCCACGTTTTAAGCCACAGTGCATTGCTGACGACGCTGACACTGGACAGGGCCATgg > 1:158809/1‑149 (MQ=255) 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taACGGATCATCTTGGTGCTGAGCCCGCTGCGGCGGGCGGCCTGGCCGATGTTCATGGCGCCTCCTGGGTGCTGCTGGTGGGTTTCCACGTTTTAAGCCACAGTGCATTGCTGACGACGCTGACACTGGACAGGGCCATGGCGGCTCCt < 4:177946/149‑1 (MQ=255) taACGGATCATCTTGGTGCTGAGCCCGCTGCGGCGGGCGGCCTGGCCGATGTTCATGGCGCCTCCTGGGTGCTGCTGGTGGGTTTCCACGTTTTAAGCCACAGTGCATTGCTGACGACGCTGACACTGGACAGGGCCATGGCGGCTCCt > 8:297450/1‑149 (MQ=255) ggATCATCTTGGTGCTGAGCCCGCTGCGGCGGGCGGCCTGGCCGATGTTCATGGCGCCTCCTGGGTGCTGCTGGTGGGTTTCCACGTTTTAAGCCACAGTGCATTGCTGACGACGCTGACACTGGACAGGGCCATGGCGGCTCCTGc > 5:423773/1‑147 (MQ=255) atcatcTTGGTGCTGAGCCCGCTGCGGCGGGCGGCCTGGCCGATGTTCATGGCGCCTCCTGGGTGCTGCTGGTGGGTTTCCACGTTTTAAGCCACAGTGCATTGCTGACGACGCTGACACTGGACAGGGCCATGGCGGCTCCTGCCAg > 1:420444/1‑148 (MQ=255) atcTTGGTGCTGAGCCCGCTGCGGCGGGCGGCCTGGCCGATGTTCATGGCGCCTCCTGGGTGCTGCTGGTGGGTTTCCACGTTTTATGCCACAGTGCATTGCTGACGACGCTGACACTGGACAGGGCCATGGCGGCTCCTGCCAGTAcc > 3:205188/1‑149 (MQ=255) atcTTGGTGCTGAGCCCGCTGCGGCGGGCGGCCTGGCCGATGTTCATGGCGCCTCCTGGGTGCTGCTGGTGGGTTTCCACGTTTTAAGCCACAGTGCATTGCTGACGACGCTGACACTGGACAGGGCCATGGCGGCTCCTGCCAGTAcc > 2:414651/1‑149 (MQ=255) ttGGTGCTGAGCCCGCTGCGGCGGGCGGCCTGGCCGATGTTCATGGCGCATCCTGGGTGCTGCTGGTGGGATTCCACGTTTTAAGCCACAGTGCATTGCTGACGACGCTGACACTGGACAGGGCCATGGCGGCACCTGCCAGTACCggg > 5:442590/1‑149 (MQ=255) ggTGCTGAGCCCGCTGCGGCGGGCGGCCTGGCCGATGTTCATGGCGCCTCCTGGGTGCTGCTGGTGGGTTTCCACGTTTTAAGCCACAGTGCATTGCTGACGACGCTGACACTGGACAGGGCCATGGCGGCTCCTGCCAGTACCggg < 4:162318/147‑1 (MQ=255) ggTGCTGAGCCCGCTGCGGCGGGCGGCCTGGCCGATGTTCATGGCGCCTCCTGGGTGCTGCTGGTGGGTTTCCACGTTTTAAGCCACAGTGCATTGCTGACGACGCTGACACTGGACAGGGCCATGGCGGCTCCTGCCAGTACCGGGt < 6:376124/148‑1 (MQ=255) gTGCTGAGCCCGCTGCGGCGGGCGGCCTGGCCGATGTTCATGGCGCCTCCTGGGTGCTGCTGGTGGGTTTCCACGTTTTAAGCCACAGTGCATTGCTGACGACGCTGACACTGGACAGGGCCATGGCGGCTCCTGCCAGTACCGGGtt < 2:229528/148‑1 (MQ=255) gCTGAGCCCGCTGCGGCGGGCGGCCTGGCCGATGTTCATGGCGCCTCCTGGGTGCTGCTGGTGGGTTTCCACGTTTTAAGCCACAGTGCATTGCTGACGACGCTGACACTGGACAGGGCCATGGCGGCTCCTGCCAGTACCGGGTTGAg < 3:306310/149‑1 (MQ=255) gCTGAGCCCGCTGCGGCGGGCGGCCTGGCCGATGTTCATGGCGCCTCCTGGGTGCTGCTGGTGGGTTTCCACGTTTTAAGCCACAGTGCATTGCTGACGACGCTGACACTGGACAGGGCCATGGCGGCTCCTGCCAGTACCGGGTTGAg > 5:23474/1‑149 (MQ=255) aggccgCCCGCCGCAGCGGGCGGCCTGGCCGATGTTCATGGCGCCTCCTGGGTGCTGCTGGTGGGTTTCCACGTTTTAAGCCACAGTGCATTGCTGACGACGCTGACACTGGACACGGCCATGGCGGCTCCTGCCAGTACCGGGGTGAg > 4:107013/6‑149 (MQ=255) cTGAGCCCGCTGCGGCGGGCGGCCTGGCCGATGTTCATGGCGCCTCCTGGGTGCTGCTGGTGGGTTTCCACGTTTTAAGCCACAGTGCATTGCTGACGACGCTGACACTGGACAGGGCCATGGCGGCTCCTGCCAGTACCGGGTTGAg < 1:414651/148‑1 (MQ=255) cTGAGCCCGCTGCGGCGGGCGGCCTGGCCGATGTTCATGGCGCCTCCTGGGTGCTGCTGGTGGGTTTCCACGTTTTAAGCCACAGTGCATTGCTGACGACGCTGACACTGGACAGGGCCATGGCGGCTCCTGCCAGTACCGGGTTGAg < 3:138208/148‑1 (MQ=255) cTGAGCCCGCTGCGGCGGGCGGCCTGGCCGATGTTCATGGCGCCTCCTGGGTGCTGCTGGTGGGGTTCCACGTTTTAAGCCACAGTGCATTGCTGACGACGCTGACACTGGACAGGGCCATGGCGGCTCCTGCCAGTACCGGGTTGAgg < 3:258954/149‑1 (MQ=255) gAGCCCGCTGCGGCGGGCGGCCTGGCCGATGTTCATGGCGCCTCCTGGGTGCTGCTGGTGGGTTTCCACGTTTTAAGCCACAGTGCATTGCTGACGACGCTGACACTGGACAGGGCCATGGCGGCTCCTGCCAGTACCGGGTTGAGGt > 6:92532/1‑148 (MQ=255) gAGCCCGCTGCGGCGGGCGGCCTGGCCGATGTTCATGGCGCCTCCTGGGTGCTGCTGGTGGGTTTCCACGTTTTAAGCCACAGTGCATTGCTGACGACGCTGACACTGGACAGGGCCATGGCGGCTCCTGCCAGTACCGGGTTGAGGt > 7:67530/1‑148 (MQ=255) ccgCCCGCCGCAGCGGGCGGCCTGGCCGATGTTCATGGCGCCTCCTGGGTGCTGCTGGTGGGTTTCCACGTTTTAAGCCACAGTGCATTGCTGACGACGCTGACACTGGACAGGGCCATGGCGGCTCCTGCCAGTACCGGGTTGAGGt > 2:418872/3‑148 (MQ=255) cccGCTGCGGCGGGCGGCCTGGCCGATGTTCATGGCGCCTGCTGGGTGCTGCTGGTGGGTTTCCACGTTTTAAGCCACAGTGCATTGCTGACGACGCTGACACTGGACCGGGCCATGGCGGCTCCTGCCCGTACCGGGTTGAGGTaagc > 6:5588/1‑147 (MQ=255) cGCTGCGGCGGGCGGCCTGGCCGATGTTCATGGCGCCTCCTGGGTGCTGCTGGTGGGTTTCCACGTTTTAAGCCACAGTGCATTGCTGACGACGCTGACACTGGACAGGGCCATGGCGGCTCCTGCCAGTACCGGGTTGAGGTAACCCa < 5:92532/149‑1 (MQ=255) gCTGCGGCGGGCGGCCTGGCCGATGTTCATGGCGCCTCCTGGGTGCTGCTGGTGGGTTTCCACGTTTTAAGCCACAGTGCATTGCTGACGACGCTGACACTGGACAGGGCCATGGCGGCTCCTGCCAGTACCggg > 2:292141/1‑135 (MQ=255) gCTGCGGCGGGCGGCCTGGCCGATGTTCATGGCGCCTCCTGGGTGCTGCTGGTGGGTTTCCACGTTTTAAGCCACAGTGCATTGCTGACGACGCTGACACTGGACAGGGCCATGGCGGCTCCTGCCAGTACCggg < 1:292141/135‑1 (MQ=255) | GAAAAGCCCAGGTCGCGGGAGCGCTTGATGAAGGCCAGGTTGTGCAAGTCTTGCGCCTGGTACAGGCGGTAGCCGCTGTCGCTGCGAGTGGCGGGTTTGAGCAGGCCGATGGATTCGTAGTAACGGATCATCTTGGTGCTGAGCCCGCTGCGGCGGGCGGCCTGGCCGATGTTCATGGCGCCTCCTGGGTGCTGCTGGTGGGTTTCCACGTTTTAAGCCACAGTGCATTGCTGACGACGCTGACACTGGACAGGGCCATGGCGGCTCCTGCCAGTACCGGGTTGAGGTAACCCA > NC_002947/683675‑683968 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |