| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 713,097 | T→A | 7.7% | I29N (ATC→AAC) | lspA → | lipoprotein signal peptidase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 713,097 | 0 | T | A | 7.7% | 256.1 / 7.9 | 88 | I29N (ATC→AAC) | lspA | lipoprotein signal peptidase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (39/41); new base A (2/5); total (42/46) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.39e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.64e-01 | |||||||||||
GGCAGCCATCCGGAGCACCCGGAAATCTGCGGCCGTTGCGTCGACAACCTGACCGGCTCGG‑GTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACC‑CTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGACTACTTCAGCTGGAC‑CCTGGCTTACAACACCGGTGCCGCGTTCAGCTTCCTGGCTGACGGAGCGGGTTGGCAGCGCTGG > NC_002947/712951‑713245 | ggCAGCCATCCGGAGCACCCGGAAATCTGCGGCCGTTGCGTCGACAACCTGACCGGCTCGG‑GTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACC‑CTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTCATc > 8:170430/1‑148 (MQ=255)ggCAGCCATCCGGAGCACCCGGAAATCTGCGGCCGTTGCGTCGACAACCTGACCGGCTCGG‑GTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACC‑CTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTCATc > 5:412007/1‑148 (MQ=255)ggCAGCCATCCGGAGCACCCGGAAATCTGCGGCCGTTGCGTCGACAACCTGACCGGCTCGG‑GTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACC‑CTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTCATc < 2:321058/148‑1 (MQ=255) ccATCCGGAGCACCCGGAAATCTGCGGCCGTTGCGTCGACAACCTGACCGGCTCGG‑GTGAGGTGCGACACTATGCCTAACC‑CTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTCAACGACCAg > 5:434137/1‑149 (MQ=255) aTCCGGAGCACCCGGAAATCTGCGGCCGTTGCGTCGACAACCTGACCGGCTCGG‑GTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACC‑CTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTCGATGACCAgga < 3:35700/149‑2 (MQ=255) tCCGGAGCACCCGGAAATCTGCGGCCGTTGCGTCGACAACCTGACCGGCTCGGTGTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACC‑CTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑c > 1:113623/1‑149 (MQ=255) tCCGGAGCACCCGGAAATCTGCGGCCGTTGCGTCGACAACCTGACCGGCTCGG‑GTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACC‑CTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑c > 4:151148/1‑148 (MQ=255) cGGAGGACCCGGAAATCTGCTGCCTTTGCGTCGACAACCTGACCGGCTCGG‑GTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACC‑CTGCAGCGTGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑ccac < 6:434137/149‑1 (MQ=255) cGGAGCACCCGGAAATCTGCGGCCGTTGCGTCGACAACCTGACCGGCTCGG‑GTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACC‑CTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGGCCTGGTCGATGACCAggacca < 7:402302/149‑5 (MQ=255) ggAGCACCCGGAAATCTGCGGCCGTTGCGTCGACAACCTGACCGGCTCGG‑GTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACC‑CTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑ccacc < 6:412007/149‑1 (MQ=255) cACCCGGAAATCTGCGGCCGTTGCGTCGACAACCTGACCGGCTCGG‑GTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACC‑CTGCAGTGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGc < 7:357380/149‑1 (MQ=255) ccGGAAATCTGCGGCCGTTGCGTCGACAACCTGACCGGCTCGG‑GTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACC‑CTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGGTGG‑CCTGGTCGATGACCAGGACCAGCAAGCtca < 7:121105/149‑3 (MQ=38) ccGGAAATCTGCGGCCGTTGCGTCGACAACCTGACCGGCTCGG‑GTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACC‑CTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTg > 5:307577/1‑148 (MQ=255) cGGAAATCTGCGGCCGTTGCGTCGACAACCTGACCGGCTCGG‑GTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACC‑CTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGGTGG‑CCTGGTCGATGACCAGGACCAGCAAGCtcag < 4:178379/149‑4 (MQ=37) aaTCTGCGGCCGTTGCGTCGACAACCTGACCGGCTCGG‑GTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACC‑CTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTc < 4:269165/149‑1 (MQ=255) tCTGCGGCCGTTGCGTCGACAACCTGACCGGCTCGG‑GTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACC‑CTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTcaa > 6:36646/1‑149 (MQ=255) tCTGCGGCCGTTGCGTCGACAACCTGACCGGCTCGG‑GTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACC‑CTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTcaa > 3:356483/1‑149 (MQ=255) ccGTTGCGTCGACAACCTGACCGGCTCGG‑GTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACC‑CTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGcc < 8:119329/149‑1 (MQ=255) cGTTGCGTCGACAACCTGACCGGCTCGG‑GTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACC‑CTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGccc > 3:224051/1‑149 (MQ=255) cGTTGCGTCGACAACCTGACCGGCTCGG‑GTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACC‑CTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGccc > 5:177855/1‑149 (MQ=255) ttGCGTCGACAACCTGACCGGCTCGG‑GTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACC‑CTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGGCCTGGTCGATGACCAggacca > 6:71674/1‑120 (MQ=255) ttGCGTCGACAACCTGACCGGCTCGG‑GTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACC‑CTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGGCCTGGTCGATGACCAggacca < 5:71674/124‑5 (MQ=255) gTCGACAACCTGACCGGCTCGG‑GTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACCACTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGAc > 1:95461/1‑148 (MQ=255) gTCGACAACCTGACCGGCTCGG‑GTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACC‑CTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGCCCa > 6:397774/1‑149 (MQ=255) tCGACAACCTGACCGGCTCGG‑GTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACC‑CTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCAt < 7:170430/149‑1 (MQ=255) tCGACAACCTGACCGGCTCGG‑GTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACC‑CTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCAt < 5:360396/149‑1 (MQ=255) aCAACCTGACCGGCTCGG‑GTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACC‑CTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTa > 1:397249/1‑149 (MQ=255) aCAACCTGACCGGCTCGG‑GTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACC‑CTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACAAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTa > 8:179158/1‑149 (MQ=255) aCAACCTGACCGGCTCGG‑GTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACC‑CTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGATGAGCTTGCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTa > 3:22846/1‑149 (MQ=255) aCCGGCTCGG‑GTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACC‑CTGCAGCGGGTCGCTTCGGTCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGa < 5:400270/149‑1 (MQ=255) cGGCTCGG‑GTGAGGTGCGCCTGTATGCGTAACC‑GTGCAGCGGGGCGCTTCTGGCGCCTTGCTTGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCTCCAAGGTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATc < 7:214266/149‑1 (MQ=255) cGGCTCGG‑GTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACC‑CTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATc < 4:53974/149‑1 (MQ=255) cTCGG‑GTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACC‑CTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTg < 8:354873/149‑1 (MQ=255) cTCGG‑GTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACC‑CTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTg > 5:225243/1‑149 (MQ=255) gg‑gTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACC‑CTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACTAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTgg < 8:64828/147‑1 (MQ=255) gg‑gTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACC‑CTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGt > 2:343255/1‑148 (MQ=255) gTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACC‑CTGCAGAGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCa > 7:285502/1‑148 (MQ=255) tGAGGTGCGCCACTATGCCTAACC‑CTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTTGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACca < 8:270755/133‑1 (MQ=255) tGAGGTGCGCCACTATGCCTAACC‑CTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTCGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACca > 7:270755/1‑133 (MQ=255) gTGCGCCACTATGCCTAACC‑CTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGAcc < 7:129661/121‑1 (MQ=255) gTGCGCCACTATGCCTAACC‑CTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGAcc > 8:129661/1‑121 (MQ=255) gcgcCACTATGCCTAACC‑CTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGac > 8:32270/1‑149 (MQ=255) cgcCACTATGCCTAACC‑CTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGGCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGac < 5:333921/148‑1 (MQ=255) gcCACTATGCCTAACC‑CTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGacta > 5:25961/1‑149 (MQ=255) cACTATGCCTAACC‑CTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTg < 2:301925/133‑1 (MQ=255) cACTATGCCTAACC‑CTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTCAGCTTGCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTg > 1:301925/1‑133 (MQ=255) aCTATGCCTAACC‑CTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGACTACtt < 6:307577/149‑1 (MQ=255) ccTAACC‑CTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGTAGATCGTGGTCATTCCTGACTACTTCAGCt < 1:38730/148‑1 (MQ=255) cTAACC‑CTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGACTACTTCAGCTgg < 5:180165/149‑1 (MQ=255) cTAACC‑CTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGACTACTTCAGCTg > 2:14147/1‑148 (MQ=255) cTAACC‑CTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGACTACTTCAGCTg > 6:159805/1‑148 (MQ=255) 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cAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGACTACTTCAGCTGGAC‑CCTGGc < 2:113623/148‑1 (MQ=255) cAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGACTACTTCAGCTGGAC‑CCTGGc < 3:151148/148‑1 (MQ=255) cAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGACTACTTCAGCTGGAC‑CCTGGc < 2:95461/148‑1 (MQ=255) cgcTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGACTACTTCAGCTGGAC‑CCTGGCTTACAacac < 5:146962/149‑1 (MQ=255) gcgcCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGACTACTTCAGCTGGAC‑CCTGGCTTACAACACCGGTGCcg > 6:182187/1‑149 (MQ=255) 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5:214699/149‑1 (MQ=255) gtcctggtcATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGACTACTTCAGCTGGAC‑CCTGGCTTACAACACCGGTGCCGCGTTCAGCTTCCTGGCTGACGGAGCGGGTTg > 3:170642/1‑149 (MQ=255) gtccaggtcAGCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACATCAACAACGCCCTGACAATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGACTACTTCAGCTGGAC‑CCTGGCGTACAACCCCGGTGCCGCGTTCCGATTCGTGGCTGACGGAGCGGGtgg > 8:187042/1‑147 (MQ=255) tcctggtcATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGACTACTTCAGCTGGAC‑CCTGGCTTACAACACCGGTGCcgc > 2:290927/1‑118 (MQ=255) tcctggtcATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGACTACTTCAGCTGGAC‑CCTGGCTTACAACACCGGTGCcgc < 1:290927/118‑1 (MQ=255) tggtcATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGACTACTTCAGCTGGAC‑CCTGGCTTACAACACCGGTGCCGCGTTCAGCTTCCTGGCTGCCGGAGCGGGTTGGCAg > 4:248793/1‑149 (MQ=255) tggtcATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTAAACAAATCACTGACCATGTACCATCAGATCGTGGTCATTACTGACTAATTCAGATGGAC‑AATGGATTACAACACCGGTGCCGCGTTCAGCTTCCTGTCTGCCGGATCGGGTTGGCAg > 4:254024/1‑149 (MQ=255) tcATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGACTACTTCAGCTGGAC‑CCTGGCTTACAACACCGGTGCCGCGTTCAGCTTCCTGGCTGACGGAGCGGGTTGGCAgcgc < 6:25961/149‑1 (MQ=255) cATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCATATGGGGGCCATTCCTTACTACTTCAGCTGGACACCTGGCTTACAACACCGGTGCCGCGTTCAGCTTCCTGGCTGACGGAGCGGGTTGGCAgcgc < 1:343255/149‑1 (MQ=255) aTCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGACTACTTCAGCTGGAC‑CCTGGCTTACAACACCGGTGCCGCGTTCAGCTTCCTGGCTGACGGAGCGGGTTGGCAGCGCTg > 1:331096/1‑149 (MQ=255) aTCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGACTACTTCAGCTGGAC‑CCTGGCTTACAACACCGGTGCCGCGTTCAGCTTCCTGGCTGACGGAGCGGGTTGGCAGCGCTg > 7:257146/1‑149 (MQ=255) aTCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCATGACTACTTCAGCTGGAC‑CCTGGCTTACAACACCGGTGCCGCGTTCAGCTTCCTGGCTGACGGAGCGGGTTGGCAGCGCTg > 3:373927/1‑149 (MQ=255) tCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGACTACTTCAGCTGGAC‑CCTGGCTTACAACACCGGTGCCGCGTTCAGCTTCCTGGCTGACGGAGCGGGTTGGCAGCGCTgg < 3:248793/149‑1 (MQ=255) tCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGACTACTTCAGCTGGAC‑CCTGGCTTACAACACCGGTGCCGCGTTCAGCTTCCTGGCTGACGGAGCGGGTTGGCAGCGCTgg < 3:254024/149‑1 (MQ=255) | GGCAGCCATCCGGAGCACCCGGAAATCTGCGGCCGTTGCGTCGACAACCTGACCGGCTCGG‑GTGAGGTGCGCCACTATGCCTAACC‑CTGCAGCGGGGCGCTTCGGGCGCCTTGCATGGCTGTGGCTGAGCTTGCTGGTCCTGGTCATCGACCAGG‑CCACCAAGCTGTACTTCAACAACGCCCTGACCATGTACCAGCAGATCGTGGTCATTCCTGACTACTTCAGCTGGAC‑CCTGGCTTACAACACCGGTGCCGCGTTCAGCTTCCTGGCTGACGGAGCGGGTTGGCAGCGCTGG > NC_002947/712951‑713245 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |