| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 728,795 | T→A | 6.4% | I95N (ATC→AAC) ‡ | rluD → | 23S rRNA pseudouridine(1911/1915/1917) synthase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 728,795 | 0 | T | A | 6.4% | 236.7 / 4.6 | 78 | I95N (ATC→AAC) ‡ | rluD | 23S rRNA pseudouridine(1911/1915/1917) synthase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (42/31); new base A (2/3); total (44/34) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.48e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.18e-01 | |||||||||||
CGGTCGATGGTGCAGTCGTGCGCCCTCGAGACCTTGTTCATGGTGGCTCTCAGCTTGCCCTGGAGGCCGAACAAGAGGCCCAGGGCGAGTGGATCGCAGAAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTGTGCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACGCGCTGCTGCACCATGTGCCAGACATCGTCAACGTGCCGCGCGCCGGTATCGTGCACCGCCTGGACAAGGACACCACC > NC_002947/728648‑728937 | cGGTCGATGGTGCAGTCGTGCGCCCTCGAGACCTTGTTCATGGTGGCTCTCAGCTTGCCCTGGAGGCCGAACAAGAGGCCCAGGGCGAGTGGATCGCAGAAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGAt > 2:148399/1‑148 (MQ=255) gTCGATGGTGCAGTCGTGCGCCCTCGAGACCTTGTTCATGGTGGCTCTCAGCTTGCCCTGGAGGCCGAACAAGAGGCCCAGGGCGAGTGGATCGCAGAAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATcaa > 6:383569/1‑149 (MQ=255) tGCAGTCGTGCGCCCTCGAGACCTTGTTCATGGTGGCTCTCAGCTTGCCCTGGAGGCCGAACAAGAGGCCCAGGGCGAGTGGATCGCAGAAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGCACAACCAGcccg > 7:386061/1‑147 (MQ=255) gCAGTCGTGCGCCCTCGAGACCTTGTTCATGGTGGCTCTCAGCTTGCCCTGGAGGCCGAACAAGAGGCCCAGGGCGAGTGGATCGCAGAAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGc > 1:195661/1‑149 (MQ=255) cAGTCGTGCGCCCTCGAGACCTTGTTCATGGTGGCTCTCAGCTTGCCCTGGAGGCCGAACAAGAGGCCCAGGGCGAGTGGATCGCAGAAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATc > 8:133260/1‑137 (MQ=255) cAGTCGTGCGCCCTCGAGACCTTGTTCATGGTGGCTCTCAGCTTGCCCTGGAGGCCGAACAAGAGGCCCAGGGCGAGTGGATCGCAGAAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATc < 7:133260/137‑1 (MQ=255) cccTCGAGACCTTGTTCATGGTGGCTCTCAGCTTGCCCTGGAGGCCGAACAAGAGGCCCAGGGCGAGTGGATCGCAGAAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAATACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTtg > 8:388729/1‑149 (MQ=255) ccTCGAGACCTTGTTCATGGTGGCTCTCAGCTTGCCCTGGAGGCCGAACAAGAGGCCCAGGGCGAGTGGATCGCAGAAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTtgt < 2:244658/149‑1 (MQ=255) cGAGACCTTGTTCATGGTGGCTCTCAGCTTGCCCTGGAGGCCGAACAAGAGGCCCAGGGCGAGTGGATCGCAGAAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTGTGCa > 4:61024/1‑149 (MQ=255) gagtCCTTGTTCATGGTGGCTCTCAGCTTGCCCTGGAGGCCGAACAAGAGGCCCAGGGCGAGTTGATCGCAGAAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACCAGCCCGGCAGGCttgttgatc < 2:263854/147‑4 (MQ=255) gagaCCTTGTTCATGGTGGCTCTCAGCTTGCCCTGGAGGCCGAACAAGAGGCCCAGGGCGAGTGGATCGCAGAAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGCACAACCAGCCCGGCAGGCttgttgatcac > 3:39940/1‑144 (MQ=255) agaCCTTGTTCATGGTGGCTCTCAGCTTGCCCTGGAGGCCGAACAAGAGGCCCAGGGCGAGTGGATCGCAGAAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTGTGCAcc < 3:61024/149‑1 (MQ=255) agaCCTTGTTCATGGTGGCTCTATGCTTGCCCTGGAGGCCGAACAAGAGGCCCAGGGCGAGTGGATCGCAGAAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTGTGCAcc < 3:307477/149‑1 (MQ=255) gaCCTTGTTCATGGTGGCTCTCAGCTTGCCCTGGAGGCCGAACAAGAGGCCCAGGGCGAGTGGATCGCAGAAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGCACAACCAGCCCGGCAGGCTTGTTGATCAcca < 8:155533/149‑2 (MQ=38) ccTTGTTCATGGTGGCTCTCAGCTTGCCCTGGAGGCCGAACAAGAGGCCCAGGGCGAGTGGATCGCAGAAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGCACAACCAGCCCGGCAGGCTTGTTGATCAccag < 4:39940/148‑3 (MQ=38) cTTGTTCATGGTGGCTCTCAGCTTGCCCTGGAGGCCGAACAAGAGGCCCTGGGCGAGTGGATCGCAGAAGTTATCGAAGTGGATTAGGACTACGAAGACGACCACATCATGGTGATCAACAACCATGCCGGGCTGGTTTTCCACCcgcc > 2:253773/1‑147 (MQ=255) cTTGTTCATGGTGGCTCTCAGCTTGCCCTGGAGGCCGAACAAGAGGCCCAGGGCGAGTGGATCGCAGAAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTGTGCACCcggc > 5:320984/1‑149 (MQ=255) cTTGTTCATGGTGGCTCTCAGCTTGCCCTGGAGGCCGAACAAGAGGCCCAGGGCGAGTGGATCGCAGAAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTGTGCACCcggc > 6:405761/1‑149 (MQ=255) gTTCATGGTGGCTCTCAGCTTGCCCTGGAGGCCGAACAAGAGGCCCAGGGCGAGTGGATCGCAGAAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGCACAACCAGCCCGGCAGGCTTGTTGATCACCaggat < 8:386061/147‑3 (MQ=37) aTGGTGGCTCTCAGCTTGCCCTGGAGGCCGAACAAGAGGCCCAGGGCGAGTGGATCGCAGAAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTGTGCACCCGGCGGCCggg > 8:215550/1‑149 (MQ=255) tggCTCTCAGCTTGCCCTGGAGGCCGAACAAGAGGCCCAGGGCGAGTGGATCGCAGAAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTGTGCACCCGGCGGCCgg < 3:226896/144‑1 (MQ=255) tggCTCTCAGCTTGCCCTGGAGGCCGAACAAGAGGCCCAGGGCGAGTGGATCGCAGAAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTGTGCACCCGGCGGCCgg > 4:226896/1‑144 (MQ=255) gCTCTCAGCTTGCCCTGGAGGCCGAACAAGAGGCCCAGGGCGAGTGGATCGCAGAAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTGTGCACCCGGCGGCCgg < 3:205851/142‑1 (MQ=255) gCTCTCAGCTTGCCCTGGAGGCCGAACAAGAGGCCCAGGGCGAGTGGATCGCAGAAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTGTGCACCCGGCGGCCgg > 4:205851/1‑142 (MQ=255) gCTCTCAGCTTGCCCTGGAGGCCGAACAAGAGGCCCAGGGCGAGTGGATCGCAGAAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTGTGCACCCGGCGGCCGGGCATGc < 1:148399/148‑1 (MQ=255) tctcAGCTTGCCCTGGAGGCCGAACAAGAGGCCCAGGGCGAGTGGATCGCAGAAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTGTGCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAg > 8:237847/1‑149 (MQ=255) tctcAGCTTGCCCTGGAGGCCGAACAAGAGGCCCAGGGCGAGTGGATCGCAGAAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTACCGGGCTGGTTGTGCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAg > 3:181431/1‑149 (MQ=255) aGCTTGCCCTGGAGGCCGAACAAGAGGCCCAGGGCGAGTGGATCGCAGAAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTGTGCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCgg > 8:163667/1‑148 (MQ=255) aGCTTGCCCTGGAGGCCGAACAAGAGGCCCAGGGCGAGTGGATCGCAGAAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTGTGCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCg < 2:196795/147‑1 (MQ=255) aGCTTGCCCGGGAGGCCGAACAAGAGTCCCAGGGCGAGTGGATCGCAGAAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCTCATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTGTGCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCg < 2:203228/147‑1 (MQ=255) gCTTGCCCTGGAGGCCGAACAAGAGGCCCAGGGCGAGTGGATCGCAGAAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTGTGCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCa > 4:422694/1‑149 (MQ=255) cTTGCCCTGGAGGCCGAACAAGAGGCCCAGGGCGAGTGGATCGCAGAAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTGTGCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCAc > 3:310111/1‑149 (MQ=255) cccTGGAGGCCGAACAAGAGACCCAGGGCGAGTGGATCGCAGAAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTGTGCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTg > 5:36381/1‑149 (MQ=255) ccTGGAGGCCGAACAAGAGGCCCAGGGCGAGTGGATCGCAGAAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTGTGCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGc > 1:267397/1‑149 (MQ=255) ccGAACAAGAGGCCCAGGGCGAGTGGATCGCAGAAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTGTGCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAAcgcg < 7:163667/149‑1 (MQ=255) cGAACAAGAGGCCCAGGGCGAGTGGATCGCAGAAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTGTGCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACgcgc > 5:201435/1‑149 (MQ=255) aacaacCGGCCCAGGGCGAGTGGATCGCAGAAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTGTGCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACGCgctg < 1:253773/149‑1 (MQ=255) gagGCCCAGGGCGAGTGGATCGCAGAAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTACCGGGCTGGTTGTGCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACGCGCTGCTGCa < 4:181431/149‑1 (MQ=255) agGCCCAGGGCGAGTGGATCGCAGAAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTGTGCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACGCGCTGCTGCAc > 5:205741/1‑149 (MQ=255) agGCCCAGGGCGAGTGGATCGCAGAAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTGTGCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACGCGCTGCTGCAc > 2:148866/1‑149 (MQ=255) ggCCCAGGGCGAGTGGATCGCAGAAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTGTGCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACGCGCTGCTGCAcc < 1:79345/149‑1 (MQ=255) ccAGGGCGAGTGGATCGCAGAAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTGTGCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACGCGCTGCTGCACCAtg < 5:405761/149‑1 (MQ=255) cAGGGCGAGTGGATCGCAGAAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCGTGCCGGGCTGGTTGTGCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACTCGCTGCTGCACCAtgt < 6:36381/149‑1 (MQ=255) ggCGAGTGGATCGCAGAAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTGTGCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACGCGCTGCTGCACCATGTGcc < 7:198159/149‑1 (MQ=255) gCGAGTGGATCGCAGAAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTGTGCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACGCGCTGCTGCACCATGTGCCa < 5:187279/149‑1 (MQ=255) cGAGTGGATCGCAGAAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTGTGCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACGCGCTGCTGCa < 5:428045/138‑1 (MQ=255) cGAGTGGATCGCAGAAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTGTGCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACGCGCTGCTGCa > 6:428045/1‑138 (MQ=255) cGAGTGGATCGCAGAAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTGTGCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACGCGCTGCTGCACCATGTGCCAg < 5:364749/149‑1 (MQ=255) gTGGATCGCAGAAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTGTGCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACGCGCTGCTGCACCATGTGCCAGACa > 1:74100/1‑149 (MQ=255) gTGGATCGCAGAAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTGTGCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACGCGCTGCTGCACCATGTGCCAGACa < 6:201435/149‑1 (MQ=255) gCAGAAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTGTGCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACGCGCTGCTGCACCATGTGCCAGACATCGTCaa < 4:388450/149‑1 (MQ=255) cAGAAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTGTGCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACGCGCTGCTGCACCATGTGCCAGACATCGTCAAc > 6:248613/1‑149 (MQ=255) cAGAAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTGTGCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACGCGCTGCTGCACCATGTGCCAGACATCGTCAAc > 3:9594/1‑149 (MQ=255) agaagaTATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTGTGCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACGCGCTGCTGCACCATGTGCCAGACATCGTCAACg > 4:193115/1‑149 (MQ=255) aCTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTGTGCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACGCGCTGCTGCACCATGTGCCAGACATCGTCAACGTGCCGCGCGCCg < 7:215550/149‑1 (MQ=255) atatCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTGTGCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACGCGCTGCTGCACCATGTGCCAGACATCGTCAACGTGCCGCGCGCCGGTATc < 6:205741/149‑1 (MQ=255) tCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTGTGCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACGCGCTGCTGCACCATGTGCCAGACATCGTCAACGTGCCGCGCGCCGGTATCGt < 5:383569/148‑1 (MQ=255) tCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTGTGCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACGCGCTGCTGCACCATGTGCCAGACATCGTCAACGTGCCGCGCGCCGGTATCGt < 7:237847/148‑1 (MQ=255) tCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTGTGCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACGCGCTGCTGCACCATGTGCCAGACATCGTCAACGTGCCGCGCGCCGGTATCGTGCAc > 3:26324/1‑149 (MQ=255) 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gAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTGTGCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACGCGCTGCTGCACCATGTGCCAGACATCGTCAACGTGCCGCGCGCCGGTATCGTGCACCGCCt > 6:160115/1‑149 (MQ=255) gAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTGTGCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACGCGCTGCTGCACCATGTGCCAGACATCGTCAACGTGCCGCGCGCCGGTATCGTGCACCGCCt > 1:58645/1‑149 (MQ=255) aaGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTGTGCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACGCGCTGCTGCACCATGTGCCAGACATCGTCAACGTGCCGCGCGCCGGTATCGTACACCGCCTg < 4:171421/149‑1 (MQ=255) aaGACGACCACATCCTGGGGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTGTGCACCCGGCGGACGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACGCGCTGCTGCACCATGTGCCAGACATCGTCAACGTGCCGCGCGCCGGTATCGTGCACCGCCTg < 5:266785/149‑1 (MQ=255) aGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTGTGCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACGCGCTGCTGCACCATGTGCCAGACATCGTCAACGTGCCGCGCGCCGGTATCGTGCACCGCCTg > 3:102143/1‑148 (MQ=255) aGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTGTGCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACGCGCTGCTGCACCATGTGCCAGACATCGTCAACGTGCCGCGCGCCGGTATCGTGCACCGCCTg > 3:295188/1‑148 (MQ=255) acgacCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTGTGCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACGCGCTGCTGCACCATGTGCCAGACATCGTCAACGTGCCGCGCGCCGGTATCGTGCACCGCCTGGa > 1:111345/1‑148 (MQ=255) gacCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTGTGCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACGCGCTGCTGCACCATGTGCCAGACATCGTCAACGTGCCGCGCGCCGGTATCGTGCACCGCCTGGAc > 5:148677/1‑147 (MQ=255) cacaTCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTGTGCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACGCGCTGCTGCACCATGTGCCAGACATCGTCAACGTGCCGCGCGCCGGTATCGTGCACCGCCTGGACAAGGa > 8:408256/1‑149 (MQ=255) cacaTCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTGTGCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACGCGCTGCTGCACCATGTGCCAGACATCGTCAACGTGCCGCGCGCCGGTATCGTGCACCGCCTGGACAAGGa > 6:174662/1‑149 (MQ=255) caTCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTGTGCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACGCGCTGCTGCACCATGTGCCAGACATCGTCAACGTGCCGCGCGCCGGTATCGTGCACCGCCTGGACAAGGaca < 6:148677/149‑1 (MQ=255) ccTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTGTGCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACGCGCTGCTGCACCATGTGCCAGACATCGTCAACGTGCCGCGCGCCGGTATCGTGCACCGCCTGGACAAGGAcacca > 4:429339/1‑149 (MQ=255) cTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTGTGCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACGCGCTGCTGCACCATGTGCCAGACATCGTCAACGTGCCGCGCGCCGGTATCGTGCACCGCCTGGACAAGGAcacca < 1:148866/148‑1 (MQ=255) tGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTGTGCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACGCGCTGCTGCACCATGTGCCAGACATCGTCAACGTGCCGCGCGCCGGTATCGTGCACCGCCTGGACAAGGACaccacc > 1:180408/1‑149 (MQ=255) | CGGTCGATGGTGCAGTCGTGCGCCCTCGAGACCTTGTTCATGGTGGCTCTCAGCTTGCCCTGGAGGCCGAACAAGAGGCCCAGGGCGAGTGGATCGCAGAAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTGTGCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACGCGCTGCTGCACCATGTGCCAGACATCGTCAACGTGCCGCGCGCCGGTATCGTGCACCGCCTGGACAAGGACACCACC > NC_002947/728648‑728937 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |