| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_002947 | 728,800 | A→C | 7.6% | K97Q (AAG→CAG) | rluD → | 23S rRNA pseudouridine(1911/1915/1917) synthase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 728,800 | 0 | A | C | 7.6% | 232.3 / 6.1 | 75 | K97Q (AAG→CAG) | rluD | 23S rRNA pseudouridine(1911/1915/1917) synthase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (40/29); new base C (2/4); total (42/33) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.95e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
TGCAGTCGTGCGCCCTCGAGACCTTGTTCATGGTGGCTCTCAGCTTGCCCTGGAGGCCGAACAAGAGGCCCAGGGCGAGTGGATCGCAGAAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTGTGCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACGCGCTGCTGCACCATGTGCCAGACATCGTCAACGTGCCGCGCGCCGGTATCGTGCACCGCCTGGACAAGGACACCACCGGCCTGATG > NC_002947/728658‑728946 | tGCAGTCGTGCGCCCTCGAGACCTTGTTCATGGTGGCTCTCAGCTTGCCCTGGAGGCCGAACAAGAGGCCCAGGGCGAGTGGATCGCAGAAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGCACAACCAGcccg > 7:386061/1‑147 (MQ=255) gCAGTCGTGCGCCCTCGAGACCTTGTTCATGGTGGCTCTCAGCTTGCCCTGGAGGCCGAACAAGAGGCCCAGGGCGAGTGGATCGCAGAAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGc > 1:195661/1‑149 (MQ=255) cccTCGAGACCTTGTTCATGGTGGCTCTCAGCTTGCCCTGGAGGCCGAACAAGAGGCCCAGGGCGAGTGGATCGCAGAAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAATACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTtg > 8:388729/1‑149 (MQ=255) ccTCGAGACCTTGTTCATGGTGGCTCTCAGCTTGCCCTGGAGGCCGAACAAGAGGCCCAGGGCGAGTGGATCGCAGAAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTtgt < 2:244658/149‑1 (MQ=255) cGAGACCTTGTTCATGGTGGCTCTCAGCTTGCCCTGGAGGCCGAACAAGAGGCCCAGGGCGAGTGGATCGCAGAAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTGTGCa > 4:61024/1‑149 (MQ=255) gagtCCTTGTTCATGGTGGCTCTCAGCTTGCCCTGGAGGCCGAACAAGAGGCCCAGGGCGAGTTGATCGCAGAAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACCAGCCCGGCAGGCttgttgatc < 2:263854/147‑4 (MQ=255) gagaCCTTGTTCATGGTGGCTCTCAGCTTGCCCTGGAGGCCGAACAAGAGGCCCAGGGCGAGTGGATCGCAGAAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGCACAACCAGCCCGGCAGGCttgttgatcac > 3:39940/1‑144 (MQ=255) agaCCTTGTTCATGGTGGCTCTCAGCTTGCCCTGGAGGCCGAACAAGAGGCCCAGGGCGAGTGGATCGCAGAAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTGTGCAcc < 3:61024/149‑1 (MQ=255) agaCCTTGTTCATGGTGGCTCTATGCTTGCCCTGGAGGCCGAACAAGAGGCCCAGGGCGAGTGGATCGCAGAAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTGTGCAcc < 3:307477/149‑1 (MQ=255) gaCCTTGTTCATGGTGGCTCTCAGCTTGCCCTGGAGGCCGAACAAGAGGCCCAGGGCGAGTGGATCGCAGAAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGCACAACCAGCCCGGCAGGCTTGTTGATCAcca < 8:155533/149‑2 (MQ=38) ccTTGTTCATGGTGGCTCTCAGCTTGCCCTGGAGGCCGAACAAGAGGCCCAGGGCGAGTGGATCGCAGAAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGCACAACCAGCCCGGCAGGCTTGTTGATCAccag < 4:39940/148‑3 (MQ=38) cTTGTTCATGGTGGCTCTCAGCTTGCCCTGGAGGCCGAACAAGAGGCCCTGGGCGAGTGGATCGCAGAAGTTATCGAAGTGGATTAGGACTACGAAGACGACCACATCATGGTGATCAACAACCATGCCGGGCTGGTTTTCCACCcgcc > 2:253773/1‑147 (MQ=255) cTTGTTCATGGTGGCTCTCAGCTTGCCCTGGAGGCCGAACAAGAGGCCCAGGGCGAGTGGATCGCAGAAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTGTGCACCcggc > 5:320984/1‑149 (MQ=255) cTTGTTCATGGTGGCTCTCAGCTTGCCCTGGAGGCCGAACAAGAGGCCCAGGGCGAGTGGATCGCAGAAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTGTGCACCcggc > 6:405761/1‑149 (MQ=255) gTTCATGGTGGCTCTCAGCTTGCCCTGGAGGCCGAACAAGAGGCCCAGGGCGAGTGGATCGCAGAAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGCACAACCAGCCCGGCAGGCTTGTTGATCACCaggat < 8:386061/147‑3 (MQ=37) aTGGTGGCTCTCAGCTTGCCCTGGAGGCCGAACAAGAGGCCCAGGGCGAGTGGATCGCAGAAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTGTGCACCCGGCGGCCggg > 8:215550/1‑149 (MQ=255) tggCTCTCAGCTTGCCCTGGAGGCCGAACAAGAGGCCCAGGGCGAGTGGATCGCAGAAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTGTGCACCCGGCGGCCgg > 4:226896/1‑144 (MQ=255) tggCTCTCAGCTTGCCCTGGAGGCCGAACAAGAGGCCCAGGGCGAGTGGATCGCAGAAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTGTGCACCCGGCGGCCgg < 3:226896/144‑1 (MQ=255) gCTCTCAGCTTGCCCTGGAGGCCGAACAAGAGGCCCAGGGCGAGTGGATCGCAGAAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTGTGCACCCGGCGGCCgg > 4:205851/1‑142 (MQ=255) gCTCTCAGCTTGCCCTGGAGGCCGAACAAGAGGCCCAGGGCGAGTGGATCGCAGAAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTGTGCACCCGGCGGCCgg < 3:205851/142‑1 (MQ=255) gCTCTCAGCTTGCCCTGGAGGCCGAACAAGAGGCCCAGGGCGAGTGGATCGCAGAAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTGTGCACCCGGCGGCCGGGCATGc < 1:148399/148‑1 (MQ=255) tctcAGCTTGCCCTGGAGGCCGAACAAGAGGCCCAGGGCGAGTGGATCGCAGAAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTGTGCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAg > 8:237847/1‑149 (MQ=255) tctcAGCTTGCCCTGGAGGCCGAACAAGAGGCCCAGGGCGAGTGGATCGCAGAAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTACCGGGCTGGTTGTGCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAg > 3:181431/1‑149 (MQ=255) aGCTTGCCCTGGAGGCCGAACAAGAGGCCCAGGGCGAGTGGATCGCAGAAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTGTGCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCgg > 8:163667/1‑148 (MQ=255) aGCTTGCCCTGGAGGCCGAACAAGAGGCCCAGGGCGAGTGGATCGCAGAAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTGTGCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCg < 2:196795/147‑1 (MQ=255) aGCTTGCCCGGGAGGCCGAACAAGAGTCCCAGGGCGAGTGGATCGCAGAAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCTCATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTGTGCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCg < 2:203228/147‑1 (MQ=255) gCTTGCCCTGGAGGCCGAACAAGAGGCCCAGGGCGAGTGGATCGCAGAAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTGTGCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCa > 4:422694/1‑149 (MQ=255) cTTGCCCTGGAGGCCGAACAAGAGGCCCAGGGCGAGTGGATCGCAGAAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTGTGCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCAc > 3:310111/1‑149 (MQ=255) cccTGGAGGCCGAACAAGAGACCCAGGGCGAGTGGATCGCAGAAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTGTGCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTg > 5:36381/1‑149 (MQ=255) ccTGGAGGCCGAACAAGAGGCCCAGGGCGAGTGGATCGCAGAAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTGTGCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGc > 1:267397/1‑149 (MQ=255) ccGAACAAGAGGCCCAGGGCGAGTGGATCGCAGAAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTGTGCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAAcgcg < 7:163667/149‑1 (MQ=255) cGAACAAGAGGCCCAGGGCGAGTGGATCGCAGAAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTGTGCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACgcgc > 5:201435/1‑149 (MQ=255) aacaacCGGCCCAGGGCGAGTGGATCGCAGAAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTGTGCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACGCgctg < 1:253773/149‑1 (MQ=255) gagGCCCAGGGCGAGTGGATCGCAGAAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTACCGGGCTGGTTGTGCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACGCGCTGCTGCa < 4:181431/149‑1 (MQ=255) agGCCCAGGGCGAGTGGATCGCAGAAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTGTGCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACGCGCTGCTGCAc > 5:205741/1‑149 (MQ=255) agGCCCAGGGCGAGTGGATCGCAGAAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTGTGCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACGCGCTGCTGCAc > 2:148866/1‑149 (MQ=255) ggCCCAGGGCGAGTGGATCGCAGAAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTGTGCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACGCGCTGCTGCAcc < 1:79345/149‑1 (MQ=255) ccAGGGCGAGTGGATCGCAGAAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTGTGCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACGCGCTGCTGCACCAtg < 5:405761/149‑1 (MQ=255) cAGGGCGAGTGGATCGCAGAAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCGTGCCGGGCTGGTTGTGCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACTCGCTGCTGCACCAtgt < 6:36381/149‑1 (MQ=255) ggCGAGTGGATCGCAGAAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTGTGCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACGCGCTGCTGCACCATGTGcc < 7:198159/149‑1 (MQ=255) gCGAGTGGATCGCAGAAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTGTGCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACGCGCTGCTGCACCATGTGCCa < 5:187279/149‑1 (MQ=255) cGAGTGGATCGCAGAAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTGTGCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACGCGCTGCTGCa > 6:428045/1‑138 (MQ=255) cGAGTGGATCGCAGAAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTGTGCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACGCGCTGCTGCa < 5:428045/138‑1 (MQ=255) cGAGTGGATCGCAGAAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTGTGCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACGCGCTGCTGCACCATGTGCCAg < 5:364749/149‑1 (MQ=255) gTGGATCGCAGAAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTGTGCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACGCGCTGCTGCACCATGTGCCAGACa < 6:201435/149‑1 (MQ=255) gTGGATCGCAGAAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTGTGCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACGCGCTGCTGCACCATGTGCCAGACa > 1:74100/1‑149 (MQ=255) gCAGAAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTGTGCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACGCGCTGCTGCACCATGTGCCAGACATCGTCaa < 4:388450/149‑1 (MQ=255) cAGAAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTGTGCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACGCGCTGCTGCACCATGTGCCAGACATCGTCAAc > 3:9594/1‑149 (MQ=255) cAGAAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTGTGCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACGCGCTGCTGCACCATGTGCCAGACATCGTCAAc > 6:248613/1‑149 (MQ=255) agaagaTATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTGTGCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACGCGCTGCTGCACCATGTGCCAGACATCGTCAACg > 4:193115/1‑149 (MQ=255) aCTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTGTGCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACGCGCTGCTGCACCATGTGCCAGACATCGTCAACGTGCCGCGCGCCg < 7:215550/149‑1 (MQ=255) atatCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTGTGCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACGCGCTGCTGCACCATGTGCCAGACATCGTCAACGTGCCGCGCGCCGGTATc < 6:205741/149‑1 (MQ=255) tCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTGTGCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACGCGCTGCTGCACCATGTGCCAGACATCGTCAACGTGCCGCGCGCCGGTATCGt < 7:237847/148‑1 (MQ=255) tCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTGTGCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACGCGCTGCTGCACCATGTGCCAGACATCGTCAACGTGCCGCGCGCCGGTATCGt < 5:383569/148‑1 (MQ=255) tCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTGTGCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACGCGCTGCTGCACCATGTGCCAGACATCGTCAACGTGCCGCGCGCCGGTATCGTGCAc > 3:26324/1‑149 (MQ=255) tCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTGTGCACCCGACGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACGCGCTGCTGCACCATGTGCCAGACATCGTCAACGTGCCGCGCGCCGGTATCGTGCAc > 8:305722/1‑149 (MQ=255) tACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTGTGCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACGCGCTGCTGCACCATGTGCCAGa < 4:44467/113‑1 (MQ=255) tACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTGTGCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACGCGCTGCTGCACCATGTGCCAGACATCGTCAACGTGCCGCGCGCCGGTATCGTGCACCg > 7:322684/1‑149 (MQ=255) tACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGATGGTTGTGCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACACTGCTCAACGCGCTGCTGCACCATGTGCCAGa > 3:44467/1‑113 (MQ=255) aCGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTGTGCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACGCGCTGCTGCACCATGTGCCAGACATCGTCAACGTGCCGCGCGCCGGTATCGTGCACCGc > 3:93725/1‑149 (MQ=255) 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4:252870/1‑110 (MQ=255) caacaaGCCTGCCGGGCTGGTTGTGCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACGCGCTGCTGCACCATGTGCCAGACATCGTCAACGTGCCGCGCGCCg < 3:252870/110‑1 (MQ=255) aacaaGCCTGCCGGGCTGGTTGTGCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACGCGCTGCTGCACCATGTGCCAGACATCGTCAACGTGCCGCGCGCCGGTATCGTGCACCGCCTGGACAAGGACTCCACCGGCCTGAt < 4:295188/149‑1 (MQ=255) aacaaGCCTGCCGGGCTGGTTGTGCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACGCGCTGCTGCACCATGTGCCAGACATCGTCAACGTGCCGCGCGCCGGTATCGTGCACCGCCTGGACAAGGACACCACCGGCCTGAt < 6:320984/149‑1 (MQ=255) aacaaGCCTGCCGGGCTGGTTGTGCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACGCGCTGCTGCACCATGTGCCAGACATCGTCAACGTGCCGCGCGCCGGTATCGTGCACCGCCTGGACAAGGACACCACCGGCCTGAt > 8:137484/1‑149 (MQ=255) aacaaGCCTGCCGGGCTGGTTGTGCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACGCGCTGCTGCACCATGTGCCAGACATCGTCAACGTGCCGCGCGCCGGTATCGTGCACCGCCTGGACAAGGACACCACCGGCCTGAt > 4:363325/1‑149 (MQ=255) acaaGCCTGCCGGGCTGGTTGTGCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACGCGCTGCTGCACCATGTGCCAGACATCGTCAACGTGCCGCGCGCCGGTATCGTGCACCGCCTGGACAAGGACACCACCGGCCTGAtg < 2:111345/149‑1 (MQ=255) | TGCAGTCGTGCGCCCTCGAGACCTTGTTCATGGTGGCTCTCAGCTTGCCCTGGAGGCCGAACAAGAGGCCCAGGGCGAGTGGATCGCAGAAGATATCGAACTGGATATCGTCTACGAAGACGACCACATCCTGGTGATCAACAAGCCTGCCGGGCTGGTTGTGCACCCGGCGGCCGGGCATGCCAGCGGCACCCTGCTCAACGCGCTGCTGCACCATGTGCCAGACATCGTCAACGTGCCGCGCGCCGGTATCGTGCACCGCCTGGACAAGGACACCACCGGCCTGATG > NC_002947/728658‑728946 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |