| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 109,430 | C→T | 6.1% | V207V (GTC→GTT) | PP_0103 → | cytochrome c oxidase subunit 2 |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 109,430 | 0 | C | T | 6.1% | 298.5 / 5.5 | 98 | V207V (GTC→GTT) | PP_0103 | cytochrome c oxidase subunit 2 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (50/42); new base T (4/2); total (54/44) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.88e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.29e-01 | |||||||||||
ATGAGCACTACCTGCTGGAAGTCGACCAGCCGCTGGTGCTGCCGGTGGGCGCGAAAGTGCGCTTCCTGGTCACTGCTGCCGATGTGATCCACTCCTGGTGGGTGCCGGCCTTCGCGGTCAAACGCGACGCCATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGACCCGGATCGAAAAGCCAGGCATCTACCGCGGCCAGTGCACCGAGCTGTGCGGCAAGGACCACGGCTTCATGCCGGTGGTGGTCGAGGTCAAGTCCAAGGCGGATTACGACACCTGGCTTGGCGAGCGCAAGGCT > NC_002947/109285‑109577 | aTGAGCACTACCTGCTGGAAGTCGACCAGCCGCTGGTGCCGCCGGTGGGCGCGAAAGTGCGCTTCCTGGTCACTGCTGCCGATGTGATCCACTCCTGGTGGGTGCCGGCCTTCGCGGTCAAACGCGACGCCCTCCCAGGCTTTGTCAAc > 3:57552/1‑149 (MQ=255) tGAGCACTACCTGCTGGAAGTCGACCAGCCGCTGGTGCTGCCGGTGGGCGCGAAAGTGCGCTTCCTGGTCACTGCTGCCGATGTGATCCACTCCTGGTGGGTGCCGGCCTTCGCGGTCAAACGCGACGCCATCCCAGGCTTTGTCAAc > 2:74784/1‑148 (MQ=255) gCACTACCTGCTGGAAGTCGACCAGCCGCTGGTGCTGCCGGTGGGCGCGAAAGTGCGCTTCCTGGTCACTGCTGCCGATGTGATCCACTCCTGGTGGGTGCCGGCCTTCGCGGTCAAACGCGACGCCATCCCAGGCTTTGTCAACGAAg > 4:233032/1‑149 (MQ=255) cTACCTGCTGGAAGTCGACCAGCCGCTGGTGCTGCCGGTGGGCGCGAAAGTGCGCTTCCTGGTCACTGCTGCCGATGTGATCCACTCCTGGTGGGTGCCGGCCTTCGCGGTCAAACGCGACGCCATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCt < 7:82704/149‑1 (MQ=255) cTACCTGCTGGAAGTCGACCAGCCGCTGGTGCTGCCGGTGGGCGCGAAAGTGCGCTTCCTGGTCACTGCTGCCGATGTGATCCACTCCTGGTGGGTGCCGGCCTTCGCGGTCAAACGCGACGCCATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCt < 7:400610/149‑1 (MQ=255) gtgGAAGTCGACCAGCCGCTGTGGGTGCCGGTGGGCGCGAAAGTGCGCTTCCTGGTCACTGCTGCCGATGTGATCCACTCCTGGTGGGTGCCGGCCTTCGCGGTCAAACGCGACGCCATCCCAGGCTTCGTTTACAAAGCCTgggat < 8:338903/146‑4 (MQ=255) ggAAGTCGACCAGCCGCTGGTGCTGCCGGTGGGCGCGAAAGTGCGCTTCCTGGTCACTGCTGCCGATGTGATCCACTCCTGGTGGGTGCCGGCCTTCGCGGTCAAACGCGACGCCATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGACCCGGa > 2:75401/1‑149 (MQ=255) ggAAGTCGACCAGCCGCTGGTGCTGCCGGTGGGCGCGAAAGTGCGCTTCCTGGTCACTGCTGCCGATGTGATCCACTCCTGGTGGGTGCCGGCCTTCGCGGTCAAACGCGACGCCATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGACCCGGa > 6:18700/1‑149 (MQ=255) ggAAGTCGACCAGCCGCTGGTGCTGCCGGTGGGCGCGAAAGTGCGCTTCCTGGTCACTGCTGCCGATGTGATCCACTCCTGGTGGGTGCCGGCCTTCGCGGTCAAACGCGACGCCATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGACCCGGa > 7:120508/1‑149 (MQ=255) gAAGTCGACCAGCCGCTGGTGCTGCCGGTGGGCGCGAAAGTGCGCTTCCTGGTCACTGCTGCCGATGTGATCCACTCCTGGTGGGTGCCGGCCTTCGCGGTCAAACGCGACGCCATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGACCCGGAt < 7:21101/149‑1 (MQ=255) aGTCGACCAGCCGCTGGTGCTGCCGGTGGGCGCGAAAGTGCGCTTCCTGGTCACTGCTGCCGATGTGATCCACTCCTGGTGGGTGCCGGCCTTCGCGGTCAAACGCGACGCCATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGACCCGGATCg < 1:197246/149‑1 (MQ=255) aGTCGACCAGCCGCTGGTGCTGCCGGTGGGCGCGAAAGTGCGCTTCCTGGTCACTGCTGCCGATGTGATCCACTCCTGGTGGGTGCCGGCCTTCGCGGTCAAACGCGACGCCATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGACCCGGATCg < 5:359453/149‑1 (MQ=255) aGTCGACCAGCCGCTGGTGCTGCCGGTGGGCGCGAAAGTGCGCTTCCTGGTCACTGCTGCCGATGTGATCCACTCCTGGTGGGTGCCGGCCTTCGCGGTCAAACGCGACGCCACCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGACCCGGATc > 7:187058/1‑148 (MQ=255) tCGACCAGCCGCTGGTGCTGCCGGTGGGCGCGAAAGTGCGCTTCCTGGTCACTGCTGCCGATGTGATCCACTCCTGGTGGGTGCCGGCCTTCGCGGTCAAACGCGACGCCATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGACCCGGATCGa > 5:70607/1‑148 (MQ=255) gACCAGCCGCTGGTGCTGCCGGTGGGCGCGAAAGTGCGCTTCCTGGTCACTGCTGCCGATGTGATCCACTCCTGGTGGGTGCCGGCCTTCGCGGTCAAACGCGACGCCATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGACCCGGATCGaaaa < 2:161036/149‑1 (MQ=255) gACCAGCCGCTGGTGCTGCCGGTGGGCGCGAAAGTGCGCTTCCTGGTCACTGCTGCCGATGTGATCCACTCCTGGTGGGTGCCGGCCTTCGCGGTCAAACGCGACGCCATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGACCCGGATCGaaa < 5:163454/148‑1 (MQ=255) gACCAGCCGCTGGTGCTGCCGGTGGGCGCGAAAGTGAGCTTCCTGGTCACTGCTGCCGATGTGATCCACTCCTGGTGGGTGCCGGCCTTCGCGGTCAAACGCGACGCCATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGACCCGGATCGaa > 1:70360/1‑147 (MQ=255) ccAGCCGCTGGTGCCGCCGGTGGGCGCGAAAGTGCGCTTCCTGGTCACTGCTGCCGATGTGATCCACTCCTGGTGGGTGCCGGCCTTCGCGGTCAAACGCGACGCCATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGACCCGGATCGAAAAGc < 4:57552/149‑1 (MQ=255) gCCGCTGGTGCTGCCGGTGGGCGCGAAAGTGCGCTTCCTGGTCACTGCTGCCGATGTGATCCACTCCTGGTGGGTGCGGGCCTTCGCGGTCAAACGCGACGCCATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGACCCGGATCGAAAAGCCAg < 3:123981/149‑1 (MQ=255) gCCGCTGGTGCTGCCGGTGGGCGCGAAAGTGCGCTTCCTGGTCACTGCTGCCGATGTGATCCACTCCTGGTGGGTGCCGGCCTTCGCGGTCAAACGCGACGCCATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGACCCGGATCGAAAAGCCAg < 5:200980/149‑1 (MQ=255) cGCTGGTGCTGCCGGTGGGCGCGAAAGTGCGCTTCCTGGTCACTGCTGCCGATGTGATCCACTCCTGGTGGGTGCCGGCCTTCGCGGTCAAACGCGACGCCATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGACCCGGATCGAAAAGCCAGGc < 1:75401/149‑1 (MQ=255) gCTGGTGCTGCCGGTGGGCGCGAAAGTGCGCTTCCTGGTCACTGCTGCCGATGTGATCCACTCCTGGTGGGTGCCGGCCTTCGCGGTCAAACGCGACGCCATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGACCCGGATCGAAAAGCCAGGCa > 2:429891/1‑149 (MQ=255) gctgcCGGTGGGCGCGAAAGTGCGCTTCCTGGTCACTGCTGCCGATGTGATCCACTCCTGGTGGGTGCCGGCCTTCGCGGTCAAACGCGACGCCATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGACCCGGATCGAAAAGCCAGGCATCTAcc > 7:263212/1‑149 (MQ=255) tgcCGGTGGGCGCGAAAGTGCGCTTCCTGGTCACTGCTGCCGATGTGATCCACTCCTGGTGGGTGCCGGCCTTCGCGGTCAAACGCGACGCCATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGACCCGGATCGAAAAGCCAGGCATCTACcgc > 1:230544/1‑149 (MQ=255) tgcCGGTGGGCGCGAAAGTGCGCTTCCTGGTCACTGCTGCCGATGTGATCCACTCCTGGTGGGTGCCGGCCTTCGCGGTCAAACGCGACGCCATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGACCCGGATCGAAAAGCCAGGCATCTACcgc > 3:400005/1‑149 (MQ=255) gcCGGTGGGCGCGAAAGTGCGCTTCCTGGTCACTGCTGCCGATGTGATCCACTCCTGGTGGGTGCCGGCCTTCGCGGTCAAACGCGACGCCATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGACCCGGATCGAAAAGCCAGGCATCTACcgcg > 7:29399/1‑149 (MQ=255) ccGGTGGGCGCGAAAGTGCGCTTCCTGGTCACTGCTGCCGATGTGATCCACTCCTGGTGGGTGCCGGCCTTCGCGGTCAAACGCGACGCCATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGACCCGGATCGAAAAGCCCGGCATCTACCGCgg > 1:389052/1‑149 (MQ=255) gggCGCGAAAGTGCGCTTCCTGGTCACTGCTGCCGATGTGATCAACTCCTGGTGGGTGCCGGCCTTCGCGGTCAAACGCGACGCCATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGACCCGGATCGAAAAGCCAGGCATCTACCGCGGCCAGt > 7:154978/1‑149 (MQ=255) gcgAAAGTGCGCTTCCTGGTCACTGCTGCCGATGTGATCCACTCCTGGTGGGTGCCGGCCTTCGCGGTCAAACGCGACGCCATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGACCCGGATCGAAAAGCCAGGCATCTACCGCGGCCAGTGCAc > 8:372047/1‑149 (MQ=255) gcgAAAGTGCGCTTCCTGGTCACTGCTGCCGATGTGATCCACTCCTGGTGGGTGCCGGCCTTCGCGGTCAAACGCGACGCCATCCCAGGCTTCGTTGACAAAGCCTgggat < 8:288841/111‑4 (MQ=255) cgAAAGTGCGCTTCCTGGTCACTGCTGCCGATGTGATCCACTCCTGGTGGGTGCCGGCCTTCGCGGTCAAACGCGACGCCATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGACCCGGATCGAAAAGCCAGGCATCTACCGCGGCCAGTGCAcc < 7:356652/149‑1 (MQ=255) gAAAGTGCGCTTCCTGGTCACTGCTGCCGATGAGATCCACTCCTGGTGGGTGCCGGCCTTCGCGGTCAAACGCGACGCCATCCCAGGCTTTGTCAACGAACCCTGGACCCGGATCGAAAAGCCAGGCATCTACCGCGGCCAGTGCAcc > 7:242787/1‑148 (MQ=255) gcgcTTCCTGGTCACTGCTGCCGATGTGATCCACTCCTGGTGGGTGCCGGCCTTCGCGGTCAAACGCGACGCCATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGACCCGGATCGAAAAG‑CAGGCATCTACCGCGGCCAGTGCACCGAGCtgtg < 4:351514/149‑1 (MQ=255) gcTTCCTGGTCACTGCTGCCGATGTGATCCACTCCTGGTGGGTGCCGGCCTTCGCGGTCAAACGCGACGCCATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGACCCGGATCGAAAAGCCAGGCATCTACCGCGGCCAGTGCACCGAGCTGTGc > 5:68305/1‑149 (MQ=255) gcTTCCTGGTCACTGCTGCCGATGTGATCCACTCCTGGTGGGTGCCGGCCTTCGCGGTCAAACGCGACGCCATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGACCCGGATCGAAAAGCCAGGCATCTACCGCGGCCAGTGCACCGAGCTGTGc > 1:203710/1‑149 (MQ=255) ccTGGTCACTGCTGCCGATGTGATCCACTCCTGGTGGGTGCCGGCCTTCGCTGTCAAACGCGACGCCATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGACCCTGATCGAAAAGCCAGGCATCTACCGCGGCCAGTGCACCGAGCTGTGCGGc < 4:255338/148‑1 (MQ=255) cTGGTCACTGCTGCCGATGTGATCCACTCCTGGTGGGTGCCGGCCTTCGCGGTCAAACGCGACGCCATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGACCCGGATCGAAAAGCCAGGCATCTACCGCGGCCAGTGCACCGAGCTGTGCGGCa < 4:427935/148‑1 (MQ=255) tGGTCACTGCTGCCGATGTGATCCACTCCTGGTGGGTGCCGGCCTTCGCGGTCAAACGCGACGCCATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGACCCGGATCGAAAAGCCAGGCATCTACCGCGGCCa > 6:16627/1‑127 (MQ=255) tGGTCACTGCTGCCGATGTGATCCACTCCTGGTGGGTGCCGGCCTTCGCGGTCAAACGCGACGCCATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGACCCGGATCGAAAAGCCAGGCATCTACCGCGGCCa < 5:16627/127‑1 (MQ=255) tGGTCACTGCTGCCGATGTGATCCACTCCTGGTGGGTGCCGGCCTTCGCGGTCAAACGCGACGCCATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGACCCGGATCGAAAAGCCAGGCATCTACCGCGGCCAGTGCACCGAGCTGTGCGGCAAg > 6:174866/1‑149 (MQ=255) gTCACTGCTGCCGATGTGATCCACTCCTGGTGGGTGCCGGCCTTCGCGGTCAAACGCGACGCCATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCTTGACCCGGATCGAAAAGCCAGGCATCTACCGCGGCCAGTGCACCGTGCTGTGCGGCAAg < 8:263212/147‑1 (MQ=255) gTCACTGCTGCCGATGTGATCCACTCCTGGTGGGTGCCGGCCTTCGCGGTCAAACGCGACGCCATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGACCCGGATCGAAAAGCCAGGCATCTACCGCGGCCAGTGCACCGAGCTGTGCGGCAAGGa > 2:357357/1‑149 (MQ=255) ctgcCGATGTGATCCACTCCTGGTGGGTGCCGGCCTTCGCGGTCAAACGCGACGCCATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGACCCGGATCGAAAAGCCAGGCATCTACCGCGGCCAGTGCACCGAGCTGTGCGGCAAGGACCACGGc > 6:39398/1‑149 (MQ=255) ccGATGTGATCCACTCCTGGTGGGTGCCGGCCTTCGCGGTCAAACGCGACGCCATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGACCCGGATCGAAAAGCCAGGCATCTACCGCGGCCAGTGCACCGAGCTGTGCGGCAAGGACCACGGCtt < 6:432095/148‑1 (MQ=255) gATGTGATCCACTCCTGGTGGGTGCCGGCCTTCGCGGTCAAACGCGACGCCATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGACCCGGATCGAAAAGCCAGGCATCTACCGCGGCCAGTGCACCGAGCTGTGCGGCAAGGACCACGGCTTCAt > 6:420033/1‑149 (MQ=255) gATGTGATCCACTCCTGGTGGGTGCCGGCCTTCGCGGTCAAACGCGACGCCATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGACCCGGATCGAAAAGCCAGGCATCTACCGCGGCCAGTGCACCGAGCTGTGCGGCAAGGACCACGGCTTCAt > 7:150466/1‑149 (MQ=255) aTGTGATCCACTCCTGGTGGGTGCCGGCCTTCGCGGTCAAACGCGACGCCATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGACCCGGATCGAAAAGCCAGGCATCTACCGCGGCCAGTGCACCGAGCTGTGCGGCAAGGACCACGGCTTCATg > 2:190228/1‑149 (MQ=255) tgtgATCCACTCCTGGTGGGTGCCGGCCTTCGCGGTCAAACGCGACGCCATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGACCCGGATCGAAAAGCCAGGCATCTTCCGCGGCCAGTGCACCGAGCTGTGCGGCAAGGACCACGGCTTCATGc < 3:230243/149‑1 (MQ=255) tgtgATCCACTCCTGGTGGGTGCCGGCCTTCGCGGTCAAACGCGACGCCATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGACCCGGATCGAAAAGCCAGGCATCTACCGCGGCCAGTGCACCGAGCTGTGCGGCAAGGACCACGGCTTCATGc < 6:76497/149‑1 (MQ=255) tgATCCACTCCTGGTGGGTGCCGGCCTTCGCGGTCAAACGCGACGCCATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGACCCGGATCGAAAAGCCAGGCATCTACCGCGGCCAGTGCACCGAGCTGTGCGGCAAGGACCACGGCTTCATGCCg > 7:193344/1‑149 (MQ=255) tCCACTCCTGGTGGGTGCCGGCCTTCGCGGTCAAACGCGACGCCATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGACCCGGATCGAAAAGCCAGGCATCTACCGCGGCCAGTGCACCGAGCTGTGCGGCAAGGACCACGGCTTCATGCCggtg < 8:120508/149‑1 (MQ=255) tCCACTCCTGGTGGGTGCCGGCCTTCGCGGTCAAACGCGACGCCATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGACCCGGATCGAAAAGCCAGGCATCTACCGCGGCCAGTGCACCGAGCTGTGCGGCAAGGACCACGGCTTCATGCCggt < 8:154978/148‑1 (MQ=255) cACTCCTGGTGGGTGCCGGCCTTCGCGGTCAAACGCGACGCCATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGACCCGGATCGAAAAGCCAGGCATCTACCGCGGCCAGTGCACCGAGCTGTGCGGCAAGGACCACGGCTTCATGCCggtgg < 8:29399/148‑1 (MQ=255) aCTCCTGGTGGGTGCCGGCCTTCGCGGTCAAACGCGACGCCATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGACCCGGATCGAAAAGCCAGGCATCTACCGCGGCCAGTGCACCGAGCTGTGCGGCAAGGACCACGGCTTCATGCCggtggtg > 2:2901/1‑149 (MQ=255) aCTCCTGGTGGGTGCCGGCCTTCGCGGTCAAACGCGACGCCATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGACCCGGATCGAAAAGCCAGGCATCTACCGCGGCCAGTGCACCGAGCTGTGCGGCAAGGACCACGGCTTCATGCCggtggtg > 8:305756/1‑149 (MQ=255) tggtggGTGCCGGCCTTCGCGGTCAAACGCGACGCCATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGACCCGGATCGAAAAGCCAGGCATCTACCGCGGCCAGTGCACCGAGCTGTGCGGCAAGGACCACGGCTTCATGCCGGTGGTGGTc > 2:79734/1‑147 (MQ=255) gtgggtgCCGGCCTTCGCGGTCAAACGCGACGCCATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGACCCGGATCGAAAAGCCAGGCATCTACCGCGGCCAGTGCACCGAGCTGTGCGGCAAGGACCACGGCTTCATGCCGGTGGTGGTCGAgg < 4:159402/149‑1 (MQ=255) gtgggtgCCGGCCTTCGCGGTCAAACGCGACGCCATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGACCCGGATCGAAAAGCCAGGCATCTACCGCGGCCAGTGCACCGAGCTGTGCGGCAAGGACCACGGCTTCATGCCGGTGGTGGTCGAg < 3:233032/148‑1 (MQ=255) gtgggtgCCGGCCTTCGCGGTCAAACGCGACGCCATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGACCCGGATCGAAAAGCCAGGCATCTACCGCGGCCAGTGCACCGAGCTGTGCGGCAAGGACCACGGCTTCATGCCGGTGGTGGTCGAg < 7:372047/148‑1 (MQ=255) gggtgCCGGCCTTCGCGGTCAAACGCGACGCCATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGACCCGGATCGAAAAGCCAGGCATCTACCGCGGCCAGTGCACCGAGCTGTGCGGCAAGGACCACGGCTTCATGCCGGTGGTGGTCGAGGTc < 5:238205/149‑1 (MQ=255) ggtgCCGGCCTTCGCGGTCAAACGCGACGCCATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGACCCGGATCGAAAAGCCAGGCATCTACCGCGGCCAGTGCACCGAGCTGTGCGGCAAGGACCACGGCTTCATGCCGGTGGTGGTCGAGGTc > 6:59801/1‑148 (MQ=255) ggtgCCGGCCTTCGCGGTCAAACGCGACGCCATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGACCCGGATCGAAAAGCCAGGCATCTACCGCGGCCAGTGCACCGAGCTGTGCGGCAAGGACCACGGCTTCATGCCGGTGGTGGTCGAGGTc < 1:2901/148‑1 (MQ=255) tgCCGGCCTTCGCGGTCAAACGCGACGCCATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGACCCGGATCGAAAAGCCAGGCATCTACCGCGGCCAGTGCACCGAGCTGTGCGGCAAGGACCACGGCTTCATGCCGGTGGTGGTCGAGGTCAAg > 5:183047/1‑149 (MQ=255) cGGCCTTCGCGGTCAAACGCGACGCCATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGACCCGGATCGAAAAGCCAGGCATCTACCGCGGCCAGTGCACCGAGCTGTGCGGCAAGGACCACGGCTTCATGCCGGTGGTGGTCGAGGTc > 6:419629/1‑143 (MQ=255) cGGCCTTCGCGGTCAAACGCGACGCCATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGACCCGGATCGAAAAGCCAGGCATCTACCGCGGCCAGTGCACCGAGCTGTGCGGCAAGGACCACGGCTTCATGCCGGTGGTGGTCGAGGTc < 5:419629/143‑1 (MQ=255) cGGCCTTCGCGGTCAAACGCGACGCCATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGACCCGGATCGAAAAGCCAGGCATCTACCGCGGCCAGTGCACCGAGCTGTGCGGCAAGGACCACGGCTTCATGCCGGTGGTGGTCGAGGTCAAGTc > 3:375420/1‑148 (MQ=255) ggCCTTCGCGGTCAAACGCGACGCCATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGACCCGGATCGAAAAGCCAGGCATCTACCGCGGCCAGTGCACCGAGCTGTGCGGCAAGGACCACGGCTTCATGCCGGTGGTGGTCGAGGTCAAGTcc > 5:53318/1‑148 (MQ=255) ttCGCGGTCAAACGCGACGCCATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGACCCGGATCGAAAAGCCAGGCATCTACCGCGGCCAGTGCACCGAGCTGTGCGGCAAGGAc < 1:383345/108‑1 (MQ=255) ttCGCGGTCAAACGCGACGCCATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGACCCGGATCGAAAAGCCAGGCATCTACCGCGGCCAGTGCACCGAGCTGTGCGGCAAGGAc > 2:383345/1‑108 (MQ=255) ttCGCGGTCAAACGCGACGCCATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGACCCGGATCGAAAAGCCAGGCATCTACCGCGGCCAGTGCACCGAGCTGTGCGGCAAGGACCACGGCTTCATGCCGGTGGTGGTCGAGGTCAAGTCCAAGGc > 2:248126/1‑149 (MQ=255) ttCGCGGTCAAACGCGACGACATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGACCCGGATCGAAAAGCCAGGAATCTACCGCGGCCAGTGCACCGAGCTGTTAGGCAAGGACAACGGCTTCATGCCGGTGGTGGTCGAGGTCAAGTACAAGGc > 2:313537/1‑149 (MQ=255) cgcgGTCAAACGCGACGCCATCCCAGTCTTTGTCAACGAAGCCTGGACCCGGATCGAAAAGCCAGGCATCTAGCGCGGCCAGTGCACCGAGCTGTGCGGCAAGGACCACGGCTTCATGCCGGTGGTGGTCGAGGTCAAGTCCAAGGCg < 2:230544/148‑1 (MQ=255) cgcgGTCAAACGCGACGCCATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGACCCGGATCGAAAAGCCAGGCATCTACCGCGGCCAGTGCACCGAGCTGTGCGGCAAGGACCACGGCTTCATGCCGGTGGTGGTCGAGGTCAAGTCCAAGGCg < 3:417196/148‑1 (MQ=255) gcgGTCAAACGCGACGCCATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGACCCGGATCGAAAAGCCAGGCATCTACCGCGGCCAGTGCACCGAGCTGTGCGGCAAGGACCACGGCTTCATGCCGGTGGTGGTCGAGGTCAAGTCCAAGGCGGa < 6:53318/149‑1 (MQ=255) aaaCGCGACGCCATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGACCCGGATCGAAAAGCCAGGCATCTACCGCGGCCAGTGCACCGAGCTGTGCGGCAAGGACCACGGCTTCATGCCGGTGGTGGTCGAGGt > 4:348789/1‑128 (MQ=255) aaaCGCGACGCCATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGACCCGGATCGAAAAGCCAGGCATCTACCGCGGCCAGTGCACCGAGCTGTGCGGCAAGGACCACGGCTTCATGCCGGTGGTGGTCGAGGt < 3:348789/128‑1 (MQ=255) aaCGCGACGCCATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGACCCGGATCGAAAAGCCAGGCATCTACCGCGGCCAGTGCACCGAGCTGTGCGGCAAGGACCACGGCTTCATGCCGGTGGTGGTCGAGGTCAAGTCCAAGGCGGATTACGa > 5:287345/1‑148 (MQ=255) cgcgACGCCATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGACCCGGATCGAAAAGCCAGGCATCTACCGCGGCCAGTGCACCGAGCTGTGCGGCAAGGACCACGGCTTCATGCCGGTGGTGGTCGAGGTCAAGTCCAAGGCGGATTACGacac < 5:420033/149‑1 (MQ=255) gcgACGCCATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGACCCGGATCGAAAAGCCAGGCATCTACCGCGGCCAGTGCACCGAGCTGTGCGGCAAGGACCACGGCTTCATGCCGGTGGTGGTCGAGGTCAAGTCCAAGGCGGATTACGACAcc > 2:289308/1‑149 (MQ=255) gcgACGCCATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGACCCGGATCGAAAAGCCAGGCATCTACCGCGGCCAGTGCACCGAGCTGTGCGGCAAGGACCACGGCTTCATGCCGGTGGTGGTCGAGGTCAAGTCCAAGGCGGATTACGACAcc > 8:27237/1‑149 (MQ=255) cgACGCCATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGACCCGGATCGAAAAGCCAGGCATCTACCGCGGCCAGTGCACCGAGCTGTGCGGCAAGGACCACGGCTTCATGCCGGTGGTGGTCGAGGTCAAGTCCAAGGCGGATTACGACACCt > 1:26660/1‑149 (MQ=255) gCCATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGACCCGGATCGAAAAGCCAGGCATCTACCGCGGCCAGTGCACCGAGCTGTGCGGCAAGGACCACGGCTTCATGCCGGTGGTGGTCGAGGTCAAGTCCAAGGCGGATTCCGACACCTGGCt > 6:317798/1‑149 (MQ=255) ccATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGACCCGGATCGAAAAGCCAGGCATCTACCGCGGCCAGTGCACCGAGCTGTGCGGCAAGGACCACGGCTTCATGCCGGTGGTGGTCGAGGTCAAGTCCAAGGCGGATTACGACACCTGGCtt < 8:303814/149‑1 (MQ=255) cATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGACCCGGATCGAAAAGCCAGGCATCTACCGCGGCCAGTGCACCGAGCTGTGCGGCAAGGACCACGGCTTCATGCCGGTGGTGGTCGAGGTCAAGTCCAAGGCGGATTACGACACCTGGCTTg > 4:402837/1‑149 (MQ=255) cATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGACCCGGATCGAAAAGCCAGGCATCTACCGCGGCCAGTGCACCGAGCTGTGCGGCAAGGACCACGGCTTCATGCCGGTGGTGGTCGAGGTCAAGTCCAAGGCGGATTACGACACCTGGCTTg < 1:79734/149‑1 (MQ=255) gtccAGGCTTCGTTGACAAAGCCTGGACCCGGATCGAAAAGCCAGGCATCTACCGCGGCCAGTGCACCGAGCTGTGCGGCAAGGACCACGGCTTCATGCCTGTGGTGGTCGAGGTCAAGTCCAAGGCGGATTACGACACCTGGCTTGGc > 3:258598/3‑149 (MQ=255) ccAGGCTTCGTTGACAAAGCCTGGACCCGGATCGAAAAGCCAGGCATCTACCGCGGCCAGTGCACCGAGCTGTGCGGCAAGGACCACGGCTTCATGCCGGTGGTGGTCGAGGTCAAGTCCAAGGCGGATTACGACACATGGCTTGGc > 5:252520/1‑147 (MQ=255) cAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGACCCGGATCGAAAAGCCAGGCATCTACCGCGGCCAGTGCACCGAGCTGTGCGGCAAGGACCACGGCTTCATGCCGGTGGTGGTCGAGGTCAAGTCCAAGGCGGATTACGACACCTGGCTTGGCGAg < 6:287345/149‑1 (MQ=255) cAGGCTTCGTTGACAAAGCCTGGACCCGGATCGAAAAGCCAGGCATCTACCGCGGCCAGTGCACCGAGCTGTGCGGCAAGGACCACGGCTTCATGCCGGTGGTGGTCGAGGTCAAGTCCAAGGCGGATTACGACACCTGGCTTGGCGAg > 2:392837/1‑149 (MQ=255) aGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGACCCGGATCGAAAAGCCAGGCATCTACCGCGGCCAGTGCACCGAGCTGTGCGGCAAGGACCACGGCTTCATGCCGGTGGTGGTCGAGGTCAAGTCCAAGGCGGATTACGACACCTGGCTTGGCGAgc > 4:140405/1‑149 (MQ=255) aGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGACCCGGATCGAAAAGCCAGGCATCTACCGCGGCCAGTGCACCGAGCTGAGCGGCAAGGACCACGGCTTCATGCCGGTGGTGGTCGAGGTCAAGTCCAAGGCGGATTACGACACCTGGCTTGGCGAgc < 5:257874/149‑1 (MQ=255) aGGCTTCGTTGACAAAGCCTGGACCCGGATCGAAAAGCCAGGCATCTACCGCGGCCAGTGCACCGAGCTGTGCGGCAAGGACCACGGCTTCATGCCGGTGGTGGTCGAGGTCAAGTCCAAGGCGGATTACGACACCTGGCTTGGCGAgc > 7:130545/1‑149 (MQ=255) tGTCAACGAAGCCTGGACCCGCATCGAAAAGCCAGGCATCTACCGCGGCCAGACCACCGACCTGTGCGGCAAGGACCACGGCTTCATGCCGGTGGTGGCCGAGGTCAAGTCCAAGGCGGATTACGACACCAGGCTTGGCGAGCGCaa < 4:400005/147‑1 (MQ=255) gTCAACGAAGCCTGGACCCGGATCGAAAAGCCAGGCATCTACCGCGGCCAGTGCACCGAGCTGTGCGGCAAGGACCACGGCTTCATGCCGGTGGTGGTCGAGGTCAAGTCCAAGGCGGATTACGACACCTGGCTTGGCGAGCGCAAGGc > 6:90515/1‑149 (MQ=255) gTCAACGAAGCCTGGACCCGGATCGAAAAGCCAGGCATCTACCGCGGCCAGTGCACCGAGCTGTGCGGCAAGGACCACGGCTTCATGCCGGTGGTGGTCGAGGTCAAGTCCAAGGCGGATTACGACACCTGGCTTGGCGAGCGCAAGGc > 7:265283/1‑149 (MQ=255) tCAACGAAGCCTGGACCCGGATCGAAAAGCCAGGCATCTACCGCGGCCAGTGCACCGAGCTGTGCGGCAATGACCACGGCTTCATGCCGGTGGTGGTCGAGGTCAAGTCCAAGGCGGATTACGACACCTGGCTTGGCGAGCGCAAGGCt < 6:68305/149‑1 (MQ=255) tCAACGAAGCCTGGACCCGGATCGAAAAGCCAGGCATCTACCGCGGCCAGTGCACCGAGCTGTGCGGCAAGGACCACGGCTTCATGCCGGTGGTGGTCGAGGTCAAGTCCAAGGCGGATTACGACACCTGGCTTGGCGAGCGCAAGGCt > 3:388319/1‑149 (MQ=255) tCAACGAAGCCTGGACCCGGATCGAAAAGCCAGGCATCTACCGCGGCCAGTGCACCGAGCTGTGCGGCAAGGACCACGGCTTCATGCCGGTGGTGGTCGAGGTCAAGTCCAAGGCGGATTACGACACCTGGCTTGGCGAGCGCAAGGCt < 2:70360/149‑1 (MQ=255) | ATGAGCACTACCTGCTGGAAGTCGACCAGCCGCTGGTGCTGCCGGTGGGCGCGAAAGTGCGCTTCCTGGTCACTGCTGCCGATGTGATCCACTCCTGGTGGGTGCCGGCCTTCGCGGTCAAACGCGACGCCATCCCAGGCTTTGTCAACGAAGCCTGGACCCGGATCGAAAAGCCAGGCATCTACCGCGGCCAGTGCACCGAGCTGTGCGGCAAGGACCACGGCTTCATGCCGGTGGTGGTCGAGGTCAAGTCCAAGGCGGATTACGACACCTGGCTTGGCGAGCGCAAGGCT > NC_002947/109285‑109577 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |