Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 951,217 | A→T | 5.0% | I16I (ATA→ATT) | cyoB → | cytochrome bo terminal oxidase subunit I |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 951,217 | 0 | A | T | 5.0% | 251.0 / 2.0 | 79 | I16I (ATA→ATT) | cyoB | cytochrome bo terminal oxidase subunit I |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (36/39); new base T (2/2); total (38/41) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 |
CGCGGTCGTAGCCACGAAGAAGCAGGCAGCAAAGATCTGGCCACAACCAAGGGTGTGGAATCGAGTATGCAACCAGCTGCCGGTGCAGAGGAGTAAGAGATGTTCGGTAAATTAAGCCTGGAGGCGATACCCTAT‑CACGAGCCGATAGTCATGGTGACGCTTGCCATGATCGCGCTCGGCGGTATCGCTGTCGT‑CGGTCTTATCACCTATTTCCGCAAGTGGACCTACTTGTGGAGCGAGTGGCTGACTACTGTCGACCACAAAAAGATCGGCGTGATGTACATCATCGTCGCG > NC_002947/951071‑951364 | cgcgGTCGTAGCCACGAAGAAGCAGGCAGCAAAGATCTGGCCACAACCAAGGGTGTGGAATCGAGTATGCAACCAGCTGCCGGTGCAGAGGAGTAAGAGATGTTCGGTAAATTAAGCCTGGAGGCGATACCCTAT‑CACGAGCCGATAGt > 5:57782/1‑149 (MQ=255) gggcGTAGCCACGAAGAAGCAGGCAGCAAAGATCTGGCCACAACCAAGGGTGTGGAATCGAGTATGCAACCAGCTGCCGGTGCAGAGGAGTAAGAGATGTTCGGTAAATTAAGCCTGGAGGCGATACCCTAT‑CACGAGCCGATAGTCAt < 8:195228/146‑1 (MQ=255) ggTCGTAGCCACGAAGAAGCAGGCAGCAAAGATCTGGCCACAACCAAGGGTGTGGAATCGAGTATGCAACCAGCTGCCGGTGCAGAGGAGTAAGAGATGTTCGGTAAATTAAGCCTGGAGGCGATACCCTAT‑CACGAGCCGATAGTCAt < 3:230140/149‑1 (MQ=255) gTCGTAGCCACGAAGAAGCAGGCAGCAAAGATCTGGCCACAACCAAGGGTGTGGAATCTAGTATGCAACCAGCTGCCGGTGCAGAGGAGTAAGAGATGTTCGGTAAATTAAGCCTGGAGGCGATACCCTAT‑CACGAGCCGATAGTCATg < 5:54239/149‑1 (MQ=255) tCGTAGCCACGAAGAAGCAGGCAGCAAAGATGTGGCCACAACCAAGGGTGTGGAATCGAGTATGCAACCTGCTGCCGGTGCAGAGGAGTAAGAGATGTTCGGTAAATTAAGCCTGGAGGCGATACCCTAT‑CACGAGCCGATAGTCATgg < 5:121740/149‑1 (MQ=255) gTAGCCACGAAGAAGCAGGCAGCAAAGATCTGGCCACAACCAAGGGTGTGGAATCGAGTATGCAACCAGCTGCCGGTGCAGAGGAGTAAGAGATGTTCGGTAAATTAAGCCTGGAGGCGATACCCTAT‑CACGAGCCGATTGTCATGGt > 4:49172/1‑148 (MQ=255) gCCACGAAGAAGCAGGCAGCAAAGATCTGGCCACAACAAAGTGTGTGGAATCTAGTATGCAACCAGCTGCCGGCGCAGAGGAGTAAGAGATGTTCGGTAAATTAAGCCTGGAGGCGATACCCTAT‑CACGAGCCGATAGTCATGGTGACg < 3:401012/149‑1 (MQ=255) ccACGAAGAAGCAGGCAGCAAAGATCTGGCCACAACCAAGGGTGTGGAATCGAGTATGCAACCAGCTGCCGGTGCAGAGGAGTAAGAGATGTTCGGTAAATTAAGCCTGGAGGCGATACCCTAT‑CACGAGCCGATAGTCATGGTGACGc < 5:411814/149‑1 (MQ=255) aagaagCAGGCAGCAAAGATCTGGCCACAACCAAGGGTGTGGAATCGAGTATGCAACCAGCTGCCGGTGCAGAGGAGTAAGAGATGTTCGGTAAATTAAGCCTGGAGGCGATACCCTAT‑CACGAGCCGATAGTCATGGTGACGCTTGcc < 5:152584/149‑1 (MQ=255) aagaagCAGGCAGCAAAGATCTGGCCACAACCAAGGGTGTGGAATCGAGTATGCAACCAGCTGCCGGTGCAGAGGAGTAAGAGATGTTCGGTAAATTAAGCCTGGAGGCGATACCCTAT‑CACGAGCCGATAGTCATGGTGACGCTTGc > 1:73547/1‑148 (MQ=255) gcaggcagCAAAGATCTGGCCACAACCAAGGGTGTGGAATCGAGTATGCAACCAGCTGCCGGTGCAGAGGAGTAAGAGATGTTCGGTAAATTAAGCCTGGAGGCGATACCCTAT‑CACGAGCCGATAGTCATGGTGACGCTTGCCATGAt > 8:282482/1‑149 (MQ=255) caggcagCAAAGATCTGGCCACAACCAAGGGTGTGGAATCGAGTATGCAACCAGCTGCCGGTGCAGAGGAGTAAGAGATGTTCGTTAAATTAAGCCTGGAGGCGATACCCTAT‑CACGAGCCGATAGTCATGGTGACGCTTGCCATGATc < 6:240694/149‑1 (MQ=255) gcagcaAAGATCTGGCCACAACCAAGGGTGTGGAATCGAGTATGCAACCAGCTGCCGGTGCAGAGGAGTAAGAGATGTTCGGTAAATTAAGCCTGGAGGCGATACCCTAT‑CACGAGCCGATAGTCATGGTGACGCTTGCCATGATcgcg > 2:119966/1‑149 (MQ=255) cTGGCCACAACCAAGGGTGTGGAATCGAGTATGCAACCAGCTGCCGGTGCAGAGGAGTAAGAGATGTTCGGTAAATTAAGCCTGGAGGCGATACCCTAT‑CACGAGCCGATAGTCATGGTGACGCTTGCCATGATCGCGCTCGGCGGTAt > 3:113750/1‑149 (MQ=255) tGGCCACAACCAAGGGTGTGGAATCGAGTATGCAACCAGCTGCCGGTGCAGAGGAGTAAGAGATGTTCGGTAAATTAAGCCTGGAGGCGATACCCTAT‑CACGAGCCGATAGTCATGGTGACGCTTGCCATGATCGCGCTCGGCGGTATc < 6:441843/149‑1 (MQ=255) gCCACAACCAAGGGTGTGGAATCGAGTATGCAACCAGCTGCCGGTGCAGAGGAGTAAGAGATGTTCGGTAAATTAAGCCTGGAGGCGATACCCTAT‑CACGAGCCGATAGTCATGGTGACGCTTGCCATGATCGCGCTCGGCGGTATCg < 6:57782/148‑1 (MQ=255) cacaACCAAGGGTGTGGAATCGAGTATGCAACCAGCTGCCGGTGCAGAGGAGTAAGAGATGTTCGGTAAATTAAGCCTGGAGGCGATACCCTAT‑CACGAGCCGATAGTCATGGTGACGCTTGCCATGATCGCGCTCGGCGGTATCGCTg > 7:387054/1‑149 (MQ=255) cacaACCAAGGGTGTGGAATCGAGTATGCAACCAGCTGCCGGTGCAGAGGAGTAAGAGATGTTCGGTAAATTAAGCCTGGAGGCGATACCCTAT‑CACGAGCCGATAGTCATGGTGACGCTTGCCATGATCGCGCTCGGCGGTATCGCTg < 4:113750/149‑1 (MQ=255) acaACCAAGGGTGTGGAATCGAGTATGCAACCAGCTGCCGGTGCAGAGGAGTAAGAGATGTTCGGTAAATTAAGCCTGGAGGCGATACCCTATCCACGAGCCGATAGTCATGGTGACGCTTGCCATGATCGCGCTCGGCGGTATCGCTg < 1:119966/149‑1 (MQ=255) acaACCAAGGGTGTGGAATCGAGTATGCAACCAGCTGCCGGTGCAGAGGAGTAAGAGATGTTCGGTAAATTAAGCCTGGAGGCGATACCCTAT‑CACGAGCCGATAGTCATGGTGACGCTTGCCATGATCGCGCTCGGCGGTATCGCTgt < 1:31773/149‑1 (MQ=255) aaCCAAGGGTGTGGAATCGAGTATGCAACCAGCTGCCGGTGCAGAGGAGTAAGAGATGTTCGGTAAATTAAGCCTGGAGGCGATACCCTAT‑CACGAGCCGATAGTCATGGTGACGCTTGCCATGATCGCGCTcggc > 2:238987/1‑136 (MQ=255) aaCCAAGGGTGTGGAATCGAGTATGCAACCAGCTGCCGGTGCAGAGGAGTAAGAGATGTTCGGTAAATTAAGCCTGGAGGCGATACCCTAT‑CACGAGCCGATAGTCATGGTGACGCTTGCCATGATCGCGCTcggc < 1:238987/136‑1 (MQ=255) cAAGGGTGTGGAATCGAGTATGCAACCAGCTGCCGGTGCAGAGGAGTAAGAGATGTTCGGTAAATTAAGCCTGGAGGCGATACCCTAT‑CACGAGCCGATAGTCATGGTGACGCTTGCCATGATCGCGCTCGGCGGTATCGCTGtcgt‑cg < 4:283077/149‑1 (MQ=255) cAAGGGTGTGGAATCGAGTATGCAACCAGCTGCCGGTGCAGAGGAGTAAGAGATGTTCGGTAAATTAAGCCTGGAGGCGATACCCTAT‑CACGAGCCGATAGTCATGGTGACGCTTGCCATGATCGCGCTCGGCGGTATCGCTGtcgt‑cg > 4:52819/1‑149 (MQ=255) cAAGGGTGTGGAATCGAGTATGCAACCAGCTGCCGGTGCAGAGGAGTAAGAGATGTTCGGTAAATTAAGCCTGGAGGCGATACCCTAT‑CACGAGCCGATAGTCATGGTGACGCTTGCCATGATCGCGCTCGGCGGTATCGCTGtcgt‑cg > 1:360555/1‑149 (MQ=255) gggTGTGGAATCGAGTATGCAACCAGCTGCCGGTGCAGAGGAGTAAGAGATGTTCGGTAAATTAAGCCTGGAGGCGATACCCTAT‑CACGAGCCGATAGTCATGGTGACGCTTGCCATGATCGCGCTCGGCGGTATCGCTGTCGT‑CGGTc < 3:70264/149‑1 (MQ=255) tgGAATCGAGTATGCAACCAGCTGCCGGTGAAGAGGAGTAAGAGATGTTCGGTAAATTAAGCCTGGAGGCGATACCCTAT‑CACGAGCCGATAGTCATGGTGACGCTTGCCATGATCGCGCTCGGCGGTATCGCTGTCGT‑CGGTCTTAt > 8:266647/1‑148 (MQ=255) ggAATCGAGTATGCAACCAGCTGCCGGTGCAGAGGAGTAAGAGATGTTCGGTAAATTAAGCCTGGAGGCGATACCCTAT‑CACGAGCCGATAGTCATGGTGACGCTTGCCATGATCGCGCTCGGCGGTATCGCTGTCGT‑CGGTCTTATCa > 3:167329/1‑149 (MQ=255) gAATCGAGTATGCAACCAGCTGCCGGTGCAGAGGAGTAAGAGATGTTCGGTAAATTAAGCCTGGAGGCGATACCCTAT‑CACGAGCCGATAGTCATGGTGACGCTTGCCATGATCGCGCTCGGCGGTATCGCTGTCGT‑CGGTCTTATCAc < 4:167329/149‑1 (MQ=255) aTCGAGTATGCAACCAGCTGCCGGTGCAGAGGAGTAAGAGATGTTCGGTAAATTAAGCCTGGAGGCGATACCCTAT‑CACGAGCCGATAGTCATGGTGACGCTTg < 3:350069/104‑1 (MQ=255) aTCGAGTATGCAACCAGCTGCCGGTGCAGAGGAGTAAGAGATGTTCGGTAAATTAAGCCTGGAGGCGATACCCTAT‑CACGAGCCGATAGTCATGGTGACGCTTg > 4:350069/1‑104 (MQ=255) tCGAGTATGCAACCAGCTGCCGGTGCAGAGGAGTAAGAGATGTTCGGTAAATTAAGCCTGGAGGCGATACCCTAT‑CACGAGCCGATAGTCATGGTGACGCTTGCCATGATCGCGCTCGGCGGTATCGCTGTCGT‑CGGTCTTATCACCTa > 2:33112/1‑149 (MQ=255) tCGAGTATGCAACCAGCTGCCGGTGCAGAGGAGTAAGAGATGTTCGGTAAATTAAGCCTGGAGGCGATACCCTAT‑CACGAGCCGATAGTCATGGTGACGCTTGCCATGATCGCGCTCGGCGGTATCGCTGTCGT‑CGGTCTTATCACCTa > 6:439015/1‑149 (MQ=255) gAGTATGCAACCAGCTGCCGGTGCAGAGGAGTAAGAGATGTTCGGTAAATTAAGCCTGGAGGCGATACCCTAT‑CACGAGCCGATAGTCATGGTGACGCTTGCCATGATc > 4:303973/1‑109 (MQ=255) gAGTATGCAACCAGCTGCCGGTGCAGAGGAGTAAGAGATGTTCGGTAAATTAAGCCTGGAGGCGATACCCTAT‑CACGAGCCGATAGTCATGGTGACGCTTGCCATGATCGCGCTCGGCGGTATCGCTGTCGT‑CGGTCTTATCACCTAtt > 1:386914/1‑149 (MQ=255) tATGCAACCAGCTGCCGGTGCAGAGGAGTAAGAGATGTTCGGTAAATTAAGCCTGGAGGCGATACCCTAT‑CACGAGCCGATAGTCATGGTGACGCTTGCCATGATCGCGCTCGGCGGTATCGCTGTCGT‑CGGTCTTATCACCTATTTcc > 6:419794/1‑149 (MQ=255) tGCAACCAGCTGCCGGTGCAGAGGAGTAAGAGATGTTCGGTAAATTAAGCCTGGAGGCGATACCCTAT‑CACGAGCCGATAGTCATGGTGACGCTTGCCATGATCGCGCTCGGCGGTATCGCTGTCGT‑CGGTCTTATCACCTATTTCCg < 8:387054/148‑1 (MQ=255) aCCAGCTGCCGGTGCAGAGGAGTAAGAGATGTTCGGTAAATTAAGCCTGGAGGCGTTACCCTCT‑CACGACCGGATAGTCATGGTGACGCTTGCCATGATCGCGCTCGGCGGTATCGCTGTCGT‑CGGTCTTATCACCTATTTCCGCAAGt < 1:142761/149‑1 (MQ=255) aCCAGCTGCCGGTGCAGAGGAGTAAGAGATGTTCGGTAAATTAAGCCTGGAGGCGATACCCTAT‑CACGAGCCGATAGTCATGGTGACGCTTGCCATGATCGCGCTCGGCGGTATCGCTGTCGT‑CGGTCTTATCACCTATTTCCGCAAGt < 2:74137/149‑1 (MQ=255) aCCAGCTGCCGGTGCAGAGGAGTAAGAGATGTTCGGTAAATTAAGCCTGGAGGCGATACCCTAT‑CACGAGCCGATAGTCATGGTGACGCTTGCCATGATCGCGCTCGGCGGTATCGCTGCCGT‑CGGTCTTATCACCTATTTCCGCAAGt < 1:33112/149‑1 (MQ=255) gCTGCCGGTGCAGAGGAGTAAGAGATGTTCGGTAAATTAAGCCTGGAGGCGATACCCTAT‑CACGAGCCGATAGTCATGGTGACGCTTGCCATGATCGCGCTCGGCGGTATCGCTGTCGT‑CGGTCTTATCACCTATTTCCGCAAGTGGAc > 8:243050/1‑149 (MQ=255) cTGCCGGTGCAGAGGAGTAAGAGATGTTCGGTAAATTAAGCCTGGAGGCGATACCCTAT‑CACGAGCCGATAGTCATGGTGACGCTTGCCATGATCGCGCTCGGCGGTATCGCTGTCGT‑CGGTCTTATCACCTATTTCCGCAAGTGGAcc < 5:439015/149‑1 (MQ=255) cTGCCGGTGCAGAGGAGTAAGAGATGTTCGGTAAATTAAGCCTGGAGGCGATACCCTAT‑CACGAGCCGATAGTCATGGTGACGCTTGCCATGATCGCGCTCGGCGGTATCGCTGTCGT‑CGGTCTTATCACCTATTTCCGCAAGTGGAcc > 4:341964/1‑149 (MQ=255) ccGGTGCAGAGGAGTAAGAGATGTTCGGTAAATTAAGCCTGGAGGCGATACCCTAT‑CACGAGCCGATAGTCATGGTGACGCTTGCCATGATCGCGCTCGGCGGTATCGCTGTCGT‑CGGTCTTATCACCTATTTCCGCAAGTGGACCTAc > 3:422152/1‑149 (MQ=255) ccGGTGCAGAGGAGTAAGAGATGTTCGGTAAATTAAGCCTGGAGGCGATACCCTAT‑CACGAGCCGATAGTCATGGTGACGCTTGCCATGATCGCGCTCGGCGGTATCGCTGTCGT‑CGGTCTTATCACCTATTTCCGCAAGTGGACCTAc > 1:343722/1‑149 (MQ=255) cAGAGGAGTAAGAGATGTTCGGTAAATTAAGCCTGGAGGCGATACCCTAT‑CACGAGCCGATAGTCATGGTGACGCTTGCCATGATCGCGCTCGGCGGTATCGCTGTCGT‑CGGTCTTATCACCTATTTCCGCAAGTGGACCTACTtgtg < 2:303071/148‑1 (MQ=255) cAGAGGAGTAAGAGATGTTCGGTAAATTAAGCCTGGAGGCGATACCCTAT‑CACGAGCCGATAGTCATGGTGACGCTTGCCATGATCGCGCTCGGCGGTATCGCTGTCGT‑CGGTCTTATCACCTATTTCCGCAAGTGGACCTACTtgtg > 2:161189/1‑148 (MQ=255) agagGAGTAAGAGATGTTCGGTAAATTAAGCCTGGAGGCGATACCCTAT‑CACGAGCCGATAGTCATGGTGACGCTTGCCATGATCGCGCTCGGCGGTATCGCTGTCGT‑CGGTCTTATCACCTATTTCCGCAAGTGGACCTACTTGTGGa < 3:341964/149‑1 (MQ=255) gagTAAGAGATGTTCGGTAAATTAAGCCTGGAGGCGATACCCTAT‑CACGAGCCGATAGTCATGGTGACTCTTGCCATGATCGCGCTCGGCGGTATCGCTGTCGT‑CGGTCTTATCACCTATTTCCGCAAGTGGACCTACTTGTGGAGCGa < 7:282482/149‑1 (MQ=255) tAAGAGATGTTCGGTAAATTAAGCCTGGAGGCGATACCCTAT‑CACGAGCCGATAGTCATGGTGACGCTTGCCATGATCGCGCTCGGCGGTATCGCTGTCGT‑CGGTCTTATCACCTATTTCCGCAAGTGGACCTACTTGTGGAGCGAGTg > 5:7109/1‑149 (MQ=255) tAAGAGATGTTCGGTAAATTAAGCCTGGAGGCGATACCCTAT‑CACGAGCCGATAGTCATGGTGACGCTTGCCATGATCGCGCTCGGCGGTATCGCTGTCGT‑CGGTCTTATCACCTATTTCCGCAAGTGGACCTACTTGTGGAGCGAGTg > 3:333697/1‑149 (MQ=255) tAAGAGATGTTCGGTAAATTAAGCCTGGAGGCGATACCCTAT‑CACGAGCCGATAGTCATGGTGACGCTTGCCATGATCGCGCTCGGCGGTATCGCTGTCGT‑CGGTCTTATCACCTATTTCCGCAAGTGGACCTACTTGTGGAGCGAGTg > 1:389306/1‑149 (MQ=255) tAAGAGATGTTCGGTAAATTAAGCCTGGAGGCGATACCCTAT‑CACGAGCCGATAGTCATGGTGACGCTTGCCATGATCGAGCTCGGCGGTATCGCTGTCGT‑CGGTCTTATCACCTATTTCAGCAAGTGGACCTACTTGTGGAGCGAGtt > 3:37470/1‑148 (MQ=255) agagATGTTCGGTAAATTAAGCCTGGAGGCGATACCCTAT‑CACGAGCCGATAGTCATGGTGACGCTTGCCATGATTGCGCTCGGCGGTATCGCTGTCGT‑CGGTCTTATCACCTATTTCCGCAAGTGGACCTACTTGTGGAGCGAGTGGc > 3:427236/1‑149 (MQ=255) gaTGTTCGGTAAATTAAGCCTGGAGGCGATACCCTAT‑CACGAGCCGATAGTCATGGTGACGCTTGCCATGATCGCGCTCGGCGGTATCGCTGTCGT‑CGGTCTTATCACCTATTTCCGCAAGTGGACCTACTTGTGGAGCGAGTGGCTGa < 2:360555/149‑1 (MQ=255) aTGTTCGGTAAATTAAGCCTGGAGGCGATACCCTAT‑CACGAGCCGATAGTCATGGTGACGCTTGCCATGATCGCGCTCGGCGGTATCGCTGTCGT‑CGGTCTTATCACCTATTTCCGCAAGTgg > 5:34885/1‑123 (MQ=255) aTGTTCGGTAAATTAAGCCTGGAGGCGATACCCTAT‑CACGAGCCGATAGTCATGGTGACGCTTGCCATGATCGCGCTCGGCGGTATCGCTGTCGT‑CGGTCTTATCACCTATTTCCGCAAGTgg < 6:34885/123‑1 (MQ=255) ttCGGTAAATTAAGCCTGGAGGCGATACCCTAT‑CACGAGCCGATTGTCATGGTGACGCTTGCCATGATCGCGCTCGGCGGTATCGCTGTCGT‑CGGTCTTATCACCTATTTCCGCAAGTGGACCTACTTGTGGAGCGAGTGGCTGacta < 3:49172/148‑1 (MQ=255) ggTAAATTAAGCCTGGAGGCGATACCCTAT‑CACGAGCCGATAGTCATGGTGACGCTTGCCATGATCGCGCTCGGCGGTATCGCTGTCGT‑CGGTCTTATCACCTATTTCCGCAAGTGGACCTACTTGTGGAGCGAGTGGCTGACTACTGt < 8:146423/149‑1 (MQ=255) gTAAATTAAGCCTGGAGGCGATACCCTAT‑CACGAGCCGATTGTCATGGTGACGCTTGCCATGATCGCGCTCGGCGGTATCGCTGTCGT‑CGGTCTTATCACCTATTTCCGCAAGTGGACCTACTTGTGGAGCGAGTGGCTGACTACTGTc > 8:205927/1‑149 (MQ=255) gTAAATTAAGCCTGGAGGCGATACCCTAT‑CACGAGCCGATAGTCATGGTGACGCTTGCCATGATCGCGCTCGGCGGTATCGCTGTCGT‑CGGTCTTATCACCTATTTCCGCAAGTGGACCTACTTGTGGAGCGAGTGGCTGACTACTGTc < 3:52819/149‑1 (MQ=255) aTTAAGCCTGGAGGCGATACCCTAT‑CACGAGCCGATAGGCATGGTGACGCTTGCCATGATCGCGCTCGGCGGTATCGCTGGCGTAAGGTCTTATCACCTATTTCCGCAAGTGGACCTACTTGTGGAGCGAGTGGCTGACTACTGTCGAc < 1:347917/149‑1 (MQ=255) gCCTGGAGGCGATACCCTAT‑CACGAGCCGATAGTCATGGTGACGCTTGCCATGATCGCGCTCGGCGGTATCGCTGTCGT‑CGGTCTTATCACCTATTTCCGCAAGTGGACCTACTTGTGGAGCGAGTGGCTGACTACTGTCGACCACaa > 3:424485/1‑148 (MQ=255) cTGGAGGCGATACCCTAT‑CACGAGCCGATAGTCATGGTGACGCTTGCCATGATCGCGCTCGGCGGTATCGCTGTCGT‑CGGTCTTATCACCTATTTCCGCAAGTGGACCTACTTGTGGATCGAGAGGCTGACTACGGTCGCCCACaaa > 2:356819/1‑147 (MQ=255) gAGGCGATACCCTAT‑CACGAGCCGATAGTCATGGTGACGCTTGCCATGATCGCGCTCGGCGGTATCGCTGTCGT‑CGGTCTTATCACCTATTTCCGCAAGTGGACCTACTTGTGGAGCGAGTGGCTGACTACTGTCGACCACAAAAAGAt < 7:243050/149‑1 (MQ=255) gATACCCTAT‑CACGAGCCGATAGTCATGGTGACGCTTGCCATGATCGCGCTCGGCGGTATCGCTGTCGT‑CGGTCTTATCACCTATTTCCGCAAGTGGACCTACTTGTGGAGCGAGTGGCTGACTACTGTc < 4:325253/130‑1 (MQ=255) gATACCCTAT‑CACGAGCCGATAGTCATGGTGACGCTTGCCATGATCGCGCTCGGCGGTATCGCTGTCGT‑CGGTCTTATCACCTATTTCCGCAAGTGGACCTACTTGTGGAGCGAGTGGCTGACTACTGTc > 3:325253/1‑130 (MQ=255) tACCCTAT‑CACGAGCCGATAGTCATGGTGACGCTTGCCATGATCGCGCTCGGCGGTATCGCTGTCGT‑CGGTCTTATCACCTATTTCCGCAAGTGGACCTACTTGTGGAGCGAGTGGCTGACTACTGTCGACCACAAAAAGATCGGCGTg < 4:333697/149‑1 (MQ=255) cccTAT‑CACGAGCCGATTGTCATGGTGACGCTTGCCATGATCGCGCTCGGCGGTATCGCTGTCGT‑CGGTCTTATCACCTATTTCCGCAAGTGGACCTACTTGTGGAGCGAGTGGCTGACTACTGTCGACCACAAAAAGATCGGCGTGa < 7:205927/148‑1 (MQ=255) ccTAT‑CACGAGCCGATAGTCATGGTGACGCTTGCCATGATCGCGCTCGGCGGTATCGCTGTCGT‑CGGTCTTATCACGTATTTCCGCAAGTGGACCTACTTGTGGAGCGAGTGGCTGACTACTGTCGACCACAAAAAGATCGGCGTTATg > 6:42482/1‑149 (MQ=255) cTAT‑CACGAGCCGATAGTCATGGTGACGCTTGCCATGATCGCGCTGGGCGGTATCGCTGTCGT‑CGGTCTTATCACCTATTTCCGCAAGTGGACCTACTTGTGGAGCGAGTGGCTGACTACTGTCGACCACAAAAAGATCGGCGTGATg > 1:307735/1‑148 (MQ=255) t‑CACGAGCCGATAGTCATGGTGACGCTTGCCATGATCGCGCTCGGCGGTATCGCTGTCGT‑CGGTCTTATCACCTATTTCCGCAAGTGGACCTACTTGTGGAGCGAGTGGCTGACTACTGTCGACCACAAAAAGATCGGCGTGATGTAc < 4:422152/148‑1 (MQ=255) t‑CACGAGCCGATAGTCATGGTGACGCTTGCCATGATCGCGCTCGGCGGTATCGCTGTCGT‑CGGTCTTATCACCTATTTCCGCAAGTGGACCTACTTGTGGAGCGAGTGGCTGACTACTGTCGACCACAAAAAGATCGGCGTGATGTAc < 6:7109/148‑1 (MQ=255) t‑CACGAGCCGATAGTCATGGTGACGCTTGCCATGATCGCGCTCGGCGGTATCGCTGTCGT‑CGGTCTTATCACCTATTTCCGCAAGTGGACCTACTTGTGGAGCGAGTGGCTGACTACTGTCGACCACAAAAAGATCGGCGTGATGTAc < 2:343722/148‑1 (MQ=255) gAGCCGATAGTCATGGTGACGCTTGCCATGATCGCGCTCGGCGGTATCGCTGTCGT‑CGGTCTTATCACCTATTTCCGCAAGTGGACCTACTTGTGGAGCGAGTGGCTGACTACTGTCGACCACAAAAAGATCGGCGTGATGTAcatcat > 8:240610/1‑149 (MQ=255) gATAGTCATGGTGACGCTTGCCATGATCGCGCTCGGCGGTATCGCTGTCGT‑CGGTCTTATCACCTATTTCCGCAAGTGGACCTACTTGTGGAGCGAGTGGCTGACTACTGTCGACCACAAAAAGATCGGCGTGATGTACATCAtcgtcg > 8:141780/1‑149 (MQ=255) aTAGTCATGGTGACGCTTGCCATGATCGCGCTCGGCGGTATCGCTGTCGT‑CGGTCTTATCACCTATTTCCGCAAGTGGACCTACTTGTGGa < 4:324082/91‑1 (MQ=255) aTAGTCATGGTGACGCTTGCCATGATCGCGCTCGGCGGTATCGCTGTCGT‑CGGTCTTATCACCTATTTCCGCAAGTGGACCTACTTGTGGa > 3:324082/1‑91 (MQ=255) tAGTCATGGTGACGCTTGCCATGATCGCGCTCGGCGGTATCGCTGTCGT‑CGGTCTTATCACCTATTTCCGCAAGTGGACCTACTTGTGGAGCGAGTGGCTGACTACTGTCGACCACAAAAAGATCGGCGTGATGTACATCATCGTcgcg < 1:161189/149‑1 (MQ=255) | CGCGGTCGTAGCCACGAAGAAGCAGGCAGCAAAGATCTGGCCACAACCAAGGGTGTGGAATCGAGTATGCAACCAGCTGCCGGTGCAGAGGAGTAAGAGATGTTCGGTAAATTAAGCCTGGAGGCGATACCCTAT‑CACGAGCCGATAGTCATGGTGACGCTTGCCATGATCGCGCTCGGCGGTATCGCTGTCGT‑CGGTCTTATCACCTATTTCCGCAAGTGGACCTACTTGTGGAGCGAGTGGCTGACTACTGTCGACCACAAAAAGATCGGCGTGATGTACATCATCGTCGCG > NC_002947/951071‑951364 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |