| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 954,436 | T→G | 5.2% | L93R (CTC→CGC) | cyoE → | protoheme IX farnesyltransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 954,436 | 0 | T | G | 5.2% | 276.7 / 4.4 | 91 | L93R (CTC→CGC) | cyoE | protoheme IX farnesyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (48/36); new base G (2/3); total (52/39) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.50e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.64e-01 | |||||||||||
TACTTCGCTGGTGGTTGCGTCCGGATGCGTGTTCAACAACTGCATCGACCGTGACATCGACCACAAGATGGAGCGCACCAAGAACCGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCAACCCGCTGTCTGCGTTCTGCGCACTGATTGGCTTTGTCGTCTACGTCGGTTTCTACAGCCTGTGGCTGAAGCGTAAATCGGTGCACGGCACCTTGGTCGGCAGCCTGTC > NC_002947/954293‑954583 | tACTTCGCTGGTGGTTGCGTCCGGATGCGTGTTCAACAACTGCATCGACCGTGACATCGACCACAAGATGGAGCGCACCAAGAACCGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCgggg < 3:428353/149‑1 (MQ=255) ttCGCTGGTGGTTGCGTCCGGATGCGTGTTCAACAACTGCATCGACCGTGACATCGACCACAAGATGGAGCGCACCAAGAACCGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTgg > 4:259961/1‑149 (MQ=255) tCGCTGGTGGTTGCGTCCGGATGCGTGTTCAACAACTGCATCGACCGTGACATCGACCACAAGATGGAGCGCACCAAGAACCGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGc > 5:436165/1‑149 (MQ=255) gCTGGTGGTTGCGTCCGGATGCGTGTTCAACAACTGCATCGACCGTGACATCGACCACAAGATGGAGCGCACCAAGAACCGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCgg < 1:275406/149‑1 (MQ=255) gCTGGTGGTTGCGTCCGGATGCGTGTTCAACAACTGCATCGACCGTGACATCGACCACAAGATGGAGCGCACCAAGAACCGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCgg < 1:339960/149‑1 (MQ=255) gCTGGTGGTTGCGTCCGGATGCGTGTTCAACAACTGCATCGACCGTGACATCGACCACAAGATGGAGCGCACCAAGAACCGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCgg < 3:259961/149‑1 (MQ=255) gCTGGTGGTTGCGTCCGGATGCGTGTTCAACAACTGCATCGACCGTGACATCGACCACAAGATGGAGCGCACCAAGAACCGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCg < 7:182449/148‑1 (MQ=255) gCTGGTGGTTGCGTCCGGATGCGTGTTCAACAACTGCATCGACCGTGACATCGACCACAAGATGGAGCGCACCAAGAACCGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCg < 4:137270/148‑1 (MQ=255) gCTGGTGGTTGCGTCCGGATGCGTGTTCAACAACTGCATCGACCGTGACATCGACCACAAGATGGAGCGCACCAAGAACCGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACG‑CACCCCGAGCAGGGTGGCgt < 4:399390/148‑2 (MQ=255) cTGGTGGTTGCGTCCGGATGCGTGTTCAACAACTGCATCGACCGTGACATCGACCACAAGATGGAGCGCACCAAGAACCGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCgg < 2:318087/148‑1 (MQ=255) ggtggtTGCGTCCGGATGCGTGTTCAACAACTGCATCGACCGTGACATCGACCACAAGATGGAGCGCACCAAGAACCGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGtt > 4:267089/1‑149 (MQ=255) gtggtTGCGTCCGGATGCGTGTTCAACAACTGCAGCGACCGTGACATCGACCACAAGATGGAGCGCACCAAGAACCGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGt < 4:256846/147‑1 (MQ=255) tggtTGCGTCCGGATGCGTGTTCAACAACTGCATCGACCGTGACATCGACCACAAGATGGAGCGCACCAAGAACCGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTc < 2:13121/149‑1 (MQ=255) ggtTGCGTCCGGATGCGTGTTCAACAACTGCATCGACCGTGACATCGACCACAAGATGGAGCGCACCAAGAACCGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGTTCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGttt > 5:370129/1‑147 (MQ=255) ggtTGCGTCCGGATGCGTGTTCAACAACTGCATCGACCGTGACATCGACCACAAGATGGAGCGCACCAAGAACCGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGttt > 6:332166/1‑147 (MQ=255) ttGCGTCCGGATGCGTGTTCAACAACTGCATCGACCGTGACATCGACCACAAGATGGAGCGCACCAAGAACCGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGc > 1:103057/1‑149 (MQ=255) gTCCGGATGCGTGTTCAACAACTGCATCGACCGTGACATCGACCACAAGATGGAGCGCACCAAGAACCGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCctgc > 7:21134/1‑149 (MQ=255) gTCCGGATGCGTGTTCAACAACTGCATCGACCGTGACATCGACCACAAGATGGAGCGCACCAAGAACCGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCctgc < 7:273183/149‑1 (MQ=255) tCCGGATGCGTGTTCAACAACTGCATCGACCGTGACATCGACCACAAGATGGAGCGCACCAAGAACCGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCATCCCGAGCAGGGTGGCg < 6:423852/135‑1 (MQ=255) tCCGGATGCGTGTTCAACAACTGCATCGACCGTGACATCGACCACAAGATGGAGCGCACCAAGAACCGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCATCCCGAGCAGGGTGGCg > 5:423852/1‑135 (MQ=255) cGGATGCGTGTTCAACAACTGCATCGACCGTGACATCGACCACAAGATGGAGCGCACCAAGAACCGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGt < 1:244739/149‑1 (MQ=255) cGGATGCGTGTTCAACAACTGCATCGACCGTGACATCGACCACAAGATGGAGCGCACCAAGAACCGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGt < 3:267089/149‑1 (MQ=255) ggATGCGTGTTCAACAACTGCATCGACCGTGACATCGACCACAAGATGGAGCGCACCAAGAACCGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTa > 2:249929/1‑149 (MQ=255) tgtTCAACAACTGCATCGACCGTGACATCGACCACAAGATGGAGCGCACCAAGAACCGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAg < 2:103057/149‑1 (MQ=255) caacaaCTGCATCGACCGTGACATCGACCACAAGATGGAGCGCACCAAGAACCGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGcc > 7:171577/1‑148 (MQ=255) aacaacTGCATCGACCGTGACATCGACCACAAGATGGAGCGCACCAAGAACCGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCaa > 7:257078/1‑149 (MQ=255) aacaacTGCATCGACCGTGACATAGACCACAAGATGGAGCGCACCAAGAACCGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCaa > 5:264075/1‑149 (MQ=255) acaacTGCATCGACCGTGACATCGACCACAAGATGGAGCGCACCAAGAACCGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCAAc > 2:307971/1‑149 (MQ=255) cTGCATCGACCGTGACATCGACCACAAGATGGAGCGCACCAAGAACCGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCAACCCGc > 3:186941/1‑149 (MQ=255) caacGACCGTGACATCGACCACAAGATGGAGCGCACCAAGAACCGTCTCATGCTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATATACGCCACCCTGCAAGGGGTGGCGGGTATCAGCCTGCTGTATGTCCATCCCAACCCGCTg > 4:306587/4‑148 (MQ=255) cATCGACCGTGACATCGACCACAAGATGGAGCGCACCAAGAACCGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCAACCCGCTGt < 6:292390/149‑1 (MQ=255) aTCGACCGTGACATCGACCACAAGATGGAGCGCACCAAGAACCGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAgg > 6:190855/1‑136 (MQ=255) aTCGACCGTGACATCGACCACAAGATGGAGCGCACCAAGAACCGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAgg < 5:190855/136‑1 (MQ=255) aCCGTGACATCGACCACAAGATGGAGCGCACCAAGAACCGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCAACCCGCTGTCTGCg > 7:154599/1‑149 (MQ=255) gTGACATCGACCACAAGATGGAGCTCACGAAGAACCGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCAACCCGCTGTCTGCGTTc < 7:251248/149‑1 (MQ=255) gTGACATCGACCACAAGATGGAGCGCACCAAGAACCGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCa > 6:21263/1‑111 (MQ=255) gTGACATCGACCACAAGATGGAGCGCACCAAGAACCGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCa < 5:21263/111‑1 (MQ=255) tGACATCGACCACAAGATGGAGCGCACCAAGAACCGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCAACCCGCTGTCTGCg < 5:78644/145‑1 (MQ=255) tGACATCGACCACAAGATGGAGCGCACCAAGAACCGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCAACCCGCTGTCTGCg > 6:78644/1‑145 (MQ=255) tGACATCGACCACAAGATGGAGCGCACCAAGAACCGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCAACCCGCTGTCTGCGTTCt > 2:21847/1‑149 (MQ=255) tGACATCGACCACAAGATGGAGCGCACCAAGAACCGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCACGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCAACCCGCTGTCTGCGTTCt > 2:403476/1‑149 (MQ=255) cATCGACCACAAGATGGAGCGCACCAAGAACCGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCAACCCGCTGTCTGCGTTCTgcg > 3:1699/1‑149 (MQ=255) cGACCACAAGATGGAGCGCACCAAGAACCGTGTCATGGTTCAGGGCGGTATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCAACCCGCTGTCTGCGTTCTGCGCAc > 2:430717/1‑149 (MQ=255) ccACAAGATGGAGCGCACCAAGAACCGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCAACCCGCTGTCTGCGTTCTGCGCa > 7:241444/1‑145 (MQ=255) ccACAAGATGGAGCGCACCAAGAACCGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCAACCCGCTGTCTGCGTTCTGCGCa < 8:241444/145‑1 (MQ=255) ccACAAGATGGAGCGCACCAAGAACCGTGTCATCGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCCCGCTCATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGCCGGGTTTCAGCCTGCTCTATGACCAGGCCAACCCGCTGACAGCGTTCTGCGCACTg > 8:295796/1‑148 (MQ=255) cacaAGATGGAGCGCACCAAGAACCGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCAACCCGCTGTCTGCGTTCTGCGCACTGAt > 4:369226/1‑149 (MQ=255) cacaAGATGGAGCGCACCAACAACCGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCAACCCGCTGTCTGCGTTCTGCGCACTGAt > 4:163957/1‑149 (MQ=255) acaAGATGGAGCGCACCAAGAACCGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCAACCCGCTGTCTGCGTTCTGCGCACTGAtt < 5:332166/149‑1 (MQ=255) acaAGATGGAGCGCA‑CAAGAACCGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCAACCCGCTGTCTGCGTTCTGCGCACTGATTg > 6:235169/1‑149 (MQ=255) acaAGATGGAGCGCA‑CAAGAACCGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCAACCCGCTGTCTGCGTTCTGCGCACTGATTg > 6:229241/1‑149 (MQ=255) caAGATGGAGCGCACCAAGAACCGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCAACCCGCTGTCTGCGTTCTGCGCACTGATTg > 7:82409/1‑149 (MQ=255) caAGATGGAGCGCACCAAGAACCGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCAACCCGCTGTCTGCGTTCTGCGCACTGATTg > 6:393334/1‑149 (MQ=255) aaGATGGAGCGCACCAAGAACCGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCAACCCGCTGTCTGCGTTCTGCGCACTGATTgg < 6:370129/149‑1 (MQ=255) gAGCGCACCAAGAACCGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCAGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCAACCCGCTGTCTGCGTTCTGCGCACTGATTGGCTTTgt > 5:29162/1‑149 (MQ=255) gcACCAAGAACCGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCAACCCGCTGTCTGCGTTCTGCGCACTGATTGGCTTTgtcgtc > 6:372205/1‑149 (MQ=255) aCCAAGAACCGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCAACCCGCTGTCTGCGTTCTGCGCACTGATTGGCTTTGTCGTCTa < 3:211092/149‑1 (MQ=255) ccAAGAACCGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCAACCCGCTGTCTGCGTTCTGCGCACTGATTGGCTTTGTCGTCTAc < 4:186941/149‑1 (MQ=255) cAAGAACCGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCAACCCGCTGTCTGCGTTCTGCGCACTGATTGGCTTTGTCGTCTACg > 1:45784/1‑149 (MQ=255) cAAGAACCGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCAACCCGCTGTCTGCGTTCTGCGCACTGATTGGCTTTGTCGTCTACg > 4:376938/1‑149 (MQ=255) gAACCGTCTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGATGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCAACCCGCTGTCTGCGTTCGGCGCACTGATTGGAATTGTCGTCTacgacg > 8:339727/1‑149 (MQ=255) tCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCAACCCGCTGTCTGCGTTCTGCGCACTGATTGGCTTTGTCGTCTACGTCGGTTTCTa > 1:56224/1‑148 (MQ=255) cATGGTTCAGGGCGGCAAGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCATGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCCACCCGCTGTCTGCGGTCTGCGCACTGATTGGCTTTGTCGTGTACGTCGGTTTCTa > 6:305426/1‑147 (MQ=255) gTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCAACCCGCTGTCTGCGTTCTGCGCACTGATTGGCTTTGTCGTCTACGTCGGTTTCTACAGCCt > 4:375499/1‑149 (MQ=255) gTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCAACCCGCTGTCTGCGTTCTGCGCACTGATTGGCTTTGTCGTCTACGTCGGTTTCTACAGCCt > 3:61672/1‑149 (MQ=255) gTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCAACCCGCTGTCTGCGTTCTGCGCACTGATTGGCTTTGTCGTCTACGTCGGTTTCTACAGCCt > 2:51749/1‑149 (MQ=255) tCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCAACCCGCTGTCTGCGTTCTGCGCACTGATTGGCTTTgtc > 1:184983/1‑124 (MQ=255) tCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCAACCCGCTGTCTGCGTTCTGCGCACTGATTGGCTTTgtc < 2:184983/124‑1 (MQ=255) aGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCAACCCGCTGTCTGCGTTCTGCGCACTGATTGGCTTTGTCGTCTACGTCGGTTTCTACAGCCtgtg < 6:436165/148‑1 (MQ=255) aGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCAACCCGCTGTCTGCGTTCTGCGCACTGATTGGCTTTGTCGTCTACGTCGGTTTCTACAGCCTGTgg > 2:91213/1‑149 (MQ=255) gcATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCAACCCGCTGTCTGCGTTCTGCGCACTGATTGGCTTTGTCGTCTACGTCGGTTTCTACAGCCTGTGGCTGAAg < 1:21847/149‑1 (MQ=255) cATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCAACCCGCTGTCTGCGTTCTGCGCACTGATTGGCTTTGTCGTCTACGTCGGTTTCTACAGCCTGTGGCTGAAGc > 5:152055/1‑149 (MQ=255) gTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCAACCCGCTGTCTGCGTTCTGCGCACTGATTGGCTTTGTCGTCTACGTCGGTTTCTACAGCCTGTGGCTGAAGCGt > 5:331563/1‑148 (MQ=255) gCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCAACCCGCTGTCTGCGTTCTGCGCACTGATTGGCTTTGTCGTCTACGTCGGTTTCTACAGCCTGTGGCTGAAGCGTAAAt > 6:444627/1‑149 (MQ=255) ccccTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCAACCCGCTGTCTGCGTTCTGCGCACTGATTGGCTTTGTCGTCTACGTCGGTTTCTACAGCCTGTGGCTGAAGCGTAAATCGGt > 1:291670/1‑149 (MQ=255) ccccTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCAACCCGCTGTCTGCGTTCTGCGCACTGATTGGCTTATTCGTCTACGTCGGTTTCTACAGCCTGTGGCTGAAGCGTAAATCg < 1:307971/147‑1 (MQ=255) cccTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCAACCCGCTGTCTGCGTTCTGCGCACTGATTGGCTTTGTCGTCTACGTCGGTTTCTACAGCCTGTGGCTGAAGCGTAAATCGGTg < 1:403476/149‑1 (MQ=255) cccTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCAGCTGTATGTCCAGGCCAACCCGCTGTCTGCGTTCTGCGCACTGATTGGCTTTGTCGTCTACGTCGGTTTCTACAGCCTGTGGCTGAAGCGTAAATCGGt > 2:254848/1‑148 (MQ=255) cTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCAACCCGCTGTCTGCGTTCTGCGCACTGATTGGCTTTGTCGTCTACGTCGGTTTCTACAGCCTGTGGCTGAAGCGTAAATCGGTGCa > 6:195391/1‑149 (MQ=255) gcgcTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCAACCCGCTGTCTGCGTTCTGCGCACTGATTGGCTTTGTCGTCTACGTCGGTTTCTACAGCCTGTGGCTGAAGCGTAAATCGGTGCAc < 8:154599/147‑1 (MQ=255) gcgcTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCAACCCGCTGTCTGCGTTCTGCGCACTGATTGGCTTTGTCGTCTACGTCGGTTTCTACAGCCTGTGGCTGAAGCGTAAATCGGTGCACgg < 8:171577/149‑1 (MQ=255) aTCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCAACCCGCTGTCTGCGTTCTGCGCACTGATTGGCTTTGTCGTCTACGTCGGTTTCTACAGCCTGTGGCTGAAGCGTAAATCGGTGCACGGCACCt < 8:82409/148‑1 (MQ=255) cccGCCACCCCGAGCAGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCAACCCGCTGTCTGCGTTCTGCGCACTGATTGGCTTTGTCGTCTACGTCGGTTTCTACAGCCTGTGGCTGAAGCGTAAATCGGTGCACGGCACCTTGGt > 3:210310/3‑149 (MQ=255) aCGCCACACTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCAACCCGCTGTCTGAGTTCTGCGCACTGATTGGCTTTGTCGTCTACGTCGGTTTCTACAGCCTGTGGCTGAAGCGTAAATCGGTGCACGGCACCTTGGTc > 8:249607/1‑149 (MQ=255) cGCCACCCTGCTCGGGGTGGCTGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCAACCCGCTGTCTGCGTTCTGCGCACTGATTGGCTTTGTCGTCTACGTCGGTTTCTACAGCCTGTGGCTGAAGCGTAAATCGGTGCACGGCACCTTgg < 3:163957/146‑1 (MQ=255) cGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCAACCCGCTGTCTGCGTTCTGCGCACTGATTGGCTTTGTCGTCTACGTCGGTTTCTACAGCCTGTGGCTGAAGCGTAAATCGGTGCACGGCACCTTAGTc < 4:1699/148‑1 (MQ=255) ccACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCAACCCGCTGTCTGCGTTCTGCGCACTGATTGGCTTTGTCGTCTACGTCGGTTTCTACAGCCTGTGGCTGAAGCGTAAATCGGTGCACGGCACCTTGGTCgg > 5:93148/1‑148 (MQ=255) aCCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCAACCCGCTGTCTGCGTTCTGCGCACTGATTGGCTTTGTCGTCTACGTCGGTTTCTACAGCCTGTGGCTGAAGCGTAAATCGGTGCACGGCACCTTGGTCGGCAg < 8:21134/149‑1 (MQ=255) cccTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCAACCCGCTGTCTGCGTTCTGCGCACTGATTGGCTTTGTCGTCTACGTCGGTTTCTACAGCCTGTGGCTGAAGCGTAAATCGGTGCACGGCACCTTGGTCGGCAGc < 5:229241/149‑1 (MQ=255) cccTGCGCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCAACCCGCTGTCTGCGTTCTGCGCACTGATTGGCTTTGTCGTCTACGTCGGTTTCTACAGCCTGTGGCTGAAGCGTAAATCGGTGCACGGCACCTTGGTCGGCAGc < 5:235169/149‑1 (MQ=255) cTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCAACCCGCTGTCTGCGTTCTGCGCACTGATTGGCTTTGTCGTCTACGTCGGTTTCTACAGCCTGTGGCTGAAGCGTAAATCGGTGCACGGCACCTTGGTCGGCAGCCTGTc < 5:372205/149‑1 (MQ=255) | TACTTCGCTGGTGGTTGCGTCCGGATGCGTGTTCAACAACTGCATCGACCGTGACATCGACCACAAGATGGAGCGCACCAAGAACCGTGTCATGGTTCAGGGCGGCATGTCGCTGCCCCTCGCGCTGATCTACGCCACCCTGCTCGGGGTGGCGGGTTTCAGCCTGCTGTATGTCCAGGCCAACCCGCTGTCTGCGTTCTGCGCACTGATTGGCTTTGTCGTCTACGTCGGTTTCTACAGCCTGTGGCTGAAGCGTAAATCGGTGCACGGCACCTTGGTCGGCAGCCTGTC > NC_002947/954293‑954583 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |