Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,237,648 | T→C | 5.9% | E154G (GAG→GGG) | PP_1078 ← | ABC transporter ATP‑binding protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,237,648 | 0 | T | C | 5.9% | 248.1 / 4.3 | 85 | E154G (GAG→GGG) | PP_1078 | ABC transporter ATP‑binding protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (40/40); new base C (3/2); total (43/42) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.43e-01 |
ACGGCAAAGGCTTCTTCCTGGTCATGGGTGACCAGAATGGCGCTGGTACCGCGGCTTTTGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGC‑CGGACAGCTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGAGTTTGACCAGCTCCAGCATCTCTTCGATGACGGCCGCCTGGCGTGGGTGTTTGGCGATAC > NC_002947/1237501‑1237792 | aCGGCAAAGGCTTCTACCTGGTCATGGGTGACCAGAATGGCGCAGGTACCGCGGCTTTTGAGAATGTCGCGATCCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCACCTCCACGACGAGGATGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTc > 2:15955/1‑149 (MQ=255) aCGGCAAAGACTTCTTCCTGGTCATGGGTGACCAGAATGGCGCTGGTACCGCGGCTTTTGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTc < 1:421027/149‑1 (MQ=255) gCAAAGGCTTCTTCCTGGTCATGGGTGACCAGAATGGCGATGGTACCGCGGCTTTTGAGAATGTAGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCggg > 6:233067/1‑149 (MQ=255) cAAAGGCTTCTTCCTGGTCATGGGTGACCAGAATGGCGCTGGTACCGCGGCTTTTGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGgc > 7:25771/1‑149 (MQ=255) ggCTTCTTCCTGGTCATGGGTGACCAGAATGGCGCTGGTACCGGGGCTTTTGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCTGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGATCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCa < 1:15955/149‑1 (MQ=255) ggCTTCTTCCTGGTCATGGGTGACCAGAATGGCGCTGGTACCGCGGCTTTTGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGgcgc > 8:356264/1‑147 (MQ=255) ggCTTCTTCCTGGTCATGGGTGACCAGAATGGCGCTGGTACCGCGGCTTTTGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCa < 2:279758/149‑1 (MQ=255) gCTTCTTCCTGGTCATGGGTGACCAGAATGGCGCTGGTACCGCGGCTTTTGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAg > 3:277888/1‑149 (MQ=255) cttcttCCTGGTCATGGGTGACCAGAATGGCGCTGGTACCGCGGCTTTTGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAgc > 5:78570/1‑149 (MQ=255) tGGTCATGGGTGACCAGAATGGCGCTGGTACCGCGGCTTTTGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGc > 3:217029/1‑149 (MQ=255) aTGGGTGACCAGAATGGCGCTGGTACCGCGGCTTTTGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAggg > 1:323196/1‑149 (MQ=255) tGGGTGACCAGAATGGCGCTGGTACCGCGGCTTTTGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCGCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGGTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGc < 2:383888/149‑1 (MQ=255) gggTGACCAGAATGGCGCTGGTACCGCGGCTTTTGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGc > 7:222605/1‑148 (MQ=255) tGACCAGAATGGCGCTGGTACCGCGGCTTTTGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGaca > 3:135783/1‑149 (MQ=255) tGACCAGAATGGCGCTGGTACCGCGGCTTTTGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTGGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGaca < 5:89577/149‑1 (MQ=255) gACCAGAATGGCGCTGGTACCGCGGCTTTTGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGacac > 4:202005/1‑149 (MQ=255) aCCAGAATGGCGCTGGTACCGCGGCTTTTGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCCGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGCGCCAGGGCGACACg > 7:399771/1‑149 (MQ=255) aCCAGAATGGCGCTGGTACCGCGGCTTTTGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACg > 1:361237/1‑149 (MQ=255) aGAATGGCGCTGGTACCGCGGCTTTTGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTtg < 2:323196/149‑1 (MQ=255) gAATGGCGCTGGTACCGCGTCTTTTGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTtgc < 7:154337/149‑1 (MQ=255) gAATGGCGCTGGTACCGCGGCTTTTGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTtgc > 5:398534/1‑149 (MQ=255) aTGGCGCTGGTACCGCGGCTTTTGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTtgctg < 1:115800/149‑1 (MQ=255) aTGGCGCTGGTACCGCGGCTTTTGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTtgctg < 3:77023/149‑1 (MQ=255) cgcTGGTACCGCGGCTTTTGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTgg < 8:222605/149‑1 (MQ=255) cTGGTACCGCGGCTTTTGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGgcc > 6:311111/1‑149 (MQ=255) gTACCGCGGCTTTTGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGgccgc < 6:371637/148‑1 (MQ=255) cgGCTTTTGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGC‑CGGACAg > 2:331797/1‑149 (MQ=255) ttttGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGC‑CGGACAGCTCa > 5:53317/1‑149 (MQ=255) ttttGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCCCGGgcgctg < 7:374240/102‑3 (MQ=255) ttttGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCCCGGgcgctg > 8:374240/1‑100 (MQ=255) tttGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCCGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGC‑CGGACAGCTCAt > 8:120218/1‑149 (MQ=255) gagaATGTCGCTTACCTGTTGGCTCAGGCGCCGGCGCAGGTCGACGTCGTGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCTGGTCTGTCGGCAGCTCCCGGTCCAGGGCGAGACGTTGCTGCTGGACGG‑CGGTCAGCTCATGc < 8:399771/148‑1 (MQ=255) gaATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGTCCGG‑CGGCCAGca < 7:325360/141‑2 (MQ=255) gaATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGC‑CGGACAGCTCATGCgg < 4:16356/148‑1 (MQ=255) gaATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCAGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGTCCGG‑CGGCCAGca > 8:325360/1‑140 (MQ=255) aTGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGC‑CGGACAGCTCATGCGGGt > 5:343895/1‑148 (MQ=255) tGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGC‑CGGACAGCTCATGCGGGTaa < 1:383832/149‑1 (MQ=255) tCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGC‑CGGACAGCTCATGCGGGTAAcg > 5:416599/1‑149 (MQ=255) tCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGC‑CGGACAGCTCATGCGGGTAAc < 4:217029/148‑1 (MQ=255) cgcgAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAgg < 3:190416/104‑1 (MQ=255) cgcgAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAgg > 4:190416/1‑104 (MQ=255) cgcgAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCCGGCCAGGGCCACACGATGCTCCTGGCCGC‑CGGACAGCTCATCCGCGTAAcgc > 8:411758/1‑149 (MQ=255) gcgAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGC‑CGGACAGCTCATGCGGGTAAcgcc > 2:99460/1‑149 (MQ=255) gcgAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGC‑CGGACAGCTCATGCGGGTAAcgcc < 6:53317/149‑1 (MQ=255) cgAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGgccgc > 6:117285/1‑124 (MQ=255) cgAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGgccgc < 5:117285/124‑1 (MQ=255) cgAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGC‑CGGACAGCTCATGCGGGTAAcgccc > 5:58567/1‑149 (MQ=255) gAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGC‑CGGACAGCTCATGCGGGTAAcgcccg < 6:443086/149‑1 (MQ=255) aaCCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGC‑CGGACAGCTCATGCGGGTAAcgcccgc < 3:255292/149‑1 (MQ=255) atgcgcCTGCTCAGCTCAACGTCGAGGTTTGAGAATGGCTCTTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGACAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCGGC‑CGGACAGCTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGa < 6:343895/146‑1 (MQ=255) aGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGC‑CGGACAGCTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGAg > 2:380488/1‑149 (MQ=255) aGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGC‑CGGACAGCTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGAg < 5:233067/149‑1 (MQ=255) ggcgccggcgccGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGC‑CGGACAGCTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGAGt < 5:311111/149‑1 (MQ=255) ggCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGC‑CGGACAGCTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGAGt < 6:416599/149‑1 (MQ=255) gcgcCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGC‑CGGACAGCTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGAGtt > 5:397116/1‑149 (MQ=255) gcgcCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACCTTGCTGCTGGCCGC‑CGGACAGCTCATGCGGGTAACGCCCGCCAAGCCCGCCGAGtt > 8:98056/1‑149 (MQ=255) gcCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGC‑CGGACAGCTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGAGGTTg < 6:417022/149‑1 (MQ=255) ccGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGC‑CGGACAGCTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGAGTTTGa < 6:398927/149‑1 (MQ=255) gcAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGC‑CGGACAGCTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGAGTTTGACCAGc < 8:78166/149‑1 (MQ=255) tCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGC‑CGGACAGCTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGAGTTTGACCAGCTCCAg > 6:400324/1‑149 (MQ=255) cACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGGCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGCTCGGACAGCTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGAGTTTGACCATCTCCa < 1:331797/147‑1 (MQ=255) cACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGC‑CGGACAGCTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGAGTGTGACCAGCTCCAGCa > 4:359859/1‑149 (MQ=255) gTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGC‑CGGACAGCTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGAGTTTGACCAGCt < 6:16470/140‑1 (MQ=255) gTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGC‑CGGACAGCTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGAGTTTGACCAGCt > 5:16470/1‑140 (MQ=255) ttGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGC‑CGGACAGCTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGAGTTTGACCAGCTCCAGCATCTCTTCGAt > 3:208530/1‑149 (MQ=255) ggAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGC‑CGGACAGCTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGAGTTTGACCAGCTCCAGCATCTCTTCGATGa > 4:194776/1‑149 (MQ=255) agaATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGC‑CGGACAGCTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGAGTTTGACCAGCTCCAGCATCTCTTCGATGACg < 6:58567/149‑1 (MQ=255) aTGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGC‑CGGACAGCTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGAGTTTGACCAGCTCCAGCATCTCTTCGATGACGgcc < 8:25771/149‑1 (MQ=255) gCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGC‑CGGACAGCTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGAGTTTGACCAGCTCCAGCATCTCTTCGATGACGgccgc < 5:400324/148‑1 (MQ=255) cTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGC‑CGGACAGCTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGAGTTTGACCAGCTCCAGCATCTCTTCGATGACGGCCGCCt > 7:108342/1‑149 (MQ=255) cTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGC‑CGGACAGCTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGAGTTTGACCAGCTCCAGCATCTCTTCGATGACGGCCGCCt > 5:170530/1‑149 (MQ=255) agcagcagcAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGC‑CGGACAGCTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGAGTTTGACCAGCTCCAGCATCTCTTCGATGACGGCCGCCTGGCGTgg < 7:98056/149‑1 (MQ=255) 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ttGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGC‑CGGACAGCTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGAGTTTGACCAGCTCCAGCATCTCTTCGATGACGGCCGCCTGGCGTGGGCGTTTGGCGa < 6:78570/149‑1 (MQ=255) cctggCCCGGGCGCTGGCGCCCGAGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGC‑CGGACAGCTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGAGTTTGACCAGCTCCAGCATCTCTTCGATGACGGCCGCCTGGCGTGGGTGTTTGGc < 5:207986/143‑1 (MQ=255) cctggCCCGGGCGCTGGCGCCCGAGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGC‑CGGACAGCTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGAGTTTGACCAGCTCCAGCATCTCTTCGATGACGGCCGCCTGGCGTGGGTGTTTGGc > 6:207986/4‑146 (MQ=255) ctggCCCGGGCGCTGGCGCCCGAGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGC‑CGGACAGCTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGAGTTTGACCAGCTCCAGCATCTCTTCGATGACGGCCGCCTGGCGTGGGTGTTTGGCGATa > 5:403044/3‑149 (MQ=255) cGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGC‑CGGACAGCTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGAGTTTGACCAGCTCCAGCATCTCTTCGATGACGGCCGCCTGGCGTGGGTGTTTGGCGATAc < 1:424559/149‑1 (MQ=255) cGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGC‑CGGACAGCTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGAGTTTGACCAGCTCCAGCATCTCTTCGATGACGGCCGCCTGGCGGGGGTGTTTGGCGATAc > 3:279015/1‑149 (MQ=255) cTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGC‑CGGACAGCTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGAGTTTGACCAGc > 4:356672/1‑97 (MQ=255) cTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGC‑CGGACAGCTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGAGTTTGACCAGc < 3:356672/97‑1 (MQ=255) | ACGGCAAAGGCTTCTTCCTGGTCATGGGTGACCAGAATGGCGCTGGTACCGCGGCTTTTGAGAATGTCGCGAACCTCATGGCTCAGGCGCCGGCGCAGCTCCACGTCGAGGTTGGAGAATGGCTCGTCAAGCAGCAGCAGTTGCGGCTCGGGCGCCAGCGCCCGGGCCAGGGCGACACGTTGCTGCTGGCCGC‑CGGACAGCTCATGCGGGTAACGCCCGCCCAGCCCGCCGAGTTTGACCAGCTCCAGCATCTCTTCGATGACGGCCGCCTGGCGTGGGTGTTTGGCGATAC > NC_002947/1237501‑1237792 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |