| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_002947 | 1,242,985 | 0 | T | C | 9.8% | 270.5 / 15.7 | 104 | intergenic (‑101/‑124) | PP_1083/tsaA | (2Fe‑2S)‑binding protein/peroxiredoxin |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (50/42); new base C (5/5); total (55/49) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
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Only 100 of 108 total aligned reads displayed.
CGGATCTGTCCGTCGGTAACGCCGACACAAAGACACACATACATAAGGGCTGACCATCGCTGGTTGGGTCGATGGGTTGGAGCTTAATGTTAATGAGAATGCTTGTCAAAGATCTTTCTGAGGGTGCTGTGCTTGAGCGACCGGTGGTCGCTTTGTCGACGGAGTCGGCCTGTCATGAGAAGCCGTGTATGAT‑GGTCGGCCTTTGTTGGATGTCGGGCAAGCCCGTCTGGCCCGGCAAACGGTTTTTCACCCTCATCAGGAGATTACAATGAGCGTACTCGTTGGTAAGAAA > NC_002947/1242841‑1243132 | cgGATCTGTCCGTCGGTACCGCCGACACAAAGACACACATACATAAGGGCTGACCATCGCTGGTTGGGTCTATGGGTTGGAGCTTAATTTTATTGAGAATGCTTGTCAAAGATCTTTCTGAGGGTGCTGTGCTTGAGCGACCGGGGGTc < 5:301354/149‑1 (MQ=255)cgGATCTGTCCGTCGGTAACGCCGACACAAAGACACACATACATAAGGGCTGACCATCGCTGGTTGGGTCGATGGGTTGGAGCTTAATGTTAATGAGAATGCTTGTCAAAGATCTTTCTGAGGGTGCTGTGCTTGAGCGACCGGTGGTc < 2:427377/149‑1 (MQ=255) aTCTGTCCGTCGGTAACGCCGACACAAAGACACACATACATAAGGGCTGACCATCGCTGGTTGGGTCGATGGGTTGGAGCTTAATGTTAATGAGAATGCTTGTCAAAGATCTTTCTGAGGGTGCTGTGCTTGAGCGACCGGTGGTCGCt > 8:116909/1‑149 (MQ=255) aTCTGTCCGTCGGTAACGCCGACACAAAGACACACATACATAAGGGCTGACCATCGCTGGTTGGGTCGATGGGTTGGAGCTTAATGTTAATGAGAATGCTTGTCAAAGATCTTTCTGAGGGTGCTGTGCTTGAGCGACCACCGGTCGCt 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> NC_002947/1242841‑1243132 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |