| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 194,608 | A→C | 6.4% | E38D (GAA→GAC) ‡ | PP_0168 → | putative surface adhesion protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 194,608 | 0 | A | C | 6.4% | 278.0 / 6.9 | 89 | E38D (GAA→GAC) ‡ | PP_0168 | putative surface adhesion protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (44/39); new base C (2/4); total (46/43) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.24e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.58e-01 | |||||||||||
GGGAAGTACCCCATCGGGTCACACGGAGAGTCCAATGAGCAGCGTTGTAGCCATCGTCAAAAGCATTGTCGGCCAGGTTATTGCGGTATCCCCAGAGGGCATCCGGCGTGTACTTATCGAAGGTGACCGCCTGTTGGCCGGTGAGGAAGTGCTCACCGGTCCGGGTGGCGCAGTTACTTTGGAGCTGGCTGATGGCCGACTGCTCGATCTTGGACGTGACAGCCAATGGAGCGCCGATGCGCCTGACAGTAGCACCGACCTGAGCCAGGCGGCAGCCCAGGCCGCGCCTTCGGT > NC_002947/194461‑194754 | gggAAGTACCCCATCGGGTCACACGGAGAGTCCAATGAGCAGCGTTGTAGCCATCGTCAAAAGCATTGTCGGCCAGGTTATTGCGGTATCCCCAGAGGGCATCCGGCGTGTACTTATCGAAGGTGACCGCCTGTTGGCCGGTGAGGAAg < 4:185647/149‑1 (MQ=255)gggAAGTACCCCATCGGGTCACACGGAGAGTCCAATGAGCAGCGTTGTAGCCATCGTCAAAAGCATTGTCGGCCAGGTTATTGCGGTATCCCCAGAGGGCATCCGGCGTGTACTTATCGAAGGTGACCGCCTGTTGGCCGGTGAGGAAg > 6:53351/1‑149 (MQ=255) aaGTACCCCATCGGGTCACACGGAGAGTCCAATGAGCAGCGTTGTAGCCATCGTCAAAAGCATTGTCGGCCAGGTTATTGCGGTATCCCCAGAGGGCAGCCGGCGTGTACTTATCGAAGGTGACCGCCTGTTGGCCGGTGAGGAAGTGc > 5:134150/1‑149 (MQ=255) aaGTACCCCATCGGGTCACACGGAGAGTCCAATGAGCAGCGTTGTAGCCATCGTCAAAAGCATTGTCGGCCAGGGTATTGCGGTATCCCCAGAGGGCATCCGGCGTGTACTTATCGATGGTGACCGCCTGTTGGCCTGTGAGTAAGTGc < 6:436021/149‑1 (MQ=255) ccccATCGGGTCACACGGAGAGTCCAATGAGCAGCGTTGTAGCCATCGTCAAAAGCTTTGTCGGCCAGGTTATTGCGGTATCCCCAGAGGGCATCCGGCGTGTACTTATCGAAGGTGACCGCCTGGTGGCCGGTGAGGAAGTGCTCAc < 2:270973/148‑1 (MQ=255) ccccATCGGGTCACACGGAGAGTCCAATGAGCAGCGTTGTAGCCATCGTCAAAAGCATTGTCGGCCAGGTTATTGCGGTATCCCCAGAGGGCATCCGGCGTGTACTTATCGAAGGTGACCGCCTGTTGGCCGGTGAGGAAGTGCTCAc < 5:36917/148‑1 (MQ=255) cccATCGGGTCACACGGAGAGTCCAATGAGCAGCGTTGTAGCCATCGTCAAAAGCATTGTCGGCCAGGTTATTGCGGTATCCCCAGAGGGCATCCGGCGTGTACTTATCGAAGGTGACCGCCTGTTGGCCGGTGAGGAATTGCTCACCg < 7:245635/149‑1 (MQ=255) cccATCGGGTCACACGGAGAGTCCAATGAGCAGCGTTGTAGCCATCGTCAAAAGCATTGTCGGCCAGGTTATTGCGGTATCCCCAGAGCGCATCCGGCGTGTACTTATCGAAGGTGACCGCCTGTTGGCAGGTGAGGAAGTGCTCAcct > 3:311596/1‑148 (MQ=255) ccATCGGGTCACACGGAGAGTCCAATGAGCAGCGTTGTAGCCATCGTCAAAAGCATTGTCGGCCAGGTTATTGCGGTATCCCCAGAGGGCATCCGGCGTGTACTTATCGAAGGTGACCGCCTGTTGGCCGGTGAGCACTTCCTCACCgg < 7:234528/149‑1 (MQ=255) ccATCGGGTCACACGGAGAGTCCAATGAGCAGCGTTGTAGCCATCGTCAAAAGCATTGTCGGCCAGGTTATTGCGGTATCCCCAGAGGGCATCCGGCGTGTACTTATCGAAGGTGACCGCCTGTTGGCCGGTGAGCACTTCCTCACCgg < 7:240841/149‑1 (MQ=255) aTCGGGTCACACGGAGAGTCCAATGAGCAGCGTTGTAGCCATCGTCAAAAGCATTGTCGGCCAGGTTATTGCGGTATCCCCAGAGGGCATCCGGCGTGTACTTATCGAAGGTGACCGCCTGTTGGCCGGTGAGGAAGTGCTCACCg < 8:24901/146‑1 (MQ=255) aTCGGGTCACACGGAGAGTCCAATGAGCAGCGTTGTAGCCATCGTCAAAAGCATTGTCGGCCAGGTTATTGCGGTATCCCCAGAGGGCATCCGGCGTGTACTTATCGAAGGTGACCGCCTGTTGGCCGGTGAGGAAGTGCTCACCg > 7:24901/1‑146 (MQ=255) aTCGGGTCACACGGAGAGTCCAATGAGCAGCGTTGTAGCCATCGTCAAAAGCATTGTCGGCCAGGTTATTGCGGTATCCCCAGAGGGCATCCGGCGTGTACTTATCGAAGGTGACCGCCTGTTGGCCGGTGAGGAAGTGCTCACCGGTc > 5:84560/1‑149 (MQ=255) ggTCACACGGAGAGTCCAATGAGCAGCGTTGTAGCCATCGTCAAAAGCATTGTCGGCCAGGTTATTGCGGTATCCCCAGAGGGCATCCGGCGTGTACTTATCGAAGGTGACCGCCTGTTGGCCGGTGAGGAAGTGCTCACCGGTCCggg > 4:307130/1‑149 (MQ=255) tCACACGGAGAGTCCAATGAGCAGCGTTGTAGCCATCGTCAAAAGCATTGTCGGCCAGGTTATTGCGGTATCCCCAGAGGGCATCCGGCGTGTACTTATCGAAGGTGACCGCCTGTTGGCCGGTGAGGAAGTGCTCACCGGTCCGGGTg < 6:224121/149‑1 (MQ=255) cacaCGGAGAGTCCAATGAGCAGCGTTGTAGCCATCGTCAAAAGCATTGTCGGCCAGGTTATTGCGGTATCCCCAGAGGGCATCCGGCGTGTACTTATCGAAGGTGACCGCCTGTTGGCCGGTGAGGAAGTGCTCACCGGTCCGGGTgg > 5:167332/1‑149 (MQ=255) acacGGAGAGTCCAATGAGCAGCGTTGTAGCCATCGTCAAAAGCATTGTCGGCCAGGTTATTGCGGTATCCCCAGAGGGCATCCGGCGTGTACTTATCGAAGGTGACCGCCTGTTGGCCGGTGAGGAAGTGCTCACCGGTCCGGGTGgc > 1:122595/1‑149 (MQ=255) cGGAGAGTCCAATGAGCAGCGTTGTAGCCATCGTCAAAAGCATTGTCGGCCAGGTTATTGCGGTATCCCCAGAGGGCATCCGGCGTGTACTTATCGAAGGTGACCGCCTGTTGGCCGGTGAGGAAGTGCTCACCGGTCCGGGTGgcg > 5:199416/1‑147 (MQ=255) ggAGAGTCCAATGAGCAGCGTTGTAGCCATCGTCAAAAGCATTGTCGGCCAGGTTATTGCGGTATCCCCAGAGGGCATCCGGCGTGTACTTATCGAAGGTGACCGCCTGTTGGCCGGTGAGGAAGTGCTCACCGGTCCGGGTGGCGCAg < 7:15342/149‑1 (MQ=255) ccAATGAGCAGCGTTGTAGCCATCGTCAAAAGCATTGTCGGCCAGGTTATTGCGGTATCCCCAGAGGGCATCCGGCGTGTACTTATCGAAGGTGACCGCCTGTTGGCCGGTGAGGAAGTGCTCACCGGTCCGGGTGGCGCAGTTACttt > 2:14556/1‑149 (MQ=255) cAATGAGCAGCGTTGTAGCCATCGTCAAAAGCATTGTCGGCCAGGTTATTGCGGTATCCCCAGAGGGCATCCGGCGTGTACTTATCGAAGGTGACCGCCTGTTGGCCGGTGAGGAAGTGCTCACCGGTCCGGGTGGCGCAGTTACTTTg < 8:183520/149‑1 (MQ=255) gcagcGTTGTAGCCATCGTCAAAAGCATTGTCGGCCAGGTTATTGCGGTATCCCCAGAGGGCATCCGGCGTGTACTTATCGAAGGTGACCGCCTGTTGGCCGGTGAGGAAGTGCTCACCGGTCCGGGTGGCGCAGTTACTTTGGAgct < 7:37934/148‑1 (MQ=255) ccgcGTTGTAGCCATCGTCAAAAGCATTGTCGGCCAGGTTATTGCGGTATCCCCAGAGGGCATCCGGCGTGTACTTATCGAAGGTGACCGCCTGTTGGCCGGTGAGGAAGTGCTCACCGGTCCGGGTGGCGCAGTTACTTTGGAgctgg < 7:401819/147‑1 (MQ=255) cagcGTTGTAGCCATCGTCAAAAGCATTGTCGGCCAGGTTATTGCGGTATCCCCAGAGGGCATCCGGCGTGTACTTATCGAAGGTGACCGCCTGTTGGCCGGTGAGGAAGTGCTCACCGGTCCGGGTGGCGCAGTTACTTTGGAgctgg > 6:308532/1‑149 (MQ=255) agcGTTGTAGCCATCGTCAAAAGCATTGTCGGCCAGGTTATTGCGGTATCCCCAGAGGGCATCCGGCGTGTACTTATCGAAGGTGACCGCCTGTTGGCCGGTGAGGAAGTGCTCACCGGTCCGGGTGGCGCAGTTACTTTGGAgctggc < 1:230618/149‑1 (MQ=255) cGTTGTAGCCATCGTCAAAAGCATTGTCGGCCAGGTTATTGCGGTATCCCCAGAGGGCATCCGGCGTGTACTTATCGAAGGTGACCGCCTGTTGGCCGGTGAGGAAGTGCTCACCGGTCCGGGTGGCGCAGTTACTTTGGAgctggctg < 4:143903/149‑1 (MQ=255) ttGTAGCCATCGTCAAAAGCATTGTCGGCCAGGTTATTGCGGTATCCCCAGAGGGCATCCGGCGTGTACTTATCGAAGGTGACCGCCTGTTGGCCGGTGAGGAAGTGCTCACCGGTCCGGGTGGCGCAGTTACTTTGGAGCTGGCTGAt > 5:368749/1‑149 (MQ=255) gTAGCCATCGTCAAAAGCATTGTCGGCCAGGTTATTGCGGTATCCCCAGAGGGCATCCGGCGTGTACTTATCGAAGGTGACCGCCTGTTGGCCGGTGAGGAAGTGCTCACCGGTCCGGGTGGCGCAGTTACTTTGGAGCTGGCTGATg < 4:373773/148‑1 (MQ=255) tAGCCATCGTCAAAAGCATTGTCGGCCAGGTTATTGCGGTATCCCCAGAGGGCATCCGGCGTGTACTTATCGAAGGTGACCGCCTGTTGGCCGGTGAGGAAGTGCTCACCGGTCCGGGTGGCGCAGTTACTTTGGAGCTGGCTGATgg < 6:336304/148‑1 (MQ=255) tAGCCATCGTCAAAAGCATTGTCGGCCAGGTTATTGCGGTATCCCCAGAGGGCATCCGGCGTGTACTTATCGAAGGTGACCGCCTGTTGGCCGGTGAGGAAGTGCTCACCGGTCCGGGTGGCGCAGTTACTTTGGAGCTGGCTGATGGc > 3:115010/1‑149 (MQ=255) aaaaGCATTGTCGGCCAGGTTATTGCGGTATCCCCAGAGGGCATCCGGCGTGTACTTATCGAAGGTGACCGCCTGTTGGCCGGTGAGGAAGTGCTCACCGGTCCGGGTGGCGCAGTTACTTTGGAGCTGGCTGATGGCCGACTGCTCGa < 6:368749/149‑1 (MQ=255) aaaaGCATTGTCGGCCAGGTTATTGCGGTATCCCCAGAGGGCATCCGGCGTGTACTTATCGAAGGTGACCGCCTGTTGGCCGGTGAGGAAGTGCTCACCGGTCCGGGTGGCGCAGTTACTTTGGAGCTGGCTGATGGCCGACTGCTCGa < 6:199416/149‑1 (MQ=255) aaaGCATTGTCGCCCAGGTTATTGCGGTATCCCCAGAGGGCATCCGGCGTGTACTTATCGAAGGTGACCGCCTGTTGGCCGGTGAGGAAGTGCTCACCGGTCCGGGTGGCGCAGTTACTTTGGAGCTGGCTGATGGCCGACTGCTCGAt > 6:326141/1‑149 (MQ=255) aGCATTGTCGGCCAGGTTATTGCGGTATCCCCAGAGGGCATCCGGCGTGTACTTATCGAAGGTGACCGCCTGTTGGCCGGTGAGGAAGTGCTCACCGGTCCGGGTGGCGCAGTTAc < 6:254148/116‑1 (MQ=255) aGCATTGTCGGCCAGGTTATTGCGGTATCCCCAGAGGGCATCCGGCGTGTACTTATCGAAGGTGACCGCCTGTTGGCCGGTGAGGAAGTGCTCACCGGTCCGGGTGGCGCAGTTAc > 5:254148/1‑116 (MQ=255) gCATTGTCGGCCAGGTTATTGCGGTATCCCCAGAGGGCATCCGGCGTGTACTTATCGAAGGTGACCGCCTGTTGGCCGGTGAGGAAGTGCTCACCGGTCCGGGTGGCGCAGTTACTTTGGAGCTGGCTGATGGCCGACTGCTCGATCtt > 1:235689/1‑149 (MQ=255) cATTGTCGGCCAGGTTATTGCGGTATCCCCAGAGGGCATCCGGCGTGTACTTATCGAAGGTGACCGCCTGTTGGCCGGTGAGGAAGTGCTCACCGGTCCGGGTGTCGCAGTTACTTTGGAGCTGGCTGATGGCCGACTGCTCGATCTTg < 7:201393/149‑1 (MQ=255) aTTGTCGGCCAGGTTATTGCGGTATCCCCAGAGGGCATCCGGCGTGTACTTATCGAAGGTGACCGCCTGTTGGCCGGTGAGGAAGTGCTCACCGGTCCGGGTGGCGCAGTTACTTTGGAGCTGGCTGATGGCCGACTGCTCGATCTTg > 1:48120/1‑148 (MQ=255) aTTGTCGGCCAGGTTATTGCGGTATCCCCAGAGGGCATCCGGCGTGTACTTATCGAAGGTGACAGCCTGTTGGCCGGTGAGGAAGTGCTCACCGGTCCGGGTGGCGCAGTTACTTTGGAGCTGGCTGATGGCCGACTGCTCGATCTTg < 4:268675/148‑1 (MQ=255) ttGTCGGCCAGGTTATTGCGGTATCCCCAGAGGGCATCCGGCGTGTACTTATCGAAGGTGACCGCCTGTTGGCCGGTGAGGAAGTGCTCACCGGTCCGGGTGGCGCAGTTACTTTGGAGCTGGCTGATGGCCGACTGCTCGATCTTGGa < 2:122595/149‑1 (MQ=255) tCGGCCAGGTTATTGCGGTATCCCCAGAGGGCATCCGGCGTGTACTTATCGAAGGTGACCGCCTGTTGGCCGGTGAGGAAGTGCTCACCGGTCCGGGTGGCGCAGTTACTTTGGAGCTGGCTGATGGCCGACTGCTCGATCTTGGACGt > 6:71415/1‑149 (MQ=255) tCGGCCAGGTTATTGCGGTATCCCCAGAGGGCATCCGGCGTGTACTTATCGAAGGTGACCGCCTGTTGGCCGGTGAGGAAGTGCTCACCGGTCCGGGTGGCGCAGTTACTTTGGAGCTGGCTGATGGCCGACTGCTCGATCTTGGACGt < 5:28553/149‑1 (MQ=255) ggCCAGGTTATTGCGGTATCCCCAGAGGGCATCCGGCGTGTACTTATCGAAGGTGACCGCCTGTTGGCCGGTGAGGAAGTGCTCACCGGTCCGGGTGGCGCAGTTACTTTGGAGCTGGCTGATGGCCGACTGCTCGATCTTGGACGTGa > 4:161964/1‑149 (MQ=255) ggCCAGGTTATTGCGGTATCCCCAGAGGGCATCCGGCGTGTACTTATCGAAGGTGACCGCCTGTTGGCCGGTGAGGAAGTGCTCACCGGTCCGGGTGGCGCAGTTACTTTGGAGCTGGCTGATGGCCGACTGCTCGATCTTGGACGTGa > 2:373396/1‑149 (MQ=255) ggCCAGGGTATTGCGGTATCCCCAGAGGGCATCCGGCGTGTACTTATCGAAGGTGACCGCCTGTTGGCCGGTGAGGAAGTGCTCACCGGTCCGGGTGGCGCAGTTACTTTGGAGCTGGCTGATGGCCGACTGCTCGATCTTGGACGTg < 6:134150/148‑1 (MQ=255) 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tCCCCAGAGGGCATCCGGCGTGTACTTATCGAAGGTGACCGCCTGTTGGCCGGTGAGGAAGTGCTCACCGGTCCGGGTGGCGCAGTTACTTTGGAGCTGGCTGGTGGCCGACTGCTCGATCTTGGACGTGACAGCCAATGGAGCGCCGa > 6:296635/1‑149 (MQ=255) tCCCCAGAGGGCATCCGGCGTGTACTTATCGAAGGTGACCGCCTGTTGGCCGGTGAGGAAGTGCTCACCGGTCCGGGTGGCGCAGTTACTTTGGAGCTGGCTGATGGCCGACTGCTCGATCTTGGACGTGACAGCCAATGGAGCGCCGa < 2:235689/149‑1 (MQ=255) tCCCCAGAGGGCATCCGGCGTGTACTTATCGAAGGTGACCGCCTGTTGGCCGGTGAGGAAGTGCTCACCGGTCCGGGTGGCGCAGTTACTTTGGAGCTGGCTGATGGCCGACTGCTCGATCTTGGACGTGACAGCCAATGGAGCGCCGa > 3:100504/1‑149 (MQ=255) cccAGAGGGCATCCGGCGTGTACTTATCGAAGGTGACCGCCTGTTGGCCGGTGAGGAAGTGCTCACCGGTCCGGGTGGCGCAGTTACTTTGGAGCTGGTTGATGGCCGACTGCTCGATCTTGGACGTGACAGCCAATGGAGCGCCGAt < 3:307130/148‑1 (MQ=255) ccAGAGGGCATCCGGCGTGTACTTATCGAAGGTGACCGCCTGTTGGCCGGTGAGGAAGTGCTCACCGGTCCGGGTGGCGCAGTTACTTTGGAGCTGGCTGATGGCCGACTGCTCGATCTTGGACGTGACAGCCAATGGAGCGCCGATgc > 5:367562/1‑149 (MQ=255) ccAGAGGGCATCCGGCGTGTACTTATCGAAGGTGACCGCCTGTTGGCCGGTGAGGAAGTGCTCACCGGTCCGGGTGGCGCAGTTACTTTGGAGCTGGCTGATGGCCGACTGCTCGATCTTGGACGTGACAGCCAATGGAGCGCCGATgc > 3:244862/1‑149 (MQ=255) agagGGCATCCGGCGTGTACTTATCGAAGGTGACCGCCTGTTGGCCGGTGAGGAAGTGCTCACCGGTCCGGGTGGCGCAGTTACTTTGGAGCTGGCTGATGGCCGACTGCTCGATCTTGGACGTGACAGCCAATGGAGCGCCGATgcgc < 3:161964/149‑1 (MQ=255) agGGCATCCGGCGTGTACTTATCGAAGGTGACCGCCTGTTGGCCGGTGAGGAAGTGCTCACCGGTCCGGGTGGCGCAGTTACTTTGGAGCTGGCTGATGGCCGACTGCTCGATCTTGGACGTGACAGCCAATGGAGCGCCGATGCGCCt < 6:167332/149‑1 (MQ=255) ggCATCCGGCGTGTACTTATCGAAGGTGACCGCCTGTTGGCCGGTGAGGAAGTGCTCACCGGTCCGGGTGGCGCAGTTACTTTGGAGCTGGCTGATGGCCGACTGCTCGATCTTGGACGTGACAGCCAATGGAGCGCCGATGTGCCTGa > 4:360899/1‑149 (MQ=255) ggCATCCGGCGTGTACTTATCGAAGGTGACCGCCTGTTGGCCGGTGAGGAAGTGCTCACCGGTCCGGGTGGCGCAGTTACTTTGGAGCTGGCTGATGGCCGACTGCTCGATCTTGGACGTGACAGCCAATGGAGCGCCGATGCGCCTGa > 8:63760/1‑149 (MQ=255) ggCATCCGGCGTGTACTTATCGAAGGTGACCGCCTGTTGGCCGGTGAGGAAGTGCTCACCGGTCCGGGTGGCGCAGTTACTTTGGAGCTGGCTGATGGCCGACTGCTCGACCTTGGACGTGACAGCCAATGGAGCGCCGATGCGCCTGa > 8:66399/1‑149 (MQ=255) gCATCCGGCGTGTACTTATCGAAGGTGACCGCCTGTTGGCCGGTGAGGAAGTGCTCACCGGTCCGGGTGGCGCAGTTACTTTGGAGCTGGCTGATGGCCGACTGCTCGATCTTGGACGTGACAGCCAATGGAGCGCCGATGCGCCTGAc < 3:242668/149‑1 (MQ=255) cATCCGGCGTGTACTTATCGAAGGTGACCGCCTGTTGGCCGGTGAGGAAGTGCTCACCGGTCCGGGTGGCGCAGTTACTTTGGAGCTGGCTGATGGCCGACTGCTCGATCTTGGACGTGACAGCCAATGGAGCGCCGATGCGCCTGACa > 6:129802/1‑149 (MQ=255) ggCGTGTACTTATCGAAGGTGACCGCCTGTTGGCCGGTGAGGAAGTGCTCACCGGTCCGGGTGGCGCAGTTACTTTGGAGCTGGCTGATGGCCGACTGCTCGATCTTGGACGTGACAGCCAATGGAGCGCCGATGCGCCTGACAGTAg > 6:406853/1‑148 (MQ=255) gtgtACTTATCGAAGGTGACCGCCTGTTGGCCGGTGAGGAAGTGCTCACCGGTCCGGGTGGCGCAGTTACTTTGGAGCTGGCTGATGGCCGACTGCTCGATCTTGGACGTGACAGCCAATGGAGCGCCGATGCGCCTGACAGTAGCAcc > 7:293521/1‑149 (MQ=255) 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cggaccGGTGAGCACTTCCTCACCGGCCCGGGTGGCGCAGTTACTTTGGAGCTGGCTGATGGCCGACTGCTCGATCTTGGACGTGACAGCCAATGGAGCGCCGATGCGCCTGACAGTAGCACCGACCTGAGCCAGGCGGCAGCCCAGGc > 2:433684/5‑149 (MQ=255) tGGCCGGTGAGGAAGTGCTCACCGGTCCGGGTGGCGCAGTTACTTTGGAGCTGGCTGATGGCCGACTGCTCGACCTTGGACGTGACAGCCAATGGAGCGCCGATGCGCCTGACAGTAGCACCGACCTGAGCCAGGCGGCAGCCCAGGcc < 7:66399/149‑1 (MQ=255) ggCCGGTGAGGAAGTGCTCACCGGTCCGGGTGGCGCAGTTACTTTGGAGCTGGCTGATGGCCGACTGCTCGATCTTGGACGTGACAGCCAATGGAGCGCCGATGCGCCTGACAGTAGCACCGACCTGAGCCAGGCGGCAGCCCAGGCcg > 5:77796/1‑149 (MQ=255) ggCCGGTGAGGAAGTGCTCACCGGTCCGGGTGGCGCAGTTACTTTGGAGCTGGCTGATGGCCGACTGCTCGATCTTGGACGTGACAGCCAATGGAGCGCCGATGCGCCTGACAGTAGCACCGACCTGAGCCAGGCGGCAGCCCAGGCcg > 4:112325/1‑149 (MQ=255) ggCCGGTGAGGAAGTGCTCACCGGTCCGGGTGGCGCAGTTACTTTGGAGCTGGCTGATGGCCGACTGCTCGATCTTGGACGTGACAGCCAATGGAGCGCCGATGCGCCTGACAGTAGCACCGACCTGAGCCAGGCGGCAGCCCAGGCcg > 5:23690/1‑149 (MQ=255) accGGTGAGCACTTCCTCACCGGTCCGGGTGGCGCAGTTACTTTGGAGCTGGCTGATGGCCGACTGCTCGATCTTGGACGTGACAGCCAATGGAGCGCCGATGCGCCTGACAGTAGCACCGACCTGAGCCAGGCGGCAGCCCAGGCcgc > 7:22453/2‑149 (MQ=255) ccGGTGAGCACTTCCTCACCGGCCCGGGTGGCGCAGTTACTTTGGAGCTGGCTGATGGCCGACTGCTCGATCTTGGACGTGACAGCCAATGGAGCGCCGATGCGCCTGACAGTAGCACCGACCTGAGCCAGGCGGCAGCCCAGGCcgcg < 1:433684/149‑1 (MQ=255) cGGTGAGGAAGTGCTCACCGGTCCGGGTGGCGCAGTTACTTTGGAGCTGGCTGATGGCCGACTGCTCGATCTTGGACGTGACAGCCAATGGAGCGCCGATGCGCCTGACAGTAGCACCGACCTGAGCCAGGCGGCAGCCCAGGCCgcgc > 5:76630/1‑149 (MQ=255) cGGTGAGGAAGTGCTCACCGGTCCGGGTGGCGCAGTTACTTTGGAGCTGGCTGATGGCCGACTGCTCGATCTTGGACGTGACAGCCAATGGAGCGCCGATGCGCCTGACAGTAGCACCGACCTGAGCCAGGCGGCAGCCCAGGCCgcgc < 6:367562/149‑1 (MQ=255) tGAGGAAGTGCTCACCGGTCCGGGTGGCGCAGTTACTTTGGAGCTGGCTGATGGCCGACTGCTCGATCTTGGACGTGACAGACAATGGAGCGCAGATGCGCCTGACAGTAGCACCGACCTGAGCCAGGCGGCAGCCCAGGCCGCGCCtt > 2:407273/1‑149 (MQ=255) ggtaGTGCTCACCGGTCCGTGTGGGGCAGTTACTTTGGAGCTGGCTTATGGCCGACGGCTCGATCTTGGACGTGACAGCCAATGGAGCGCCGATGCGCCTGACAGTAGCACCGACCTGAGTCAGGCGGCAGCCCAGGCCGCGCCTTCgg < 7:71368/146‑1 (MQ=255) ggAAGTGCTCACCGGTCCGGGTGGCGCAGTTACTTTGGAGCTGGCTGATGGCCGACTGCTCGATCTTGGACGTGACAGCCAATGGAGCGCCGATGCGCCTGACAGTAGCACCGACCTGAGCCAGGCGGCAGCCCAGGCCGCGCCTTCgg > 1:319260/1‑149 (MQ=255) ggAAGTGCTCACCGGTCCGGGTGGCGCAGTTACTTTGGAGCTGGCTGATGGCCGACTGCTCGATCTTGGACGTGACAGCCAATGGAGCGCCGATGCGCCTGACAGTAGCACCGACCTGAGCCAGGCGGCAGCCCAGGCCGCGCCTTCgg < 6:46418/149‑1 (MQ=255) gAAGTGCTCACCGGTCCGGGTGGCGCAGTTACTTTGGAGCTGGCTGATGGCCGACTGCTCGATCTTGGACGTGACAGCCAATGGAGCGCCGATGCGCCTGACAGTAGCACCGACCTGAGCCAGGCGGCAGCCCAGGCCGCGCCTTCGGt < 4:115010/149‑1 (MQ=255) | GGGAAGTACCCCATCGGGTCACACGGAGAGTCCAATGAGCAGCGTTGTAGCCATCGTCAAAAGCATTGTCGGCCAGGTTATTGCGGTATCCCCAGAGGGCATCCGGCGTGTACTTATCGAAGGTGACCGCCTGTTGGCCGGTGAGGAAGTGCTCACCGGTCCGGGTGGCGCAGTTACTTTGGAGCTGGCTGATGGCCGACTGCTCGATCTTGGACGTGACAGCCAATGGAGCGCCGATGCGCCTGACAGTAGCACCGACCTGAGCCAGGCGGCAGCCCAGGCCGCGCCTTCGGT > NC_002947/194461‑194754 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |