| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,445,386 | G→C | 5.8% | G337A (GGG→GCG) ‡ | PP_1263 → | fusaric acid resistance protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,445,386 | 0 | G | C | 5.8% | 296.6 / 4.4 | 96 | G337A (GGG→GCG) ‡ | PP_1263 | fusaric acid resistance protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (48/42); new base C (4/2); total (52/44) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.84e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.91e-01 | |||||||||||
Only 100 of 104 total aligned reads displayed.
ACCTGCCCGCCGAACTGGTCGGCCAGCGGCCTGATGTGGTTGCCAGCCGCTGGCAGGTGGCTGCCCAGGCGCGTGGCATCGACGTCGCTCACGCCGGCTTCTTCCCCAACGTCGACCTGGTC‑GGCAGCCTGGGCTTCATGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGGCGCAAGTTCAACTACAACGTCGGCCCGGCCATCAGCTTGCCGATCTTTGACGGTGGGCGCCTGCGCTCAGAACTGGGCGTGGCCTCGGCGGGGTATGACGTGGCGGTGGCCCGCTACAAC > NC_002947/1445239‑1445534 | aCCTGCCCGCCGAACTGGTCGGCCAGCGGCCTGATGTGGTTGCCAGCCGCTGGCAGGTGGCTGCCCAGGCGCGTGGCATCGACGTCGCTCACGCCGGCTTCTTCCCCAACGTCGACCTGGTC‑GGCAGCCTGGGCTTCATGGCCACCggg < 4:148625/149‑1 (MQ=255) ccTGCCCGCCTAACTGGTCGGCCAGCGGCCTGATGTGGTTGCCAGCCGCTGGCAGGTGGCTGCCCAGGCGCGTGGCATCGACGTCGCTCACGCCGGCTTCTTCCCCAACGTCGACCTGGTC‑GGCAGCCTGGGCTTCATGGCCACCgggg < 8:284375/149‑1 (MQ=255) ccTGCCCGCCGAACTGGGCGGCCAGCGGCCTGATGTGGTTGCCAGCCGCTGGCAGGGGGCTGCCCAGGCGCGTGGCATCGACGTCGCTCACGCCGGCTTCTTCCCCAACGTCGACCTGGTC‑GGCAGCCTGGGCTTCATGGCCACCgggg < 7:58230/149‑1 (MQ=255) cccGCCGAACTGGTCGGCCAGCGGCCTGATGTGGTTGCCAGCCGCTGGCAGGTGGCTGCCCAGGCGCGTGGCATCGACGTCGCTCACGCCGGCTTCTTCCCCAACGTCGACCTGGTC‑GGCAGCCTGGGCTTCATGGCCACCGGGGGTgg < 7:85955/149‑1 (MQ=255) cgccgAACTGGTCGGCCAGCGGCCTGATGTGGTTGCCAGCCGCTGGCAGGTGGCTGCCCAGGCGCGTGGCATCGACGTCGCTCACGCCGGCTTCTTCCCCAACGTCGACCTGGTC‑GGCAGCCTGGGCTTCATGGCCACCGGGGGTGGcc > 6:120700/1‑149 (MQ=255) gAACTGGTCGGCCAGCGGCCTGATGTGGTTGCCAGCCGCTGGCAGGTGGCTGCCCAGGCGCGTGGCATCGACGTCGCTCACGCCGGCTTCTTCCCCAACGTCGACCTGGTC‑GGCAGCCTGGGCTTCATGGCCACCGGGGGTGGCCCGCt < 6:327072/149‑1 (MQ=255) gTCGGCCAGCGGCCTGATGTGGTTGCCAGCCGCTGGCAGGTGGCTGCCCAGGCGCGTGGCATCGACGTCGCTCACGCCGGCTTCTTCCCCAACGTCGACCTGGTC‑GGCAGCCTGGGCTTCATGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTGGAAtt > 3:209978/1‑149 (MQ=255) cGGCCAGCGGCCTGATGTGGTTGCCAGCCGCTGGCAGGTGGCTGCCCAGGCGCGTGGCATCGACGTCGCTCACGCCGGCTTCTTCCCCAACGTCGACCTGGTC‑GGCAGCCTGGGCTTCATGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTcc < 1:385619/149‑1 (MQ=255) ggCCAGCGGCCTGATGTGGTTGCCAGCCGCTGGCAGGTGGCTGCCCAGGCGCGTGGCATCGACGTCGCTCACGCCGGCTTCTTCCCCAACGTCGACCTGGTC‑GGCAGCCTGGGCTTCATGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTCCt < 1:233042/149‑1 (MQ=255) aGCGGCCTGATGTGGTTGCCAGCCGCTGGCAGGTGGCTGCCCAGGCGCGTGGCATCGACGTCGCTCACGCCGGCTTCTTCCCCAACGTCGACCTGGTC‑GGCAGCCTGGGCTTCATGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGAcc < 8:223940/149‑1 (MQ=255) gCCTGATGTGGTTGCCAGCCGCTGGCAGGTGGCTGCCCAGGCGCGTGGCATCGACGTCGCTCACGCCGGCTTCTTCCCCAACGTCGACCTGGTC‑GGCAGCCTGGGCTTCATGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGgc < 1:191509/149‑1 (MQ=255) gCCTGATGTGGTTGCCAGCCGCTGGCAGGTGGCTGCCCAGGCGCGTGGCATCGACGTCGCTCACGCCGGCTTCTTCCCCAACGTCGACCTGGTC‑GGCAGCCTGGGCTTCATGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGgc < 6:243067/149‑1 (MQ=255) gCCTGATGTGGTTGCCAGCCGCTGGCAGGTGGCTGCCCAGGCGCGTGGCATCGACGTCGCTCACGCCGGCTTCTTCCCCAACGTCGACCTGGTC‑GGCAGCCTGGGCTTCATGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGgc < 7:180581/149‑1 (MQ=255) gCCTGATGTGGTTGCCAGCCGCTGGCAGGTGGCTGCCCAGGCGCGTGGCATCGACGTCGCTCACGCCGGCTTCTTCCCCAACGTCGACCTGGTC‑GGCAGCCTGGGCTTCATGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGgc < 2:124103/149‑1 (MQ=255) tGATGTGGTTGCCAGCCGCTGGCAGGTGGCTGCCCAGGCGCGTGGCATCGACGTCGCTCACGCCGGCTTCTTCCCCAACGTCGACCTGGTC‑GGCAGCCTGGGCTTCATGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGgcgc > 6:371950/1‑148 (MQ=255) tGATGTGGTTGCCAGCCGCTGGCAGGTGGCTGCCCAGGCGCGTGGCATCGACGTCGCTCACGCCGGCTTCTTCCCCAACGTCGACCTGGAC‑GGCAGCCTGGGCTTCATGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGgcgc > 3:125985/1‑148 (MQ=255) gATGTGGTTGCCAGCCGCTGGCAGGTGGCTGCCCAGGCGCGTGGCATCGACGTCGCTCACGCCGGCTTCTTCCCCAACGTCGACCTGGTC‑GGCAGCCTGGGCTTCATGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGgcgc > 3:171768/1‑147 (MQ=255) aTGTGGTTGCCAGCCGCTGGCAGGTGGCTGCCCAGGCGCGTGGCATCGACGTCGCTCACGCCGGCTTCTTCCCCAACGTCGACCTGGTC‑GGCAGCCTGGGCTTCATGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGGCGCAAg > 2:148076/1‑149 (MQ=255) aTGTGGTTGCCAGCCGCTGGCAGGTGGCTGCCCAGGCGCGTGGCATCGACGTCGCTCACGCCGGCTTCTTCCCCAACGTCGACCTGGTC‑GGCAGCCTGGGCTTCATGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGGCGCAAg < 7:140495/149‑1 (MQ=255) aTGTGGTTGCCAGCCGCTGGCAGGTGGCTGCCCAGGCGCGTGGCATCGACGTCGCTCACGCCGGCTTCTTCCCCAACGTCGACCTGGTC‑GGCAGCCTGGGCTTCATGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGGCGCAAg < 5:288095/149‑1 (MQ=255) gggggggCCAGCCGCGGGCAGGTGGCGGCCCAGTCGCGGGGCATCGACGTCGCTCCCGCCGGCTTCTTCCCCCCCGTCGACCTGGTC‑GGCAGCCTGGGCTTCATGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGGCGCAAGtt < 8:296329/143‑1 (MQ=255) ggTTGCCAGCCGCTGGCAGGTGGCTGCCCAGGCGCGTGGCATCGACGTCGCTCACGCCGGCTTCTTCCCCAACGTCGACCTGGTC‑GGCAGCCTGGGCTTCATGGCCACCgggg < 1:167190/113‑1 (MQ=255) ggTTGCCAGCCGCTGGCAGGTGGCTGCCCAGGCGCGTGGCATCGACGTCGCTCACGCCGGCTTCTTCCCCAACGTCGACCTGGTC‑GGCAGCCTGGGCTTCATGGCCACCgggg > 2:167190/1‑113 (MQ=255) gTTGCCAGCCGCTGGCAGGTGGCTGCCCAGGCGCGTGGCATCGACGTCGCTCACGCCGGCTTCTTCCCCAACGTCGACCTGGTC‑GGCAGCCTGGGCTTCATGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGGCGCAAGTTCaa < 3:399655/149‑1 (MQ=255) ttGCCAGCCGCTGGCAGGTGGCTGCCCAGGCGCGTGGCATCGACGTCGCTCACGCCGGCTTCTTCCCCAACGTCGACCTGGTC‑GGCAGCCTGGGCTTCATGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGGCGCAAGTTCAAc < 5:371950/149‑1 (MQ=255) gCCAGCCGCTGGCAGGTGGCTGCCCAGGCGCGTGGCATCGACGTCGCTCACGCCGGCTTCTTCCCCAACGTCGACCTGGTC‑GGCAGCCTGGGCTTCATGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTGGAAt < 2:262376/124‑1 (MQ=255) gCCAGCCGCTGGCAGGTGGCTGCCCAGGCGCGTGGCATCGACGTCGCTCACGCCGGCTTCTTCCCCAACGTCGACCTGGTC‑GGCAGCCTGGGCTTCATGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTGGAAt > 1:262376/1‑124 (MQ=255) cAGCCGCTGGCAGGTGGCTGCCCAGGCGCGTGGCATCGACGTCGCTCACGCCGGCTTCTTCCCCAACGTCGACCTGGTC‑GGCAGCCTGGGCTTCATGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGGCGCAAGTTCAACTAc > 6:377761/1‑148 (MQ=255) aGCCGCTGGCAGGTGGCTGCCCAGGCGCGTGGCATCGACGTCGCTCACGCCGGCTTCTTCCCCAACGTCGACCTGGTC‑GGCAGCCTGGGCTTCATGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGGCGCAAGTTCAACTACaa > 8:239585/1‑149 (MQ=255) gCCGCTGGCAGGTGGCTGCCCAGGCGCGTGGCATCGACGTCGCTCACGCCGGCTTCTTCCCCAACGTCGACCTGGTC‑GGCAGCCTGGGCTTCATGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGGCGCAAGTTCAACTACAAc < 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gTGGCTGCCCAGGCGCGTGGCATCGACGTCGCTCACGCCGGCTTCTTCCCCAACGTCGACCTGGTC‑GGCAGCCTGGGCTTCATGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGGCGCAAGTTCAACTACAACGTcggcccggc > 3:38056/1‑149 (MQ=255) gTGGCTGCCCAGGCGCGTGGCATCGACGTCGCTCACGCCGGCTTCTTCCCCAACGTCGACCTGGTC‑GGCAGCCTGGGCTTCATGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGGCGCAAGTTCAACTACAACGTcggcccggc > 7:379196/1‑149 (MQ=255) tGCCCAGGCGCGTGGCATCGACGTCGCTCACGCCGGCTTCTTCCCCAACGTCGACCTGGTC‑GGCAGCCTGGGCTTCAGGGCCACCCCCGGTGGcc > 1:221166/1‑95 (MQ=255) tGCCCAGGCGCGTGGCATCGACGTCGCTCACGCCGGCTTCTTCCCCAACGTCGACCTGGTC‑GGCAGCCTGGGCTTCAGGGCCACCCCCGGTGGcc < 2:221166/95‑1 (MQ=255) gccAGGCGCGTGGGTTCGTCGTCGCTCAGGCCGGGTTCTTGCCCAACGTCGTCCTGGTC‑GGCAGCGTGGGCTTGATGGCCACCGGTGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGGCGCAAGTTCAACTACAACGTCGGCCCTGCGATCa < 4:125985/146‑1 (MQ=255) cccAGGCGCGTGGCATCGACGTCGCTCACGCCGGCTTCTTCCCCAACGTCGACCTGGTC‑GGCAGCCTGGGCTTCATGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGGCGCAAGTTCAACTACAACGTCGGCCCGGCCATCAg < 8:379196/148‑1 (MQ=255) cccAGGCGCGTGGCATCGACGTCGCTCACGCCGGCTTCTTCCCCAACGTCGACCTGGTC‑GGCAGCCTGGGCTTCATGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGGCGCAAGTTCAACTACAACGTCGGCCCGGCCATCAGc > 6:296708/1‑149 (MQ=255) ccAGGCGCGTGGCATCGACGTCGCTCACGCCGGCTTCTTCCCCAACGTCGACCTGGTCTGGCAGCCTGGGCTTCATGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGGCGCAAGTTCAACTACAACGTCGGCCCGGCCATCAGc > 1:343285/1‑149 (MQ=255) ccAGGCGCGTGGCATCGACGTCGCTCACGCCGGCTTCTTCCCCAACGTCGACCTGGTC‑GGCAGCCTGGGCTTCATGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTCCt < 5:250839/105‑1 (MQ=255) ccAGGCGCGTGGCATCGACGTCGCTCACGCCGGCTTCTTCCCCAACGTCGACCTGGTC‑GGCAGCCTGGGCTTCATGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTCCt > 6:250839/1‑105 (MQ=255) aGGCGCGTGGCATCGACGTCGCTCACGCCGGCTTCTTCCCCAACGTCGACCTGGTC‑GGCAGCCTGGGCTTCATGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGACTGGGCGCAAGTTCAACTACAACGTCGGCCCGGCCATCAGCTTg > 4:321478/1‑149 (MQ=255) ggCGCGTGGCATCGACGTCGCTCACGCCGGCTTCTTCCCCAACGTCGACCTGGTC‑GGCAGCCTGGGCTTCATGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGGCGCAAGTTCAACTACAACGTCGGCCCGGCCATCAGCTTGc < 1:409989/149‑1 (MQ=255) tGGCATCGACGTCGCTCACGCCGGCTTCTTCCCCAACGTCGACCTGGTC‑GGCAGCCTGGGCTTCATGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGGCGCAAGTTCAACTACAACGTCGGCCCGGCCATCAGCTTGCCGATCt < 5:296708/149‑1 (MQ=255) gCATCGACGTCGCTCACGCCGGCTTCTTCCCCAACGTCGACCTGGTC‑GGCAGCCTGGGCTTCATGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGGCGCAAGTTCAACTACAACGTCGGCCCGGCCATCAGCTTGCCGATCttt < 5:4140/149‑1 (MQ=255) cATCGACGTCGCTCACGCCGGCTTCTTCCCCAACGTCGACCTGGTC‑GGCAGCCTGGGCTTCATGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGGCGCAAGTTCAACTACAACGTCGGCCCGGCCATCAGCTTGCCGATCttt > 8:245368/1‑148 (MQ=255) tCGACGTCGCTCACGCCGGCTTCTTCCCCAACGTCGACCTGGTC‑GGCAGCCTGGGCTTCATGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGGCGCAAGTTCAACTACAACGTCGGCCCGGCCATCAGCTTGCCGATCTTTGag > 6:331466/1‑148 (MQ=255) tCGACGTCGCTCACGCCGGCTTCTTCCCCAACGTCGACCTGGTC‑GGCAGCCTGGGCTTCATGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGGCGCAAGTTCAACTACAACGTCGGCCCGGCCATCAGCTTGCCGATCTTTGAc > 3:366634/1‑149 (MQ=255) 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tcCCCAACGTCGACCTGGTC‑GGCAGCCTGGGCTTCATGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGGCGCAAGTTCAACTACAACGTCGGCCCGGCCATCAGCTTGCCGATCTTTGACGGTGGGCGCCTGCGCTCAGAACTg > 5:206378/1‑149 (MQ=255) ccccAACGTCGACCTGGTC‑GGCAGCCTGGGCTTCATGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGGCGCAAGTTCAACTACAACGTCGGCCCGGCCATCAGCTTGCCGATCTTTGACGGTGGGCGCCTGCGCTCAGAACt < 4:209978/147‑1 (MQ=255) ccccAACGTCGACCTGGTC‑GGCAGCCTGGGCTTCATGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGGCGCAAGTTCAACTACAACGTCGGCCCGGCCATCAGCTTGCCGATCTTTGACGGTGGGCGCCTGCGCTCAGAACTgg > 6:204522/1‑149 (MQ=255) cccAACGTCGACCTGGTC‑GGCAGCCTGGGCTTCATGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGGCGCAAGTTCAACTACAACGTCGGCCCGGCCATCAGCTTGCCGATCTTTGCCGGTGGGCGCCTGCGCTCAGGACTggg > 1:344992/1‑149 (MQ=255) cccAACGTCGACCTGGTC‑GGCAGCCTGGGCTTCATGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGGCGCAAGTTCAACTACAACGTCGGCCCGGCCATCAGCTTGCCGATCTTTGACGGTGGGCGCCTGCGCTCAGAACTggg < 5:120700/149‑1 (MQ=255) cccAACGTCGACCTGGTC‑GGCAGCCTGGGCTTCATGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGGCGCAAGTTCAACTACAACGTCGGCCCGGCCATCAGCTTGCCGATCTTTGACGGTGGGCGCCTGCGCTCAGAACTggg > 1:425016/1‑149 (MQ=255) ccAACGTCGACCTGGTC‑GGCAGCCTGGGCTTCATGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGGCGCAAGTTCAACTACAACGTCGGCCCGGCCATCAGCTTGCCGATCTTTGACGGTGGGCGCCTGCGCTCAGAACTGGGc > 1:215730/1‑149 (MQ=255) cAACGTCGACCTGGTC‑GGCAGCCTGGGCTTCATGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGGCGCAAGTTCAACTACAACGTCGGCCCGGCCATCCGCTTGCCGATCTTTGACGGTGGGCGCCTGCGCGCAGAACTGGGCg > 4:159150/1‑149 (MQ=255) cAACGTCGACCTGGTC‑GGCAGCCTGGGCTTCATGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGGCGCAAGTTCAACTACAACGTCGGCCCGGCCATCAGCTTGCCGATCTTTGACGGTGGGCGCCTGCGCTCAGAACTGGGCg > 3:416337/1‑149 (MQ=255) cGTCGACCTGGTC‑GGCAGCCTGGGCTTCATGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGGCGCAAGTTCAACTACAACGTCGGCCCGGCCATCAGCTTGCCGATCTTTGACGGTGGGCGCCTGCGCTCAGAACTGGGCGTgg > 4:187580/1‑149 (MQ=255) 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tC‑GGCAGCCTGGGCTTCATGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGGCGCAAGTTCAACTACAACGTCGGCCCGGCCATCAGCTTGCCGATCTTTGACGGTGGGCGCCTGCGCTCAGAACTGGGCGTGGCCTCGGCgggg < 4:38056/149‑1 (MQ=255) cAGCCTGGGCTTCATGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGGCGCAAGTTCAACTACAACGTCGGCCCGGCCATCAGCTTGCCGATCTTTGACGGTGGGCGCCTGCGCTCAGAACTGGGCGTGGCCTCGGCGGGGTAt > 5:319202/1‑148 (MQ=255) aGCCTGGGCTTCATGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGGCGCAAGTTCAACTACAACGTcg < 7:102430/73‑1 (MQ=255) aGCCTGGGCTTCATGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGGCGCAAGTTCAACTACAACGTcg > 8:102430/1‑73 (MQ=255) ccTGGGCTTCATGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGGCGCAAGTTCAACTACAACGTCGGCCCGGCCATCAGCTTGCCGATCTTTGACGGTGGGCGCCTGCGCTCAGAACTGGGCGTGGCCTCGGCGGGGTATGACg > 4:244259/1‑149 (MQ=255) ccTGGGCTTCATGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGGCGCAAGTTCAACTACAACGTCGGCCCGGCCATCAGCTTGCCGATCTTTGACGGTGGGCGCCTGCGCTCAGAACTGGGCGTGGCCTCGGCGGGGTATGACg > 5:194313/1‑149 (MQ=255) ccTGGGCTTCATGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGGCGCAAGTTCAACTACAACGTCGGCCCGGCCATCAGCTTGCCGATCTTTGACGGTGGGCGCCTGCGCTCAGAACTGGGCGTGGCCTCGGCGGGGTATGACg > 7:396735/1‑149 (MQ=255) ggCTTCATGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGGCGCAAGTTCAACTACAACGTCGGCCCGGCCATCAGCTTGCCGATCTTTGACGGTGGGCGCCTGCGCTCAGAACTGGGCGTGGCCTCGGCGGGGTATGACGTgg < 5:204522/148‑1 (MQ=255) ggCTTCATGGCCACCGGGGGGGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGGCGCAAGTTCAACTACAACGTCGGCCCGGCCATCAGCTTGCCGATCTTTGACGGTGGGCGCCTGCGCTCAGAACTGGGCGTGGCCTCGGCGGGGTATGACGTg < 5:52448/147‑1 (MQ=255) ttCATGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGGCGCAAGTTCAACTACAACGTCGGCCCGGCCATCAGCTTGCCGATCTTTGACGGTGGGCGCCTGCGCTCAGAACTGGGCGTGGCCTCGGCGGGGTATGACGTGGCGGt > 2:362259/1‑149 (MQ=255) cagcgggCCACCCCCGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGGCGCAAGTTCAACTACAACGTCGGCCCGGCCATCAGCTTGCCGATCTTTGACGGTGGGCGCCTGCGCTCAGAACTGGGCGTGGCCTCGGCGGGGTATGACGTGGCGGt > 1:49704/6‑149 (MQ=255) tCATGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGGCGCAAGTTCAACTACAACGTCGGCCCGGCCATCAGCTTGCCGATCTTTGACGGTGGGCGCCTGCGCTCAGAACTGGGCGTGGCCTCGGCGGGGTATGACGTGGCGGTg > 6:11363/1‑149 (MQ=255) tCATGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGGCGCAAGTTCAACTACAACGTCGGCCCGGCCATCAGCTTGCCGATCTTTGACGGTGGGCGCCTGCGCTCAGAACTGGGCGTGGCCTCGGCGGGGTATGACGTGGCGGTg > 7:313225/1‑149 (MQ=255) agcgggCCACCCCCGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGGCGCAAGTTCAACTACAACGTCGGCCCGGCCATCAGCTTGCCGATCTTTGACGGTGGGCGCCTGCGCTc > 4:64416/5‑109 (MQ=255) agcgggCCACCCCCGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGGCGCAAGTTCAACTACAACGTCGGCCCGGCCATCAGCTTGCCGATCTTTGACGGTGGGCGCCTGCGCTc < 3:64416/105‑1 (MQ=255) gcgggCCACCCCCGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGGCGCAAGTTCAACTACAACGTCGGCCCGGCCATCAGCTTGCCGATCTTTGACGGTGGGCGCCTGCGCTCAGAACTGGGCGTGGCCTCGGCGGGGTATGACGTGGCGgggg > 8:378677/4‑149 (MQ=255) tGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGGCGCAAGTTCAACTACAACGTCGGCCCGGCCATCAGCTTGCCGATCTTTGACGGTGGGCGCCTGCGCTCAGAACTGGGCGTGGCCTCGGCGGGGTATGACGTGGCGGTGGcc > 8:363028/1‑149 (MQ=255) ccACCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGGCGCAAGTTCAACTACAACGTCGGCCCGGCCATCAGCTTGCCGATCTTTGACGGTGGGCGCCTGCGCTCAGAACTGGGCGTGGCCTCGGCGGGGTATGACGTGGCGGTGGCCCGc < 7:134127/149‑1 (MQ=255) cACCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGGCGCAAGTTCAACTACAACGTCGGCCCGGCCATCAGCTTGCCGATCTTTGACGGTGGGCGCCTGCGCTCAGAACTGGGCGTGGGCTCGGCGGGGTATGACGTGGCGGTGGCCCGCt < 4:4015/149‑1 (MQ=255) ccGGGGGTGGCCCGGTGGAATTCCTGACCGGGCGCTAGGTCAACTTCATCGTCGGCCCGGCGATCAGCTTGCCGATCTTTGACGGTGGGCGCCTGCGCTCAGAAGTGGGCGTGGCCTGGGCGGGGTATGACGTGGCGGTGGCCCGCTAc < 1:74336/149‑1 (MQ=255) gggggTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGGCGCAAGTTCAACTACAACGTCGGCCCGGCCATCAGCTTGCCGATCTTTGACGGTGGGCGCCTGCGCTCAGAACTGGGCGTGGCCTCGGCGGGGTATGACGTGGCGGTGGCCCGCTACaa < 5:11363/149‑1 (MQ=255) ggggTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGGCGCAAGTTCAACTACAACGTCGGCCCGGCCATCAGCTTGCCGATCTTTGACGGTGGGCGCCTGCGCTCAGAACTGGGCGTGGCCTCGGCGGGGTATGACGTGGCGGTGGCCCGCTACAAc < 4:416337/149‑1 (MQ=255) ggggTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGGCGCAAGTTCAACTACAACGTCGGCCCGGCCATCAGCTTGCCGATCTTTGACGGTGGGCGCCTGCGCTCAGAACTGGGCGTGGCCTCGGCGGGGTATGACGTGGCGGTGGCCCGCTACAAc < 3:81781/149‑1 (MQ=255) | ACCTGCCCGCCGAACTGGTCGGCCAGCGGCCTGATGTGGTTGCCAGCCGCTGGCAGGTGGCTGCCCAGGCGCGTGGCATCGACGTCGCTCACGCCGGCTTCTTCCCCAACGTCGACCTGGTC‑GGCAGCCTGGGCTTCATGGCCACCGGGGGTGGCCCGCTGGAATTCCTGACCGGGCGCAAGTTCAACTACAACGTCGGCCCGGCCATCAGCTTGCCGATCTTTGACGGTGGGCGCCTGCGCTCAGAACTGGGCGTGGCCTCGGCGGGGTATGACGTGGCGGTGGCCCGCTACAAC > NC_002947/1445239‑1445534 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |