Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_002947 | 1,520,991 | 0 | T | A | 5.7% | 303.2 / 3.6 | 97 | L83* (TTG→TAG) | murD | UDP‑N‑acetylmuramoylalanine‑‑D‑glutamate ligase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (47/44); new base A (2/4); total (49/48) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.36e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
CCTTTGCGGTCGCCGATACCCGCGAGCAGCCGCCGGAACTGGAAACCCTGCGCCGTGATTACCCGCAGGTGGAAGTGCGCTGTGGTGAACTGGACGTGGACTTCCTGTGCCGCGCCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTGGC‑CACGCCGGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTGTTTGCTCGCCATGCCAAGGCGCCGATCGTTGCCATCAGTGGTTCCAACGCCAAGAGCACCGTCACGACGCTGGTCGGTGA > NC_002947/1520844‑1521135 | ccTTTGCGGTCGCCGATACCTGCGAGCAGCCGCCGGAACTGGAAACCCTGCGCCGTGATTACCCGCAGGTGGAAGTGGGCTGTGGTGAACTGGACGTGGACTTCCTGTGCCGCGCCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTg < 1:73140/149‑1 (MQ=255) ccTTTGCGGTCGCCGATACCCGCGAGCAGCCGCCGGAACTGGAAACCCTGCGCCGTGATTACCCGCAGGTGGAAGTGCGCTGTGGTGAACTGGACGTGGACTTCCTGTGCCGCGCCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTg < 6:27799/149‑1 (MQ=255) cTTTGCGGTCGCCGATACCCGCGAGCAGCCGCCGGAACTGGAAACCCTGCGCCGTGATTACCCGCAGGTGGAAGTGCGCTGTGGTGAACTGGACGTGGACTTCCTGTGCTGCGCCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTgg > 1:157667/1‑149 (MQ=255) cTTTGCGGTCGCCGATACCCGCGAGCAGCCGCCGGAACTGGAAACCCTGCGCCGTGATTACCCGCAGGTGGAAGTGCGCTGTGGTGAACTGGACGTGGACTTCCTGTGCCGCGCCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTgg < 8:402312/149‑1 (MQ=255) cGCCGATACCCGCGAGCAGCCGCCGGAACTGGAAACCCTGCGCCGTGATTCCCCGCAGGTGGAAGTGCGCTGTGGTGAACTGGACGTGGACTTCCTGTGCCGCGCCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCGTGGCCAAGGC‑CAGGCCgg < 7:291007/149‑1 (MQ=255) gCCGATACCCGCGAGCAGCCGCCGGAACTGGAAACCCTGCGCCGTGATTACCCGCAGGTGGAAGTGCGCTGTGGTGAACTGGACGTGGACTTCCTGTGCCGCGCCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTGGC‑CACGCCGGc > 1:74207/1‑149 (MQ=255) ccGATACCCGCGAGCAGCCGCCGGAACTGGAAACCCTGCGCCGTGATTACCCGCAGGTGGAAGTGCGCTGTGGTGAACTGGACGTGGACTTCCTGTGCCGCGCCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCAAGGC‑CAGGCCgggg < 6:376312/149‑3 (MQ=255) gATACCCGCGAGCAGCCGCCGGAACTGGAAACCCTGCGCCGTGATTACCCGCAGGTGGAAGTGCGCTGTGGTGAACTGGACGTGGACTTCCTGTGCCGCGCCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTGGC‑CACGCCGGCCtt < 7:256895/149‑1 (MQ=255) aCCCGCGAGCAGCCGCCGGAACTGGAAACCCTGCGCCGTGATTACCCGCAGGTGGAAGTGCGCTGTGGTGAACTGGACGTGGACTTCCTGTGCCGCGCCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCGTGGCCAAGGC‑CAGGCCggggctcac < 6:63956/149‑8 (MQ=255) cccGCGAGCAGCCGCCGGAACTGGAAACCCTGCGCCGTGATTACCCGCAGGTGGAAGTGCGCTGTGGTGAACTGGACGTGGACTTCCTGTGCCGCGCCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTGGC‑CACGCCGGCCTTgca < 1:420782/148‑1 (MQ=255) ccGCGAGCAGCCGCCGGAACTGGAAACCCTGCGCCGTGATTACCCGCAGGTGGAAGTGCGCTGTGGTGAACTGGACGTGGACTTCCTGTGCCGCGCCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTg < 2:253812/130‑1 (MQ=255) ccGCGAGCAGCCGCCGGAACTGGAAACCCTGCGCCGTGATTACCCGCAGGTGGAAGTGCGCTGTGGTGAACTGGACGTGGACTTCCTGTGCCGCGCCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTg > 1:253812/1‑130 (MQ=255) ccGCGAGCAGCCGCCGGAACTGGAAACCCTGCGCCGTGATTACCCGCAGGTGGAAGTGCGCTGTGGTGAACTGGACGTGGACTTCCTGTGCCGCGCCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTGGC‑CACGCCGGCCTTgcag > 8:303799/1‑148 (MQ=255) cgcgAGCAGCCGCCGGAACTGGAAACCCTGCGCCGTGATTACCCGCAGGTGGAAGTGCGCTGTGGTGAACTGGACGTGGACTTCCTGTGCTGCGCCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTGGC‑CACGCCGGCCTTgcagca < 2:157667/149‑1 (MQ=255) cgcgAGCAGCCGCCGGAACTGGAAACCCTGCGCCGTGATTACCCGCAGGTGGAAGTGCGCTGTGGTGAACTGGACGTGGACTTCCTGTGCCGCGCCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCtt > 2:256190/1‑128 (MQ=255) cgcgAGCAGCCGCCGGAACTGGAAACCCTGCGCCGTGATTACCCGCAGGTGGAAGTGCGCTGTGGTGAACTGGACGTGGACTTCCTGTGCCGCGCCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCtt < 1:256190/128‑1 (MQ=255) cgcgAGCAGCCGCCGGAACTGGAAACCCTGCGCCGTGATTACCCGCAGGTGGAAGTGCGCTGTGGTGAACTGGACGTGGACTTCCTGTGCCGCGCCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTGGC‑CACTCCGGCCTTgcag > 8:168158/1‑147 (MQ=255) gcgAGCAGCCGCCGGAACTGGAAACCCTGCGCCGTGATTACCCGCAGGTGGAAGTGCGCTGTGGTGAACTGGACGTGGACTTCCTGTGCCGCGCCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTGGC‑CACGCCGGCCTTGcagcag < 5:103416/149‑1 (MQ=255) agcCGCCGGAACTGGAAACCCTGCGCCGTGATTACCCGCAGGTGGAAGTGCGCTCTGGTGAACTGGACGTGGACTTCCTGTGCCGCGCCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTGGC‑CACGCCCGCCTTCCAGCAGCCTGcc > 4:3040/1‑149 (MQ=255) gccgccGGAACTGGAAACCCTGCGCCGTGATTACCCGCAGGTGGAAGTGCGCTGTGGTGAACTGGACGTGGACTTCCTGTGCCGCGCCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTGGC‑CACGCCGGCCTTGCAGCAGGCTGCcg > 5:198227/1‑149 (MQ=255) 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tGCGCCGTGATTACACGCAGGTGGAAGTGCGCTGTGGTGAACTGGACGTGGACTTCCTGTGCCGCGCCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTGGC‑CACGCCGGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCt > 6:216104/1‑149 (MQ=255) gcCGTGATTACCCGCAGGTGGAAGTGCGCTGTGGTGAACTGGACGTGGACTTCCTGTGCCGCGCCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTGGC‑CACGCCGGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGc < 7:303799/149‑1 (MQ=255) gcCGTGATTACCCGCAGGTGGAAGTGCGCTGTGGTGAACTGGACGTGGACTTCCTGTGCCGCGCCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTGGC‑CACGCCGGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGc < 2:294102/149‑1 (MQ=255) cGTGATTACCCGCAGGTGGAAGTGCGCTGTGGTGAACTGGACGTGGACTTCCTGTGCCGCGCCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTGGC‑CACGCCGGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGa < 5:307732/149‑1 (MQ=255) gTGATTACCCGCAGGTGGAAGTGCGCTGTGGTGAACTGGACGTGGACTTCCTGTGCCGCGCCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTGGC‑CACGCCGGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGAc < 3:87527/149‑1 (MQ=255) 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aCGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTGGCGCACGCCGGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTGTTTGCTCGCCATGCCAAGGCGCCGATCGTTGCCATCAGTGGTTCCAACGcc > 1:59675/1‑147 (MQ=255) aCGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTGGC‑CACGCCGGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTGTTTGCTCGCCATGCCAAGGCGCCGATCGTTGCCATCAGTGGTTCCAACGcc > 5:260524/1‑146 (MQ=255) cGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTGGC‑CACGCCGGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTGTTTGCTCGCCATGCCAAGGCGCCGATCGTTGCCATCAGTGGTTCCAACGCCAaga < 1:17480/149‑1 (MQ=255) gTACGACAGCCCCGTCATGGCCTACGC‑CACGCCGGCCTTGAAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATACAGCTGTTTGCTCGCCATGCCAAGGCGCCGATCGTTTCCATCAGTGGTTCCAACGCCAAGAGCAcc > 8:23610/1‑148 (MQ=255) tGAGCCCCGGCCTGGCCTTGGC‑CACGCCGGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTGTTTGCTCGCCATGCCAAGGCGCCGATCGTTGCCATCAGTGGTTCCAACGCCAAGAGCACCGTCacg > 7:340816/1‑149 (MQ=255) tGAGCCCCGGCCTGGCCTTGGC‑CACGCCGGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTGTTTGCTCGCCATGCCAAGGCGCCGATCGTTGCCATCAGTGGTTCCAACGCCAAGAGCACCGTCac > 3:292722/1‑148 (MQ=255) gAGCCCCGGCCTGGCCTTGGC‑CACGCCGGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTGTTTGCTCGCCATGCCAAGGCGCCGATCGTTGCCATCAGTGGTTCCAACGCCAAGAGCACCGTCa < 7:74129/146‑1 (MQ=255) gAGCCCCGGCCTGGCCTTGGC‑CACGCCGGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTGTTTGCTCGCCATGCCAAGGCGCCGATCGTTGCCATCAGTGGTTCCAACGCCAAGAGCACCGTCa > 8:74129/1‑146 (MQ=255) ccccGGCCTGGCCTTGGC‑CACGCCGGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTGTTTGCTCGCCATGCCAAGGCGCCGATCGTTGCCATCAGTGGTTCCAACg > 7:246847/1‑128 (MQ=255) ccccGGCCTGGCCTTGGC‑CACGCCGGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTGTTTGCTCGCCATGCCAAGGCGCCGATCGTTGCCATCAGTGGTTCCAACg < 8:246847/128‑1 (MQ=255) cccGGCCTGGCCTTGGC‑CACGCCGGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTGTTTGCTCGCCATGCCAAGGCGCCGATCGTTGCCATCAGTGGTTCCAACGCCAAGAGCACCGTCACGACGCt > 6:192499/1‑149 (MQ=255) ccGGCCTGGCCTTGGC‑CACGCCGGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTGTTTGCTCGCCATGCCAAGGCGCCGATCGTTGCCATCAGTGGTTCCAACGCCAAGAGCACCGTCACGACGCTg > 6:306706/1‑149 (MQ=255) ccGGCCTGGCCTTGGC‑CACGCCGGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTGTTTGCTCGCCATGCCAAGGCGCCGATCGTTGCCATCAGTGGTTCCAACGCCAAGAGCACCGTCACGACGCTg > 2:218850/1‑149 (MQ=255) cGGCGTGGCCAAGGC‑CAGGCCGGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTGTTTGCTCGCCATGCCAAGGCGCCGATCGTTGCCATCAGTGGTTCCAACGCCAAGAGCACCGTCACGACGCTgg > 4:118572/1‑149 (MQ=255) cgtggccaAGGC‑CAGGCCGGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTGTTTGCTCGCCATGCCAAGGCGCCGATCGTTGCCATCAGTGGTTCCAACGCCAAGAGCACCGTCACGACGCTGGTCg < 3:118572/147‑1 (MQ=255) cctggcctTGGC‑CACGCCGGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTGTTTGCTCGCCATGCCAAGGCGCCGATCGTTGCCATCAGTTGTTCCAACGCCAAGAGCACCGTCACGACGCTGGTCg < 6:291637/149‑1 (MQ=255) ctggcctTGGC‑CACGCCGGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTGTTTGCTCGCCATGCCAAGGCGCCGATCGTTGCCATCAGTGGTTCCAACGCCAAGAGCACCGTCACGACGCTGGTCgg > 4:68667/1‑149 (MQ=255) ctggcctTGGC‑CACGCCGGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTGTTTGCTCGCCATGCCAAGGCGCCGATCGTTGCCATCAGTGGTTCCAACGCCAAGAGCACCGTCACGACGCTGGTCgg < 3:328747/149‑1 (MQ=255) ctggcctTGGC‑CACGCCGGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTGTTTGCTCGCCATGCCAAGGCGCCGATCGTTGCCATCAGTGGTTCCAACGCCAAGAGCACCGTCACGACGCTGGTCgg > 6:65507/1‑149 (MQ=255) gcctTGGC‑CACGCCGGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTGTTTGCTCGCCATGCCAAGGCGCCGATCGTTGCCATCAGTGGTTCCAACGCCAAGAGCACCGTCACGACGCTGGTCGGTGa < 4:187755/149‑1 (MQ=255) cctTGGC‑CACGCCGGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTGTTTGCTCGCCATGCCAAGGCGCCGATCGTTGCCATCAGTGGTTCCAACGCCa < 4:4182/120‑1 (MQ=255) cctTGGC‑CACGCCGGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTGTTTGCTCGCCATGCCAAGGCGCCGATCGTTGCCATCAGTGGTTCCAACGCCa > 3:4182/1‑120 (MQ=255) | CCTTTGCGGTCGCCGATACCCGCGAGCAGCCGCCGGAACTGGAAACCCTGCGCCGTGATTACCCGCAGGTGGAAGTGCGCTGTGGTGAACTGGACGTGGACTTCCTGTGCCGCGCCAACGAGCTGTACGTGAGCCCCGGCCTGGCCTTGGC‑CACGCCGGCCTTGCAGCAGGCTGCCGCGCGTGGCGTGAAGCTGTCTGGCGACATAGAGCTGTTTGCTCGCCATGCCAAGGCGCCGATCGTTGCCATCAGTGGTTCCAACGCCAAGAGCACCGTCACGACGCTGGTCGGTGA > NC_002947/1520844‑1521135 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |