Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,581,266 | G→T | 100% | A44D (GCC→GAC) | ttgB ← | efflux pump membrane protein TtgB |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,581,266 | 0 | G | T | 99.8% | 230.2 / ‑7.4 | 73 | A44D (GCC→GAC) | ttgB | efflux pump membrane protein TtgB |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/2); new base T (38/32); total (39/34) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.19e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
GCGGTAATGGTCATGCTGCCGTCGGAGTTACTTTCCGACGACACATAACGCAGGTTGTCGATACC‑GTTGAGCTGCTGCTCGATCACCTGCACCACGGTGTCCTGCACGGTTT‑GCGCCGAGGCGCCCGGGTAGGTCACGGCGATGGCGATGGCTGGCGGCGCGATACTGGGGTACTGGTTGATCGGCAGCTTCAGGATGGACAAGGCCCCGACCAGCATGATCACCAAGGCGATCACCCAGGCGAAGATCGGGCGATCGATAAAGAACTTCGACATGGTTTA > NC_002947/1581122‑1581402 | gCGGGAATGGTCATGCTGCCGTCGGAGTTACTTTCCGACGACACATAACGCAGGTTGTCGATACC‑GTTGAGCTGCTGCTCGATCACCTGCACCACGGTGTCCTGCACGGTTT‑GCGCCGAGGCGCCCGGGTAGGTCACggcgatgtcgat < 1:327676/149‑1 (MQ=255) cGGTAATGGTCATGCTGCCGTCGGAGTTACTTTCCGACGACACATAACGCAGGTTGTCGATACC‑GTTGAGCTGCTGCTCGATCACCTGCACCACGGTGTCCTGCACGGTTT‑GCGCCGAGGCGCCCGGGTAGGTCACGgcgatgtcgatg < 7:264555/149‑1 (MQ=255) ggTAATGGTCATGCTGCCGTCGGAGTTACTTTCCGACGACACATAACGCAGGTTGTCGATACC‑GTTGAGCTGCTGCTCGATCACCTGCACCACGGTGTCCTGCACGGTTT‑GCGCCGAGGCGCCCGGGTAGGTCACGGcgatgtcgatgg > 4:362345/1‑149 (MQ=255) aTGGTCATGCTGCCGTCGGAGTTACTTTCCGACGACACATAACGCAGGTTGTCGATACC‑GTTGAGCTGCTGCTCGATCACCTGCACCACGGTGTCCTGCACGGTTT‑GCGCCGAGGCGCCCGGGTAGGTCACGGCGATGTCGAtggctgg > 4:80350/1‑149 (MQ=255) ggTCATGCTGCCGTCGGAGTTACTTTCCGACGACACATAACGCAGGTTGTCGATACC‑GTTGAGCTGCTGCTCGATCACCTGCACCACGGTGTCCTGCACGGTTT‑GCGCCGAGGCGCCCGGGTAGGTCACGGCGATGTCGATGGCTggcg > 3:65204/1‑149 (MQ=255) ggTCATGCTGCCGTCGGAGTTACTTTCCGACGACACATAACGCAGGTTGTCGATACC‑GTTGAGCTGCTGCTCGATCACCTGCACCACGGTGTCCTGCACGGTTT‑GCGCCGAGGCGCCCGGGTAGGTCACGGCGATGTCGATGGCTggcg > 6:377181/1‑149 (MQ=255) gTCATGCTGCCGTCGGAGTTACTTTCCGACGACACATAACGCAGGTTGTCGATACC‑GTTGAGCTGCTGCTCGATCACCTGCACCACGGTGTCCTGCACGGTTT‑GCGCCGAGGCGCCCGGGTAGGTCACGGCGATGTCGATGGCTggcgg > 1:226652/1‑149 (MQ=255) gTCATGCTGCCGTCGGAGTTACTTTCCGACGACACATAACGCAGGTTGTCGATACC‑GTTGAGCTGCTGCTCGATCACCTGCACCACGGTGTCCTGCACGGTTT‑GCGCCGAGGCGCCCGGGTAGGTCACGGCGATGTCGATGGCTggcgg > 3:325666/1‑149 (MQ=255) cGTCGGAGTTACTTTCCGACGACACATAACGCAGGTTGTCGATACC‑GTTGAGCTGCTGCTCGATCACCTGCACCACGGTGTCCTGCACGGTTT‑GCGCCGAGGCGCCCGGGTAGGTCACGGCGATGTCGATGGCTGGCGGCGCGATACTg < 2:226652/149‑1 (MQ=255) tCGGAGTTACTTTCCGACGACACATAACGCAGGTTGTCGATACC‑GTTGAGCTGCTGCTCGATCACCTGCACCACGGTGTCCTGCACGGTTT‑GCGCCGAGGCGCCCGGGTAGGTCACGGCGATGTCGATGGCTGGCGGCGCGATACTggg < 7:354517/149‑1 (MQ=255) tCGGAGTTACTTTCCGACGACACATAACGCAGGTTGTCGATACC‑GTTGAGCTGCTGCTCGATCACCTGCACCACGGTGTCCTGCACGGTTT‑GCGCCGAGGCGCCCGGGTAGGTCACGGCGATGTCGATGGCTGGCGGCGCGATACTggg < 7:387250/149‑1 (MQ=255) aGTTACTTTCCGACGACACATAACGCAGGTTGTCGATACC‑GTTGAGCTGCTGCTCGATCACCTGCACCACGGTGTCCTGCACGGTTT‑GCGCCGAGGCGCCCGGGTAGGTCACGGCGATGTCGATGGCTGGCGGCGCGATACTGGGGTAc < 3:80350/149‑1 (MQ=255) tACTTTCCGACGACACATAACGCAGGTTGTCGATACC‑GTTGAGCTGCTGCTCGATCACCTGCACCACGGTGTCCTGCACGGTTT‑GCGCCGAGGCGCCCGGGTAGGTCACGGCGATGTCGATGGCTGGCGGCGCGATACTGGGGTACTgg > 3:118102/1‑149 (MQ=255) aCTTTCCGACGACACATAACGCAGGTTGTCGATACC‑GTTGAGCTGCTGCTCGATCACCTGCACCACGGTGTCCTGCACGGTTT‑GCGCCGAGGCGCCCGGGTAGGTCACGGCGATGTCGATGGCTGGCGGCGCGATACTGGGGTACTGGt > 2:167490/1‑149 (MQ=255) cTTTCCGACGACACATAACGCAGGTTGTCGATACC‑GTTGAGCTGCTGCTCGATCACCTGCACCACGGTGTCCTGCACGGTTT‑GCGCCGAGGCGCCCTGGTAGGTCACGGCGATGTCGATGGCTGGCGGCGCGATACTGGGGTACTGGt < 2:244069/148‑1 (MQ=255) tttCCGACGACACATAACGCAGGTTGTCAATACC‑GTTGAGCTGCTGCTCGATCACCTGCACCACGGTGTCCTGCACGGTTT‑GCGCCGAGGCGCCCGGGTAGGTCACGGCGATGTCGATGGCTGGCGGCGCGATACTGGGGTACTGGtt > 8:56421/1‑148 (MQ=255) ttCGGAAGACTCATAACGCTGGTTGTCGATACC‑GTTGTGCTGCTGCTGGATCTCCTGCTCCACGGTGTCCTGGACGGTTT‑GCGCCGAGGCGCCTGGGTAGGTCACGGCGATGTCGATGGCTGGCGGCGCGATACTGGGGTAGTGGTTg < 5:335150/148‑1 (MQ=255) ttCCGACGACACATAACGCAGGTTGTCGATACC‑GTTGAGCTGCTGCTCGATCACCTGCACCACGGTGTCCTGCACGGTTT‑GCGCCGAGGCGCCCGGGTAGGTCACGGCGATGTCGGTGGCTGGCGGCGCGATACTGGGGTACTGGTTGa > 5:243559/1‑149 (MQ=255) tcagacgacACATAACGCAGGTTGTCGATACCTGTTGAGATGCTGCTCGATCACCTCCAACACGGTGTCCTGAACGGTTT‑CCGCCGAGCCGCCCGGGTAGGTCACGGCGATGACGATGGCTGGCGCCCCGATACTGGGGTACTGGTTGa > 1:53557/4‑149 (MQ=255) gacgacACATAACGCAGGTTGTCGATACC‑GTTGAGCTGCTGCTCGATCACCTGCACCACGGTGTCCTGCACGGTTT‑GCGCCGAGGCGCCCGGGTAGGTCACGGCAATGTCGATGGCTGGCGGCGCGATACTGGGGTACTGGTTGATCgg > 7:176556/1‑149 (MQ=255) acgacACATAACGCAGGTTGTCGATACC‑GTTGAGCTGCTGCTCGATCACCTGCACCACGGTGTCCTGCACGGTTT‑GCGCCGAGGCGCCCGGGTAGGTCACGGCGATGTCGATGGCTGGCGGCGCGATACTGGGGTACTGGTTGATCGGc < 4:65204/149‑1 (MQ=255) acgacACATAACGCAGGTTGTCGATACC‑GTTGAGCTGCTGCTCGATCACCTGCACCACGGTGTCCTGCACGGTTT‑GCGCCGAGGCGCCCGGGTAGGTCACGGCGATGTCGATGGCTGGCGGCGCGATACTGGGGTACTGGTTGATCGGc < 6:143118/149‑1 (MQ=255) acaTAACGCAGGTTGTCGATACC‑GTTGAGCTGCTGCTCGATCACCTGCACCACGGTGTCCTGCACGGTTT‑GCGCCGAGGCGCCCGGGTAGGTCACGGCGATGTCGATGGCTGGCGGCGCGATACTGGGGTACTGGTTGATCGGCAGCtt > 1:239919/1‑149 (MQ=255) aTAACGCAGGTTGTCGATACC‑GTTGAGCTGCTGCTCGATCACCTGCACCACGGTGTCCTGCACGGTTT‑GCGCCGAGGCGCCCGGGTAGGTCACGGCGATGTCGATGGCTGGCGGCGCGATACTGGGGTACTGGTTGATCGGCAGCTTCa < 2:239919/149‑1 (MQ=255) cGCAGGTTGTCGATACC‑GTTGAGCTGCTGCTCGATCACCTGCACCACGGTGTCCTGCACGGTTT‑GCGCCGAGGCGCCCGGGTAGGTCACGGCGATGTCGATGGCTGGCGGCGCGATACTGGGGTACTGGTTGATCGGCAGCTTCAGGAt < 1:167490/149‑1 (MQ=255) cGCAGGTTGTCGATACC‑GTTGAGCTGCTGCTCGATCACCTGCACCACGGTGTCCTGCACGGTTT‑GCGCCGAGGCGCCCGGGTAGGTCACGGCGATGTCGATGGCTGGCGGCGCGATACTGGGGTACTGGTTGATCGGCAGCTTCAGGAt < 3:24501/149‑1 (MQ=255) gCAGGTTGTCGATACC‑GTTGAGCTGCTGCTCGATCACCTGCACCACGGTGTCCTGCACGGTTT‑GCGCCGAGGCGCCCGGGTAGGTCACGGCGATGTCGATGGCTGGCGGCGCGATACTGGGGTACTGGTTGATCGGCAGCTTCAGGATg < 2:9135/149‑1 (MQ=255) gCAGGTTGTCGATACC‑GTTGAGCTGCTGCTCGATCACCTGCACCACGGTGTCCTGCACGGTTT‑GCGCCGAGGCGCCCGGGTAGGTCACGGCGATGTCGATGGCTGGCGGCGCGATACTGGGGTACTGGTTGATCGGCAGCTTCAGGATg < 3:362345/149‑1 (MQ=255) aGGTTGTCGATACC‑GTTGAGCTGCTGCTCGATCACCTGCACCACGGTGTCCTGCACGGTTT‑GCGCCGAGGCGCCCGGGTAGGTCACGGCGATGTCGATGGCTGGCGGCGCGATACTGGGGTACTGGTTGATCGGCAGCTTCAGGATGGa < 2:316307/149‑1 (MQ=255) gTTGTCGATACC‑GTTGAGCTGCTGCTCGATCACCTGCACCACGGTGTCCTGCACGGTTT‑GCGCCGAGGCGCCCGGGTAGGTCACGGCGATGTCGATGGCTGGCGGCGCGATACTGGGGTACTGGTTGATCGGCAGCTTCAGGATGGAc > 2:157225/1‑148 (MQ=255) tACC‑GTTGAGCTGCTGCTCGATCACCTGCACCACGGTGTCCTGCACGGTTT‑GCGCCGAGGCGCCCGGGTAGGTCACGGCGATGTCGATGGCTGGCGGCGCGATACTGGGGTACTGGTTGATCGGCAGCTTCAGGATGGACAAGGcccc > 4:149839/1‑148 (MQ=255) tACC‑GTTGAGCTGCTGCTCGATCACCTGCACCACGGTGTCCTGCACGGTTT‑GCGCCGAGGCGCCCGGGTAGGTCACGGCGATGTCGATGGCTGGCGGCGCGATACTGGGGTACTGGTTGATCGCCAGCTTCAGGATGGACAAGGCCCCg > 4:424649/1‑149 (MQ=255) gctgctgctCGATCACCTGCACCTCGGTGTCCTGCACGGTTT‑GCTCCGAGGCGCCCGGGTAGGTCACGGCGATGTCGATGGCTGGCGGCGCGATACTGGGGTACTGGTTGATCGGCAGCTTCAGGa < 7:403742/126‑1 (MQ=255) gctgctgctCGATCACCTGCACCACGGAGTCCTGCACGGTTT‑GCGCCGAGGCGCCCGGGTAGCTCACGGCGATGTCGATGCCAGGCGGAGCGATACTGGGGTACTGGTTGCTCGGCAGCTTCAGGa > 8:403742/1‑126 (MQ=255) gctgatgctCGATCACCTGCACCACGTTGTCCTGCACGGTTT‑GCGCCGAGGCGCCCGGGTAGGTCACGGCGATGTCGATGGATGGCGGCGCGATACGGGGGTACTGGTGGATCGGCCGCTTCAGGATTGACAAGGCACCGCCCCGCAt > 3:247877/1‑148 (MQ=255) gctgctCGATCACCTGCACCACGGTGTCCTGCACGGTTT‑GCGCCGAGGCGCCCGGGTAGGTCACGGCGATGTCGATGGCTGGCGGCGCGATACTGGGGTACTGGTTGATCgg > 3:262494/1‑112 (MQ=255) gctgctCGATCACCTGCACCACGGTGTCCTGCACGGTTT‑GCGCCGAGGCGCCCGGGTAGGTCACGGCGATGTCGATGGCTGGCGGCGCGATACTGGGGTACTGGTTGATCgg < 4:262494/112‑1 (MQ=255) gctgctCGATCACCTGCACCACGGTGTCCTGCACGGTTT‑GCGCCGAGGCGCCCGGGTAGGTCACGGCGATGTCGATGGCTGGCGGCGCGATACTGGGGTACTGGTTGATCGGCAGCTTCAGGATGGACAAGGCCCCGACCAGCATGAt > 8:37472/1‑148 (MQ=255) ctggtCGTTCACCTGCACCACGGTGTCCTGCTCGGTTT‑GCGACGAGGCTCCCGGGTAGGTCACGGCGATGTCGATGGCTGGCGGCGCGATACTGGGGTAATGGTTGATCGGCAGCTTCAGGATGGACAAGGCCCCGACCAGCATGATc < 2:155376/148‑1 (MQ=255) ctgctCGATCACCTGCACCACGGTGTCCTGCACGGTTT‑GCGCCGAGGCGCCCGGGTAGGTCACGGCGATGTCGATGGCTGGCGGCGCGATACTGGGGTACTGGTTGATCGGCAGCTTCAGGATGGACAAGGCCCCGACCAGCATGATc < 5:113867/148‑1 (MQ=255) gctCGATCACCTGCACCACGGTGTCCTGCACGGTTT‑GCGCCGAGGCGCCCGGGTAGGTCACGGCGATGTCGATGGCTGGCGGCGCGATACTGGGGTACTGGTTGATCGGCAGCTTCAGGATGGACAAGGCCCCGACCAACATGATCAc > 5:141135/1‑148 (MQ=255) ctCGATCACCTGCACCACGGTGTCCTGCACGGTTT‑GCGCCGAGGCGCCCGGGTAGGTCACGGCGATGTCGATGGCTGGCGGCGCGATACTGGGGTACTGGTTGATCGGCAGCTTCAGGATGGACAAGGCCCCGACCAGCATGATCACCa < 2:266765/149‑1 (MQ=255) cGATCACCTGCACCACGGTGTCCTGCACGGTTT‑GCGCCGAGGCGCCCGGGTAGGTCACGGCGATGTCGATGGCTGGCGGCGCGATACTGGGGTACTGGTTGATCGGCAGCTTCAGGATGGACAAGGCCCCGACCAGCATGATCACCAAg > 4:201793/1‑149 (MQ=255) cGATCACCTGCACCACGGTGTCCTGCACGGTTT‑GCGCCGAGGCGCCCGGGTAGGTCACGGCGATGTCGATGGCTGGCGGCGCGATACTGGGGTACTGGTTGATCGGCAGCTTCAGGATGGACAAGGCCCCGACCAGCATGATCACCAAg > 8:250732/1‑149 (MQ=255) gacaaCCTGCACCACGGTGTCCTGCACGGTTT‑GCGCCGAGGCGCCCGGGTAGGTCACGGCGATGTCGATGGCTGGCGGCGCGATACTGGGGTACTGGTTGATCGGCAGCTTCAGGATGGACAAGGCCCCGACCAGCATGATCACCAAgg < 6:426120/145‑1 (MQ=255) tCACCTGCACCACGGTGTCCTGCACGGTTTGGCGCCGAGGCGCCCGGGTAGGTCACGGCGATGTCGATGGCTGGCGGCGCGATACTGGGGTACTGGTTGATCGGCAGCTTCAGGATGGACAAGGCCCCGACCAGCATGATCACCAAGGc > 1:46255/1‑149 (MQ=255) tCACCTGCACCACGGTGTCCTGCACGGTTT‑GCGCCGAGGCGCCCGGGTAGGTCACGGCGATGTCGATGGCTGGCGGCGCGATACTGGGGTACTGGTTGATCGGCAGCTTCAGGATGGACAAGGCCCCGACCAGCATGATCACCAAGGCg < 7:108417/149‑1 (MQ=255) ccTGCACCACGGTGTCCTGCACGGTTT‑GCGCCGAGGCGCCCGGGTAGGTCACGGCGATGTCGATGGCTGGCGGCGCGATACTGGGGTACTGGTTGATCGGCAGCTTCAGGATGGACAAGGCCCCGACCAGCATGATCACCAAGGCGAt > 2:121769/1‑148 (MQ=255) ccTGCACCACGGTGTCCTGCACGGTTT‑GCGCCGAGGCGCCCGGGTAGGTCACGGCGATGTCGATGGCTGGCGGCGCGATACTGGGGTACTGGTTGATCGGCAGCTTCAGGATGGACAAGGCCCCGACCAGCATGATCACCAAGGCGATc < 7:37472/149‑1 (MQ=255) ccTGAACCACGGTGTCCTGCACGGTTT‑GCGCCGAGGCGCCCGCGTAGGTCACGGCGATGTCGATGGCTGGCGGCGCGATACTGGGGTACTGGTTGATCGGCAGCTTCAGGATGGACAAGGCCCCGACCAGCATGATCACCAAGGCGAt > 5:300950/1‑148 (MQ=255) cttctccacGTTGTCCTGCTGTGTTT‑GCGCCGAGGCGCCCGGGTAGGTCACGGCGATGGCGATGGCTGGCGGCTCGATACTGGGGTACTGGTTGATCGGCAGCTTCAGGATGGACAAGGCCCCGACCAGCATGATCACCAAGGCGATc < 6:300950/143‑1 (MQ=255) caccacGGTGTCCTGCACGGTTT‑GCGCCGAGGCGCCCGGGTAGGTCACGGCGATGTCGATGGCTGGCGGCGCGATACTGGGGTACTGGTTGATCGGCAGCTTCAGGATGGACAAGGCCCCGACCAGCATGATCACCAAGGCGATCAcc < 1:121769/148‑1 (MQ=255) agcacGGTGTCCTGCACGGTTT‑GCGTCGAGGCGCCCGGGTAGGTCACGGGGATGTCGATGGCTTGCGGCGCGATACTGGGGTACTGGTTGATCGGCAGCTTCAGGATGGACAAGGCGCCGACCAGCATGATCACCAAGGCGATCAccc < 2:53557/146‑1 (MQ=255) ccacGGTGTCCTTCAGGGTTT‑GCGCCGAGGCGCGCGGGTAGGTCACGGCGATGTCGATGGCTGGCGGCGCGATACTGGGGTACTGGTTGATCGGCAGCTTGAGGATGGACAAGGCCCCGACCAGCATGATCACCAAGGCGATCACCCAg < 3:26986/149‑1 (MQ=255) cacGGTGTCCTGCACGGTTT‑GCGCCGAGGCGCCCGGGTAGGTCACGGCGATGTCGATGGCTGGCGGCGCGATACTGGGGTACTGGTTGATCGGCAGCTTCAGGATGGACAAGGCCCCGACCAGCATGATCACCAAGGCGATCACCCAgg > 7:227507/1‑149 (MQ=255) cGGTGTCCTGCACGGTTT‑GCGCCGAGGCGCCCGGGTAGGTCACGGCGATGTCGATGGCTGGCGGCGCGATACTGGGGTACTGGTTGATCGGCAGCTTCAGGATGGACAAGGCCCCGACCAGCATGATCACCAAGGCGATCACCCAGGc > 2:298684/1‑148 (MQ=255) tgtCCTGCACGGTTT‑GCGCCGAGGCGCCCGGGTAGGTCACGGCGATGTCGATGGCTGGCGGCGCGATACTGGGGTACTGGTTGATCGGCAGCTTCAGGATGGACAAGGCCCCGACCAGCATGATCACCAAGGCGATCACCCAGGCg > 2:52793/1‑146 (MQ=255) tCCTGCACGGTTT‑GCGCCGAGGCGCCCGGGTAGGTCACGGCGATGTCGATGGCTGGCGGCGCGATACTGGGGTACTGGTTGATCGGCAGCTTCAGGATGGACAAGGCCCCGACCAGCATGATCACCAAGGCGATCACCCAGGCg > 4:385944/1‑144 (MQ=255) cTGCACGGTTT‑GCGCCGAGGCGCCCGGGTAGGTCACGGCGATGTCGATGGCTGGCGGCGCGATACTGGGGTACTGGTTGATCGGCAGCTTCAGGATGGACAAGGCCCCGACCAGCATGATCACCAAGGCGATCACCCAGGCGAAGATCg > 8:320927/1‑149 (MQ=255) tGCACGGTTT‑GCGCCGAGGCGCCCGGGTAGGTCACGGCGATGTCGATGGCTGGCGGCGCGATACTGGGGTACTGGTTGATCGGCAGCTTCAGGATGGACAAGGCCCCGACCAGCATGATCACCAAGGCGATCACCCAGGCGAAGATCgg > 4:80038/1‑149 (MQ=255) tGCACGGTTT‑GCGCCGAGGCGCCCGGGTAGGTCACGGCGATGTCGATGGCTGGCGGCGCGATACTGGGGTACTGGTTGATCGGCAGCTTCAGGATGGACAAGGCCCCGACCAGCATGATCACCAAGGCGATCACCCAGGCGAAGATCgg > 1:209194/1‑149 (MQ=255) gCACGGTTT‑GCGCCGAGGCGCCCGGGTAGGTCACGGCGATGTCGATGGCTGGCGGCGCGATACTGGGGTACTGGTTGATCGGCAGCTTCAGGATGGACAAGGCCCCGACCAGCATGATCACCAAGGCGATCACCCAGGCGAAGATCggg > 2:106465/1‑149 (MQ=255) cGGTTT‑GCGCCGAGGCGCCCGGGTAGGTCACGGCGATGTCGATGGCTGGCGGCGCGATACTGGGGTACTGGTTGATCGGCAGCTTCAGGATGGACAAGGCCCCGACCAGCATGATCACCAAGGCGATCACCCAGGCGAAGATCGGGcga > 4:128537/1‑149 (MQ=255) ggTTT‑GCGCCGAGGCGCCCGGGTAGGTCACGGCGATGTCGATGGCTGGCGGCGCGATACTGGGGTACTGGTTGATCGGCAGCTTCAGGATGGACAAGGCCCCGACCAGCATGATCACCAAGGCGATCACCCAGGCGAAGATCGGGcgat > 8:40481/1‑149 (MQ=255) ggTTT‑GCGCCGAGGCGCCCGGGTAGGTCACGGCGATGTCGATGGCTGGCGGCGCGATACTGGGGTACTGGTTGATCGGCAGCTTCAGGATGGACAAGGCCCCGACCAGCATGATCACCAAGGCGATCACCCAGGCGAAGATCGGGcgat < 8:227507/149‑1 (MQ=255) ttt‑GCGCCGAGGCGCCCGGGTAGGTCACGGCGATGTCGATGGCTGGCGGCGCGATACTGGGGTACTGGTTGATCGGCAGCTTCAGGATGGACAAGGCCCCGACCAGCATGATCACCAAGGCGATCACCCAGGCGAAGATCGGGcgatcg < 3:201793/149‑1 (MQ=255) t‑GCGCCGAGGCGCCCGGGTAGGTCACGGCGATGTCGATGGCTGGCGGCGCGATACTGGGGTACTGGTTGATCGGCAGCTTCAGGATGGACAAGGCCCCGACCAGCATGATCACCAAGGCGATCACCCAGGCGAAGATCGGGcgatcga > 7:131427/1‑148 (MQ=255) gcgcCGAGGCGCCCGGGTAGGTCACGGCGATGTCGATGGCTGGCGGCGCGATACTGGGGTACTGGTTGATCGGCAGCTTCAGGATGGACAAGGCCCCGACCAGCATGATCACCAAGGCGATCACCCAGGCGAAGATCGGGcgatcgat < 5:377181/148‑1 (MQ=255) gcCGAGGCGCCCGGGTAGGTCACGGCGATGTCGATGGCTGGCGGCGCGATACTGGGGTACTGGTTGATCGGCAGCTTCAGGATGGACAAGGCCCCGACCAGCATGATCACCAAGGCGATCACCCAGGCGAAGATCGGGCGATCGATa > 1:114810/1‑147 (MQ=255) gcGAGGCGCCCGGGTAGGGCACGGCGATGGCGATGGCTGGCGGCGCGATACTGGGGTACTGGTTGATCGGCAGCTTCAGGATGGACAAGGCCCCGACCAGCATGATCACCAAGGCGATCACCCAGGCGAAGATCGGGCGATCGATAAAg < 2:142622/148‑1 (MQ=255) ccGAGGCGCCCGGGTAGGTCACGGCGATGTCGATGGCTGGCGGCGCGATACTGGGGTACTGGTTGATc < 3:186204/68‑1 (MQ=255) ccGAGGCGCCCGGGTAGGTCACGGCGATGTCGATGGCTGGCGGCGCGATACTGGGGTACTGGTTGATc > 4:186204/1‑68 (MQ=255) cgcCCGGGTAGGTCACGGCGATGTCGATGGCTGGCGGCGCGATACTGGGGTACTGGATGATCGGCAGCTTCAGGATGGACAAGGCCCCGACCAGCATGATCACCAAGGCGATCACCCAGGCGAAGATCGGGCGATCGATAAAGAACTTc < 3:424649/149‑1 (MQ=255) ggTCACGGCGATGTCGATGGCTGGCGGCGCGATACTGGGGTACTGGTTGATCGGCAGCTTCAGGATGGACAAGGCCCCGACCAGCATGATCACCAAGGCGATCACCCAGGCGAAGATCGGGCGATCGATAAAGAACTTCGACATGGtt < 2:209194/148‑1 (MQ=255) ggTCACGGCGATGTCGATGGCTGGCGGCGCGATACTGGGGTACTGGTTGATCGGCAGCTTCAGGATGGACAAGGCCCCGACCAGCATGATCACCAAGGCGATCACCCAGGCGAAGATCGGGCGATCGATAAAGAACTTCGACATGGtt < 3:385944/148‑1 (MQ=255) tCACGGCGATGTCGATGGCTGGCGGCGCGATACTGGGGTACTGGTTGATCGGCAGCTTCAGGATGGACAAGGCCCCGACCAGCATGATCACCAACGCGATCACCCAGGCGAAGATCCGGCGATCGATAAAGAACTACGACATCGttaa > 7:400117/1‑146 (MQ=255) | GCGGTAATGGTCATGCTGCCGTCGGAGTTACTTTCCGACGACACATAACGCAGGTTGTCGATACC‑GTTGAGCTGCTGCTCGATCACCTGCACCACGGTGTCCTGCACGGTTT‑GCGCCGAGGCGCCCGGGTAGGTCACGGCGATGGCGATGGCTGGCGGCGCGATACTGGGGTACTGGTTGATCGGCAGCTTCAGGATGGACAAGGCCCCGACCAGCATGATCACCAAGGCGATCACCCAGGCGAAGATCGGGCGATCGATAAAGAACTTCGACATGGTTTA > NC_002947/1581122‑1581402 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |