| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,623,383 | G→A | 6.1% | intergenic (‑27/+23) | PP_1422 ← / ← PP_1423 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,623,383 | 0 | G | A | 6.1% | 241.4 / 3.6 | 82 | intergenic (‑27/+23) | PP_1422/PP_1423 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (43/34); new base A (3/2); total (46/36) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.44e-01 | |||||||||||
TTCCGCTGCCTCGCGGATGCTCAAGGCAACCTCGGGCAGGGTTGGCAGGACCAGGTCATCCTTTTCGATGGCGTCGAGCAATTGTGCTTGAACCAACTCGGCCAGCTTGTTCATGGGCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCT‑GGATTTCCCGGTCGCGGTCCAGTTCGTAAGGCAGGGTCAGCACCTGCAGGCGCGGGCCTTCGAGGCTGCCCAGGTGCAGGTGGCCGTCTTCCACCGCCTCGGCGCTGAGCACCGCGA > NC_002947/1623237‑1623530 | ttCCGCTGCCTCGCGGATGCTCAAGGCAACCTCGGGCAGGGTTGGCAGGACCAGGTCATCCTTTTCGATGGCGTCGAGCAATTGTGCTTGAACCAACTCGGCCAGCTTGTTCATGGGCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGcc > 5:126913/1‑149 (MQ=255) cGCTGCCTCGCGGATGCTCAAGGCAACCTCGGGCAGGGTTGGCAGGACCAGGTCATCCTTTTCGATGGCGTCGAGCAATTGTGCTTGAACCAACTCGGCCAGCTTGTTCATGGGCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCcaca < 4:55759/149‑1 (MQ=255) cGCTGCCTCGCGGATGCTCAAGGCAACCTCGGGCAGGGTTGGCAGGACCAGGTCATCCTTTTCGATGGCGTCGAGCAATTGTGCTTGAACCAACTCGGCCAGCTTGTTCATGGGCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCcac < 3:23129/148‑1 (MQ=255) gCTGCCTCGCGGATGCTCAAGGCAACCTCGGGCAGGGTTGGCAGGACCAGGTCATCCTTTTCGATGGCGTCGAGCAATTGTGCTTGAACCAACTCGGCCAGCTTGTTCATGGGCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAg < 1:49803/149‑1 (MQ=255) tGCCTCGCGGATGCTCAAGGCAACCTCGGGCAGGGTTGGCAGGACCAGGTCATCCTTTTCGATGGCGTCGAGCAATTGTGCTTGAACCAACTCGGCCAGCTTGTTCATGGGCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAggg < 1:247087/149‑1 (MQ=255) cgGATGCTCAAGGCAACCTCGGGCAGGGTTGGCAGGACCAGGTCATCCTTTTCGATGGCGTCGAGCAATTGTGCTTGAACCAACTCGGCCAGCTTGTTCATGGGCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCACCCCTGTGGCGGGGc < 6:277751/149‑1 (MQ=255) cgGATGCGCAAGGCAACCTCGGGCAGGGTTGGCAGGACCAGGTCATCCTTTTCGATGGCGTCGAGCAATTGTGCTTGAACCAACTCGGCCAGCTTGTTCATGGGCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGc < 2:377715/149‑1 (MQ=255) tCAAGGCAACCTCGGGCAGGGTTGGCAGGACCAGGTCATCCTTTTCGATGGCGTCGAGCAATTGTGCTTGAACCAACTCGGCCAGCTTGTTCATGGGCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTgg > 8:331509/1‑149 (MQ=255) tCAAGGCAACCTCGGGCAGGGTTGGCAGGACCAGGTCATCCTTTTCGATGGCGTCGAGCAATTGTGCTTGAACCAACTCGGCCAGCTTGTTCATGGGCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTgg > 4:279245/1‑149 (MQ=255) tCAAGGCAACCTCGGGCAGGGTTGGCAGGACCAGGTCATCCTTTTCGATGGCGTCGAGCAATTGTGCTTGAACCAACTCGGCCAGCTTGTTCATGGGCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTgg > 4:74416/1‑149 (MQ=255) tCAAGGCAACCTCGGGCAGGGTTGGCAGGACCAGGTCATCCTTTTCGATGGCGTCGAGCAATTGTGCTTGAACCAACTCGGCCAGCTTGTTCATGGGCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCACCCCTGTGGCGGGGc < 3:420895/142‑1 (MQ=255) tCAAGGCAACCTCGGGCAGGGTTGGCAGGACCAGGTCATCCTTTTCGATGGCGTCGAGCAATTGTGCTTGAACCAACTCGGCCAGCTTGTTCATGGGCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCACCCCTGTGGCGGGGc > 4:420895/1‑142 (MQ=255) aaCCTCGGGCAGGGTTGGCAGGACCAGGTCATCCTTTTCGATGGCGTCGAGCAATTGTGCTTGAACCAACTCGGCCAGCTTGTTCATGGGCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAgcgc > 6:229638/1‑149 (MQ=255) aCCTCGGGCAGGGTTGGCAGGACCAGGTCATCCTTTTCGATGGCGTCGAGCAATTGTGCTTGAACCAACTCGGCCAGCTTGTTCATGGGCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCt < 1:182500/149‑1 (MQ=255) aCCTCGGGCAGGGTTGGCAGGACCAGGTCATCCTTTTCGATGGCGTCGAGCAATTGTGCTTGAACCAACTCGGCCAGCTTGTTCATGGGCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCt > 2:182500/1‑149 (MQ=255) cTCGGGCAGGGTTGGCAGGACCAGGTCATCCTTTTCGATGGCGTCGAGCAATTGTGCTTGAACCAACTCGGCCAGCTTGTTCATGGCCATGTCTACCGCAGTTGTGGTGCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCT‑gg < 5:298804/149‑1 (MQ=255) cGGGCAGGGTTGGCAGGACCAGGTCATCCTTTTCGATGGCGTCGAGCAATTGTGCTTGAACCAACTCGGCCAGCTTGTTCATGGGCATGTCTACC‑CAGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCT‑GGAtt > 4:283820/1‑149 (MQ=255) gCAGGGTTGGCAGGACCAGGTCATCCTTTTCGATGGCGTCGAGCAATTGTGCTTGAACCAACTCGGCCAGCTTGTTCATGGGCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGc > 5:200239/1‑131 (MQ=255) gCAGGGTTGGCAGGACCAGGTCATCCTTTTCGATGGCGTCGAGCAATTGTGCTTGAACCAACTCGGCCAGCTTGTTCATGGGCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGc < 6:200239/131‑1 (MQ=255) gCAGGGTTGGCAGGACCAGGTCATCCTTTTCGATGGCGTCGAGCAATTGTGCTTGAACCAACTCGGCCAGCTTGTTCATGGGCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCT‑g > 5:222741/1‑143 (MQ=255) gCAGGGTTGGCAGGACCAGGTCATCCTTTTCGATGGCGTCGAGCAATTGTGCTTGAACCAACTCGGCCAGCTTGTTCATGGGCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCT‑g < 6:222741/143‑1 (MQ=255) gCAGGGTTGGCAGGACCAGGTCATCCTTTTCGATGGCGTCGAGCAATTGTGCTTGAACCAACTCGGCCAGCTTGTTCATGGGCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCT‑GGATTTc < 4:224733/149‑1 (MQ=255) gCAGGGTTGGCAGGACCAGGTCATACTTTTCGATGGCGTCGAGCAATTGTGCTTGAACCAACTCGGCCAGCTTGTTCATGGGCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCT‑GGATTTc > 6:213176/1‑149 (MQ=255) cAGGGTTGGCAGGACCAGGTCATCCTTTTCGATGGCGTCGAGCAATTGTGCTTGAACCAACTCGGCCAGCTTGTTCATGGGCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCT‑GGATTTcc < 6:126913/149‑1 (MQ=255) gggTTGGCAGGACCAGGTCATCCTTTTCGATGGCGTCGAGCAATTGTGCTTGAACCAACTCGGCCAGCTTGTTCATGGGCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCGACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCT‑GGATTTCCCg > 1:220722/1‑149 (MQ=255) ggTTGGCAGGACCAGGTCATCCTTTTCGATGGCGTCGAGCAATTGTGCTTGAACCAACTCGGCCAGCTTGTTCATGGGCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCT‑GGATTTCCCgg < 5:108597/149‑1 (MQ=255) tGGCAGGACCAGGTCATACTTTTCGATGGCGTCGAGCAATTGTGCTTGAACCAACTCGGCCAGCTTGTTCATGGGCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCT‑GGATTTCCCGGTcg > 2:65621/1‑149 (MQ=255) gCAGGACCAGGTCATCCTTTTCGATGGCGTCGAGCAATTGTGCTTGAACCAACTCGGCCAGCTTGTTCATGGGCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTg < 2:14221/124‑1 (MQ=255) gCAGGACCAGGTCATCCTTTTCGATGGCGTCGAGCAATTGTGCTTGAACCAACTCGGCCAGCTTGTTCATGGGCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTg > 1:14221/1‑124 (MQ=255) gCAGGACCAGGTCATCCTTTTCGATGGCGTCGAGCAATTGTGCTTGAACCAACTCGGCCAGCTTGTTCATGGGCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCT‑GGATTTCCCGGTcgcg < 8:43141/149‑1 (MQ=255) ggACCAGGTCATCCTTTTCGATGGCGTCGAGCAATTGTGCTTGAACCAACTCGGCCAGCTTGTTCATGGGCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCT‑GGATTTCCCGGTCGCGGTc > 2:351384/1‑149 (MQ=255) aCCAGGTCATCCTTTTCGATGGCGTCGAGCAATTGTGCTTGAACCAACTCGGCCAGCTTGTTCATGGGCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCT‑GGATTTCCCGGTCGCGGTCCa < 5:159741/149‑1 (MQ=255) aCCAGGTCATCCTTTTCGATGGCGTCGAGCAATTGTGCTTGAACCAACTCGGCCAGCTTGTTCATGGGCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCACCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCT‑GGATTTCCCGGTCGCGGTc > 4:387481/1‑147 (MQ=255) cAGGTCATCCTTTTCGATGGCGTCGAGCAATTGTGCTTGAACCAACTCGGCCAGCTTGTTCATGGGCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCT‑GGATTTCCCGGTCGCGGTCCAGt < 2:195903/149‑1 (MQ=255) aGGTCATCCTTTTCGATGGCGTCGAGCAATTGTGCTTGAACCAACTCGGCCAGCTTGTTCATGGGCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCT‑GGATTTCCCGGTCGCGGTCCAGtt < 3:387481/149‑1 (MQ=255) aGGTCATCCTTTTCGATGGCGTCGAGCAATTGTGCTTGAACCAACTCGGCCAGCTTGTTCATGGGCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCT‑GGATTTCCCGGTCGCGGTCCAGtt > 1:84998/1‑149 (MQ=255) aGGTCAGCCTTTTCGATGGCGTCGAGCAATTGTGCTTGAACCAACTCGGCCAGCTTGTTCATGGGCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCT‑GGATTTCCCGGTCGCGGTCCAGtt < 6:230229/149‑1 (MQ=255) gTCATCCTTTTCGATGGCGTCGAGCAATTGTGCTTGAACCAACTCGGCCAGCTTGTTCATGGGCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAgcg > 3:273601/1‑121 (MQ=255) gTCATCCTTTTCGATGGCGTCGAGCAATTGTGCTTGAACCAACTCGGCCAGCTTGTTCATGGGCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAgcg < 4:273601/121‑1 (MQ=255) ccTTTTCGATGGCGTCGAGCAATTGTGCTTGAACCAACTCGGCCAGCTTGTTCATGGGCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCT‑GGATTTCCCGGTCGCGGTCCAGTTCGTaa < 3:232862/147‑1 (MQ=255) ccTTTTCGATGGCGTCGAGCAATTGTGCTTGAACCAACTCGGCCAGCTTGTTCATGGGCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCT‑GGATTTCCCGGTCGCGGTCCAGTTCGTaa > 4:232862/1‑147 (MQ=255) ccTTTTCGATGGCGTCGAGCAATTGTGCTTGAACCAACTCGGCCAGCTTGTTCATGGGCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCT‑GGATTTCCCGGTCGCGGTCCAGTTCGTAAgg > 2:277390/1‑149 (MQ=255) ttttCGATGGCGTCGAGCAATTGTGCTTGAACCAACTCGGCCAGCTTGTTCATGGGCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCT‑GGATTTCCCGGTCGCGGTCCAGTTCGTAAgg > 4:327941/1‑147 (MQ=255) tCGATGGCGTCGAGCAATTGTGCTTGAACCAACTCGGCCAGCTTGTTCATGGGCATGTCTACC‑CAGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCT‑GGATTTCCCGGTCGCGGTCCAGTTCGTAAGGCAggg < 3:283820/148‑1 (MQ=255) cGATGGCGTCGTGCAATTGTGCTTGAAACAACTCGGCCAGCTTGTTCATGGGCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCTCGGATTTCCCGGTCGCGGTCCAGTTCGTAAGGCAgg < 1:65621/148‑1 (MQ=255) cGATGGCGTCGAGCAATTGTGCTTGAACCAACTCGGCCAGCTTGTTCATGGGCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAGGCGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCT‑GGATTTCCCGGTCGCGGTCCAGTTCGTAAGGCAGGGt > 2:401495/1‑149 (MQ=255) gATGGCGTCGAGCAATTGTGCTTGAACCAACTCGGCCAGCTTGTTCATGGGCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCT‑GGATTTCCCGGTCGCGGTCCAGTTCGTAAGGCAGGGt < 3:279245/148‑1 (MQ=255) tGGCGTCGAGCAATTGTGCTTGAACCAACTCGGCCAGCTTGTTCATGGGCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCT‑GGATTTCCCGGTCGCGGTCCAGTTCGTAAGGCAGGGTCAg < 3:327941/149‑1 (MQ=255) cGAGCAATTGTGCTTGAACCAACTCGGCCAGCTTGTTCATGGGCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCt > 8:21750/1‑103 (MQ=255) cGAGCAATTGTGCTTGAACCAACTCGGCCAGCTTGTTCATGGGCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCt < 7:21750/103‑1 (MQ=255) aaTTGTGCTTGAACCAACTCGGCCAGCTTGTTCATGGGCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCT‑GGATTTCCCGGTCGCGGTCCAGTTCGTAAGGCAGGGTCAGCACCTGCAGgc > 5:99400/1‑149 (MQ=255) gCTTGAACCAACTCGGCCAGCTTGTTCATGGGCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCT‑GGATTTCCCGGTCGCGGTCCAGTTCGTAAGGCAGGGTCAGCACCTGCAGGCGCgg < 2:51969/147‑1 (MQ=255) gCTTGAACCAACTCGGCCAGCTTGTTCATGGGCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCT‑GGATTTCCCGGTCGCGGTCCAGTTCGTAAGGCAGGGTCAGCACCTGCAGGCGCgg > 1:51969/1‑147 (MQ=255) cTTGAACCAACTCGGCCAGCTTGTTCATGGGCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCT‑GGATTTCCCGGTCGCGGTCCAGTTCGTAAGGCAGGGTCAGCACCTGCAGGCGCGGGcc > 1:375912/1‑149 (MQ=255) gAACCAACTCGGCCAGCTTGTTCATGGGCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCT‑GGATTTCCCGGTCGCGGTCCAGTTCGTAAGGCAGGGTCAGCACCTGCAGGCGCGGGCCt < 7:331509/147‑1 (MQ=255) ccAACTCGGCCAGCTTGTTCATGGGCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCT‑GGATTTCCCGGTCGCGGTCCAGTTCGTAAGGCAGGGTCAGCACCTGCAGGCGCGGGCCTTCGAg < 2:25943/149‑1 (MQ=255) cAACTCGGCCAGCTTGTTCATGGGCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCT‑GGATTTCCCGGTCGAGGTCCAGTTCGTAAGGAAGGGTCAGCACCTGCAGGCGCGGGCCTTCGAgg > 4:224469/1‑149 (MQ=255) aCTCGGCCAGCTTGTTCATGGGCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCT‑GGATTTCCCGGTCGCGGTCCAGTTCGTAAGGCAGGGTCAGCACCTGCAGGCGCGGGCCTTCGAGGCt > 7:165242/1‑149 (MQ=255) aCTCGGCCAGCTTGTTCATGGGCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCT‑GGATTTCCCGGTCGCGGTCCAGTTCGTAAGGCAGGGTCAGCACCTGCAGGCGCGGGCCTTCGAGGCt > 4:182458/1‑149 (MQ=255) gTTCATGGGCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCT‑GGATTTCCCGGTCGCGGTCCAGTTCGTAAGGCAGGGTCAGCACCTGCAGGCGCGGGCCTTCGAGGCTGCCcaggtgcag < 2:84998/148‑1 (MQ=255) ttCATGGGCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCGACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCT‑GGATTTCCCGGTCGCGGTCCAGTTCGTAAGGCAGGGTCAGCACCTGCAGGCGCGGGCCTTCGAGGCTGCCcaggtgcaggt < 2:220722/149‑1 (MQ=255) gggCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCT‑GGATTTCCCGGTCGCGGTCCAGTTCGTAAGGCAGGGTCAGCACCTGCAGGCGCGGGCCTTCGAGGCTGCCCAGGTGCAGGTGGCCg > 3:95437/1‑149 (MQ=255) gCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCT‑GGATTTCCCGGTCGCGGTCCAGTTCGTAAGGCAGGGTCAGCACCTGCAGGCGCGGGCCTTCGAGGCTGCCCAGGTGCAGGTGGCCGTc > 4:414051/1‑149 (MQ=255) cATGTCTACCGCAGTGGTGGGGCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCT‑GGATTTCCCGGTCGCGGGCCAGTTCGTAAGGCAGGGTCAGCACCTGCAGGCGCGGGCCTTCGAGGCTGCCCAGGTGCAGGTGGCCGTCt < 3:23932/149‑1 (MQ=255) tCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCT‑GGATTTCCCGGTCGCGGTCCAGTTCGTAAGGCAGGGTCAGCACCTGCAGGCGCGGGCCTTCGAg < 8:399501/120‑1 (MQ=255) tCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCT‑GGATTTCCCGGTCGCGGTCCAGTTCGTAAGGCAGGGTCAGCACCTGCAGGCGCGGGCCTTCGAg > 7:399501/1‑120 (MQ=255) tACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCT‑GGATTTCCCGGTCGCGGTCCAGTTCGTAAGGCAGGGTCAGCACCTGCAGGCGCGGGCCTTCGAGGCTGCCCAGGTGCAGGTGGCCGTCTTCCAcc > 7:333780/1‑149 (MQ=255) ccGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCT‑GGATTTCCCGGTCGCGGTCCAGTTCGTAAGGCAGGGTCAGCACCTGCAGGCGCGGGCCTTCGAGGCTGCCCAGGTGCAGGTGGCCGTCTTCCACCGc > 7:314624/1‑149 (MQ=255) cGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCT‑GGATTTCCCGGTCGCGGTCCAGTTCGTAAGGCAGGGTCAGCACCTGCAGGCGCGGGCCTTCGAGGCTGCCCAGGTGCAGGTGGCCGTCTTCCACCGc > 2:159306/1‑148 (MQ=255) gtgCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCT‑GGATTTCCCGGTCGCGGTCCAGTTCGTAAGGCAGGGTCAGCACCTGCAGGCGCGGGCCTTCGAGGCTGCCCAGGTGCAGGTGGCCGTCTTCCACCGCCTCGGCGCtta < 5:213176/149‑3 (MQ=255) tgCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCT‑GGATTTCCCGGTCGCGGTCCAGTTCGTAAGGCAGGGTCAGCACCTGCAGGCGCGGGCCTTCGAGGCTGCCCAGGTGCAGGTGGCCGTCTTCCACCGCCTCGGCGCTGAg < 2:375912/149‑1 (MQ=255) gCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCT‑GGATTTCCCGGTCGCGGTCCAGTTCGTAAGGCAGGGTCAGCACCTGCAGGCGCGGGCCTTCGAGGCTGCCCAGGTGCAGGTGGCCGTCTTCCACCGCCTCGGCGCTGAg > 1:350381/1‑148 (MQ=255) cctgCCCCACCCCTGTGGCGGGGCAGGCTGGTCAGCGCT‑GGATTTCCCGGTCGCGGTCCAGTTCGTAAGGCAGGGTCAGCACCTGCAGGCGCGGGCCTTCGAGGCTGCCCAGGTGCAGGTGGCCGTCTTCCACCGCCTCGGCGCTGAg > 5:404312/4‑148 (MQ=255) ctgCCCCACCCCTGTGGCGGGGCAGGCTGGTCAGCGCT‑GGATTTCCCGGTCGCGGTCCAGTTCGTAAGGCAGGGTCAGCACCTGCAGGCGCGGGCCTTCGAGGCTGCCCAGGTGCAGGTGGCCGTCTTCCACCGCCTCGGCGCTGAGCa > 4:49894/3‑149 (MQ=255) gCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCT‑GGATTTCCCGGTCGCGGTCCAGTTCGTAAGGCAGGGTCCGCACCTGCAGGCGCGGGCCTTCTATGCTGCCCAGGTGCAGGTGGCCGTCTTACACCGCCTCTGCCCTGAGCAcc > 3:225384/1‑149 (MQ=255) gCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCT‑GGATTTCCCGGTCGCGGTCCAGTTCGTAAGGCAGGGTCAGCACCTGCAGGCGCGGGCCTTCGAGGCTGCCCAGGTGCAGGTGGCCGTCTTCCACCGCCTCGGCGCTGAGCAcc > 6:35995/1‑149 (MQ=255) ccccGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCT‑GGATTTCCCGGTCGCGGTCCAGTTCGTAAGGCAGGGTCAGCACCTGCAGGCGCGGGCCTTCGAGGCTGCCCAGGTGCAGGTGGCCGTCTTCCACCGCCTCGGCGCTGAGCACcg > 2:172989/1‑149 (MQ=255) cccGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCT‑GGATTTCCCGGTCGCGGTCCAGTTCGTAAGGCAGGGTCAGCACCTGCAGGCGCGGGCCTTCGAGGCTGCCCAGGTGCAGGTGGCCGTCTTCCACCGCCTCGGCGCTGAGCACcgc > 8:146629/1‑149 (MQ=255) cccGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCT‑GGATTTCCCGGTCGCGGTCCAGTTCGTAAGGCAGGGTCAGCACCTGCAGGCGCGGGCCTTCGAGGCTGCCCAGGTGCAGGTGGCCGTCTTCCACCGCCTCGGCGCTGAGCACcgc > 2:407919/1‑149 (MQ=255) cccGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCT‑GGAATTCCCGGTCGCGGTCCAGTTCGTAAGGCAGGGTCAGCACCTGCAGGCGCGGGCCTTCGAGGCTGCCCAGGTGCAGGTGGCCGTCTTCCACCGCCTCGGCGCTGAGCACcgc > 7:146067/1‑149 (MQ=255) ccGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCT‑GGATTTCCCGGTCGCGGTCCAGTTCGTAAGGCAGGGTCAGCACCTGCAGGCGCGGGCCTTCGAGGCTGCCCAGGTGCAGGTGGCCGTCTTCCACCGCCTCGGCGCTGAGCACcgc > 3:37921/1‑148 (MQ=255) cGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCT‑GGATTTCCCGGTCGCGGTCCAGTTCGTAAGGCAGGGTCAGCACCTGCAGGCGCGGGCCTTCGAGGCTGCCCAGGTGCAGGTGGCCGTCTTCCACCGCCTCGGCGCTGAGCACCGCGa > 3:393795/1‑149 (MQ=255) | TTCCGCTGCCTCGCGGATGCTCAAGGCAACCTCGGGCAGGGTTGGCAGGACCAGGTCATCCTTTTCGATGGCGTCGAGCAATTGTGCTTGAACCAACTCGGCCAGCTTGTTCATGGGCATGTCTACCGCAGTGGTGGTGCGGCCCCGCCACAGGGGTGGGGCAGGCTGGTCAGCGCT‑GGATTTCCCGGTCGCGGTCCAGTTCGTAAGGCAGGGTCAGCACCTGCAGGCGCGGGCCTTCGAGGCTGCCCAGGTGCAGGTGGCCGTCTTCCACCGCCTCGGCGCTGAGCACCGCGA > NC_002947/1623237‑1623530 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |