Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,693,686 | C→G | 7.3% | P52R (CCT→CGT) ‡ | PP_1489 → | CheW domain‑containing protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,693,686 | 0 | C | G | 7.3% | 210.8 / 5.3 | 68 | P52R (CCT→CGT) ‡ | PP_1489 | CheW domain‑containing protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (34/29); new base G (2/3); total (36/32) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.60e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.15e-01 |
TTGCAACTGCGCACCGCTCGGGCGGCGAACACCGAGGGGGCGTTGTACCTGCAGTTTCGCATCAGAGCGCAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTC‑AGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCG‑CCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCC > NC_002947/1693541‑1693832 | ttGCAACTGCGCACCGCTCGGGCGGCGAACACCGAGGGGGCGTTGTACCTGCAGTTTCGCATCAGAGCGCAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTC‑AGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCAcctgc > 8:54591/1‑149 (MQ=255) ttGCAACTGCGCACCGCTCGAGCGGCGAACACCGAGGGGGCGTTGTACCTGCAGTTTCGCATCAGAGCGCAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTC‑AGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCAcctgc > 7:291116/1‑149 (MQ=255) tGCAACTGCGCACCGCTCGGGCGGCGAACACCGAGGGGGCGTTGTACCTGCAGTTTCGCATCAGAGCGCAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTC‑AGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCAcctgcc > 7:194753/1‑149 (MQ=255) gCAACTGCGCACCGCTCGGGCGGCGAACACCGAGGGGGCGTTGTACCTGCAGTTTCGCATCAGAGCGCAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTC‑AGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCAcctgcct > 4:276112/1‑149 (MQ=255) cAACTGCGCACCGCTCGGGCGGCGAACACCGAGGGGGCGTTGTACCTGCAGTTTCGCATCAGAGCGCAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTC‑AGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCAcctgcctg < 1:406741/149‑1 (MQ=255) aaCTGCGCACCGCTCGGGCGGCGAACACCGAGGGGGCGTTGTACCTGCAGTTTCGCATCAGAGCGCAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTC‑AGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTgg > 7:194235/1‑149 (MQ=255) aaCTGCGCACCGCTCGGGCGGCGAACACCGAGGGGGCGTTGTACCTGCAGTTTCGCATCAGAGCGCAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTC‑AGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTgg > 4:137489/1‑149 (MQ=255) aCTGCGCACCGCTCGGGCGGCGAACACCGAGGGGGCGTTGTACCTGCAGTTTCGCATCAGAGCGCAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTC‑AGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCAGGTGCCTggg < 5:360172/149‑1 (MQ=255) cTGCGCACCGCTCGGGCGGCGAACACCGAGGGGGCGTTGTACCTGCAGTTTCGCATCAGAGCGCAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTC‑AGCTGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCAGGTGCCTgggc < 4:118145/149‑2 (MQ=255) cTGCGCACCGCTCGGGCGGCGAACACCGAGGGGGCGTTGTACCTGCAGTTTCGCATCAGAGCGCAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTC‑AGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCAGGTGCCTgggc < 1:269600/149‑2 (MQ=255) cACCGCTCGGGCGGCGAACACCGAGGGGGCGTTGTACCTGCAGTTTCGCATCAGAGCGCAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTC‑AGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCgg < 1:55079/149‑1 (MQ=255) gcggcgAACACCGAGGGGGCGTTGTACCTGCAGTTTCGCATCAGAGCGCAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTC‑AGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCG‑c < 5:332446/149‑1 (MQ=255) gcggcgAACACCGAGGGGGCGTTGTACCTGCAGTTTCGCATCAGAGCGCAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTC‑AGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCG‑c < 3:168087/149‑1 (MQ=255) cgAACACCGAGGGGGCGTTGTACCTGCAGTTTCGCATCAGAGCGCAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTC‑AGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCG‑CCCAt > 4:315012/1‑149 (MQ=255) cacCGAGGGGGCGTTGTACCTGCAGTTTCGCATCAGAGCGCAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTC‑AGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCG‑CCCATCGTg < 3:137489/149‑1 (MQ=255) ggggCGTTGTACCTGCAGTTTCGCATCAGAGCGCAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTC‑AGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCG‑CCCATCGTGGCCAGCt < 6:387249/149‑1 (MQ=255) gTTGTACCTGCAGTTTCGCATCAGAGCGCAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTC‑AGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCG‑CCCATCGTGGCCAGCTGGTTc < 8:291116/149‑1 (MQ=255) ttGTACCTGCAGTTTCGCATCAGAGCGCAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTC‑AGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCG‑CCCATCGTGGCCAGCTGGTTcc > 1:90532/1‑149 (MQ=255) gTACCTGCAGTTTCGCATCAGAGCGCAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTC‑AGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCG‑CCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCgg > 7:109462/1‑149 (MQ=255) tACCTGCAGTTTCGCATCAGAGCGCAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTC‑AGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCG‑CCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCgg < 8:109462/148‑1 (MQ=255) ccTGCAGTTTCGCATCAGAGCGCAGCGGTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTC‑AGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCG‑CCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTc < 4:291122/148‑1 (MQ=255) cTGCAGTTTCGCATCAGAGCGCAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTC‑AGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCG‑CCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCAt < 8:194753/149‑1 (MQ=255) aGTTTCGCATCAGAGCGCAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTC‑AGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCG‑CCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGAc > 1:380077/1‑149 (MQ=255) tttCGCATCAGAGCGCAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTC‑AGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCG‑CCCATCGTGGCCAGCTGGCTCCGGTCATCAACCt > 1:237077/1‑149 (MQ=255) gCATCAGAGCGCAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTC‑AGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCG‑CCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTgc < 8:194235/148‑1 (MQ=255) tCAGAGCGCAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTC‑AGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCG‑CCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTgccgcc < 3:315012/149‑1 (MQ=255) gagCGCAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTC‑AGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCG‑CCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCtt > 6:196764/1‑148 (MQ=255) gcgcAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTC‑AGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGa < 1:90682/149‑1 (MQ=255) gcgcAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTC‑AGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCG‑CCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCAGCCTTGAg > 5:144475/1‑149 (MQ=255) aGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTC‑AGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCG‑CCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCttt > 5:206798/1‑149 (MQ=255) aGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTC‑AGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCG‑CCCATCGTGGCCAGCCGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCttt > 7:241566/1‑149 (MQ=255) gCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTC‑AGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCG‑CCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTg < 5:40557/149‑1 (MQ=255) ccTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTC‑AGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCG‑CCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCcgg > 8:262401/1‑149 (MQ=255) cagAGCCTGAACGAGGTGATCGAAGTCTTGCCGCGTC‑AGCCGCTCAAGCCGATCCCCCACGCACCTGCCTGGGACGCGGGCATTCTCC‑CCAAACATGGCAAGCTCGTTCCGGTCAACGACCTTTCCGCATTGAGCTTTGGCAAGAcggc > 6:428528/3‑149 (MQ=255) aGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTC‑AGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCG‑CCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCcggcgg < 4:176178/148‑1 (MQ=255) aGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTC‑AGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCG‑CCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCcggcg < 7:54591/147‑1 (MQ=255) cGTGCACGAGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTC‑AGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCG‑CCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCATTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTg > 6:316682/1‑148 (MQ=255) cACGAGGTGATCGAAGTGTTTCCGCGTC‑AGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCG‑CCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTTCAAc < 2:314588/148‑1 (MQ=255) aCGAGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTC‑AGCTGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCG‑CCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACg > 4:190885/1‑148 (MQ=255) aCGAGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTC‑AGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCG‑CCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACg > 3:417928/1‑148 (MQ=255) gAGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTCAAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCG‑CCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCa > 1:4971/1‑149 (MQ=255) aGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTC‑AGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCgg < 7:112628/66‑1 (MQ=255) aGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTC‑AGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCgg > 8:112628/1‑66 (MQ=255) gTGATCGAAGTGTTGCCGCGTC‑AGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCG‑CCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAg > 8:270820/1‑149 (MQ=255) aTCGAAGTGTTGCCGCGTC‑AGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCG‑CCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCAc > 8:288086/1‑149 (MQ=255) aaGTGTTGCCGCGTC‑AGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCG‑CCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGc > 4:275891/1‑149 (MQ=255) tgtTGCCGCGTC‑AGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCG‑CCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCctg < 3:276112/149‑1 (MQ=255) tgtTGCCGCGTC‑AGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCG‑CCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCctg < 7:270820/149‑1 (MQ=255) ttGCCGCGTC‑AGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCG‑CCCATCGTGGCCAGCTGGGTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCctggt < 7:369623/149‑1 (MQ=255) gCCGCGTC‑AGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCG‑CCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCctggtgc > 3:57795/1‑149 (MQ=255) ccccgTC‑ACACGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCAACTGCCTGGCTCGATGGCATTCTCG‑CCCAAAGTAGCAAGATGGTACCGGTCATCGACCTAGCCGCCATGAGCTTTGGCCACCCCGCCGTGCAACACACCAGCACCCGCcaggtgct > 6:218302/4‑149 (MQ=255) gTC‑AGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCG‑CCCATCGTGGCCAGCCGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCC‑GCC‑TCGGT‑‑AGTGCACCAGCACCAGGCgggtgctggtgcgtt < 8:241566/149‑4 (MQ=25) c‑AGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCG‑CCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCa > 4:366993/1‑149 (MQ=255) c‑AGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCG‑CCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCa > 1:212434/1‑149 (MQ=255) aGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCG‑CCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCAc > 5:118918/1‑149 (MQ=255) gCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCG‑CCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCAc > 6:7915/1‑148 (MQ=255) gCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCG‑CCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCAc > 3:46559/1‑148 (MQ=255) gCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCG‑CCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTAcc > 2:82032/1‑149 (MQ=255) tCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCG‑CCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTAcc > 8:303107/1‑147 (MQ=255) gCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCG‑CCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAggcg < 5:316682/149‑1 (MQ=255) gATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCG‑CCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGcc > 3:101984/1‑149 (MQ=255) aTCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCG‑CCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCt < 6:403753/149‑1 (MQ=255) gacccAGGCAGGTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCG‑CCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTg > 1:225128/3‑148 (MQ=255) gacccAGGCAGGTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCG‑CCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTg > 1:418575/3‑148 (MQ=255) cccAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCG‑CCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAg > 3:226620/1‑149 (MQ=255) cccAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCG‑CCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAg > 8:258459/1‑149 (MQ=255) cccAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCG‑CCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAg < 4:101984/149‑1 (MQ=255) ccAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCG‑CCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGc > 6:173229/1‑149 (MQ=255) aGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCG‑CCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCtt < 5:7915/149‑1 (MQ=255) ggCCCCTGCCTGGGTCGCGGCCATTCTCG‑CCCATCGTGGCCAGCGGGTGCCGGTCATCGCCCTTGCCGCCTTGCGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTg < 8:362418/149‑1 (MQ=255) ggCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCG‑CCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTg < 2:380077/149‑1 (MQ=255) cACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCG‑CCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGGCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCTACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGc < 5:428528/149‑1 (MQ=255) aCCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCG‑CCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGcc < 4:46559/149‑1 (MQ=255) ctgcctgGGTCGCGGGCATTCTCG‑CCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCa > 5:166946/1‑121 (MQ=255) ctgcctgGGTCGCGGGCATTCTCG‑CCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCa < 6:166946/121‑1 (MQ=255) | TTGCAACTGCGCACCGCTCGGGCGGCGAACACCGAGGGGGCGTTGTACCTGCAGTTTCGCATCAGAGCGCAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTGTTGCCGCGTC‑AGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCG‑CCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCC > NC_002947/1693541‑1693832 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |