| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,835,637 | A→G | 7.3% | intergenic (‑79/+53) | PP_1639 ← / ← yohC | SprT family protein/inner membrane protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,835,637 | 0 | A | G | 7.3% | 182.9 / 4.7 | 69 | intergenic (‑79/+53) | PP_1639/yohC | SprT family protein/inner membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (31/32); new base G (3/2); total (34/35) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.82e-01 | |||||||||||
AGCGGCGTTTGAAAAAGGCTTCGGCTTGCTGGTAACAGGTTTCGACGCGTTGTTTGAGCTGCTCGGGCATGGCGGGGCGGTTCTCCTGACCAGGCATTATGCCGCAAGCGCAGGTGGCTTGCCGAGTCACCGGTCAGCGCACAGCCAGAGGCCGCCTTGCGGCGGCCCCTGGTTGATGCCCCAGTGTTGGTTCGGTCTGTTCTAGTTGGTGTAGACGGGCCCCACGCCCAGTCCCCAGATAATCACGGTAGCGGCCATGATTGCCACCAGTACTACCAAGCCCACTGCCAGCACC > NC_002947/1835489‑1835783 | aGCGGCGTTTGAAAAAGGCTTCGGCTTGCTGGTAACAGGTTTCGACGCGTTGTTTGAGCTGCTCGGGCATGGCGGGGCGGTTCTCCTGACCAGGCATTATGCCGCAAGCGCAGGTGGCTTGCCGAGTCACCGGTCAGCGCACAGCCaga < 7:8954/149‑1 (MQ=255) gcggcgTTTGAAAAAGGCTTCGGCTTGCTGGTAACAGGTTTCGACGCGTTGTTTGAGCTGCTCGGGCATGGCGGGGCGGTTCTCCTGACCAGGCATTATGCCGCAAGCGCAGGTGGCTTGCCGAGTCACCGGTCAGCGCACAGCCagag < 5:242038/149‑1 (MQ=255) cggcgTTTGAAAAAGGCTTCGGCTTGCTGGTAACAGGTTTCGACGCGTTGTTTGAGCTGCTCGTGCATGGCGGGGCGGTTCTCCTGACCAGGCATTATGCCTCAAGCGCAGGTGGCTTGCCGAGTCACCGGTCAGCGCACAGCCAGAgg < 6:286612/149‑1 (MQ=255) cggcgTTTGAAAAAGGCTTCGGCTTGCTGGTAACAGGTTTCGACGCGTTGTTTGAGCTGCTCGGGCATGGCGGGGCGGTTCTCCTGACCAGGCATTATGCCGCAAGCGCAGGTGGCTTGCCGAGTCACCGGTCAGCGCACAGCCAGAgg < 8:261340/149‑1 (MQ=255) cggcgTTTGAAAAAGGCTTCGGCTTGCTGGTAACAGGTTTCGACGCGTTGTTTGAGCTGCTCGGGCATGGCGGGGCGGTTCTCCTGACCAGGCATTATGCCGCAAGCGCAGGTGGCTTGCCGAGTCACCGGTCAGCGCACAGCCAGAgg > 4:267951/1‑149 (MQ=255) cggcgTTTGAAAAAGGCTTCGGCTTGCTGGTAACAGGTTTCGACGCGTTGTTTGAGCTGCTCGGGCATGGCGGGGCGGTTCTCCTGACCAGGCATTATGCCGCAAGCGCAGGTGGCTTGCCGAGTCACCGGTCAGCGCACAGCCAGAgg < 1:49155/149‑1 (MQ=255) gAAAAAGGCTTCGGCTTGCTGGTAACAGGTTTCGACGCGTTGTTTGAGCTGCTCGGGCATGGCGGGGCGGTTCTCCTGACCAGGCATTATGCCGCAAGCGCAGGTGGCTTGCCGAGTCACCGGTCAGCGCACAGCCAGAGGCCGCCTTg > 7:386275/1‑149 (MQ=255) aaaaaGGCTTCGGCTTGCTGGTAACAGGTTTCGACGCGTTGTTTGAGCTGCTCGGGCATGGCGGGGCGGTTCTCCTGACCAGGCATTATGCCGCAAGCGCAGGTGGCTTGCCGAGTCACCGGTCAGCGCACAGCCAGAGGCCGCCTTgc > 1:173034/1‑149 (MQ=255) aaaaaGGCTTCGGCTTGCTGGTAACAGGTTTCGACGCGTTGTTTGAGCTGCTCGGGCATGGCGGGGCGGTTCTCCTGACCAGGCATTATGCCGCAAGCGCAGGTGGCTTGCCGAGTCACCGGTCAGCGCACAGCCAGAGGCCGCCTTgc < 3:19828/149‑1 (MQ=255) aaaGGCTTCGGCTTGCTGGTAACAGGTTTCGACGCGTTCTTTGAGCTGCTCGGGCATGGCGGGGCGGTTCTCCTGACCAGGCATTATGCCGCAAGCGCAGGTGGCTTGCCGAGTCACCGGTCAGCGCACAGCCAGGGgccgccgcaagg > 5:246598/1‑143 (MQ=255) ttCGGCTTGCTGGTAACAGGTTTCGACGCGTTGTTTGAGCTGCTCGGGCATGGCGGGGCGGTTCTCCTGACCAGGCATTATGCCGCAAGCGCAGGTGGCTTGCCGAGTCACCGGTCAGCGCACAGCCAGAGGCCGCCTTGCGGCGGccc > 3:113012/1‑149 (MQ=255) ggCTTGCTGGTAACAGGTTTCGACGCGTTGTTTGAGCTGCTCGGGCATGGCGGGGCGGTTCTCCTGACCAGGCATTATGCCGCAAGCGCAGGTGGCTTGCCGAGTCACCGGTCAGCGCACAGCCAGAGGCCGCCTTGCGGCGGCCCCt < 8:40823/148‑1 (MQ=255) ggCTTGCTGGTAACAGGTTTCGACGCGTTGTTTGAGCTGCTCGGGCATGGCGGGGCGGTTCTCCTGACCAGGCATTATGCCGCAAGCGCAGGTGGCTTGCCGAGTCACCGGTCAGCGCACAGCCAGAGGCCGCCTTGCGGCGGCCCCt < 3:267951/148‑1 (MQ=255) gCTTGCTGGTAACAGGTTTCGACGCGTTGTTTGAGCTGCTCGGGCATGGCGGGGCGGTTCTCCTGACCAGGCATTATGCCGCAAGCGCAGGTGGCTTGCCGAGTCACCGGTCAGCGCACAGCCAGGGGCCGCCGCAAGGCGGCCTCTgg < 6:246598/149‑1 (MQ=255) gCTTGCTGGTAACAGGTTTCGACGCGTTGTTTGAGCTGCTCGGGCATGGCGGGGCGGTTCTCCTGACCAGGCATTATGCCGCAAGCGCAGGTGGCTTGCCGAGTCACCGGTCAGCGCACAGCCAGAGGCCGCCTTGCGGCGGCCCCTgg < 1:18291/149‑1 (MQ=255) cTTGCTGGTAACAGGTTTCGACGCGTTGTTTGAGCTGCTCGGGCATGGCGGGGCGGTTCTCCTGACCAGGCATTATGCCGCAAGCGCAGGTGGCTTGCCGAGTCACCGGTCAGCGCACAGCCAGAGGCCGCCTTGCGGCGGCCCCTGGt < 5:424414/149‑1 (MQ=255) gtGCTGGTCACAGGTCTCGACTCGGTGTTTGAGCTGCTCGGGCATGGCGGGGCGGTTCTCCTGACCAGGCATTATGCCGCAAGCACAGGTGGCTTGCCGAGTCACCGGTCAGCGCACAGCCAGAGGCCGCCTTGCGGCGGCCCCTGGtt < 8:180716/148‑1 (MQ=255) gCTGGTAACAGGGTTCGACGCGTTGTTTGAGCTGCTCGGGCAGGGCGGGGCGGTTCTCCTGACCAGGCATTATGCCGCAAGCGCAGGTGGCTTGCCGAGTCACCGGTCAGCGCACAGCCAGGGGCCGCCGCAAGGCGGCCTCTggct < 7:200703/147‑3 (MQ=255) gTAACAGGTTTCGACGCGTTGTTTGAGCTGCTCGGGCATGGCGGGGCGGTTCTCCTGACCAGGCATTATGCCGCAAGCGCAGGTGGCTTGCCGAGTCACCGGTCAGCGCACAGCCAGAGGCCGCCTTGCGGCGGCCCCTGGTTGATGcc < 1:236890/149‑1 (MQ=255) gTAACAGGTTTCGACGCGTTGTTTGAGCTGCTCGGGCATGGCGGGGCGGTTCTCCTGACCAGGCATTATGCCGCAAGCGCAGGTGGCTTGCCGAGTCACCGGTCAGCGCACAGCCAGAGGCCGCCTTGCGGCGGCCCCTGGTTGATGc < 4:173448/148‑1 (MQ=255) aaCAGGTTTCGACGCGTTGTTTGAGCTGCTCGGGCATGGCGGGGCGGTTCTCCTGACCAGGCATTATGCCGCAAGCGCAGGTGGCTTGCCGAGTCCCCGGTCAGCGCACAGCCAGAGGCCGCCTTGCGGCGGCCCCTGGTTGATGccc > 6:210165/1‑148 (MQ=255) aGGTTTCGACGCGTTGTTTGAGCTGCTCGGGCATGGCGGGGCGGTTCTCCTGACCAGGCATTATGCCGCAAGCGCAGGTGGCTTGCCGAGTCACCGGTCAGCGCACAGCCAGAGGCCGCCTTGCGGCGGCCCCTGGTTGATGCCCCAgt > 5:175428/1‑149 (MQ=255) gACGCGTTGTTTGAGCTGCTCGGGCATGGCGGGGCGGTTCTCCTGACCAGGCATTATGCCGCAAGCGCAGGTGGCTTGCCGAGTCACCGGTCAGCGCACAGCCAGAGGCCGCCTTGCGGCGGCCCCTGGTTGATGCCCCAGTGTTGGtt > 1:261899/1‑149 (MQ=255) gACGCGTTGTTTGAGCTGCTCGGGCATGGCGGGGCGGTTCTCCTGACCAGGCATTATGCCGCAAGCGCAGGTGGCTTGCCGAGTCACCGGTCAGCGCACAGCCAGAGGCCGCCTTGCGGCGGCCCCTGGTTGATGCCCCAGTGTTGGtt > 1:188436/1‑149 (MQ=255) aCGCGTTGTTTGAGCTGCTCGGGCATGGCGGGGCGGTTCTCCTGACCAGGCATTATGCCGCAAGCGCAGGTGGCTTGCCGAGTCACCGGTCAGCGCACAGCCAGAGGCCGCCTTGCGGCGGCCCCTGGTTGATCCCCCAGTGTTggcgc > 8:371739/1‑146 (MQ=255) cgcgTTGTTTGAGCTGCTCGGGCATGGCGGGGCGGTTCTCCTGACCAGGCATTATGCCGCAAGCGCAGGTGGCTTGCCGAGTCACCGGTCAGCGCACAGCCAGAGGCCGCCTTGCGGCGGCCCCTGGTTGATGCCCCAGTGTTGGTTCg < 3:56941/149‑1 (MQ=255) gcgTTGTTTGAGCTGCTCGGGCATGGCGGGGCGGTTCTCCTGACCAGGCATTATGCCGCAAGCGCAGGTGGCTTGCCGAGTCACCGGTCAGCGCACAGCCAGAGGCCGCCTTGCGGCGGCCCCTGGTTGa < 6:243532/130‑1 (MQ=255) gcgTTGTTTGAGCTGCTCGGGCATGGCGGGGCGGTTCTCCTGACCAGGCATTATGCCGCAAGCGCAGGTGGCTTGCCGAGTCACCGGTCAGCGCACAGCCAGAGGCCGCCTTGCGGCGGCCCCTGGTTGa > 5:243532/1‑130 (MQ=255) gttgttTGAGCTGCTCGGGCATGGCGGGGCGGTTCTCCTGACCAGGCATTATGCCGCAAGCGCAGGTGGCTTGCCGAGTCACCGGTCAGCGCACAGCCAGAGGCCGCCTTGCGGCGGCCCCTGGTTGATGCCCCAGTGTTGGTTCGGTc > 3:257428/1‑149 (MQ=255) gttgttTGAGCTGCTCGGGCATGGCGGGGCGGTTCTCCTGACCAGGCATTATGCCGCAAGCGCAGGTGGCTTGCCGAGTCACCGGTCAGCGCACAGCCAGAGGCCGCCTTGCGGCGGCCCCTGGTTGATGCCCCAGTGTTGGTTCGGTc > 7:223365/1‑149 (MQ=255) aGCTGCTCGGGCATGGCGGGGCGGTTCTCCTGACCAGGCATTATGCCGCAAGCGCAGGTGGCTTGCCGAGTCACCGGTCAGCGCACAGCCAGAGGCCGCCTTGCGGCGGCCCCTGGTTGATGCCCCAGTGTTGGTTCGGTCTGTTCTa < 6:276994/148‑1 (MQ=255) ctCGGGCATGGCGGGGCGGTTCTCCTGACCAGGCATTATGCCGCAAGCGCAGGTGGCTTGCCGAGTCACCGGTCAGCGCACAGCCAGAGGCCGCCTTGCGGCGGCCCCTGGTTGATGCCCCAGTGTTGGTTCGGTCTGTTCTAGTTgg < 4:113012/148‑1 (MQ=255) gggCATGGCGGGGCGGTTCTCCTGACCAGGCATTATGCCGCAAGCGCAGGTGGCTTGCCGAGTCACCGGTCAGCGCACAGCCAGAGGCCGCCTTGCGGCGGCCCCTGGTTGATGCCCCAGTGTTGGTTCg > 1:312057/1‑130 (MQ=255) gggCATGGCGGGGCGGTTCTCCTGACCAGGCATTATGCCGCAAGCGCAGGTGGCTTGCCGAGTCACCGGTCAGCGCACAGCCAGAGGCCGCCTTGCGGCGGCCCCTGGTTGATGCCCCAGTGTTGGTTCg < 2:312057/130‑1 (MQ=255) gggCATGGCGGGGCGGTTCTCCTGACCAGGCATTATGCCGCAAGCGCAGGTGGCTTGCCGAGTCACCGGTCAGCGCACAGCCAGAGGCCGCCTTGCGGCGGCCCCTGGTTGATGCCCCAGTGTTGGTTCGGTCTGTTCTAGTTGgtg < 1:277612/147‑1 (MQ=255) gggCATGGCGGGGCGGGTCTCCTTCCCAGGCATTATGCCGCAAGCGCAGGTGGCTTGCCGAGTCACCGGTCAGCGCACAGCCAGAGGCCGCCTTGCGGCGGCCCCTGGTTGATGCCCCAGTGTTGGTTCGGTCTGTTCTAGTTGgtg < 8:272952/147‑1 (MQ=255) gCATGGCGGGGCGGTTCTCCTGACCAGGCATTATGCCGCAAGCGCAGGTGGCTTGCCGAGTCACCGGTCAGCGCACAGCCAGAGGCCGCCTTGCGGCGGCCCCTGGTTGATGCCCCAGTGTTGGTTCGGTCTGTTCTAGTTGGTGTAGa < 8:386275/149‑1 (MQ=255) aTGGCGGGGCGGTTCTCCTGACCAGGCATTATGCCGCAAGCGCAGGTGGCTTGCCGAGTCACCGGTCAGCGCACAGCCAGAGGCCGCCTTGCGGCGGCCCCTGGTTGATGCCCCAGTGTTGGTTCGGTCTGTTCTAGtt > 1:240734/1‑139 (MQ=255) aTGGCGGGGCGGTTCTCCTGACCAGGCATTATGCCGCAAGCGCAGGTGGCTTGCCGAGTCACCGGTCAGCGCACAGCCAGAGGCCGCCTTGCGGCGGCCCCTGGTTGATGCCCCAGTGTTGGTTCGGTCTGTTCTAGtt < 2:240734/139‑1 (MQ=255) aTGGCGGGGCGGTTCTCCTGACCAGGCATTATGCCGCAAGCGCAGGTGGCTTGCCGAGTCACCGGTCAGCGCACAGCCAGAGGCCGCCTTGCGGCGGCCCCTGGTTGATGCCCCAGTGTTGGTTCGGTCTGTTCTAGTTGGTGTAGACg > 1:223089/1‑149 (MQ=255) ggggcggTTCTCCTGACCAGGCATTATGCCGCAAGCGCAGGTGGCTTGCCGAGTCACCGGTCAGCGCACAGCCAGAGGCCGCCTTGCGGCGGCCCCTGGTTGATGCCCCAGTGTTGGTTCGGTCTGTTCTAGTTGGTGTAGACGGGccc < 8:26134/149‑1 (MQ=255) ggggcggTTCTCCTGACCAGGCATTATGCCGCAAGCGCAGGTGGCTTGCCGAGTCACCGGTCAGCGCACAGCCAGAGGCCGCCTTGCGGCGGCCCCTGGTTGATGCCCCAGTGTTGGTTCGGTCTGTTCTAGTTGGTGTAGACGGGccc < 2:223716/149‑1 (MQ=255) gTTCTCCTGACCAGGCATTATGCCGCAAGCGCAGGTGGCTTGCCGAGTCACCGGTCAGCGCACAGCCAGAGGCCGCCTTGCGGCGGCCCCTGGTTGATGCCCCAGTGTTGGTTCGGTCTGTTCTAGTTGGTGTAGACGGGCCCCACGcc < 2:261899/149‑1 (MQ=255) tctcCTGACCAGGCATTATGCCGCAAGCGCAGGTGGCTTGCCGAGTCACCGGTCAGCGCACAGCCAGAGGCCGCCTTGCGGCGGCCCCTGGTTGATGCCCCAGTGTTGGTTCGGTCTGTTCTAGTTGGTGTAGACGGGCCCCACGcc > 3:258837/1‑147 (MQ=255) aCCAGGCATTATGCCGCAAGCGTAGGTGGATTGCCGAGTCACCGGTCAGCGCACAGCCAGAGGCCGCATTGCGGCGGCCCATGGTTGATGCCCCAGTGTTGGTTCGGTGTGTTGTAGTTGGTGTAGACGGGCCCCACGCCCAGTccc > 7:65145/1‑147 (MQ=255) ggCATTATGCCGCAAGCGCAGGTGGCTTGCCGAGTCACCGGTCAGCGCACAGCCAGAGGCCGCCTTGCGGCGGCCCCTGGTTGATGCCCCAGTGTTGGTTCGGTCTGTTCTAGTTGGTGTAGACGGGCCCCACGCCCAGTCCCCAGATa < 1:289394/149‑1 (MQ=255) aTTATGCCGCAAGCGCAGGTGGCTTGCCGAGTCACCGGTCAGCGCACAGCCAGAGGCCGCCTTGCGGCGGCCCCTGGTTGATGCCCCAGTGTTGGTTCGGTCTGTTCTAGTTGGTGTAGACGGGCCCCACGCCCAGTCCCCAGATAAt > 5:330516/1‑148 (MQ=255) aTGCCGCAAGCGCAGGTGGCTTGCCGAGTCACCGGTCAGCGCACAGCCAGAGGCCGCCTTGCGGCGGCCCCTGGTTGATGCCCCAGTGTTGGTTCGGTCTGTTCTAGTTGGTGTAGACGGGCCCCCCGCCCAGTCCCCAGATAATCACg > 7:307596/1‑149 (MQ=255) tGCCGCAAGCGCAGGTGGCTTGCCGAGTCACCGGTCAGCGCACAGCCAGAGGCCGCCTTGCGGCGGCCCCTGGTTGATGCCCCAGTGTTGGTTCGGTCTGTTCTAGTTGGTGTAGACGGGCCCCACGCCCAGTCCCCAGATAATCACgg > 8:281097/1‑149 (MQ=255) cGCAAGCGCAGGTGGCTTGCCGAGTCACCGGTCAGCGCACAGCCAGAGGCCGCCTTGCGGCGGCCCCTGGTTGATGCCCCAGTGTTGGTTCGGTCTGTTCTAGTTGGTGTAGACGGGCCCCACGCCCAGTCCCCAGATAATCACGGTAg > 1:373658/1‑149 (MQ=255) cGCAAGCGCAGGTGGCTTGCCGAGTCACCGGTCAGCGCACAGCCAGAGGCCGCCTTGCGGCGGCCCCTGGTTGATGCCCCAGTGTTGGTTCGGTCTGTTCTAGTTGGTGTAGACGGGCCCCACGCCCAGTCCCCAGATAATCACGGTAg > 1:88725/1‑149 (MQ=255) cAAGCGCAGGTGGCTTGCCGAGTCACCGGTCAGCGCACAGCCAGAGGCCGCCTTGCGGCGGCCCCTGGTTGATGCCCCAGTGTTGGTTCGGTCTGTTCTAGTTGGTGTAGACGGGCCCCACGCCCAGTCCCCAGATAATCACGGTAGCg < 2:88725/149‑1 (MQ=255) aaGCGCAGGTGGCTTGCCGAGTCACCGGTCAGCGCACAGCCAGAGGCCGCCTTGCGGCGGCCCCTGGTTGATGCCCCAGTGTTGGTTCGGTCTGTTCTAGTTGGTGTAGACGGGCCCCACGCCCAGTCCCCAGATAATCACGGTAGCgg > 5:316220/1‑149 (MQ=255) gcgcAGGTGGCTTGCCGAGTCACCGGTCAGCGCACAGCCAGAGGCCGCCTTGCGGCGGCCCCTGGTTGATGCCCCAGTGTTGGTTCGGTCTGTTCTAGTTGGTGTAGACGGGCCCCACGCCCAGTCCCCAGATAATCACGGTAGCGGc > 3:303568/1‑148 (MQ=255) gcAGGTGGCTTGCCGAGTCACCGGTCAGCGCACAGCCAGAGGCCGCCATGCCGCGGCCCCTGGTTGATCCCCCAGTGGTGGTTCGGTCAGATCAAGTTGGTGTAGACGGGCCCCACCCCCAGTCCCCAGATAATCACCCTAGCGGcc > 6:37211/1‑147 (MQ=255) aGGTGGCTTGCCGAGTCACCGGTCAGCGCACAGCCAGAGGCCGCCTTGCGGCGGCCCCTGGTTGATGCCCCAGTGTTGGTTCGGTCTGTTCTAGTTGGTGTAGACGGGCCCCACGCCCAGTCCCCAGATAATCACGGTAGCGGCCATGa < 2:223089/149‑1 (MQ=255) gTGGCTTGCCGAGTCACCGGTCAGCGCACAGCCAGAGGCCGCCTTGCGGCGGCCCCTGGTTGATGCCCCAGTGTTGGTTCGGTCTGTTCTAGTTGGTGTAGACGGGCCCCACGCCCAGTCCCCAGATAATCACGGTAGCGGCCATGAtt < 6:330516/149‑1 (MQ=255) gTGGCTTGCCGAGTCACCGGTCAGCGCACAGCCAGAGGCCGCCTTGCGGCGGCCCCTGGTTGATGACCCAGTGTTGGTTCGGTCTGTTCTAGTTGGTGTAGACGGGCCCCACGCCCAGTCCCCAGATAATCACGGTAGCGGCCATGAtt < 7:281097/149‑1 (MQ=255) tGCCGAGTCACCGGTCAGCGCACAGCCAGAGGCCGCCTTGCGGCGGCCCCTGGTTGATGCCCCAGTGTTGGTTCGGTCTGTTCTAGTTGGTGTAGACGGGCCCCACGCCCAGTCCCCAGATAATCACGGTAGCGGCCATGATTGccac > 7:160781/1‑148 (MQ=255) gAGTCACCGGTCAGCGCACAGCCAGAGGCCGCCTTGCGGCGGCCCCTGGTTGATGCCCCAGTGTTGGTTCGGTCTGTTCTAGTTGGTGTAGACGGGCCCCACGCCCAGTCCCCAGATAATCACGGTAGCGGCCATGATTGCCACCAGta > 8:117095/1‑149 (MQ=255) tCACCGGTCAGCGCACAGCCAGAGGCCGCCTTGCGGCGGCCCCTGGTTGATGCCCCAGTGTTGGTTCGGTCTGTTCTAGTTGGTGTAGACGGGCCCCACGCCCAGTCCCCAGATAATCACGGTAGCGGCCATGATTGCCACCAGtacta < 6:175428/149‑1 (MQ=255) aCCGGTCAGCGCACAGCCAGAGGCCGCCTTGCGGCGGCCCCTGGTTGATGCCCCAGTGTTGGTTCGGTCTGTTCTAGTTGGTGTAGACGGGCCCCACGCCCAGTcccc < 2:308372/108‑1 (MQ=255) aCCGGTCAGCGCACAGCCAGAGGCCGCCTTGCGGCGGCCCCTGGGTGATGCCCCAGTGTTGGTTCGGTCTGTTCTAGTTGGTGTAGACGGGCCCCACGCCCAGTcccc > 1:308372/1‑108 (MQ=255) ccGGTCAGCGCACAGCCAGAGGCCGCCTTGCGGCGGCCCCTGGTTGATGCCCCAGTGTTGGTTCGGTCTGTTCTAGTTGGTGTAGACGGGCCCCACGCCCAGTCCCCAGATAATCACGGTAGCGGCCATGATTGCCACCAGTACTAcc > 4:233504/1‑148 (MQ=255) cGGTCAGCGCACAGCCAGAGGCCGCCTTGCGGCGGCCCCTGGTTGATGCCCGAGTGTTGGTTCGGTCTGTTCTAGTTGGTGTAGACGGGCCCCACGCCCAGTCCCCAGATAATCACGGTAGCGGCCATGATTGCCACCAGTACTACCaa < 2:188436/149‑1 (MQ=255) cGGTCAGCGCACAGCCAGAGGCCGCCTTGCGGCGGCCCCTGGTTGATGCCCCAGTGTTGGTTCGGTCTGTTCTAGTTGGTGTAGACGGGCCCCACGCCCAGTCCCCAGATAATCACGGTAGCGGCCATGATTGCCACCAGTACTAcc > 1:388784/1‑147 (MQ=255) cGGTCAGCGCACAGCCAGAGGCCGCCTTGCGGCGGCCCCTGGTTGATGCCCCAGTGTTGGTTCGGTCTGTTCTAGTTGGTGTAGACGGGCCCCACGCCCAGTCCCCAGATAATCACGGTAGCGGCCATGATTGCCACCAGTACTACCaa < 2:373658/149‑1 (MQ=255) aGCGCACAGCCAGAGGCCGCCTTGCGGCGGCCCCTGGTTGATGCCCCAGTGTTGGTTCGGTCTGTTCTAGTTGGTGTAGACGGGCCCCACGCCCAGTCCCCAGATAATCACGGTAGCGGCCATGATTGCCACCAGTACTACCAAGCCCa > 5:114518/1‑149 (MQ=255) cgcACAGCCAGCGGCCGCCTTGCGGCGGCCCCTGGTTGATGCCCCAGTGTTGGTTCGGTCTGTTCTAGTTGGTGTAGACGGGCCCCACGCCCAGTCCCCAGATAATCACGGTAGCGGCCATGATTGCCACCAGTACTACCAAGCCCACt < 4:258837/149‑1 (MQ=255) accAGGGGCCGCCGCAAGGCGGCCTCTGGTTGATGCCCCAGTGTTGGTTCGGTCTGTTCTAGTTGGTGTAGACGGGCCCCACGCCCAGTCCCCAGATAATCACGGTAGCGGCCATGATTGCCACCAGTACTACCAAGCCCACTGCCAg > 3:60573/2‑148 (MQ=255) ccAGGGGCCGCCGCAAGGCGGCCTCTGGTTGATGCCCCAGTGTTGGTTCGGTCTGTTCTAGTAGATGTAGACGGGCCCCACGCCCAGTCCCCAGATAATCACGGTAGCGGCCATGATTTCCACCAGTACTACCAAGCCCACTGCCAGCa > 1:131184/1‑149 (MQ=255) agagGCCGCCTTGCGGCGGCCCCTGGTTGATGCCCCAGTGTTGGTTCGGTCTGTTCTAGTTGGTGTAGACGGGCCCCACGCCCAGTCCCCAGATAATCACGGTAGCGGCCATGATTGCCACCAGTACTACCAAGCCCACTGCCAGCAcc > 4:166117/1‑149 (MQ=255) | AGCGGCGTTTGAAAAAGGCTTCGGCTTGCTGGTAACAGGTTTCGACGCGTTGTTTGAGCTGCTCGGGCATGGCGGGGCGGTTCTCCTGACCAGGCATTATGCCGCAAGCGCAGGTGGCTTGCCGAGTCACCGGTCAGCGCACAGCCAGAGGCCGCCTTGCGGCGGCCCCTGGTTGATGCCCCAGTGTTGGTTCGGTCTGTTCTAGTTGGTGTAGACGGGCCCCACGCCCAGTCCCCAGATAATCACGGTAGCGGCCATGATTGCCACCAGTACTACCAAGCCCACTGCCAGCACC > NC_002947/1835489‑1835783 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |