| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,886,878 | G→A | 5.6% | A1132V (GCA→GTA) | PP_1695 ← | sodium‑solute symporter/two‑component system sensor histidine kinase/response regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,886,878 | 0 | G | A | 5.6% | 272.8 / 3.1 | 88 | A1132V (GCA→GTA) | PP_1695 | sodium‑solute symporter/two‑component system sensor histidine kinase/response regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (43/40); new base A (2/3); total (45/43) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.73e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.85e-01 | |||||||||||
CTTGCCGGCAGACCTGCTGGAGCGGGCGCTGTCCGATGAGGCGCTGCCCGAGGTAGCGGTTACTGAGCCAGGCTCAGATGGCGATTGAGCAGGGCGCGCAAGGCCGCAGGCTTGACCGGTTTGGCCAGGTAGTCCAGCCCTGATGCATGTACCAGGGCGATGGTTTCCTTGCTGCCGTCGGCGCTGATCACTACACCGGGTACCGGCTCACCCAGCCGTGCTCGAAGCCAGCCCATCAGCCCGGTGCCGGTCTCGCCGTCGTCCAGGTGGTAGTCCACCAATGCCAGGTGC > NC_002947/1886734‑1887024 | cTTGCCGGCAGACCTGCTGGAGCGGGCGCTGTCCGATGAGGCGCTGCCCGAGGTAGCGGTTACTGAGCCAGGCTCAGATGGCGATTGAGCAGGGCGCGCAAGGCCGCAGGCTTGACCGGTTTGGCCAGGTAGTCCAGCCCTGATGCATg > 8:106566/1‑149 (MQ=255) ttGCCGGCAGACCTGCTGGAGCGGGCGCTGTCCGATGAGGCGCTGCCCGAGGTAGCGGTTACTGAGCCAGGCTCAGAT‑GCGATTGAGCAGGGCGCGCAAGGCCGCAGGCTTGACCGGTTTGGCCAGGTAGTCCAGCCCTGATGCATGTa > 4:385386/1‑149 (MQ=255) gCCGGCAGACCTGCTGGAGCGGGCGCTGTCCGATGAGGCGCTGCCCGAGGTAGCGGTTACTGAGCCAGGCTCAGATGGCGATTGAGCAGGGCGCGCAAGGCCGCAGGCTTGACCGGTTTGGCCAGGTAGTCCAGCCCTGATGCATGTa < 7:106566/148‑1 (MQ=255) gCAGACCTGCTGGAGCGGGCGCTGTCCGATGAGGCGCTGCCCGAGGTAGCGGTTACTGAGCCAGGCTCAGCTGGCGATTGAGCAGGGCGCGCAAGGCCGCAGGCTTGACCGGTTTGGCCAGGTAGTCCAGCCCTGCTGCATGTACCAgg > 7:395948/1‑149 (MQ=255) cAGACCTGCTGGAGCGGGCGCTGTCCGATGAGGCGCTGCCCGAGGTAGCGGTTACTGAGCCAGGCTCAGATGGCGATTGAGCAGGGCGCGCAAGGCCGCAGGCTTGACCGGTTTGGCCAGGTAGTCCAGCCCTGATGCATGTACCAggg < 3:325327/149‑1 (MQ=255) gACCTGCTGGAGCGGGCGCTGTCCGATGAGGCGCTGCCCGAGGTAGCGGTTACTGAGCCAGGCTCAGATGGCGATTGAGCAGGGCGCGCAAGGCCGCAGGCTTGACCGGTTTGGCCAGGTAGTCCAGCCCTGGTACATGCATCAGGGct < 4:23887/149‑2 (MQ=255) aCCTGCTGGAGCGGGCGCTGTCCGATGAGGCGCTGCCCGAGGTAGCGGTTACTGAGCCAGGCTCAGATGGCGATTGAGCAGGGCGCGCAAGGCCGCAGGCTTGACCGGTTTGGCCAGGTAGTCCAGCCCTGATGCATGTACCAGGGCGa > 2:53384/1‑149 (MQ=255) ccTGCTGGAGCGGGCGCTGTCCGATGAGGCGCTGCCCGAGGTAGTGGTTACTGAGCCAGGCTCAGATGGCGATTGAGCAGGGCGCGCAAGGCCGCAGGCTTGACCGGTTTGGCCAGGTAGTCCAGCCCTGATGCATGTACCAGGGCGAt > 5:246600/1‑149 (MQ=255) ccTGCTGGAGCGGGCGCTGTCCGATGAGGCGCTGCCCGAGGTAGCGGTTACTGAGCCAGGCTCAGATGGCGATTGAGCAGGGCGCGCAAGGCCGCAGGCTTGACCGGTTTGGCCAGGTAGTCCAGCCCTGATGCATGTACCAGGGCGAt < 4:46449/149‑1 (MQ=255) ctgGAGCGGGCGCTGTCCGATGAGGCGCTGCCCGAGGTAGCGGTTACTGAGCCAGGCTCAGATGGCGATTGAGCAGGGCGCGCAAGGCCGCAGGCTTGACCGGTTTGGCCAGGTAGTCCAGCCCTGGTACATGCATCAGGGctggac < 1:173933/147‑6 (MQ=255) ctgGAGCGGGCGCTGTCCGATGAGGCGCTGCCCGAGGTAGCGGTTACTGAGCCAGGCTCAGATGGCGATTGAGCAGGGCGCGCAAGGCCGCAGGCTTGACCGGTTTGGCCAGGTAGTCCAGCCCTGATGCATGTACCAGGGCGATGGtt > 7:131998/1‑149 (MQ=255) ggAGCGGGCGCTGTCCGATGAGGCGCTGCCCGAGGTAGCGGTTACTGAGCCAGGCTCAGATGGCGATTGAGCAGGGCGCGCAAGGCCGCAGGCTTGACCGGTTTGGCCAGGTAGTCCAGCCCTGATGCATGTACCAGGGCGATGGTTTc > 3:63746/1‑149 (MQ=255) aGCGGGCGCTGTCCGATGAGGCGCTGCCCGAGGTAGCGGTTACTGAGCCAGGCTCAGATGGCGATTGAGCAGGGCGCGCAAGGCCGCAGGCTTGACCGGTTTGGCCAGGTAGTCCAGCCCTGTTGCATGTACCAGGGCGATGGTTTCCt < 7:107382/149‑1 (MQ=255) aGCGGGCGCTGTCCGATGAGGCGCTGCCCGAGGTAGCGGTTACTGAGCCAGGCTCAGATGGCGATTGAGCAGGGCGCGCAAGGCCGCAGGCTTGACCGGTTTGGCCAGGTAGTCCAGCCCTGATGCATGTACCAGGGCGATGGTTTCCt < 7:21893/149‑1 (MQ=255) gCGGGCGCTGTCCGATGAGGCGCTGCCCGAGGTAGCGGTTACTGAGCCAGGCTCAGATGGCGATTGAGCAGGGCGCGCAAGGCCGCAGGCTTGACCGGTTTGGCCAGGTAGTCCAGCCCTGATGCATGTACCAGGGCGATGGTTTCCtt < 8:45024/149‑1 (MQ=255) cGGGCGCTGTCCGATGAGGCGCTGCCCGAGGTAGCGGTTACTGAGCCAGGCTCAGATGGCGATTGAGCAGGGCGCGCAAGGCCGCAGGCTTGACCGGTTTGGCCAGGTAGTCCAGCCCTGATGCATGTACCAGGGCGATGGTTTCCTtg > 7:289401/1‑149 (MQ=255) cGGGCGCTGTCCGATGAGGCGCTGCCCGAGGTAGCGGTTACTGAGCCAGGCTCAGATGGCGATTGAGCAGGGCGCGCAAGGCCGCAGGCTTGACCGGTTTGGCCAGGTAGTCCAGCCCTGATGCATGTACCAGGGCGATGGTTTCCTtg < 6:134787/149‑1 (MQ=255) cgcTGTCCGATGAGGCGCTGCCCGAGGTAGCGGTTACTGAGCCAGGCTCAGATGGCGATTGAGCAGGGCGCGCAAGGCCGCAGGCTTGACCGGTTTTGCCAGGTAGTGCAGCCCTGATGCATGTACCAGGGCGATGGTTTcc > 5:374563/1‑142 (MQ=255) cgcTGTCCGATGAGGCGCTGCCCGAGGTAGCGGTTACTGAGCCAGGCTCAGATGGCGATTGAGCAGGGCGCGCAAGGCCGCAGGCTTGACCGGTTTGGCCAGGTAGTCCAGCCCTGATGCATGTACCAGGGCGATGGTTTcc < 6:374563/142‑1 (MQ=255) gcTGTCCGATGAGGCGCTGCCCGAGGTAGCGGTTACTGAGCCAGGCTCAGATGGCGATTGAGCAGGGCGCGCAAGGCCGCAGGCTTGACCGGTTTGGCCAGGTAGTCCAGCCCTGATGCATGTACCAGGGCGATGGTTTCCTTGCTGcc > 6:439799/1‑149 (MQ=255) gcTGTCCGATGAGGCGCTGCCCGAGGTAGCGGTTACTGAGCCAGGCTCAGATGGCGATTGAGCAGGGCGCGCAAGGCCGCAGGCTTGACCGGTTTGGCCAGGTAGTCCAGCCCTGATGCATGTACCAGGGCGATGGTTTCCTTGCTGcc < 6:199071/149‑1 (MQ=255) tGTCCGATGAGGCGCTGCCCGAGGTAGCGGTTACTGAGCCAGGCTCAGATGGCGATTGAGCAGGGCGCGCAAGGCCGCAGGCTTGACCGGTTTGGCCAGGTAGTCCAGCCCTGATGCATGTACCAGGGCGATGGTTTCCTTGCTGCCGt > 3:86245/1‑149 (MQ=255) cGATGAGGCGCTGCCCGAGGTAGCGGTTACTGAGCCAGGCTCAGATGGCGATTGAGCAGGGCGCGCAAGGCCGCAGGCTTGACCGGTTTGGCCAGGTAGTCCAGCCCTGATGCATGTACCAGGGCGATGGTTTCCTTGCTGCCGTCgg < 8:289401/148‑1 (MQ=255) cGATGAGGCGCTGCCCGAGGTAGCGGTTACTGAGCCAGGCACAGATGGCGATTGAGCAGGGCGCGCAAGGCCGCAGGCTTGACCGGTTTGGCCAGGTAGTCCAGCCCTGATGCATGTACCAGGGCGATGGTTTCCTTGCTGCCGTCGgc > 2:341585/1‑149 (MQ=255) aGGCGCTGCCCGAGGTAGCGGTTACTGAGCCAGGCTCAGATGGCGATTGAGCAGGGCGCGCAAGGCCGCAGGCTTGACCGGTTTGGCCAGGTAGTCCAGCCCTGATGCATGTACCAGGGCGATGGTTTCCTTGCTGCCGTCGGCGCTGa < 8:249903/149‑1 (MQ=255) ggCGCTGCCCGAGGTAGCGGTTACTGAGCCAGGCTCAGATGGCGATTGAGTAGGGCGCGCAAGGCCGCAGGCTTGACCGGTTTGGCCAGGTAGTCCAGCCCTGATGCATGTACCAGGGCGATGGTTTCCTTGCTGCCGTCGGCGCTGa > 7:3649/1‑148 (MQ=255) gcgcTGCCCGAGGTAGCGGTTACTGAGCCAGGCTCAGATGGCGATTGAGCAGGGCGCGCAAGGCCGCAGGCTTGACCGGTTTGGCCAGGTAGTCCAGCCCTGATGCATGTACCAGGGCGATGGTTTCCTTGCTGCCGTCGGCGCTGAt > 6:275406/1‑148 (MQ=255) gcgcTGCCCGAGGTAGCGGTTACTGAGCCAGGCTCAGATGGCGATTGAGCAGGGCGCGCAAGGCCGCAGGCTTGACCGGTTTGGCCAGGTAGTCCAGCCCTGATGCATGTACCAGGGCGATGGTTTCCTTGCTGCCGTCGGCGCTGATc < 1:341585/149‑1 (MQ=255) cTGCCCGAGGTAGCGGTTACTGAGCCAGGCTCAGATGGCGATTGAGCAGGGCGCGCAAGGCCGCAGGCTTGACCGGTTTGGCCAGGTAGTCCAGCCCTGATGCATGTACCAGGGCGATGGTTTCCTTGCTGCCGTCGGCGCTGATCAc > 7:371428/1‑148 (MQ=255) cTGCCCGAGGTAGCGGTTACTGAGCCAGGCTCAGATGGCGATTGAGCAGGGCGCGCAAGGCCGCAGGCTTGACCGGTTTGGCCAGGTAGTCCAGCCCTGATGCATGTACCAGGGCGATGGTTTCCTTGCTGCCGTCGGCGCTGATCAc > 5:204998/1‑148 (MQ=255) cccGAGGTAGCGGTTACTGAGCCAGGCTCAGATGGCGATTGAGCAGGGCGCGCAAGGCCGCAGGCTTGACCGGTTTGGCCAGGTAGTCCAGCCCTGATGCATGTACCAGGGCGATGGTTTCCTTGCTGCCGTCGGCGCTGATCACTa < 1:397050/147‑1 (MQ=255) cGAGGTAGCGGTTACTGAGCCAGGCTCAGATGGCGATTGAGCAGGGCGCGCAAGGCCGCAGGCTTGACCGGTTTGGCCAGGTAGTCCAGCCCTGATGCATGTACCAGGGCGATGGTTTCCTTGCTGCCGTCGGCGCTGATCACTACAcc < 8:222827/149‑1 (MQ=255) gAGGTAGCGGTTACTGAGCCAGGCTCAGATGGCGATTGAGTAGGGCGCGCAAGGCCGCAGGCTTGACCGGTTTGGCCAGGTAGTCCAGCCCTGATGCATGTACCAGGGCGATGGTTTCCTTGCTGCCGTCGGCGCTGATCACTACACCg < 8:3649/149‑1 (MQ=255) ggTAGCGGTTACTGAGCCAGGCTCAGATGGCGATTGAGCAGGGCGCGCAAGGCCGCAGGCTTGACCGGTTTGGCCAGGTAGTCCAGCCCTGATGCATGTACCAGGGCGATGGTTTCCTTGCTGCCGTCGGCGCTGATCACTACACCggg < 5:439799/149‑1 (MQ=255) tAGCGGTTACTGAGCCAGGCTCAGATGGCGATTGAGCAGGGCGCGCAAGGCCGCAGGCTTGACCGGTTTGGCCAGGTAGTCCAGCCCTGATGCATGTACCAGGGCGATGGTTTCCTTGCTGCCGTCGGCGCTGATCACTACACCGGGTa < 8:7334/149‑1 (MQ=255) gTTACTGAGCCAGGCTCAGATGGCGATTGAGCAGGGCGCGCAAGGCCGCAGGCTTGACCGGTTTGGCCAGGTAGTCCAGCCCTGATGCATGTACCAGGGCGATGGTTTCCTTGCTGCCGTCGGCGCTGATCACTACACCGGGTACCGGc < 8:131998/149‑1 (MQ=255) gTTACTGAGCCAGGCTCAGATGGCGATTGAGCAGGGCGCGCAAGGCCGCAGGCTTGACCGGTTTGGCCAGGTAGTCCAGCCCTGATGCATGTACCAGGGCGATGGTTTCCTTGCTGCCGTCGGCGCTGATCACTACACCGGGTACCGGc < 1:53384/149‑1 (MQ=255) cTGAGCCAGGCTCAGATGGCGATTGAGCAGGGCGCGCAAGGCCGCAGGCTTGACCGGTTTGGCCAGGTAGTCCAGCCCTGATGCATGTACCAGGGCGATGGTTTCCTTGCTGCCGTCGGCGCTGATCACTACACCGGGTACCGGCTCa < 1:106859/148‑1 (MQ=255) cTGAGCCAGGCTCAGATGGCGATTGAGCAGGGCGCGCAAGGCCGCAGGCTTGACCGGTTTGGCCAGGTAGTCCAGCCCTGATGCATGTACCAGGGCGATGGTTTCCTTGCTGCCGTCGGAGCTGATCACTACACAGGGTCCCGGCTCAc > 5:100045/1‑149 (MQ=255) aGCCAGGCTCAGATGGCGATTGAGCAGGGCGCGCAAGGCCGCAGGCTTGACCGGTTTGGCCAGGTAGTCCAGCCCTGATGCATGTACCAGGGCGATGGTTTCCTTGCTGCCGTCGGCGCTGATCACTACACCGGGTACCGGCTCAcc > 2:113736/1‑147 (MQ=255) ccAGGCTCAGATGGCGATTGAGCAGGGCGCGCAAGGCCGCAGGCTTGACCGGTTTGGCCAGGTAGTCCAGCCCTGATGCATGTACCAGGGCGATGGTTTCCTTGCTGCCGTCGGCGCTGATCACTACACCGGGTACCGGCTCACCCAGc > 6:15109/1‑149 (MQ=255) cAGGCTCAGATGGCGATTGAGCAGGGCGCGCAAGGCCGCAGGCTTGACCGGTTTGGCCAGGTAGTCCAGCCCTGATGCATGTACCAGGGCGATGGTTTCCTTGCTGCCGTCGGCGCTGATCACTACACCGGGTACCGGCTCACCCAGcc < 7:353134/149‑1 (MQ=255) aGGCTCAGATGGCGATTGAGCAGGGCGCGCAAGGCCGCAGGCTTGACCGGTTTGGCCAGGTAGTCCATCCCTGATGCATGTACCAGGGCGATGGTTTCCTTGCTGCCGTCGGCGCTGATCACTACACCGGGTACCGGCTCACCCAGCCg < 6:246600/149‑1 (MQ=255) tCAGATGGCGATTGAGCAGGGCGCGCAAGGCCGCAGGCTTGACCGGTTTGGCCAGGTAGTCCAGCCCTGATGCATGTACCAGGGCGATGGTTTCCTTGCTGCCGTCGGCGCTGATCACTACACCg < 7:14353/125‑1 (MQ=255) tCAGATGGCGATTGAGCAGGGCGCGCAAGGCCGCAGGCTTGACCGGTTTGGCCAGGTAGTCCAGCCCTGATGCATGTACCAGGGCGATGGTTTCCTTGCTGCCGTCGGCGCTGATCACTACACCg > 8:14353/1‑125 (MQ=255) aGATGGCGATTGAGCAGGGCGCGCAAGGCCGCAGGCTTGACCGGTTTGGCCAGGTAGTCCAGCCCTGATGCATGTACCAGGGCGATGGTTTCCTTGCTGCCGTCGGCGCTGATCACTACACCGGGTACCGGCTCa < 4:211150/135‑1 (MQ=255) aGATGGCGATTGAGCAGGGCGCGCAAGGCCGCAGGCTTGACCGGTTTGGCCAGGTAGTCCAGCCCTGATGCATGTACCAGGGCGATGGTTTCCTTGCTGCCGTCGGCGCTGATCACTACACCGGGTACCGGCTCa > 3:211150/1‑135 (MQ=255) aTGGCGATTGAGCAGGGCGCGCAAGGCCGCAGGCTTGACCGGTTTGGCCAGGTAGTCCAGCCCTGATGCATGTACCAGGGCGATGGTTTCCTTGCTGCCGTCGGCGCTGATCACTACACCGGGTACCGGCTCACCCAGCCGTGCTCGaa < 5:15109/149‑1 (MQ=255) aTGGCGATTGAGCAGGGCGCGCAAGGCCGCAGGCTTGACCGGTTTGGCCAGGTAGTCCAGCCCTGATGCATGTACCAGGGCGATGGTTTCCTTGCTGCCGTCGGCGCTGATCACTACACCGGGTACCGGCTCACCCAGCCGTGCTCGaa < 1:333662/149‑1 (MQ=255) cGATTGAGCAGGGCGCGCAAGGCCGCAGGCTTGACCGGTTTGGCCAGGTAGTCCAGCCCTGATGCATGTACCAGGGCGATGGTTTCCTTGCTGCCGTCGGCGCTGATCACTACACCGGGTACCGGCTCACCCAGCCGTGCTCGAagcca < 4:418069/149‑1 (MQ=255) gATTGAGCAGGGCGCGCAAGGCCGCAGGCTTGACCGGTTTGGCCAGGTAGTCCAGCCCTGATGCATGTACCAGGGCGATGGTTTCCTTGCTGCCGTCGGCGCTGATCACTACAcc > 4:291082/1‑115 (MQ=255) gATTGAGCAGGGCGCGCAAGGCCGCAGGCTTGACCGGTTTGGCCAGGTAGTCCAGCCCTGATGCATGTACCAGGGCGATGGTTTCCTTGCTGCCGTCGGCGCTGATCACTACAcc < 3:291082/115‑1 (MQ=255) aTTGTGCAGGGCGCGCAAGGCCGCAGGCTTGACCGGTTTGGCCAGGTAGTCCAGCCCTGATGCATGTACCAGGGCGATGGTTTCCTTGCTGCCGTCGGCGCTGATCACTACACCGGGTACCGGCTCACCCAGCCGTGCTCGAagccagc > 7:120449/1‑149 (MQ=255) gCAGGGCGCGCAAGGCCGCAGGCTTGACCGGTTTGGCCAGGTAGTCCAGCCCTGATGCATGTACCAGGGCGATGGTTTCCTTGCTGCCGTCGGCGCTGATCACTACACCGGGTACCGGCTCACCCAGCCGTGCTCGAAGCCAGCCCAt > 1:55836/1‑148 (MQ=255) gCAGGGCGCGCAAGGCCGCAGGCTTGACCGGTTTGGCCAGGTAGTCCAGCCCTGATGCATGTACCAGGGCGATGGTTTCCTTGCTGCCGTCGGCGCTGATCACTACACCGGGTACCGGCTCACCCAGCCGTGCTCGAAGCCAGCCCAt > 4:253454/1‑148 (MQ=255) gCAGGGCGCGCAAGGCCGCAGGCTTGACCGGTTTGGCCAGGTAGTCCAGCCCTGATGCATGTACCAGGGCGATGGTTTCCTTGCTGCCGTCGGCGCTGATCACTACACCGGGTACCGGCTCACCCAGCCGTGCTCGAAGCCAGCCCAt > 3:7807/1‑148 (MQ=255) cAGGGCGCGCAAGGCCGCAGGCTTGACCGGTTTGGCCAGGTAGTCCAGCCCTGATGCATGTACCAGGGCGATGGTTTCCTTGCTGCCGTCGGCGCTGATCACTACACCGGGTACCGGCTCACCCAGCCGTGCTCGAAGCCAGCCCAt > 5:398787/1‑147 (MQ=255) cAGGGCGCGCAAGGCCGCAGGCTTGACCGGTTTGGCCAGGTAGTCCAGCCCTGATGCATGTACCAGGGCGATGGTTTCCTTGCTGCCGTCGGCGCTGATCACTACACCGGGTACCGGCTCACCCAGCCGTGCTCGAAGCCAGCCCATCa < 1:428393/149‑1 (MQ=255) ggCGCTCACGGCCGCAGGCTTGTCAGGTTTTGCCAGGTAGTCCAGCCCTGATGCATGTACCAGGGCGATGGTTTCCTTGCTGCCGTCGGCGCTGATCACTACACCGGGTACCGGCTCACCCAGCCGTGCTCGAAGCCAGCCCATCATcc < 6:100045/149‑1 (MQ=255) aaGGCCGCAGGCTTGACCGGTTTGGCCAGGTAGTCCAGCCCTGATGCATGTACCAGGGCGATGGTTTCCTTGCTGCCGTCGGCGCTGATCACTACACCGGGTACCGGCTCACCCAGCCGTGCTCGAAGCCAGCCCATCAGCCCGGTGcc > 1:31851/1‑149 (MQ=255) aGGCCGCAGGCTTGACCGGTTTGGCCAGGTAGTCCAGCCCTGATGCATGTACCAGGGCGATGGTTTCCTTGCTGCCGTCGGCGCTGATCACTACACCGGGTACCGGCTCACCCAGCCGTGCTCGAAGCCAGCCCATCAGCCCGGTGCCg < 3:385386/149‑1 (MQ=255) gCCGCAGGCTTGACCGGTTTGGCCAGGTAGTCCAGCCCTGATGCATGTACCAGGGCGATGGTTTCCTTGCTGCCGTCGGCGCTGATCACTACACCGGGTACCGGCTCACCCAGCCGTGCTCGAAGCCAGCCCATCAGCCCGGTGCCGGt < 8:371428/149‑1 (MQ=255) ccGCAGGCTTGACCGGTTTGGCCAGGTAGTCCAGCCCTGATGCATGTACCAGGGCGATGGTTTCCTTGCTGCCGTCGGCGCTGATCACTACACCGGGTACCGGCTCACCCAGCCGTGCTCGAAGCCAGCCCATCAGCCCGGTGCCGGtc < 7:179890/149‑1 (MQ=255) ccGCAGGCTTGACCGGTTTGGCCAGGTAGTCCAGCCCTGATGCATGTACCAGGGCGATGGTTTCCTTGCTGCCGTCGGCGCTGATCACTACACCGGGTACCGGCTCACCCAGCCGTGCTCGAAGCCAGCCCATCAGCCCGGTGCCGGtc > 1:145728/1‑149 (MQ=255) cGCAGGCTTGACCGGTTTGGCCAGGTAGTCCAGCCCTGATGCATGTACCAGGGCGATGGTTTCCTTGCTGCCGTCGGCGCTGATCACTACACCGGGTACCGGCTCACACAGCCGTGCTCGAAGCCAGCCCATCAGCCCGGTGACGGtct > 5:45520/1‑149 (MQ=255) ggCTTGACCGGTTTGGCCAGGTAGTCCAGCCCTGATGCATGTACCAGGGCGATGGTTTCCTTGCTGCCGTCGGCGCTGATCACTACACCGGGTACCGGCTCACCCAGCCGTGCTCGAAGCCAGCCCATCAGCCCGGTGCCGGTCTCGcc < 6:204998/149‑1 (MQ=255) ttGACCGGTTTGGCCAGGTAGTCCAGCCCTGATGCATGTACCAGGGCGATGGTTTCCTTGCTGCCGTCGGCGCTGATCACTACACCGGGTACCGGCTCACCCAGCCGTGCTCGAAGCCAGCCCATCAGCCCGGTGCCGGTCTCGCcgtc > 7:266329/1‑149 (MQ=255) ccGGTTTGGCCAGGTAGTCCAGCCCTGATGCATGTACCAGGGCGATGGTTTCCTTGCTGCCGTCGGCGCTGATCACTACACCGGGTACCGGCTCACCCAGCCGTGCTCGAAGCCAGCCCATCAGCCCGGTACCGGTCTCGCCgtcgtc > 3:147950/1‑148 (MQ=255) ggTTTGGCCAGGTAGTCCAGCCCTGATGCATGTACCAGGGCGATGGTTTCCTTGCTGCCGTCGGCGCTGATCACTACACCGGGTACCGGCTCACCCAGCCGTGCTCGAAGCCAGCCCATCAGCCCGGTACCGGTCTCGCCGTCGTCCAg < 4:147950/149‑1 (MQ=255) tGGCCAGGTAGTCCAGCCCTGATGCATGTACCAGGGCGATGGTTTCCTTGCTGCCGTCGGCGCTGATCACTACACCGGGTACCGGCTCACCCAGCCGTGCTCGAAGCCAGCCCATCAGCCCGGTGCCGGTCTCGCCGTCGTCCAggtgg > 5:275086/1‑149 (MQ=255) ggCCAGGTAGTCCAGCCCTGATGCATGTACCAGGGCGATGGTTTCCTTGCTGCCGTCGGCGCTGATCACTACACCGGGTACCGGCTCACCCAGCCGTGCTCGAAGCCAGCCCATCAGCCCGGTGCCGGTCTCGCCGTCGTCCAggtgg < 4:7807/148‑1 (MQ=255) cAGGTAGTCCAGCCCTGATGCATGTACCAGGGCGATGGTTTCCTTGCTGCCGTCGGCGCTGATCACTACACCGGGTACCGGCTCACCCAGCCGTGCTCGAAGCCAGCCCATCAGCCCGGTGCCGGTCTCGCCGTCGTCCAGGTGGTAGt > 7:237477/1‑149 (MQ=255) cAGGTAGTCCAGCCCTGATGCATGTACCAGGGCGATGGTTTCCTTGCTGCCGTCGGCGCTGATCACTACACCGGGTACCGGCTCACCCAGCCGTGCTCGAAGCCAGCCCATCAGCCCGGTGCCGGTCTCGCCGTCGTCCAGGTGGTAGt > 5:283451/1‑149 (MQ=255) gTAGTCCAGCCCTGATGCATGTACCAGGGCGATGGTTTCCTTGCTGCCGTCGGCGCTGATCACTACACCGGGTACCGGCTCACCCAGCCGTGCTCGAAGCCAGCCCATCAGCCCGGTGCCGGTCTCGCCGTCGTCCAGGTGGTAGTcca > 4:88748/1‑149 (MQ=255) tAGTCCAGCCCTGATGCATGTACCAGGGCGATGGTTTCCTTGCTGCCGTCGGCGCTGATCACTACACCGGGTACCGGCTCACCCAGCCGTGCTCGAAGCCAGCCCATCAGCCCGGTGCCGGTCTCGCCGTCGTCCAGGTGGTAGTccac < 8:266329/149‑1 (MQ=255) gTCCAGCCCTGATGCATGTACCAGGGCGATGGTTTCCTTGCTGCCGTCGGCGCTGATCACTACACCGGGTACCGGCTCACCCAGCCGTGCTCGAAGCCAGCCCATCAGCCCGGTGCCGGTCTCGCCGTCGTCCAGGTGGTAGTccacc > 6:413935/1‑148 (MQ=255) gTCCAGCCCTGATGCATGTACCAGGGCGATGGTTTCCTTGCTGCCGTCGGCGCTGATCACTACACCGGGTACCGGCTCACCCAGCCGTGCTCGAAGCCAGCCCATCAGCCCGGTGCCGGTCGCGCCGTCGTCCAGGTGGTAGTccacc > 6:338416/1‑148 (MQ=255) tCCACCCCTGATGCATGTACCAGGGCGATGGTTTCCTTGCTGCAGTCGGCGCTGATCACTACACAAGGTACCGGCTCACCCAGCCGTGCTCGAAGCCAGCCCATCAGCCCGGTGCCGGTCTCGCCGTCGTCCAGGTGGTAGTCCACCaa > 1:131740/1‑149 (MQ=255) catcgCCCTGGTACATGCATCAGGGCGATGGTTTCCTTGCTGCCGTCGGCGCTGATCACTACACCGGGTACCGGCTCACCCAGCCGTGCTCGAAGCCAGCCCATCAGCCCGGTGCCGGTCTCGCCGTCGTCCAGGTGGTAGTCCACCaa > 7:375935/5‑149 (MQ=255) atcgCCCTGGTACATGCATCAGGGCGATGGTTTCCTTGCTGCCGTCGGCGCTGATCACTACACCGGGTACCGGCTCACCCAGCCGTGCTCGAAGCCAGCCCATCAGccc > 7:342460/4‑109 (MQ=255) atcgCCCTGGTACATGCATCAGGGCGATGGTTTCCTTGCTGCCGTCGGCGCTGATCACTACACCGGGTACCGGCTCACCCAGCCGTGCTCGAAGCCAGCCCATCAGccc < 8:342460/106‑1 (MQ=255) cAGCCCTGATGCATGTCCCACGGCGATGCTTTCATTGCTGCCGTCGGCGCTGATACCTTCACCGGGTACCGGCTCACCCTGCCGAGGTCGAAGCCAGCCCATGCGCCCGGTGCCGGGCTCGCCGTCGTCCAGCTGGTAGTccccaaaag > 2:319046/1‑142 (MQ=255) cccTGATGCATGTACCAGGGCGATGGTTTCCTTGCTGCCGTCGGCGCTGATCACTACACCGGGTACCGGCTCACCCAGCCGTGCTCGAAGCCAGCCCATCAGCCCGGTGCCGGTCTCGCcgtcg < 1:408309/124‑1 (MQ=255) cccTGATGCATGTACCAGGGCGATGGTTTCCTTGCTGCCGTCGGCGCTGATCACTACACCGGGTACCGGCTCACCCAGCCGTGCTCGAAGCCAGCCCATCAGCCCGGTGCCGGTCTCGCcgtcg > 2:408309/1‑124 (MQ=255) cccTGATGCATGTACCAGGGCGATGGTTTCCTTGCTGCCGTCGGCGCTGATCACTACACCGGGTACCGGCTCACCCAGCCGTGCTCGAAGCCAGCCCATCAGCCCGGTGCCGGTCTCGCCGTCGTCCAGGTGGTAGTCCACCAATGCCa < 4:86245/149‑1 (MQ=255) cccAGATGCATGTACCAGGGCGATGGTTTCCTTGCTGCCGTCGGCGCTGATCACTACACAGGGTACCGGCTCACCCAGCCGTGCTCCAAGCCAGCCCATCAGCCCGGTGCCGGTCTCGCCGTCGTCCAGGTGGTAGTCCACCAATGc > 8:279280/1‑147 (MQ=255) aTGCATGTACCAGGGCGATGGTTTCCTTGCTGCCGTCGGCGCTGATCACTACACCGGGTACCGGCTCACCCAGCCGTGCTCGAAGCCAGCCCATCAGCCCGGTGCCGGTCTCGCCGTCGTCCAGGTGGTAGTCCACCAATGCCAGGTGc < 8:237477/149‑1 (MQ=255) aTGCATGTACCAGGGCGATGGTTTCCTTGCTGCCGTCGGCGCTGATCACTACACCGGGTACCGGCTCACCCAGCCGTGCTCGAAGCCAGCCCATCAGCCCGGTGCCGGTCTCGCCGTCGTCCAGGTGGTAGTCCACCAATGCCAGGTGc > 7:249839/1‑149 (MQ=255) | CTTGCCGGCAGACCTGCTGGAGCGGGCGCTGTCCGATGAGGCGCTGCCCGAGGTAGCGGTTACTGAGCCAGGCTCAGATGGCGATTGAGCAGGGCGCGCAAGGCCGCAGGCTTGACCGGTTTGGCCAGGTAGTCCAGCCCTGATGCATGTACCAGGGCGATGGTTTCCTTGCTGCCGTCGGCGCTGATCACTACACCGGGTACCGGCTCACCCAGCCGTGCTCGAAGCCAGCCCATCAGCCCGGTGCCGGTCTCGCCGTCGTCCAGGTGGTAGTCCACCAATGCCAGGTGC > NC_002947/1886734‑1887024 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |