Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 2,053,627 | T→C | 6.3% | intergenic (‑27/+39) | PP_1828 ← / ← PP_1829 | hypothetical protein/alpha/beta family hydrolase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 2,053,627 | 0 | T | C | 6.3% | 179.4 / 2.0 | 63 | intergenic (‑27/+39) | PP_1828/PP_1829 | hypothetical protein/alpha/beta family hydrolase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (31/28); new base C (2/2); total (33/30) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.66e-01 |
GGTCGGCAGTGCTGCCAGGCGTAGCAGCTGGAAATGTTCGGCGGTCAGCTCGGC‑CCAGGGCAGGGCGGGGGTTTCCTGGGGTTCTTCGGCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCCTGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGCCCAGCTCACGCGCCAGCGGCAGCTCGGGGTTGAGGTAGCTGTCGCGCTG‑CTGGCTCATGCCCTTGG > NC_002947/2053481‑2053775 | ggtcggCAGTGCTGCCAGGCGTAGCAGCTGGAAATGTTCGGCGGTCAGCTCGGC‑CCAGGGCAGGGCGGGGGTTTCCTGGGGTTCTTCGGCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCctgctg > 4:285750/1‑148 (MQ=255) cggCTGTGCTGCCGGGCGTAGCTGCTGGAATTGTTGGGCGGTCAGGTGGGC‑CCTGGGCTGGGGGGGGGTTTCCTGGGGTTCTTGGGCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATc < 3:399199/149‑1 (MQ=255) ggCAGTGCTGCCAGGCGTAGCAGCTGGAAATGTTCGGCGGTCAGCTCGGC‑CCAGGGCAGGGCGGGGGTTTCCTGGGGTTCTTCGGCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCg > 3:343335/1‑149 (MQ=255) cAGTGCTGCCAGGCGTAGCAGCTGGAAATGTTCGGCGGTCAGCTCGGC‑CCAGGGCAGGGCGGGGGTTTCCTGGGGTTCTTCGGCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCgg > 8:199409/1‑148 (MQ=255) cAGTGCTGCCAGGCGTAGCAGCTGCAAATGTTCGGCGGTCAGCTCGGC‑CCAGGGCAGGGCGGGGGTTTCCTGGGGTTCTTCGGCCGGCTCGACGGCGGGGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCggc < 2:878/149‑1 (MQ=255) gTGCTGCCAGGCGTAGCAGCTGGAAATGTTCGGCGGTCAGCTCGGC‑CCAGGGCAGGGCGGGGGTGTCCTGGGGTTCTTCGGCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCggcag < 3:44581/149‑1 (MQ=255) ctgcCAGGCGTAGCAGGTGGAAATGTTCGGCGGTCAGCGCGGC‑CCTGGGCAGGGGGGGGGTTTCCTGGGGTTCTTCGGCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCggcaggc < 1:162740/148‑1 (MQ=255) ccAGGCGTAGCAGCTGGAAATGTTCGGCGGTCAGCTCGGC‑CCAGGGCAGGGCGGGGGTTTCCTGGGGTTCTTCGGCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCCGATACAGCAGGCAt < 2:294987/147‑1 (MQ=255) aGGCGTAGCAGCTGGAAATGTTCGGCGGTCAGCTCGGC‑CCAGGGCAGGGCGGGGGTTTCCTGGGGTTCTTCGGCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCt > 5:270214/1‑149 (MQ=255) gTAGCAGCTGGAAATGTTCGGCGGTCAGCTCGGC‑CCAGGGCAGGGCGGGGGTTTCCTGGGGTTCTTCGGCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTgaga > 6:434276/1‑149 (MQ=255) gTAGCAGCTGGAAATGTTCGGCGGTCAGCTCGGC‑CCAGGGCAGGGCGGGGGTTTCCTGGGGTTCTTCGGCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTgaga > 6:20099/1‑149 (MQ=255) ccagcTGGAAATGTTCGGCGGTCAGCTCGGC‑CCCGGGCAGGGCGGGGGTTTCCTGGGGTTCTTCGCCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCt < 7:126236/148‑1 (MQ=255) tGGAAATGTTCGGCGGTCAGCTCGGCGCCAGGGCAGGGCGGGGGTTTCCTGGGGTTCTTCGGCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGc > 1:4405/1‑149 (MQ=255) aatggtgcggcggGCCGCGCGGC‑CCAGGGCAGGGGGGGGGTTCCCGGGGTTGCTTCGGCCGGCGCGCCGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCGGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCCTGt < 6:310090/142‑1 (MQ=255) aaTGTTCGGCGGTCAGCTCGGC‑CCA‑GGCAGGGCGGGGGTTTCCTGGGGTTCTTCGGCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCCTGttt > 6:8120/1‑149 (MQ=255) tGTTGGGGGGTCTGGTGGGC‑GCTGGGCAGGGGGGGGGTTTCTTGGGGTTCTTGGGCGGGGTGGAGGGGGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCCTGttt < 4:343335/148‑1 (MQ=255) gTTCGGCGGTCAGCTCGGC‑CCAGGGCAGGGCGGGGGTTTCCTGGGGTTCTTCGGCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCCTGTTTg > 2:218964/1‑148 (MQ=255) tCAGCTCGGC‑CCAGGGCAGGGCGGGGGTTTCCTGGGGTTCTTCGGCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCCGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCCTGTTTGACTTACGcc > 5:167903/1‑148 (MQ=255) aGCTGGGC‑CCAGGGCAGGGCTGGTGTTTCGGGGGGTGCTTCGGCCGGCTCGAGGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGTCTGAGACCTGAGCCTGTTTGACTTACGCCGa < 6:386594/148‑1 (MQ=255) aGCTCGGC‑CCAGGGCAGGGCGGGGGTTTCCTGGGGTTCTTCGGCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCCTGTTTGACTTACGCCg > 3:271080/1‑147 (MQ=255) ggtCGGG‑CCCGGGCAGGGGGGGGGGTTCCGGGGGTTCTGCTGCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTTGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCCTGTTTGACTTACGCCGAAg < 7:401929/147‑1 (MQ=255) gcgcGGC‑CCAGGGCTGGGCGGGGGTTTCCTGGGGTTCTTCGGCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCCTGTTTGACTTACGCCGAAg < 6:37757/146‑1 (MQ=255) gCTCGGC‑CCAGGGCAGGGCGGGGGTTTCCTGGGGTTCTTCGGCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGa < 2:126794/127‑1 (MQ=255) gCTCGGC‑CCAGGGCAGGGCGGGGGTTTCCTGGGGTTCTTCGGCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGa > 1:126794/1‑127 (MQ=255) ggC‑CCAGGGCAGGGCGGGGGTTTCCTGGGGTTCTTCGGCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCCTGTTTGACTTACGCCGAAGGCa > 3:180106/1‑148 (MQ=255) c‑ccAGGGCAGGGCGGGGGTTTCGTGGGGGTCTTCGGCCGGCTCGCCGGCGGGGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCCTGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAAt < 5:107938/149‑1 (MQ=255) c‑ccAGGGCAGGGCGGGGGTTTCCTGGGGTTCTTCGGCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGa < 6:327273/121‑1 (MQ=255) c‑ccAGGGCAGGGCGGGGGTTTCCTGGGGTTCTTCGGCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGa > 5:327273/1‑121 (MQ=255) cgggctgggcGGGGGTTTCCTGGGGTTCTTCGGCCGGCGCGACGGGGGGGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCCTGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCt < 4:180106/148‑1 (MQ=255) agggcagggcGGGGGTTTCCTGGGGTTCTTCGGCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCCTGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCt < 2:19692/149‑1 (MQ=255) ggcagggcGGGGGTTTCCTGGGGTTCTTCGGCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCCGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCCTGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTgg < 6:167903/149‑1 (MQ=255) ggcGGGGGTTTCCTGGGGTTCTTCGGCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCCTGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGaa > 4:330175/1‑149 (MQ=255) ggcGGGGGTTTCCTGGGGTTCTTCGGCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCCTGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGaa > 5:34909/1‑149 (MQ=255) gggggggTTTCCTGGGTGTCTTCGGCCGGCTCTACGGCGGGTGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCCTGTTTGACTTACGCCGAATGCAAATGCTGGATGAAc < 4:271080/147‑1 (MQ=255) tCCTGGGGTTCTTCGGCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCCTGTTTGACTTACGCCGAAg < 6:111857/123‑1 (MQ=255) tCCTGGGGTTCTTCGGCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCCTGTTTGACTTACGCCGAAg > 5:111857/1‑123 (MQ=255) ccTGGGGTTCTTCGGCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATAAGGGCTTGTCATCAGCTATGCCTCCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCCTGTTTGAATTACGCCGATGGAAAATGATGGATGAACTTccaaatac > 4:149177/1‑142 (MQ=255) cTGGGGTTCTTCGGCCGGCTCGACGGGGGT‑GGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCCTGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATtcgc < 6:40102/149‑1 (MQ=255) tGGGGTTCTTCGGCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCCTGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATtcgc > 4:351428/1‑149 (MQ=255) ggggTTCTTCGGCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCCTGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATtcgct > 6:44234/1‑149 (MQ=255) gggTTCTTGCGCCGGCGCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCCTGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATtcgctc < 3:149177/149‑1 (MQ=255) gggTTCTTCGGCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTTGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCCTGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATtcgctc < 7:143596/149‑1 (MQ=255) gggTTCTTCGGCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCCTGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATtcgctc < 6:270214/149‑1 (MQ=255) cttcGGCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCCTGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGccc < 5:434276/148‑1 (MQ=255) cttcGGCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCCTGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGccc < 5:20099/148‑1 (MQ=255) ggcggTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCCTGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGCCCAGCTCACGCGCCAGCgg < 8:115868/149‑1 (MQ=255) ggTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCCTGTTTGACTTACGCCGTAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGCCCAGCTCACGCGCCAGCGGCAg > 4:290476/1‑149 (MQ=255) gTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCCTGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGCCCAGCTCACGCGCCAGCGGCAGc > 6:57819/1‑149 (MQ=255) ggggAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCCTGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGCCCAGCTCACGCGCCAGCGGCAGCTCg < 6:34909/149‑1 (MQ=255) ggAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCCTGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGCCCAGCTCACGCGCCAGCGGCAGCTCggg < 3:330175/149‑1 (MQ=255) aGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCCTGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGCCCAGCTCACgcgc < 3:62235/132‑1 (MQ=255) aGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCCTGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGCCCAGCTAACgcgc > 4:62235/1‑132 (MQ=255) ggtCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCCTGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGCCCAGCTCACGCGCCAGCGGCAGCTCGGGGTTGAg > 1:186026/1‑149 (MQ=255) caGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCCTGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGCCCAGCTCACGCGCCAGCGGCAGCTCGGGGTTGAGGTAGCt > 1:267467/1‑149 (MQ=255) gggCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCCTGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGCCCAGCTCACGCGCCAGCGGCAGCTCGGGGTTGAGGTAGCTGt > 4:149137/1‑149 (MQ=255) gTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCCTGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGCCCAGCTCACGCGCCAGCGGCAGCTCGGGGTTGAGGTAGCTGTcgcg < 7:199409/147‑1 (MQ=255) gTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCCTGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGCCCAGCTCACGCGCCAGCGGCAGCTCGGGGTTGAGGTAGCTGTCGCgct > 4:37100/1‑149 (MQ=255) ccTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCCTGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGCCCAGCTCACGCGCCAGCGGCAGCTCGGGGTTGAGGTAGCTGTCGCgctg‑c > 2:231805/1‑149 (MQ=255) cTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCCTGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGCCCAGCTCACGCGCCAGCGGCAGCTCGGGGTTGAGGTAGCTGTCGCgctg‑ct > 6:215415/1‑149 (MQ=255) tCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCCTGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGCCCAGCTCACGCGCCAGCGGCAGCTCGGGGTTGAGGTAGCTGTCGCGctg‑ctg > 8:300689/1‑149 (MQ=255) aGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCCTGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGCCCAGCTCACGCGCCAGCGGCAGCTCGGGGTTGAGGTAGCTGTCGCGCTG‑CTGGc > 1:74630/1‑149 (MQ=255) aGCCATGCCTGCCGATACAGCAGGCATAGCTGAGACCTGAGCCTGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGCCCAGCTCACGCGCCAGCGGCAGCTCGGGGTTGAGGTAGCTGTCGCGCTG‑CTGGc > 5:407919/1‑149 (MQ=255) cTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCCTGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGCCCAACTCACGCGCCAGCGGCAGCTCGGGGTTGAGGTAGCTGTCGCGCTG‑CTGGCt > 7:246316/1‑148 (MQ=255) ccTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCCTGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGCCCAGCTCACGCGCCAGCGGCAGCTCGGGGTTAAGGTAGCTGTCGCGCTGTCTGGCTCATGc > 1:368214/1‑149 (MQ=255) tgTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCCTGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGCCCAGCTCACGCGCCAGCGGCAGCTCGGGGTTGAGGTAGCTGTCGCGCTG‑CTGGCTCATGCCCTTgg > 5:279129/1‑149 (MQ=255) | GGTCGGCAGTGCTGCCAGGCGTAGCAGCTGGAAATGTTCGGCGGTCAGCTCGGC‑CCAGGGCAGGGCGGGGGTTTCCTGGGGTTCTTCGGCCGGCTCGACGGCGGTGGGGGAGGTGGTCATCAGGGCTTGTCCTCAGCTATGCCTGCTGTATCGGCAGGCATGGCTGAGACCTGAGCCTGTTTGACTTACGCCGAAGGCAAATGCTGGATGAACGTCACAATTCGCTCGCCCAGCTCACGCGCCAGCGGCAGCTCGGGGTTGAGGTAGCTGTCGCGCTG‑CTGGCTCATGCCCTTGG > NC_002947/2053481‑2053775 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |