| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_002947 | 2,421,568 | G→A | 7.7% | G127R (GGG→AGG) ‡ | moaB‑I → | molybdenum cofactor biosynthesis protein B |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_002947 | 2,421,568 | 0 | G | A | 7.7% | 255.3 / 7.4 | 90 | G127R (GGG→AGG) ‡ | moaB‑I | molybdenum cofactor biosynthesis protein B |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (40/43); new base A (5/2); total (45/45) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.34e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.28e-01 | |||||||||||
CGGCGGTACCGGGTTTACTGGTCGCGACAGCACCCCCGAGGCGGTGGCCTGCCTGCTGGACAAGCAAGTAGACGGCTTTGGTGAGCTGTTCCGGCAGATTTCCGTGGCCGACATTGGCACCTCCACCGTGCAGTCGCGTGCC‑TTGGCCGGGCTGGCCAACGGCACGCTGGTGTGCTGCCTGCCAGGCTCCACC‑AACGCTGTGCGTACCGGTTGGGATGGCATCCTGGCCGAGCAGCTCGATGCCCGTCATCGCCCTTGCAACTTCGTGGCGCACCTGAAGCAGGCAGCGGCCTGT > NC_002947/2421420‑2421714 | cggcggTACCGGGTTTACTGGTCGCGACAGCACCCCCGAGGCGGTGGCCTGCCTGCTGGACAAGCAAGTAGACGGCTTTGGTGAGCTGTTCCGGCAGATTTCCGTGGCCGACATTGGCACCTCCACCGTGCAGTCGCGTGCC‑TTGGCCg > 1:50436/1‑149 (MQ=255) gcggTACCGGGTTTACTGGTCGCGACAGCACCCCCGAGGCGGTGGCCTGCCTGCTGGACAAGCAAGTAGACGGCTTTGGTGAGCTGTTCCGGCAGATTTCCGTGGCCGACATTGGCACCTCCACCGTGCAGTCGCGTGCC‑TTGGCCggg < 8:144971/149‑1 (MQ=255) ggTACCGGGTTTACTGGTCGCGACAGCACCCCCGAGGCGGTGGCCTGCCTGCTGGACAAGCAAGTAGACGGCTTTGGTGAGCTGTTCCGGCAGATTTCCGTGGCCGACATTGGCACCTCCACCGTGCAGTCGCGTGCC‑TTGGCCggg > 2:86436/1‑147 (MQ=255) 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ggTTTACTGGTCGCGACAGCACCCCCGAGGCGGTGGCCTGCCTGCTGGACAAGCAAGTAGACGGCTTTGGTGAGCTGTTCCGGCAGATTTCCGTGGCCGACATTGGCACCTCCACCGTGCAGTCGCGTGCC‑TTGGCCGGGCTGGCCAAc < 4:300874/149‑1 (MQ=255) ggTTTACTGGTCGCGACAGCACCCCCGAGGCGGTGGCCTGCCTGCTGGACAAGCAAGTAGACGGCTTTGGTGAGCTGTTCCGGCAGATTTCCGTGGCCGACATTGGCACCTCCACCGTGCAGTCGCGTGCC‑TTGGCCGGGCTGGCCAAc > 6:315643/1‑149 (MQ=255) aCTGGTCGCGACAGCACCCCCGAGGCGGTGGCCTGCCTGCTGGACAAGCAAGTAGACGGCTTTGGTGAGCTGTTCCGGCAGATTTCCGTGGCCGACATTGGCACCTCCACCGTGCAGTCGCGTGCG‑TTGGCCAGCCCGGCCAA‑GGCAc < 5:188181/148‑1 (MQ=255) tGGTCGCGACAGCACCCCCGAGGCGGTGGCCTGCCTGCTGGACAAGCAAGTAGACGGCTTTGGTGAGCTGTTCCGGCAGATTTCCGTGGCCGACATTGGCACCTCCACCGTGCAGTCGCGTGCC‑TTGGCCGGGCTGGCCAACGGCACGc > 2:273811/1‑149 (MQ=255) gTCGCGACAGCACCCCCGAGGCGGTGGCCTGCCTGCTGGACAAGCAAGTAGACGGCTTTGGTGAGCTGTTCCGGCAGATTTCCGTGGCCGACATTGGCACCTCCACCGTGCAGTCGCGTGCC‑TTGGCCGGGCTGGCCAACGGCACGCTg > 7:376628/1‑149 (MQ=255) 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caagcaagTAGACGGCTTTGGTGAGCTGTTCCGGCAGATTTCCGTGGCCGACATTGGCACCTCCACCGTGCAGTCGCGTGCC‑TTGGCCGGGCTGGCCAACGGCACGCTGGTGTGCTGCCTGCCAGGCTCCACC‑AACGCTGTGCGTACCg > 2:288739/1‑149 (MQ=255) caagcaagTAGACGGCTTTGGTGAGCTGTTCCGGCAGATTTCCGTGGCCGACATTGGCACCTCCACCGTGCAGTCGCGTGCC‑TTGGCCGGGCTGGCCAACGGCACGCTGGTGTGCTGCCTGCCAGGCTCCACC‑AACGCTGTGCGTACCg < 2:177653/149‑1 (MQ=255) aagcaagTAGACGGCTTTGGTGAGCTGTTCCGGCAGATTTCCGTGGCCGACATTGGCACCTCCACCGTGCAGTCGCGTGCC‑TTGGCCGGGCTGGCCAACGGCACGCTGGTGTGCTGCCTGCCAGGCTCCACCAAAGGATGTGCGTACCg > 1:369041/1‑149 (MQ=255) gcaagTAGACGTCTTTGGGGAGCTGTTCCGGCAGATTTCCGTGGCCGACATTGGCACCTCCACCGTGCAGTCGCGTGCC‑TTGGCCGGGCTTGCCAACGGCACGCTGGTGTGCTGCCTGCCAGGCTCCACC‑AACGCTGTGCGTACCGGtt < 6:323696/149‑1 (MQ=255) caagTAGACGGCTTTGGTGAGCTGTTCCGGCAGATTTCCGTGGCCGACATTGGCACCTCCACCGTGCAGTCGCGTGCC‑TTGGCCGGGCTGGCCAACGGCACGCTGGTGTGCTGCCTGCCAGGCTCCACC‑AACGCTGTGc < 8:113631/139‑1 (MQ=255) 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ccTCCACCGTGCAGTCGCGTGCC‑TTGGCCGGGCTGGCCAACGGCACGCTGGTGTGCTGCCTGCCAGGCTCCACC‑AACGCTGTGCGTACCGGTTGGGATGGCATCCTGGCCGAGCAGCTCGATGCCCGTCATCGCCCTTGCAACTTCGTg < 4:219609/149‑1 (MQ=255) ccTCCACCGTGCAGTCGCGTGCC‑TTGGCCGGGCTGGCCAACGGCACGCTGGTGTGCTGCCTGCCAGGCTCCACC‑AACGCTGTGCGTACCGGTTGGGATGGCATCCTGGCCGAGCAGCTCGATGCCCGTCATCGCCCTTGCAACTTCGTg < 3:362772/149‑1 (MQ=255) ccGTGCAGTCGCGTGCC‑TTGGCCGGGCTGGCCAACGGCACGCTGGTGTGCTGCCTGCCAGGCTCCACC‑AACGCTGTGCGTACCGGTTGGGATGGCATCCTGGCCGAGCAGCTCGATGccc > 2:361261/1‑120 (MQ=255) ccGTGCAGTCGCGTGCC‑TTGGCCGGGCTGGCCAACGGCACGCTGGTGTGCTGCCTGCCAGGCTCCACC‑AACGCTGTGCGTACCGGTTGGGATGGCATCCTGGCCGAGCAGCTCGATGccc < 1:361261/120‑1 (MQ=255) ccGTGCAGTCGCGTGCC‑ATGGCCGGGCTGGCCCACGGCACGCGGGTGTGCTGCCTGCCACGCTCCACC‑AACCCTGTGCGTACCGGGTGGGGTGGCCTCCTGGCCGCGCCGCTCGATTCCCGGCATCGCCCTTGCAACTTCGTGgcgccc > 2:383228/1‑147 (MQ=255) aGTCGCGTGCC‑TTGGCCGGGCTGGCCAACGGCACGCTGGTGTGCTGCCTGCCAGGCTCCACC‑AACGCTGTGCGTACCGGTTGGGATGGCATCCTGGCCGAGCAGCTCGATGCCCGTCATCGCCCTTGCAACTTCGTGGCGCACCTGAAg > 7:17136/1‑149 (MQ=255) ccagcgTGCCGTTGGCCAGCCCGGCCAA‑GGCACGCTGGTGTGCTGCCTGCCAGGCTCCACC‑AACGCTGTGCGTACCGGTTGGGATGGCATCCTGGCCGAGCAGCTCGATGCCCGTCATCGCCCTTGCAACTTCGTGGCGCACCTGAAg > 1:236247/4‑148 (MQ=38) tCGCGTGCC‑TTGGCCGGGCTGGCCAACGGCACGCTGGTGTGCTGCCTGCCAGGCTCCACC‑AACGCTGTGCGTACCGGTTGGGATGGCATCCTGGCCGAGCAGCTCGATGCCCGTCATCGCCCTTGCAACTTCGTGGCGCACCTGAAgca < 8:376628/149‑1 (MQ=255) gcgTGCCGTTGGCCAGCCCGGCCAA‑GGCACGCTGGTGTGCTGCCTGCCAGGCTCCACC‑AACGCTGTGCGTACCGGTTGGGATGGCATCCTGGCCGAGCAGCTCGATGCCCGTCATCGCCCTTGCAACTTCGTGGCGCACCTGAAgcagg > 1:284604/1‑149 (MQ=255) tgccgttGGCCAGCCCGGCCAA‑GGCACGCTGGTGTGCTGCCTGCCAGGCTCCACC‑AACGCTGTGCGTACCGGTTGGGATGGCATCCTGGCCGAGCAGCTCGATGCCCGTCATCGCCCTTGCAACTTCGTGGCGCACCTGAAgc < 3:422232/138‑1 (MQ=255) tgccgttGGCCAGCCCGGCCAA‑GGCACGCTGGTGTGCTGCCTGCCAGGCTCCACC‑AACGCTGTGCGTACCGGTTGGGATGGCATCCTGGCCGAGCAGCTCGATGCCCGTCATCGCCCTTGCAACTTCGTGGCGCACCTGAAgc > 4:422232/6‑143 (MQ=255) gccgttGGCCAGCCCGGCCAAGGGCACGCTGGTGTGCTGCCTGCCAGGCTCCACC‑AACGCTGTGCGTACCGGTTGGGATGGCATCCTGGCCGAGCAGCTCGATGCCCGTCATCGCCCTTGCAACTTCGTGGCGCACCTGAAgcaggcag > 1:149421/5‑149 (MQ=255) cc‑TTGGCCGGGCTGGCCAACGGCACGCTGGTGTGCTGCCTGCCAGGCTCCACC‑AACGCTGTGCGTACCGGTTGGGATGGCATCCTGGCCGAGCAGCTCGATGCCCGTCATCGCCCTTGCAACTTCGTGGCGCACCTGAAGCAGGCAGc < 8:240742/148‑1 (MQ=255) cc‑TTGGCCGGGCTGGCCAACGGCACGCTGGTGTGCTGCCTGCCAGGCTCCACC‑AACGCTGTGCGTACCGGTTGGGATGGCATCCTGGCCGAGCAGCTCGATGCCCGTCATCGCCCTTGCAACTTCGTGGCGCACCTGAAGCAGGCAGCg > 1:282811/1‑149 (MQ=255) cgttGGCCAGCCCGGCCAACGGCACGCTGGTGTGCTGCCTGCCAGGCTCCACC‑AACGCTGTGCGTACCGGTTGGGATGGCATCCTGGCCGAGCAGCTCGATGCCCGTCATCGCCCTTGCAACTTCGTGGCGCACCTGAAGCAGGCAGCg > 8:237891/3‑149 (MQ=255) c‑TTGGCCGGGCTGGCCAACGGCACGCTGGTGTGCTGCCTGCCAGGCTCCACC‑AACGCTGTGCGTACCGGTTGGGATGGCATCCTGGCCGAGCAGCTCGATGCCCGTCATCGCCCTTGCAACTTCGTGGCGCACCTGAAGCAGGCAGCgg < 1:273811/149‑1 (MQ=255) gCCGGGCTGGCCAACGGCACGCTGGTGTGCTGCCTGCCAGGCTCCACC‑AACGCTGTGCGTACCGGTTGGGATGGCATCCTGGCCGAGCAGCTCGATGCCCGTCATCGCCCTTGCAACTTCGTGGCGCACCTGAAGCAGGCAGCGGCCtg < 2:261503/149‑1 (MQ=255) ccGGGCTGGCCAACGGCACGCTGGTGTGCTGCCTGCCAGGCTCCACC‑AACGCTGTGCGTACCGGTTGGGATGGCATCCTGGCCGAGCAGCTCGATGCCCGTCATCGCCCTTGCAACTTCGTGGCGCACCTGAAGCAGGCAGCGGCCtgt < 1:204767/149‑1 (MQ=255) ccGGGCTGGCCAACGGCACGCTGGTGTGCTGCCTGCCAGGCTCCACC‑AACGCTGTGCGTACCGGTTGGGATGGCATCCTGGCCGAGCAGCTCGATGCCCGTCATCGCCCTTGCAACTTCGTGGCGCACCTGAAGCAGGCAGCGGCCtgt < 2:316244/149‑1 (MQ=255) | CGGCGGTACCGGGTTTACTGGTCGCGACAGCACCCCCGAGGCGGTGGCCTGCCTGCTGGACAAGCAAGTAGACGGCTTTGGTGAGCTGTTCCGGCAGATTTCCGTGGCCGACATTGGCACCTCCACCGTGCAGTCGCGTGCC‑TTGGCCGGGCTGGCCAACGGCACGCTGGTGTGCTGCCTGCCAGGCTCCACC‑AACGCTGTGCGTACCGGTTGGGATGGCATCCTGGCCGAGCAGCTCGATGCCCGTCATCGCCCTTGCAACTTCGTGGCGCACCTGAAGCAGGCAGCGGCCTGT > NC_002947/2421420‑2421714 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |