| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,447,418 | G→C | 6.8% | L269L (CTG→CTC) | nagZ → | beta‑N‑acetylglucosaminidase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,447,418 | 0 | G | C | 6.8% | 237.0 / 6.9 | 73 | L269L (CTG→CTC) | nagZ | beta‑N‑acetylglucosaminidase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (30/38); new base C (3/2); total (33/40) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.53e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.30e-01 | |||||||||||
AACCAGCCCGCTGGCTTCTCGCGGCGTTGGTTGCAGGACATCCTGCGTGGCGAGCTGGGCTTTGATGGGGTGATTTTCAGTGATGACCTGTCGATGGCCGGTGCGCATGTGGTGGGCGACGCGGCCAGCCGTATCGAGG‑CGGCGCTGAGCGCCGGTTGTGATATGGGCCTGGTGTGCAATGACCGGGCGGCGGCGGAGCTGGCGCTGAGTGCGGCGCAGCGCATGAAGGTCAAGCCATCGCCGCGGATTGCGCGGATGCGTGGGCAAGGGTTTGCGCGAACCGATTATC > NC_002947/2447272‑2447560 | aaCCAGCCCGCTGGCTTCTCGCGGCGTTGGTTGCAGGACATCCTGCGTGGCGAGCTGGGCTTTGATGGGGTGATTTTCAGTGATGACCTGTCGATGGCCGGTGCGCATGTGGTGGGCGACGCGGCCAGCCGTATCGAGG‑CGGCGCTGAg > 8:26385/1‑149 (MQ=255) ccAGCCCGCTGGCTTCTCGCGGCGTTGGTTGCAGGACATCCTGCGTGGCGAGCTGGGCTTTGATGGGGTGATTTTCAGTGATGACCTGTCGATGGCCGGTGCGCATGTGGTGGGCGACGCGGCCAGCCGTATCGAGG‑CGGCGCTGAgcg > 2:304730/1‑149 (MQ=255) cAGCCCGCTGGCTTCTCGCGGCGTTGGTTGCAGGACATCCTGCGTGGCGAGCTGGGCTTTGATGGGGTGATTTTCAGTGATGACCTGTCGATGGCCGGTGCGCATGTGGTGGGCGACGCGGCCAGCCGTATCGAGG‑CGGCGCTGAgcgc > 5:74259/1‑149 (MQ=255) cAGCCCGCTGGCTTCTCGCGGCGTTGGTTGCAGGACATCCTGCGTGGCGAGCTGGGCTTTGATGGGGTGATTTTCAGTGATGACCTGTCGATGGCCGGTGCGCATGTGGTGGGCGACGCGGCCAGCCGTATCGAGG‑CGGCGCTGAgcgc > 4:299338/1‑149 (MQ=255) cGCTGGCTTCTCGCGGCGTTGGTTGCAGGACATCCTGCGTGGCGAGCTGGGCTTTGATGGGGTGATTTTCAGTGATGACCTGTCGATGGCCGGTGCGCATGTGGTGGGCGACGCGGCCAGCCGTATCGAGG‑CGGCGCTGAGCGCCGGtt < 6:23401/149‑1 (MQ=255) cGCTGGCTTCTCGCGGCGTTGGTTGCAGGACATCCTGCGTGGCGAGCTGGGCTTTGATGGGGTGATTTTCAGTGATGACCTGTCGATGGCCGGTGCGCATGTGGTGGGCGACGCGGCCAGCCGTATCGAGG‑CGGCGCTGAGCGCCGGtt < 8:233902/149‑1 (MQ=255) cGCTGGCTTCTCGCGGCGTTGGTTGCAGGACATCCTGCGTGGCGAGCTGGGCTTTGATGGGGTGATTTTCAGTGATGACCTGTCGATGGCCGGTGCGCATGTGGTGGGCGACGCGGCCAGCCGTATCGAGG‑CGGCGCTGAGCGCCGGtt < 3:391813/149‑1 (MQ=255) gCTGGCTTCTCGCGGCGTTGGTTGCAGGACATCCTGCGTGGCGAGCTGGGCTTTGATGGGGTGATTTTCAGTGATGACCTGTCGATGGCCGGTGCGCATGTGGTGGGCGACGCGGCCAGCCGTATCGAGG‑CGGCGCTCAGCGCCgcctc < 6:290505/149‑5 (MQ=255) cTGGCTTCTCGCGGCGTTGGTTGCAGGACATCCTGCGTGGCGAGCTGGGCTTTGATGGGGTGATTTTCAGTGATGACCTGTCGATGGCCGGTGCGCATGTGGTGGGCGACGCGGCCAGCCGTATCGAGG‑CGGCGCTGAGCGCCGGTtgt < 5:37418/149‑1 (MQ=255) gCTTCTCGCGGCGTTGGTTGCAGGACATCCTGCGTGGCGAGCTGGGCTTTGATGGGGTGATTTTCAGTGATGACCTGTCGATGGCCGGTGCGCATGTGGTGGGCGACGCGGCCAGCCGTATCGAGG‑CGGCGCTGAGCGCCGGTtgtg < 7:71159/147‑1 (MQ=255) gCTTCTCGCGGCGTTGGTTGCAGGACATCCTGCGTGGCGAGCTGGGCTTTGATGGGGTGATTTTCAGTGATGACCTGTCGATGGCCGGTGCGCATGTGGTGGGCGACGCGGCCAGCCGTATCGAGG‑CGGCGCTGAGCGCCGGTtgtg < 8:105383/147‑1 (MQ=255) gCTTCTCGCGGCGTTGGTTGCAGGACATCCTGCGTGGCGAGCTGGGCTTTGATGGGGTGATTTTCAGTGATGACCTGTCGATGGCCGGTGCGCATGTGGTGGGCGACGCGGCCAGCCGTATCGAGG‑CGGCGCTGAGCGCCGGTTGTGa < 7:26385/148‑1 (MQ=255) gCTTCTCGCGGCGTTGGTTGCAGGACATCCTGCGTGGCGAGCTGGGCTTTGATGGGGTGATTTTCAGTGATGACCTGTCGATGGCCGGTGCGCAGGTGGTGGGCGACGCGGCCAGCCGTATCGAGG‑CGGCGCTGAGCGCCGGTTGTGat > 6:144999/1‑149 (MQ=255) ttCTCTCGGCGTTGGTTGGAGGACATCCTGCGTGGCGAGGTGGGCTTTGATGGGGTTATTTTCAGTGATGACCTGTCGATGGCCGGTGCGCATGTGGTGGGCGACGCGGCCAGCCGTATCGAGG‑CGGCTCTCAGCGCCgcctc < 8:123582/143‑5 (MQ=255) ttCTCGCGGCGTTGGTTGCAGGACATCCTGCGTGGCGAGCTGGGCTTTGATGGGGTGATTTTCAGTGATGACCTGTCGATGGCCGGTGCGCATGTGGTGGGCGACGCGGCCAGCCGTATCGAGG‑CGGCGCTGAGCGCCGGTTGTGatat > 8:383517/1‑149 (MQ=255) ttCTCGCGGCGTTGGTTGCAGGACATCCTGCGTGGCGAGCTGGGCTTTGATGGGGTGATTTTCAGTGATGACCTGTCGATGGCCGGTGCGCATGTGGTGGGCGACGCGGCCAGCCGTATCGAGG‑CGGCGCTCAGCGCCgcctc > 7:123582/1‑139 (MQ=255) cgcgGCGTTGGTTGCAGGACATCCTGCGTGGCGAGCTGGGCTTTGATGGGGTGATTTTCAGTGATGACCTGTCGATGGCCGGTGCGCATGTGGTGGGCGACGCGGCCAGCCGTATCGAGG‑CGGCGCTGAGCGcc > 7:86580/1‑134 (MQ=255) cgcgGCGTTGGTTGCAGGACATCCTGCGTGGCGAGCTGGGCTTTGATGGGGTGATTTTCAGTGATGACCTGTCGATGGCCGGTGCGCATGTGGTGGGCGACGCGGCCAGCCGTATCGAGG‑CGGCGCTGAGCGcc < 8:86580/134‑1 (MQ=255) cgTTGGTTGCAGGACATCCTGCGTGGCGAGCTGGGCTTTGATGGGGTGATTTTCAGTGATGACCTGTCGATGGCCGGTGCGCATGTGGTGGGCGACGCGGCCAGCCGTATCGAGG‑CGGCGCTGAGCGCCGGTTGTGATATGGGCCTGgt < 8:51669/149‑1 (MQ=255) ttgCAGGACATCCTGCGTGGCGAGCTGGGCTTTGATGGGGTGATTTTCAGTGATGACCTGTCGATGGCCGGTGCGCATGTGGTGGGCGACGCGGCCAGCCGTATCGAGG‑CGGCGCTGAGCGCCGGTTGTGATATGGGCCTGGTGTGCaa < 6:50490/149‑1 (MQ=255) tGCGTGGCGAGCTGGGCTTTGATGGGGTGATTTTCAGTGATGACCTGTCGATGGCCGGTGCGCATGTGGTGGGCGACGCGGCCAGCCGTATCGAGG‑CGGCGCTGAGCGCCGGTTGTGATATGGGCCTGGTGTGCAATGACCGggcggcg > 1:55104/1‑149 (MQ=255) cGTGGCGAGCTGGGCTTTGATGGGGTGATTTTCAGTGATGACCTGTCGATGGCCGGTGCGCATGTGGTGGGCGACGCGGCCAGCCGTATCGAGG‑CGGCGCTGAGCGCCGGTTGTGATATGGGCCTGGTGTGCAATGACCGggcggcggc < 2:375503/149‑1 (MQ=255) cGTGGCGAGCTGGGCTTTGATGGGGTGATTTTCAGTGATGACCTGTCGATGGCCGGTGCGCATGTGGTGGGCGACGCGGCCAGCCGTAGCGGGG‑CGGCGCTGAGCGCCGGTTGTGATATGGGCCTGGTGTGCAATGACCGggcggcggc < 3:94032/149‑1 (MQ=255) ggCGAGCTGGGCTTTGATGGGGTGATTTTCAGTGATGACCTGTCGATGGCCGGTGCGCATGTGGTGGGCGACGCGGCCAGCCGTATCGAGG‑CGGCGCTGAGCGCCGGTTGTGATATGGGCCTGGTGTGCAATGACCGGgcggcggcg > 3:403459/1‑147 (MQ=255) gCGAGCTGGGCTTTGATGGGGTGATTTTCAGTGATGACCTGTCGATGGCCGGTGCGCATGTGGTGGGCGACGCGGCCAGCCGTATCGAGG‑CGGCGCTGAGCGCCGGTTGTGATATGGGCCTGGTGTGCAATGACCGGGCGGCGGCGGAg < 6:74259/149‑1 (MQ=255) gCTGGGCTTTGATGGGGTGATTTTCAGTGATGACCTGTCGATGGCCGGTGCGCATGTGGTGGGCGACGCGGCCAGCCGTATCGAGG‑CGGCGCTGAGCGCCGGTTGTGATATGGGCCTGGTGTGCAATGACCGGGCGGCGGCGGAGCTgg < 7:264572/149‑1 (MQ=255) aTGGGGTGATTTTCAGTGATGACCTGTCGATGGCCGGTGCGCATGTGGTGGGCGACGCGGCCAGCCGTATCGAGG‑CGGCGCTGAGCGCCGGTTGTGATATGGGCCTGGTGTGCAATGACCGGGCGGCGGCGGAGCTGGCGCTGAGTgc < 5:144999/148‑1 (MQ=255) gTGATTTTCAGTGATGACCTGTCGATGGCCGGTGCGCATGTGGTGGGCGACGCGGCCAGCCGTATCGAGG‑CGGCGCTGAGCGCCGGTTGTGATATGGGCCTGGTGTGCAATGACCGGGCGGCGGCGGAGCTGGCGCTGAGTgcggcg > 6:353890/1‑147 (MQ=255) tGATTTTCAGTGATGACCTGTCGATGGCCGGTGCGCATGTGGTGGGCGACGCGGCCAGCCGTATCGAGG‑CGGCGCTGAGCGCCGGTTGTGATATGGGCCTGGTGTGCAATGACCGGGCGGCGGCGGAGCTGGCGCTGAGTGCGgcgcag > 7:208429/1‑149 (MQ=255) tGATTTTCAGTGATGACCTGTCGATGGCCGGTGCGCATGTGGTGGGCGACGCGGCCAGCCGTATCGAGG‑CGGCGCTGAGCGCCGGTTGTGATATGGGCCTGGTGTGCAATGACCGGGCGGCGGCGGAGCTGGCGCTGAGTGCGgcgcag > 4:339133/1‑149 (MQ=255) aTTTTCAGTGATGACCTGTCGATGGCCGGTGCGCATGTGGTGGGCGACGCGGCCAGCCGTATCGAGG‑CGGCGCTGAGCGCCGGTTGTGATATGGGCCTGGTGTGCAATGACCGGGCGGCGGCGGAGCTGGCGCTGAGTGCGgcgcagcg < 7:383517/149‑1 (MQ=255) aTTTTCAGTGATGACCTGTCGATGGCCGGTGCGCATGTGGTGGGCGACGCGGCCAGCCGTATCGAGG‑CGGCGCTGAGCGCCGGTTGTGATATGGGCCTGGTGTGCAATGACCGGGCGGCGGCGGAGCTGGCGCTGAGTGCGgcgcagcg > 8:139090/1‑149 (MQ=255) tttCAGTGATGACCTGTCGATGGCCGGTGCGCATGTGGTGGGCGACGCGGCCAGCCGTATCGAGG‑CGGCGCTGAGCGCCGGTTGTGATATGGGCCTGGTGTGCAATGACCGGGCGGCGGCGGAGCTgg < 3:174129/128‑1 (MQ=255) tttCAGTGATGACCTGTCGATGGCCGGTGCGCATGTGGTGGGCGACGCGGCCAGCCGTATCGAGG‑CGGCGCTGAGCGCCGGTTGTGATATGGGCCTGGTGTGCAATGACCGGGCGGCGGCGGAGCTgg > 4:174129/1‑128 (MQ=255) aGTGATGACCTGTCGATGGCCGGTGCGCATGTGGTGGGCGACGCGGCCAGCCGTATCGAGG‑CGGCGCTGAGCGCCGGTTGTGATATGGGCCTGGTGTGCAATGACCGGGCGGCGGCGGAGCTGGCGCTGAGTGCGGCGCAGCGCATGa < 3:339133/148‑1 (MQ=255) tgatgaCCTGTCGATGGCCGGTGCGCATGTGGTGGGCGACGCGGCCAGCCGTATCGAGG‑CGGCGCTGAGCGCCGGTTGTGATATGGGCCTGGTGTGCAATGACCGGGCGGCGGCGGAGCTGGCGCTGAGTGCGGCGCAGCGCATGAAgg > 5:142137/1‑149 (MQ=255) gaCCTGTCGATGGCCGGTGCGCATGTGGTGGGCGACGCGGCCAGCCGTATCGAGG‑CGGCGCTGAGCGCCGGTTGTGATATGGGCCTGGTGTGCAATGACCGGGCGGCGGCGGAGCTGGCGCTGAGTGCGGCGCAGCGCATGAAGGTc > 4:193999/1‑147 (MQ=255) ccTGTCGATGGCCGGTGCGCATGTGGTGGGCGACGCGGCCAGCCGTATCGAGG‑CGGCGCTGAGCGCCGGTTGTGATATGGGCCTGGTGTGCAATGACCGGGCGGCGGCGGAGCTGGCGCTGAGTGCGGCGCAGCGCATGAAGGTCAAGc < 8:208429/149‑1 (MQ=255) cTGTCGATGGCCGGTGCGCATGTGGTGGGCGACGCGGCCAGCCGTATCGAGG‑CGGCGCTGAGCGCCGGTTGTGATATggg < 2:401200/80‑1 (MQ=255) cTGTCGATGGCCGGTGCGCATGTGGTGGGCGACGCGGCCAGCCGTATCGAGG‑CGGCGCTGAGCGCCGGTTGTGATATggg > 1:401200/1‑80 (MQ=255) tGTCGATGGCCGGTGCGCATGTGGTGGGCGACGCGGCCAGCCGTATCGAGG‑CGGCGCTGAGCGCCGGTTGTGATATGGGCCTGGTGTGCAATGACCGGGCGGCGGCGGAGCTGGCGCTGAGTGCGGCGCAGCGCATGAAGGTCAAGCCa > 6:420921/1‑149 (MQ=255) tCGATGGCCGGTGCGCATGTGGTGGGCGACGCGGCCAGCCGTATCGAGG‑CGGCGCTGAGCGCCGGTTGTGATATGGGCCTGGTGTGCAATGACCGGGCGGCGCCGGAGCTGGCGCTGAGTGCGGCGCAGCGCATGAAGGTCAAGCCAt < 1:304730/148‑1 (MQ=255) gCCGGTGCGCATGTGGTGGGCGACGCGGCCAGCCGTATCGAGG‑CGGCGCTGAGCGCCGGTTGTGATATGGGCCTGGTGTGCAATGACCGGGCGGCGGCGGAGCTGGCGCTGAGTGCGGCGCAGCGCATGAAGGTCAAGCCATCGCcgcg > 5:233942/1‑149 (MQ=255) gCCGGTGCCCATGTGGTGGGCGACGCGGCCAGCCGTATCGAGG‑CGGCGCTGAGCGCCGGTTGTGATATGGGCCTGGTGTGCAATGACCGGGCGGCGGCGGAGCTGGCGCTGAGTGCGGCGCAGCGCATGAAGGTCAAGCCATCGCcgcg > 1:167091/1‑149 (MQ=255) gCCGGTGCCCATGTGGTGGGCGACGCGGCCAGCCGTATCGAGG‑CGGCGCTGAGCGCCGGTTGTGATATGGGCCTGGTGTGCAATGACCGGGCGGCGGCGGAGCTGGCGCTGAGTGCGGCGCAGCGCATGAAGGTCAAGCCATCGCcgcg > 1:160852/1‑149 (MQ=255) ccGGTGCGCATGTGGTGGGCGACGCGGCCAGCCGTATCGAGG‑CGGCGCTGAGCGCCGGTTGTGATATGGGCCTGGTGTGCAATGACCGGGCGGCGGCGGAGCTGGCGCTGAGTGCGGCGCAGCGCATGAAGGTCAAGCCATCGCCGCgg < 5:353890/149‑1 (MQ=255) gTGCGCATGTGGTGGGCGACGCGGCCAGCCGTATCGAGG‑CGGCGCTGAGCGCCGGTTGTGATATGGGCCTGGTGTGCAATGACCGGGCGGTGGCGGAGCTGGCGCTGAGTGCGGCGCAGCGCATGAAGGTCAAGCCATCGCCGCGGAtt > 3:178438/1‑149 (MQ=255) gTGCGCATGTGGTGGGCGACGCGGCCAGCCGTATCGAGG‑CGGCGCTGAGCGCCGGTTGTGATATGGGCCTGGTGTGCAATGACCGGGCGGCGGCGGAGCTGGCGCTGAGTGCGGCGCAGCGCATGAAGGTCAAGCCATCGCCGCGGAtt < 7:139090/149‑1 (MQ=255) gcgcATGTGGTGGGCGACGCGGCCAGCCGTATCGAGGACGGCGCTGAGCGCCGGTTGTGATATGGGCCTGGTGTGCAATGACCGGGCGGCGGCGGAGCTGGCGCTGAGTGCGGCGCAGCGCATGAAGGTCGAGCCATCGCCGCGGATTg > 1:297284/1‑149 (MQ=255) gcgcATGTGGTGGGCGACGCGGCCAGCCGTATCGAGG‑CGGCGCTGAGCGCCGGTTGTGATATGGGCCTGGTGTGCAATGACCGGGCGGCGGCGGAGCTGGCGCTGAGTGCGGCGCAGCGCATGAAGGTCGAGCCATCGCCGCGGATTgc > 5:283587/1‑149 (MQ=255) cgcATGTGGTGGGCGACGCGGCCAGCCGTATCGAGG‑CGGCGCTGAGCGCCGGTTGTGATACGGGCCTGGTGTGCAATGACCGGGCGGCGGCGGAGCTGGCGCTGAGTGCGGCGCAGCGCATGAAGGTCAAGCCATCGCCGCGGATTgc < 6:142137/148‑1 (MQ=255) cATGTGGTGGGCGACGCGGCCAGCCGTATCGAGG‑CGGCGCTGAGCGCCGGTTGTGATATGGGCCTGGTGTGCAATGACCGGGCGGCGGCGGAGCTGGCGCTGAGTGCGGCGCAGCGCATGAAGGTCAAGCCATCGCCGCGGATTGcgcg < 4:235391/149‑1 (MQ=255) tggtggGCGACGCGGCCAGCCGTATCGAGG‑CGGCGCTGAGCGCCGGTTGTGATATGGGCCTGGTGTGCAATGACCGGGCGGCGGCGGAGCTGGCGCTGAGTGCGGCGCAGCGCATGAAGGTCGAGCCATCGCCGCGGATTGCGCGGAt < 6:283587/148‑1 (MQ=255) tggtggGCGACGCGGCCAGCCGTATCGAGG‑CGGCGCTGAGCGCCGGTTGTGATATGGGCCTGGTGTGCAATGACCGGGCGGCGGCGGAGCTGGCGCTGAGTGCGGCGCAGCGCATGAAGGTCGAGCCATCGCCGCGGATTGCGCGGAt < 2:297284/148‑1 (MQ=255) tggtggGCGACGCGGCCAGCCGTATCGAGG‑CGGCGCTGAGCGCCGGTTGTGATATGGGCCTGGTGTGCAATGACCGGGCGGCGGCGGAGCTGGCGCTGAGTGCGGCGCAGCGCATGAAGGTCAAGCCATCGCCGCGGATTGCGCGGAt < 7:397529/148‑1 (MQ=255) tggtggGCGACGCGGCCAGCCGTATCGAGG‑CGGCGCTGAGCGCCGGTTGTGATATGGGCCTGGTGTGCAATGACCGGGCGGCGGCGGAGCTGGCGCTGAGTGCGGCGCAGCGCATGAAGGTCAAGCCATCGCCGCGGATTGCGCGGATg > 3:33707/1‑149 (MQ=255) ggCGACGCGGCCAGCCGTATCGAGG‑CGGCGCTGAGCGCCGGTTGTGATATGGGCCTGGTGTGCAATGACCGGGCGGCGGCGGAGCTGGCGCTGAGTGCGGCGCAGCGCATGAAGGTCAAGCCATCGCCGCGGATTGCGCGGATGCGTgg < 4:33707/149‑1 (MQ=255) gCGACGCGGCCAGCCGTATCGAGG‑CGGCGCTGAGCGCCGGTTGTGATATGGGCCTGGTGTGCAATGACCGGGCGGCGGCGGAGCTGGCGCTGAGTGCGGCGCAGCGCATGAAGGTCAAGCCATCGCCGCGGATTGCGCGGATGCGTggg < 2:93190/149‑1 (MQ=255) gcgGCCAGCCGTATCGAGG‑CGGCGCTGAGCGCCGGTTGTGATATGGGCCTGGTGTGCAATGACCGGGCGGCGGCGGAGCTGGCGCTGAGTGCGGCGCAGCGCATGAAGGTCAAGCCATCGCCGCGGATTGCGCGGATGCGTGGGCAAgg < 5:420921/149‑1 (MQ=255) gcgGCCAGCCGTATCGAGG‑CGGCGCTGAGCGCCGGTTGTGATATGGGCCTGGTGTGCAATGACCGGGCGGCGGCGGAGCTGGCGCTGAGTGCGGCGCAGCGCATGAAGGTCAAGCCATCGCCGCGGATTGCGCGGATGCGTGGGCAAgg < 5:164773/149‑1 (MQ=255) gCCAGCCGTATCGAGG‑CGGCGCTGAGCGCCGGTTGTGATATGGGCCTGGTGTGCAATGACCGGGCGGCGGCGGAGCTGGCGCTGAGTGCGGCGCAGCGCATGAAGGTCAAGCCATCGCCGCGGATTGCGCGGATGCGTGGGCAAGGGtt > 1:226354/1‑149 (MQ=255) cAGCCGTATCGAGG‑CGGCGCTGAGCGCCGGTTGTGATATGGGCCTGGTGTGCAATGACCGGGCGGCGGCGGAGCTGGCGCTGAGTGCGGCGCAGCGCATGAAGGTCAAGCCATCGCCGCGGATTGCGCGGATGCGTGGGCAAGGGTTTg > 7:67234/1‑149 (MQ=255) cAGCCGTATCGAGG‑CGGCGCTGAGCGCCGGTTGTGATATGGGCCTGGTGTGCAATGACCGGGCGGCGGCGGAGCTGGCGCCGAGTGCGGCGCAGCGCATGAAGGTCAAGCCATCGCCGCGGATTGCGCGGATGCGTGGGCAAGGGTTTg < 7:130766/149‑1 (MQ=255) aGCCGTATCGAGG‑CGGCGCTGAGCGCCGGTTGTGATATGGGCCTGGTGTGCAATGACCGGGCGGCGGCGGAGCTGGCGCTGAGTGCGGCGCAGCGCATGAAGGTCAAGCCATCGCCGCGGATTGCGCGGATGCGTGGGCAAGGGTTTgc < 6:233942/149‑1 (MQ=255) ccGTATCGAGG‑CGGCGCTGAGCGCCGGTTGTGATATGGGCCTGGTGTGCAATGACCGGGCGGCGGCGGAGCTGGCGCTGAGTGCGGCGCAGCGCATGAAGGTCAAGCCATCGCCGCGGATTGCGCGGAt > 6:420213/1‑129 (MQ=255) ccGTATCGAGG‑CGGCGCTGAGCGCCGGTTGTGATATGGGCCTGGTGTGCAATGACCGGGCGGCGGCGGAGCTGGCGCTGAGTGCGGCGCAGCGCATGAAGGTCAAGCCATCGCCGCGGATTGCGCGGAt < 5:420213/129‑1 (MQ=255) ccGTATCGAGG‑CGGCGCTGAGCGCCGGTTGTGATATGGGCCTGGTGTGCAATGACCGGGCGGCGGCGGAGCTGGCGCTGAGTGCGGCGCAGCGCATGAAGGTCAAGCCATCGCCGCGGATTGCGCGGATGCGTGGGCAAGGGTTTgcgc > 6:286660/1‑149 (MQ=255) gAGG‑CGGCGCTGAGCGCCGGTTGTGATATGGGCCTGGTGTGCAATGACCGGGCGGCGGCGGAGCTGGCGCTGAGTGCGGCGCAGCGCATGAAGGTCAAGCCATCGCCGCGGATTGCGCGGATGCGTGGGCAAGGGTTTgc > 7:86828/1‑140 (MQ=255) gAGG‑CGGCGCTGAGCGCCGGTTGTGATATGGGCCTGGTGTGCAATGACCGGGCGGCGGCGGAGCTGGCGCTGAGTGCGGCGCAGCGCATGAAGGTCAAGCCATCGCCGCGGATTGCGCGGATGCGTGGGCAAGGGTTTgc < 8:86828/140‑1 (MQ=255) aGG‑CGGCGCTGAGCGCCGGTTGTGATATGGGCCTGGTGTGCAATGACCGGGCGGCGGCGGAGCTGGCGCTGAGTGCGGCGCAGCGCATGAAGGTCAAGCCATCGCCGCGGATTGCGCGGATGCGTGGGCAAGGGTTTGCGCGAACCGAt < 5:255549/149‑1 (MQ=255) aaccggcgCTCAGCGCCGGTTGTGATATGGGCCTGGTGTGCAATGACCGGGCGGCGGCGGAGCTGGCGCTGAGTGCGGCGCAGCGCATGAAGGTCAAGCCATCGCCGCGGATTGCGCGGATGCGTGGGCAAGGGTTTGCGCGAACCGAt > 3:110114/4‑149 (MQ=255) ccggcgCTCAGCGCCGGTTGTGATATGGGCCTGGTGTGCAATGACCGGGCGGCGGCGGAGCTGGCGCTGAGTGCGGCGCAGCGCATGAAGGTCAAGCCATCGCCGCGGATTGCGCGGATGCGTGGGGAAGGGTTTGCGCGAACCGATTa > 7:315351/2‑149 (MQ=255) ggcgCTGAGCGCCGGTTGTGATATGGGCCTGGTGTGCAATGACCGGGCGGCGGCGGAGCTGGCGCTGAGTGCGGCGCAGCGCATGAAGGTCAAGCCATCGCCGCGGATTGCGCGGATGCGTGGGCAAGGGTTTGCGCGAACCGATTATc < 5:286660/149‑1 (MQ=255) | AACCAGCCCGCTGGCTTCTCGCGGCGTTGGTTGCAGGACATCCTGCGTGGCGAGCTGGGCTTTGATGGGGTGATTTTCAGTGATGACCTGTCGATGGCCGGTGCGCATGTGGTGGGCGACGCGGCCAGCCGTATCGAGG‑CGGCGCTGAGCGCCGGTTGTGATATGGGCCTGGTGTGCAATGACCGGGCGGCGGCGGAGCTGGCGCTGAGTGCGGCGCAGCGCATGAAGGTCAAGCCATCGCCGCGGATTGCGCGGATGCGTGGGCAAGGGTTTGCGCGAACCGATTATC > NC_002947/2447272‑2447560 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |