| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 223,870 | G→C | 5.9% | G233G (GGG→GGC) ‡ | PP_0171 → | ABC transporter ATP‑binding protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 223,870 | 0 | G | C | 5.9% | 275.6 / 5.3 | 85 | G233G (GGG→GGC) ‡ | PP_0171 | ABC transporter ATP‑binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (45/35); new base C (3/2); total (48/37) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.64e-01 | |||||||||||
CTGGATGCGCTGACCCGGCGCAAGATGCAGGAAGAGCTGTTGCTGCTGTGGGAGGAAGTGCGGTTCACCCTGTTGTTCGTCACCCACTCCATCGAAGAAGCACTGGTGGTTGGCAACCGTATCCTGCTGTTGTCGCCGCACCCGGGGCGGGTGCGCGCCGAGGTGCATAGCCATCAATACGGCCTGGGCAGCCTGGGTGGCAGCGACTTCCAGGCCAGTGCCCGGCGTATCCACCGTTTGCTGTTCGATGAAGCAGATATCCCGGAACAGCCTGACAACCTTGGGTTCAAC > NC_002947/223724‑224014 | cTGGATGCGCTGACCCGGCGCAAGATGCAGGAAGAGCTGTTGCTGCTGTGGGAGGAAGTGCGGTTCACCCTGTTGTTCGTCACCCACTCCATCGAAGAAGCACTGGTGGTTGGCAACCGTATCCTGCTGTTGTCGCCGCACCCGGGGCg > 7:145622/1‑149 (MQ=255) ggATGCGCTGACCCGGCGCAAGATGCAGGAAGAGCTGTTGCTGCTGTGGGAGGAAGTGCGGTTCACCCTGTTGTTCGTCACCCACTCCATCGAAGAAGCACTGGTGGTTGGCAACCGTATCCTGCTGTTGTCGCCGCACCCGGGGCggg > 8:119309/1‑149 (MQ=255) gATGCGCTGACCCGGCGCAAGATGCAGGAAGAGCTGTTGCTGCTGTGGGAGGAAGTGCGGTTCACCCTGTTGTTCGTCACCCACTCCATCGAAGAAGCACTGGTGGTTGGCAACCGTATCCTGCTGTTGTCG‑CGCACCCGCCCCGGGTg > 7:7902/1‑149 (MQ=255) gcgcTGACCCGGCGCAAGATGCAGGAAGAGCTGTTGCTGCTGTGGGAGGAAGTGCGGTTCACCCTGTTGTTCGTCACCCACTCCATCGAAGAAGCACTGGTGGTTGGCAACCGTATCCTGCTGTTGTCGCCGCACCCGGGGCGGGTgcg > 1:323989/1‑149 (MQ=255) cgcTGACCCGGCGCAAGATGCAGGAAGAGCTGTTGCTGCTGTGGGAGGAAGTGCGGTTCACCCTGTTGTTCGTCACCCACTCCATCGAAGAAGCACTGGTGGTTGGCAACCGTATCCTGCTGTTGTCGCCGCACCCGGGGCGGGTgcgc < 3:217269/149‑1 (MQ=255) cgcTGACCCGGCGCAAGATGCAGGAAGAGCTGTTGCTGCTGTGGGAGGAAGTGCGGTTCACCCTGTTGTTCGTCACCCACTCCATCGAAGAAGCACTGGTGGTTGGCAACCGTATCCTGCTGTTGTCG‑CGCACCCGCCCCGGGTgcggc < 8:7902/149‑3 (MQ=255) cgcTGACCCGGCGCAAGATGCAGGAAGAGCTGTTGCGGCTGTGGGAGGAAGTGCGGTTCACCCTGTTGTTCGTCACCCACTCCATCGAAGAAGCACTGGTGGTTGGCAACCGTATCCTGCTGTTGTCGCCGCACCCGGGGCGGGTgcgc < 5:438158/149‑1 (MQ=255) gcTGACCCGGGGCAAGATGCAGGAAGAGCTGTTGCTGCTGTGGGAGGAAGTGCGGTTCACCCTGTTGTTCGTCACCCACTCCATCGAAGAAGCACTGGTGGTTGGCAACCGTATCCTGCTGTTGTCGCCGCACCCGGGGCGGGTgcgcg > 2:291317/1‑149 (MQ=255) gcTGACCCGGCGCAAGATGCAGGAAGAGCTGTTGCTGCTGTGGGAGGAAGTGCGGTTCACCCTGTTGTTCGTCACCCACTCCATCGAAGAAGCACTGGTGGTTGGCAACCGTATCCTGCTGTTGTCGCCGCACCCGGGGCGGGTgcgcg > 4:229161/1‑149 (MQ=255) gcTGACCCGGCGCAAGATGCAGGAAGAGCTGTTGCTGCTGTGGGAGGAAGTGCGGTTCACCCTGTTGTTCGTCACCCACTCCATCGAAGAAGCACTGGTGGTTGGCAACCGTATCCTGCTGTTGTCGCCGCACCCGGGGCGGGTgcgcg > 2:285350/1‑149 (MQ=255) cTGACCCGGCGCAAGATGCAGGAAGAGCTGTTGCTGCTGTGGGAGGAAGTGCGGTTCACCCTGTTGTTCGTCACCCACTCCATCGAAGAAGCACTGGTGGTTGGCAACCGTATCCTGCTGTTGTCGCCGCACCCGGGGCGGGTgcgcgc > 6:160446/1‑149 (MQ=255) cTGACCCCCCCCAAGATGCAGGAAGAGCTCTTGCTGCTGTGGGAGGAAGTGCCGTTCACCCAGATGTTCGTCACCCACAACAACGAACAAGCACTGGTCGATGGCAACCGTATCCTACTGTAGTCGCCGCACCCTCTGCCGGTgcgcgc > 8:105663/1‑149 (MQ=255) tGACCCGGCGCAAGAGGCAGGAAGAGCTGGTGCTGCTGTGGGAGGAAGACCGGTTCACCCTGTAGTTCGTCACCCACTCCATCGAAGCAGCACTGGTGGTTGGCAACCGTATCCTGCTGTTCTCGCCGCCACCGGGGCGGGAGCGCGcc > 5:129224/1‑149 (MQ=255) cccGGCGCAAGATGCAGGAAGAGCTGTTGCTGCTGTGGGAGGAAGTGCGGTTCACCCTGTTGTTCGTCACCCACTCCATCGAAGAAGCACTGGTGGTTGGCAACCGTATCCTGCTGTTGTCGCCGCACCCGGGGCGGGTGCGCGCCGAg > 4:259545/1‑149 (MQ=255) cAAGATGCAGGAAGAGCTGTTGCTGCTGTGGGAGGAAGTGCGGTTCACCCTGTTGTTCGTCACCCACTCCATCGAAGAAGCACTGGTGGTTGGCAACCGTATCCTGCTGTTGTCGCCGCACCCGGGGCGGGTGCGCGCCGAGGTGCATa < 2:141256/149‑1 (MQ=255) gATGCAGGAAGAGCTGTTGCTGCTGTGGGAGGAAGTGCGGTTCACCCTGTTGTTCGTCACCCACTCCATCGAAGAAGCACTGGTGGTTGGCAACCGTATCCTGCTGTTGTCGCCGCACCCGGGGCGGGTGCGCGCCGAGGTGCATAGc > 3:257313/1‑148 (MQ=255) tGCAGGAAGAGCTGTTGCTGCTGTGGGAGGAAGTGCGGTTCACCCTGTTGTTCGTCACCCACTCCATCGAAGAAGCACTGGTGGTTGGCAACCGTATCCTGCTGTTGTCGCCGCACCCGGGGCGGGTGCGCGCCGAGGTGCATAGCCAt < 4:61166/149‑1 (MQ=255) gCAGGAAGAGCTGTTGCTGCTGTGGGAGGAAGTGCGGTTCACCCTGTTGTTCGTCACCCACTCCATCGAAGAAGCACTGGTGGTTGGCAACCGTATCCTGCTGTTGTCGCCGCACCCGGGGCGGGTGCGCGCCGAGGTGCATAGCCAt > 2:229731/1‑148 (MQ=255) cAGGAAGAGCTGTTGCTGCTGTGGGAGGAAGTGCGGTTCACCCTGTTGTTCGTCACCCACTCCATCGAAGAAGCACTGGTGGTTGGCAACCGTATCCTGCTGTTGTCGCCGCACCCGGGGCGGGTGCGCGCCGAGGTGCATAGCCATc < 2:296263/148‑1 (MQ=255) gagCTGTTGCTGCTGTGGGAGGAAGTGCGGTTCACCCTGTTGTTCGTCACCCACTCCATCGAAGAAGCACTGGTGGTTGGCAACCGTATCCTGCTGTTGTCGCCGCACCCGGGGCGGGTGCGCGCCGAGGTGCATAGCCATCAATACgg > 6:375386/1‑149 (MQ=255) cTGTTGCTGCTGTGGGAGGAAGTGCGGTTCACCCTGTTGTTCGTCACCCACTCCATCGAAGAAGCACTGGTGGTTGGCAACCGTATCCTGCTGTTGTCGCCGCACCCGGGGCGGGTGCGCGCCGAGGTGCATAGCCATCAATACGGCCt > 6:26763/1‑149 (MQ=255) gTTGCTGCTGTGGGAGGAAGTGCGGTTCACCCTGTTGTTCGTCACCCACTCCATCGAAGAAGCACTGGTGGTTGGCAACCGTATCCTGCTGTTGTCGCCGCACCCGGGGCGGGTGCGCGCCGAGGTGCATAGCCATCAATACGGCCTgg > 6:184722/1‑149 (MQ=255) gTTGCTGCTGTGGGAGGAAGTGCGGTTCACCCTGTTGTTCGTCACCCACTCCATCGAAGAAGCACTGGTGGTTGGCAACCGTATCCTGCTGTTGTCGCCGCACCCGGGGCGGGTGCGCGCCGAGGTGCATAGCCATCAATACGGCCTgg > 3:330884/1‑149 (MQ=255) ttGCTGCTGTGGGAGGAAGTGCGGTTCACCCTGTTGTTCGTCACCCACTCCATCGAAGAAGCACTGGTGGTTGGCAACCGTATCCTGCTGTTGTCGCCGCACCCGGGGCGGGTGCGCGCCGAGGTGCATAGCCATCAATACGGCCTgg < 4:330884/148‑1 (MQ=255) tgGGAGGAAGTGCGGTTCACCCTGTTGTTCGTCACCCACTCCATCGAAGAAGCACTGGTGGTTGGCAACCGTATCCTGCTGTTGTCGCCGCACCCGGGGCGGGTGCGCGCCGATGTGCATAGCCATCAATACGGCCTGGGCAGCCTggg < 7:215780/149‑1 (MQ=255) tgGGAGGAAGTGCGGTTCACCCTGTTGTTCGTCACCCACTCCATCGAAGAAGCACTGGTGGTTGGCAACCGTATCCTGCTGTTGTCGCCGCACCCGGGGCGGGTGCGCGCCGAGGTGCATAGCCATCAATACGGCCTGGGCAGCCTggg < 7:221892/149‑1 (MQ=255) tgGGAGGAAGTGCGGTTCACCCTGTTGTTCGTCACCCACTCCATCGAAGAAGCACTGGTGGTTGGCAACCGTATCCTGCTGTTGTCGCCGCACCCGGGGCGGGTGCGCGCCGAGGTGCATAGCCATCAATACGGCCTGGGCAGCCTgg < 7:119309/148‑1 (MQ=255) ggaggaAGTGCGGTTCACCCTGTTGTTCGTCACCCACTCCATCGAAGAAGCACTGGTGGTTGGCAACCGTATCCTGCTGTTGTCGCCGCACCCGGGGCGGGTGCGCGCCGAGGTGCATAGCCATCAATACGGCCTGGGCAGCCTGGGTg > 7:47450/1‑149 (MQ=255) ggaggaAGTGCGGTTCACCCTGTTGTTCGTCACCCACTCCATCGAAGAAGCACTGGTGGTTGGCAACCGTATCCTGCTGTTGTCGCCGCACCCGGGGCGGGTGCGCGCCGAGGTGCATAGCCATCAATACGGCCTGGGCAGCCTGGGTg > 6:352428/1‑149 (MQ=255) gaggaAGTGCGGTTCACCCTGTTGTTCGTCACCCACTCCATCGAAGAAGCACTGGTGGTTGGCAACCGTATCCTGCTGTTGTCGCCGCACCCGGGGCGGGTGCGCGCCGAGGTGCATAGCCATCAATACGGCCTGGGCAGCCTGGGTgg > 2:58206/1‑149 (MQ=255) gTTCACCCTGTTGTTCGTCACCCACTCCATCGAAGAAGCACTGGTGGTTGGCAACCGTATCCTGCTGTTGTCGCCGCACCCGGGGCGGGTGCGCGCCGAGGTGCATAGCCATCAATACGGCCTGGGCAGCCTGGGTGGCAGCGACTTcc < 1:301941/149‑1 (MQ=255) cACCCTGTTGTTCGTCACCCACTCCATCGAAGAAGCACTGGTGGTTGGCAACCGTATCCTGCTGTTGTCGCCGCACCCGGGGCGGGTGCGCGCCGAGGTGCATAGCCATCAATACGGCCTGGGCAGCCTGGGTGGCAGCGACTTCCAg < 5:160446/148‑1 (MQ=255) aCCCTGTTGTTCGTCACCCACTCCATCGAAGAAGCACTGGTGGTTGGCAACCGTATCCTGCTGTTGTCGCCGCACCCGGGGCGGGTGCGCGCCGAGGTGCATAGCCATCAATACGGCCTGGGCAGCCTGGGTGGCAGCGACTTCCAGGc > 2:37776/1‑149 (MQ=255) ccTGTTGTTCGTCACCCACTCCATCGAAGAAGCACTGGTGGTTGGCAACCGTATCCTGCTGTTGTCGCCGCACCCGGGGCGGGTGCGCGCCGAGGTGCATAGCCATCAATACGGCCTGGGCAGCCTGGGTGGCAGCGACTTCCAGGc > 1:220616/1‑147 (MQ=255) ccTGTTGTTCGTCACCCACTCCATCGAAGAAGCACTGGTGGTTGGCAACCGTATCCTGCTGTTGTCGCCGCACCCGGGGCGGGTGCGCGCCGAGGTGCATAGCCATCAATACGGCCTGGGCAGCCTGGGTGGCAGCGACTTCCAGGCCa < 2:220616/149‑1 (MQ=255) ccTGTTGTTCGTCACCCACTCCATCGAAGAAGCACTGGTGGTTGGCAACCGTATCCTGCTGTTGTCGCCGCACCCGGGGCGGGTGCGCGCCGAGGTGCATAGCCATCAATACGGCCTGGGCAGCCTGGGTGGCAGCGACTTCCAGGCCa < 5:352428/149‑1 (MQ=255) ccTGTTGTTCGTCACCCACTCCATCGAAGAAGCACTGGTGGTTGGCAACCGTATCCTGCTGTTGTCGCCGCACCCGGGGCGGGTGCGCGCCCAGGTGCATAGCCATCAATACGGCCTGGGCAGCCTGGGTGGCAGCGACTTCCAGGc > 6:289279/1‑147 (MQ=255) tgttgtTCGTCACCCACTCCATCGAAGAAGCACTGGTGGTTGGCAACCGTATCCTGCTGTTGTCGCCGCACCCGGGGCGGGTGCGCGCCGAGGTGCATAGCCATCAATACGGCCTGGGCAGCCTGGGt < 6:39984/128‑1 (MQ=255) tgttgtTCGTCACCCACTCCATCGAAGAAGCACTGGTGGTTGGCAACCGTATCCTGCTGTTGTCGCCGCACCCGGGGCGGGTGCGCGCCGAGGTGCATAGCCATCAATACGGCCTGGGCAGCCTGGGt > 5:39984/1‑128 (MQ=255) tgttgtTCGTCACCCACTCCATCGAAGAAGCACTGGTGGTTGGCAACCGTATCCTGCTGTTGTCGCCGCACCCGGGGCGGGTGCGCGCCGAGGTGCATAGCCATCAATACGGCCTGGGCAGCCTGGGTGGCAGCGACTTCCAGGCCAGt > 7:162280/1‑149 (MQ=255) gttCGTCACCCACTCCATCGAAGAAGCACTGGTGGTTGGCAACCGTATCCTGCTGTTGTCGCCGCACCCGGGGCGGGTGCGCGCCGAGGTGCATAGCCATCAATACGGCCTGGGCAGCCTGGGTGGCAGCGACTTCCAGGc < 7:324623/141‑1 (MQ=255) gttCGTCACCCACTCCATCGAAGAAGCACTGGTGGTTGGCAACCGTATCCTGCTGTTGTCGCCGCACCCGGGGCGGGTGCGCGCCGAGGTGCATAGCCATCAATACGGCCTGGGCAGCCTGGGTGGCAGCGACTTCCAGGc > 8:324623/1‑141 (MQ=255) cGTCACCCACTCCATCGAAGAAGCACTGGTGGTTGGCAACCGTATCCTGCTGTTGTCGCCGCACCCGGGGCGGGTGCGCGCCGAGGTGCATAGCCATCAATACGGCCTGGGCAGCCTGGGTGGCAGCGACTTCCAGGCCAGTGCCCgg < 1:58206/148‑1 (MQ=255) gTCACCCACTCCATCGAAGAAGCACTGGTGGTTGGCAACCGTATCCTGCTGTTGTCGCCGCACCCGGGGCGGGTGCGCGCCGAGGTGCATAGCCATCAATACGGCCTGGGCAGCCTGGGTGGCAGCGACTTCCAGGCCAGTGCCCGGc < 6:237376/148‑1 (MQ=255) tCACCCACTCCATCGAAGAAGCACTGGTGGTTGGCAACCGTATCCTGCTGTTGTCGCCGCACCCGGGGCGGGTGCGCGCCGAGGTGCATAGCCATCAATACGGCCTGGGCAGCCTGGGTGGCAGCGACTTCCAGGCCAGTGCCCGGCg > 1:201774/1‑148 (MQ=255) cACCCACTCCATCGAAGAAGCACTGGTGGTTGGCAACCGTATCCTGCTGTTGTCGCCGCACCCGGGGCGGGTGCGGGCCGAGGTGCATAGCCATCAATACGGCCTGGGCAGCCTGGGTGGCAGCGACTTCCAGGCCAGTGCCCGTCGTa < 4:44362/149‑1 (MQ=255) ccACTCCATCGAAGAAGCACTGGTGGTTGGCAACCGTATCCTGCTGTTGTCGCCGCACCCGGGGCGGGTGCGCGCCGAGGTGCATAGCCATCAATACGGCCTGGGCAGCCTGGGTGGCAGCGACTTCCAGGCCAGTGCCCGGCGTATcc > 8:297135/1‑149 (MQ=255) ccATCGAAGAAGCACTGGTGGTTGGCAACCGTATCCTGCTGTTGTCGCCGCACCCGGGGCGGGTGCGCGCCGAGGTGCATAGCCATCAATACGGCCTGGGCAGCCTGGGTGGCAGCGACTTCCAGGCCAGTGCCCGGCGTATCCACCGt > 3:364457/1‑149 (MQ=255) cATCGAAGAAGCACTGGTGGTTGGCAACCGTATCCTGCTGTTGTCGCCGCACCCGGGGCGGGTGCGCGCCGAGGTGCATAGCCATCAATACGGCCTGGGCAGCCTGGGTGGCAGCGACTTCCAGGCCAGTGCCCGGCGTATCCACCGtt > 4:331700/1‑149 (MQ=255) tCGAAGAAGCACTGGTGGTTGGCAACCGTATCCTGCTGTTGTCGCCGCACCCGGGGCGGGTGCGCGCCGAGGTGCATAGCCATCAATACGGCCTGGGCAGCCTGGGTGGCAGCGACTTCCAGGCCAGTGCCCGGCGTATCCACCGTTTg < 8:162280/149‑1 (MQ=255) aagCACTGGTGGTTGGCAACCGTATCCTGCTGTTGTCGCCGCACCCGGGGCGGGTGCGCGCCGAGGTGCATAGCCATCAATACGGCCTGGGCAGCCTGGGTGGCAGCGACTTCCAGGCCAGTGCCCGGCGTATCCACCGTTTGCTGTTc > 6:265474/1‑149 (MQ=255) agCACTGGTGGTTGGCAACCGTATCCTGCTGTTGGCGCCGCACCCGGGGCGGGTGCGCGCCGAGGTGCATAGCCATCAATACGGCCTGGGCAGCCTGGGTGGCAGCGACTTCCAGGCCAGTGCCCGGCGTATCCACCGTTTGCTGTTCg < 4:257313/149‑1 (MQ=255) gCACTGGTGGTTGGCAACCGTATCCTGCTGTTGTCGCCGCACCCGGGGCGGGTGCGCGCCGAGGTGCATAGCCATCAATACGGCCTGGGCAGCCTGGGTGGCAGCGACTTCCATGCCAGTGCCCGGCGTATCCACCGTTTGCTGTTCGa < 1:291317/149‑1 (MQ=255) gCACTGGTGGTTGGCAACCGTATCCTGCTGTTGTCGCCGCACCCGGGGCGGGTGCGCGCCGAGGTGCATAGCCATCAATACGGCCTGGGCAGCCTGGGTGGCAGCGACTTCCATGCCAGTGCCCGGCGTATCCACCGTTTGCTGTTCGa < 1:285350/149‑1 (MQ=255) gCACTGGTGGTTGGCAACCGTATCCTGCTGTTGTCGCCGCACCCGGGGCGGGTGCGCGCCGAGGTGCATAGCCATCAATACGGCCTGGGCAGCCTGGGTGGCAGCGACTTCCAGGCCAGTGCCCGGCGTATCCACCGTTTGCTGTTCGa < 1:229731/149‑1 (MQ=255) cACTGGTGGTTGGCAACCGTATCCTGCTGTTGTCGCCGCACCCGGGGCGGGTGCGCGCCGAGGTGCATAGCCATCAATACGGCCTCGGCAGCCTCGGTGGAAGCGACTTCCAGGCAAGTGCCCGCCGTATCAACCGTTTGCTGGTCGAt > 7:373582/1‑149 (MQ=255) aCTGGTGGTTGGCAACCGTATCCTGCTGTTGTCGCCGCACCCGGGGCGGGTGCGCGGCGAGGTGCATAGCCATCAATAAGGCCTGGGCAGCCTGGGTGGCAGCGACTTCCAGGCCAGTGCCCGGCGTATCCACCCTTTGCTGTTCGAt > 5:42771/1‑148 (MQ=255) cTGGTGGTTGGCAACCGTATCCTGCTGTTGTCGCCGCACCCGGGGCGGGTGCGCGCCGAGGTGCATAGCCATCAATACGGCCTGGGCAGCCTGGGTGGCAGCGACTTCCAGGCCAGTGCCCGGCGTATCCACCGTTTGCTGTTCGATg > 5:228844/1‑148 (MQ=255) tggtggTTGGCAACCGTATCCTGCTGTTGTCGCCGCACCCGGGGCGGGTGCGCGCCGAGGTGCATAGCCATCAATACGGCCTGGGCAGCCTGGGTGGCAGCGACTTCCAGGCCAGTGCCCGGCGTATCCACCGTTTGCTGTTCGATg > 7:237721/1‑147 (MQ=255) gtggtTGGCAACCGTATCCTGCTGTTGTCGCCGCACCCGGGGCGGGTGCGCGCCGAGGTGCATAGCCATCAATACGGCCTGGGCAGCCTGGGTGGCAGCGACTTCCAGGCCAGTGCCCGGCGTATCCACCGTTTGCTGTTCGATGaa < 5:375386/147‑1 (MQ=255) gtggtTGGCAACCGTATCCTGCTGTTGTCGCCGCACCCGGGGCGGGTGCGCGCCGAGGTGCATAGCCATCAATACGGCCTGGGCAGCCTGGGTGGCAGCGACTTCCAGGCCAGTGCCCGGCGTATCCACCGTTTGCTGTTCGATGAAg < 8:47450/148‑1 (MQ=255) gtggtTGGCAACCGTATCCTGCTGTTGTCGCCGCACCCGGGGCGGGTGCGCGCCGAGGTGCATAGCCATCAATACGGCCTGGGCAGCCTGGGTGGCAGCGACTTCCAGGCCAGTGCCCGGCGTATCCACCGTTTGCTGTTCGATGAAg > 5:257741/1‑148 (MQ=255) ttGGCAACCGTATCCTGCTGTTGTCGCCGCACCCGGGGCGGGTGCGCGCCGAGGTGCATAGCCATCAATACGGCCTGGGCAGCCTGGGTGGCAGCGACTTCCAGGCCAGTGCCCGGCGTATCCACCGTTTGCTGTTCGATGAAGCAGa > 2:400671/1‑148 (MQ=255) gCAACCGTATCCTGCTGTTGTCGCCCCACCCGCGGCGGGTGCGCGCCGAGGTGCATAGCCATCAATACCGCCAGGGCAGCCTGCGTGGCACCGACTTACAGGCCAGTGCCCGGCGTATCCACCCTTTGCTGTTCGATGAAGCAGatata > 2:190407/1‑148 (MQ=255) cAACCGTATCCTGCTGTTGTCGCCGCACCCGGGGCGGGTGCGCGCCGAGGTGCATAGCCATCAATACGGCCTGGGCAGCCTGGGTGGCAGCGACTTCCAGGCCAGTGCCCGGCGTATCCACCGTTTGCTGTTCGATGAAGCAGATATcc > 2:90940/1‑149 (MQ=255) 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1:88039/7‑133 (MQ=255) tcggcgcgcACCCGCCCCGGGTGCG‑GCCGAGGTGCATAGCCATCAATACGGCCTGGGCAGCCTGGGTGGCAGCGACTTCCAGGCCAGTGCCCGGCGTATCCACCGTTTGCTGTTCGATGAAGCAGATATCCCg < 2:88039/127‑1 (MQ=255) gccgcACCCGGGGCGGGTGCGCTCCGAGGTGCATAGCCATCAATACGGCCTGGGCAGCCTGGGTGGCAGCGACTTCCAGGCCAGTGCACGGCGTATCCACCGTTTGCTGTTCGATGAAGCAGATATCCCGGAACAGCCTGACAACCtt < 5:289279/148‑1 (MQ=255) gccgcACCCGGGGCGGGTGCGCGCCGAGGTGCATAGCCATCAATACGGCCTGGGCAGCCTGGGTGGCAGCGACTTCCAGGCCAGTGCCCGGCGTATCCACCGTTTGCTGTTCGATGAAGCAGATATCCCGGAACAGCCTGACAACCTTg > 3:262326/1‑149 (MQ=255) gcgcACCCGCCCCGGGTGCGCGCCGAGGTGCATAGCCATCAATACGGCCTGGGCAGCCTGGGTGGCAGCGACTTCCAGGCCAGTGCCCGGCGTATCCACCGTTTGCTGTTCGATGAAGCAGATATCCCGGAACAGCCTGACAACCTTgg > 3:233515/2‑149 (MQ=255) cgcACCCGGGGCGGGTGCGCGCCGAGGTGCATAGCCATCAATACGGCCTGGGCAGCCTGGGTGGCAGCGACTTCCAGGCCAGTGCCCGGCGTATCCACCGTTTGCTGTTCGATGAAGCAGATATCCCGGAACAGCCTGACAACCTTggg < 8:237721/149‑1 (MQ=255) gcACCCGGGGCGGGTGCGCGCCGAGGTGCATAGCCATCAATACGGCCTGGGCAGCCTGGGTGGCAGCGACTTCCAGGCCAGTGCCCGGCGTATCCACCGTTTGCTGTTCGATGAAGCAGATATCCCGGAACAGCCTGACAACCTTGGGt < 2:201774/149‑1 (MQ=255) aCCCGGGGCGGGTGCGCGCCGAGGTGCATAGCCATCAATACGGCCTGGGCAGCCTGGGTGGCAGCGACTTCCAGGCCAGTGCCCGGCGTATCCACCGTTTGCTGTTCGATGAAGCAGATATCCCGGAACAGCCTGACAACCTTGGGtt > 5:202984/1‑148 (MQ=255) ccGGGGCGGGTGCGCGCCGAGGTGCATAGCCATCAATACGGCCTGGGCAGCCTGGGTGGCAGCGACTTCCAGGCCAGTGCCCGGCGTATCCACCGTTTGCTGTTCGATGAAGCAGATATCCCGGAACAGCCTGACAACCTTGGGTTCaa > 2:149822/1‑149 (MQ=255) ccGGGGCGGGTGCGCGCCGAGGTGCATAGCCATCAATACGGCCTGGGCAGCCTGGGTGGCAGCGACTTCCAGGCCAGTGCCCGGCGTATCCACCGTTTGCTGTTCGATGAAGCAGATATCCCGGAACAGCCTGACAACCTTGGGTTCaa < 8:187566/149‑1 (MQ=255) ggggCGGGTGCGCGCCGAGGTGCATAGCCATCAATACGGCCTGGGCAGCCTGGGTGGCAGCGACTTCCAGGCCAGTGCCCGGCGTATCCACCGTTTGCTGTTCGATGAAGCAGATATCCCGGAACAGCCTGACAACCTTGGGTTCAAc > 5:365453/1‑148 (MQ=255) | 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |