| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,489,129 | C→T | 7.8% | D42D (GAC→GAT) | PP_2184 → | formate dehydrogenase subunit beta |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,489,129 | 0 | C | T | 7.8% | 228.1 / 5.8 | 77 | D42D (GAC→GAT) | PP_2184 | formate dehydrogenase subunit beta |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (37/34); new base T (3/3); total (40/37) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.23e-01 | |||||||||||
CCTGCGGGACTTGGTCAACGGTTGCCGGGAGGACTCAGCATGCTGAAGCTGTATATTCCCTGTGATTCGGTAGCCCG‑TGCCGTGGGTGCCGACCAGGTTGCCGAGGCCCTGCTGCGCGAGGCCGAGCGCCGCCAGTTGCCGCTGGACATCCAGCGCACCAGCTCGCGTGGGCTTTACTGGCTGGAGCCGCTGATCGAGTGCGACAGTGCGCAAGGGCGCCTGGGTTTCGGCCCGATTACGCCACACGATGTGCCATCACTGCTTGATGCCCTGGCGGGCGAACCCGGTGGCCA > NC_002947/2488983‑2489275 | ccTGGGGGACTTGGTCAACGGTTGCCGGGAGGACTCAGCATGCTTAAGCTTTATATTCCCTGTGATTCGGTAGCCGG‑TGCCGTGGGTGCCGACCAGGTTGCCGAGGCCCTGCTGCGCGAGGCCGAGCGCCGCCAGTTGCCGCTGGACAt < 6:417714/149‑1 (MQ=255) cggCGGGACTTGTCCAACGGTGGCCGGGAGGACTCACCATGCTGACGCTGTATATTCCCTGTGATTCGGTCGCCCG‑TGCCGGGGGTGCCGACCCGGTTGCCGCGGCCCTGCGGCGCGAGGCCGAGCGCCGCCAGTTGCCGCTGGACATc < 4:131871/147‑1 (MQ=255) aCTTGGTCAACGGTTGCCGGGAGGACTCAGCATGCTGAAGCTGTATATTCCCTGTGATTCGGTAGCCCG‑TGCCGTGGGTGCCGACCAGGTTGCCGAGGCCCTGCTGCGCGAGGCCGAGCGCCGCCAGTTGCCGCTGGACATCCAGCGCa > 3:157267/1‑149 (MQ=255) ggTCAACGGTTGCCGGGAGCACTCAGCATGCTTAAGCTGTATATTCCCTGTTATTCGGTCGCCCG‑TGCGGTGGGTGCCGACCTGGTTGCCGAGGCCCTGCTGCGCGAGGCCGAGCGCCGCCAGTTGCCGCTGGACATCCAGCGCAcc < 4:335100/147‑1 (MQ=255) ggTCAACGGTTCCCGGGAGGACTCTGCTTGCGCTTGCTGTTTATTCCGTGTGTTGCGGTCGCCCG‑TGCCGGGGGTGCCGACCTGGTTGCCGCGGCCCTGCTGCGCGAGGCCGAGCGCCGCCAGTTGCCGCTGGATGTCCAgcggcaa < 8:210177/147‑5 (MQ=255) gTCAACGGTTGCCGGGAGGACTCAGCATGCTGAAGCTTTTTTTTCCCTGTGTTTCGGTAGCCCG‑TGCCGGGGGTGCCGACCAGGTTGCCGAGGCCCTGCTGCGCGAGGCCGAGCGCCGCCAGTTGCCGCTGGACATCCAGCGCACCAGc < 6:8143/149‑1 (MQ=255) gTCAACGGTTGCCGGGAGGACTCAGCATGCTGAAGCTGTATATTCCCTGTGATTCGGTAGCCCG‑TGCCGTGGGTGCCGACCAGGTTGCCGAGGCCCTGCTGCGCGAGGCCGAGCGCCGCCAGTTGCCGCTGGACATCCAGCGCACCAGc > 1:254136/1‑149 (MQ=255) tCAACGGTTGCCGGGAGGACTCAGCATGCTGAAGCTGTATATTCCCTGTGATTCGGTAGCCCG‑TGCCGTGGGTGCCGACCAGGTTGCCGAGGCCCTGCTGCGCGAGGCCGAGCGCCGCCAGTTGCCGCTGGACATCCAGCGCACCAGCt > 3:47702/1‑149 (MQ=255) tCAACGGTTGCCGGGAGGACTCAGCATCCTGAAGCTGTATATTCCCTGTGATTCGGTAGCCCG‑TGCCGTGGGTGCCGACCAGGTTGCCGAGGCCCTGCTGCCCGAGGCCGAGCGCCGCCAGTTGCCGCTGGACATCCAGCGCACCAGCt > 4:262638/1‑149 (MQ=255) cAACGGTTGCCGGGAGGACTCAGCATGCTGAAGCTGTATATTCCCTGTGATTCGGTAGCCCG‑TGCCGTGGGTGCCGACCAGGTTGCCGAGGCCCTGCTGCGCGAGGCCGAGCGCCGCCAGTTGCCGCTGGACATCCAGCGCACCAGCTc > 6:287742/1‑149 (MQ=255) tGCCGTGATTACTCATAATGCTTATGATTTATATTCCCTGTTATTCGCTCGCCGG‑TGGGGGGGGTGCCCACCTGGTTGCCGCCGCCGTGCTGCGCGCGGCCGAGCGCCGCCAGTTGCCGCTGGACATCCAGCGCACCAGCTCGCGTgg < 4:157267/148‑1 (MQ=255) gCCGTGAGGACTCAGAATGCTTAAGCTTTATATTCCCTGTGATTCGGTAGCCCG‑TGCCGTGGGTGCCTACCAGTTTGCCGAGGCCCTGCTGCGCGAGGCCGAGCGCCGCCAGTTGCCGCTGGACATCCAGCGCACCAGCTCGCGTggg < 4:115586/148‑1 (MQ=255) cTCAGCATGCTGAAGCTGTATATTCCCTGTGATTCGGTAGCCCG‑TGCCGTGGGTGCCGACCAGGTTGCCGAGGCCCTGCTGCGCGAGGCCGAGCGCCGCCAGTTGCCGCTGGACATCCAGCGCACCAGCTCGCGTGGGCTTTActggct > 6:251354/1‑149 (MQ=255) tCAGCATGCTGAAGCTGTATATTCCCTGTGATTCGGTAGCCCGCTGCCGTGGGTGCCGACCAGGTTGCCGAGGCACTGCTCCGCGAGGCCGAGCGCCGCCAGTTGCCGCTGTACATCCAGCGCACCAGCTCGCGTGGGCTTTActggct > 1:84564/1‑149 (MQ=255) tCAGCATGCTGAAGCTGTATATTCCCTGTGATTCGGTAGCCCG‑TGCCGTGGGTGTCGACCAGGTTGCCGAGGCCCTGCTGCGCGAGGCCGAGCGCCGCCAGTTGCCGCTGGACATCCAGCGCACCAGCTCGCGTGGGCTTTActggctg > 2:310026/1‑149 (MQ=255) aGCATGCTGAAGCTGTATATTCCCTGTGATTCGGTAGCCCG‑TGCCGTGGGTGCCGACCAGGTTGCCGAGGCCCTGCTGCGCGAGGCCGAGCGCCGCCAGTTGCCGCTGGACATCCAGCGCACCAGCTCGCGTGGGCTTTActggctg > 7:151069/1‑147 (MQ=255) aGCATGCTGAAGCTGTATATTCCCTGTGATTCGGTAGCCCG‑TGCCGTGGGTGCCGACCAGGTTGCCGAGGCCCTGCTGCGCGAGGCCGAGCGCCGCCAGTTGCCGCTGGACATCCAGCGCACCAGCTCGCGTGGGCTTTActggctg > 6:234241/1‑147 (MQ=255) aGCATGCTGAAGCTGTATATTCCCTGTGATTCGGTAGCCCG‑TGCCGTGGGTGCCGACCAGGTTGCCGAGGCCCTGCTGCGCGAGGCCGAGCGCCGCCAGTTGCCGCTGGACATCCAGCGCACCAGCTCGCGTGGGCTTTActggctg > 5:112131/1‑147 (MQ=255) gCTGATGGTTTATATTCGGTGTCTTTGGGTCGCCCG‑GGCGGGGGGGGCCTCCCAGGTGGCGGAGGCCGTGCTGCGCGAGGCCTCGCGCCGCCAGTTGCCGCTGGACATCCAGCGCACCAGCTCGCGTGGGCTTTACTGGCTGGAGCCg < 3:85489/148‑1 (MQ=255) cTGAAGCTTTATATTCCCTGTTATTCGGTAGCCCG‑TGCGGTGGGTGCCGACCAGGTTGCCGAGGCCCTGCTGCGCGAGGCCGAGCGCCGCCAGTTGCCGCTGGACATCCAGCGCACCAGCTCGCGTGGGCTTTACTGGCTGGAGCCGc < 2:65639/148‑1 (MQ=255) tGAAGCTGTATATTCCCTGTGATTCGGTAGCCCG‑TGCCGTGGGTGCCGACCAGGTTGCCGAGGCCCTGCTGCGCGAGGCCGAGCGCCGCCAGTTGCCGCTGGACATCCAGCGCACCAGCTCGCGTGGGCTTTACTGGCTGGAGCCGCt > 7:298881/1‑148 (MQ=255) gAAGCTGTATATTCCCTGTGATTCGGTAGCCCG‑TGCCGTGGGTGCCGACCAGGTTGCCGAGGCCCTGCTGCGCGAGGCCGAGCGCCGCCAGTTGCCGCTGGACATCCAGCGCACCAGCTCGCGTGGGCTTTACTGGCTGGAGCCGCTGa > 5:146403/1‑149 (MQ=255) aaGCTGTATATTCCCTGTGATTCGGTAGCCCG‑TGCCGTGGGTGCCGACCAGGTTGCCGAGGCCCTGCTGCGCGAGGCCGAGCGCCGCCAGTTGCCGCTGGACATCCAGCGCACCAGCTCGCGTGGGCTTTACTGGCTGGAGCCGCTGAt > 1:169899/1‑149 (MQ=255) gCTGTATATTCCCTGTGATTCGGTAGCCCG‑TGCCGTGGGTGCCGACCAGGTTGCCGAGGCCCTGCTGCGCGAGGCCGAGCGCCGCCAGTTGCCGCTGGACATCCAGCGCACCAGCTCGCGTGGGCTTTACTGGCTGGAGCCGCTGATc > 6:380570/1‑148 (MQ=255) cTGTATATTCCCTGTGATTCGGTAGCCCG‑TGCCGTGGGTGCCGACCAGATTGCCGAGGCCCTGCTGCGCGAGGCCGAGCGCCGCCAGTTGCCGCTGGACATCCAGCGCACCAGCTCGCGTGGGCTTTACTGGCTGGAGCCGCTGATc > 1:319722/1‑147 (MQ=255) tataTTCCCTGTTCTGGGGTCGCCCG‑TGCCGTGGGCGCCGACCAGGTTCCCGCGGCCCTGCTGCGCGAGGCCCAGCGCCGCCAGTTGCCGCTGGACATCCAGCGCACCAGCTCGTGTGGGCTTTACTGGCTGGAGCCGCTGATCGAGt < 3:253379/148‑1 (MQ=255) atgcGGTAGCCCG‑TGCCGTGGGTGCCGACCCGGTTGCCGCGGCCCTGCGGCGCGAGGCCGCGCGCCGCCAGTTGCCGCTGGACATCCAGCGCACCAGCTCGCGTGGGCTTTACTGGCTGGAGCCGCTGATCGAGTGCGACAGTGCGCaa < 8:101346/146‑1 (MQ=255) cGGTAGCCCG‑TGCCGTGGGTGCCGACCAGGTTGCCGAGGCCCTGCTGCGCGAGGCCGAGCGCCGCCAGTTGCCGCTGGACATCCAGCGCACCAGCTCGCGTGGGCTTTACTGGCTGGAGCCGCTGATCGAGTGCGACAGTGCGCAAgg < 2:162398/148‑1 (MQ=255) cGGGAGCCGG‑TGCCGTGGGGGCCGACCAGGTGGCCGCGGCCCTGCGGCGCGAGGCCGAGCGCCGCCAGTTGCCGCTGGACATCCAGCGCACCAGCTCGCGTGGGCTTTACTGGCTGGAGCCGCTGATCGAGTGCGACAGTGCGCAAgg < 7:165895/148‑1 (MQ=255) ccg‑tgccgtgGGTGCCGACCAGGTTGCCGAGGCCCTGCTGCGCGAGGCCGAGCGCCGCCAGTTGCCGCTGGACATCCAGCGCACCAGCTCGCGTGGGCTTTACTGGCTGGAGCCGCTGATCGAGTGCGACAGTGCGCAAGGGCGCCTgg > 5:236867/1‑149 (MQ=255) ccg‑tgccgtgGGAGCCTACCAGGTTGCCGAGGCCCTGCTGCGCGAGGCCGAGCGCCGCCAGTTGCCGCTGGACATCCAGCGCACCAGCTTGCGTGGGCTTTACTGGCTGGAGCCGCTGATCGAGTGCGACAGTGCGCAAGGGCGCCTgg < 6:163505/149‑1 (MQ=255) gccgtgGGTGCCGACCAGGTTGCCGAGGCCCTGCTGCGCGAGGCCGAGCGCCGCCAGTTGCCGCTGGACATCCAGCGCACCAGCTCGCGTGGGCTTTACTGGCTGGAGCCGCTGATCGAGTGCGACAGTGCGCAAGGGCGCCTGGGttt < 2:319722/149‑1 (MQ=255) ggtgGGTGCCGACCAGGGTGCCGCGCCCCTGCTGCGCGTGGCCGAGCGCCGCCAGTTGCCGCTGGACATCCAGCGCACCAGCTCGCGTGGGCTTTACTGGCTGGAGCCGCTGATCGAGTGCGACAGTGCGCAAGGGCGCCTGGGTTTCg < 2:254136/148‑1 (MQ=255) gtgGGTGCCGACCAGGTTGCCGAGGCCCTGCTGCGCGAGGCCGAGCGCCGCCAGTTGCCGCTGGACATCCAGCGCACCAGCTCGCGTGGGCTTTACTGGCTGGAGCCGCTGATCGAGTGCGACAGTGCGCAAGGGCGCCTGGGTTTCgg < 4:47702/149‑1 (MQ=255) gggTGCCGACCAGGTTGCCGAGGCCCTGCTGCGCGAGGCCGAGCGCCGCCAGTTGCCGCTGGACATCCAGCGCACCAGCTCGCGTGGGCTTTACTGGCTGGAGCCGCTGATCGAGTGCGACAGTGCGCAAGGGCGCCTGGGTTTCGGcc > 8:214280/1‑149 (MQ=255) gggTGCCGACCAGGTTGCCGAGGCCCTGCTGCGCGAGGCCGAGCGCCGCCAGTTGCCGCTGGACATCCAGCGCACCAGCTCGCGTGGGCTTTACTGGCTGGAGCCGCTGATCGAGTGCGACAGTGCGCAAGGGCGCCTGGGTTTCGGca > 7:138806/1‑148 (MQ=255) gggccgccCTGGCTGCCGCGCCCGTGCGGGGCGCGCCCGCCCGCCGCCAGTTGCCGCTGGACATCCAGCGCACCAGCTCGCGTGGGCTTTACTGGCTGGAGCCGCTGATCGAGTGCGACAGTGCGCAAGGGCGCCTGGGTTTCGGCCCg < 3:380132/147‑1 (MQ=255) gCCGACCAGGTTGCCGAGGCCCTGCTGCGCGAGGCCGAGCGCCGCCAGTTGCCGCTGGACATCCAGCGCACCAGCTCGCGTGGGCTTTACTGGCTGGAGCCGCTGATCGAGTGCGACAGTGCGCAAGGGCGCCTGGGTTTCGGCCCGAt > 1:382725/1‑149 (MQ=255) gACCCGGTTGCCGTGGCCCTGCTGCGCGCGGCCGAGCGCCGCCAGTTGCCGCTGGACATCCAGCGCACCAGCTCGCGTGGGCTTTACTGGCTGGAGCCGCTGATCGAGTGCGACAGTGCGCAAGGGCGCCTGGGTTTCGGCCCGATTAc < 2:382725/149‑1 (MQ=255) gACCAGGTTGCCGAGGCCCTGCTGCGCGAGGCCGAGCGCCGCCAGTTGCCGCTGGACATCCAGCGCACCAGCTCGCGTGGGCTTTACTGGCTGGAGCCGCTGATCGAGTGCGACAGTGCGCAAGGGCGCCTGGGTTTCGGCCCGATTAc > 4:222931/1‑149 (MQ=255) gTTGCCGAGGCCCTGCTGCGCGAGGCCGAGCGCCGCCAGTTGCCGCTGGACATCCAGCGCACCAGCTCGCGTGGGCTTTACTGGCTGGAGCCGCTGATCGAGTGCGACAGTGCGCAAGGGCGCCTGGGTTTCGGCCCGATTACGCcaca > 5:175284/1‑149 (MQ=255) cGAGGCCCTGCTGCGCGAGGCCGAGCGCCGCCAGTTGCCGCTGGACATCCAGCGCACCAGCTCGCGTGGGCTTTACTGGCTGGAGCCGCTGATCGAGTGCGACAGTGCGCAAGGGCGCCTGGGTTTCGGCCCGATTACGCCACACGAtg < 4:247902/149‑1 (MQ=255) gAGGCCCTGCTGCGCGAGGCCGAGCGCCGCCAGTTGCCGCTGGACATCCAGCGCACCAGCTCGCGTGGGCTTTACTGGCTGGAGCCGCTGATCGAGTGCGACAGTGCGCAAGGGCGCCTGGGTTTCGGCCCGATTACGCCACACGAtgt < 6:112131/149‑1 (MQ=255) gAGGCCCTGCTGCGCGAGGCCGAGCGCCGCCAGTTGCCGCTGGACATCCAGCGCACCAGCTCGCGTGGGCTTTACTGGCTGGAGCCGCTGATCGAGTGCGACAGTGCGCAAGGGCGCCTGGGTTTCGGCCCGATTACGCCACACGAtgt > 1:77326/1‑149 (MQ=255) cccTGCTGCGCGAGGCCGAGCGCCGCCAGTTGCCGCTGGACATCCAGCGCACCAGCTCGCGTGGGCTTTACTGGCTGGAGCCGCTGATCGAGTGCGACAGTGCGCAAGGGCGCCTGGGTTTCGGCCCGATTACGCCACACGATGTGCCa > 7:211318/1‑149 (MQ=255) ccTGCTGCGCGAGGCCGAGCGCCGCCAGTTGCCGCTGGACATCCAGCGCACCAGCTCGCGTGGGCTTTACTGGCTGGAGCCGCTGATCGAGTGCGACAGTGCGCAAGGGCGCCTGGGTTTCGGCCCGATTACGCCACACGAtgt < 4:47992/144‑1 (MQ=255) ccTGCTGCGCGAGGCCGAGCGCCGCCAGTTGCCGCTGGACATCCAGCGCACCAGCTCGCGTGGGCTTTACTGGCTGGAGCCGCTGATCGAGTGCGACAGTGCGCAAGGGCGCCTGGGTTTCGGCCCGATTACGCCACACGAtgt > 3:47992/1‑144 (MQ=255) ccTGCTGCGCGAGGCCGAGCGCCGCCAGTTGCCGCTGGACATCCAGCGCACCAGCTCGCGTGGGCTTTACTGGCTGGAGCCGCTGATCGAGTGCGACAGTGCGCAAGGGCGCCTGGGTTTCGGCCCGATTACGCCACACGATGTGCCa > 4:584/1‑148 (MQ=255) ccTGCTGCGCGAGGCCGAGCGCCGCCAGTTGCCGCTGGACATCCAGCGCACCAGCTCGCGTGGGCTTTACTGGCTGGAGCCGCTGATCGAGTGCGACAGTGCGCAAGGGCGCCTGGGTTTCGGCCCGATTACGCCACACGATGTGCCAt < 2:169899/149‑1 (MQ=255) tgctgcGCGAGGCCGAGCGCCGCCAGTTGCCGCTGGACATCCAGCGCACCAGCTCGCGTGGGCTTTACTGGCTGGAGCCGCTGATCGAGTGCGACAGTGCGCAAGGGCGCCTGGGTTTCGGCCCGATTACGCCACACGATGTGCCATCa > 3:8666/1‑149 (MQ=255) ctgcGGGAGGCCGAGCGCCGCCAGTTGCCGCTGGACATCCAGCGCACCAGCTCGCGTGGGCTTTACTGGCTGGAGCCGCTGATCGAGTGCGACAGTGCGCAAGGGCGCCTGGGTTTCGGCCCGATTACGCCACACGATGTGCCATCAc < 4:290682/148‑1 (MQ=255) ctgcGCGTGGCCGGGGGCCGCCAGTTGCCGCTGGACATCCAGCGCACCAGCTCGCGTGGGCTTTACTGGCTGGAGCCGCTGATCGAGTGCGACAGTGCGCAAGGGCGCCTGGGTTTCGGCCCGATTACGCCACACGATGTGCCATCAc < 3:262638/148‑1 (MQ=255) gcgcGAGGCCGAGCGCCGCCAGTTGCCGCTGGACATCCAGCGCACCAGCTCGCGTGGGCTTTACTGGCTGGAGCCGCTGATCGAGTGCGACAGTGCGCAAGGGCGCCTGGGTTTCGGCCCGATTACGCCACACGATGTGCCATCACTGc > 2:190703/1‑149 (MQ=255) gtcgtggCCGAGCGCCGCCAGTTGCCGCTGGACATCCAGCGCACCAGCTCGCGTGGGCTTTACTGGCTGGAGCCGCTGATCGAGTGCGACAGTGCGCAAGGGCGCCTGGGTTTCGGCCCGATTACGCCACACGATGTGCCATCACTGCt < 8:298881/144‑1 (MQ=255) gcgAGGCCGAGCGCCGCCAGTTGCCGCTGGACATCCAGCGCACCAGCTAGCGTGGGCTTTACTGGCTGGAGCCGCTGATCGAGTGCGACAGTGCGCAAGGGAGCCTGGGTTTCGGCACGATTACGCCACACGATGTGCCATAACTGCtt > 7:289557/1‑149 (MQ=255) gcggCCGAGCGCCGCCAGTTGCCGCTGGACATCCCGCGCACCAGCTCGCGTGGGCGTTACTGGCTGGAGCCGCTGATCGAGGGCGACAGTGCGCACGGGCGCCTGGGTTTCGGCCCGATTACGCCACACGATGTGCCATCACTGCTTGa < 6:214529/147‑1 (MQ=255) agcccGAGCGCCGCCAGTTGCCGCTGTACATCCAGCGCACCAGCTCGCGTGGGCTTTACTGGCTGGAGCCGCTTATCGAGTGCGACAGTGCGCAAGGGCGCCTGGGTTTCGGCCCGATTACGCCACACGATGTGCCATCACTGCTTGAt < 1:285014/146‑1 (MQ=255) aGGCCGCCCGCCGCCAGTTGCCGCTGGACATCCAGCGCACCAGCTCGCGTGGGCTTTACTGGCTGGAGCCGCTGATCGAGTGCGACAGTGCGCAAGGGCGCCTGGGTTTCGGCCCGATTACGCCACACGATGTGCCATCACTGCTTGAt < 3:2272/149‑1 (MQ=255) aGGCCGAGCGCCGCCAGTTGCCGCTGGACATCCAGCGCACCAGCTCGCGTGGGCTTTACTGGCTGGAGCCGCTGATCGAGTGCGACAGTGCGCAAGGGCGCCTGGGTTTCGGCCCGATTACGCCACACGATGTGCCATCACTGCTTGAt < 6:236867/149‑1 (MQ=255) gCCGAGCGCCGCCAGTTGCCGCTGGACATCCAGCGCACCAGCTCGCGTGGGCTTTACTGGCTGGAGCCGCTGATCGAGTGCGACAGTGCGCAAGGGCGCCTGGGTTTCGGCCCGATTACGCCACACGATGTGCCATCACTGCTTGATGc > 5:419359/1‑149 (MQ=255) cgccgcCAGTTGCCGCTGGACATCCAGCGCACCAGCTCGCGTGGGCTTTACTGGCTGGAGCCGCTGATCGAGTGCGACAGTGCGCAAGGGCGCCTGGGTTTCGGCCCGATTACGCCACACGATGTGCCATCACTGCTTGATGCCCTggc < 2:77326/149‑1 (MQ=255) gccgccAGTTGCCGCTGGACATCCAGCGCACCAGCTCGCGTGGGCTTTACTGGCTGGAGCCGCTGATCGAGTGCGACAGTGCGCAAGGGCGCCTGGGTTTCGGGTCGATTACGCCACACGATGTGCCATCACTGCTTGATGCCCTggcg < 1:310026/149‑1 (MQ=255) ccgccAGTTGCCGCTGGACATCCAGCGCACCAGCTCGCGTGGGCTTTACTGGCTGGAGCCGCTGATCGAGTGCGACAGTGCGCAAGGGCGCCTGGGTTTCGGCCCGATTACGCCACACGATGTGCCATCACTGCTTGATGCCCTggcgg > 6:39473/1‑149 (MQ=255) ccgccAGTTGCCGCTGGACATCCAGCGCACCAGCTCGCGTGGGCTTTACTGGCTGGAGCCGCTGATCGAGTGCGACAGTGCGCAAGGGCGCCTGGGTTTCGGCCCGATTACGCCACACGATGTGCCATCACTGCTTGATGCCCTggcgg > 1:270239/1‑149 (MQ=255) ccgccAGTTGCCGCTGGACATCCAGCGCACCAGCTCGCGTGGGCTTTACTGGCTGGAGCCGCTGATCGAGTGCGACAGTGCGCAAGGGCGCCTGGGTTTCGGCCCGATTACGCCACACGATGTGCCATCACTGCTTGATGCCCTggcgg < 5:287742/149‑1 (MQ=255) ccgccAGTTGCCGCTGGACATCCAGCGCACCAGCTCGCGTGGGCTTTACTGGCTGGAGCCGCTGATCGAGTGCCACAGTGCGCAAGGGCGCCTGGGTTTCGGCCCGATTACGCCACACGATGTCCCAACACTGCATGATGCCCTggcg > 4:73722/1‑148 (MQ=255) gccAGTTGCCGCTGGACATCCAGCGCACCAGCTCGCGTGGGCTTTACTGGCTGGAGCCGCTGATCGAGTGCGACAGTGCGCAAGGGCGCCTGGGTTTCGGCCCGATTACGCCACACGATGTGCCATCACTGCTTGATGCCCTggcgggc > 1:31974/1‑149 (MQ=255) gccAGTTGCCGCTGGACATCCAGCGCACCAGCTCGCGTGGGCTTTACTGGCTGGAGCCGCTGATCGAGTGCGACAGTGCGCAAGGGCGCCTGGGTTTCGGCCCGATTACGCCACACGATGTGCCATCACTGCTTGATGCCCTggcgggc < 7:214280/149‑1 (MQ=255) gccAGGTGCCGCTGGACATCCAGCGCACCAGCTCGCGTTGGCTTTACTGGCTGGAGCCGCTGATCGAGTGCGACAGTGCGCAAGGGCGCCTGGGTTTCGGCCCGATTACGCCACACGATGTGCCATCACTGCTTGATGCCCTggcgggc < 8:151069/149‑1 (MQ=255) gTTGCCGCTGGACATCCAGCGCACCAGCTCGCGTGGGCTTTACTGGCTGGAGCCGCTGATCGAGTGCGACAGTGCGCAAGGGCGCCTGGGTTTCGGCCCGATTACGCCACACGATGTGCCATCACTGCTTGATGCCCTGGCGGGCGAAc > 2:304702/1‑149 (MQ=255) gtgcGCTGGATGTCCAGCGCACCAGCTCGCGTGGGCTTTACTGGCTGGAGCCGCTGATCGAGTGCGACAGTGCGCAAGGGCGCCTGGGTTTCGGCCCGATTACGCCACACGATGTGCCATCACTGcct < 7:245833/125‑3 (MQ=255) gtgcGCTGGATGTCCAGCGCACCAGCTCGCGTGGGCTTTACTGGCTGGAGCCGCTGATCGAGTGCGACAGTGCGCAAGGGCGCCTGGGTTTCGGCCCGATTACGCCACACGATGTGCCATCACTGcct > 8:245833/4‑126 (MQ=255) gtgcGCTGGATGTCCAGCGCACCAGCTCGCGTGGGCTTTACTGGCTGGAGCCGCTGATCGAGTGCGACAGTGCGCAAGGGCGCCTGGGTTTCGGCCCGATTACGCCACACGATGTGCCATCACTGCTTGATGCCCTGGCGGGCGAAccc > 1:45751/4‑149 (MQ=255) gcGCTGGATGTCCAGCGCACCAGCTCGCGTGGGCTTTACTGGCTGGAGCCGCTGATCGAGTGCGACAGTGCGCAAGGGCGCCTGGGTTTCGGCCCGATTACGCCACACGATGTGCCATCACTGCTTGATGCCCTGGCGGGCGAACCCgg > 2:256890/2‑149 (MQ=255) gCTGGATGTCCAGCGCACCAGCTCGCGTGGGCTTTACTGGCTGGAGCCGCTGATCGAGTGCGACAGTGCGCAAGGGCGCCTGGGTTTCGGCCCGATTACGCCACACGATGTGCCATCACTGCTTGATGCCCTGGCGGGCGAACCCGGTg < 1:256890/149‑1 (MQ=255) gCTGGACATCCAGCGCACCAGCTCGCGTGGGCTTTACTGGATGGAGCCGCTGAGCGAGTGCGCCAGTGCGCAAGGGCGCCTGGGTTTCGGCCCGATTACGCCACCCGATGTGCCATCACTGCTTGATGCCCTGGCGGGCGAACCCGGTg > 6:379976/1‑149 (MQ=255) gACATCCAGCGCACCAGCTCGCGTGGGCTTTACTGGCTGGAGCCGCTGATCGAGTTCGACAGTGCGCAAGGGCGCCTGGGTTTCGGCCCGATTACGCCACACGATGTGCCATCACTGCTTGATGCCCTTCCGGCCGAACCCGGAGGCCa > 4:324752/1‑149 (MQ=255) | CCTGCGGGACTTGGTCAACGGTTGCCGGGAGGACTCAGCATGCTGAAGCTGTATATTCCCTGTGATTCGGTAGCCCG‑TGCCGTGGGTGCCGACCAGGTTGCCGAGGCCCTGCTGCGCGAGGCCGAGCGCCGCCAGTTGCCGCTGGACATCCAGCGCACCAGCTCGCGTGGGCTTTACTGGCTGGAGCCGCTGATCGAGTGCGACAGTGCGCAAGGGCGCCTGGGTTTCGGCCCGATTACGCCACACGATGTGCCATCACTGCTTGATGCCCTGGCGGGCGAACCCGGTGGCCA > NC_002947/2488983‑2489275 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |