Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 2,499,711 | G→T | 5.6% | D538Y (GAC→TAC) | PP_2193 → | ferric siderophore receptor |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 2,499,711 | 0 | G | T | 5.6% | 226.9 / 3.5 | 71 | D538Y (GAC→TAC) | PP_2193 | ferric siderophore receptor |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (31/36); new base T (2/2); total (33/38) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.79e-01 |
CTTCAACGCCGAGCAGACCACCTTCAACGCCCAGACCTCGTCCGAGTCGGGTGGCCTGGAGCTGGAAAAAGACAGCAAGGCCGACCGCTACCCCAGCTACCGGGTGGATGGTGTGTCGGTGTATGCCCAGCTGGACTGGCATGCCACCGACAACCTGACATTGTCCGGTGGTGCCCGGCGGCAGCAGATGGACGTTGATGTCAGCGACTTCAAGGGTGTGCCAGGTGGCAGTAACGACTATCAGGTCAACCTGTTCAACGTCGGTGCCATCTACGACTTCAAGAACGGCCACCAG > NC_002947/2499563‑2499857 | cTTCAACGCCGAGCAGACCACCTTCAACGCCCAGACCTCGTCCGAGTCGGGTGGCCTGGAGCTGGAAAAAGACAGCAAGGCCGACCGCTACCCCAGCTACCGGGTGGATGGTGTGTCGGTGTATGCCCAGCTGGACTGGCATGCCACCg < 2:19356/149‑1 (MQ=255) ttCAACGCCGAGCAGACCACCTTCAACGCCCAGACCTCGTCCGAGTCGGGTGGCCAGGAGCTGGAAAAAGACAGCAAGGCCGCCCGCTACCCCAGCTACAGGGTGGATGGTGTGTCGGTGTATGCCAAGCTGGACTGGCATGCCACCGa > 6:76453/1‑149 (MQ=255) aaCGCCGAGCAGACCACCTTCAACGCCCAGACCTCGTCCGAGTCGGGTGGCCTGGAGCTGGAAAAAGACAGCAAGGCCGACCGCTACCCCAGCTACCGGGTGGATGGTGTGTCGGTGTATGCCCAGCTGGACTGGCATGCCACCGACaa > 8:237488/1‑149 (MQ=255) cGCCGAGCAGACCACCTTCAACGCACAGACCTCGTCCGAGTCGGGTGGCCTGGAGCTGGAAAAAGACAGCAAGGCCGACCGCTACCCCAGCTAACGGCTGGATGGTGTGTCGGTGTATGCCCAGCTGGACTGGCATGCCACCGACAAcc > 5:438577/1‑149 (MQ=255) gAGCAGACCACCTTCAACGCCCAGACCTCGTCCGAGTCGGGTGGCCTGGAGCTGGAAAAAGACAGCAAGGCCGACCGCTACCCCAGCTACCGGGTGGATGGTGTGTCGGTGTATGCCCAGCTGGACTGGCATGCCACCGACAACCTGAc < 6:33399/149‑1 (MQ=255) accaccTTCAACGCCCAGACCTCGTCCGAGTCGGGTGGCCTGGAGCTGGAAAAAGACAGCAAGGCCGACCGCTACCCCAGCTACCGGGTGGATGGTGTGTCGGTGTATGCCCAGCTGGACTGGCATGCCACCGACAACCTGACATTGTc < 7:237488/149‑1 (MQ=255) caccTTCAACGCCCAGACCTCGTCCGAGTCGGGTGGCCTGGAGCTGGAAAAAGACAGCAAGGCCGACCGCTACCCCAGCTACCGGGTGGATGGTGTGTCGGTGTATGCCCAGCTGGACTGGCATGCCACCGACAACCTGACATTGTCCg > 8:53359/1‑149 (MQ=255) ccTTCAACGCCCAGACCTCGTCCGAGTCGGGTGGCCTGGAGCTGGAAAAAGACAGCAAGGCCGACCGCTACCCCAGCTACCGGGTGGATGGTGTGTCGGTGTATGCCCAGCTGGACTGGCATGCCACCGACAACCTGACATTGTCCggt > 8:378132/1‑149 (MQ=255) cTTCAACGCCCAGACCTCGTCCGAGTCGGGTGGCCTGGAGCTGGAAAAAGACAGCAAGGCCGACCGCTACCCCAGCTACCGGGTGGATGGTGTGTCGGTGTATGCCCAGCTGGACTGGCATGCCACCGACAACCTGACATTGTCCggtt < 8:382232/149‑2 (MQ=255) tCAACGCCCAGACCTCGTCCGAGTCGGGTGGCCTGGAGCTGGAAAAAGACAGCAAGGCCGACCGCTACCCCAGCTACCGGGTGGATGGTGTGTCGGTGTATGCCCAGCTGGACTGGCATGCCACCGACAACCTGACATTGTCCggtggt > 5:236088/1‑149 (MQ=255) gCCCAGACCTCGTCCGAGTCGGGTGGCCTGGAGCTGGAAAAAGACAGCAAGGCCGACCGCTACCCCAGCTACCGGGTGGATGGTGTGTCGGTGTATGCCCAGCTGGACTGGCATGCCACCGACAACCTGACATTGTCCGGTGGTGCCcg > 5:269241/1‑149 (MQ=255) cccAGACCTCGTCCGAGTCGGGTGGCCTGGAGCTGGAAAAAGACAGCAAGGCCGACCGCTACCCCAGCTACCGGGTGGATGGTGTGTCGGTGTATGCCCAGCTGGACTGGCATGCCACCGACAACCTGACATTGTCCGGTGGTGCCcgg < 7:378132/149‑1 (MQ=255) cccAGACCTCGTCCGAGTCGGGTGGCCTGGAGCTGGAAAAAGACAGCAAGGCCGACCGCTACCCCAGCTACCGGGTGGATGGTGTGTCGGTGTATGCCCAGCTGGACTGGCATGCCACCGACAACCTGACATTGTCCGGTGGTGCCcgg < 3:382525/149‑1 (MQ=255) cAGCCCTCGTCCGAGTCGGGTGGCCTGGAGCTGGAAAAAGACAGCAAGGCCGACCGCTACCCCAGCTACCGGGTGGATGGTGTGTCGGTGTATGCCCAGCTGGACTGGCATGCCACCGACAACCTGACATTGTCCGGTGGTGCCcggcg < 2:133113/149‑1 (MQ=255) aCCTCGTCCGAGTCGGGTGGCCTGGAGCTGGAAAAAGACAGCAAGGCCGACCGCTACCCCAGCTACCGGGTGGATGGTGTGTCGGTGTATGCCCAGCTGGACTGGCATGCCACCGACAACCTGACATTGTCCGGTGGTGCCCGGCGgca < 1:311524/149‑1 (MQ=255) ccTCGTCCGAGTCGGGTGGCCTGGAGCTGGAAAAAGACAGCAAGGCCGACCGCTACCCCAGCTACCGGGTGGATGGTGTGTCGGTGTATGCCCAGCTGGACTGGCATGCCACCGACAACCTGACATTGTCCGGTGGTGCCCGGCGgcag < 6:411365/149‑1 (MQ=255) ccTCGTCCGAGTCGGGTGGCCTGGAGCTGGAAAAAGACAGCAAGGCCGACCGCTACCCCAGCTACCGGGTGGATGGTGTGTCGGTGTATGCCCAGCTGGACTGGCATGCCACCGACAACCTGACATTGTCCGGTGGTGCCCGGCGgcag < 6:92376/149‑1 (MQ=255) gTCCGAGTCGGGTGGCCTGGAGCTGGAAAAAGACAGCAAGGCCGACCGCTACCCCAGCTACCGGGTGGATGGTGTGTCGGTGTATGCCCAGCTGGACTGGCATGCCACCGACAACCTGACATTGTCCGGTGGTGCCCGGCGGCAGCAGa < 1:378756/149‑1 (MQ=255) gAGTCGGGTGGCCTGGAGCTGGAAAAAGACAGCAAGGCCGACCGCTACCCCAGCTACCGGGTGGATGGTGTGTCGGTGTATGCCCAGCTGGACTGGCATGCCACCGACAACCTGACATTGTCCGGTGGTGCCCGGAGGCTGCAGATGGa > 7:287801/1‑149 (MQ=255) tCGGGTGGCCTGGAGCTGGAAAAAGACAGCAAGGCCGACCGCTACCCCAGCTACCGGGTGGATGGTGTGTCGGTGTATGCCCAGCTGGACTGGCATGCCACCGACAACCTGACATTGTCCGGTGGTGCCCGGCGgcagc < 4:341616/139‑1 (MQ=255) tCGGGTGGCCTGGAGCTGGAAAAAGACAGCAAGGCCGACCGCTACCCCAGCTACCGGGTGGATGGTGTGTCGGTGTATGCCCAGCTGGACTGGCATGCCACCGACAACCTGACATTGTCCGGTGGTGCCCGGCGgcagc > 3:341616/1‑139 (MQ=255) tCGGGTGGCCTGGAGCTGGAAAAAGACAGCAAGGCCGACCGCTACCCCAGCTACCGGGTGGATGGTGTGTCGGTGTATGCCCAGCTGGACTGGCATGCCACCGACAACCTGACATTGTCCGGTGGTGCCCGGCGGCAGCAGATGGACGt < 6:363293/149‑1 (MQ=255) ggTGGCCTGGAGCTGGAAAAAGACAGCAAGGCCGACCGCTACCCCAGCTACCGGGTGGATGGTGTGTCGGTGTATGCCCAGCTGGACTGGCATGCCACCGACAACCTGACATTGTCCGGTGGTGCCCGGCGGCAGCAGATGGACGTTGa > 4:356568/1‑149 (MQ=255) gTGGCCTGGAGCTGGAAAAAGACAGCAAGGCCGACCGCTACCCCAGCTACCGGGTGGATGGTGTGTCGGTGTATGCCCAGCTGGACTGGCATGCCACCGACAACCTGACATTGTCCGGTGGTGCCCGGCGGCAGCAGATGGACGTTGAt > 3:279001/1‑149 (MQ=255) gTGGCCTGGAGCTGGAAAAAGACAGCAAGGCCGACCGCTACCCCAGCTACCGGGTGGATGGTGTGTCGGTGTATGCCCAGCTGGACTGGCATGCCACCGACAACCTGACATTGTCCGGTGGTGCCCGGCGGCAGCAGATGGACGTTGAt < 6:236088/149‑1 (MQ=255) aaaaaGACAGCAAGGCCGACCGCTACCCCAGCTACCGGGTGGATGGTGTGTCGGTGTATGCCCAGCTGGACTGGCATGCCACCGACAACCTGACATTGTCCGGTGGTGCCCGGCGGCAGCAGATGGACGTTGATGTCAGc < 1:148487/140‑1 (MQ=255) aaaaaGACAGCAAGGCCGACCGCTACCCCAGCTACCGGGTGGATGGTGTGTCGGTGTATGCCCAGCTGGACTGGCATGCCACCGACAACCTGACATTGTCCGGTGGTGCCCGGCGGCAGCAGATGGACGTTGATGTCAGc > 2:148487/1‑140 (MQ=255) aaaaGACAGCAAGGCCGACCGCTACCCCAGCTACCGGGTGGATGGTGTGTCGGTGTATGCCCAGCTGGACTGGCATGCCACCGACAACCTGACATTGTCCGGTGGTGCCCGGCGGCAGCAGATGGACGTTGATGTCAGCGACTTCAAgg > 5:170593/1‑149 (MQ=255) aGCAAGGCCGACCGCTACCCCAGCTACCGGGTGGATGGTGTGTCGGTGTATGCCCAGCTGGACTGGCATGCCACCGACAACCTGACATTGTCCGGTGGTGCCCGGCGGCAGCAGATGGACGTTGATGTCAGCGACTTCAAGGGTGTGc > 4:49104/1‑148 (MQ=255) ggCCGACCGCTACCCCAGCTACCGGGTGGATGGTGTGTCGGTGTATGCCCAGCTGGACTGGCATGCCACCGACAACCTGACATTGTCCGGTGGTGCCCGGCGGCAGCAGATGGACGTTGATGTCAGCGACTTCAAGGGTGTGCCAGGTg < 7:105265/149‑1 (MQ=255) ggCCGACCGCTACCCCAGCTACCGGGTGGATGGTGTGTCGGTGTATGCCCAGCTGGACTGGCATGCCACCGACAACCTGACATTGTCCGGTGGTGCCCGGCGGCAGCAGATGGACGTTGATGTCAGCGACTTCAAGGGTGTGCCAGGTg > 4:255392/1‑149 (MQ=255) gACCGCTACCCCAGCTACCGGGTGGATGGTGTGTCGGTGTATGCCCAGCTGGACTGGCATGCCACCGACAACCTGACATTGTCCGGTGGTGCCCGGCGGCAGCAGATGGACGTTGATGTCAGCGACTTCAAGGgt > 2:146229/1‑135 (MQ=255) gACCGCTACCCCAGCTACCGGGTGGATGGTGAGTCGGTGTATGCCCAGCTGGACTGGCATGCCACCGACAACCTGACATTGTCCGGTGGTGCCCGGCGGCAGCAGATGGACGTTGATGTCAGCGACTTCAAGGgt < 1:146229/135‑1 (MQ=255) cgatACCCCAGCTACCGGGTGGATGGTGTGTCGGTGTATGCCCAGATCGACTGGCATGCCACCGACAACCTGACATTGTCCGGTGGTGCCCGGCGGCAGCAGAGGGACGTTGATTTCAGCGACTTCAAGGGTGTGCCAGGTGGCAGTaa < 1:277351/146‑1 (MQ=255) cGCTACCCCAGCTACCGGGTGGATGGTGTGTCGGTGTATGCCCAGCTGGACTGGCATGCCACCGACAACCTGACATTGTCCGGTGGTGCCCGGCGGCAGCAGATGGACGTTGATGTCAGCGACTTCAAGGGTGTGCCAGGTGGCAGTaa < 4:279001/149‑1 (MQ=255) cTACCCCAGCTACCGGGTGGATGGTGTGTCGGTGTATGCCCAGCTGGACTGGCATGCCACCGACAACCTGACATTGTCCGGTGGTGCCCGGCGGCAGCAGATGGACGTTGATGTCAGCGACTTCAAGGGTGTGCCAGGTgg < 7:30293/141‑1 (MQ=255) cTACCCCAGCTACCGGGTGGATGGTGTGTCGGTGTATGCCCAGCTGGACTGGCATGCCACCGACAACCTGACATTGTCCGGTGGTGCCCGGCGGCAGCAGATGGACGTTGATGTCAGCGACTTCAAGGGTGTGCCAGGTgg > 8:30293/1‑141 (MQ=255) ccccAGCTACCGGGTGGATGGTGTGTCGGTGTATGCCCAGCTGGACTGGCATGCCACCGACAACCTGACATTGTCCGGTGGTGCCCGGCGGCAGCAGATGGACGTTGATGTCAGCGACTTCAAGGGTGTGCCAGGTGGCAGTAACGa < 6:438577/147‑1 (MQ=255) ccccAGCTACCGGGTGGATGGTGTGTCGGTGTATGCCCAGCTGGACTGGCATGCCACCGACAACCTGACATTGTCCGGTGGTGCCCGGCGGCAGCAGATGGACGTTGATGTCAGCGACTTCAAGGGTGTGCCAGGTGGCAGTAACGa < 3:49104/147‑1 (MQ=255) ccccAGCTACCGGGTGGATGGTGTGTCGGTGTATGCCCAGCTGGACTGGCATGCCACCGACAACCTGACATTGTCCGGTGGTGCCCGGCGGCAGCAGATGGACGTTGATGTCAGCGACTTCAAGGGTGTGCCAGGTGGCAGTAACGa < 7:53359/147‑1 (MQ=255) ccccAGCTACCGGGTGGATGGTGTGTCGGTGTATGCCCAGCTGGACTGGCATGCCACCGACAACCTGACATTGTCCGGTGGTGCCCGGCGGCAGCAGATGGACGTTGATGTCAGCGACTTCAAGGGTGTGCCAGGTGGCAGTAACGa < 3:356568/147‑1 (MQ=255) ccAGCTACCGGGTGGATGGTGTGTCGGTGTATGCCCAGCTGGACTGGCATGCCACCGACAACCTGACATTGTCCGGTGGTGCCCGGCGGCAGCAGATGGACGTTGATGTCAGCGACTTCAAGGGTGTGCCAGGTGGCAGTAACGACTAt < 1:160719/149‑1 (MQ=255) cAGCTACCGGGTGGATGGTGTGTCGGTGTATGCCCAGCTGGACTGGCATGCCACCGACAACCTGACATTGTCCGGTGGTGCCCGGCGGCAGCAGATGGACGTTGATGTCAGCGACTTCAAGGGTGTGCCAGGTGGCAGTAACGACTAt > 3:330237/1‑148 (MQ=255) gCTACCGGGTGGATGGTGTGTCGGTGTATGCCCAGCTGGACTGGCATGCCACCGACAAACTGACATTGTCCGGTGGTGCCCGGCGGCATCAGATGGACGTTGATGTCAGCGACTTCAAGGGTGTGCCAGGTGGCAGTAACGACTATCAg < 2:127187/149‑1 (MQ=255) ccGGGTGGATGGTGTGTCGGTGTATGCCCAGCTGGACTGGCATGCCACCGACAACCTGACATTGTCCGGTGGTGCCCGGCGGCAGCAGATGGACGTTGATGTCAGCGACTTCAAGGGTGTGCCAGGTGGCAGTAACGACTATCAGGt < 3:255392/147‑1 (MQ=255) ccGGGTGGATGGTGTGTCGGTGTATGCCCAGCTGGACTGGCATGCCACCGACAACCTGACATTGTCCGGTGGTGCCCGGCGGCAGCAGATGGACGTTGATGTCAGCGACTTCAAGGGTGTGCCAGGTGGCAGTAACGACTATCAGGTc > 2:149066/1‑148 (MQ=255) gATGGTGTGTCGGTGTATGCCCAGCTGGACTGGCATGCCACCGACAACCTGACATTGTCCGGTGGTGCCCGGCGGCAGCAGATGGACGTTGATGTCAGCGACTTCAAGGGTGTGCCAGGTGGCAGTAACGACTATCAGGTCAACCTGt < 6:170593/148‑1 (MQ=255) tgtCGGTGTATGCCCAGCTGGACTGGCATGCCACCTACAACCTGACATTGTCCGGTGGTGCCCGGCGGCAGCAGATGGACGTTGATGTCAGCGACTTCAAGGGTGTGCCAGGTGGCAGTAACGACTATCAGGTCAAc < 2:95364/137‑1 (MQ=255) tgtCGGTGTATGCCCAGCTGGACTGGCATGCCACCTACAACCTGACATTGTCCGGTGGTGCCCGGCGGCAGCAGATGGACGTTGATGTCAGCGACTTCAAGGGTGTGCCAGGTGGCAGTAACGACTATCAGGTCAAc < 2:101433/137‑1 (MQ=255) tgtCGGTGTATGCCCAGCTGGACTGGCATGCCACCTACAACCTGACAATGTCCGGTGGTGCCCGGCGGCAGCAGATGGACGTTGATGTCAGCGACTTCAAGGGTGTGCCAGGTGGCAGTAACGACTATCAGGTCAAc > 1:101433/1‑137 (MQ=255) tgtCGGTGTATGCCCAGCTGGACTGGCATGCCACCTACAACCTGACAATGTCCGGTGGTGCCCGGCGGCAGCAGATGGACGTTGATGTCAGCGACTTCAAGGGTGTGCCAGGTGGCAGTAACGACTATCAGGTCAAc > 1:95364/1‑137 (MQ=255) tgtCGGTGTATGCCCAGCTGGACTGGCATGCCACCGACAACCTGACATTGTCCGGTGGTGCCCGGCGGCAGCAGATGGACGTTGATGTCAGCGACTTCAAGGGTGTGCCAGGTGGCAGTAACGACTATCAGGTCAACCTGTTCAACGTc > 4:120033/1‑149 (MQ=255) ggTGTATGCCCAGCTGGACTGGCATGCCACCGACAACCTGACATTGTCCGGTGGTGCCCGGCGGCAGCAGATGGACGTTGATGTCAGCGACTTCAAGGGTGTGCCAGGTGGCAGTAACGACTATCAGGTCAACCTGTTCAACGTCGGt < 3:235123/148‑1 (MQ=255) gtATGCCCAGCTGGACTGGCATGCCACCGACAACCTGACATTGTCCGGTGGTGCCCGGCGGCAGCAGATGGACGTTGATGTCAGCGACTTCAAGGGTGTGCCAGGTGGCAGTAACGACTATCAGGTCAACCTGTTCAACGTCGGTGCCa > 2:151492/1‑149 (MQ=255) tATGCCCAGCTGGACTGGCATGCCACCGACAACCTGACATTGTCCGGTGGTGCCCGGCGGCAGCAGATGGACGTTGATGTCAGCGACTTCAAGGGTGTGCCAGGTGGCAGTAACGACTATCAGGTCAACCTGTTCAACGTCGGTGCCAt < 6:152320/149‑1 (MQ=255) aTGCCCAGCTGGACTGGCATGCCACCGACAACCTGACATTGTCCGGTGGTGCCCGGCGGCAGCAGATGGACGTTGATGTCAGCGACTTCAAGGGTGTGCCAGGTGGCAGTAACGACTATCAGGTCAACCTGTTCAACGTCGGTGCCATc > 1:122933/1‑149 (MQ=255) gCCCAGCTGGACTGGCATGCCACCGACAACCTGACATTGTCCGGTGGTGCCCGGCGGCAGCAGATGGACGTTGATGTCAGCGACTTCAAGGGTGTGCCAGGTGGCAGTAACGACTATCAGGTCAACCTGTTCAACGTCGGTGCCATCTa > 7:155980/1‑149 (MQ=255) gCCCAGCTGGACTGGCATGCCACCGACAACCTGACATTGTCCGGTGGTGCCCGGCGGCAGCAGATGGACGTTGATGTCAGCGACTTCAAGGGTGTGCCAGGTGGCAGTAACGACTATCAGGTCAACCTGTTCAACGTCGGTGCCATCTa > 3:242294/1‑149 (MQ=255) ccAGCTGGACTGGCATGCCACCGACAACCTGACATTGTCCGGTGGTGCCCGGCGGCAGCAGATGGACGTTGATGTCAGCGACTTCAAGGGTGTGCCAGGTGGCAGTAACGACTATCAGGTCAACCTGTTCAACGTCGGTGc < 7:286754/141‑1 (MQ=255) ccAGCTGGACTGGCATGCCACCGACAACCTGACATTGTCCGGTGGTGCCCGGCGGCAGCAGATGGACGTTGATGTCAGCGACTTCAAGGGTGTGCCAGGTGGCAGTAACGACTATCAGGTCAACCTGTTCAACGTCGGTGc > 8:286754/1‑141 (MQ=255) aGCTGGACTGGCATGCCACCGACAACCTGACATTGTCCGGTGGTGCCCGGCGGCAGCAGATGGACGTTGATGTCAGCGACTTCAAGGGTGTGCCAGGTGGCAGTAACGACTATCAGGTCAACCTGTTCAACGTCGGt > 2:177269/1‑137 (MQ=255) aGCTGGACTGGCATGCCACCGACAACCTGACATTGTCCGGTGGTGCCCGGCGGCAGCAGATGGACGTTGATGTCAGCGACTTCAAGGGTGTGCCAGGTGGCAGTAACGACTATCAGGTCAACCTGTTCAACGTCGGt < 1:177269/137‑1 (MQ=255) tGGACTGGCATGCCACCGACAACCTGACATTGTCCGGTGGTGCCCGGCGGCAGCAGATGGACGTTGATGTCAGCGACTTCAAGGGTGTGCCAGGTGGCAGTAACGACTATCAGGTCAACCTGTTCAACGTCGGTGCCATCTACGACtt > 2:141539/1‑148 (MQ=255) gACTGGCATGCCACCGACAACCTGACATTGTCCGGTGGTGCCCGGCGGCAGCAGATGGACGTTGATGTCAGCGACTTCAAGGGTGTGCCAGGTGGCAGTAACGACTATCAGGTCAACCTGTTCAACGTCGGTGCCATCTACGACTTc < 1:61414/147‑1 (MQ=255) aCTGGCATGCCACCGACAACCTGACATTGTCCGGTGGTGCCCGGCGGCAGCAGATGGACGTTGATGTCAGCGACTTCAAGGGTGTGCCAGGTGGCAGTAACGACTATCAGGTCAACCTGTTCAACGTCGGTGCCATCTACGACTTc > 1:357402/1‑146 (MQ=255) gCATGCCACCGACAACCTGACATTGTCCGGTGGTGCCCGGCGGCAGCAGATGGACGTTGATGTCAGCGACTTCAAGGGTGTGCCAGGTGGCAGTAACGACTATCAGGTCAACCTGTTCAACGTCGGTGCCATCTACGACTTCAAGAAc < 4:82075/148‑1 (MQ=255) gCATGCCACCGACAACCTGACATTGTCCGGTGGTGCCCGGCGGCAGCAGATGGACGTTGATGTCAGCGACTTCAAGGGTGTGCCAGGTGGCAGTAACGACTATCAGGTCAACCTGTTCAACGTCGGTGCCATCTACGACTTCAAGAACg > 7:207958/1‑149 (MQ=255) gCATGCCACCGACAACCTGACATTGTCCGGTGGTGCCCGGCGGCAGCAGATGGACGTTGATGTCAGCGACTTCAAGGGTGTGCCAGGTGGCAGTAACGACTATCAGGTCAACCTGTTCAACGTCGGTGCCATCTACGACTTCAAGAACg > 2:283939/1‑149 (MQ=255) cATGCCACCGACAACCTGACATTGTCCGGTGGTGCCCGGCGGCAGCAGATGGACGTTGATGTCAGCGACTTCAAGGGTGTGCCAGGTGGCAGTAACGACTATCAGGTCAACCTGTTCAACGTCGGTGCCATCTACGACTTCAAGAACgg < 6:269241/149‑1 (MQ=255) ccACCGACAACCTGACATTGTCCGGTGGTGCCCGGCGGCAGCAGATGGACGTTGATGTCAGCGACTTCAAGGGTGTGCCAGGTGGCa > 4:139742/1‑87 (MQ=255) ccACCGACAACCTGACATTGTCCGGTGGTGCCCGGCGGCAGCAGATGGACGTTGATGTCAGCGACTTCAAGGGTGTGCCAGGTGGCa < 3:139742/87‑1 (MQ=255) ccGACAACCTGACATTGTCCGGTGGTGCCCGGCGGCAGCAGATGGACGTTGATGTCAGCGACTTCAAGGGTGTGCCAGGTGGCAGTAACGACTATCAGGTCAACCTGTTCAACGTCGGTGCCATCTACGACTTCAAGAACGGCCACCAg < 4:242294/149‑1 (MQ=255) | CTTCAACGCCGAGCAGACCACCTTCAACGCCCAGACCTCGTCCGAGTCGGGTGGCCTGGAGCTGGAAAAAGACAGCAAGGCCGACCGCTACCCCAGCTACCGGGTGGATGGTGTGTCGGTGTATGCCCAGCTGGACTGGCATGCCACCGACAACCTGACATTGTCCGGTGGTGCCCGGCGGCAGCAGATGGACGTTGATGTCAGCGACTTCAAGGGTGTGCCAGGTGGCAGTAACGACTATCAGGTCAACCTGTTCAACGTCGGTGCCATCTACGACTTCAAGAACGGCCACCAG > NC_002947/2499563‑2499857 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |