| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 227,872 | G→A | 5.6% | R233H (CGC→CAC) | PP_0176 → | putative efflux transporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 227,872 | 0 | G | A | 5.6% | 269.7 / 2.4 | 89 | R233H (CGC→CAC) | PP_0176 | putative efflux transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (46/38); new base A (2/3); total (48/41) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.58e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.48e-01 | |||||||||||
CAGCGACACCTACCTGGCCCGCGATGCCAGCGCTGACAAGGTCGGCGGTATGCGCGGGGCGATGGTCACTACCTTCAACTCGCTGGAGCTGATGATCGGTCAGCTCGCCCACGAAGGTGCCGGCCCGCATACCCTGAAGAACGCCCGCGAATTGCGTGGGCGGATGATCCATCTGCTGCCGGTGATCGACGCCCTCGACGACGCACTGGTAGCCCTGGAAGGCCGCGCCCCGGCCCAGTTCGCCCAGCTTCAACCCGTGCTGGAAGCCGCTCGTGAATGGCTCAAAGGCACCG > NC_002947/227726‑228018 | cAGCGACACCTACCTGGCCCGCGATGCCAGCGCTGACAAGGTCGGCGGTATGCGCGGGGCGATGGTCACTACCTTCAACTCGCTGGAGCTGATGATCGGTCAGCTCGCCCACGAAGGTGCCGGCCCGCATACCCTGAAGAACGCCcgc < 1:150094/148‑1 (MQ=255) gCGACACCTACCTGGCCCGCGATGCCAGCGCTGACAAGGTCGGCGGTATGCGCGGGGCGATGGTCACTACCTTCAACTCGCTGGAGCTGATGATCGGTCAGCTCGCCCACGAAGGTGCCGGCCCGCATACCCTGAAGAACGCCCGCGaa > 4:10057/1‑149 (MQ=255) cGACACCTACCTGGCCCGCGATGCCAGCGCTGACAAGGTCGGCGGTATGCGCGGGGCGATGGTCACTACCTTCAACTCGCTGGAGCTGATGATCGGTCAGCTCGCCCACGAAGGTGCCGGCCCGCATACCCTGAAGAACGCCCGCGAAt > 4:273807/1‑149 (MQ=255) gACACCTACCTGGCCCGCGATGCCAGCGCTGACAAGGTCGGCGGTATGCGCGGGGCGATGGTCACTACCTTCAACTCGCTGGAGCTGATGATCGGTCAGCTCGCCCACGAAGGTGCCGGCCCGCATACCCTGAAGAACGCCCGCGAAtt < 3:66375/149‑1 (MQ=255) cctacctGGCCCGCGATGCCAGCGCTGACAAGGTCGGCGGTATGCGCGGGGCGATGGTCACTACCTTCAACTCGCTGGAGCTGATGATCGGTCAGCTCGCCCACGAAGGTGCCGGCCCGCATACCCTGAAGAACGCCCGCGAATTGCGt < 6:421565/149‑1 (MQ=255) ctacctGGCCCGCGATGCCAGCGCTGACAATGTCGGGGGTATGCGCGTGGAGATGGTCACTACCTTCAACTCGCTGGATCTGATGATCGGTCAGCTCGCCGACGAAGTTGCCGGCCCGCATACCATGAAGAACGCCCGCGAATTGCGt < 5:17139/148‑1 (MQ=255) ctacctGGCCCGCGATGCCAGCGCTGACAAGGTCGGCGGTATGCGCGGGGCGATGGTCACTACCTTCAACTCGCTGGAGCTGATGATCGGTCAGCTCGCCCACGAAGGTGCCGGCCCGCATACCCTGAAGAACGCCCGCGAATTGCGTg > 2:321996/1‑149 (MQ=255) cctGGCCCGCGATGCCAGCGCTGACAAGGTCGGCGGTATGCGCGGGGCGATGGTCACTACCTTCAACTCGCTGGAGCTGATGATCGGTCAGCTCGCCCACGAAGGTGCCGGCCCGCATACCCTGAAGAACGCCCGCGAATTGCTTGGGc > 3:85592/1‑149 (MQ=255) cctGGACCGCGATGCCAGCGCTGACAAGGTCAGCGGTATGCGCGGGGCGATCGTCACTACCTTCAACTCTCAGGAGCTGATGATCGGTCAGCTCGACCACTAAGTTGACGGCCCGCAAACCCTGAAGAACGACCGCGAATTGAGt > 6:17139/1‑145 (MQ=255) ctGGCCCGCGATGCCAGCGCTGACAAGGTCGGCGGTATGCGCGGGGCGATGGTCACTACCTTCAACTCGCTGGAGCTGATGATCGGTCAGCTCGCCCACGAAGGTGCCGGCCCGCATACCCTGAAGAACGCCCGCGAATTGCGTGGGCg > 3:179778/1‑149 (MQ=255) ccGCGATGCCAGCGCTGACAAGGTCGGCGGTATGCGCGGGGCGATGGTCACTACCTTCAACTCGCTGGAGCTGATGATCGGTCAGCTCGCCCACGAAGGTGCCGGCCCGCATACCCTGAAGAACGCCCGCGAATTGCGTGGGCGgatga > 5:366409/1‑149 (MQ=255) ccGCGATGCCAGCGCTGACAAGGTCGGCGGTATGCGCGGGGCGATGGTCACTACCTTCAACTCGCTGGAGCTGATGATCGGTCAGCTCGCCCACGAAGGTGCCGGCCCGCATACCCTGAAGAACGCCCGCGAATTGCGTGGGCGgatga > 1:56715/1‑149 (MQ=255) gcgATGCCAGCGCTGACAAGGTCGGCGGTATGCGCGGGGCGTTGGTCACTACCTTCAACTCGCTGGAGCTGATGATCGGTCAGCTCGCCCACGAAGGTGCCGGCCCGCATACCCTGAAGAACGCCCACGCAATTCGCGGGCgttcttca < 8:169172/149‑8 (MQ=255) gcgATGCCAGCGCTGACAAGGTCGGCGGTATGCGCGGGGCGATGGTCACTACCTTCAACTCGCTGGAGCTGATGATCGGTCAGCTCGCCCACGAAGGTGCCGGCCCGCATACCCTGAAGAACGCCCACGCAATTCGCGGGCgttcttca < 6:291408/149‑8 (MQ=255) tGCCAGCGCTGACAAGGGCGGCGGTATGCGCGGGGCGATGGTCACTACCTTCAACTCGCTGGAGCTGATGATCGGTCAGCTCGCCCACGAAGGTGCCGGCCCGCATACCCTGAAGAACGCCCGCGAATTGCGTGGGCGGATGATCCATc < 3:234038/149‑1 (MQ=255) ccAGCGCTGACAAGGTCGGCGGTATGCGCTGGGCGATGGTCACTACCTTCAACTCGCTGGATCTGATGATCGGTCAGCTCGCCCACGAAGGTTCCGTCCCGCATACCCTGAAGAACTCCCGCGAATTGCGTTGGCGGATGATCCATctg < 4:39796/149‑1 (MQ=255) ccAGCGCTGACAAGGTCGGCGGTATGCGCGGGGCGATGGTCACTACCTTCAACTCGCTGGAGCTGATGATCGGTCAGCTCGCCCACGAAGGTGCCGGCCCGCATACCCTGAAGAACGCCCGCGAATTGCGTGGGCGGATGATCCATctg > 8:179417/1‑149 (MQ=255) cAGCGCTGACAAGGTCGGCGGTATGCGCGGGGCGATGGTCACTACCTTCAACTCGCTGGAGCTGATGATCGGTCAGCTCGCCCACGAAGGTGCCGGCCCGCATACCCTGAAGAACGCCCGCGAATTGCGTGGGCGGATGATCCATctgc > 6:183043/1‑149 (MQ=255) gcgcTGACAAGGTCGGCGGTATGCGCGGGGCGATGGTCACTACCTTCAACTCGCTGGAGCTGATGATCGGTCAGCTCGCCCACGAAGGTGCCGGCCCGCATACCCTGAAGAACGCCCGCGAATTGCGTGGGCGGATGATCCATctgctg < 7:335407/149‑1 (MQ=255) cTGACAAGGTCGGCGGTATGCGCGGGGCGATGGTCACTACCTTCAACTCGCTGGAGCTGATGATCGGTCAGCTCGCCCACGAAGGTGCCGGCCCGCATACCCTGAAGAACGCCCGCGAATTGCGTGGGCGGATGATCCATCTGCTGCCg < 7:216368/149‑1 (MQ=255) aCAAGGTCGGCGGTATGCGCGGGGCGATGGTCACTACCTTCAACTCGCTGGAGCTGATGATCGGTCAGCTCGCCCACGAAGGTGCCGGCCCGCATACCCTGAAGAACGCCcgc > 6:284425/1‑113 (MQ=255) aCAAGGTCGGCGGTATGCGCGGGGCGATGGTCACTACCTTCAACTCGCTGGAGCTGATGATCGGTCAGCTCGCCCACGAAGGTGCCGGCCCGCATACCCTGAAGAACGCCcgc < 5:284425/113‑1 (MQ=255) aCAAGGTCGGCGGTATGCGCGGGGCGATGGTCACTACCTTCAACTCGCTGGAGCTGATGATCGGTCAGCTCGCCCACGAAGGTGCCGGCCCGCATACCCTGAAGAACGCCCGCGAATTGCGTGGGCGGATGATCCATCTGCTGCCgg < 3:271464/147‑1 (MQ=255) aCAAGGTCGGCGGTATGCGCGGGGCGATGGTCACTACCTTCAACTCGCTGGAGCTGATGATCGGTCAGCTCGCCCACGAAGGTGCCGGCCCGCATACCCTGAAGAACGCCCGCGAATTGCGTGGGCGGATGATCCATCTGCTGCCGGt > 1:378237/1‑148 (MQ=255) gTCGGCGGTATGCGCGGGGCGATGGTCACTACCTTCAACTCGCTGGAGCTGATGATCGGTCAGCTCGCCCACGAAGGTGCCGGCCCGCATACCCTGAAGAACGCCCGCGAATTGCGTGGGCGGATGATCCATCTGCTGCCGGTGATCGa > 3:242812/1‑149 (MQ=255) ggcggTATGCGCGGGGCGATGGTCACTACCTTCAACTCGCTGGAGCTGATGATCGGTCAGCTCGCCCACGAAGGTGCCGGCCCGCATACCCTGAAGAACGCCCGCGAATTGCGTGGGCGGATGATCCATCTGCTGCCGGTGATCGACg < 1:321996/148‑1 (MQ=255) gTATGGGCGGGGCTATGGTCACTACCTTCATCTGTCTGTAGATGATGATCGGTCAGCTCGCCCACGAATGTGCCGGCACGCATACCGTGAAGAACTCGCGTGAATTGCGTGGGCGGATGATGCATGTTCTGTCGTTTATCGACGCCCTc < 4:85592/149‑1 (MQ=255) tATGCGCGGGGCGATGGTCACTACCTTCAACTCGCTGGAGCTGATGATCGGTCAGCTCGCCCACGAAGGTGCCGGCCCGCATACCCTGAAGAACGCCCGCGAATTGCGTGGGCGGATGATCCATCTGCTGCCGGTGATCGACGCCCTcg < 2:378237/149‑1 (MQ=255) gcgcGGGGCGATGGTCACTACCTTCAACTCGCTGGAGCTGATGATCGGTCAGCTCGCCCACGAAGGTGCCGGCCCGCATACCCTGAAGAACGCCCGCGAATTGCGTGGGCGGATGATCCATCTGCTGCCGGTGATCGACGCCCTcgac > 5:120980/1‑148 (MQ=255) cgcgGGGCGATGGTCACTACCTTCAACTCGCTGGAGCTGATGATCGGTCAGCTCGCCCACGAAGGTGCCGGCCCGCATACCCTGAAGAACGCCCGCGAATTGCGTGGGCGGATGATCCATCTGCTGCCGGTGATCGACGCCCTcgacga > 3:299119/1‑149 (MQ=255) gcgGGGCGATGGTCACTACCTTCAACTCGCTGGAGCTGATGATCGGTCAGCTCGCCCACGAAGGTGCCGGCCCGCATACCCTGAAGAACGCCCGCGAATTGCGTGGGCGGATGATCCATCTGCTGCCGGTGATCGACGCCCTCgacgac < 1:19049/149‑1 (MQ=255) cgGGGCGATGGTCACTACCTTCAACTCGCTGGAGCTGATGATCGGTCAGCTCGCCCACGAAGGTGCCGGCCCGCATACCCTGAAGAACGCCCGCGAATTGCGTGGGCGGATGATCCATCTGCTGCCGGTGATCGACGCCCTCGacgacg > 1:31874/1‑149 (MQ=255) ggCGATGGTCACTACCTTCAACTCGCTGGAGCTGATGATCGGTCAGCTCGCCCACGAAGGTGCCGGCCCGCATACCCTGAAGAACGCACGCGAATTGCGTGGGCGGATGATCCATCTGCTGCCGGTGATCGACGCCCTCGACGACGCAc < 6:426804/149‑1 (MQ=255) gCGATGGTCACTACCTTCAACTCGCTGGAGCTGATGATCGGTCAGCTCGCCCACGAAGGTGCCGGCCCGCATACCCTGAAGAACGCCCGCGAATTGCGTGGGCGGATGATCCATCTGCTGCCGGTGATCGACGCCCTCGACGACGCACt < 5:337716/149‑1 (MQ=255) cGATGGTCACTACCTTCAACTCGCTGGAGCTGATGATCGGTCAGCTCGCCCACGAAGGTGCCGGCCCGCATACCCTGAAGAACGCCCGCGAATTGCGTGGGCGGATGATcc < 6:322782/111‑1 (MQ=255) cGATGGTCACTACCTTCAACTCGCTGGAGCTGATGATCGGTCAGCTCGCCCACGAAGGTGCCGGCCCGCATACCCTGAAGAACGCCCGCGAATTGCGTGGGCGGATGATcc > 5:322782/1‑111 (MQ=255) aTGGTCACTACCTTCAACTCGCTGGAGCTGATGATCGGTCAGCTCGCCCACGAAGGTGCCGGCCCGCATACCCTGAAGAACGCCCACGAATTGCGTGGGCGGATGATCCATCTGCTGCCGGTGATCGACGCCCTCGACGACGCACTgg > 5:115145/1‑148 (MQ=255) gTCACTACCTTCAACTCGCTGGAGCTGATGATCGGTCAGCTCGCCCACGAAGGTGCCGGCCCGCATACCCTGAAGAACGCCCGCGAATTGCGTGGGCGGATGATCCATCTGCTGCCGGTGATCGACGCCCTCGACGACGCACTGGTAg < 7:179417/148‑1 (MQ=255) cTACCTTCAACTCGCTGGAGCTGATGATCGGTCAGCTCGCCCACGAAGGTGCCGGCCCGCATACCCTGAAGAACGCCCGCGAATTGCGTGGGCGGATGATCCATCTGCTGCCGGTGATCGACGCCCTCGACGACGCACTGGTAGCCCTg > 6:116556/1‑149 (MQ=255) tACCTTCAACTCGCTGGAGCTGATGATCGGTCAGCTCGCCCACGAAGGTGCCGGCCCGCATACCCTGAAGAACGCCCGCGAATTGCGTGGGCGGATGATCCATCTGCTGCCGGTGATCGACGCCCTCGACGACGCACTGGTAGCCCTg > 6:380756/1‑148 (MQ=255) ccTTCAACTCGCTGGAGCTGATGATCGGTCAGCTCGCCCACGAAGGTGCCGGCCCGCATACCCTGAAGAACGCCCGCGAATTGCGTGGGCGGATGATCCATCTGCTGCCGGTGATCGACGCCCTCGACGACGCACTGGTAGCCCTgg > 8:182022/1‑147 (MQ=255) cTTCAACTCGCTGGAGCTGATGATCGGTCAGCTCGCCCACGAAGGTGCCGGCCCGCATACCCTGAAGAACGCCCGCGAATTGCGTGGGCGGATGATCCATCTGCTGCCGGTGATCGACGCCCTCGACGACGCACTGGTAGCCCTGGAAg < 5:306317/149‑1 (MQ=255) ttCAACTCGCTGGAGCTGATGATCGGTCAGCTCGCCCACGAAGGTGCCGGCCCGCATACCCTGAAGAACGCCCGCGAATTGCGTGGGCGGATGATCCATCTGCTGCCGGTGATCGACGCCCTCGACGACGCACTGGTAGCCCTGGAAgg > 6:285403/1‑149 (MQ=255) ttCAACTCGCTGGAGCTGATGATCGGTCAGCTCGCCCACGAAGGTGCCGGCCCGCATACCCTGAAGAACGCCCGCGAATTGCGTGGGCGGATGATCCATCTGCTGCCGGTGATCGACGCCCTCGACGACGCACTGGTAGCCCTGGAAgg > 2:331570/1‑149 (MQ=255) cAACTCGCTGGAGCTGATGATCGGGCAGCTCGCCCACGAAGGTGCCGGCCCGCATACCCTGAAGAACGCCCGCGAATTGCGTGGGCGGATGATCCATCTGCTGCCGGTGATCGACGCCCTCGACGACGCACTGGTAGCCCTGGAAGGc < 8:79408/148‑1 (MQ=255) aaCTCGCTGGAGCTGATGATCGGTCAGCTCGCCCACGAAGGTGCCGGCCCGCATACCCTGAAGAACGCCCGCGAATTGCGTGGGCGGATGATCCATCTGCTGCCGGTGATCGACGCCCTCGACGACGCACTGGTAGCCCTGGAAGGCcg > 5:161353/1‑149 (MQ=255) cTCGCTGGAGCTGATGATCGGTCAGCTCGCCCACGAAGGTGCCGGCCCGCATACCCTGAAGAACGCCCGCGAATTGCGTGGGCGGATGATCCATCTGCTGCCGGTGATCGACGCCCTCGACGACGCACTGGTAGCCCTGGAAGGCcgcg < 5:212624/149‑1 (MQ=255) cTCGCTGGAGCTGATGATCGGTCAGCTCGCCCACGAAAGTGCCGGCCCGCATACCCTGAAGAACGCCCGCGAATTGCGTGGGCGGATGATCCATCTGCTGCCGGTGATCGACGCCCTCGACGACGCACTGGTAGCCCTGGAAGGCcgcg > 8:212980/1‑149 (MQ=255) tCGCTGGAGCTGATGATCGGTCAGCTCGCCCACGAAGGTGCCGGCCCGCATACCCTGAAGAACGCCCGCGAATTGCGTGGGCGGATGATCCATCTGCTGCCGGTGATCGACGCCCTCGACGACGCACTGGTAGCCCTGGAAGGCCgcgc > 2:305796/1‑149 (MQ=255) gCTGGAGCTGATGATCGGTCAGCTCGCCCACGAAGGTGCCGGCCCGCATACCCTGAAGAACGCCCGCGAATTGCGTGGGCGGATGATCCATCTGCTGCCGGTGATCGACGCCCTCGACGACGCACTGGTAGCCCTGGAAg < 7:202554/140‑1 (MQ=255) gCTGGAGCTGATGATCGGTCAGCTCGCCCACGAAGGTGCCGGCCCGCATACCCTGAAGAACGCCCGCGAATTGCGTGGGCGGATGATCCATCTGCTGCCGGTGATCGACGCCCTCGACGACGCACTGGTAGCCCTGGAAg > 8:202554/1‑140 (MQ=255) gCTGGAGCTGATGATCGGTCAGCTCGCCCACGAAGGTGCCGGCCCGCATACCCTGAAGAACGCCCGCGAATTGCGTGGGCGGATGATCCATCTGCTGCCGGTGATCGACGCCCTCGACGACGCACTGGTAGCCCTGGAAGGCCGCGccc > 7:6912/1‑149 (MQ=255) ggAGCTGATGATCGGTCAGCTCGCCCACGAAGGTGCCGGCCCGCATACCCTGAAGAACGCCCGCGAATTGCGTGGGCGGATGATCCATCTGCTGCCGGTGATCGACGCCCt > 8:262855/1‑111 (MQ=255) ggAGCTGATGATCGGTCAGCTCGCCCACGAAGGTGCCGGCCCGCATACCCTGAAGAACGCCCGCGAATTGCGTGGGCGGATGATCCATCTGCTGCCGGTGATCGACGCCCt < 7:262855/111‑1 (MQ=255) gAGCTGATGATCGGTCAGCTCGCCCACGAAGGTGCCGGCCCGCATACCCTGAAGAACGCCCGCGAATTGCGTGGGCGGATGATCCATCTGCTGCCGGTGATCGACGCCCTCGACGACGCACTGGTAGCCCTGGAAGGCCGCGCCCCGGc < 4:179778/149‑1 (MQ=255) aGCTGATGATCGGTCAGCTCGCCCACGAAGGTGCCGGCCCGCATACCCTGAAGAACGCCCGCGAATTGCGTGGGCGGATGATCCATCTGCTGCCGGTGATCGACGCCCTCGACGACGCACTGGTAGCCCTGGAAGGCCGCGCCCCGGcc < 7:182022/149‑1 (MQ=255) gatgatCGGTCAGCTCGCCCACGAAGGTGCCGGCCCGCATACCCTGAAGAACGCCCGCGAATTGCGTGGGCGGATGATCCATCTGCTGCCGGTGATCGACGCCCTCGACGACGCACTGGTAGCCCTGGAAGGCCGCGCCCCGGCCCAGt > 2:239517/1‑149 (MQ=255) gatgatCGGTCAGCTCGCCCACGAAGGTGCCGGCCCGCATACCCTGAAGAACGCCCGCGAATTGCGTGGGCGGATGATCCATCTGCTGCCGGTGATCGACGCCCTCGACGACGCACTGGTAGCCCTGGAAGGCCGCGCCCCGGCCCAGt > 6:380888/1‑149 (MQ=255) atgatCGGTCAGCTCGCCCACGAAGGTGCCGGCCCGCATACCCTGAAGAACGCCCGCGAATTGCGTGGGCGGATGATCCATCTGCTGCCGGTGATCGACGCCCTCGACGACGCACTGGTAGCCCTGGAAGGCCGCGCCCCGGCCCAGtt > 6:370934/1‑149 (MQ=255) atgatCGGTCAGCTCGCCCACGAAGGTGCCGGCCCGCATACCCTGAAGAACGCCCACGAATTGCGTGGGCGGATGATCCATCTGCTGCCGGTGATCGACGCCCTCGACGACGCACTGGTAGCCCTGGAAGGCCGCGCCCCGGCCCAGtt < 6:115145/149‑1 (MQ=255) atCGGTCAGCTCGCCCACGAAGGTGCCGGCCCGCATACCCTGAAGAACGCCCGCGAATTGCGTGGGCGGATGATCCATCTGCTGCCGGTGATCGACGCCCTCGACGACGCACTGGTAGCCCTGGAAGGCCGCGCCCCGGCCCAGTTCg < 4:299119/148‑1 (MQ=255) gTCAGCTCGCCCACGAAGGTGCCGGCCCGCATACCCTGAAGAACGCCCGCGAATTGCg > 5:38366/1‑58 (MQ=255) gTCAGCTCGCCCACGAAGGTGCCGGCCCGCATACCCTGAAGAACGCCCGCGAATTGCg < 6:38366/58‑1 (MQ=255) gTCAGCTCGCCCACGAAGGTGCCGGCCCGCATACCCTGAAGAACGCCCGCGAATTGCGTGGGCGGATGATCCATCTGCTGCCGGTGATCGACGCCCTCGACGACGCACTGGTAGCCCTGGAAGGCCGCGCCCCGGCCCAGTTCGCCCAg > 8:279807/1‑149 (MQ=255) atCAGCTCGCCCACGAAGGTGCCGGCCCGCATACCCTGAAGAACGCCCGCGAATTGCGTGGGCGGATGATCCATCTGCTGCCGGTGATCGACGCCCTCGACGACGCACTGGTAGCCCTGGAAGGCCGCGCCCCGGCCCAGTTCGCCCa < 4:281863/147‑1 (MQ=255) tCAGCTCGCCCACGAAGGTGCCGGCCCGCATACCCTGAAGAACGCCCGCGAATTGCGTGGGCGGATGATCCATCTGCTGCCGGTGATCGACGCCCTCGACGACGCACTGGTAGCCCTGGAAGGCCGCGCCCCGGCCCAGTTCGCCCAGc < 4:418636/149‑1 (MQ=255) cAGCTCGCCCACGAAGGTGCCGGCCCGCATACCCTGAAGAACGCCCGCGAATTGCGTGGGCGGATGATCCATCTGCTGCCGGTGATCGACGCCCTCGACGACGCACTGGTAGCCCTGGAAGGCCGCGCCCCGGCCCAGTTCGCCCAGCt < 5:183043/149‑1 (MQ=255) cTCGCCCACGAAGGTGCCGGCCCGCATACCCTGAAGAACGCCCGCGAATTGCGTGGGCGGATGATCCATCTGCTGCCGGTGATCGACGCCCTCGACGACGCACTCGTAGCACTGGAAGGCCGCGCCCCGGCCCAGTTCGCCCAGCtac > 4:430065/1‑146 (MQ=255) 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tGCCGGCCCGCATACCCTGAAGAACGCCCGCGAATTGCGTGGGCGGATGATCCATCTGCTGCCGGTGATCGACGCCCTCGACGACGCACTGGTAGCCCTGGAAGGCCGCGCCCCGGCCCAGTTCGCCCAGCTTCAACCCGTGCTGGAAg > 5:154774/1‑149 (MQ=255) ccGGCCCGCATACCCTGGAGAACGCCCGCGAATTGCGTGGGCGGATGATCCATCTGCTGCCGGTGATCGACGCCCTCGACGACGCACTGGTAGCCCTGGAAGGCCGCGCCCCGGCCCAGTTCGCCCAGCTTCAACCCGTGCTGGAAGcc > 6:370161/1‑149 (MQ=255) ccGGCCCGCATACCCTGAAGAACGCCCGCGAATTGCGTGGGCGGATGATCCATCTGCTGCCGGTGATCGACGCCCTCGACGACGCACTGGTAGCCCTGGAAGGCCGCGCCCCGGCCCAGTTCGCCCAGCTTCAACCCGTGCTGGAAGcc > 3:134002/1‑149 (MQ=255) gCCCGCATACCCTGAAGAACGCCCGCGAATTGCGTGGGCGGATGATCCATCTGCTGCCGGTGATCGACGCCCTCGACGACGCACTGGTAGCCCTGGAAGGCCGCGCCCCGGCCCAGTTCGCCCAGCTTCAACCCGTGCTGGAAGCCGCt > 4:334880/1‑149 (MQ=255) cccGCATACCCTGAAGAACGCCCGCGAATTGCGTGGGCGGATGATCCATCTGCTGCCGGTGATCGACGCCCTCGACGACGCACTGGTAGCCCTGGAAGGCCGCGCCCCGGCCCAGTTCGCCCAGCTTCAACCCGTGCTGGAAGCCGCTc < 7:399453/149‑1 (MQ=255) cccGCATACCCTGAAGAACGCCCGCGAATTGCGTGGGCGGATGATCCATCTGCTGCCGGTGATCGACGCCCTCGACGACGCACTGGTAGCCCTGGAAGGCCGCGCCCCGGCCCAGTTCGCCCAGCTTCAACCCGTGCTGGAAGCCGCTc < 5:116556/149‑1 (MQ=255) cATACCCTGAAGAACGCCCGCGAATTGCGTGGGCGGATGATCCATCTGCTGCCGGTGATCGACGCCCTCGACGACGCACTGGTAGCCCTGGAAGGCCGCGCCCCGGCCCAGTTCGCCCAGCTTCAACCCGTGCTGGAAGCCg < 8:42839/142‑1 (MQ=255) cATACCCTGAAGAACGCCCGCGAATTGCGTGGGCGGATGATCCATCTGCTGCCGGTGATCGACGCCCTCGACGACGCACTGGTAGCCCTGGAAGGCCGCGCCCCGGCCCAGTTCGCCCAGCTTCAACCCGTGCTGGAAGCCg > 7:42839/1‑142 (MQ=255) aTACCCTGAAGAACGCCCGCGAATTGCGTGGGCGGATGATCCATCTGCTGCCGGTGATCGACGCCCTCGACGACGCACTGGTAGCCCTGGAAGGCCGCGCCCCGGCCCAGTTCGCCCAGCTTCAACCCGTGCTGGAAGCCGCTCGTGaa < 6:349998/149‑1 (MQ=255) ccTGAAGAACGCCCGCGAATTGCGTGGGCGGATGATCCATCTGCTGCCGGTGATCGACGCCCTCGACGACGCACTGGTAGCCCTGGAAGGCCGCGCCCCGGCCCAGTTCGCCCAGCTTCAACCCGTGCTGGAAGCCGCTCGTGAATGGc < 6:154774/149‑1 (MQ=255) tcatccGCCCACGCAATTCGCGGGCGGATGATCCATCTGCTGCCGGTGATCGACGCCCTCGACGACGCACTGGTAGCCCTGGAAGGCCGCGCCCCGGCCCAGTTCGCCCAGCTTCAACCCGTGCTGGAAGCCGCTCGTGAATGGCTCa > 5:4484/6‑148 (MQ=255) gaaCGCCCGCGAATTGCGTGGGCGGATGATCCATCTGCTGCCGGTGATCGACGCCCTCGACGACGCACTGGTAGCCCTGGAAGGCCGCGCCCCGGCCCAGTTCGCCCAGCTTCAACCCGTGCTGGAAGCCGCTCGTGAATGGCTCAAAg > 6:142099/1‑149 (MQ=255) aaCGCCCGCGAATTGCGTGGGCGGATGATCCATCTGCTGCCGGTGATCGACGCCCTCGACGACGCACTGGTAGCCCTGGAAGGCCGCGCCCCGGCCCAGTTCGCCCAGCTTCAACCCGTGCTGGAAGCCGCTCGTGAATGGCTCAAAgg < 8:6912/149‑1 (MQ=255) ccGCGAATTGCGTGGGCGGATGATCCATCTGCTGCCGGTGATCGACGCCCTCGACGACGCACTGGTAGCCCTGGAAGGCCGCGCCCCGGCCCAGTTCGCCCAGCTTCAACCCGTGCTGGAAGCCGCTCGTGAATGGCTCAAAGGCAccg > 4:352272/1‑149 (MQ=255) | CAGCGACACCTACCTGGCCCGCGATGCCAGCGCTGACAAGGTCGGCGGTATGCGCGGGGCGATGGTCACTACCTTCAACTCGCTGGAGCTGATGATCGGTCAGCTCGCCCACGAAGGTGCCGGCCCGCATACCCTGAAGAACGCCCGCGAATTGCGTGGGCGGATGATCCATCTGCTGCCGGTGATCGACGCCCTCGACGACGCACTGGTAGCCCTGGAAGGCCGCGCCCCGGCCCAGTTCGCCCAGCTTCAACCCGTGCTGGAAGCCGCTCGTGAATGGCTCAAAGGCACCG > NC_002947/227726‑228018 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |